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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 2481 - 2500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2481 | 2026-02-27 |
A defined bacterial consortium and spatial transcriptomics highlight the complex interaction between Campylobacter jejuni and the murine intestine
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2600053
PMID:41411657
|
研究论文 | 本研究通过建立定义的细菌群落并结合空间转录组学技术，揭示了空肠弯曲菌与小鼠肠道之间的复杂相互作用 | 首次使用定义的13种细菌群落结合空间转录组学，在单细胞水平上解析宿主、微生物群和病原体在肠道感染中的相互作用 | 研究仅使用小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类；定义的细菌群落可能无法完全模拟自然微生物群的复杂性 | 阐明特定肠道细菌与空肠弯曲菌介导的宿主反应之间的相互作用机制 | 无菌小鼠、定义的13种细菌群落、空肠弯曲菌81-176菌株 | 空间转录组学 | 肠道感染 | 16S rRNA基因测序、荧光原位杂交、RNAscope、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 三组无菌小鼠：C13组、C13+空肠弯曲菌组、无菌对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2482 | 2026-02-27 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Nov, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，并基于单细胞和空间转录组学研究总结了主要发现 | 整合了最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学数据，为神经退行性疾病模型提供了新的分子和细胞层面见解 | 没有模型是完美的，可能存在物种差异和病理不完全模拟的问题 | 研究神经退行性疾病的病因和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2483 | 2026-02-27 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
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研究论文 | 本文介绍了GreenCells数据库，一个专门用于在单细胞水平探索植物长非编码RNA的综合资源 | 开发了首个专注于植物lncRNA的单细胞分析数据库，整合了多物种数据并识别了lncRNA标记基因及共表达网络 | NA | 研究植物lncRNA在单细胞分辨率下的表达和功能 | 八种植物物种的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2484 | 2026-02-27 |
The urokinase receptor/uPAR is a major effector of p53 gain-of-function mutations in gemcitabine-treated pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110561
PMID:40759369
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研究论文 | 本文研究了在胰腺导管腺癌中，TP53功能获得性突变通过上调uPAR表达，促进吉西他滨治疗后癌细胞侵袭和转移的机制 | 揭示了TP53功能获得性突变通过上调PLAUR/uPAR表达，驱动吉西他滨治疗后胰腺癌细胞的侵袭性增强和化疗耐药，并利用单细胞RNA测序技术验证了PLAUR在特定恶性上皮细胞簇中的表达增加 | 研究主要基于细胞系和TCGA数据，缺乏体内实验验证，且EGFR沉默对uPAR介导的ERK1/2激活无影响的机制未完全阐明 | 探究TP53功能获得性突变在胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系（PANC1和MIA PaCa-2）及TCGA数据库中的患者数据 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、基因沉默、细胞迁移和侵袭实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库中的胰腺导管腺癌样本及PANC1、MIA PaCa-2细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2485 | 2026-02-27 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
|
研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A来调控小鼠胚胎干细胞中细胞命运程序的转录抑制机制 | 发现了SMAD1/5通过招募KDM1A去除增强子相关的H3K4me1/2标记，从而调控细胞类型特异性基因表达程序的新机制 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型，在人类细胞或其他生物系统中的普适性尚需验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运的具体分子机制 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | 基因表达数据，染色质修饰数据 | Smad1/5双敲除（S1/5 dKO）和野生型（WT）小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA测序，染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 2486 | 2026-02-26 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
|
研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑亚基DPF2通过调控CACNA1D介导的MAPK通路，在巨噬细胞炎症反应和肠道损伤修复中的关键作用 | 首次发现DPF2缺失通过改变组蛋白修饰（H3K27ac和H3K4me1）调控CACNA1D表达，进而影响细胞内钙水平和MAPK信号通路，最终调节巨噬细胞的炎症极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证的规模可能有限，且具体调控机制中涉及的转录因子或其他共调节因子尚未完全阐明 | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应和肠道再生的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病（IBD）样本、患者来源的类器官 | 单细胞组学与空间转录组学 | 炎症性肠病（IBD） | 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 未明确具体样本数量，但涉及小鼠模型、临床IBD样本和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2487 | 2026-02-26 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
|
综述 | 本文系统总结了单细胞转录组学和表观基因组学方法在阿尔茨海默病研究中的应用，重点阐述了细胞类型和亚型特异性转录组改变的特征 | 整合单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学技术，揭示了疾病轨迹和跨病理阶段的细胞通讯网络，为精准医学提供了新见解 | 本文为综述文章，未报告原始实验数据，其总结依赖于现有研究的发现和局限性 | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解，并为通过识别新的治疗靶点和生物标志物实现精准医学铺平道路 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-seq), 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2488 | 2026-02-26 |
Leveraging RNA-seq deconvolution to improve complex in vitro model characterization
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110510
PMID:40701251
|
研究论文 | 本文评估了利用RNA-seq反卷积技术，结合公开单细胞RNA-seq数据集，从复杂体外模型的bulk RNA-seq数据预测细胞比例，以改进这些模型的表征 | 首次将RNA-seq反卷积技术应用于复杂体外模型（如肠道类器官和睾丸模型）的细胞组成分析，并评估了单细胞数据插补方法对反卷积准确性的提升效果 | 反卷积方法的准确性在不同分析中差异显著，且依赖于公开单细胞数据集的可用性和质量 | 开发新方法以表征复杂体外模型，用于毒理学和药物开发 | 基于干细胞的人肠道类器官CIVM和新生啮齿动物睾丸CIVM | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 反卷积模型 | bulk RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2489 | 2026-02-26 |
Cathepsin K as a key regulator of myocardial fibrosis in dilated cardiomyopathy and a promising therapeutic target
2025-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110421
PMID:40578558
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研究论文 | 本研究通过整合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序，揭示了组织蛋白酶K在扩张型心肌病心肌纤维化中的关键调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定出CTSK在心脏成纤维细胞中的特异性表达，并证实其通过PDGF-BB通路调控细胞增殖而非TGF-β1诱导的转分化 | CTSK敲低仅抑制PDGF-BB诱导的增殖，对TGF-β1诱导的肌成纤维细胞转分化无影响，其具体调控机制仍需进一步研究 | 探究扩张型心肌病中心肌纤维化的关键调控因子及潜在治疗靶点 | 扩张型心肌病患者心脏组织及体外培养的人心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 免疫荧光染色, Masson三色染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2490 | 2026-02-26 |
Genetic deficiency of EXOSC10 ribonuclease disrupts spermatogenesis and male fertility in mice
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110364
PMID:40513949
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研究论文 | 本研究探讨了EXOSC10核糖核酸酶在小鼠雄性生殖细胞减数分裂中的关键作用，揭示其缺失导致精子发生障碍和雄性不育 | 首次在雄性生殖细胞中系统研究EXOSC10的功能，通过条件性敲除模型结合单细胞RNA测序技术，阐明其在减数分裂转录组调控中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类中的功能保守性尚未验证；单细胞测序样本量相对有限 | 探究EXOSC10核糖核酸酶在雄性生殖细胞减数分裂调控中的作用机制 | 小鼠雄性生殖细胞（特别是减数分裂前生殖细胞和精母细胞） | 生殖生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及条件性敲除小鼠的生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2491 | 2026-02-26 |
A tumor necrosis factor-α-responsive cryptic promoter drives overexpression of the human endogenous retrovirus ERVK-7
2025-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108568
PMID:40316021
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研究论文 | 本研究揭示了内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中通过肿瘤坏死因子-α响应的隐蔽启动子驱动的过表达机制 | 发现了ERVK-7的两个新型转录本（ERVK-7.long和ERVK-7.short），并阐明了它们由不同上游启动子驱动、受炎症信号通路差异调控的机制 | 研究主要聚焦于肺腺癌，对其他癌症类型中ERVK-7的调控机制探讨有限 | 探究内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中的表达调控机制及其临床意义 | 人类内源性逆转录病毒ERVK-7及其在肺腺癌中的转录调控 | 表观遗传学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序、表观遗传图谱分析 | NA | RNA-seq数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2492 | 2026-02-26 |
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110206
PMID:40345585
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研究论文 | 本研究探讨NOTCH2信号在小鼠骨骺软骨细胞中对转录组和细胞群体的影响，特别是在炎症反应和骨关节炎发病机制中的作用 | 通过NOTCH2功能获得性突变和条件性模型，结合bulk RNA-Seq和scRNA-Seq分析，揭示了NOTCH2如何增强炎症通路并破坏关节滑膜成纤维细胞的转录组特性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类骨关节炎的复杂性，且样本来源和实验条件存在一定限制 | 探究NOTCH2信号如何调控骨骺软骨细胞的转录组和细胞群体，以理解其在骨关节炎发病机制中的作用 | 小鼠骨骺软骨细胞，包括NOTCH2功能获得性突变模型和条件性表达NICD2的模型 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq (scRNA-Seq) | NA | RNA序列数据 | 来自NOTCH2功能获得性突变小鼠和R26-NICD2小鼠的原代骨骺细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2493 | 2026-02-26 |
A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data
2025-Jun, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.91
PMID:41675510
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综述 | 本文系统回顾并评估了超过10种流行的单细胞RNA测序和ATAC测序数据整合方法 | 强调在生物学相关粒度上进行数据整合的重要性，并考虑不同模态间的固有差异以平衡生物学发现与噪声去除 | 讨论了这些整合方法的数据偏好、局限性、应用挑战及未来方向 | 比较和评估单细胞多模态数据整合方法，以解决细胞间对应关系识别这一挑战性任务 | 单细胞RNA测序数据和ATAC测序数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2494 | 2026-02-26 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.07.642107
PMID:40161587
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析肝癌样本，揭示了肿瘤细胞村庄及其与微环境的共依赖性对肿瘤异质性和患者预后的影响 | 开发了一种基于深度学习的空间动态网络策略，首次将肿瘤细胞状态组织成村庄概念，并展示了其与微环境的特异性分子共依赖性 | 研究样本量有限（50个肿瘤生物样本），且主要聚焦于肝癌，可能不适用于其他癌症类型 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像，单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像，RNA测序数据 | 超过200万个细胞，来自50个肿瘤生物样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2495 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1693937
PMID:41334557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了体外冲击波疗法治疗糖尿病伤口组织的细胞图谱，揭示了该疗法促进组织修复的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了体外冲击波疗法对糖尿病伤口组织的细胞动态和转录重编程影响，并阐明了其通过调节巨噬细胞、成纤维细胞和内皮细胞状态以及增强免疫细胞通讯网络来促进修复的机制 | 研究主要基于转录组层面的分析，缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入探索；样本量相对有限，且为观察性研究，因果关系需进一步验证 | 探究体外冲击波疗法促进糖尿病伤口愈合的细胞和分子机制 | 糖尿病伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约39,475个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2496 | 2026-01-23 |
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1773404
PMID:41567218
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correction | 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2497 | 2026-02-25 |
A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis
2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241873
PMID:40900124
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析、空间转录组学和功能研究，比较了四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞，识别了保守的疾病相关巨噬细胞 | 首次通过跨物种分析识别了狼疮性肾炎中保守的疾病相关单核细胞和巨噬细胞，并验证了小鼠模型在理解人类疾病中的适用性 | 研究主要基于观察性数据，功能机制验证可能有限，且样本量虽大但可能未覆盖所有疾病亚型 | 探索狼疮性肾炎中肾内髓系细胞的改变，并评估小鼠模型在治疗开发中的适用性 | 四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞分析，空间转录组学，功能研究 | NA | 单细胞数据，空间转录组数据 | 155名狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2498 | 2026-02-25 |
Multi-omic profiling reveals age-specific blood biomarkers and aging-driven B cell remodeling in osteoarthritis
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003076
PMID:40696927
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，揭示了骨关节炎（OA）中年龄特异性的血液生物标志物及衰老驱动的B细胞重塑机制 | 识别了五个外周血生物标志物（MAPK1、MAP3K8、ING1、LDLR、NUP153），并建立了基于年龄特异性标志物的优化预测模型，首次揭示了衰老驱动的B细胞重塑在老年OA发病中的关键作用 | 研究样本量有限，且主要聚焦于膝关节OA，未来需在更大队列和其他关节类型中验证 | 开发骨关节炎的非侵入性诊断工具并探索其发病机制，特别是年龄相关的免疫失调 | 骨关节炎患者（包括年轻和老年）的关节组织（四种OA受累关节组织）和外周血样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组分析、单细胞RNA测序、流式细胞术 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞数据 | 217,983个关节细胞进行单细胞RNA测序，具体患者样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2499 | 2026-02-25 |
Unraveling molecular characteristics and functional exploration of panoptosis for prognosis stratification in lung adenocarcinoma: a tumor marker prognostic study
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002968
PMID:40844260
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，揭示了PANoptosis在肺腺癌中的分子特征，并开发了一个预后分层模型 | 首次将PANoptosis与肺腺癌预后关联，并识别出YWHAG-vasopressin-PANoptosis轴作为潜在治疗靶点 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性验证；体外和体内实验样本量有限 | 探索PANoptosis在肺腺癌中的分子机制并建立预后预测模型 | 肺腺癌患者活检样本 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 机器学习组合算法 | 转录组数据、单细胞数据 | 超过1500个肺腺癌及其他癌症活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2500 | 2026-02-25 |
Human microglia in brain assembloids display region-specific diversity and respond to hyperexcitable neurons carrying SCN2A mutation: Microglial diversity and response in assembloids
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657874
PMID:40501840
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研究论文 | 本研究通过构建包含人类小胶质细胞的区域特异性脑类器官和组装体，揭示了小胶质细胞在人类大脑不同区域的多样性及其对神经元过度兴奋的响应机制 | 首次在人类脑类器官和组装体中整合小胶质细胞，系统揭示了其区域特异性亚型多样性，并建立了研究神经免疫相互作用的先进平台 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本规模相对有限 | 探究人类大脑不同区域小胶质细胞的特性及其在神经回路发育和功能中的作用 | 人类小胶质细胞、区域特异性脑类器官（皮质、纹状体、中脑）以及中脑-纹状体组装体 | 神经科学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、钙成像、化学遗传学 | 脑类器官模型、组装体模型 | 单细胞转录组数据、钙信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |