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当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 2441 - 2460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2441 | 2025-11-12 |
STAHD: a scalable and accurate method to detect spatial domains in high-resolution spatial transcriptomics data
2025-Nov-10, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf619
PMID:41212773
|
研究论文 | 提出一种名为STAHD的可扩展且准确的方法，用于检测高分辨率空间转录组数据中的空间域 | 结合图注意力自编码器和多层次k路图分割技术，将大图分解为紧凑子图并生成低维嵌入，提高了计算效率和聚类准确性 | NA | 开发能够处理大规模高分辨率空间转录组数据的空间域检测方法 | 人类和小鼠的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 图注意力自编码器, 多层次k路图分割 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2442 | 2025-11-12 |
Meflin/ISLR is a meningeal cell-specific marker involved in the development of meninges and meningioma progression
2025-Nov-10, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70048
PMID:41213602
|
研究论文 | 本研究探讨Meflin/ISLR在脑膜发育和脑膜瘤进展中的表达模式及功能 | 首次揭示Meflin在脑膜发育早期表达，并发现其高表达与脑膜瘤WNT信号通路激活相关 | Meflin在脑膜瘤进展中的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究Meflin在脑膜发育和脑膜瘤病理生理学中的作用 | 小鼠胚胎脑膜、人类脑膜瘤样本 | 分子生物学 | 脑膜瘤 | 谱系追踪、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | Meflin报告基因小鼠系、人类脑膜瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2443 | 2025-11-12 |
CPE/HYOU1 axis-activated Hippo-YAP signaling pathway suppresses PANoptosis to facilitate osteosarcoma progression
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218121
PMID:41213463
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组数据分析，鉴定出骨肉瘤中PANoptosis相关的预后生物标志物，并揭示了CPE/HYOU1轴通过激活Hippo-YAP信号通路抑制PANoptosis促进骨肉瘤进展的机制 | 首次发现CPE通过增强HYOU1蛋白稳定性并激活Hippo-YAP信号通路来抑制PANoptosis，从而促进骨肉瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 鉴定骨肉瘤中PANoptosis相关的预后生物标志物并阐明其下游调控机制 | 骨肉瘤细胞和肿瘤组织 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组测序，批量RNA测序，免疫荧光，流式细胞术，western blot，异种移植肿瘤实验 | 预后特征模型 | 转录组数据，实验数据 | 公共数据库中的骨肉瘤样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 2444 | 2025-11-12 |
Oligo-CALL: A next-generation barcoding platform for studying resistance to targeted therapy
2025-Nov-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw9990
PMID:41202131
|
研究论文 | 开发了一种名为Oligo-CALL的新型细胞条形码平台，用于研究靶向治疗耐药性 | 开发了Oligo-CALL平台，实现了高效的谱系追踪、活克隆分离以及与单细胞RNA测序的无缝整合 | NA | 研究靶向治疗耐药性的分子机制和谱系演化 | 肺癌细胞 | 单细胞多组学 | 肺癌 | CRISPR-based cellular barcoding, single-cell RNA sequencing | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | Oligo-CALL | 寡核苷酸诱导的CRISPR转录激活因子辅助谱系标记平台 |
| 2445 | 2025-11-12 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
|
研究论文 | 提出一种名为TransST的迁移学习框架，用于提升空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 通过迁移学习自适应利用外部细胞标记信息来改善空间转录组数据分析 | NA | 开发空间转录组数据分析方法以更可靠地提取生物信号 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2446 | 2025-11-12 |
CellSP enables module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Nov-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08891-2
PMID:41193576
|
研究论文 | 本文提出了CellSP计算框架，用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 | 引入了'基因-细胞模块'概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布的基因集 | NA | 开发能够识别和解释亚细胞转录空间分布功能模式的工具 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | 多种组织和技术的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2447 | 2025-11-12 |
Multi-Omics Advances in Major Depressive Disorder for Molecular Insights, Biomarker Discovery, and Therapeutic Development
2025-Nov-05, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.1075
PMID:41213078
|
综述 | 本文综述了多组学技术在重度抑郁症研究中的最新进展，包括分子机制解析、生物标志物发现和治疗方法开发 | 整合多组学方法与计算系统生物学，将多组学信号转化为候选生物标志物和机制导向疗法 | 讨论了当前研究的局限性和转化优先事项 | 通过多组学方法解析重度抑郁症的多因素病因学并开发精准精神病学方法 | 重度抑郁症的分子机制、生物标志物和治疗方法 | 自然语言处理 | 精神疾病 | GWAS、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | AI驱动的网络建模 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 2448 | 2025-11-12 |
Serum response factor is essential for endometrial function and prevention of inflammatory fibrosis
2025-Nov-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2510060122
PMID:41150713
|
研究论文 | 本研究揭示血清反应因子(SRF)对子宫内膜功能和防止炎症性纤维化的重要作用 | 首次发现SRF在子宫内膜中的关键功能及其在子宫内膜异位症中的失调机制 | 动物模型与人类疾病的差异可能限制结果的直接转化应用 | 探究SRF在子宫内膜功能和生殖成功中的分子机制 | 人类子宫内膜异位症患者组织、人子宫内膜基质细胞、条件性基因敲除小鼠 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 免疫组织化学分析、RNA干扰、单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、组织学图像 | 人类子宫内膜异位症患者组织样本和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2449 | 2025-11-12 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
|
研究论文 | 提出了一种名为STORIES的新计算方法，通过最优传输学习空间转录组数据中的细胞命运景观 | 将最优传输扩展到空间转录组数据分析，学习空间感知的细胞分化潜能 | NA | 从多个时间点的空间转录组数据推断细胞命运轨迹 | 空间转录组数据，特别是蝾螈神经再生和小鼠胶质细胞生成过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输，神经网络 | 空间转录组数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 2450 | 2025-11-12 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 通过连续去噪和语义特征整合，学习瞬态细胞状态并预测时间和条件下高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的反应，促进细胞命运决定调控原理的理解 | 细胞分化、基因扰动和药物反应预测，血管类器官发育，中子辐射和生长因子反应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2451 | 2025-11-12 |
MYEOV Is a Novel Marker of Differentiated Corneal Epithelium
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.7
PMID:41186354
|
研究论文 | 本研究揭示了MYEOV作为角膜上皮分化标志物的特异性表达及其调控机制 | 首次发现MYEOV在KRT12阳性角膜上皮细胞中特异性高表达，且受PAX6和KLF4调控 | 研究主要基于体外实验和免疫染色分析，缺乏体内功能验证 | 表征MYEOV在人类眼表组织中的表达和调控机制 | 人类角膜上皮细胞和角膜组织 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | RNA测序，免疫染色，基因敲低，Western blot，细胞增殖检测 | NA | 图像，基因表达数据 | 人类角膜组织及体外培养的角膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2452 | 2025-11-10 |
Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease
2025-Jun, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-024-01109-8
PMID:39743564
|
综述 | 本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病状态下的功能多样性、发育起源及其在心脏稳态和病理过程中的作用 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域 | NA | 探讨心脏巨噬细胞的发育起源、功能多样性及其在心脏疾病发病机制中的作用 | 心脏巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2453 | 2025-11-12 |
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-Cell/Nuclei RNA Sequencing Data
2025-Apr-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.12.589216
PMID:38659857
|
研究论文 | 本研究系统评估了单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确性 | 建立了基于大量数据的数据驱动阈值来优化研究设计，并开发了VICE工具评估数据质量和估计差异表达真阳性率 | 研究主要关注单细胞水平的精确度和准确性，可能未涵盖所有技术变异来源 | 评估单细胞/单核RNA测序数据的定量测量性能并建立优化指南 | 单细胞和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,682,576个细胞来自339个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 2454 | 2025-11-11 |
Harnessing Arginase-2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive Cutaneous T cell Lymphoma
2025-Nov-10, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf450
PMID:41208405
|
研究论文 | 本研究证明ARG2特异性CD8⁺ T细胞能够靶向识别并杀伤表达ARG2的皮肤T细胞淋巴瘤细胞 | 首次发现ARG2特异性CD8⁺ T细胞可靶向识别恶性CTCL细胞，揭示了ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的潜力 | 研究仅使用了8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集，样本量有限 | 探索ARG2特异性CD8⁺ T细胞靶向治疗皮肤T细胞淋巴瘤的新免疫治疗策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤细胞系和患者病灶中的恶性T细胞 | 免疫治疗 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | western blotting, 单细胞RNA测序, IFN-γ ELISPOT, CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 蛋白质印迹数据, 单细胞RNA测序数据, 细胞因子分泌数据 | 8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集中的CTCL患者病灶 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2455 | 2025-11-11 |
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2025-Nov-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003561
PMID:41208796
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研究论文 | 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴调控线粒体生物合成抑制铁死亡，从而缓解主动脉夹层的机制 | 首次揭示硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴调控线粒体生物合成抑制铁死亡的新机制 | 动物模型和细胞实验仍需临床验证 | 探究硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其分子机制 | 小鼠主动脉夹层模型和血管平滑肌细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,转录组分析,siRNA敲低 | 动物模型,细胞模型 | 基因表达数据,病理数据 | 小鼠模型和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 2456 | 2025-11-11 |
LMO7 Suppresses Tumor-Associated Macrophage Phagocytosis of Tumor Cells Through Degradation of LRP1
2025-Nov-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511162
PMID:41208232
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研究论文 | 本研究揭示了LMO7通过降解LRP1抑制肿瘤相关巨噬细胞吞噬肿瘤细胞的机制 | 首次发现LMO7通过促进LRP1的K48连接多聚泛素化降解来抑制巨噬细胞吞噬功能，并证明LMO7缺失与SIRPα阻断联合治疗的协同抗肿瘤效果 | NA | 探究LMO7在肿瘤相关巨噬细胞功能调控中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2457 | 2025-11-11 |
Integrative SMR and single cell & spatial analysis reveals the spatial heterogeneity and prognostic value of CASP9-mediated apoptotic pathways in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03798-0
PMID:41201629
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了CASP9介导的凋亡通路在透明细胞肾细胞癌中的空间异质性及其预后价值 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学与孟德尔随机化方法结合，系统解析了CASP9驱动的凋亡程序在肾癌中的空间组织和免疫抑制功能 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步实验验证CASP9在肿瘤-巨噬细胞相互作用中的具体机制 | 阐明凋亡相关基因程序在透明细胞肾细胞癌中的空间动态、转录异质性和预后相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织中的恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 | LASSO Cox回归, DeepSurv | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组数据 | TCGA和E-MTAB-1980队列的透明细胞肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2458 | 2025-11-11 |
EGR4 transcriptionally upregulates GDF15 to promote gastric cancer metastasis
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08095-w
PMID:41203604
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现EGR4通过转录上调GDF15促进胃癌转移的新机制 | 首次发现EGR4/GDF15轴在胃癌转移中的关键作用，并揭示了其通过ErbB受体异源二聚化和CAF激活的双重促转移机制 | 样本量较小（仅6例患者），需要更大规模研究验证 | 探究胃癌转移的分子驱动机制 | 胃癌患者原发肿瘤和匹配的转移淋巴结 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, ChIP-seq数据 | 6例胃癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2459 | 2025-11-11 |
Targeting the ac4C 'Writer' NAT10 enhances pancreatic cancer immunotherapy via dual modulation of CD8+ T cells and tumor cells
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08156-0
PMID:41203621
|
研究论文 | 本研究探索了NAT10介导的ac4C RNA修饰在胰腺癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 首次揭示NAT10通过ac4C乙酰化稳定ETS2和KRT8 mRNA，形成正反馈环上调PD-L1表达，促进胰腺癌免疫逃逸 | NA | 探索NAT10在胰腺癌免疫治疗耐药中的作用机制及治疗潜力 | 胰腺癌细胞、CD8+T细胞、肿瘤微环境 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2460 | 2025-11-11 |
The transcription factor ZEB2 mediates the antitumor efficacy of tumor-infiltrating lymphocytes in non-small cell lung cancer
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08112-y
PMID:41203628
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现转录因子ZEB2在非小细胞肺癌中驱动CD8+T细胞向细胞毒性效应轨迹分化 | 首次通过metaVIPER单细胞RNA测序分析揭示ZEB2作为主调节子在CD8+T细胞分化中的关键作用，并发现T-bet/ZEB2轴在肺癌免疫治疗中的新机制 | 研究样本量较小（14例初治患者），且动物模型结果需要进一步临床验证 | 探索非小细胞肺癌中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能调节机制，寻找改善免疫检查点阻断治疗效果的策略 | 非小细胞肺癌患者CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、小鼠肺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，metaVIPER分析，体外细胞实验，动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 14例初治非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |