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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2441 | 2026-03-03 |
Population analysis and immunologic landscape of melanoma in people living with HIV
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.648995
PMID:40313919
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研究论文 | 本研究通过分析HIV感染者(PLWH)与HIV阴性者(PLw/oH)的黑色素瘤临床数据,结合空间免疫转录组学和多色免疫荧光技术,揭示了PLWH患者肿瘤微环境的免疫抑制特征及其与不良临床结局的关联 | 首次在HIV感染背景下,结合大规模临床队列分析与空间免疫转录组学技术,系统揭示了黑色素瘤肿瘤微环境的免疫抑制特征及其与治疗延迟、脑转移风险增加和生存率降低的关联 | 样本量相对有限(空间转录组学n=11,多色免疫荧光n=29),且为回顾性研究,可能受混杂因素影响 | 剖析HIV感染者黑色素瘤的临床和免疫学特征,以解释其比HIV阴性患者更差的临床结局 | HIV感染者(PLWH)和HIV阴性者(PLw/oH)的黑色素瘤患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间免疫转录组学,多色免疫荧光 | NA | 电子健康记录,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 临床队列:1,019名PLWH和373,121名PLw/oH;空间转录组:11个肿瘤样本;多色免疫荧光:15名PLWH和14名PLw/oH的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2442 | 2026-03-03 |
Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas
2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.08.584091
PMID:38559270
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研究论文 | 本研究揭示了自噬在突变IDH1胶质瘤生存中的关键作用,并通过靶向Atg7抑制自噬,增强了肿瘤对放疗的敏感性 | 首次发现mIDH1胶质瘤通过表观遗传重编程激活自噬作为能量来源,并开发了靶向Atg7的合成蛋白纳米颗粒siRNA递送系统,在体内实现放疗增敏 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和患者样本分析,临床转化效果仍需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 突变IDH1胶质瘤细胞、患者肿瘤样本、基因工程小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, siRNA纳米递送 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据、单细胞转录组数据 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤细胞及患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 2443 | 2026-03-03 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
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综述 | 本文综述了在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中,胶质细胞(特别是小胶质细胞)在神经免疫反应中的作用,以及转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学等技术在揭示胶质细胞亚群和功能中的应用 | 整合了多种组学方法(如单细胞RNA测序、空间转录组学和核糖体标记策略)来阐明胶质细胞在缺血性疾病中的动态响应,并强调了这些技术在识别新型细胞亚型和生成新假设方面的潜力 | NA | 阐明胶质细胞在急性缺血性中风和慢性脑小血管病中的神经免疫反应,并探索多组学方法在进一步解析这些反应中的应用 | 胶质细胞,包括小胶质细胞和星形胶质细胞,在缺血性中风和脑小血管病中的响应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核糖体标记策略, 转录组分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2444 | 2026-03-03 |
All the single cells: Single-cell transcriptomics/epigenomics experimental design and analysis considerations for glial biologists
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24633
PMID:39558887
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综述 | 本文为胶质细胞生物学家提供单细胞RNA-seq实验设计与分析的入门指南 | 针对胶质细胞研究领域,系统梳理单细胞组学实验设计与分析的关键决策点 | 作为入门指南,未涉及具体算法或工具的深入技术细节 | 提升胶质生物学家对单细胞组学数据的分析、解释与批判能力 | 胶质细胞及其在神经疾病中的亚型与功能 | 单细胞组学 | 神经疾病 | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2445 | 2026-03-03 |
Analysis of human neutrophils from nasal polyps by single-cell RNA sequencing reveals roles of neutrophils in chronic rhinosinusitis
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.032
PMID:39522652
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的中性粒细胞,揭示了其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的潜在作用及异质性 | 首次利用基于微孔的单细胞RNA测序技术,对鼻息肉组织中的中性粒细胞进行高分辨率分析,揭示了其基因表达谱的改变和亚群异质性 | 样本量较小(5例对照、5例鼻息肉组织),且仅分析了粒细胞富集样本,可能未完全捕获所有细胞类型 | 揭示中性粒细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用和异质性 | 鼻息肉组织、对照鼻窦组织及患者匹配的外周血样本中的中性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | Benjamini-Hochberg算法、通路富集分析、基因本体富集分析 | 单细胞转录组数据 | 5例对照鼻窦组织、5例鼻息肉组织及匹配外周血样本 | 未明确 | 单细胞RNA-seq | 微孔基单细胞RNA测序检测方法 | 新型基于微孔的单细胞RNA测序检测方法,使用粒细胞富集样本 |
| 2446 | 2026-03-03 |
Microglial Responses to Alzheimer's Disease Pathology: Insights From "Omics" Studies
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24666
PMID:39760224
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综述 | 本文综述了利用多种组学技术研究阿尔茨海默病小鼠模型中小胶质细胞反应的文献,旨在阐明小胶质细胞在AD病理中的作用机制 | 整合了多种组学技术(如单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学等)来系统分析AD小鼠模型中小胶质细胞的异质性和分子模式变化 | 主要基于小鼠模型研究,可能无法完全反映人类AD的复杂性;且为综述性文章,未提供原始实验数据 | 阐明小胶质细胞在阿尔茨海默病病理中的驱动和贡献机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学、蛋白质组学、脂质组学、代谢组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2447 | 2026-03-03 |
Techniques and analytic workflow for spatial transcriptomics and its application to allergy and inflammation
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.009
PMID:39837466
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术及其在过敏和炎症研究中的应用,重点关注数据处理和分析方法 | 通过整合单细胞基因表达数据与细胞定位,在完整空间背景下提供前所未有的生物学见解,为数据解释增加新维度 | NA | 总结空间转录组学领域的最新进展及其在过敏和炎症研究中的应用 | 过敏和炎症疾病,如特应性皮炎和慢性阻塞性肺疾病 | 数字病理学 | 过敏和炎症疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2448 | 2026-03-03 |
Deciphering key roles of B cells in prognostication and tailored therapeutic strategies for lung adenocarcinoma: a multi-omics and machine learning approach towards predictive, preventive, and personalized treatment strategies
2025-Mar, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-024-00390-4
PMID:39991096
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研究论文 | 本研究通过多组学和机器学习方法,揭示了B细胞在肺腺癌预后中的关键作用,并开发了SRBS评分以支持预测性、预防性和个性化治疗策略 | 整合了多组学数据(包括bulk RNA、ATAC-seq、单细胞RNA和空间转录组测序)和机器学习算法,首次构建了与B细胞相关的SRBS评分,用于肺腺癌的预后预测和个性化治疗指导 | 未明确说明样本量大小,且实验验证部分可能有限,需要进一步临床验证 | 探索B细胞在肺腺癌预后中的作用,并开发个性化治疗策略以改善患者结局 | 肺腺癌患者及其相关的多组学数据 | 机器学习 | 肺癌 | 多组学整合分析,包括bulk RNA-seq、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组测序 | 多种机器学习算法整合 | 多组学数据(RNA、ATAC、单细胞、空间转录组) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 2449 | 2026-03-03 |
Spatial Transcriptomics in Inflammatory Skin Diseases Using GeoMx Digital Spatial Profiling: A Practical Guide for Applications in Dermatology
2025-Jan, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100317
PMID:39559817
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研究论文 | 本文提供了使用NanoString GeoMx数字空间分析仪在炎症性皮肤病中进行空间转录组学研究的实用指南 | 提供了制造商指南中未包含的RNA捕获优化方法和潜在问题解决方案,并通过具体疾病案例展示了空间分析策略 | 主要关注GeoMx平台在皮肤病学的应用,可能不直接适用于其他空间转录组技术或其他组织类型 | 为皮肤病研究者提供数字空间分析技术的实用操作指南和优化策略 | 炎症性皮肤病(银屑病、扁平苔藓、盘状红斑狼疮)的组织样本 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 2450 | 2026-03-03 |
Network pharmacology, bioinformatics and in vitro/in vivo validation elucidate the anti-lung cancer activities and potential targets of Rhoifolin
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727729
PMID:41614077
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、生物信息学及体外/体内实验,系统探讨了Rhoifolin的抗肺癌活性及其潜在分子靶点EPHB2 | 首次将网络药理学、转录组学与机器学习相结合,识别出EPHB2作为Rhoifolin的关键治疗靶点,并通过分子对接、动力学模拟及体内外实验验证了其直接作用机制 | 研究主要基于H358细胞系和小鼠异种移植模型,临床前数据需在更多肺癌模型和临床试验中进一步验证 | 系统研究Rhoifolin的抗肿瘤效应并识别其关键分子靶点,为肺癌治疗提供新策略 | 肺癌细胞系(如H358)及H358异种移植小鼠模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、转录组分析、机器学习、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子对接、动力学模拟 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 体外细胞实验及H358异种移植小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2451 | 2026-03-02 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
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研究论文 | 本研究利用人类神经类器官模型,通过单细胞RNA测序分析了脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序动态影响 | 首次在可扩展的人类神经类器官模型中,通过单细胞测序揭示了血液暴露引起的细胞特异性转录组变化及其时间动态性,并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内脑出血的复杂微环境;样本量相对有限(18个类器官) | 探究脑出血后血液诱导的继发性神经损伤对不同脑细胞类型的影响,以优化手术清除时机 | 人类神经类器官,包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞测序 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官,共96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2452 | 2026-03-02 |
Deconvoluting single-cell transcriptomics reveals cellular programs regulated by cell-cell communication in colorectal cancer
2025-Sep-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.648030
PMID:40321215
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荟萃分析 | 本研究通过整合八个单细胞队列数据,开发了一种新颖的分析框架,以揭示结直肠癌中细胞间通讯网络及其调控的细胞程序 | 采用分层主题建模识别反映单细胞信号状态的基因表达模块,并结合因果发现方法系统揭示可能受配体-受体信号和跨细胞类型通讯调控的模块,通过空间转录组学验证了这些模块在空间域中的共定位 | NA | 深入理解结直肠癌中细胞间通讯网络的复杂性及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠癌患者样本中的单细胞转录组数据 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 分层主题建模,因果发现方法 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 153名患者,279个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2453 | 2026-03-02 |
Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation
2025-Sep, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00952-9
PMID:40897908
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术,揭示了神经相关巨噬细胞在脂肪组织稳态和年龄相关炎症中的关键作用 | 首次定义了神经相关巨噬细胞作为脂肪组织巨噬细胞的一个特殊亚群,并发现其随年龄减少会加剧炎症和脂解功能障碍 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证 | 探究脂肪组织巨噬细胞在年龄相关炎症中的作用机制 | 小鼠脂肪组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 年龄相关炎症 | 单细胞测序,多参数流式细胞术,血管内标记 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2454 | 2026-03-02 |
Dynamic GLUT trafficking at high glucose levels enhances insulin secretion: Dysregulation leads to decreased insulin secretion during type 2 diabetes
2025-Aug-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2425955122
PMID:40811462
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研究论文 | 本研究揭示了葡萄糖转运蛋白(GLUT)在高葡萄糖浓度下的动态转运机制及其在胰岛素分泌中的作用,并发现2型糖尿病中该过程的失调 | 首次阐明了GLUT在β细胞质膜上的招募与网格蛋白介导的内存作用之间的动态耦合关系,并揭示了其在2型糖尿病胰岛素分泌缺陷中的作用 | 研究主要基于体外细胞模型和人类胰岛组织,体内生理环境下的验证尚需进一步研究 | 探究葡萄糖刺激下GLUT转运的动态调控机制及其在2型糖尿病胰岛素分泌障碍中的作用 | 胰腺β细胞、人类胰岛组织(来自非糖尿病和2型糖尿病供体) | 细胞生物学与糖尿病研究 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、分子生物学技术 | NA | 基因表达数据、细胞成像数据 | 人类胰岛组织(非糖尿病与2型糖尿病供体) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2455 | 2026-03-02 |
Cell type-specific master metabolic regulators of Alzheimer's disease
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664443
PMID:40791427
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研究论文 | 本研究开发了一种名为scFUMES的算法,用于识别阿尔茨海默病中细胞类型特异性的主要代谢调控因子,并揭示了神经元和小胶质细胞在疾病中的代谢异质性 | 开发了scFUMES算法,首次整合单细胞RNA测序、相互作用组学、基因组学、转录组学和代谢组学数据,系统性地绘制了AD中细胞类型特异性的主要代谢调控因子网络 | 研究主要基于人类脑库的组学数据,实验验证部分有限,且算法在更广泛疾病类型中的应用效果尚待检验 | 揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性的代谢异质性及其调控机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 人类大脑组织(来自脑库),重点关注神经元和小胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,相互作用组学,基因组学,转录组学,代谢组学 | scFUMES算法(整合多组学数据的计算模型) | 多组学数据(包括RNA-seq、基因组、转录组、代谢组数据) | 来自两个AD易感区域(颞中回和背外侧前额叶皮层)的人类脑组织样本,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2456 | 2026-03-02 |
Preterm birth increases susceptibility to hyperglycemia induced glomerular alterations in male mice
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00103-5
PMID:40442182
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研究论文 | 本研究探讨了早产如何增加雄性小鼠在高血糖条件下发生肾小球和肾小管损伤的易感性 | 首次研究了早产对糖尿病肾病进展的影响,并利用单细胞RNA测序揭示了早产糖尿病小鼠内皮细胞与足细胞相互作用的特异性改变 | 研究仅使用雄性小鼠,未探讨性别差异;样本量未明确说明;研究结果基于动物模型,需在人类中进一步验证 | 确定早产对暴露于高血糖后肾脏健康的影响 | CD-1品系的早产(19天受孕后)和足月产(20天受孕后)雄性小鼠 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,分子技术,成像技术 | NA | 基因表达数据,组织图像,生理指标数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2457 | 2026-03-02 |
Emerging Techniques in Spatial Multiomics: Fundamental Principles and Applications to Dermatology
2025-May, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.09.006
PMID:39503694
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综述 | 本文综述了新兴的空间多组学技术的基本原理及其在皮肤病学研究中的应用 | 介绍了空间多组学技术如何同时捕获DNA、基因组可及性、组蛋白修饰和蛋白质,并在单细胞分辨率下保留空间背景,为皮肤病研究提供新视角 | NA | 概述空间多组学技术的原理、优势、局限性及其在皮肤病学中的研究潜力 | 皮肤组织切片 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间多组学技术 | NA | 基因组、蛋白质组、表观基因组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 2458 | 2026-03-02 |
Citrullination of NF-κB p65 by PAD2 as a Novel Therapeutic Target for Modulating Macrophage Polarization in Acute Lung Injury
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413253
PMID:40087815
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研究论文 | 本文发现PAD2通过瓜氨酸化NF-κB p65的R171位点调控巨噬细胞极化,并开发了一种基于金纳米颗粒的靶向治疗策略,用于治疗铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤 | 首次鉴定出NF-κB p65的R171瓜氨酸化位点及其在巨噬细胞极化中的作用,并创新性地设计了靶向M1巨噬细胞的纳米药物治疗策略 | 研究主要聚焦于PA诱导的ALI模型,其他病原体或损伤类型中的适用性未验证,纳米药物的长期安全性和临床转化潜力需进一步评估 | 探究PAD2介导的瓜氨酸化在巨噬细胞极化中的作用机制,并开发针对急性肺损伤的靶向治疗策略 | 巨噬细胞极化过程、NF-κB p65蛋白、铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 生物医学研究 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、基于质谱的蛋白质组学、纳米药物递送 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2459 | 2026-03-02 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的增强作用 | 揭示了STAT3在胚胎植入后发育中的时间控制作用,特别是在需要快速细胞分裂的组织中,如植入后外胚层和造血谱系 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性仅通过突变与矮小症的关联间接提及 | 研究STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中的功能 | 小鼠胚胎、胚胎干细胞、植入后外胚层和造血谱系 | 发育生物学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠胚胎和胚胎干细胞样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2460 | 2026-03-02 |
Single cell RNA sequencing after moderate traumatic brain injury: effects of therapeutic hypothermia
2025-Apr-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03430-6
PMID:40251570
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了中度创伤性脑损伤后治疗性低温对脑皮层细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在创伤性脑损伤模型中应用单细胞RNA测序技术,全面评估治疗性低温对不同细胞亚型的特异性调控作用,揭示了温度敏感的胶质细胞和血管细胞过程在神经保护中的重要性 | 研究仅关注了损伤后24小时的时间点,未评估长期效应;样本来源于小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病情况 | 探究治疗性低温在创伤性脑损伤后的细胞类型特异性保护机制 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织,包括损伤周围区域 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |