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当前共找到 10617 篇文献,本页显示第 2441 - 2460 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2441 2025-12-05
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SIID的算法,用于整合不同空间转录组学平台的数据,通过联合非负矩阵分解模型实现基因表达的插补和细胞类型特异性表达的解卷积 首次提出能够同时处理空间转录组数据插补和解卷积的联合模型,通过空间对齐和联合非负矩阵分解,有效整合不同分辨率和技术特点的平台数据 算法性能依赖于配对数据集的质量和空间对齐的准确性,在技术平台差异过大时可能效果受限 开发能够整合不同空间转录组学平台数据的算法,实现基因表达插补和细胞类型解卷积 空间转录组学数据,特别是来自不同技术平台(如10x Genomics Visium和Xenium)的配对数据集 空间转录组学 乳腺癌, 结肠癌 空间转录组学技术 联合非负矩阵分解模型 空间基因表达数据 人类乳腺癌和结肠癌组织样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Xenium 10x Visium(全转录组,多细胞分辨率), 10x Xenium(靶向数百个基因,亚细胞分辨率)
2442 2025-12-05
Immunological and Prognostic Profiling of Triple-Negative Breast Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing of T-Cell Exhaustion
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序分析三阴性乳腺癌中的T细胞耗竭特征,构建风险评分模型并评估其与患者预后及免疫治疗响应的关系 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统分析三阴性乳腺癌中T细胞耗竭的免疫学特征,并构建基于TEX相关基因的风险评分模型用于预后评估 研究仅基于公开数据集GSE161529,缺乏独立验证队列和实验验证,样本量相对有限 评估T细胞耗竭特征对三阴性乳腺癌患者免疫治疗响应的影响,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的T细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 风险评分模型 RNA测序数据 12,477个高质量细胞,来自GSE161529数据集 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
2443 2025-12-05
Infiltration of CXCL9+ macrophages confers a favorable prognosis in breast cancer: Insights from an integrated single-cell RNA and bulk RNA sequencing study
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序,揭示了CXCL9+巨噬细胞在乳腺癌中的浸润与患者良好预后相关,并构建了基于相关基因的生存风险模型 首次通过单细胞和bulk RNA测序整合分析,识别出CXCL9+巨噬细胞作为乳腺癌预后良好的关键细胞亚群,并验证了其通过CXCL9/10/11-CXCR3轴激活T细胞和NK细胞的抑制肿瘤机制 研究主要基于测序数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源和数量未具体说明,可能影响结论的普适性 探究乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性,识别与生存预后相关的关键细胞类型,并开发免疫治疗新靶点 乳腺癌肿瘤组织中的免疫细胞(特别是巨噬细胞亚群)及乳腺癌细胞系 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, 体外细胞实验 反卷积算法, 生存风险模型 RNA测序数据, 细胞实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2444 2025-12-05
Integrated multi-omics analysis reveals necroptosis-related biomarker BIRC3 for early diagnosis and therapeutic targeting in preeclampsia
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了坏死性凋亡相关基因BIRC3作为先兆子痫早期诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 首次将坏死性凋亡与先兆子痫发病机制联系起来,并通过多组学验证确定了BIRC3作为新型诊断标志物 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;样本量有限且依赖于现有数据库 识别先兆子痫的坏死性凋亡相关生物标志物,并通过虚拟筛选寻找潜在天然化合物 先兆子痫患者胎盘组织及相关基因表达数据 生物信息学 先兆子痫 单细胞RNA测序,机器学习,分子对接 随机森林 基因表达数据 多个公共数据集(GSE66273、GSE44711、GSE173193) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2445 2025-12-05
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过综合转录组学、孟德尔随机化和机器学习分析,探讨了内质网应激相关基因DNAJB1在慢性阻塞性肺疾病中的风险作用和临床价值 首次将DNAJB1识别为COPD的风险基因,并利用单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法构建了一个包含九个关键基因的诊断标志物组合 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和具体数据细节未明确说明 识别与COPD发病和进展相关的遗传变异和新型生物标志物,以改善临床预后 慢性阻塞性肺疾病患者及相关基因数据 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞测序、微阵列数据分析 机器学习 转录组数据、单细胞测序数据、微阵列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2446 2025-12-05
Single-cell RNA-seq combined with bulk RNA-seq explores shared gene signatures between thyroid and breast cancers
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了甲状腺癌和乳腺癌之间的共享基因特征和潜在治疗靶点 结合单细胞和bulk转录组数据,应用细胞反卷积和WGCNA分析,首次系统性地识别了两种癌症共有的关键基因模块和信号通路 研究样本量有限,且主要基于转录组数据,缺乏功能实验验证这些基因在癌症发生发展中的具体机制 识别乳腺癌和甲状腺癌共有的关键基因和共享治疗靶点 乳腺癌和甲状腺癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织 生物信息学 乳腺癌, 甲状腺癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, 免疫组化 机器学习方法 转录组数据, 单细胞数据 未明确指定样本数量,但包括两种癌症患者的临床样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2447 2025-12-05
Potential marker genes for psoriasis revealed based on single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别了与银屑病风险相关的七个候选基因,并探讨了它们在CD4+ T细胞中的表达及免疫通路中的作用 首次结合单细胞转录组数据与孟德尔随机化分析来识别银屑病的遗传标记基因,并聚焦于CD4+ T细胞中的表达 研究依赖于公开数据库数据,样本量相对有限,且未进行实验验证 探究银屑病的分子机制,识别潜在的生物标志物和治疗靶点 银屑病患者和健康对照的皮肤样本 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 Seurat包用于数据处理 单细胞转录组数据 174个皮肤样本(92个来自银屑病患者,82个来自健康对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2448 2025-12-04
cGAS-STING signaling in the tumor microenvironment induces myeloid cell activation and favors T cell-mediated antitumor immunity
2025-Dec-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序技术,揭示了STING激动剂通过重塑肿瘤微环境中的免疫细胞图谱,增强先天和适应性免疫反应,从而促进抗肿瘤免疫的机制 首次在胰腺癌同基因肿瘤模型中,通过单细胞转录组测序系统描绘了STING激动剂诱导的肿瘤微环境多细胞谱系转录重编程全景图 临床转化面临药代动力学限制和潜在全身毒性的挑战,需要进一步优化STING激动剂的递送方式和剂量 探究STING信号通路在肿瘤微环境中如何调控免疫细胞功能并促进T细胞介导的抗肿瘤免疫 胰腺癌同基因肿瘤模型中的肿瘤微环境免疫细胞 单细胞组学 胰腺癌 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2449 2025-12-04
Elevated 5-HTR7 deteriorates dysregulated megakaryocytopoiesis in immune thrombocytopenic purpura via upregulating the PKA/Orai1/ERK1/2 pathway
2025-Dec-01, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了5-羟色胺受体7(5-HTR7)在免疫性血小板减少性紫癜(ITP)中通过上调PKA/Orai1/ERK1/2通路损害巨核细胞成熟并导致血小板减少的机制 首次揭示了5-HTR7在ITP发病机制中的具体作用,并阐明了其通过PKA/Orai1/ERK轴抑制钙离子内流从而损害巨核细胞成熟的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,其临床转化效果仍需进一步验证 探究5-HTR7在ITP中调控巨核细胞生成障碍的分子机制 ITP患者的巨核细胞及小鼠ITP模型 NA 免疫性血小板减少性紫癜 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blot、共聚焦显微镜 NA 测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据 未明确具体样本数量,涉及ITP患者和健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2450 2025-12-04
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-Dec-01, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期小鼠皮下脂肪组织中DPP4+前脂肪细胞群的扩张机制,并发现IGF2在此过程中驱动细胞增殖而非分化 首次识别出断奶前小鼠皮下脂肪网状间质中表达IGF2的DPP4+前体细胞群,并阐明IGF2在促进前脂肪细胞扩张中的时间限制性作用 研究仅基于小鼠模型,未在人类组织中验证;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 探究早期生命阶段脂肪组织快速扩张的细胞机制,以理解代谢健康性肥胖 断奶前和成年小鼠的皮下脂肪组织 单细胞组学 肥胖 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠皮下脂肪组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2451 2025-12-04
Depleting IL1R2+ Tumor-Infiltrating Regulatory T Cells with an ADCC-Prone Nanobody Construct Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy
2025-Dec-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)表面的IL1R2,开发了一种ADCC倾向的纳米抗体构建体,以增强抗PD-1免疫疗法的疗效 首次将IL1R2鉴定为高度活化和强抑制性肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)的表面标志物,并开发了具有优化ADCC功能的抗IL1R2纳米抗体-Fc构建体,可特异性清除IL1R2+ tiTregs,并与抗PD-1疗法产生协同抗肿瘤效应 研究主要基于小鼠模型和人类数据集的分析,尚未在临床环境中验证;IL1R2受体本身对tiTreg的丰度和活化并非必需,其具体功能机制有待进一步阐明 探索特异性靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)以增强免疫检查点阻断疗法疗效的策略 三阴性乳腺癌(TNBC)和结直肠癌小鼠模型以及人类TNBC和结直肠癌数据集中的肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg) 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌,结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞转录组和表位测序索引(CITE-seq),荟萃分析 NA 单细胞转录组数据,表位数据,测序数据 来自小鼠模型和人类数据集(TNBC和结直肠癌)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2452 2025-12-04
CCNE1 Exerts a Protective Effect on Parkinson's Disease by Regulating Ferroptosis-Related Proteins
2025-Dec, Brain and behavior IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析揭示了CCNE1通过上调PARP16表达调控铁死亡,从而对帕金森病发挥神经保护作用的分子机制 首次从分子层面阐明了CCNE1通过调控铁死亡关键蛋白PARP16发挥神经保护作用的机制,为帕金森病研究提供了新视角 孟德尔随机化分析存在潜在的多效性偏倚风险,且机制验证主要依赖于生物信息学分析 探究铁死亡相关蛋白如何通过遗传变异调控帕金森病风险 帕金森病患者相关的蛋白质与基因 生物信息学 帕金森病 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、转录组分析 两样本孟德尔随机化、中介分析 遗传变异数据、蛋白质定量性状位点数据、基因表达数据 基于UKB-PPP和deCODE研究的pQTL数据及PD GWAS数据,涉及210个显著相关蛋白 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2453 2025-12-04
Development and Validation of a Prognostic Model for Lung Cancer Based on Machine Learning and Immune Microenvironment Analysis
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究基于机器学习和免疫微环境分析,开发并验证了一个用于肺癌的预后模型 整合了多种机器学习算法和单细胞RNA测序数据,识别了关键的免疫基因和细胞间通讯网络,为肺癌预后提供了新的预测工具和免疫学见解 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的数据,可能存在样本选择偏差,且模型在独立队列中的验证未在摘要中明确说明 开发一个准确的肺癌预后预测工具,并探究免疫微环境在肺癌进展和治疗反应中的作用 肺癌患者及其RNA表达谱和临床数据 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 多种机器学习算法组合 RNA表达谱数据, 临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2454 2025-12-04
Epigenetic Regulation of G6PD Drives Metabolic Reprogramming in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Dec, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用,特别是G6PD和戊糖磷酸途径的调控 首次将增强子介导的表观遗传调控与肝内胆管癌中的G6PD过表达和戊糖磷酸途径活性联系起来,揭示了肿瘤特异性增强子作为关键表观遗传驱动因子的新作用 未来研究需探索将增强子分析整合到精准医学框架中,并开发新的增强子靶向策略 研究肿瘤特异性增强子在肝内胆管癌代谢重编程中的作用及其治疗潜力 肝内胆管癌肿瘤上皮细胞 表观遗传学 肝内胆管癌 原生延伸转录本捕获分析基因表达,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2455 2025-12-04
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Effect of Commensal Bacteria on the Multistep Development of Esophageal Cancer
2025-Dec, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了食管共生菌在食管鳞状细胞癌多阶段发展中的作用,包括其对上皮细胞恶性转化和炎症性成纤维细胞形成的影响 首次在单细胞水平上系统分析了食管共生菌在ESCC肿瘤微环境中的异质性分布及其对慢性炎症和免疫抑制状态的调控机制 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需进一步验证;抗生素处理可能产生非特异性效应 阐明食管共生菌在食管鳞状细胞癌发生发展中的具体作用机制 小鼠自发性食管鳞状细胞癌模型中的54,562个单细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 54,562个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2456 2025-12-04
Integration of scRNA-Seq and scATAC-Seq Reveals Malignant Characteristics of Sarcomatoid Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025-Dec, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,揭示了肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征 首次利用scATAC-seq识别肉瘤样分化肿瘤细胞的转录调控特征,并鉴定出DST、FRMD4A和PREX2作为该疾病的肿瘤标志物 研究仅基于单例患者样本,样本量较小,可能影响结果的普遍性 阐明肉瘤样透明细胞肾细胞癌的恶性特征,为诊断和治疗提供新见解 肉瘤样透明细胞肾细胞癌患者样本 数字病理学 肾细胞癌 scRNA-seq, scATAC-seq, WES NA 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、全外显子组测序数据 1例肉瘤样ccRCC患者样本,以及19例经典ccRCC样本(共19,819个肿瘤细胞和21,684个细胞核) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
2457 2025-12-04
MedakaBase as a unified genomic resource platform for medaka fish biology
2025-Dec-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes IF:3.9Q1
研究论文 本文介绍了MedakaBase作为一个统一的基因组资源平台,用于支持青鳉鱼生物学研究,整合了多物种的基因组数据和分析工具 首次为青鳉鱼建立了一个统一的基因组资源平台,整合了分散的组学数据,并提供面向基因的分析功能,包括单细胞转录组优化的基因模型 平台目前主要覆盖七个Oryzias物种,数据范围可能有限,且依赖于NBRP团队生成的部分原始数据 为青鳉鱼生物学研究提供一个统一的基因组资源平台,整合和分析多物种的组学数据 青鳉鱼(Oryzias latipes)及其他六个Oryzias物种的基因组数据 基因组学 NA 基因组测序、转录组分析、单细胞转录组分析 NA 基因组序列、转录组数据、基因组变异数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2458 2025-12-04
β-catenin initiates peritoneal fibrosis by triggering mitochondrial fission-mediated mesothelial cell senescence fate transition
2025-Dec-01, Military Medical Research IF:16.7Q1
研究论文 本研究揭示了β-catenin通过触发线粒体分裂介导的间皮细胞衰老命运转变,从而启动腹膜纤维化的机制 首次在单细胞水平上明确了长期腹膜透析患者中间皮细胞向衰老命运的转变,并阐明了β-catenin-Drp1-线粒体分裂-TGF-β1信号轴在驱动这一过程及后续纤维化中的关键作用 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,其结论在人体中的普适性及长期疗效仍需进一步临床验证 探究腹膜纤维化的起始机制,并寻找潜在的治疗靶点 腹膜间皮细胞、来自腹膜透析患者的透析液流出物和腹膜活检标本、PDF诱导的小鼠模型、原代培养的间皮细胞 单细胞组学与分子病理学 终末期肾病相关的腹膜纤维化 单细胞RNA测序,转录组测序,免疫荧光,Western blotting NA 单细胞RNA测序数据,转录组数据,蛋白质印迹数据,免疫荧光图像 包含腹膜透析患者临床队列、小鼠模型及原代细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2459 2025-12-04
Restoring macrophage iron homeostasis by natural carrier-free nanoplatform for the therapy of rheumatoid arthritis syndromes
2025-Dec, Materials today. Bio
研究论文 本研究开发了一种无载体纳米药物RTNs,通过自组装天然产物RBA和TMP,用于恢复巨噬细胞铁稳态以治疗类风湿关节炎综合征 首次利用无载体自组装纳米平台结合天然产物,靶向巨噬细胞铁稳态治疗RA,并整合单细胞测序分析阐明机制 未明确提及样本量细节或长期毒性数据,且研究基于动物模型,临床转化潜力待验证 开发安全有效的策略治疗类风湿关节炎综合征,特别是针对铁过载引发的巨噬细胞极化问题 类风湿关节炎患者(通过佐剂诱导关节炎啮齿动物模型模拟) NA 类风湿关节炎 单细胞测序分析 NA NA NA NA NA NA NA
2460 2025-12-04
A practical protocol of processing mineralized tissue for Visium spatial transcriptomics
2025-Dec, Mechanobiology in medicine
研究论文 本文提出了一种用于处理矿化组织以进行Visium空间转录组学分析的优化工作流程 使用Morse's溶液替代传统EDTA脱钙,实现快速脱钙(<24小时)同时保持RNA质量,并强调使用SCHOTT NEXTERION® Slide H(3-D水凝胶涂层)以增强脆弱脱钙骨切片的粘附性 NA 克服矿化组织空间转录组学分析中因脱钙过程导致的RNA完整性和基因检测问题 完整和骨折的小鼠股骨样本 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 小鼠股骨样本(具体数量未明确说明) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium V2和Visium HD
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