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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2421 | 2025-11-13 |
Single-Cell Transcriptome Atlas Reveals the Underlying Mechanism of Kynurenic Acid in the Regulation of Tumor Immune Microenvironment in Glioblastoma
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507705
PMID:41221633
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了犬尿酸在胶质母细胞瘤中调节肿瘤免疫微环境的潜在机制 | 首次系统阐明犬尿酸通过重塑髓系免疫抑制细胞和逆转T细胞耗竭来增强抗肿瘤免疫反应的作用机制 | 研究主要依赖小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;T细胞缺陷模型虽证实适应性免疫的必要性,但具体机制细节仍需深入探索 | 探究犬尿酸在胶质母细胞瘤免疫微环境调节中的功能机制 | 胶质母细胞瘤组织样本和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术,蛋白质组学,流式细胞术,靶向代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,流式细胞数据 | 临床队列组织样本和原位GBM小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 2422 | 2025-11-13 |
High-Resolution Multiplexed Sequencing of Single-Cell Full-length Transcriptome Via Combinational Barcoded Tn5 Transposon Insertion
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516013
PMID:41218139
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研究论文 | 本文提出了一种名为CBTi-seq的新型单细胞全长转录组测序技术,通过组合条形码Tn5转座子插入实现高分辨率多重测序 | 利用Tn5转座酶介导的组合条形码和UMI分子组装,实现单细胞全长转录组的高分辨率测序,正交组合条形码设计在减少DNA条形码多样性的同时增强多重检测灵活性 | NA | 开发一种能够在单细胞水平实现全长转录组高分辨率测序的新方法 | 基因编辑细胞和人类睾丸细胞 | 单细胞测序技术 | 生殖发育疾病 | 单细胞全长转录组测序,组合条形码Tn5转座子插入测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间分辨组织微环境数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | CBTi-seq | 组合条形码Tn5转座子插入测序技术,兼容单细胞和空间分辨组织微环境分析 |
| 2423 | 2025-11-13 |
FAM135B Deficiency Inhibits Cytotoxic T-Cell Activity in Triple-negative Breast Cancer by Blocking the IFI16-dependent STING Pathway
2025-Nov-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0310
PMID:41218197
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研究论文 | 本研究揭示FAM135B通过调控IFI16依赖性STING通路激活细胞毒性T细胞,影响三阴性乳腺癌免疫治疗疗效 | 首次发现FAM135B作为抗肿瘤免疫调节因子,通过竞争性阻断TRIM21介导的IFI16泛素化降解来激活STING通路 | NA | 探究三阴性乳腺癌免疫检查点阻断治疗反应差异的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者样本和免疫细胞 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序,功能实验 | NA | 单细胞测序数据,分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2424 | 2025-11-13 |
Multimodal learning enables chat-based exploration of single-cell data
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02857-9
PMID:41219484
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研究论文 | 开发了名为CellWhisperer的人工智能模型和软件工具,用于通过自然语言对话探索单细胞数据 | 建立了转录组与其文本注释的多模态嵌入,通过对比学习连接基因表达与文本描述,实现自然语言交互式探索单细胞数据 | NA | 解决单细胞测序数据解释的挑战,实现交互式单细胞数据探索 | 单细胞RNA测序数据和文本注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序,对比学习 | 多模态嵌入模型,大语言模型 | 基因表达数据,文本数据 | 100万个RNA测序图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2425 | 2025-11-13 |
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2025-Nov-11, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf301
PMID:41220068
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研究论文 | 开发基于寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的多重蛋白质基因组分析方法,用于分析人类B细胞反应性 | 建立结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新工作流程,实现并行分析不同抗原特异性B细胞 | 需要优化抗原与链霉亲和素比例,稀有细胞检测灵敏度仍需提高 | 开发多重蛋白质基因组分析方法以解析B细胞对抗原的反应性 | 人类B细胞,特别是外周血中的稀有抗原特异性B细胞 | 单细胞多组学 | 传染病(SARS-CoV-2、登革热) | 单细胞测序,流式细胞术,寡核苷酸标记 | NA | 单细胞多组学数据 | 人类外周血样本 | NA | 单细胞测序,流式细胞术 | NA | 寡核苷酸标记抗原组装与荧光标记抗原组装的双重标记方法 |
| 2426 | 2025-11-13 |
Identification of mitochondria-related hub genes and immune associations in acute myocardial infarction: A bioinformatic analysis
2025-Nov-07, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045611
PMID:41204556
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别急性心肌梗死中线粒体相关枢纽基因及其与免疫系统的关联 | 首次系统性地识别了5个与线粒体相关的AMI诊断枢纽基因,并揭示了这些基因与免疫细胞的关联机制 | 这是一项探索性研究,需要严格的外部验证才能考虑临床应用 | 探索急性心肌梗死中线粒体代谢与免疫反应的相互作用机制 | 急性心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 差异表达分析、富集分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞测序、实时定量PCR | 机器学习、列线图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2427 | 2025-11-13 |
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013063
PMID:41176316
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研究论文 | 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化为免疫抑制状态中的关键作用及其对免疫疗法的负面影响 | 首次发现NRF2激活梯度将肿瘤相关巨噬细胞分为促炎CXCL9+和抗炎SPP1+亚群,并证明其通过沉默IFN-STAT1通路导致免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型,人类癌症中的验证仍需进一步临床研究 | 探索NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化中的作用及其对免疫疗法疗效的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2428 | 2025-11-13 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了n-irAEs患者体内存在特异性克隆扩增的CD4+CTLs,并发现其表达与神经炎症相关的效应基因谱 | 样本量较小(仅17例患者),且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂治疗诱发神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者,包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统并发症 | 单细胞RNA测序,T细胞受体谱分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 17例癌症患者(8例n-irAEs患者),共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2429 | 2025-11-13 |
Acquisition of an immunosuppressive microenvironment after anti-CD19 CAR T-cell therapy is associated with T-cell dysfunction and resistance
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011768
PMID:41135951
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析,揭示了抗CD19 CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境获得免疫抑制特性与T细胞功能障碍和治疗抵抗的关联 | 首次在单细胞水平系统描述了CAR-T治疗后骨髓微环境的动态变化,发现髓系细胞激活、干扰素反应、缺氧和TGF-β信号通路在驱动免疫抑制中的关键作用 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现;机制研究主要基于相关性分析,需要进一步功能验证 | 探究CAR-T细胞治疗后肿瘤微环境变化与治疗反应的关系 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者和造血干细胞人源化小鼠模型 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | B-ALL患者治疗前后骨髓样本,人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2430 | 2025-11-13 |
TRIM28 drives immune evasion via PARP1 SUMOylation and NAD+ depletion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Oct-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013025
PMID:41135953
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研究论文 | 本研究揭示了TRIM28通过PARP1 SUMO化和NAD+耗竭驱动透明细胞肾细胞癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现TRIM28通过双重免疫代谢机制促进免疫抵抗:稳定PARP1并促进其SUMO化,以及耗竭肿瘤微环境中的NAD+ | 研究主要基于细胞模型和动物实验,需要进一步临床验证 | 探索透明细胞肾细胞癌中免疫逃逸的分子机制 | 透明细胞肾细胞癌细胞系、CD8+ T细胞、患者来源异种移植模型 | 癌症免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组学、RNA-seq、质谱分析、代谢组学、虚拟筛选 | Geneformer、患者来源异种移植模型 | 转录组数据、代谢组数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE159115数据集 |
| 2431 | 2025-11-13 |
SPP1high macrophage-induced T-cell stress promotes colon cancer liver metastasis through SPP1/CD44/PI3K/AKT signaling
2025-Oct-20, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012330
PMID:41120125
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1高表达巨噬细胞通过SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路诱导T细胞应激状态促进结肠癌肝转移的机制 | 首次发现SPP1高表达巨噬细胞诱导的T细胞应激状态在结肠癌肝转移中的作用,并揭示SPP1/CD44/PI3K/AKT信号通路机制 | 研究样本量有限,主要基于体外实验验证机制 | 阐明结肠癌肝转移免疫抑制微环境的形成机制并寻找免疫治疗新靶点 | 结肠癌肝转移患者的肿瘤标本和匹配的肝转移灶 | 单细胞转录组学 | 结肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 结肠癌肝转移患者肿瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2432 | 2025-11-13 |
ALCAM-CD6 axis suppression: a key determinant of immune-mediated metastasis recurrence in stage III non-small cell lung cancer
2025-Oct-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010416
PMID:41073134
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研究论文 | 本研究揭示了ALCAM-CD6轴在III期非小细胞肺癌转移复发中的关键作用机制 | 首次发现ALCAM-CD6相互作用抑制导致免疫抑制状态,并通过转录因子MYB调控ALCAM表达影响肿瘤进展 | 研究样本仅限于III期NSCLC患者,未涵盖其他分期或肺癌亚型 | 探究III期非小细胞肺癌转移复发的生物学机制 | 接受肺癌切除术的III期非小细胞肺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序,组织流式细胞分析,实时PCR,Western blotting,基因沉默,细胞共培养,流式细胞术,染色质免疫沉淀定量PCR | NA | 单细胞测序数据,组织样本,临床数据 | 2018年8月至2021年7月期间接受肺癌切除术的III期NSCLC患者组织样本和临床数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2433 | 2025-11-13 |
Neural stem cell-delivered oncolytic virus via intracerebroventricular administration enhances glioblastoma therapy and immune modulation
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012934
PMID:41062177
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研究论文 | 本研究通过脑室内注射神经干细胞递送溶瘤病毒,评估其对胶质母细胞瘤的治疗效果和免疫调节作用 | 利用神经干细胞作为溶瘤病毒载体通过脑室内给药增强肿瘤靶向性,并结合单细胞RNA测序揭示其通过下调S100A8/A9抑制髓源性抑制细胞募集的免疫调节机制 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发改善胶质母细胞瘤治疗效果的创新疗法 | 胶质母细胞瘤细胞、神经干细胞、溶瘤病毒 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外细胞实验、动物模型 | 异种移植模型、原位肿瘤模型、人源化免疫系统小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确具体样本数量,使用多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2434 | 2025-11-13 |
Multiomics elucidation of surrounding AT2 cells impeding tertiary lymphoid structures function in neoadjuvant chemoimmunotherapy response of multiple primary lung cancers
2025-Oct-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011882
PMID:41062178
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研究论文 | 通过多组学分析揭示AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能,影响多原发肺癌新辅助化疗免疫治疗的疗效 | 首次发现AT2细胞通过MIF-SIAE信号轴抑制三级淋巴结构中B细胞功能,揭示了多原发肺癌免疫治疗反应不一致的新机制 | 样本量有限,仅分析了少数MPLC病例 | 探究多原发肺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应不一致的机制 | 多原发肺癌患者的肿瘤病灶 | 多组学分析 | 肺癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,空间共定位分析 | 细胞邻域分析 | 单细胞数据,空间转录组数据,免疫组织化学数据 | 1例MPLC患者的所有病灶,外加3例MPLC患者的4个无反应结节 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2435 | 2025-11-13 |
Spatial transcriptomic profiling of metastatic renal cell carcinoma identifies chemokine-driven macrophage and CD8+ T-cell interactions predictive of immunotherapy response
2025-Oct-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012991
PMID:41043857
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研究论文 | 通过空间转录组学分析转移性肾细胞癌,发现预测免疫治疗反应的巨噬细胞和CD8+ T细胞相互作用 | 首次使用高分辨率空间转录组技术揭示转移灶特异性免疫生态位对免疫检查点抑制剂疗效的决定性作用 | 样本量较小(12例初治患者),需要更大规模研究验证 | 开发预测转移性肾细胞癌免疫治疗反应的生物标志物 | 转移性肾细胞癌患者组织样本 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | 细胞类型反卷积分析 | 空间转录组数据,临床数据 | 12例初治mRCC患者,其中6例提供匹配转移灶样本 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | 10x Visium, NanoString COSMx | 10x Visium空间转录组技术,NanoString COSMx空间分子成像 |
| 2436 | 2025-11-13 |
Plasma Exosomes Derived from Patients with Primary Immune Thrombocytopenia Attenuate TBX21+ Regulatory T Cell-Mediated Immune Suppression via MiR-363-3p
2025-Oct, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02275-8
PMID:40032779
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研究论文 | 本研究揭示了原发性免疫性血小板减少症患者血浆外泌体通过miR-363-3p削弱调节性T细胞免疫抑制功能的分子机制 | 首次发现ITP患者外泌体通过miR-363-3p-ARID3A/SPI1/TBX21轴调控Treg功能,并利用单细胞测序技术鉴定出TBX21高表达的Treg亚群 | 研究样本量未明确说明,机制研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探究原发性免疫性血小板减少症中调节性T细胞功能减弱的分子机制 | 原发性免疫性血小板减少症患者的血浆外泌体和调节性T细胞 | 免疫学 | 原发性免疫性血小板减少症 | 单细胞测序,Treg功能测定,细胞因子分析 | NA | 单细胞测序数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2437 | 2025-11-13 |
Single-cell analysis of lung epithelial cells reveals age and cell population-specific responses to SARS-CoV-2 infection in ciliated cells
2025-Jan-21, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxae118
PMID:39780400
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示肺上皮细胞对SARS-CoV-2感染的年龄和细胞群体特异性反应 | 发现两种纤毛细胞亚群(FOXJ1高/低)具有不同感染率和免疫应答特征,并首次揭示儿童与成人肺细胞对病毒感染的差异基因表达 | 研究基于体外气液界面培养模型,可能与体内真实情况存在差异 | 研究先天免疫信号在肺发育和年龄中对SARS-CoV-2感染应答的作用 | 儿童和成人肺组织来源的气道上皮细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | Seurat, scType, Monocle | 单细胞转录组数据 | 儿童和成人肺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2438 | 2025-11-12 |
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516580
PMID:41216859
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,发现SLPI表达的AT2样细胞在肺腺癌侵袭边缘驱动肿瘤进展 | 首次识别出位于肿瘤侵袭边缘的SLPI表达AT2样细胞亚群,揭示了其通过Wnt通路激活和基质互作协调肺腺癌侵袭的空间机制 | NA | 阐明肺腺癌侵袭过程中的细胞类型、空间分布和功能互作机制 | 肺腺癌肿瘤微环境中的SLPI表达AT2样细胞、MRC1表达组织驻留巨噬细胞和癌症相关肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2439 | 2025-11-12 |
Unveiling the toxicological impact of cigarette smoke exposure on chronic obstructive pulmonary disease: integrated insights from network toxicology and multi-omics
2025-Nov-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04783-8
PMID:41217457
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研究论文 | 本研究整合网络毒理学、多组学分析和实验验证,揭示香烟烟雾暴露通过特定化合物和枢纽基因导致慢性阻塞性肺疾病的发病机制 | 首次系统整合网络毒理学、多组学分析和实验验证,构建香烟烟雾诱导慢性阻塞性肺疾病的化合物-靶点-疾病网络 | 研究主要基于数据库预测和动物实验,需要进一步临床验证 | 阐明香烟烟雾暴露诱导慢性阻塞性肺疾病的系统毒理学机制 | 香烟烟雾中的有害化合物及其与慢性阻塞性肺疾病相关的基因靶点 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 网络毒理学, 多组学分析, 分子对接, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 随机森林(RF), 支持向量机递归特征消除(SVM-RFE), LASSO | 基因组数据, 转录组数据 | 涉及93种香烟有害化合物的筛选和28个致病基因的鉴定 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2440 | 2025-11-12 |
PIP4K2A: A Novel CD8+ T Cell-Related Biomarker Associated with Lung Function Decline in COPD
2025-Nov-11, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11274-1
PMID:41217726
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了与COPD中CD8+ T细胞相关的生物标志物,并构建了诊断模型 | 首次发现PIP4K2A作为CD8+ T细胞相关生物标志物与COPD肺功能下降显著相关 | 研究样本来源于公共数据库,临床验证样本规模有限 | 阐明CD8+ T细胞在COPD发病机制中的分子机制 | COPD患者和健康对照者的肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 生物信息学分析 | LASSO回归, 线性回归 | 基因表达数据 | 从GEO数据库获取的COPD患者和对照样本,具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |