单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2401	2025-03-28	Myosin 1f and Proline-rich 13 are transcriptionally upregulated yet functionally redundant in CD4+ T cells during blood-stage Plasmodium infection 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0320375 PMID:40132035	研究论文	研究在疟疾实验模型中，CD4+ T细胞中Myo1f和Prr13基因的转录上调及其功能冗余性	首次在T辅助细胞中鉴定并研究了Myo1f和Prr13基因的功能，尽管这些基因在效应和记忆分化过程中转录上调，但在功能上是冗余的	研究仅限于小鼠模型中的Plasmodium chabaudi chabaudi AS感染，可能不适用于其他疟原虫物种或人类感染	探究CD4+ T细胞在疟疾感染期间的分化机制，特别是Myo1f和Prr13基因的作用	CD4+ T细胞，特别是Plasmodium特异性TCR转基因PbTII细胞	免疫学	疟疾	scRNA-seq, 条件性基因敲除	小鼠感染模型	基因表达数据	NA
2402	2025-03-28	Single-cell and transcriptome analyses revealed CTHRC1 a potential therapeutic target mediating invasion and tumor microenvironment in TNBC: experimental validation 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1534981 PMID:40134434	研究论文	研究CTHRC1在三阴性乳腺癌(TNBC)肿瘤微环境中的关键作用及其作为潜在治疗靶点的可能性	首次系统性地研究了CTHRC1在TNBC中的表达特征及其通过调节M2型巨噬细胞影响肿瘤免疫微环境的机制	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证	探索CTHRC1在TNBC肿瘤微环境中的作用及其治疗潜力	三阴性乳腺癌(TNBC)患者样本和肿瘤微环境	肿瘤生物学	乳腺癌	RNA转录组分析、单细胞测序、多重免疫荧光分析	NA	RNA测序数据、单细胞测序数据	来自TCGA和GEO数据库的TNBC患者样本数据
2403	2025-03-28	Jing-Yin-Gu-Biao formula protects mice from postinfluenza Staphylococcus aureus infection by ameliorating acute lung injury and improving hypercoagulable state via inhibiting NETosis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1567522 PMID:40134435	研究论文	本研究探讨了荆银固表方（JYGBF）对流感后金黄色葡萄球菌感染的保护作用及其机制	首次发现JYGBF通过抑制NETosis改善急性肺损伤和高凝状态	研究仅限于小鼠模型，尚未进行人体临床试验	评估JYGBF对流感后金黄色葡萄球菌感染的保护作用及相关机制	流感后金黄色葡萄球菌感染的小鼠模型	医学	急性呼吸道感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠感染模型	体内和体外实验数据	未明确说明具体样本数量
2404	2025-03-28	Differential neuropilin isoform expressions highlight plasticity in macrophages in the heterogenous TME through in-silico profiling 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1547330 PMID:40134439	research paper	该研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了神经纤毛蛋白（NRP）异构体NRP1和NRP2在肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）中的差异表达及其在肿瘤微环境（TME）中的不同作用机制	首次在单细胞水平上揭示了NRP1和NRP2在ccRCC和SKCM肿瘤中的差异表达模式，并发现了与这两种异构体过表达相关的特定基因集	研究仅基于两种癌症类型（ccRCC和SKCM）的数据，可能无法完全代表其他癌症类型中NRP异构体的表达模式	探究NRP1和NRP2在肿瘤相关巨噬细胞中的差异表达及其在肿瘤微环境中的作用机制	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）和皮肤黑色素瘤（SKCM）中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤免疫学	肾癌, 黑色素瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 差异基因表达分析（DEGA）	聚类算法	RNA测序数据	来自ccRCC和SKCM肿瘤的样本（具体数量未明确说明）
2405	2025-03-28	Discrepancies between human and murine model cerebral aneurysms at single-cell resolution 2025, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1 DOI:10.3389/fcell.2025.1512938 PMID:40134579	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术比较了人类和小鼠模型脑动脉瘤的细胞和分子差异	首次在单细胞分辨率下系统地比较了人类和小鼠模型脑动脉瘤的差异，揭示了表型可修饰细胞的关键不同	研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行功能验证实验	探究人类和小鼠模型脑动脉瘤的细胞和分子差异	人类和小鼠模型的脑动脉瘤组织	digital pathology	cardiovascular disease	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	未明确说明样本数量
2406	2025-03-28	Application and Progression of Single-Cell RNA Sequencing in Diabetes Mellitus and Diabetes Complications 2025, Journal of diabetes research IF:3.6Q2 DOI:10.1155/jdr/3248350 PMID:40135071	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在糖尿病及其并发症研究中的应用和进展	强调了scRNA-seq在糖尿病研究中识别新型生物标志物和免疫治疗靶点的潜力	未提及具体实验数据或样本量的限制	探讨scRNA-seq在糖尿病及其并发症研究中的应用	糖尿病及其并发症（如糖尿病视网膜病变、糖尿病心肌病和糖尿病肾病）	digital pathology	糖尿病	scRNA-seq	NA	RNA序列数据	NA
2407	2025-03-27	Erythroblastic island: the niche for erythroid terminal differentiation and beyond 2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/BS9.0000000000000228 PMID:40129604	review	本文综述了关于红细胞岛（EBI）的最新发现，探讨了其潜在的免疫功能，并提供了未来研究的视角	挑战了传统观点，提出红细胞岛可能支持其他造血谱系细胞，并发现了红细胞岛巨噬细胞的新标记——促红细胞生成素受体	尚不清楚免疫倾向性红细胞母细胞是否及如何在红细胞岛中成熟	探讨红细胞岛的功能及其在造血系统中的潜在作用	红细胞岛（EBI）及其细胞组成	NA	NA	谱系追踪小鼠模型、成像流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	NA	NA
2408	2025-03-27	PRMT1 Ablation in Endothelial Cells Causes Endothelial Dysfunction and Aggravates COPD Attributable to Dysregulated NF-κB Signaling 2025-Mar-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202411514 PMID:40135804	研究论文	本文研究了PRMT1在内皮细胞中的作用，特别是在慢性阻塞性肺病（COPD）发病机制中的角色	揭示了PRMT1作为肺内皮细胞功能的关键调节因子，防止NF-κB驱动的内皮功能障碍和衰老	PRMT1在内皮细胞中的具体作用机制仍需进一步研究	探讨PRMT1在内皮细胞中的作用及其在COPD发病机制中的影响	内皮细胞和慢性阻塞性肺病（COPD）	分子生物学	慢性阻塞性肺病（COPD）	RNA测序（bulk RNA sequencing和single-cell RNA sequencing）	内皮特异性PRMT1敲除小鼠	基因表达数据	小鼠模型和肺内皮细胞
2409	2025-03-27	Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis 2025-Mar-25, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-025-05216-1 PMID:40131629	研究论文	本研究探讨了乳酸化相关基因标记在绝经后骨质疏松症中的作用及其验证	首次利用单细胞RNA测序数据和转录组数据，结合机器学习算法，揭示了乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的重要作用，并构建了诊断模型	研究样本量有限，且未进行实验验证	探究乳酸化相关基因在绝经后骨质疏松症中的作用，并寻找潜在的诊断生物标志物	绝经后骨质疏松症患者	数字病理学	骨质疏松症	scRNA-seq, 转录组测序, Mendelian randomization (MR) 分析	机器学习算法组合	单细胞RNA测序数据, 转录组数据	未明确提及具体样本数量
2410	2025-03-27	Macrophage Subpopulation Promotes Skeletal Muscle Regeneration Through HGF/MET Signaling-Mediated Skeletal Muscle Stem Cell Proliferation 2025-Mar-25, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70042 PMID:40132988	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了巨噬细胞亚群Mac_1通过HGF/MET信号通路促进骨骼肌干细胞增殖，从而促进骨骼肌再生的机制	首次鉴定出促进骨骼肌再生的巨噬细胞亚群Mac_1，并阐明其通过HGF/c-Met信号通路抑制Cdkn1b表达来促进肌肉卫星细胞增殖的分子机制	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究骨骼肌再生过程中巨噬细胞亚群的作用及其分子机制	年轻(8周龄)和老年(24月龄)小鼠的骨骼肌组织和肌肉卫星细胞	细胞生物学	肌肉疾病	单细胞RNA测序	3D肌肉类器官模型	基因表达数据	年轻和老年小鼠的骨骼肌组织
2411	2025-03-27	Single-cell sequencing combined with urinary multi-omics analysis reveals that the non-invasive biomarker PRDX5 regulates bladder cancer progression through ferroptosis signaling 2025-Mar-24, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-13881-y PMID:40122834	研究论文	本研究通过单细胞测序和尿液多组学分析揭示了非侵入性生物标志物PRDX5通过铁死亡信号调控膀胱癌进展的机制	首次结合单细胞RNA测序和尿液多组学数据，系统研究了PRDX5在膀胱癌中的表达特征及其通过调控ROS水平和铁死亡通路促进肿瘤进展的机制	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在临床患者中进行验证	阐明过氧化物酶5(PRDX5)在膀胱癌中的表达特征及其生物学意义，特别是研究其通过调控活性氧(ROS)水平和激活铁死亡通路对膀胱癌进展的影响	膀胱癌组织和细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、尿液蛋白质组学、转录组学	NA	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据	TCGA数据库中的膀胱癌组织样本和单细胞测序数据
2412	2025-03-27	Checkpoint kinase 1 in colorectal cancer: Upregulation of expression and promotion of cell proliferation 2025-Mar-24, World journal of clinical oncology IF:2.6Q3 DOI:10.5306/wjco.v16.i3.101725 PMID:40130044	研究论文	本研究探讨了检查点激酶1（CHEK1）在结直肠癌（CRC）中的表达及其对癌细胞增殖的促进作用	首次通过单细胞RNA测序和组织微阵列数据全面分析CHEK1在CRC中的表达和功能，并探索其作为治疗靶点的潜力	数据集多样性有限，需要进一步研究其具体机制	研究CHEK1在CRC中的表达和功能，探索其作为新型治疗靶点的潜力	结直肠癌细胞和组织	癌症研究	结直肠癌	单细胞RNA测序、免疫组织化学、分子对接、CRISPR敲除实验	NA	RNA测序数据、组织微阵列数据、公共数据库mRNA表达数据	GSE144735数据集中的CRC细胞及多个公共数据库中的mRNA表达数据
2413	2025-03-27	Enhancing TREM2 expression activates microglia and modestly mitigates tau pathology and neurodegeneration 2025-Mar-23, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-025-03420-8 PMID:40122810	研究论文	本研究探讨了TREM2在tau病理和神经退行性变中的作用，发现增强TREM2表达可适度减轻tau病理和神经退行性变	首次在PS19 tauopathy小鼠模型中诱导过表达人类野生型TREM2和R47H变体，揭示了TREM2在调节小胶质细胞活性和tau病理中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，结果对人类疾病的适用性尚不明确	探究TREM2在tau病理和神经退行性变中的作用及其潜在治疗价值	PS19 tauopathy小鼠模型	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	未明确说明
2414	2025-03-27	Inhibition of stromal MAOA leading activation of WNT5A enhance prostate cancer immunotherapy by involving the transition of cancer-associated fibroblasts 2025-Mar-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010555 PMID:40121032	研究论文	研究探讨了基质细胞中MAOA抑制通过激活WNT5A增强前列腺癌免疫治疗的机制	揭示了MAOA通过调节癌症相关成纤维细胞转化和WNT5A-Ca2+-NFATC1信号通路增强CD8+ T细胞活性的新机制	研究主要基于小鼠模型，人体内的效果尚需进一步验证	探索基质MAOA在前列腺癌免疫微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力	前列腺癌基质细胞、CD8+ T细胞、癌症相关成纤维细胞	肿瘤免疫学	前列腺癌	单细胞测序、体外共培养、小鼠移植瘤模型、双人源化小鼠模型	动物模型	测序数据、细胞实验数据	未明确说明样本数量，使用了小鼠模型和体外培养细胞
2415	2025-03-27	Bulk and single-cell RNA sequencing reveal the roles of neutrophils in pediatric Crohn's disease 2025-Mar-22, Pediatric research IF:3.1Q1 DOI:10.1038/s41390-025-03961-x PMID:40121337	research paper	本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，探索了中性粒细胞在儿童克罗恩病中的作用及其潜在生物标志物和治疗靶点	揭示了中性粒细胞在克罗恩病中的数量和功能状态变化，及其与其他细胞类型的增强相互作用，提出了中性粒细胞作为治疗靶点的潜力	研究样本仅限于回肠和结肠活检样本，可能无法全面反映克罗恩病的整体情况	探索克罗恩病的分子机制、细胞类型及其潜在生物标志物和治疗靶点	儿童克罗恩病患者的中性粒细胞	digital pathology	Crohn's disease	single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing	NA	RNA sequencing data	回肠和结肠活检样本
2416	2025-03-27	Mapping Gene Expression in Whole Larval Brains of Bicyclus anynana Butterflies 2025-Mar-13, Methods and protocols IF:2.3Q3 DOI:10.3390/mps8020031 PMID:40126249	研究论文	优化了杂交链反应3.0（HCR v3.0）协议，以可视化非洲蝴蝶幼虫大脑中多个RNA分子的表达	优化了聚丙烯酰胺凝胶固定、固定和样品渗透步骤，并在单细胞分辨率下绘制了十个基因在幼虫全脑组织中的表达域	未提及具体局限性	研究蝴蝶幼虫大脑在分子水平上的行为变化	非洲蝴蝶（Bicyclus anynana）的幼虫大脑	分子生物学	NA	杂交链反应3.0（HCR v3.0）	NA	RNA分子表达数据	未提及具体样本数量
2417	2025-03-27	Single-Cell Transcriptomic Approaches for Decoding Non-Coding RNA Mechanisms in Colorectal Cancer 2025-Mar-10, Non-coding RNA IF:3.6Q2 DOI:10.3390/ncrna11020024 PMID:40126348	综述	本文综述了单细胞转录组学方法在解码结直肠癌中非编码RNA机制方面的最新进展	强调了单细胞生物信息学方法在非编码RNA分析中的应用，包括序列和结构基础的方法、机器学习应用以及多组学数据整合	未提及具体的研究局限性	综述单细胞生物信息学在结直肠癌非编码RNA研究中的现状并展望未来方向	结直肠癌中的非编码RNA	生物信息学	结直肠癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	机器学习	转录组数据	NA
2418	2025-03-27	Myeloma cell-intrinsic ANXA1 elevation and T cell dysfunction contribute to BCMA-negative relapse after CAR-T therapy 2025-Mar-08, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.03.001 PMID:40057828	research paper	该研究探讨了多发性骨髓瘤（MM）在抗B细胞成熟抗原（BCMA）CAR-T细胞治疗后复发的原因，发现ANXA1的高表达与BCMA阴性复发相关	首次发现ANXA1的高表达与BCMA阴性多发性骨髓瘤复发相关，并验证了ANXA1作为潜在治疗靶点的有效性	研究样本量较小，仅基于单例患者的单细胞转录组测序数据	探究多发性骨髓瘤在CAR-T细胞治疗后BCMA阴性复发的机制	多发性骨髓瘤患者和CAR-T细胞	肿瘤免疫治疗	多发性骨髓瘤	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	1例CAR-T治疗后复发的多发性骨髓瘤患者
2419	2025-03-27	Identifying gene expression and cellular pathways involved in glomerular AL-amyloidosis and correlation with experimental data: seeking novel therapeutic interventions 2025-Mar-04, Ultrastructural pathology IF:1.1Q4 DOI:10.1080/01913123.2025.2468708 PMID:39985165	research paper	本研究通过空间转录组学分析肾小球淀粉样变性不同阶段的基因表达和细胞通路，寻找新的治疗靶点	首次在人类肾小球中探测了淀粉样轻链与系膜细胞相互作用时的基因表达谱和激活的细胞通路	样本量较小（仅5例肾活检样本）	寻找改善或消除肾损伤的新型治疗干预措施	肾小球淀粉样变性患者的系膜细胞	digital pathology	renal disease	spatial transcriptomics	NA	gene expression data	5例肾活检样本（不同阶段肾小球淀粉样变性）和正常对照
2420	2025-03-27	Spatially Resolved Single-Cell Transcriptome Analysis of Mycosis Fungoides Reveals Distinct Biomarkers GNLY and FYB1 Compared With Psoriasis and Chronic Spongiotic Dermatitis 2025-Mar, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.modpat.2024.100681 PMID:39675427	research paper	通过空间分辨单细胞转录组分析，研究蕈样肉芽肿（MF）与银屑病及慢性海绵性皮炎的差异生物标志物GNLY和FYB1	首次利用空间分辨单细胞转录组技术鉴定出GNLY和FYB1作为区分MF与银屑病及慢性海绵性皮炎的特异性生物标志物	样本量相对有限（150例患者），且免疫组化验证的敏感性和特异性仍有提升空间	探索区分蕈样肉芽肿与炎症性皮肤病的诊断标志物	蕈样肉芽肿、银屑病和慢性海绵性皮炎患者的表皮内T细胞	digital pathology	skin disease	spatially resolved single-cell transcriptome analysis, immunohistochemistry	NA	transcriptomic data, immunohistochemical data	150例患者（56例MF，48例银屑病，46例慢性湿疹）