单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 3840 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2025-03-25 |
A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466
PMID:40090085
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research paper | 研究发现了一组在青少年系统性红斑狼疮中高度激活的CD99- CD72+ B细胞亚群，这些细胞通过表达高水平的TLR7促进自身免疫反应 | 首次识别并描述了CD72 BCs这一关键过渡细胞群体，其在系统性红斑狼疮中连接了初始B细胞和浆细胞的分化过程 | 研究主要基于青少年系统性红斑狼疮患者，结果在成人患者中的适用性尚待验证 | 探究系统性红斑狼疮中自身抗体分泌细胞的起源和分化机制 | CD99- CD72+ B细胞亚群 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，研究对象为青少年系统性红斑狼疮患者 |
| 2382 | 2025-03-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416846
PMID:40123572
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研究论文 | 该研究利用单细胞和空间转录组学技术，揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维响应 | 首次构建了水稻叶片的单细胞转录组图谱，揭示了细胞特异性和多维度的免疫响应机制 | NA | 研究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 | 水稻叶片细胞和稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae) | 植物病理学 | 稻瘟病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 236,708个单细胞转录组 |
| 2383 | 2025-03-25 |
Exosomal PKM2: A Noninvasive Diagnostic Marker Linking Macrophage Metabolic Reprogramming to Gastric Cancer Pathogenesis
2025-Mar-24, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70056
PMID:40126044
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research paper | 该研究探讨了血浆外泌体PKM2作为胃癌诊断标志物的潜力及其在肿瘤微环境中通过调控巨噬细胞代谢重编程促进胃癌发展的机制 | 首次揭示外泌体PKM2通过抑制SCAP多聚泛素化激活SREBP1相关脂质合成通路促进胃癌发展的分子机制 | 样本量相对有限（216例），且机制研究主要在细胞水平进行 | 探究外泌体PKM2在胃癌诊断和发病机制中的作用 | 胃癌患者和健康供体的血浆样本（216例）及肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序、Kaplan-Meier分析 | NA | 血液样本、单细胞转录组数据 | 216例血液样本（胃癌患者和健康对照） |
| 2384 | 2025-03-25 |
Time, the final frontier
2025-Mar-24, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70025
PMID:40126098
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研究论文 | 本文主张将时间动态整合到癌症研究中，强调从传统的终点实验向数据驱动的连续方法的根本转变 | 提出将时间动态整合到癌症研究中，开发先进的活体成像技术、创新的时间组学方法和新型计算工具 | 未提及具体的技术实施细节或实验验证结果 | 探索肿瘤的时间动态变化，以更全面地理解肿瘤的异质性和进化 | 肿瘤及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 活体成像技术、时间组学方法 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 2385 | 2025-03-25 |
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416523
PMID:40126173
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研究论文 | 研究通过靶向胶原重塑细胞外基质（ECM）来增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 发现Halofuginone（HF）通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生，破坏胶原沉积并促进CD8+ T细胞浸润，从而增强化疗敏感性 | NA | 探索靶向ECM重塑以增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 卵巢癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）和细胞外基质（ECM） | 癌症研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2386 | 2025-03-25 |
Single-Cell Analysis Clarifies Pathological Heterogeneity in Tenosynovial Giant Cell Tumor and Identifies Biomarkers for Predicting Disease Recurrence
2025-Mar-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415835
PMID:40126353
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析弥漫型和局限型腱鞘巨细胞瘤的转录差异，揭示疾病复发预测的生物标志物 | 发现D-TGCT中独特的肿瘤细胞簇及其通过COL6A3-(ITGAV+ITGB8)相互作用调控成纤维细胞分化的机制，并鉴定出预测疾病复发的生物标志物ROR1和PRKD1 | NA | 阐明弥漫型腱鞘巨细胞瘤的侵袭性行为机制并寻找疾病复发预测标志物 | 人类弥漫型(D-TGCT)和局限型(L-TGCT)腱鞘巨细胞瘤病变组织 | 单细胞组学 | 腱鞘巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 2387 | 2025-03-25 |
eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis
2025-Mar-24, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0342OC
PMID:40126452
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research paper | 该研究探讨了eNAMPT作为人类和临床前IPF治疗靶点的潜力，并评估了ALT-100单克隆抗体的治疗效果 | 首次将eNAMPT鉴定为肺纤维化的新型DAMP和治疗靶点，并展示了ALT-100单抗的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，需要更大规模的临床试验验证 | 探索eNAMPT在肺纤维化中的作用并评估其作为治疗靶点的潜力 | IPF患者和小鼠模型 | NA | 肺纤维化 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | 血液、PBMCs、肺组织样本 | IPF患者样本和C57Bl6小鼠模型 |
| 2388 | 2025-03-25 |
Endothelial-like cancer-associated fibroblasts facilitate pancreatic cancer metastasis via vasculogenic mimicry and paracrine signalling
2025-Mar-23, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333638
PMID:40122596
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research paper | 该研究识别了一种新型的前肿瘤性癌症相关成纤维细胞(CAF)亚型，该亚型通过血管生成拟态和旁分泌信号促进胰腺癌转移 | 发现FAPα+CD144+内皮样CAFs(endoCAFs)并通过CD144-β-catenin-STAT3信号轴阐明其促进转移的机制，开发了靶向siRNA递送纳米系统 | 未明确说明样本量大小，且机制研究主要在动物模型中进行 | 鉴定胰腺导管腺癌(PDAC)中具有血管生成拟态功能的新型CAF亚型并探索其促转移机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)微环境中的FAPα+CD144+内皮样CAFs | 肿瘤微环境 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、mIHC、细胞因子阵列分析、RNA测序、IP-质谱、ChIP和荧光素酶分析 | KPC小鼠模型(LSL-KrasG12D/+, LSL-Trp53R172H/+和Pdx1-Cre) | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA |
| 2389 | 2025-03-25 |
Mapping molecular landscapes in triple-negative breast cancer: insights from spatial transcriptomics
2025-Mar-22, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04057-3
PMID:40119898
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review | 本文综述了空间转录组学在三阴性乳腺癌肿瘤微环境研究中的应用及其在精准医学中的潜力 | 利用空间转录组学技术揭示三阴性乳腺癌的肿瘤微环境异质性，识别空间生物标志物，并预测免疫治疗反应 | 需要进一步发展空间转录组学技术、计算工具和多中心合作以促进其临床应用 | 探讨空间转录组学在三阴性乳腺癌研究中的应用及其对精准医学的贡献 | 三阴性乳腺癌的肿瘤微环境 | digital pathology | breast cancer | spatial transcriptomics | AI-based spatial analysis | transcriptomic data | NA |
| 2390 | 2025-03-25 |
Constructing a disease-specific ceRNA coregulatory network for keratoconus diagnosis and landscape of the immune environment
2025-Mar-22, International ophthalmology
IF:1.4Q3
DOI:10.1007/s10792-025-03488-4
PMID:40119981
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研究论文 | 本研究通过构建圆锥角膜（KC）特异的ceRNA共调控网络和免疫环境图谱，旨在发现早期诊断的生物标志物并揭示其分子机制 | 首次构建KC特异的PPI和ceRNA网络，开发了基于ElasticNet算法的诊断模型，并揭示了KC患者独特的免疫微环境特征 | 研究基于公共数据库的转录组数据，需要进一步实验验证 | 确定圆锥角膜的潜在疾病特异性基因生物标志物并解析其免疫环境 | 圆锥角膜患者与对照组的转录组数据 | 生物信息学 | 圆锥角膜 | 转录组分析，单细胞测序分析 | ElasticNet算法 | RNA-seq数据 | 来自GEO和ArrayExpress数据库的圆锥角膜患者与对照组样本 |
| 2391 | 2025-03-25 |
Immunosuppressive JAG2+ tumor-associated neutrophils hamper PD-1 blockade response in ovarian cancer by mediating the differentiation of effector regulatory T cells
2025-Mar-22, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70021
PMID:40120139
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research paper | 该研究揭示了JAG2+肿瘤相关中性粒细胞（TANs）在高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）中通过介导效应调节性T细胞（eTregs）的分化来阻碍PD-1阻断反应的机制 | 首次阐明了JAG2+ TANs通过Notch信号通路促进eTregs分化，从而导致免疫逃避和抗PD-1治疗抵抗的具体机制 | 研究主要基于HGSOC样本，其他类型卵巢癌或实体瘤的适用性需要进一步验证 | 阐明JAG2+ TANs在HGSOC肿瘤免疫抑制微环境中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者样本和肿瘤相关中性粒细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 多重免疫组化、流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、体外共培养系统、肿瘤移植小鼠模型 | 患者来源肿瘤类器官（PDTOs）模型和异种移植模型 | 临床样本数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 304例HGSOC样本（274例构成两个独立队列，30例用于建立PDTOs） |
| 2392 | 2025-03-25 |
AMPK-dependent Parkin activation suppresses macrophage antigen presentation to promote tumor progression
2025-Mar-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn8402
PMID:40117357
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research paper | 该研究揭示了Parkin通过AMPK依赖性激活抑制巨噬细胞抗原呈递，从而促进肿瘤进展的机制 | 发现了Parkin在肿瘤免疫微环境中调控巨噬细胞与T细胞相互作用的新机制，并证明Parkin缺失可增强免疫检查点阻断治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证仍需进一步研究 | 探究Parkin在肿瘤免疫微环境中的调控作用及其机制 | 小鼠模型和人类固体肿瘤患者样本 | 肿瘤免疫学 | 固体肿瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | 小鼠基因敲除模型 | 基因表达数据、流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及基因工程小鼠和人类患者数据 |
| 2393 | 2025-03-25 |
Influence of experimental variables on spheroid attributes
2025-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-92037-1
PMID:40118968
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research paper | 本文通过分析32,000个球体图像，系统性地研究了影响3D细胞培养模型可靠性的关键参数 | 大规模分析揭示了氧气水平、培养基成分和血清浓度对球体特性的显著影响，并整合了单细胞RNA测序和自动图像分析技术 | 研究未涉及所有可能的实验变量，且结果可能受特定细胞类型或培养条件限制 | 提高3D细胞培养模型的可靠性和可重复性，以促进其在药物测试、个性化医疗和肿瘤生物学中的应用 | 三维(3D)细胞培养系统中的球体 | 生物医学研究 | NA | 单细胞RNA测序, 自动图像分析 | NA | 图像, 基因表达数据 | 32,000个球体图像 |
| 2394 | 2025-03-25 |
DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells
2025-Mar-21, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00215-5
PMID:40119174
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研究论文 | 本研究通过DNA甲基化和单细胞RNA测序技术，探讨了COVID-19患者急性期DNA甲基化变化与长期转录调控异常的关系 | 首次揭示了COVID-19急性期DNA甲基化变化与长期呼吸道基因表达失调的关联，特别是纤毛功能相关基因的持续抑制 | 样本量相对较小(n=19患者)，长期随访样本更少(n=5) | 阐明SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制 | COVID-19患者和对照组的鼻上皮细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | 酶促DNA甲基化测序，单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组甲基化数据，单细胞转录组数据 | 急性期：19例患者(14例scRNA-seq)和14例对照(10例scRNA-seq)；随访期：3个月(n=7)和12个月(n=5)；验证队列：15例(感染后6个月) |
| 2395 | 2025-03-25 |
Runx2 drives Schwann cells repair phenotype switch through chromatin remodeling and Sox2 activation after nerve injury
2025-Mar-21, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01142-4
PMID:40119274
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research paper | 本研究探讨了Runx2通过染色质重塑和Sox2激活调控雪旺细胞修复表型转换的机制 | 揭示了Runx2通过染色质重塑和转录因子激活调控雪旺细胞表型转换的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，人类细胞中的机制尚需进一步验证 | 探究Runx2在神经损伤后雪旺细胞表型转换中的表观遗传调控机制 | 雪旺细胞 | 分子生物学 | 神经损伤 | qPCR, ATAC测序, CUT&Tag测序, 单细胞RNA测序, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 单细胞RNA测序数据 | 健康成年Sprague-Dawley大鼠(100-150g) |
| 2396 | 2025-03-25 |
Exploring cell-to-cell variability and functional insights through differentially variable gene analysis
2025-Mar-20, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00507-z
PMID:40113778
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research paper | 本文介绍了一种名为spline-DV的统计框架，用于通过单细胞RNA测序数据进行差异变异性分析，以探索细胞间变异性和功能见解 | 提出了spline-DV方法，专注于分析单细胞基因表达数据的变异性，而非仅关注平均表达水平 | 未提及具体的技术限制或数据局限性 | 开发一种新的统计方法，以更深入地理解细胞系统的变异性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异性 | 生物信息学 | 肥胖、纤维化和癌症 | scRNA-seq | spline-DV | 基因表达数据 | NA |
| 2397 | 2025-03-25 |
RNA m7G methylation regulators and targets significantly contribute to chronic obstructive pulmonary disease
2025-Mar-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93901-w
PMID:40113900
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研究论文 | 本研究首次通过整合生物信息学方法探讨了m7G RNA甲基化调节因子在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的联合作用 | 首次发现m7G甲基化调节因子及其靶标在COPD中的重要作用，并鉴定出METTL1-CAT轴作为关键调控机制 | 研究结果需要进一步的实验验证 | 探讨m7G RNA甲基化在COPD发病机制中的作用 | COPD患者和细胞早衰模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 生物信息学分析，单细胞测序，qRT-PCR，GSEA | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 2398 | 2025-03-25 |
Intratumoral microbiota-aided fusion radiomics model for predicting tumor response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06369-7
PMID:40114207
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研究论文 | 本研究开发了一种基于瘤内微生物组和放射组学的融合模型，用于预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫疗法的病理完全缓解 | 首次结合瘤内微生物组特征和多时间点MRI放射组学特征构建预测模型，显著提高了预测准确性 | 样本量相对有限（124例患者），需要更大规模的研究验证 | 开发预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫疗法反应的非侵入性工具 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 16S rDNA测序、单细胞RNA测序、MRI影像分析 | 融合放射组学模型 | 微生物组数据、单细胞RNA测序数据、MRI影像数据 | 124例患者（训练集88例，验证集36例） |
| 2399 | 2025-03-25 |
Periarteriolar niches become inflamed in aging bone marrow, remodeling the stromal microenvironment and depleting lymphoid progenitors
2025-Mar-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412317122
PMID:40063797
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了衰老骨髓中LepR细胞和内皮细胞的变化及其对造血干细胞微环境的影响 | 首次发现衰老骨髓中动脉周围微环境炎症化现象，并阐明其通过干扰素依赖性机制重塑基质微环境并耗竭淋巴祖细胞 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究骨髓基质细胞在衰老过程中的变化及其对造血功能的影响 | 小鼠骨髓基质细胞（LepR细胞和内皮细胞） | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2月龄、12月龄和24月龄小鼠骨髓基质细胞 |
| 2400 | 2025-03-25 |
Cell type and region-specific transcriptional changes in the endometrium of women with RIF identify potential treatment targets
2025-Mar-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421254122
PMID:40063812
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研究论文 | 通过空间转录组学分析，识别了复发性植入失败（RIF）女性子宫内膜中区域和细胞类型特异的基因表达差异，并提出了潜在的治疗靶点 | 首次使用空间转录组学技术对RIF患者子宫内膜进行区域和细胞类型特异的基因表达分析，并发现不同区域和细胞类型之间存在显著差异 | 样本量较小（每组8人），且仅针对特定时间点的子宫内膜进行分析 | 探索复发性植入失败的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 复发性植入失败（RIF）患者和生育能力正常女性（FC）的子宫内膜组织 | 生殖医学 | 不孕症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 8名RIF患者和8名生育能力正常女性的子宫内膜活检样本 |