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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-05-02 |
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011665
PMID:41386973
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研究论文 | 本文研究原位DC启动疫苗联合CD137激动剂通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+T细胞应答诱导持久抗肿瘤免疫 | 首次揭示原位疫苗与CD137激动剂联合治疗通过cDC1细胞依赖性增强肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞应答,并实现Treg细胞功能重塑以减轻免疫抑制 | 研究局限于小鼠移植瘤模型,未验证在人类肿瘤微环境中的疗效及长期安全性 | 评估原位DC启动疫苗联合CD137激动剂在肺癌和结肠癌小鼠模型中的治疗潜力及免疫机制 | 肺癌和结肠癌小鼠移植瘤模型 | 免疫学 | 肺癌, 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 植入性小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2026-05-02 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to attenuate cortical excitability during TDP-43-related neurodegeneration
2025-Dec-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.016
PMID:40975067
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研究论文 | 该论文揭示了在TDP-43相关神经退行性变中,杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用来减弱皮质过度兴奋 | 首次发现杆状小胶质细胞亚群及其在神经退行性变中通过重塑兴奋性突触输入来保护神经元的机制,并阐明了TREM2在其中的关键作用 | 具体局限性未在摘要中提及 | 研究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性变中调控皮质兴奋性的作用 | rNLS8转基因小鼠模型中的小胶质细胞和神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 多通道探针记录、纵向体内钙成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、钙成像数据、基因表达数据 | rNLS8小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 223 | 2026-05-02 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
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研究论文 | 使用BARseq高通量原位测序技术,对小鼠大脑皮层1030万个细胞进行基因表达分析,揭示皮层区域身份与转录组特征的关系 | 首次利用大规模原位测序技术BARseq在单细胞分辨率下揭示皮层区域身份与转录组类型组成高度相关,并发现外周输入可调控区域内转录组身份 | 仅检测了104个细胞类型标记基因,未覆盖全转录组;研究仅针对小鼠模型,需进一步验证在其他物种中的适用性 | 探究大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中,以及这些特征在发育中如何建立 | 小鼠大脑皮层九个半球中的4194658个皮层神经元 | 数字病理学 | NA | 原位测序 | NA | 基因表达数据 | 1030万个细胞,包含9个小鼠前脑半球 | NA | 单细胞RNA测序 | BARseq | BARseq高通量原位测序技术 |
| 224 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: Advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Sep-17, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2026-05-02 |
Targeting Liver Epsins Ameliorates Dyslipidemia in Atherosclerosis through Inhibition of Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9-Mediated Low-density Lipoprotein Receptor Degradation
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609742
PMID:39253478
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研究论文 | 通过抑制PCSK9介导的低密度脂蛋白受体降解,靶向肝脏Epsins可改善动脉粥样硬化中的血脂异常 | 首次揭示肝脏Epsins通过其泛素相互作用基序(UIM)与LDLR结合,促进PCSK9介导的LDLR降解,从而加剧动脉粥样硬化,并提出了靶向Epsins的纳米颗粒siRNA疗法 | 主要基于小鼠模型,未在人体中验证疗效;长期安全性和副作用需进一步研究 | 探究肝脏Epsins是否及如何通过调节PCSK9介导的LDLR内吞和降解,影响LDL-C清除和动脉粥样硬化进程 | 肝脏特异性Epsin敲除的动脉粥样硬化小鼠模型(ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导) | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型:ApoE-/-和PCSK9-AAV8诱导的肝脏特异性Epsin敲除小鼠,西方饮食喂养 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 226 | 2026-05-02 |
Simulating paired and longitudinal single-cell RNA sequencing data with rescueSim
2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf442
PMID:40811017
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研究论文 | 介绍一种模拟配对和纵向单细胞RNA测序数据的新方法rescueSim | 首次在gamma-Poisson框架中引入样本间和受试者间变异性,实现对配对/纵向scRNA-seq数据的模拟 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够模拟配对/纵向scRNA-seq数据的方法,支持研究规划和功效分析 | 单细胞RNA测序数据中的时间依赖性转录组变化 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq模拟 | gamma-Poisson框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2026-05-02 |
Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs
2025-07-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205
PMID:40209410
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序探索孕期氟氯氰菊酯暴露对子代神经发育毒性的影响,揭示神经干细胞命运决定的关键作用 | 首次构建了孕期氟氯氰菊酯暴露后子代大脑海马区的单细胞图谱,并通过体内外实验验证了神经干细胞分化方向、增殖和凋亡水平改变是毒性主因 | NA | 阐明孕期氟氯氰菊酯暴露导致子代神经发育毒性的机制 | 不同年龄段的子代大鼠(新生儿、幼年等)及其海马组织 | 机器学习 | 神经发育毒性 | 单细胞RNA测序、差异表达分析、细胞间通讯分析、拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生儿大鼠海马组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2026-05-02 |
Elucidating brain transport pathways and cell type-dependent gene silencing of a durable lipid-siRNA conjugate administered into cerebrospinal fluid
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf600
PMID:40598893
|
研究论文 | 本研究开发了一种脂质-siRNA偶联物(L2-siRNA),注入脑脊液后可有效运输至大脑,实现区域性和细胞类型依赖的基因沉默 | 首次详细阐述了脂质-siRNA偶联物在脑脊液到大脑转运中的特性,展示了单次注射后长达5个月的持续基因沉默效果,并通过单细胞RNA测序构建了细胞类型特异性敲除图谱 | 未提供 | 阐明脂质-siRNA偶联物通过脑脊液给药后的大脑运输途径和细胞类型依赖性基因沉默机制 | 小鼠和大鼠的大脑组织及细胞 | 机器学习 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 测序数据 | 小鼠和大鼠样本 | 未提供 | 单细胞RNA测序 | 未提供 | 未提供 |
| 229 | 2026-05-02 |
Single-cell and spatiotemporal profile of ovulation in the mouse ovary
2025-Jun, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003193
PMID:40554460
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,构建小鼠卵巢排卵过程中的时空图谱,揭示卵巢细胞类型的时间依赖性转录状态和空间分布 | 首次在单细胞分辨率下详细描述排卵的精确时间窗口,并结合空间转录组学提供细胞类型的空间定位信息,同时发现新的配体-受体互作对 | 该研究仅基于小鼠模型,人类排卵机制可能存在差异,且细胞互作分析需进一步验证 | 揭示小鼠卵巢排卵过程中细胞类型的时空动态变化及其调控机制 | 小鼠卵巢细胞(包括卵母细胞、颗粒细胞、基质细胞等) | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的小鼠卵巢配对样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 230 | 2026-05-02 |
scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia
2025-05-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97958
PMID:40371706
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示支持细胞通过阶段特异性通讯介导非阻塞性无精子症的生殖障碍 | 首次在非阻塞性无精子症中鉴定出三种新型支持细胞亚型表型(SC4/未成熟、SC7/成熟、SC8/进一步成熟),并发现生殖细胞亚型与支持细胞亚型之间的阶段特异性匹配交互模式,由Notch1/2/3信号通路调控 | NA | 探究非阻塞性无精子症中生殖障碍的细胞类型特异性异常机制 | 阻塞性无精子症和非阻塞性无精子症患者的睾丸组织 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 231 | 2026-05-02 |
Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401475R
PMID:40270323
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研究论文 | 本研究探讨了脂氧素A4/FPR2信号通过NRF2依赖通路减轻肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次揭示脂氧素A4通过FPR2/NRF2通路特异性抑制肺泡上皮细胞铁死亡,从而保护肺移植后缺血再灌注损伤的分子机制 | 主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床验证尚有限;未深入探讨FPR2下游其他潜在信号通路 | 阐明脂氧素A4在肺缺血再灌注损伤中通过NRF2依赖途径抑制铁死亡的保护机制 | 肺移植患者术后肺组织、C57BL/6小鼠(野生型、Fpr2敲除、Nrf2敲除)、肺泡II型上皮细胞(ATII) | 分子生物学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、脂质组学数据 | 肺移植患者样本(具体数量未说明)、小鼠(野生型、Fpr2敲除、Nrf2敲除)、体外ATII细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-05-02 |
Impdh1 was identified as a key protein promotes diabetic vasculopathy by intervention of vascular endothelial cell pyroptosis
2025-03-13, BMC cardiovascular disorders
IF:2.0Q3
DOI:10.1186/s12872-025-04604-z
PMID:40082765
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研究论文 | 通过scRNA-seq和bulk RNA-seq分析,鉴定Impdh1为关键蛋白,通过干预血管内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变 | 首次通过单细胞RNA测序和批量RNA测序联合分析,鉴定Impdh1为与糖尿病血管病变相关的焦亡关键分子,并验证其在血管内皮细胞焦亡中的保护作用 | 未明确提及临床验证,且样本来源于小鼠模型和公共数据集,可能不完全代表人体病理过程 | 探索糖尿病血管病变中血管内皮细胞焦亡的分子机制及关键蛋白Impdh1的作用 | 糖尿病小鼠模型及GSE169332数据集中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 糖尿病血管病变 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量逆转录PCR, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据 | GSE169332数据集(scRNA-seq数据)及糖尿病小鼠主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-05-02 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable features from high-resolution spatial omics data
2025-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.02.636138
PMID:39974940
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研究论文 | scBSP是一个快速准确的开源工具,用于从高分辨率空间组学数据中识别空间可变特征 | 利用稀疏矩阵运算显著提升计算效率和内存使用,能在桌面电脑上10秒内处理超过18万个点的高清空间转录组数据,是当前处理此类数据最快的工具 | 未在文中明确说明局限性 | 开发一种高效计算工具,用于识别高分辨率空间组学数据中的空间可变生物学特征 | 空间组学数据中的空间可变基因和空间可变峰 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 空间转录组学,10x Xenium | NA | 空间组学数据(二维和三维) | 高分辨率空间转录组数据包含19950个基因和181367个点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium空间原位分析平台 |
| 234 | 2026-05-02 |
Sleeve gastrectomy reveals the plasticity of the human gastric epithelium
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56135-y
PMID:39833151
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研究论文 | 通过组织学和单细胞RNA测序,发现袖状胃切除术导致人类胃上皮细胞重塑,包括产酸壁细胞和肠嗜铬样细胞亚群的变化 | 首次在单细胞水平揭示袖状胃切除术后人类胃上皮的重塑机制,并建立胃泌素调控胃酸稳态的数学模型 | 本文未明确提及局限性 | 探究袖状胃切除术后胃上皮细胞的适应性重塑机制 | 12名接受袖状胃切除术的女性患者的胃上皮细胞 | 数字病理学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 非线性比例积分控制模型 | 转录组数据 | 12名女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2026-05-02 |
Detecting gene expression in Caenorhabditis elegans
2025-01-08, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae167
PMID:39693264
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综述 | 介绍秀丽隐杆线虫中检测基因表达的多种方法,包括原位检测、批量RNA测序、单细胞RNA测序和高通量蛋白质组学 | 系统总结了近年来线虫基因表达检测技术的新进展,并提供了选择方法和公开资源的实用指导 | 未深入比较各技术的具体性能指标或局限性,可能缺乏对最新前沿技术(如空间转录组学)的覆盖 | 为线虫基因表达检测方法提供综述和选择指南 | 秀丽隐杆线虫 | 自然语言处理 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 原位杂交 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-05-02 |
Epigenetic control of antigen presentation failure in osteosarcoma: from single-cell chromatin maps to therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728091
PMID:41383594
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迷你综述 | 本文综述了骨肉瘤中抗原呈递失败的表观遗传调控机制,并阐述了单细胞染色质图谱如何指导恢复肿瘤抗原可见性的治疗策略 | 通过整合单细胞ATAC-seq与单细胞和空间转录组学,解析了HLA、NLRC5及抗原加工基因的启动子-增强子可及性,区分可逆性抑制与固定病变,并将微环境应激与干扰素能力联系起来 | 尽管有令人鼓舞的临床前证据,但疗效将取决于克隆选择、保持干扰素信号传导的治疗安排以及与先天激动剂和免疫检查点阻断剂的合理组合 | 阐明骨肉瘤中抗原呈递失败的表观遗传机制,并概述单细胞染色质分析如何指导恢复肿瘤抗原可见性的策略 | 骨肉瘤肿瘤免疫生态系统中的恶性克隆、分化状态、髓系细胞和T细胞微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 237 | 2026-05-02 |
Development of a Multilayered Prognostic Model for Wilms' Tumor Based on Characteristic Lymphocyte Genes
2025, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/1964582
PMID:41438620
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研究论文 | 基于特征淋巴细胞基因构建Wilms肿瘤多层预后模型 | 首次整合淋巴细胞基因表达与临床因素建立Wilms肿瘤预后列线图,利用单细胞RNA测序数据识别关键基因 | 未提及 | 开发整合遗传和临床因素的Wilms肿瘤预后列线图,提高评估准确性和临床效用 | Wilms肿瘤患者 | 机器学习 | 肾母细胞瘤 | RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归模型,列线图 | 基因表达数据 | 125名患者(RNA-seq),2437个样本(scRNA-seq) | 未提及 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 未提及 | 未提及 |
| 238 | 2026-05-01 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing analysis reveals characteristics of a unique subpopulation in high-grade IDH-mutant astrocytoma
2025-Dec-29, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01139-5
PMID:41460424
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组测序分析揭示高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个独特亚群的特征 | 首次通过单细胞和空间转录组测序联合分析,鉴定出高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个具有免疫抑制表型、与不良预后相关的独特肿瘤细胞亚群 | NA | 识别高级别IDH突变型星形细胞瘤中独特的肿瘤细胞亚群及其特征 | 高级别(WHO 3-4级)和低级别(WHO 2级)IDH突变型星形细胞瘤样本 | 数字病理学 | 星形细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 239 | 2026-05-01 |
Dermatomyositis is characterized by JAK1-mediated monocyte-driven vasculopathy and inflammation
2025-Dec-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea9007
PMID:41442501
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析皮肌炎中JAK1介导的单核细胞驱动血管病变和炎症机制 | 首次通过跨疾病比较(皮肌炎与红斑狼疮)揭示皮肌炎特异性单核细胞与内皮细胞互作导致的血管病变,并发现JAK1抑制可逆转相关表型 | 样本量有限且主要聚焦皮肤组织,对肌肉病变机制未深入探讨 | 阐明皮肌炎免疫发病机制,尤其是血管病变和炎症的分子基础 | 皮肌炎患者的非病灶皮肤、病灶皮肤及外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯网络分析 | 基因表达数据 | 皮肌炎、红斑狼疮患者及健康对照的皮肤和外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 240 | 2026-05-01 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-12-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了Igf2调控早期出生后DPP4+前脂肪细胞池扩展的机制 | 首次发现Igf2在早期生命阶段通过促进DPP4+前脂肪细胞增殖而非分化来驱动脂肪组织扩展 | 未提供具体局限性信息 | 阐明早期生命阶段促进脂肪组织快速扩展的分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织中的DPP4+前脂肪细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢健康肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮下脂肪组织样本(断奶前和成年小鼠) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |