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当前共找到 10572 篇文献,本页显示第 2361 - 2380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2361 2026-03-14
An automatic annotation tool and reference database for T cell subtypes and states at single-cell resolution
2025-05-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究构建了最大的人类T细胞参考数据库,并开发了名为STCAT的自动注释工具,用于单细胞RNA测序数据中T细胞亚型和状态的精准注释 构建了包含134.8万个T细胞、涵盖35种条件和16种组织的最大人类T细胞参考数据库;开发了基于分层模型和标记物校正的新型自动注释工具STCAT,其准确率比现有工具提高28%;首次系统揭示了CD4 Treg细胞在肿瘤样本中的富集现象以及CD8 naive相关细胞在健康个体中的丰度特征 参考数据库主要基于现有公开数据集构建,可能无法涵盖所有疾病状态和组织类型;工具验证仅在六个独立数据集上进行,需要更广泛的临床验证 开发T细胞亚型和状态的自动注释工具及参考数据库,以促进T细胞免疫和肿瘤免疫学研究 人类T细胞(包括CD4和CD8 T细胞) 单细胞组学 肺癌、COVID-19、卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 分层模型 单细胞转录组数据 1,348,268个T细胞,来自35种条件和16种组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2362 2026-03-14
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用多样性远交小鼠的单细胞转录组数据,构建细胞类型特异性网络,以解析人类骨密度GWAS关联基因的潜在因果作用 首次结合单细胞转录组轨迹分析与网络驱动基因识别,从细胞状态动态变化角度揭示骨密度调控新机制 研究基于小鼠模型数据,在人类中的直接验证尚需进一步实验 解析骨密度GWAS关联基因的细胞类型特异性功能与因果机制 骨髓来源基质细胞在成骨条件下的分化过程 单细胞转录组学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 网络分析 单细胞转录组数据 多样性远交小鼠的骨髓基质细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2363 2026-03-14
The impact of breast radiotherapy on the tumor genome and immune ecosystem
2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究探讨了放疗对雌激素受体阳性乳腺癌患者肿瘤基因组和免疫微环境的影响 首次结合单细胞DNA测序和单细胞RNA测序技术,在放疗前后时间点分析乳腺癌肿瘤的克隆选择和免疫细胞动态变化 样本量较小(20名患者),仅针对雌激素受体阳性乳腺癌,且随访时间较短(放疗后7天) 阐明放疗如何调节乳腺癌肿瘤微环境,特别是对肿瘤基因组和免疫生态系统的影响 20名接受新辅助放疗的雌激素受体阳性乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 20名患者,其中8名进行scDNA-seq,11名进行scRNA-seq,在放疗前和放疗后7天采集肿瘤活检样本 NA 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
2364 2026-03-14
Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析探索瘢痕疙瘩的分子机制,识别了关键基因和免疫细胞参与 结合bulk RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析和单细胞RNA测序,首次系统识别DUSP1和HOXA5作为瘢痕疙瘩的关键枢纽基因,并揭示IL17信号通路和免疫细胞(如肥大细胞和巨噬细胞)的关键作用 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;多组学数据的整合分析可能存在技术偏差 识别瘢痕疙瘩的潜在致病机制、枢纽基因和免疫细胞参与,为靶向治疗提供新见解 瘢痕疙瘩组织 生物信息学 皮肤肿瘤(瘢痕疙瘩) bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫浸润分析, GSEA, GSVA, 网络分析 NA 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2365 2026-03-14
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1
研究论文 本研究基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,识别并验证了瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物及巨噬细胞极化类型 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,利用WGCNA和三种机器学习方法识别出BMP1和IL1R1作为新型生物标志物,并揭示了瘢痕疙瘩中M2巨噬细胞显著增加而M1减少的极化异常 研究依赖于公共数据库数据,样本量可能有限,且实验验证仅通过WB和IF进行,需要进一步功能研究确认机制 识别瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型,为治疗提供新见解 瘢痕疙瘩组织样本 生物信息学 瘢痕疙瘩 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, 机器学习(LASSO, SVM-RFE, RF), 蛋白质印迹, 免疫荧光 LASSO, SVM-RFE, 随机森林 RNA-seq数据 多个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051),具体样本数未明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2366 2026-03-14
Kölliker's Organ Functions as a Developmental Hub in Mouse Cochlea Regulating Spiral Limbus and Tectorial Membrane Development
2025-03-26, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型,揭示了Kölliker's器官作为发育枢纽,调控小鼠耳蜗螺旋缘和盖膜发育的关键作用 首次发现Kölliker's器官通过上皮-间质信号通路(涉及CTGF因子)非自主性调控螺旋缘间质基质发育,并确认其为新的耳聋基因 研究局限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证;单细胞测序样本量有限 探究Kölliker's器官在耳蜗发育中的功能及其对听力形成的影响 基因敲除小鼠的耳蜗组织(Kölliker's器官、螺旋缘、盖膜) 发育生物学 听力障碍 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除、听觉脑干反应测试 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、组织形态学数据、生理功能数据 未明确样本数量的小鼠耳蜗组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2367 2026-03-14
High-throughput single cell -omics using semi-permeable capsules
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种基于半透性胶囊(SPCs)的高通量单细胞组学技术,用于多种核酸分析,包括数字PCR、基因组测序和单细胞RNA测序 开发了基于半透性胶囊的通用技术,克服了液滴微流体系统长期培养和克隆扩增的限制,提供了更高的转录本捕获效率 未明确说明技术在大规模应用中的成本、通量上限或与其他单细胞平台的直接比较数据 开发一种高效、可定制的单细胞组学技术,用于解析生物系统的复杂性和异质性 造血系统疾病患者的白细胞,特别是急性髓系白血病样本中的成熟粒细胞和单核细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、数字PCR、基因组测序、FACS分选 NA 单细胞转录组数据 造血系统疾病患者的白细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 CapSeq(胶囊测序) 基于半透性胶囊(SPCs)的单细胞测序技术,支持长期细胞培养和克隆扩增
2368 2026-03-14
Linking Cellular Senescence to Vascular Pathology: The Diagnostic Potential of Superoxide Dismutase 2 in Aortic Dissection
2025, Vascular health and risk management IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学和单细胞转录组学分析,探讨了血管衰老的分子和细胞机制及其在主动脉夹层(AD)发病中的关键作用,并确定了超氧化物歧化酶2(SOD2)作为AD的潜在诊断生物标志物和治疗靶点 首次将SOD2与主动脉夹层的血管衰老和免疫调节联系起来,并通过单细胞RNA测序揭示了其在巨噬细胞和树突状细胞中的特异性表达,同时构建了基因-药物相互作用网络以探索靶向治疗的可能性 研究主要基于公开数据集和单细胞测序数据,需要进一步的实验验证和临床队列研究来确认SOD2的诊断和治疗价值 探讨血管衰老在主动脉夹层发病中的分子和细胞机制,并寻找潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 主动脉夹层组织样本及相关公开数据集(GSE52093, GSE153434) 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, ROC分析 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 基于两个公开数据集(GSE52093, GSE153434)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2369 2026-03-14
Exhaustion of NK cells and interferon activation in anti-MDA5+ dermatomyositis are associated and determine the development of ILD
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了抗MDA5+皮肌炎患者中干扰素过度激活导致自然杀伤细胞耗竭,并与间质性肺病的发生发展相关 首次在抗MDA5+皮肌炎患者中,通过单细胞RNA测序揭示了干扰素信号通路广泛激活与自然杀伤细胞耗竭之间的关联,并证实了这种耗竭与间质性肺病严重程度的相关性 样本量较小(仅6名患者),且为横断面研究,无法确定因果关系 探究抗MDA5+皮肌炎患者外周血中自然杀伤细胞和干扰素信号的作用,特别是在间质性肺病发展中的作用 抗MDA5+皮肌炎患者(伴有或不伴有间质性肺病)的外周血单个核细胞和血清样本 数字病理学 皮肌炎与间质性肺病 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外细胞培养实验 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,血清细胞因子数据 6名新诊断的活动性抗MDA5+皮肌炎患者(3名伴有ILD,3名不伴有ILD),以及一个独立队列用于验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2370 2026-03-13
Multimodal Integration of Genomic Data Reveals Regulatory Mechanisms at the Polycystic Ovary Syndrome (PCOS)-Associated 12q13.2 Locus
2025-Nov-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多种基因组数据,揭示了多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的调控机制 首次整合全外显子组测序、STARR-seq增强子活性和单细胞RNA测序数据,系统解析了PCOS相关基因座的功能机制 研究主要聚焦于12q13.2基因座,可能未涵盖PCOS的其他遗传因素;样本来源相对有限 阐明多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的遗传变异功能机制 多囊卵巢综合征患者和正常对照的卵泡膜细胞 基因组学 多囊卵巢综合征 全外显子组测序, STARR-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组测序, eQTL共定位分析 NA 基因组变异数据, 增强子活性数据, 单细胞表达数据 PCOS患者和正常对照的卵泡膜细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 全基因组测序 NA NA
2371 2026-03-13
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
综述 本文总结了肝脏分区在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 利用单细胞基因组学和空间转录组学技术深化了对肝脏分区的理解 NA 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老中的作用 肝脏细胞,特别是沿门静脉-中央静脉轴的肝细胞 数字病理学 NA 单细胞基因组学,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2372 2026-03-13
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究揭示了接头蛋白Kindlin-2通过重塑造血过程和调节PD-L1表达,在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的关键作用 首次阐明Kindlin-2通过系统性调节造血过程(促进髓系细胞扩增)和肿瘤PD-L1表达,驱动三阴性乳腺癌免疫逃逸的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;未详细探讨Kindlin-2调控造血和PD-L1表达的具体下游信号通路 探究Kindlin-2在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的作用机制,并评估其作为免疫治疗联合靶点的潜力 三阴性乳腺癌肿瘤模型、荷瘤小鼠的造血系统及肿瘤微环境 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、基因敲除 基因敲除小鼠模型 RNA测序数据、免疫组化图像 未明确说明具体样本数量,但涉及荷瘤小鼠模型及多种测序分析 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2373 2026-03-13
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究优化了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系,以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控特征 开发了一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境下评估胶质瘤代谢的可行方法,结合人血浆样培养基和稳定同位素示踪技术,揭示了传统培养条件中被抑制的代谢和免疫程序 该方法仍为体外模型,可能无法完全模拟体内复杂的生理和免疫相互作用 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 代谢组学 胶质母细胞瘤 稳定同位素示踪技术、空间转录组学 NA 代谢数据、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2374 2026-03-13
[Research progress on the mechanistic role and constituents of hepatic macrophages during the occurrence and development of hepatic fibrosis]
2025-Feb-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
综述 本文综述了肝纤维化发生发展中肝巨噬细胞的机制作用、构成及其亚型,并探讨了单细胞测序技术揭示的新发现以及靶向巨噬细胞治疗的优势 总结了单细胞测序技术揭示的肝纤维化过程中巨噬细胞的新亚型和作用模式,并分析了靶向巨噬细胞治疗相较于传统抗纤维化疗法的优势 NA 阐明肝巨噬细胞在肝纤维化发生发展中的机制作用和构成,并探讨新的治疗方向 肝巨噬细胞 NA 肝纤维化 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
2375 2026-03-13
CancerTrace: Multi-stage single-cell analysis of networked cancer evolution for driver and modulator gene identification
2025, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本文介绍了一种名为CancerTrace的计算框架,用于从单细胞RNA测序数据中识别癌症驱动基因及其上游调控因子 结合转移熵和稀疏条件结构于变分贝叶斯模型中,实现时间感知的动态调控机制重建,无需匹配DNA或外部扰动数据 仅基于九个纵向scRNA-seq文库(来自三名肺腺癌患者),样本规模较小,且仅应用于肺腺癌 识别患者特异性癌症驱动基因及其上游调控因子,以推进精准肿瘤学 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 变分贝叶斯模型 单细胞RNA测序数据 九个纵向scRNA-seq文库,来自三名肺腺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2376 2026-03-13
Comparative single-cell landscape of immune cells in human livers affected HBV and non-viral cirrhosis
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了HBV与非病毒性肝硬化患者肝脏中的免疫细胞景观,揭示了疾病进展中的不同免疫机制 首次在单细胞水平上系统比较HBV与非病毒性肝硬化中的免疫细胞异质性,并整合空间转录组数据验证细胞共定位 样本量有限,主要基于HBV肝硬化患者,未涵盖所有非病毒性肝硬化亚型 阐明HBV与非病毒性肝硬化中免疫细胞景观的差异及其在疾病进展中的作用 HBV肝硬化患者、非病毒性肝硬化患者及健康对照者的肝脏组织 数字病理学 肝硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 HBV肝硬化患者与健康对照者的肝脏组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2377 2026-03-10
Pharmacological Inhibition of Ferroptosis Attenuates Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究探讨了铁死亡在腹主动脉瘤形成中的作用,并通过药理学抑制铁死亡来减轻实验性腹主动脉瘤的形成 首次在腹主动脉瘤形成中揭示了铁死亡的作用,并展示了使用liproxstatin-1抑制铁死亡可减轻主动脉炎症和重塑 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且仅使用了一种铁死亡抑制剂 探究铁死亡在腹主动脉瘤形成中的机制及药理学抑制的潜在治疗效果 人类腹主动脉瘤组织、C57BL/6小鼠(雄性和雌性)的主动脉组织、巨噬细胞和平滑肌细胞 单细胞组学 腹主动脉瘤 单细胞RNA测序、质谱分析、组织学分析、体外细胞培养 NA 单细胞RNA测序数据、质谱数据、组织图像、体外实验数据 人类AAA组织数据库、使用弹性蛋白酶或弹性蛋白酶+β-氨基丙腈诱导的C57BL/6小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2378 2026-03-10
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Oct, Journal of the Royal Society, Interface
研究论文 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式,首次实现了从混沌系统中进行准确预测 首次引入混沌学习,通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入交互式混沌动力系统,并调制其动态行为以实现准确预测 NA 探索混沌系统的可预测性,并开发一种能够从混沌中提取物理属性的新学习范式 28个数据集,包括脑波、蛋白质基准数据、单细胞RNA测序数据和图像数据,以及Lorenz和Rossler吸引子两种混沌动力系统 机器学习 NA 单细胞RNA测序 混沌学习范式 脑波数据、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 28个数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2379 2026-03-10
Nephrobase Cell+: Multimodal Single-Cell Foundation Model for Decoding Kidney Biology
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了首个专注于肾脏的大型基础模型Nephrobase Cell+,用于解码肾脏生物学 首次构建了肾脏特异性的大型基础模型,通过器官规模的多模态预训练和专门的Transformer架构,实现了跨物种、跨模态的高保真表示学习 模型主要针对四种哺乳动物物种,可能无法完全覆盖所有肾脏细胞类型或疾病状态 开发一个统一的、高保真的肾脏生物学表示模型,以提升单细胞分析能力 人类、小鼠、大鼠和猪的肾脏单细胞和单核转录组及空间转录组数据 机器学习 肾脏疾病 scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq, 空间转录组学 Transformer-based encoder-decoder with gene-token cross-attention and mixture-of-experts 单细胞和单核转录组、表观基因组及空间转录组数据 约39.5百万个单细胞和单核图谱,来自4,319个样本 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
2380 2026-03-10
Single-cell transcriptome combined with genetic tracing reveals a roadmap of fibrosis formation during proliferative vitreoretinopathy
2025-Sep-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪技术,揭示了增殖性玻璃体视网膜病变(PVR)中纤维化形成的细胞起源和机制,并识别了TSP-1作为关键驱动基因 首次结合单细胞转录组学和遗传谱系追踪,系统绘制了PVR纤维化形成的细胞路线图,并发现TSP-1作为治疗靶点 NA 解析增殖性玻璃体视网膜病变(PVR)中纤维化形成的细胞机制,以开发治疗策略 视网膜色素上皮细胞、免疫细胞和Müller细胞在PVR病变中的贡献 数字病理学 增殖性玻璃体视网膜病变 单细胞转录组学,遗传谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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