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当前共找到 10536 篇文献,本页显示第 2341 - 2360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2341 2025-12-23
Transcriptomic Profiling of Bronchial Epithelium Reveals Dysregulated Interferon and Inflammatory Responses to Rhinovirus in Exacerbation-Prone Pediatric Asthma
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过转录组学分析揭示了易发作性儿童哮喘患者支气管上皮细胞对鼻病毒感染表现出失调的干扰素和炎症反应 首次在易发作性儿童哮喘患者中,结合器官型支气管上皮培养、批量与单细胞转录组学及靶向蛋白分析,系统揭示了低基线干扰素水平是宿主对鼻病毒不良反应易感性的可调节因果决定因素 研究样本量有限,且主要基于体外培养模型,可能无法完全反映体内复杂环境 探究宿主因素对鼻病毒诱导哮喘发作易感性的影响 来自哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮培养物 数字病理学 哮喘 批量转录组学, 单细胞转录组学, 靶向蛋白分析 NA 转录组数据, 蛋白质数据 来自哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮培养物样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2342 2025-12-23
Induction of menstruation in mice reveals the regulation of menstrual shedding
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过建立转基因小鼠模型,模拟人类月经的关键特征,并利用单细胞空间转录组学揭示了月经前子宫内膜分层和脱落的空间调控新机制 首次建立了能够重现人类月经关键特征的转基因小鼠模型,并提出了子宫内膜成纤维细胞空间分化驱动组织分层和脱落的新范式 小鼠模型与人类月经生理仍存在差异,研究结果需要进一步在人类样本中验证 研究月经过程中子宫内膜选择性脱落的调控机制 转基因小鼠的子宫内膜组织 单细胞空间转录组学 生殖系统疾病 单细胞空间转录组学,靶向化学遗传学激活 转基因小鼠模型 空间转录组数据 转基因小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞空间转录组学 NA NA
2343 2025-12-23
Cmpk2 Protects Against Acute Lung Injury in Mice
2025-Jul-05, Lung IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了线粒体代谢酶Cmpk2在铜绿假单胞菌诱导的急性肺损伤中的作用及其保护机制 首次揭示了Cmpk2通过STING依赖的机制增强中性粒细胞吞噬功能并减轻肺部炎症,从而在急性肺损伤中发挥保护作用 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型,在人体中的直接验证尚不充分,且STING通路的具体调控机制有待进一步阐明 探究Cmpk2在急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征中的功能与分子机制 Cmpk2基因敲除小鼠、斑马鱼胚胎、ARDS患者样本 数字病理学 急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA、GO/KEGG分析、苏木精-伊红染色 基因敲除动物模型 基因表达数据、病理图像、细胞计数数据 未明确样本数量,但使用了小鼠模型、斑马鱼胚胎及公共数据库(GEO)中ARDS患者数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2344 2025-12-23
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了高原脑水肿后认知衰退中少突胶质细胞与神经元相互作用的新机制 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在高原脑水肿模型中系统解析了少突胶质细胞与神经元间的相互作用机制,并发现了PI3K/mTOR动态变化、Rps29-bax轴及Tnfrsf21-App作为新型调控因子 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;仅观察了3天和7天两个时间点,长期效应尚不明确 探究高原脑水肿导致认知衰退的细胞与分子机制 高原脑水肿小鼠模型中的海马组织细胞 数字病理学 高原脑水肿 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2345 2025-12-22
Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis
2025-Dec-18, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和TRAP-seq技术,在小鼠动脉粥样硬化模型中表征了巨噬细胞在主动脉、脂肪组织和肝脏中的功能多样性,并识别了Trem2、Folr2和Slc7a7作为巨噬细胞相关生物标志物,用于疾病诊断和监测 首次结合单细胞RNA测序和TRAP-seq技术,系统评估了巨噬细胞在动脉粥样硬化关键组织中的组织特异性基因程序,并识别了跨物种共享的生物标志物,包括Trem2作为循环生物标志物、Folr2和Slc7a7作为PET示踪剂靶点 研究基于小鼠模型,人类样本验证有限;PET示踪剂应用尚处探索阶段,需进一步临床验证 阐明巨噬细胞在动脉粥样硬化中的驱动机制,识别可用于诊断、监测和治疗的生物标志物 小鼠动脉粥样硬化模型中的巨噬细胞,涉及主动脉、脂肪组织和肝脏组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, TRAP-seq, PET成像 NA RNA测序数据, 成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2346 2025-12-22
[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]
2025-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:41399063
研究论文 本研究通过B细胞单细胞RNA测序对干燥综合征患者进行分子分型,揭示了三种具有不同基因特征和临床异质性的亚型 首次利用B细胞scRNA-seq数据对干燥综合征患者进行无监督聚类,建立了分子分型框架,并识别了亚型特异性的核心调控基因和潜在治疗靶点 研究样本量相对较小(24名患者和4名健康对照),且数据来源于公共数据库,缺乏独立验证队列 建立干燥综合征的分子分类框架,以阐明其临床异质性并为靶向治疗提供见解 干燥综合征患者和健康对照者的B细胞 单细胞组学 干燥综合征 单细胞RNA测序 无监督聚类 单细胞RNA测序数据 24名干燥综合征患者和4名健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2347 2025-12-22
Pomalidomide enhances CAR-T cell therapeutic efficacy and remodels immune microenvironment in lymphoid malignancies
2025-Dec-18, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨了泊马度胺如何增强CAR-T细胞功能并重塑免疫微环境,以克服淋巴恶性肿瘤治疗中的局限性 揭示了泊马度胺通过直接增强CAR-T细胞功能(如记忆、细胞因子/趋化因子产生、代谢适应性和减少耗竭)以及重塑抑制性免疫微环境(增加细胞毒性效应细胞、减少MDSC活性)来协同CAR-T治疗的机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本仅来自一名淋巴瘤患者,样本量有限,需要更大规模的临床研究验证 阐明泊马度胺增强CAR-T细胞功能和重塑免疫微环境的机制,以优化难治性淋巴恶性肿瘤的治疗组合 人类CAR-T细胞、多发性骨髓瘤异种移植模型、淋巴瘤患者外周血单个核细胞 肿瘤免疫治疗 淋巴恶性肿瘤 CCK-8、LDH、qPCR、ELISA、流式细胞术、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、细胞表型数据 体外人类CAR-T细胞、多发性骨髓瘤异种移植模型、一名淋巴瘤患者的外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2348 2025-12-22
Integrating whole-exome sequencing and scRNA-seq reveal the characteristic in one clear cell renal cell carcinoma sample arising in the setting of VHL disease
2025-Dec-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序技术,揭示了VHL疾病背景下透明细胞肾细胞癌的基因表达特征和肿瘤微环境特点 首次在单细胞水平上对VHL疾病相关的ccRCC进行特征分析,并整合了DNA突变和转录组数据以揭示其独特特性 仅使用了一个VHL突变样本进行研究,样本量较小,可能限制结果的普遍性 探究VHL疾病背景下透明细胞肾细胞癌的分子特征和肿瘤微环境 一个VHL突变ccRCC样本和六个非VHL突变ccRCC样本 数字病理学 肾癌 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 Seurat 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 一个VHL突变ccRCC样本和六个非VHL突变ccRCC样本 NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 NA NA
2349 2025-12-22
Molecular subtyping and prognostic evaluation in idiopathic pulmonary fibrosis: a focus on mechanical-related genes
2025-Dec-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究聚焦于机械力相关基因,对特发性肺纤维化进行分子分型与预后评估 首次将机械力相关基因评分应用于IPF,识别出与机械力相关的核心基因和分子亚型,并通过单细胞RNA测序和CMap分析揭示了潜在的致病机制与治疗靶点 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列验证核心基因的预后价值 探究机械敏感基因在特发性肺纤维化发病机制中的作用,并进行分子分型与预后评估 特发性肺纤维化患者样本与对照样本 生物信息学 肺纤维化 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法,Cox回归分析,Connectivity Map分析 机器学习算法,Cox回归模型,列线图 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床病理数据 IPF样本与对照样本(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2350 2025-12-22
IFN-Mediated Bronchial Epithelium Cellular Senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Dec, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者支气管上皮细胞中细胞衰老的机制,并探讨了IFN通路在其中的作用 首次在COPD中结合单细胞RNA测序技术,系统分析了支气管上皮细胞亚型中的衰老标记分布,并发现I/II型干扰素介导的衰老表型,以及JAK-STAT和cGAS-STING通路抑制剂对衰老的缓解作用 研究样本量有限,且主要基于体外培养细胞和组织学分析,未涉及长期体内干预效果验证 阐明COPD中支气管上皮细胞衰老的分子机制及其在疾病发病中的作用 COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞及肺组织 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织学图像 COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2351 2025-12-22
MAGNET: Multi-view graph autoencoder with cell-gene attention for cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2025-Dec, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为MAGNET的多视图图自编码器框架,通过细胞-基因注意力模块整合细胞外部相互作用与内部基因调控,用于从空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 开发了细胞-基因注意力模块,将细胞环境与内部基因活动在统一表示中连接,克服了现有方法将两者分离处理的限制 未明确提及 从空间转录组数据中准确推断细胞间相互作用网络 空间转录组数据中的细胞 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 多视图图自编码器 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2352 2025-12-22
Determining gene specificity from multivariate single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于熵度量的基因特异性测量方法ember,用于分析单细胞RNA测序数据,并应用于小鼠和人类数据集 基于公理化方法定义了基因特异性测量的四个关键属性,并开发了唯一满足这些属性的ember方法 未明确讨论方法在复杂生物系统或大规模数据集中的计算效率或可扩展性限制 识别单细胞基因组学数据中基因对生物类别或实验条件的特异性 小鼠八个组织的基因表达数据及人类PBMC样本 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 八个小鼠组织及255名个体的人类PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2353 2025-12-22
Orchestrating Spatial Transcriptomics Analysis with Bioconductor
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一个基于Bioconductor在R中用于空间转录组学数据分析的开源在线书籍,包含可复现的代码示例、数据集和工作流讨论 提供了一个自由访问、开源、持续更新和测试的在线资源,整合了空间组学数据分析的多步骤工作流,并支持与Python的互操作性 NA 简化和标准化空间转录组学数据的分析流程,促进可复现性研究 空间转录组学数据及其分析工作流 生物信息学 NA 空间转录组学技术 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2354 2025-12-22
Insights into the relevance of targeting fibroblasts to control cancer
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
综述 本文总结并讨论了以癌症相关成纤维细胞为靶点控制癌症的新进展,并探讨了其异质性对未来治疗策略的影响 探讨了利用单细胞RNA测序等高通量技术结合AI平台解析CAF异质性,并前瞻性地讨论了针对CAF复杂起源的个性化治疗需求 NA 探讨靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞以控制癌症的潜力和策略 癌症相关成纤维细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序,蛋白质组学 NA 转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2355 2025-12-22
Virus envelope glycoprotein targeting bispecific T cell engager protects mice from lethal severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术数据,揭示了T细胞缺陷与功能障碍在严重发热伴血小板减少综合征(SFTS)致死病例中的关键作用,并设计了一种靶向病毒包膜糖蛋白的双特异性T细胞衔接器(BiTE)抗体,在小鼠模型中有效治疗了致命的SFTSV感染 首次利用单细胞RNA测序和流式细胞术数据,系统分析了SFTS患者中T细胞(特别是CD4 T细胞)的细胞毒性受损和耗竭状态与致死后果的关联,并创新性地设计了靶向SFTSV包膜糖蛋白Gn的BiTE抗体,成功在小鼠模型中实现了对致命感染的救援 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行临床试验,且BiTE抗体的长期安全性和有效性需进一步评估 开发针对SFTSV的有效治疗干预措施,通过增强T细胞介导的免疫反应来消除病毒感染细胞 SFTS患者和小鼠模型中的T细胞(特别是CD4和CD8 T细胞)以及SFTSV感染的细胞 免疫学与传染病学 严重发热伴血小板减少综合征(SFTS) 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2356 2025-12-22
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文研究了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何通过髓系细胞-肿瘤相互作用促进肿瘤生长 首次将肿瘤糖基化(Tn糖抗原)与CD301b凝集素信号传导联系起来,揭示了CD301b在调节乳腺癌免疫微环境中的关键作用,并指出其作为潜在治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自单细胞RNA测序分析,缺乏直接的功能验证;未探讨CD301b在其他癌症类型中的普适性 探究糖基化-凝集素相互作用在乳腺癌进展中的具体机制,并识别潜在的免疫治疗靶点 小鼠三阴性乳腺癌模型和人类乳腺癌样本中的免疫细胞(特别是CD301b/CLEC10A表达的髓系细胞) 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序,转录组分析,表型分析 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2357 2025-12-22
Genetic Convergence Analysis of CRISPR Perturbations Deciphers Gene Functional Similarity
2025-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为XConTest的两步交叉验证方法,用于评估CRISPR扰动之间的遗传收敛性,以量化基因功能相似性 提出了一种统计方法来量化CRISPR扰动之间的相似性,解决了现有方法大多启发式的问题,通过近似标准正态的检验统计量评估扰动对细胞表达谱的正交影响 未明确提及具体样本量或实验平台细节,可能依赖于现有数据集 开发统计方法以量化CRISPR扰动之间的遗传收敛性,从而解读基因功能相似性 CRISPR扰动、基因功能相似性、下游基因表达 机器学习 自闭症、免疫相关疾病 CRISPR筛选、单细胞RNA测序(Perturb-seq) 统计检验方法(XConTest) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2358 2025-12-22
Heimdall: A Modular Framework for Tokenization in Single-Cell Foundation Models
2025-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了Heimdall,一个用于系统评估单细胞基础模型中标记化策略的模块化框架和开源工具包 提出首个全面框架,将单细胞基础模型分解为模块化组件,实现标记化策略的细粒度控制和归因,并系统评估其在跨分布转移场景下的影响 未明确说明样本量或具体数据集细节,可能限制了结果的普适性验证 系统评估单细胞基础模型中标记化策略对模型性能的影响,特别是在分布转移场景下 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 Transformer 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2359 2025-12-22
D-dimer drives immune dysregulation in COVID-19 via chemokine modulation and inflammatory signaling
2025-Nov, Virus research IF:2.5Q3
研究论文 本研究探讨了D-二聚体在COVID-19中通过调节趋化因子和炎症信号通路驱动免疫失调的作用 揭示了D-二聚体作为血栓炎症反应的潜在驱动因子,不仅作为临床生物标志物,还通过上调趋化因子(如CXCL5、CXCL6)和富集IL-17、PI3K-Akt等炎症通路来调节免疫微环境 体外实验使用THP-1细胞系,可能无法完全模拟体内复杂免疫环境;样本来自上海地区,可能存在地域局限性 探究D-二聚体在COVID-19免疫调节中的作用机制 COVID-19患者(轻症和重症)及SARS-CoV-2阴性对照参与者 生物信息学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、体外细胞刺激实验 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 356名参与者(包括轻症和重症COVID-19患者及阴性对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2360 2025-12-22
Age-Related Changes in Myeloid Cells and Their Impact on Subcutaneous Melanoma Growth in Mice
2025-Nov, Aging and cancer
研究论文 本研究探讨了衰老如何通过改变Gr-1+髓系细胞的功能来影响小鼠皮下黑色素瘤的生长及免疫治疗反应 揭示了衰老背景下Gr-1+髓系细胞功能增强(如CD8+ T细胞抑制、活性氧产生和胞外陷阱形成)与黑色素瘤生长加速及免疫治疗反应差异之间的关联,并首次证明髓过氧化物酶(MPO)在此过程中的关键驱动作用 研究主要在YUMM1.7黑色素瘤细胞系和小鼠模型中进行,结论可能不适用于所有黑色素瘤亚型或人类情况;研究聚焦于Gr-1+髓系细胞,其他免疫细胞类型的影响未全面探讨 表征衰老如何改变Gr-1+髓系细胞功能及其对黑色素瘤生长和免疫治疗反应的影响 2月、6月和12月龄的野生型小鼠及同基因型髓过氧化物酶缺陷小鼠,以及多种YUMM黑色素瘤细胞系(特别是YUMM1.7) 肿瘤免疫学 黑色素瘤 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞功能分析(CD8+ T细胞抑制、活性氧检测、胞外陷阱形成评估) 小鼠皮下黑色素瘤模型 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、肿瘤生长测量数据 多个年龄组(2、6、12月龄)的野生型和MPO缺陷型小鼠,使用多种YUMM黑色素瘤细胞系进行肿瘤生长评估 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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