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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2341 | 2025-11-30 |
Tumor-intrinsic MHC-II activation in pancreatic ductal adenocarcinoma enhances immune response and treatment efficacy
2025-Oct-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.21.683745
PMID:41278823
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研究论文 | 本研究探讨胰腺导管腺癌中恶性细胞固有MHC-II表达对免疫微环境和治疗效果的调控作用 | 首次系统揭示恶性细胞固有MHC-II表达在PDAC中的预后价值及其通过增强抗原呈递促进抗肿瘤免疫的机制 | 研究主要基于临床前模型,需要在更大规模的人类队列中验证 | 探究MHC-II在PDAC恶性细胞中的表达特征及其对免疫治疗疗效的影响 | 人类PDAC样本和KPC小鼠PDAC模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重免疫组织化学,体外培养实验 | NA | 基因表达数据,空间定位数据,组织切片图像 | 人类PDAC样本和KPC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2342 | 2025-11-30 |
Identification of Apically Localized Endogenous Dental Pulp Stem Cells
2025-Oct-18, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251378094
PMID:41108143
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系追踪技术识别了小鼠磨牙根尖定位的内源性Axin2+牙髓干细胞 | 首次在牙根尖部位发现内源性Axin2+牙髓干细胞,并揭示其在牙髓组织形成和损伤修复中的动态过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类牙髓干细胞的特性和行为可能存在差异 | 探索牙髓干细胞在牙髓和牙本质再生中的原位作用机制 | 小鼠磨牙牙髓组织和根尖乳头组织 | 干细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学,谱系追踪 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | 小鼠磨牙组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2343 | 2025-11-30 |
Age- and Sex- Driven Transcriptional and Metabolic Diversity in Myeloid-Derived Suppressor Cells After Mouse Sepsis
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680736
PMID:41278644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了年龄和性别对脓毒症诱导的髓源性抑制细胞转录组和代谢状态的显著影响 | 首次在单细胞水平系统揭示年龄和性别因素对脓毒症中MDSC转录组和代谢状态的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 阐明年龄和性别因素如何影响脓毒症诱导的髓源性抑制细胞生物学特性 | 年轻和老年雄性和雌性小鼠的脾脏白细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻组(3-4个月)和老年组(18-24个月)雄性和雌性小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2344 | 2025-11-30 |
Coxsackievirus B infection invokes unique cell-type-specific responses in primary human pancreatic islets
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116211
PMID:40892543
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示柯萨奇病毒B3感染在人胰岛中引发独特的细胞类型特异性反应 | 挑战了关于胰岛特异性病毒靶向的长期假设,发现导管细胞而非β细胞表现出最强的干扰素和HLA相关反应,并鉴定长非编码RNA MIR7-3HG在调节病毒感染中的作用 | 使用人尸体胰岛可能无法完全反映活体状态,干细胞衍生的胰岛模型可能与原代胰岛存在差异 | 探究柯萨奇病毒B感染对不同类型人胰岛细胞的特异性影响及其与1型糖尿病的关联 | 原代人胰岛细胞和干细胞衍生的胰岛 | 单细胞生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人尸体胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2345 | 2025-11-30 |
Somatic mutations distinguish melanocyte subpopulations in human skin
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637114
PMID:39975212
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研究论文 | 通过深度表型分析揭示人类皮肤中黑色素细胞亚群的体细胞突变特征及其空间分布 | 首次发现低突变负荷黑色素细胞亚群在日光损伤皮肤中的持续存在,并揭示其干细胞特性及毛囊保护性微环境 | 样本量相对有限(31名供体),主要关注体细胞突变而未深入探讨其他分子机制 | 探究人类皮肤黑色素细胞的稳态调控机制和亚群异质性 | 人类皮肤黑色素细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤疾病 | 单细胞空间转录组测序 | NA | 基因表达数据、突变数据、形态学数据 | 31名供体的297个黑色素细胞 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium单细胞空间转录组平台 |
| 2346 | 2024-11-30 |
Dissecting the effect of genetic variants on atherosclerosis: integrating bulk and single-cell transcriptomics
2025-Jan-16, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae489
PMID:39607792
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2347 | 2025-11-30 |
Analysis of the Mechanism Underlying Radiotherapy Resistance Caused by Oligodendroglia Cells in Glioblastoma by Applying the Single-cell RNA Sequencing Technology
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胶质母细胞瘤中少突胶质细胞导致放疗抵抗的分子机制 | 首次识别出两个具有放疗抵抗特性的少突胶质细胞亚群ODC3和ODC4,并揭示它们通过不同分子通路获得放疗抵抗性 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索胶质母细胞瘤放疗抵抗的分子机制及关键影响因素 | 胶质母细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Monocle2, AUCell, maftools | 单细胞RNA测序数据,基因突变数据 | 来自GEO和TCGA数据库的胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2348 | 2025-11-30 |
Integrated Single-cell RNA-seq and Bulk RNA-seq Identify Diagnostic Biomarkers for Postmenopausal Osteoporosis
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,筛选出绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞转录组图谱和WGCNA分析骨质疏松症,识别出单核细胞亚型特异性表达的新型生物标志物 | 未提及样本量的具体数字和验证队列的详细信息 | 探索绝经后骨质疏松症的诊断生物标志物,为早期诊断和治疗靶点提供依据 | 绝经后骨质疏松症患者样本 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, 基因集富集分析 | 列线图诊断模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2349 | 2025-11-30 |
Proximity-based proteomics (BioID) uncovers the Rho GTPase interactome in kidney podocytes
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1625950
PMID:41306285
|
研究论文 | 本研究通过邻近标记技术绘制了肾足细胞中Rho GTPases的相互作用网络 | 首次在足细胞中系统绘制RhoA、Rac1和Cdc42的相互作用组,发现约50%的相互作用是足细胞特有的,并鉴定出KIAA1522作为新型Cdc42效应子和ARHGEF12作为关键RhoA调节因子 | NA | 揭示肾足细胞中Rho GTPases的信号网络及其在足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾足细胞、HEK293细胞、HeLa细胞、斑马鱼模型 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | 邻近依赖性生物素标记(BioID)、单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据 | NA | NA | 邻近标记蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2350 | 2025-11-30 |
Targeting Matrix Metalloproteinase-9 to Alleviate T Cell Exhaustion and Improve Sepsis Prognosis
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0996
PMID:41306770
|
研究论文 | 本研究通过构建分子互作扰动网络,首次揭示脓毒症免疫异质性的网络生物学基础,并确定单核细胞来源的MMP9是驱动CD4 T细胞功能障碍的关键调节因子 | 首次构建脓毒症免疫异质性的分子互作扰动网络,发现MMP9通过双重机制调控T细胞耗竭,并验证选择性MMP9抑制剂可逆转T细胞功能障碍 | NA | 阐明脓毒症免疫异质性的分子机制并寻找有效治疗靶点 | 人类外周血样本和免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,功能验证 | NA | 转录组数据,蛋白质数据,功能实验数据 | 1,862例人类外周血样本,超过450,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2351 | 2025-11-30 |
Ocular surface health and disease: insight from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1683167
PMID:41306916
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼表组织健康与疾病研究中的原理、应用及局限性 | 首次系统总结scRNA-seq在眼表组织细胞多样性解析和疾病机制研究中的综合应用 | 技术本身存在检测灵敏度限制和细胞捕获偏差,且眼表组织样本获取难度较大 | 探讨单细胞RNA测序技术在眼表组织研究和疾病机制解析中的应用价值 | 眼表组织(角膜、睑板腺、结膜、泪腺)及相关疾病 | 单细胞组学 | 眼表疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2352 | 2025-11-30 |
Multi-omics reveals that NOTCH1 promotes cervical cancer progression and reduces radiosensitivity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1703032
PMID:41306984
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了NOTCH1在促进宫颈癌进展和降低放疗敏感性中的作用机制 | 首次从单细胞水平揭示NOTCH1在宫颈癌恶性细胞中的表达特征及其通过MIF配体-受体通路影响浆细胞分化的新机制 | NA | 阐明NOTCH1在宫颈癌进展和放疗抵抗中的分子机制 | 宫颈癌组织和细胞系 | 生物医学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,cDNA微阵列,高通量测序,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2353 | 2025-11-30 |
The Role of Vitamin D Metabolism-Related Genes in Recurrent Pregnancy Loss and Their Immune Microenvironmental Changes
2025, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S541670
PMID:41307047
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示了维生素D代谢相关基因DOCK11和ETV2在复发性流产中的作用机制 | 首次将维生素D代谢基因与复发性流产的免疫微环境变化联系起来,并发现DOCK11和ETV2作为新型生物标志物 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 阐明维生素D代谢在复发性流产发生中的潜在机制 | 复发性流产患者的基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 复发性流产 | 转录组测序, RT-qPCR, Western blotting, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 2354 | 2025-11-30 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
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综述 | 本章重点阐述多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学机制中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,结合单细胞测序、空间转录组学等高通量工具,重建连接遗传风险、基因调控、蛋白质功能障碍和代谢失衡的分子网络 | 面临数据异质性和标准化有限的挑战 | 推进神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化(ALS)等神经退行性疾病 | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序,空间转录组学,质谱分析,基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,神经影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2355 | 2025-11-30 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
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综述 | 本章概述精准医学如何重塑神经退行性疾病的认知、诊断和治疗方式 | 整合基因治疗、药物基因组学和个性化生活方式策略,并引入单细胞转录组学、数字孪生等未来工具 | 存在试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等应用挑战 | 推动精准医学在神经退行性疾病领域从研究向临床实践转化 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病患者 | 精准医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、成像技术、数字工具、生物标志物分析 | 数字孪生 | 遗传数据、分子数据、生物标志物、临床特征、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2356 | 2025-11-29 |
Single-Cell Atlas of Aging Human Skin Reveals FOSB-Related Transcriptional Programs and Druggable Targets
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70569
PMID:41293818
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类皮肤衰老图谱,揭示FOSB相关转录程序和可药物靶点 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示人类皮肤衰老的转录调控网络,发现FOSB作为关键衰老相关转录因子 | 样本数量有限,仅比较年轻和老年组,缺乏中间年龄段数据 | 研究人类皮肤衰老的细胞类型特异性转录调控机制和潜在治疗靶点 | 年轻和老年人皮肤细胞 | 单细胞基因组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年人类皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2357 | 2025-11-29 |
Integrated Aerobic Exercise and Multisensory Environment Training for Age-related Cognitive Decline via Hippocampal-prefrontal Neural Circuit Modulation
2025-Nov-28, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05302-9
PMID:41313574
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研究论文 | 本研究开发了一种结合有氧运动和多感官环境训练的新型干预方法,通过调节海马-前额叶神经回路改善年龄相关认知衰退 | 首次将有氧运动与多感官环境训练相结合,并揭示了海马-前额叶神经回路在此过程中的关键作用机制 | 研究仅使用老年小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索联合训练改善年龄相关认知衰退的神经机制 | 老年小鼠 | 神经科学 | 老年性疾病 | 神经回路追踪、化学遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 神经活动数据、基因表达数据 | 老年小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2358 | 2025-11-29 |
Multiplexed Transcriptomics for Screening Drug Combinations and Defining the Mechanism of Action of HCC Therapeutics at Single-Cell Resolution
2025-Nov-27, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70148
PMID:41308634
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研究论文 | 本研究利用高通量单核测序平台筛选肝癌治疗药物组合,并通过单细胞转录组学分析揭示HY组合通过诱导铁死亡抑制肿瘤细胞增殖的机制 | 首次将高通量单细胞筛选与机制解析相结合,在单细胞分辨率下系统评估药物组合对肝癌细胞的影响并发现JUN是关键调控因子 | 研究主要聚焦于HY药物组合,其他潜在有效组合可能需要进一步探索 | 筛选抗肝癌药物组合并阐明其作用机制 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单核测序,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | snHH-seq | 高通量高灵敏度单核测序平台 |
| 2359 | 2025-11-29 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
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研究论文 | 本研究通过活体成像和空间转录组学技术鉴定出促进免疫治疗反应的肿瘤微环境结构CRATER | 首次在斑马鱼和人类黑色素瘤中发现CRATER结构,揭示其作为CD8+T细胞与肿瘤细胞相互作用的关键区域 | 研究主要聚焦于黑色素瘤,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探索免疫治疗中T细胞与肿瘤细胞相互作用的时空动态机制 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | NA | 图像、空间转录组数据 | 斑马鱼和人类黑色素瘤样本(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2360 | 2025-11-29 |
Gut microbiota L-ornithine promotes resistance to obesity through metabolites mediated immunosuppressive macrophages
2025-Nov-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05882-8
PMID:41291317
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物代谢物L-鸟氨酸通过调控巨噬细胞功能抵抗肥胖的新机制 | 首次发现L-鸟氨酸通过下游代谢物精胺和亚精胺调控巨噬细胞向免疫抑制表型极化,从而抵抗肥胖 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢物在肥胖发病机制中的保护作用 | 小鼠模型和肥胖人群 | 代谢疾病研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和肥胖人群样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |