单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2321	2025-06-11	Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies age associated changes in macrophages and signaling dynamics 2025-Jun-03, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioaf122 PMID:40459236	研究论文	通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析，研究了年轻和老年小鼠卵巢中髓系细胞的功能特征及其在卵巢衰老过程中的作用	发现老年小鼠卵巢中独特的Cx3cr1lowCd81hi巨噬细胞亚群，以及ANNEXIN和TGFβ信号通路的显著改变，揭示了卵巢衰老相关炎症和纤维化的新机制	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类卵巢中进行验证	探究髓系细胞在卵巢衰老过程中的作用及其机制	年轻（3个月大）和老年（14-17个月大）小鼠卵巢中的CD45+ CD11b+髓系细胞	单细胞分析	卵巢衰老	单细胞RNA测序（scRNAseq）、流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据	年轻和老年小鼠卵巢中的髓系细胞
2322	2025-06-11	BNT162b2 COVID-19 vaccination elicits the expansion of CD16+CD8+ T cells endowed with natural killer cell features 2025-Jun, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2025.01.024 PMID:39894227	研究论文	研究BNT162b2 COVID-19疫苗接种后引发的CD16+CD8+ T细胞亚群的扩增及其自然杀伤细胞特征	揭示了BNT162b2 mRNA疫苗能诱导CD16+CD8+ T细胞的扩增，这些细胞具有自然杀伤细胞的功能特征，并能通过抗体依赖性细胞毒性(ADCC)对抗更广泛的疾病	研究样本量较小（30名健康个体），且未探讨这些细胞在长期免疫保护中的作用	表征BNT162b2 mRNA疫苗接种后出现的非常规T细胞亚群	30名接受BNT162b2 mRNA疫苗接种的健康个体的外周血T细胞	免疫学	COVID-19	多参数流式细胞术和单细胞转录组分析	NA	外周血样本	30名健康个体
2323	2025-06-11	Kinesin family member 4 a drives Cancer stem cell characteristics in breast Cancer: Insights from scRNA-Seq and experimental validation 2025-Jun, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144308 PMID:40383330	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，识别了乳腺癌中的癌症干细胞标记基因，并验证了其功能	通过单细胞RNA测序和实验验证，确定了驱动蛋白家族成员4A等基因在乳腺癌干细胞特性中的核心作用	研究主要基于特定数据集（GSE180286和TCGA乳腺癌数据集），可能不适用于所有乳腺癌亚型	识别乳腺癌中的癌症干细胞标记基因并验证其功能	乳腺癌干细胞	生物信息学	乳腺癌	scRNA-Seq, bulk RNA-Seq, WGCNA	NA	RNA测序数据	GSE180286数据集和TCGA乳腺癌数据集中的样本
2324	2025-06-11	Integrative genome-wide association studies, proteome-wide Mendelian randomization, and single-cell RNA sequencing identify interleukin-6 receptor protein as a therapeutic target in aortic aneurysm 2025-Jun, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144380 PMID:40409638	research paper	该研究通过整合全基因组关联研究、蛋白质组孟德尔随机化和单细胞RNA测序数据，识别出白细胞介素-6受体蛋白作为主动脉瘤的治疗靶点	整合多种组学数据识别新的生物标志物和治疗靶点，特别是IL6R在主动脉瘤中的潜在作用	靶向IL6R的药物可能存在副作用，需要进一步考虑	识别主动脉瘤的新生物标志物和治疗靶点	主动脉瘤患者和对照组的遗传数据	基因组学和蛋白质组学	心血管疾病	GWAS, PW-MR, 单细胞RNA测序	NA	遗传数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据	8125名主动脉瘤患者和381,977名对照
2325	2025-06-11	Single-cell and spatial transcriptomics reveals an anti-tumor neutrophil subgroup in microwave thermochemotherapy-treated lip cancer 2025-05-13, International journal of oral science IF:10.8Q1 DOI:10.1038/s41368-025-00366-8 PMID:40360503	研究论文	通过单细胞转录组学和空间转录组学揭示了微波热化疗治疗唇癌中具有抗肿瘤活性的中性粒细胞亚群	发现微波热化疗（MTC）能促进具有抗肿瘤活性的MNDA TANs（N1表型）浸润，并揭示了这些TANs通过IL1B-IL1R激活T&NK细胞和成纤维细胞的机制	需要进一步验证MX2作为N1-TANs标记物在临床中的实用性	探究微波热化疗治疗唇鳞状细胞癌的分子机制	唇鳞状细胞癌（LSCC）患者样本	数字病理学	唇癌	scRNA-seq, ST, 深度学习	深度学习	单细胞转录组数据, 空间转录组数据, H&E染色图像	NA
2326	2025-06-11	Mechanism and Efficacy of Etanercept in Treating Autoimmune-like Manifestations of Coronavirus Disease 2019 in elderly individuals 2025-May, Immunobiology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.imbio.2025.152898 PMID:40168796	研究论文	本研究评估了TNF抑制剂依那西普在老年COVID-19患者中的治疗效果，通过观察性分析发现依那西普能改善临床指标并缓解自身免疫样表现	首次在老年COVID-19患者中评估依那西普的疗效，发现其对自身免疫样表现的治疗潜力，并通过单细胞测序揭示了治疗敏感细胞类型	样本量较小（7名治疗患者），且为观察性研究而非随机对照试验	评估依那西普对老年COVID-19患者的治疗效果	老年COVID-19患者	临床医学	COVID-19	单细胞测序、分子对接	NA	临床指标数据、单细胞转录组数据	7名接受依那西普治疗的COVID-19患者和2名未感染个体
2327	2025-06-11	Single-cell sequencing systematically analyzed the mechanism of Emdogain on the restoration of delayed replantation periodontal membrane 2025-04-17, International journal of oral science IF:10.8Q1 DOI:10.1038/s41368-024-00345-5 PMID:40246878	研究论文	本研究通过单细胞测序系统分析了Emdogain（EMD）在延迟再植牙周膜修复中的作用机制	首次在单细胞分辨率下揭示EMD促进牙周膜修复的细胞和分子机制，并发现Vtn+成纤维细胞在组织再生中的关键作用	研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人体验证	探究EMD促进牙周膜修复的细胞和分子机制	大鼠延迟再植牙模型	数字病理学	牙周疾病	单细胞测序、Micro-CT、HE染色、TRAP染色、免疫荧光染色	NA	单细胞测序数据、影像数据	大鼠延迟再植牙模型（具体数量未明确说明）
2328	2025-06-10	Genetically supported causality between gut microbiota, prefrontal cortex and depression: insights from multiple Mendelian randomization, multi-omics analysis, and network pharmacology 2025-Oct-01, Journal of affective disorders IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.jad.2025.119458 PMID:40419156	研究论文	通过多组学分析和网络药理学方法，研究肠道菌群与前额叶皮层及抑郁症之间的遗传支持因果关系	首次通过多变量孟德尔随机化分析揭示了肠道菌群通过前额叶皮层结构介导对抑郁症的影响，并鉴定了潜在的治疗靶点和药物	研究结果主要基于遗传数据，需要进一步实验验证	探究肠道菌群与前额叶皮层及抑郁症之间的因果关系及其生物学机制	肠道菌群、前额叶皮层、抑郁症患者	多组学分析	抑郁症	GWAS、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序、分子对接	孟德尔随机化模型	基因组数据、转录组数据、影像数据	肠道菌群(n=5959)、抑郁症(43,280病例/329,192对照)、脑影像表型(n=33,224)
2329	2025-06-10	Endothelial Nrf2 deficiency promotes atherosclerotic lesion formation by shaping a proinflammatory niche 2025-Aug-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123725 PMID:40404122	research paper	研究探讨了内皮细胞中Nrf2缺乏如何通过促炎性微环境促进动脉粥样硬化斑块形成	揭示了内皮细胞Nrf2缺乏如何通过改变细胞间通讯和促炎性因子分泌促进动脉粥样硬化	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究内皮细胞Nrf2在动脉粥样硬化中的细胞特异性作用和细胞间通讯机制	小鼠主动脉内皮细胞和动脉粥样硬化斑块	心血管疾病	动脉粥样硬化	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织学分析	Nrf2Cdh5tKO小鼠模型	基因表达数据, 组织学数据	Nrf2Cdh5tKO小鼠和对照Nrf2flox/flox小鼠
2330	2025-06-10	Single-cell transcriptomics and metabolomics reveal the potential role of ASRGL1 in metabolic reprogramming and invasion of nasopharyngeal carcinoma cells 2025-08, The international journal of biochemistry & cell biology DOI:10.1016/j.biocel.2025.106788 PMID:40320045	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和代谢组学分析，探讨了ASRGL1在鼻咽癌细胞代谢重编程和侵袭中的潜在作用	首次揭示了ASRGL1在鼻咽癌中的表达特征及其对细胞代谢和侵袭的影响	研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内实验验证	探究ASRGL1在鼻咽癌中的功能角色及其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力	鼻咽癌细胞系C666-1	癌症研究	鼻咽癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、氨基酸代谢组学、GC-MS顶空代谢组学	NA	转录组数据、代谢组数据	公开数据集GSE150430及C666-1细胞系
2331	2025-06-10	Single-cell transcriptional profiling reveals cellular senescence and inflammatory persistence as key features of type 1 diabetes partial remission 2025-Jul, Diabetes, obesity & metabolism DOI:10.1111/dom.16384 PMID:40183401	研究论文	通过单细胞RNA测序研究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制	揭示了1型糖尿病部分缓解期未被认识的免疫失调特征，包括单细胞亚群的分子特征和动态变化	研究仅基于外周血单个核细胞，未涉及其他免疫细胞或组织	探究1型糖尿病部分缓解期的免疫机制	健康对照者、新诊断的1型糖尿病患者和处于部分缓解期的患者	单细胞转录组学	1型糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康对照者、新诊断T1D患者和PR阶段患者的PBMCs样本
2332	2025-06-10	A survey of the methodological process of modeling, inference, and evaluation of gene regulatory networks using scRNA-Seq data 2025-Jul, Bio Systems DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105464 PMID:40409400	综述	本文综述了利用scRNA-Seq数据建模、推断和评估基因调控网络的方法学过程	揭示了scRNA-Seq技术在基因调控网络推断中的技术和方法学挑战，并提出了更稳健的方法学过程建议	缺乏关于真实网络的知识以及评估指标的非标准化，导致算法性能比较困难	探讨scRNA-Seq数据在基因调控网络推断中的方法学挑战和改进方向	基因调控网络（GRNs）	生物信息学	NA	scRNA-Seq	NA	基因表达数据	NA
2333	2025-06-10	CD44 Deficiency Induces Combinatory NRF2 Inhibition and Endoplasmic Reticulum Stress-Associated Dyserythropoiesis 2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202500228R PMID:40488748	research paper	本研究探讨了CD44在终末红细胞生成中的作用及其功能机制，发现CD44缺失会导致骨髓红细胞生成异常并加剧苯肼诱导的溶血性贫血	揭示了CD44通过调节PI3K/AKT/NRF2和p62/NRF2通路维持红细胞生成过程中的氧化还原稳态和蛋白质稳态的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类红细胞生成中的CD44功能需要进一步验证	阐明CD44在终末红细胞生成中的具体作用和分子机制	CD44敲除小鼠和其红细胞前体细胞	分子生物学	溶血性贫血	单细胞测序分析	CD44敲除小鼠模型	基因表达数据和细胞表型数据	CD44敲除小鼠及其红细胞前体细胞
2334	2025-06-10	Loss of ARNTL Enhances ER Stress and Apoptosis in CKD Through Disruption of NRF2 Signaling 2025-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202403398RRR PMID:40489010	研究论文	本研究揭示了ARNTL通过调控NRF2信号通路在慢性肾病(CKD)中对抗内质网(ER)应激和细胞凋亡的关键保护作用	首次发现ARNTL-NRF2轴在肾小管细胞中的保护机制，并证实其可作为CKD治疗的潜在靶点	研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚未在人体进行临床验证	探究CKD中ER应激导致肾小管细胞凋亡的分子机制	慢性肾病患者和小鼠模型的肾小管细胞	分子病理学	慢性肾病	单细胞测序、蛋白质相互作用分析	HK2细胞系和小鼠CKD模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	CKD患者样本和CKD模型小鼠
2335	2025-06-10	Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Functional and Spatial Heterogeneity of Atrial and Ventricular Cardiomyocytes in the Heart 2025-Jun-09, Molecular biotechnology IF:2.4Q3 DOI:10.1007/s12033-025-01443-3 PMID:40488964	研究论文	本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了心房和心室心肌细胞在心脏中的功能和空间异质性	首次结合scRNA-seq和空间转录组学技术，系统解析了心房和心室心肌细胞的空间分布及细胞间通讯网络	研究主要基于小鼠模型，结果在人类心脏中的适用性需要进一步验证	探究心脏中心房和心室心肌细胞的空间分布特征及其细胞间通讯机制	心房心肌细胞(aCM)和心室心肌细胞(vCM)	空间转录组学	心血管疾病	scRNA-seq, 空间转录组学	t-SNE聚类分析	单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据	未明确说明样本数量，使用分离的心脏细胞
2336	2025-06-10	Principles of synaptogenesis: Insights from Caenorhabditiselegans 2025-Jun-07, Current opinion in neurobiology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.conb.2025.103056 PMID:40483740	review	本文综述了基于秀丽隐杆线虫模型的突触形成、组织和精细化的当前理解	利用秀丽隐杆线虫的基因编辑、显微镜技术、单细胞转录组分析和计算分析等最新进展，深入探索突触形成和调控的机制	NA	探讨突触形成的原理及其在神经系统连接中的作用	秀丽隐杆线虫的神经系统	神经科学	NA	基因编辑、显微镜技术、单细胞转录组分析、计算分析	NA	NA	NA
2337	2025-06-10	High-throughput differentiation of human blood vessel organoids reveals overlapping and distinct functions of the cerebral cavernous malformation proteins 2025-Jun-06, Angiogenesis IF:9.2Q1 DOI:10.1007/s10456-025-09985-5 PMID:40478324	research paper	通过高通量分化人类血管类器官，揭示了脑海绵状血管畸形蛋白的共同和独特功能	结合高通量血管类器官分化、单细胞RNA测序和高内涵成像技术，揭示了CCM蛋白在神经元、间充质和内皮细胞群体中的特异性基因表达模式	研究主要基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境	探究CCM1、CCM2和CCM3基因突变导致不同临床表型的分子机制	人类诱导多能干细胞分化的血管类器官	生物医学研究	脑海绵状血管畸形	高通量类器官分化、单细胞RNA测序、高内涵成像	类器官模型	基因表达数据、图像数据	使用96孔板格式进行高通量实验
2338	2025-06-10	A spatially organized Cd24a+/Pax9+ stem cell core governs postnatal tooth establishment 2025-Jun-06, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adu5653 PMID:40479070	research paper	本研究揭示了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在哺乳动物牙齿后生建立中的空间组织作用	发现了Cd24a+/Pax9+干细胞核心在牙齿发育过程中的空间组织模式及其对牙根形成的调控作用	未详细探讨Cd24a+/Pax9+干细胞核心在其他矿化组织中的作用	探究牙齿后生建立过程中干细胞的空间组织模式及其调控机制	小鼠和人类的牙齿发育过程	发育生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq), CUT&Tag, 空间定位分析	NA	基因表达数据, 空间定位数据	未明确说明样本数量，但涉及小鼠和人类牙齿组织
2339	2025-06-10	Cathepsin C correlates with M2 macrophage infiltration and regulates the tumor growth and metastasis in non-small cell lung cancer 2025-Jun-05, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-14341-3 PMID:40474091	研究论文	探讨组织蛋白酶C（CTSC）在非小细胞肺癌（NSCLC）中的作用及其与M2巨噬细胞浸润的关系	首次系统分析了CTSC在NSCLC中的表达及其与M2巨噬细胞浸润的关联，并验证了CTSC对肿瘤生长和转移的调控作用	研究主要基于体外和动物实验，临床样本验证仍需进一步扩大	阐明CTSC在NSCLC进展和转移中的分子机制及其潜在治疗价值	非小细胞肺癌（NSCLC）细胞系、临床样本及动物模型	肿瘤免疫学	非小细胞肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组织化学、基因集富集分析（GSEA）	NA	基因表达数据、临床样本数据	临床NSCLC队列（具体数量未明确说明）及体外细胞系实验
2340	2025-06-10	Targeting CD39 boosts PD-1 blockade antitumor therapeutic efficacy via strengthening CD8 + TILs function and recruiting B cells in cervical cancer 2025-Jun-03, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-025-03500-0 PMID:40462160	research paper	该研究探讨了靶向CD39如何通过增强CD8+TILs功能和招募B细胞来提高PD-1阻断在宫颈癌中的抗肿瘤疗效	发现CD39在耗竭的CD8+T细胞中高表达，并验证了CD39抑制不仅能增强CD8+TILs的细胞毒性，还能通过增加CXCL13分泌促进B细胞浸润，从而放大PD-1阻断的抗肿瘤免疫	样本量较小（仅10名宫颈癌患者），且研究主要基于体外实验和皮下肿瘤模型，未涉及临床试验	寻找增强免疫检查点阻断（ICBs）对宫颈癌患者疗效的新型联合治疗策略	宫颈癌患者和皮下肿瘤模型	肿瘤免疫治疗	宫颈癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据和临床数据	10名宫颈癌患者及TCGA数据库中的队列