单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2321	2025-03-23	Lepidopteran scale cells derive from sensory organ precursors through a canonical lineage 2025-Mar-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204501 PMID:40052482	研究论文	本文通过发育和转录组学证据，揭示了鳞翅目昆虫鳞片的分化源自感觉器官前体细胞（SOP）	首次通过活体成像和单核RNA测序技术，揭示了鳞翅目昆虫鳞片分化的细胞谱系和基因表达模式，并发现了一个新的转录因子pdm3在鳞片分化中的作用	研究主要基于鳞翅目昆虫的早期蛹期翅膀，可能无法完全代表其他发育阶段或物种的鳞片分化机制	探索鳞翅目昆虫鳞片的起源和分化机制	鳞翅目昆虫的鳞片和感觉器官前体细胞（SOP）	发育生物学	NA	活体成像、单核RNA测序	NA	基因表达数据、影像数据	早期蛹期翅膀的细胞样本
2322	2025-03-23	Lymphocyte Subpopulations in the Healthy Human Lacrimal Gland and Their Variations With Age and Sex, Systematic Review 1960-2023 2025-Mar, Immunity, inflammation and disease DOI:10.1002/iid3.70167 PMID:40105662	系统综述	本文通过系统综述和荟萃分析，探讨了健康人类泪腺中淋巴细胞亚群及其随年龄和性别变化的规律	首次系统性地回顾了1960年至2023年间关于健康人类泪腺中淋巴细胞亚群的研究，并进行了荟萃分析	研究中40岁以下个体和女性的代表性不足，且不同研究对泪腺淋巴细胞浸润的定义和量化标准存在较大差异	明确健康人类泪腺中主要淋巴细胞亚群及其随年龄和性别的变化	健康人类泪腺	免疫学	NA	苏木精和伊红染色、免疫组织化学、免疫荧光	NA	文献数据	774名健康个体（其中722名为尸体）
2323	2025-03-23	Heterozygous GAA knockout is nonconsequential on metabolism and the spatial liver transcriptome in high-fat diet-induced obese and prediabetic mice 2025-Mar, Physiological reports IF:2.2Q3 DOI:10.14814/phy2.70276 PMID:40108792	研究论文	本研究探讨了在高脂饮食诱导的肥胖和糖尿病前期小鼠中，杂合性GAA敲除对肝脏代谢和代谢健康的影响	首次使用空间转录组学分析揭示了高脂饮食对门静脉周围和静脉周围肝细胞基因丰度的影响，并发现杂合性GAA敲除对这些影响无显著改变	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类或其他动物模型	探讨GAA敲除对肝脏代谢和代谢健康的影响	高脂饮食诱导的肥胖和糖尿病前期小鼠	代谢研究	肥胖和糖尿病	空间转录组学分析	小鼠模型	基因表达数据	高脂饮食诱导的肥胖和糖尿病前期小鼠
2324	2025-03-23	Aberrant Hematopoiesis and CD8+ T-Cell Activation in Thymoma-Associated Pure Red Cell Aplasia 2025-Mar, Thoracic cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1111/1759-7714.70046 PMID:40109027	研究论文	本文通过单细胞RNA测序等技术，研究了胸腺瘤相关纯红细胞再生障碍性贫血（PRCA）中的造血异常和CD8+ T细胞激活机制	首次通过单细胞RNA测序揭示了胸腺瘤相关PRCA患者骨髓中红细胞祖细胞的显著减少和粒细胞-单核细胞祖细胞的增加，并发现CD8+ T细胞激活的增强与炎症性骨髓环境相关	研究样本量较小，且未进行长期随访以验证治疗靶点的有效性	探讨胸腺瘤相关PRCA的免疫机制，特别是CD8+ T细胞激活对红细胞生成的影响	胸腺瘤相关PRCA患者和健康对照者的骨髓细胞及外周血CD8+ T细胞	免疫学	纯红细胞再生障碍性贫血	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序、流式细胞术、细胞因子分析	NA	RNA测序数据、流式细胞术数据、细胞因子数据	胸腺瘤相关PRCA患者和健康对照者的骨髓细胞及外周血CD8+ T细胞
2325	2025-03-23	Single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal transcriptional cell lineage heterogeneity in extracranial arteriovenous malformation 2025-Feb-24, Journal of dermatological science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.02.005 PMID:40118698	研究论文	本文通过单细胞和空间转录组分析，揭示了颅外动静脉畸形（eAVMs）中细胞谱系的转录异质性	首次在单细胞水平上揭示了eAVMs中内皮细胞、血管周围细胞和免疫细胞的不同状态及其相互作用	样本量较小，仅包括9个eAVMs样本和2个非病变组织样本	生成eAVMs在单细胞水平上的分子信息概览	颅外动静脉畸形（eAVMs）	数字病理学	血管畸形	单细胞RNA测序（scRNA-seq），10x Visium空间转录组学（ST）	NA	RNA测序数据，空间转录组数据	9个eAVMs样本和2个非病变组织样本
2326	2025-03-23	Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis 2025-02-21, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604 PMID:39982975	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和细胞转录组及表位测序技术，揭示了多发性硬化症（MS）患者深颈淋巴结（dcLNs）的免疫景观变化，特别是EB病毒（EBV）感染在MS发病机制中的关键作用	首次结合单细胞RNA测序和细胞转录组及表位测序技术，详细描述了MS患者dcLNs的免疫景观，并发现EBV驱动的B细胞失调是MS发病的关键机制	研究样本仅限于新诊断未治疗的MS患者，未涵盖其他阶段或治疗中的患者	探讨多发性硬化症（MS）的发病机制，特别是EB病毒（EBV）感染在其中的作用	新诊断未治疗的多发性硬化症（MS）患者	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序，细胞转录组及表位测序	NA	RNA测序数据，唾液样本	新诊断未治疗的MS患者的深颈淋巴结（dcLNs）样本
2327	2025-03-23	Single-cell RNA-seq reveals disease-specific CD8+ T cell clonal expansion and a high frequency of transcriptionally distinct double-negative T cells in diabetic NOD mice 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0317987 PMID:40106422	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了糖尿病NOD小鼠中CD8+ T细胞的克隆扩增和转录上独特的双阴性T细胞的高频率存在	首次在单细胞水平上揭示了T1D进展过程中T细胞的克隆扩增和转录特征，并发现了与疾病相关的TCR序列和潜在生物标志物	研究仅限于NOD小鼠模型，未在人类样本中验证	识别与1型糖尿病（T1D）进展相关的T细胞克隆扩增和转录特征	非肥胖糖尿病（NOD）小鼠的T细胞	数字病理学	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NOD小鼠的外周血和胰岛组织
2328	2025-03-23	A single-cell RNA sequencing atlas of the healthy canine lung: a foundation for comparative studies 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1501603 PMID:40114924	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，构建了健康犬肺组织的细胞图谱，揭示了细胞和分子异质性，并鉴定了46个转录上不同的细胞亚群	首次对健康犬肺组织进行单细胞RNA测序分析，揭示了新的细胞亚群和标记物，并提供了犬肺疾病的分子基础	研究样本仅来自四只犬，样本量较小，可能限制结果的普适性	构建健康犬肺组织的单细胞RNA测序图谱，为犬肺疾病的研究提供分子基础，并促进与人类肺疾病的比较研究	健康犬肺组织	单细胞RNA测序	肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	四只犬的26,278个细胞
2329	2025-03-23	Targeting glycolysis in esophageal squamous cell carcinoma: single-cell and multi-omics insights for risk stratification and personalized therapy 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1559546 PMID:40115255	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和多组学方法，揭示了食管鳞状细胞癌（ESCC）中糖酵解介导的机制，重点关注风险分层和治疗机会	提出了一个基于糖酵解的七基因风险评分模型，用于ESCC患者的风险分层和个性化治疗指导	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探讨ESCC中糖酵解代谢的作用及其在风险分层和个性化治疗中的应用	食管鳞状细胞癌（ESCC）患者	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序、批量RNA测序、Western blotting	非负矩阵分解（NMF）、Cox回归	RNA测序数据、临床数据	来自TCGA和GEO数据库的数据集
2330	2025-03-22	Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells From Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway 2025-May, Glia IF:5.4Q1 DOI:10.1002/glia.24657 PMID:39916387	研究论文	本文研究了Ibudilast在保护视网膜双极细胞免受兴奋性毒性视网膜损伤中的作用，并探讨了其激活mTOR通路的机制	首次在兴奋性毒性视网膜损伤模型中验证了Ibudilast的神经保护作用，并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制	研究仅基于鸡的视网膜损伤模型，未在人类或其他哺乳动物模型中进行验证	探讨Ibudilast在视网膜神经元保护中的作用及其机制	鸡的视网膜神经元，特别是双极细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），光谱域光学相干断层扫描（SD-OCT），电生理学	兴奋性毒性视网膜损伤模型	RNA测序数据，光学成像数据，电生理数据	未明确提及具体样本数量，但使用了鸡的视网膜损伤模型
2331	2025-03-22	Hydrogen sulfide improves depression-like behaviors in CUMS-induced mice by regulating autophagy 2025-May, Psychoneuroendocrinology IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.psyneuen.2025.107418 PMID:40023886	研究论文	本研究探讨了硫化氢通过调节自噬改善慢性不可预测轻度应激（CUMS）诱导的小鼠抑郁样行为的机制	首次揭示了硫化氢通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制自噬并改善突触可塑性损伤的抗抑郁机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探讨硫化氢在抑郁症中的抗抑郁机制及其治疗潜力	慢性不可预测轻度应激（CUMS）诱导的抑郁小鼠	神经科学	抑郁症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	CUMS诱导的抑郁小鼠
2332	2025-03-22	Single-cell RNA sequencing reveals ECM remodeling-tumor stiffness-FAK as a key driver of vestibular schwannoma progression 2025-Apr, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102730 PMID:39988022	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了前庭神经鞘瘤（VS）进展中ECM重塑-肿瘤硬度-FAK信号的关键作用	首次将单细胞RNA测序应用于前庭神经鞘瘤，揭示了ECM重塑-肿瘤硬度-FAK信号在肿瘤进展中的关键作用	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证	探讨肿瘤硬度-FAK信号在前庭神经鞘瘤进展中的作用	前庭神经鞘瘤细胞	数字病理学	前庭神经鞘瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
2333	2025-03-22	Cancer-associated fibroblasts in breast cancer in the single-cell era: Opportunities and challenges 2025-Apr, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189291 PMID:40024607	综述	本文探讨了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，并强调了单细胞RNA测序技术在分析CAF亚群中的应用	利用单细胞RNA测序技术对CAFs进行高分辨率分析，揭示了CAFs的异质性及其在乳腺癌进展中的具体作用	主要集中于乳腺癌中的CAFs，未涉及其他类型癌症或更广泛的肿瘤微环境研究	探讨CAFs在乳腺癌中的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，为靶向治疗提供潜在方向	乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
2334	2025-03-22	Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model 2025-Mar-21, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052024 PMID:40114603	研究论文	本文研究了常染色体显性多囊肾病（ADPKD）中肾脏微血管异常的特征及其在Pkd1突变小鼠模型中的早期表现	通过单细胞转录组学、三维成像及多模态磁共振成像技术，首次在ADPKD肾脏中识别出分子特征独特的微血管亚群，并在Pkd1突变小鼠模型中验证了这些异常特征的早期存在	研究主要依赖于小鼠模型，人类样本仅来自晚期ADPKD患者，可能限制了早期病理特征的全面理解	探讨ADPKD中肾脏微血管异常的起始和性质，为治疗策略提供依据	人类ADPKD肾脏及Pkd1突变小鼠肾脏	数字病理学	多囊肾病	单细胞转录组学、三维成像、多模态磁共振成像	Pkd1突变小鼠模型	图像、转录组数据	人类ADPKD肾脏样本及Pkd1突变小鼠肾脏样本
2335	2025-03-22	Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11075-6 PMID:40113718	研究论文	本研究采用网络药理学和单细胞RNA测序技术，筛选脓毒症中的核心治疗基因，并探讨金银花的潜在治疗机制	结合网络药理学和单细胞RNA测序技术，首次系统性地筛选并验证了脓毒症中的核心治疗基因及其与金银花成分的潜在相互作用	研究结果需要进一步的实验验证，特别是金银花成分与核心基因的具体作用机制尚未明确	阐明金银花在脓毒症中的潜在治疗机制，并筛选核心治疗基因	脓毒症患者和健康对照者的血液样本	生物信息学	脓毒症	RNA测序、单细胞RNA测序、网络药理学	NA	RNA测序数据	22名脓毒症患者和10名健康对照者
2336	2025-03-22	The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11086-3 PMID:40113719	研究论文	本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，包括肿瘤微环境、预后和治疗反应	首次从肿瘤微环境、凝血功能差异、治疗和预后等多个角度全面探讨了凝血相关基因在GBM中的作用，并构建了基于五个CRGs的风险特征模型	研究主要依赖于公开数据集和体外实验，缺乏大规模的临床验证	探讨凝血相关基因在GBM中的作用及其对预后和治疗的影响	胶质母细胞瘤（GBM）患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、免疫组化、CCK8实验、伤口愈合实验、克隆形成实验	LASSO回归、随机生存森林分析	SNP、拷贝数变异数据、单细胞RNA测序数据	461例GBM患者（TCGA队列）和CGGA693队列
2337	2025-03-22	SPARROW reveals microenvironment-zone-specific cell states in healthy and diseased tissues 2025-Mar-19, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101235 PMID:40112778	研究论文	SPARROW是一种计算框架，用于在健康和疾病组织中揭示微环境区域特定的细胞状态	SPARROW通过联合学习细胞类型和细胞组织的潜在嵌入和软聚类，解决了当前分析工具在细胞类型推断和细胞邻域识别方面的局限性	NA	提供跨尺度、样本和条件的组织特征的全面表征	人类和小鼠组织	数字病理学	NA	空间分辨转录组学和单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
2338	2025-03-22	Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration 2025-Mar-18, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02085-2 PMID:40100436	研究论文	本研究探讨了STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能，发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中显著下调，并与较好的预后相关	首次系统地评估了STAT家族在结直肠癌中的表达水平和预后价值，并探索了其与免疫功能和免疫浸润水平的关系	研究主要依赖于公共数据库和有限的临床样本，可能影响结果的普遍性	研究STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能	结直肠癌样本	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学技术	NA	基因表达数据、临床数据	TCGA数据库644样本、GTEx数据库308样本、中国临床样本30样本
2339	2025-03-22	AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation 2025-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.28.640907 PMID:40093069	研究论文	本文通过AI驱动的单细胞RNA测序分析，揭示了在视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态	利用AI辅助的单细胞分析工具SCassist，首次识别了九种不同的Müller细胞亚群和五种T细胞亚群，并揭示了激活的Müller细胞在炎症视网膜中的主要功能	研究主要基于Aire-/-小鼠模型，可能不完全适用于人类视网膜炎症的情况	探索在视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能和动态变化	Müller细胞和T细胞	数字病理学	视网膜自身免疫炎症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	AI辅助分析工具SCassist	单细胞RNA测序数据	Aire-/-小鼠的视网膜样本
2340	2025-03-22	[Comprehensive analysis of the structural phenotypes and functional characteristics of B cells in oral lichen planus and oral lichenoid lesions through single-cell and spatial transcriptomics] 2025-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology DOI:10.3760/cma.j.cn112144-20241220-00500 PMID:40015701	研究论文	本文通过单细胞和空间转录组学技术，全面分析了口腔扁平苔藓（OLP）和口腔苔藓样病变（OLL）中B细胞的结构表型和功能特征	首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，深入探讨了OLP/OLL中B细胞的表型和功能，揭示了B细胞在口腔黏膜微环境中的免疫调节机制	样本量较小，仅包括2例侵蚀性OLP、3例非侵蚀性OLP和1例健康对照，且功能机制尚需进一步研究	揭示B细胞在OLP/OLL中的表型和功能特征，探讨其在口腔黏膜微环境中的免疫调节机制	口腔扁平苔藓（OLP）和口腔苔藓样病变（OLL）患者及健康对照	数字病理学	口腔疾病	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据、空间转录组数据	2例侵蚀性OLP、3例非侵蚀性OLP、1例健康对照，以及3例OLP/OLL患者和3例健康对照的病理标本