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当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 2301 - 2320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2025-11-15 |
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-25-0326
PMID:41186269
|
研究论文 | 本研究开发了Sig27基因面板及其衍生面板Sig27IMG，用于评估前列腺癌复发风险并揭示肿瘤的免疫抑制特性 | 首次提出27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG，能够通过评估肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制特性来预测前列腺癌复发 | 研究基于回顾性数据集，需要前瞻性研究验证临床实用性 | 开发基因标志物面板用于前列腺癌复发风险分层和免疫抑制特性评估 | 前列腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 基因面板评分系统 | 基因表达数据 | 3,133个肿瘤样本（批量RNA-seq），53名患者（单细胞RNA-seq），后续扩展到5,672名患者（17种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 2302 | 2025-11-15 |
The role of hypothyroidism in cirrhosis pathogenesis: A retrospective cohort study and multi-omics integration analysis
2025-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011947
PMID:41202080
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研究论文 | 本研究通过回顾性队列分析和多组学整合分析揭示了甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系及潜在分子机制 | 首次揭示甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系，发现HLA-DQA1和CD27作为潜在治疗靶点，并鉴定甘草酸和左甲状腺素钠为候选药物 | 研究主要基于回顾性数据和遗传分析方法，需要进一步实验验证 | 探讨甲状腺功能减退在肝硬化发病机制中的作用 | 肝硬化患者和甲状腺功能减退患者 | 多组学整合分析 | 肝硬化 | 连锁不平衡评分回归，孟德尔随机化，转录组关联研究，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA测序，分子对接 | 孟德尔随机化模型，基因共表达网络模型，分子对接模型 | 临床数据，遗传数据，转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 基于Medical Information Mart for Intensive Care临床数据库的纵向数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2303 | 2025-11-15 |
Curcumin-chitosan microspheres inhibit epithelial cell PANoptosis: analysis of key PANoptosis gene distribution via single-cell RNA sequencing and in vivo validation in ulcerative colitis mice
2025-Nov, General physiology and biophysics
IF:1.3Q4
DOI:10.4149/gpb_2025030
PMID:41217223
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内实验验证姜黄素-壳聚糖微球通过抑制上皮细胞PANoptosis改善溃疡性结肠炎 | 首次揭示姜黄素-壳聚糖微球通过调控肠上皮细胞PANoptosis缓解溃疡性结肠炎的机制 | NA | 探究姜黄素-壳聚糖微球对溃疡性结肠炎的治疗作用机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和Caco-2细胞系 | 单细胞测序 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2304 | 2025-11-15 |
Single-cell transcriptome atlas unveils transcriptional regulation networks of banana root tips in response to Fusarium oxysporum infection
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf220
PMID:41220693
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了香蕉根尖响应尖孢镰刀菌感染的转录调控网络 | 首次构建香蕉根尖单细胞转录图谱，发现周鞘细胞是TR4感染下的主要响应细胞类型，并鉴定出MaKAN4调控锌依赖性基因模块的关键作用 | NA | 解析香蕉根尖细胞类型对尖孢镰刀菌感染的转录响应机制 | 香蕉根尖细胞 | 单细胞生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 19个细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2305 | 2025-11-14 |
Characteristics of ectopic alveolar basal cells relative to airway basal cells in fibrosis
2025-Nov, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.01259-2024
PMID:41220820
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研究论文 | 本研究通过比较间质性肺病患者中异位肺泡基底细胞与气道基底细胞的特性，探索其起源和功能差异 | 首次在相同ILD患者中同时分离和比较肺泡与气道基底细胞，揭示两者在转录组和类器官形成能力上的差异 | 样本来源于活检组织，数量有限；动物模型使用博来霉素损伤小鼠，可能不完全反映人类疾病情况 | 阐明间质性肺病中异位肺泡基底细胞的起源和功能特性 | 间质性肺病患者的肺泡基底细胞和气道基底细胞 | 单细胞生物学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序，实时荧光定量PCR，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | 来自ILD患者的经支气管和气道黏膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2306 | 2025-11-15 |
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study
2025-Nov, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251383288
PMID:41235474
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研究论文 | 本研究应用机器学习技术分析结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的关联 | 首次结合机器学习与单细胞RNA测序技术系统揭示结直肠癌中基因表达特征与免疫细胞浸润的复杂关系 | NA | 探究结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的关联及其临床意义 | 结直肠癌患者的基因表达数据和免疫细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 聚类分析, 生存分析, 基因富集分析 | 预后模型, 聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2307 | 2025-11-15 |
Niche environment remodeling promotes long-term endometrium stromal stem cell engraftment and tissue regeneration in thin endometrium
2025-Oct-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.053
PMID:41176621
|
研究论文 | 通过改造干细胞微环境提高子宫内膜基质干细胞移植效率并促进薄型子宫内膜组织再生 | 提出通过免疫抑制和血管重建双重策略改造干细胞微环境，显著提高子宫内膜基质干细胞移植存活率 | 研究主要基于大鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 开发治疗薄型子宫内膜的新型干细胞疗法 | 大鼠薄型子宫内膜模型和人类子宫内膜基质干细胞 | 再生医学 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，mRNA工程，异种移植模型 | 动物模型 | 基因表达数据，病理数据 | 大鼠模型和人类干细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2308 | 2025-11-15 |
YTHDF1 regulates YTHDF2 stability via m6A-dependent mechanisms in hepatocellular carcinoma: insights from in vitro, in vivo, and multi-cohort clinical studies
2025-Oct-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-2025-363
PMID:41220748
|
研究论文 | 本研究揭示YTHDF1通过m6A依赖性机制调控YTHDF2稳定性促进肝细胞癌进展 | 首次发现YTHDF1通过m6A依赖性方式增强YTHDF2的mRNA稳定性和翻译效率，并揭示两者在肝细胞癌中的空间共表达模式 | 未明确说明样本规模和研究人群的详细特征 | 探索YTHDF同源蛋白在肝细胞癌中的调控网络和临床相关性 | 肝细胞癌组织、YTHDF蛋白家族 | 分子生物学 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学、空间转录组学、Western blot、实时定量PCR、RNA免疫沉淀、e-CLIP测序、双荧光报告基因检测、RNA稳定性实验 | NA | 蛋白质表达数据、RNA表达数据、空间转录组数据、临床预后数据 | 两个临床队列的肝细胞癌患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2309 | 2025-11-15 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2025-Oct-29, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示了慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活状态和配体-受体关系 | 首次在单细胞分辨率下通过空间转录组学技术揭示CAMR中肾小球内细胞特异性激活状态和空间分子相互作用机制 | 样本量相对有限，且仅针对肾脏活检组织进行分析 | 探究慢性活动性抗体介导排斥反应的分子机制和细胞间相互作用 | 肾脏移植活检组织中的肾小球内皮细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞 | 空间转录组学 | 肾脏移植排斥反应 | 空间转录组学，单细胞RNA分析 | 细胞分型、聚类分析、降维分析、差异基因表达分析 | 空间转录组数据，基因表达数据 | CAMR患者和对照组的肾脏活检组织 | Nanostring | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪用于福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检组织的单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 2310 | 2025-11-15 |
Focal Adhesion Kinase-Dependent Reprogramming of IFN-γ Signaling through PYK2 Coinhibition Sensitizes Melanoma to Immune Checkpoint Blockade
2025-Oct-14, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.376
PMID:41101630
|
研究论文 | 本研究揭示了黏着斑激酶(FAK)及其同源物PYK2在IFN-γ介导的免疫检查点阻断耐药中的不同作用机制 | 首次阐明FAK作为主要支架蛋白、PYK2作为辅助因子在IFN-γ信号通路中的协同作用，并提出联合抑制策略可增强免疫治疗效果 | 研究主要基于临床前模型，需进一步临床验证；PYK2抑制的最佳程度尚未完全确定 | 探索克服黑色素瘤免疫检查点阻断耐药的新策略 | 黑色素瘤细胞、小鼠模型、临床患者样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 无标记磷酸化蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA皮肤黑色素瘤队列、GSE91061临床数据集、抗PD-1耐药小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2311 | 2025-11-15 |
Single-cell clonal lineage tracing identifies the transcriptional program controlling the cell-fate decisions by neoantigen-specific CD8+ T cells
2025-Oct-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
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研究论文 | 通过单细胞克隆谱系追踪揭示新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控程序 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析，系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹 | 研究基于小鼠前列腺癌模型，人类临床样本验证有限 | 解析新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控机制 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2312 | 2025-11-15 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
|
研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法，用于精确识别CRISPR编辑的疾病变异效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本量限制或技术适用范围 | 识别疾病相关非编码等位基因的功能后果并确定因果变异 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2313 | 2025-11-15 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e38
PMID:41220845
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建结直肠癌免疫预后模型并鉴定TIMP1作为预后标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型，并实验验证TIMP1的生物学功能 | NA | 解析结直肠癌免疫异质性并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO方法 | 随机森林,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2314 | 2025-11-15 |
[RNA Sequencing Reveals Molecular Alternations of Splenocytes Associated with Anti-FⅧ Immune Response in Hemophilia A Murine Model]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
研究论文 | 通过RNA测序技术研究血友病A小鼠模型中与抗FⅧ免疫反应相关的脾细胞分子变化 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统分析血友病A小鼠抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究血友病A中抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 血友病A小鼠模型的脾细胞 | 生物信息学 | 血友病A | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 血友病A小鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | CASAVA碱基识别技术 |
| 2315 | 2025-11-15 |
[Research Progress of Epigenetic Modification in Hematopoietic Stem Cell Functional Regulation--Review]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
综述 | 本文综述了表观遗传修饰在造血干细胞发育、功能调控和扩增中的研究进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组和追踪技术等新兴技术对造血干细胞表观遗传调控机制的最新研究成果 | NA | 探讨表观遗传修饰在造血干细胞功能调控中的作用机制 | 造血干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序技术, 空间转录组技术, 追踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2316 | 2025-11-15 |
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03748-7
PMID:40983914
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研究论文 | 提出SIGEL框架，通过利用空间基因组上下文从空间转录组数据中学习基因表示 | 开发了成本效益高的空间感知基因表示学习框架，生成的基因表示具有上下文感知、生物学意义明确和跨样本鲁棒性强的特点 | NA | 解决空间转录组学中生成空间信息基因表示的方法有限且计算密集的问题 | 空间转录组数据中的基因表示 | 空间基因组学 | NA | 空间转录组学 | 基因组表示学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2317 | 2025-11-15 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
|
研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合用于基因调控网络推断，能够识别驱动基因并阐明不同细胞背景下的调控机制 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2318 | 2025-11-15 |
scooby: Modeling multi-modal genomic profiles from DNA sequence at single-cell resolution
2025-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.613754
PMID:39345504
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研究论文 | 提出首个从DNA序列建模单细胞分辨率多组学数据的框架scooby | 首个在单细胞分辨率从序列建模scRNA-seq覆盖度和scATAC-seq插入谱的框架，通过细胞特异性解码器和预训练模型微调实现 | NA | 理解调控DNA元件如何影响单个细胞中的基因表达，建立统一的基因调控模型 | 造血系统数据集中的单细胞多组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 基于Borzoi预训练模型的深度学习框架 | 基因组序列, 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2319 | 2025-11-15 |
Integrative machine learning and multi-omics framework identifies shared biomarkers for rheumatoid arthritis and ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336243
PMID:41212891
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学方法识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享生物标志物 | 开发了包含12种算法和交叉验证的综合机器学习框架，首次系统识别RA和UC的共享生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证 | 研究主要基于公共基因表达数据集，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享诊断生物标志物 | 类风湿关节炎和溃疡性结肠炎患者的基因表达数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 集成学习框架(包含12种算法) | 基因表达数据 | 公共基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2320 | 2025-11-15 |
Metalloproteinase-9 as a Pyroptosis-Hypoxia Synergy Effector Drives Immune Remodeling in Ischemic Stroke: A Multi-Omics Validated Diagnostic Biomarker and Therapeutic Target
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S550007
PMID:41220599
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定基质金属蛋白酶-9(MMP9)作为缺血性脑卒中诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次系统探索细胞焦亡与缺氧在缺血性脑卒中中的协同调控作用，并通过多组学验证MMP9的诊断价值 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 探索缺血性脑卒中早期诊断生物标志物和治疗靶点 | 缺血性脑卒中患者外周血样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序,单细胞测序,RT-qPCR,分子对接 | LASSO,支持向量机,随机森林 | 基因表达数据 | 三个独立数据集(GSE66724,GSE58294,GSE16561)和RT-qPCR验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |