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当前共找到 10779 篇文献，本页显示第 2261 - 2280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2261 | 2025-12-02 |
Ex Vivo Expanded Regulatory T Cells Inhibit AAA Progression by Limiting CD4+ and CD8+ T Cell Accumulation in Aortic Tissue
2025-Oct-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681290
PMID:41279653
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研究论文 | 本研究探讨了调节性T细胞（Tregs）在腹主动脉瘤（AAA）进展中的作用，通过小鼠模型验证Treg疗法能通过限制CD4+和CD8+ T细胞在主动脉组织中的积累来抑制AAA发展 | 利用单细胞RNA测序数据识别T细胞在AAA中的关键作用，并通过同种移植Tregs到AAA诱导小鼠中，揭示Tregs通过定位于引流淋巴结而非主动脉微环境来减少促炎细胞浸润，从而抑制AAA进展 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；Tregs在主动脉微环境中未被检测到，其具体作用机制需进一步探索；临床转化潜力尚未在人体试验中验证 | 研究Tregs在AAA进展中的具体机制，探索Treg疗法作为早期AAA治疗策略的潜力 | 人类和小鼠AAA单细胞RNA测序数据、AAA诱导的野生型C57BL/6J小鼠、Thy1.1等位基因供体小鼠的Tregs | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、qRT-PCR、Verhoeff-van Gieson染色、苏木精-伊红染色、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据、流式细胞数据 | 使用小鼠模型，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2262 | 2025-12-02 |
Integrated single-cell whole genome sequencing and spatial transcriptomics reveal latent intra-tumoral heterogeneity in ovarian cancer
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.676897
PMID:41279090
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞全基因组测序和空间转录组学技术，揭示了卵巢癌中潜在的肿瘤内异质性 | 首次结合单细胞全基因组测序与空间转录组学，系统分析卵巢癌的细胞、克隆和亚克隆水平异质性，并关联组织病理学和基因表达程序 | 研究仅基于五个上皮性卵巢癌样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究卵巢癌的肿瘤内异质性及其对疾病复发和治疗失败的影响 | 五个上皮性卵巢癌样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | 5个上皮性卵巢癌样本 | NA | 单细胞全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2263 | 2025-12-02 |
Single-Cell Profiling of HDAC Inhibitor-Induced EBV Lytic Heterogeneity Defines Abortive and Refractory States in B Lymphoblasts
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.09.681362
PMID:41279324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了HDAC抑制剂在EBV阳性B淋巴细胞中诱导的裂解异质性，定义了流产和耐药状态 | 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性，并识别了流产裂解细胞中NF-κB通路和免疫信号基因的上调 | 研究仅基于四种EBV阳性细胞系，且裂解反应仅在少数细胞中成功，可能限制了结果的普遍性 | 探究HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤细胞裂解反应的影响，并阐明宿主因子在阻止成功裂解中的作用 | 四种EBV阳性细胞系：P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和感染衍生的淋巴母细胞系 | 单细胞组学 | EBV相关恶性肿瘤（如伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四种EBV阳性细胞系，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2264 | 2025-12-02 |
Epicardial contributions to fibro-inflammatory signaling in a Pkp2-deficient arrhythmogenic cardiomyopathy model
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.680826
PMID:41279609
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研究论文 | 本研究通过构建Pkp2缺陷小鼠模型，探究了心外膜来源细胞在致心律失常性心肌病中纤维炎症信号传导的作用 | 首次在单细胞水平揭示了Pkp2缺陷导致心外膜来源成纤维细胞获得衰老相关分泌表型，并阐明了B细胞在疾病早期炎症和纤维化反应中的作用 | 研究基于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需谨慎；B细胞耗竭仅延迟早期反应，未显著改变终末期心脏生理 | 探究Pkp2缺陷在心外膜来源细胞中对致心律失常性心肌病纤维炎症信号传导和发病机制的贡献 | 转基因小鼠（Pkp2-cKO和Pkp2-ceKO模型）及其心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，流式细胞术，qRT-PCR，超声心动图 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，定量PCR数据，生理测量数据 | 转基因小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2265 | 2025-12-02 |
Targeting tumor-intrinsic TAK1 triggers anti-tumor immunity and sensitizes pancreatic cancer to checkpoint blockade
2025-Oct-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681226
PMID:41280086
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研究论文 | 本文发现TAK1是胰腺导管腺癌中维持基因组完整性的关键介质，并揭示其作为治疗靶点可诱导炎症性肿瘤微环境，使PDAC对免疫检查点阻断敏感 | 首次将TAK1鉴定为胰腺癌中与T细胞功能障碍相关的异常激活激酶，并阐明其通过磷酸化EphA2和RAD51调控DNA修复和cGAS-STING通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床验证尚需进一步开展 | 探索逆转胰腺癌免疫抑制微环境的新治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化、蛋白质组学 | 基因工程小鼠模型（GEMM） | 测序数据、图像数据、蛋白质数据 | 人类PDAC样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2266 | 2025-12-02 |
Optimal Gene Panel Selection for Targeted Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681071
PMID:41279853
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ReconST的新方法，用于自动设计空间转录组学分析中的最优基因面板 | ReconST利用现有scRNA-seq数据，通过门控自编码器识别最优基因子集，在重建准确性和空间模式保留方面优于现有方法 | NA | 优化基因面板选择以最大化空间转录组学分析的效用 | 基因面板设计 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析，scRNA-seq | 门控自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2267 | 2025-12-02 |
Accelerating scRNA-seq Analysis: Automated cell type annotation using representation learning and vector search
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680787
PMID:41279915
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于表示学习和向量搜索的自动化细胞类型注释服务，用于加速单细胞RNA测序分析 | 采用反向搜索方法，避免依赖预定义标记基因或组织特异性参考，提供细粒度和粗粒度注释 | NA | 自动化单细胞RNA测序中的细胞类型注释，以提高分析速度和准确性 | 10x Genomics单细胞基因表达样本中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 表示学习 | 基因表达谱数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 2268 | 2025-12-02 |
SpaDiff: Denoising for Sequence-based Spatial Transcriptomics via Diffusion Process
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.07.681011
PMID:41280001
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaDiff的去噪方法，用于处理基于序列的空间转录组学数据中的spot-swapping噪声 | 将spot-swapping噪声建模为扩散过程，并模拟RNA分子的位移以逆转噪声，从而恢复原始空间分布 | NA | 提高空间转录组学数据的空间特异性和数据完整性 | 空间转录组学数据中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 扩散过程模型 | 序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2269 | 2025-12-02 |
Multi-omics analysis identifies S100a10/Anxa2 complex within proximal tubule aggravates acute kidney injury through p-Stat3/Spp1 signaling
2025-Oct, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.11.003
PMID:41265636
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研究论文 | 通过多组学分析发现S100a10/Anxa2复合物在近端小管内通过p-Stat3/Spp1信号通路加剧急性肾损伤 | 首次结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学技术，系统性地识别了S100a10/Anxa2复合物在AKI中的作用，并通过实验验证了其通过p-Stat3/Spp1信号通路调控AKI的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证，且具体信号通路的上下游调控细节有待进一步探索 | 探究急性肾损伤（AKI）的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠肾脏组织，特别是近端小管上皮细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, ChIP-seq | NA | RNA-seq数据, 空间转录组数据, ChIP-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及对照组和AKI模型组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2270 | 2025-12-02 |
Immune cell communication networks and memory CD8+ T cell signatures sustaining chronic inflammation in COVID-19 and Long COVID
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689507
PMID:41200182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了COVID-19及长新冠患者的免疫细胞图谱，揭示了记忆CD8+ T细胞在慢性炎症中的核心作用及其分子特征 | 在单细胞分辨率下绘制了COVID-19及长新冠的免疫景观，首次系统性地揭示了记忆CD8+ T细胞在MHC-I介导的细胞通讯网络中的中心地位及其与慢性炎症的关联，并利用机器学习模型识别出预测慢性免疫失调的关键基因标志 | 研究样本量相对有限（73,110个PBMCs），且仅基于外周血单核细胞分析，未能涵盖组织特异性免疫反应；机器学习模型的验证仍需在独立队列中进行 | 探究COVID-19及长新冠中持续免疫失调和慢性炎症的分子机制，特别是记忆CD8+ T细胞的功能异常与炎症维持的关系 | 来自健康、暴露、感染及住院四个疾病状态个体的外周血单核细胞（PBMCs） | 生物信息学 | COVID-19及长新冠 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、机器学习模型训练、SHAP解释框架 | XGBoost等九种机器学习模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 73,110个外周血单核细胞（PBMCs），来自四个疾病状态（健康、暴露、感染、住院）的个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2271 | 2025-12-01 |
Type I IFN drives neutrophil swarming, impeding lung T cell-macrophage interactions and TB control
2025-Dec-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250466
PMID:40986319
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了I型干扰素在结核感染早期通过驱动中性粒细胞聚集而限制CD4+ T细胞-巨噬细胞相互作用的新机制 | 发现相对耐药小鼠早期肺内I型干扰素反应更强，并阐明其通过中性粒细胞群聚阻碍T细胞-巨噬细胞空间互作的独特免疫调控机制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中验证；观察时间限于感染初期数周 | 探究结核分枝杆菌感染早期决定感染结局的免疫机制 | C57BL/6和C3HeB/FeJ小鼠的肺部免疫细胞 | 免疫学 | 结核病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两种基因型小鼠在感染初数周内的肺部样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2272 | 2025-12-01 |
Inhibition of Cholesterol Transport from Lysosomes by Itraconazole Repolarizes Tumor-associated Macrophages to Anti-tumor M1 type
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17866
PMID:41318128
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研究论文 | 本研究探讨伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇转运将肿瘤相关巨噬细胞从促瘤M2表型重编程为抗瘤M1表型的机制 | 首次揭示伊曲康唑通过抑制溶酶体胆固醇释放实现巨噬细胞表型重编程的新机制 | 研究仅使用THP-1细胞来源的M2巨噬细胞，未在体内模型验证 | 探究伊曲康唑诱导肿瘤相关巨噬细胞表型重编程的分子机制 | THP-1细胞来源的M2巨噬细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,延时成像,Western blot | 细胞模型 | 基因表达数据,图像数据,蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2273 | 2025-12-01 |
Potential Role of Tumor-derived MIF in B-Cell Antigen Presentation in Lung Adenocarcinoma: Single-cell and TCGA Analyses
2025-Dec, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17874
PMID:41318120
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研究论文 | 本研究通过单细胞和TCGA分析探讨了肿瘤源性MIF在肺腺癌B细胞抗原呈递中的潜在作用 | 首次在单细胞水平揭示MIF通过调控B细胞获得抗原呈递细胞样功能在肺腺癌中的双重作用 | 样本量较小（仅3个肿瘤样本），需要更大规模验证 | 研究肿瘤源性MIF在肺腺癌免疫调控和预后中的作用 | 肺腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和恶性细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | Seurat，CellChat，GEPIA2 | 单细胞RNA测序数据，TCGA临床数据 | 3个肺腺癌肿瘤（29,936个细胞）和TCGA-LUAD队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2274 | 2025-12-01 |
Deep Transfer Learning Links Benign Glands to Prostate Cancer Progression via Transcriptomics
2025-Nov-29, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf119
PMID:41317378
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习分析前列腺癌空间转录组数据，揭示形态学良性腺体与癌症进展的关联 | 首次将DEGAS深度迁移学习框架应用于前列腺癌空间转录组学，发现形态学良性腺体中MSMB表达降低与癌症进展的关联 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；空间转录组技术分辨率限制可能影响细胞类型精确识别 | 探索前列腺癌进展中的场效应现象，识别与癌症进展相关的分子特征 | 前列腺癌患者的空间转录组数据、单细胞转录组数据和免疫组织化学样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 深度迁移学习, 免疫组织化学 | 深度迁移学习, 深度学习图像分析 | 转录组数据, 图像数据, 蛋白质表达数据 | 包含有和无5年远处转移患者的前列腺组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2275 | 2025-12-01 |
T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 3-mediated immunomodulation in myeloid cells and keratinocytes in the development of severe acne
2025-Nov-27, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00367-3
PMID:41307843
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现TIM3在重度痤疮发展中作为免疫检查点的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合孟德尔随机化分析揭示TIM3在重度痤疮中的免疫调节功能 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探究TIM3在重度痤疮发病机制中的免疫调节作用 | 重度痤疮患者皮肤样本、人永生化角质形成细胞(HaCaT)、痤疮丙酸杆菌诱导的小鼠模型 | 单细胞组学 | 痤疮 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化分析, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像 | 重度痤疮、普通痤疮和正常皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2276 | 2025-12-01 |
Spatial gene expression profiling reveals the distinct microenvironment of tuberous sclerosis complex-associated angiomyolipoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26541-9
PMID:41309810
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的独特微环境特征 | 首次使用空间转录组技术比较TSC-AML、散发性AML和肾细胞癌的转录景观，识别出TSC特异性分子特征 | 研究仅基于单例样本设计，样本量有限 | 表征结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤的转录特征并识别TSC特异性分子标志物 | 结节性硬化症相关肾血管平滑肌脂肪瘤、散发性肾血管平滑肌脂肪瘤和肾细胞癌组织样本 | 空间转录组学 | 结节性硬化症相关肾肿瘤 | 空间转录组测序 | 无监督聚类分析 | 空间基因表达数据 | 3例样本（TSC-AML、散发性AML和RCC各1例） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | CytAssist Visium平台，使用福尔马林固定石蜡包埋组织切片 |
| 2277 | 2025-12-01 |
Cathepsin B as a potential serum biomarker for early diagnosis and progression of diabetic foot ulcer complicated with peripheral vascular disease
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26599-5
PMID:41309848
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现组织蛋白酶B可作为糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清诊断标志物 | 首次通过单细胞转录组分析鉴定CTSB在DFU合并PVD血管内皮细胞中的富集，并验证其血清检测价值 | 样本量有限，需要更大规模临床研究验证CTSB的诊断效能 | 探索糖尿病足溃疡合并外周血管疾病的潜在血清生物标志物 | 糖尿病足溃疡合并外周血管疾病患者 | 生物医学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞转录组分析,免疫组化,ELISA,临床相关性分析,血管生成实验,CCK8实验,划痕实验 | NA | 基因表达数据,血清样本,组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2278 | 2025-12-01 |
Multi-omics and experimental validation identify methylation-related genes and METTL16 as key regulators in diabetic foot ulcer pathogenesis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26306-4
PMID:41310324
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，系统研究了甲基化相关基因在糖尿病足溃疡发病机制中的作用，并确定METTL16作为关键调控因子 | 首次系统鉴定糖尿病足溃疡中的甲基化相关基因，发现METTL16在成纤维细胞功能和细胞间通讯中的动态作用，并验证其保护性功能 | 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验，需要进一步体内验证和临床样本验证 | 研究甲基化相关基因在糖尿病足溃疡发病机制中的作用及其诊断和治疗潜力 | 糖尿病足溃疡组织样本和高糖处理的人皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 多组学分析,RNA测序,单细胞RNA测序,微阵列,机器学习算法 | LASSO,GBM,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 多个公共数据集中的糖尿病足溃疡组织和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2279 | 2025-12-01 |
Integrative multi-omics and single-cell transcriptomics reveal ARHGEF12 driving chemoresistance in bladder cancer
2025-Nov-27, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00606-1
PMID:41310897
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和单细胞转录组学，揭示了ARHGEF12基因在膀胱癌顺铂耐药中的关键作用机制 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组学相结合探索膀胱癌顺铂耐药的遗传基础，发现ARHGEF12通过RhoA/ROCK依赖的PI3K/AKT轴驱动化疗耐药的新机制 | NA | 阐明膀胱癌顺铂耐药的遗传驱动因素和肿瘤进展机制 | 膀胱癌顺铂耐药细胞和UM-UC-3/DDP耐药模型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 全基因组关联研究,表达数量性状位点分析,孟德尔随机化,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 19,942个基因的eQTL数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2280 | 2025-12-01 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2025-Nov-26, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术识别出双阳性平滑肌-内皮细胞簇，并证实TGF-β/Snail信号轴驱动的EndMT机制 | 需要在临床前模型中进一步验证 | 阐明TGF-β信号在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 空间转录组学, HE染色, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 伪时间轨迹分析, 细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据, 组织图像 | 11例烟雾病标本进行空间转录组分析，总计51例烟雾病和11例对照血管标本进行组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |