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当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-11-17 |
SegDecon bridges histology and transcriptomics through AI-based nuclei segmentation and image-informed spatial deconvolution
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.10.041
PMID:41234485
|
研究论文 | 提出SegDecon计算框架，通过AI驱动的细胞核分割和图像信息空间解卷积连接组织学与转录组学 | 将图像衍生的细胞计数估计整合到贝叶斯解卷积中，使用HSV色彩空间转换、形态学过滤和深度学习实例分割增强细胞核分割 | 仅在鼠脑空间转录组数据上进行了评估，未在其他组织或物种中验证 | 提高空间转录组学中细胞组成空间定位的精确度 | 鼠脑组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习实例分割，改进的cell2location模型 | 组织图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2202 | 2025-11-17 |
Single-cell sequencing reveals cellular heterogeneity and molecular mechanisms in tendon and enthesis injury repair
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1685955
PMID:41234689
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综述 | 本文通过单细胞测序技术揭示肌腱和骨附着点损伤修复过程中的细胞异质性及分子机制 | 利用多模态整合方法精确识别肌腱和骨附着点细胞亚群，阐明细胞间通讯及愈合过程中的分化路径 | NA | 探索肌腱和骨附着点损伤修复的细胞分子机制 | 肌腱和骨附着点细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2203 | 2025-11-17 |
Unraveling porcine dendritic-cell diversity: welcome tDC and DC3
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1639553
PMID:41235223
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和RNA测序技术揭示了猪树突状细胞的新型亚群tDC和DC3 | 首次在猪血液中鉴定出与人类和小鼠对应的过渡型树突状细胞(tDC)和DC3亚群 | tDC和DC3的核心功能尚未完全阐明，需要进一步功能验证 | 解析猪树突状细胞的异质性和亚群分类 | 猪树突状细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术,RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2204 | 2025-11-17 |
Single-cell/spatial integration reveals an MES2-like glioblastoma program orchestrated by immune communication and regulatory networks
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699134
PMID:41235227
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组数据揭示了胶质母细胞瘤中由免疫通讯和调控网络协调的MES2样程序 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和bulk数据系统解析胶质母细胞瘤间质程序，发现MES2样状态的空间分布特征和调控网络 | 样本量相对有限，功能验证主要在U251细胞系中进行，需要更多体内实验验证 | 解析胶质母细胞瘤间质程序的空间分布、临床意义和分子机制 | 胶质母细胞瘤患者样本和U251细胞系 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组, bulk RNA-seq, 细胞功能实验 | 图神经网络(GNN), WGCNA, hdWGCNA, 贝叶斯反卷积 | 单细胞转录组, 空间转录组, bulk转录组 | TCGA队列157例, CGGA队列共225例, GBM组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | 10x Visium | Visium空间转录组技术 |
| 2205 | 2025-11-17 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics analysis reveals FLAD1 as a regulator of the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680101
PMID:41235234
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示FLAD1作为肝细胞癌免疫微环境调节因子的作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学技术系统分析线粒体相关基因在肝细胞癌中的作用，发现FLAD1与肿瘤免疫微环境的结构性排斥相关 | NA | 探索线粒体相关基因在肝细胞癌进展中的作用及其与免疫微环境的关联 | 肝细胞癌组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,DNA甲基化分析,Western blotting | 九种机器学习算法的92种组合建模 | 基因表达数据,空间转录组数据,DNA甲基化数据,蛋白质印迹数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2206 | 2025-11-17 |
The role of the MYL12A liquid-liquid phase separation in neutrophil improves the prognosis of acute respiratory distress syndrome: a multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662680
PMID:41235230
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了MYL12A液-液相分离在急性呼吸窘迫综合征中性粒细胞中的保护作用机制 | 首次发现MYL12A通过磷酸化依赖性相分离动态调控中性粒细胞迁移，并证明LLPS评分可作为ARDS预后生物标志物 | 研究样本量有限，需要更大规模临床队列验证 | 探究液-液相分离在急性呼吸窘迫综合征发病机制中的作用及临床意义 | 急性呼吸窘迫综合征患者的中性粒细胞及fMLP刺激的中性粒细胞 | 多组学分析 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞转录组测序,蛋白质组学,免疫荧光,Western blotting,功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,临床队列数据 | 来自GEO数据库的单细胞转录组数据集(GSE157789)和蛋白质组数据集(GSE32707/GSE76293)，以及临床队列样本 | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 2207 | 2025-11-17 |
Integration of bulk and single-cell transcriptomic data reveals a novel signature related to liver metastasis and basement membrane in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671956
PMID:41235257
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，构建了一个与胰腺癌肝转移和基底膜相关的预后模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别胰腺癌肝转移和基底膜相关基因，并构建包含COL7A1等六个标志基因的创新预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证；样本来源有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 构建胰腺癌肝转移和基底膜相关基因的预后模型，并验证其与免疫微环境和治疗疗效的关联 | 胰腺癌患者样本数据，包括TCGA、ICGC和GEO数据库的转录组、突变和临床数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，WGCNA分析，机器学习算法，多变量Cox回归分析 | 预后模型，机器学习算法，Cox回归模型 | 转录组数据，突变数据，临床数据 | TCGA-PAAD队列（训练集）和PACA-AU队列（验证集） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2208 | 2025-11-17 |
The single-cell revolution in transplantation: high-resolution mapping of graft rejection, tolerance, and injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670683
PMID:41235239
|
综述 | 系统总结单细胞测序技术在移植生物学中的应用及其对移植排斥、免疫耐受和损伤机制的高分辨率解析 | 首次系统阐述单细胞技术如何将移植医学从形态学诊断推向分子内表型分析的新时代，揭示传统方法无法发现的细胞亚群和致病通路 | 临床转化仍面临挑战 | 阐明决定移植物命运的机制 | 实体器官和胰岛移植 | 数字病理学 | 移植相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2209 | 2025-11-17 |
Integrating scRNA-seq and machine learning identifies MNAT1 as a therapeutic target in OSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663487
PMID:41235252
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术，构建了口腔鳞状细胞癌的预后模型并鉴定MNAT1为治疗靶点 | 首次构建基于T细胞相关泛素化基因的预后风险模型，并发现MNAT1在OSCC恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于计算分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 开发口腔鳞状细胞癌的预后预测模型和寻找治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者和Cal27细胞系 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO算法, Spearman相关分析, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2210 | 2025-11-17 |
Multiomic Landscape Uncovers TRMT112 as a Central Driver of HPV-Positive Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5308441
PMID:41235342
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示TRMT112作为HPV阳性头颈鳞状细胞癌的核心驱动因子 | 首次整合单细胞RNA测序、bulk RNA测序和空间转录组数据，发现TRMT112是HPV+HNSCC的关键风险基因并与免疫排斥微环境形成相关 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 解析HPV阳性头颈鳞状细胞癌的分子机制和免疫景观 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组, 机器学习算法 | 高维加权基因共表达网络分析, 基因非负矩阵分解, 101种机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-HNSC和GSE65858队列患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 2211 | 2025-11-17 |
Glucokinase Regulatory Protein (GCKR) Links Metabolic Reprogramming With Immune Exclusion: Insights From a Pan-Cancer Analysis and Gastric Cancer Validation
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4240223
PMID:41235343
|
研究论文 | 通过泛癌分析和胃癌验证揭示了GCKR在代谢重编程与免疫排斥中的关键作用 | 首次系统描绘GCKR在泛癌中的表达和突变图谱，并发现其通过代谢重编程影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要聚焦于胃癌验证，其他癌症类型的功能验证相对有限 | 探究GCKR在癌症中的遗传和功能作用及其与免疫微环境的关联 | 泛癌数据集和胃癌样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 泛癌数据集和胃癌验证样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 2212 | 2025-11-17 |
Comprehensive Analysis of the PANoptosis-Related Genes in Stroke Based on Single-Cell RNA-Seq and Spatial Transcriptomics
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5828665
PMID:41235394
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和空间转录组学综合分析脑卒中中的PANoptosis相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，系统研究缺血性脑卒中中的PANoptosis分子特征 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证TNFRSF1A的功能机制 | 探索PANoptosis在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 缺血性脑卒中患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,Western blot | 多模态交叉分析,高维加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | 多个数据集（包括GSE35338和GSE137482） | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2213 | 2025-11-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-Dec, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
|
综述 | 本文系统评述了空间转录组学中细胞类型反卷积方法的类型、功能对比，并创建了在线交互式表格以促进方法选择 | 开发了基于网络的交互式表格工具，帮助研究人员更高效地选择适合的空间转录组细胞类型反卷积方法 | NA | 评述空间转录组学中细胞类型反卷积方法的现状与发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2214 | 2025-11-16 |
Simultaneously infer cell pseudotime, velocity field, and gene interaction from multi-branch scRNA-seq data with scPN
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf144
PMID:41229398
|
研究论文 | 提出一种名为scPN的新型高维动力学建模方法，可从单细胞RNA测序数据同时推断细胞伪时间、速度场和基因相互作用 | 首次能够在多分支数据集上同时恢复伪时间、速度场和基因相互作用，使用分段基因-基因相互作用网络建模基因调控动力学 | NA | 从单细胞RNA测序数据建模细胞动力学，理解细胞发育和基因调控关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育过程和基因相互作用网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高维动力学模型，分段网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2215 | 2025-11-16 |
Allele-specific immune gene quantification and expression analysis in single-cell RNA-seq data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf149
PMID:41229397
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中免疫基因等位基因特异性表达定量的新型计算方法 | 开发了新型R/Bioconductor数据结构，可处理多个免疫遗传注释层的表达数据，并支持免疫基因表达的交互式探索 | NA | 研究人类免疫基因组多样性中的等位基因特异性表达模式 | 人类免疫基因（如HLA和KIR基因） | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2216 | 2025-11-16 |
Clinical characteristics and target exploration via scRNA-seq and high-throughput drug screening of FOXO1 fusion positive rhabdomyosarcoma
2025-Nov-15, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06241-1
PMID:41240117
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量药物筛选探索FOXO1融合阳性横纹肌肉瘤的临床特征和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与高通量药物筛选系统研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤的影响，并发现MET作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（65例患者），且包含罕见病例类型 | 研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤临床特征和治疗靶点的影响 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选，患者来源异种移植模型 | Cox回归分析，Kaplan-Meier估计 | 临床数据，单细胞转录组数据 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者（36例胚胎型，15例腺泡型，14例其他类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2217 | 2025-11-16 |
Targeting the HMGB1-IL32 pathway to alleviate T cell exhaustion in epithelial ovarian cancer
2025-Nov-15, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01963-5
PMID:41240232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了卵巢癌细胞通过HMGB1-IL32信号通路影响终末耗竭CD8+T细胞的机制 | 首次发现HMGB1-HAVCR2配体-受体对介导卵巢癌细胞与终末耗竭CD8+T细胞的通讯，并阐明HMGB1通过NFKB1和TP53调控IL32表达的新信号通路 | NA | 解析卵巢癌微环境中细胞间通讯对终末耗竭CD8+T细胞的影响机制 | 卵巢癌微环境中的癌细胞和CD8+T细胞 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2218 | 2025-11-16 |
Single-cell analysis of adult mouse testes exposed to cigarette smoke
2025-Nov-15, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03703-2
PMID:41240254
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析香烟烟雾暴露对成年小鼠睾丸的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示香烟烟雾暴露导致睾丸细胞类型比例变化及多细胞类型的转录组改变 | 研究仅使用小鼠模型，样本量相对有限 | 探究香烟烟雾暴露对睾丸组织结构和精子发生过程的影响机制 | 成年小鼠睾丸组织 | 单细胞组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因本体分析(GO分析), 基因集富集分析(GSEA) | NA | 单细胞转录组数据, 病理学数据 | 成年小鼠睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2219 | 2025-11-16 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习的免疫学分析，识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次系统整合多组学数据和机器学习方法识别AS-CAD特异性生物标志物FGL1，并验证其诊断和预后价值 | 样本量有限，需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后相关性 | 主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、ELISA、免疫组化、Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、临床数据 | AS-CAD患者组织样本、独立临床队列、多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2220 | 2025-11-16 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
|
研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次系统揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制和转移的关系 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |