单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7513 篇文献，本页显示第 2201 - 2220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2201 | 2025-07-21 |
Medulloblastoma: biology and immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1602930
PMID:40677711
|
综述 | 本文讨论了髓母细胞瘤的生物学特性及免疫治疗的最新进展 | 总结了髓母细胞瘤的分子特征和免疫微环境，探讨了新旧免疫治疗方法的结合应用 | 未提及具体临床试验数据或治疗效果的具体数据 | 探讨髓母细胞瘤的生物学特性和免疫治疗的应用 | 髓母细胞瘤及其免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 2202 | 2025-07-21 |
Spatial transcriptomic analysis of 4NQO-induced tongue cancer revealed cellular lineage diversity and evolutionary trajectory
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1592044
PMID:40678065
|
研究论文 | 利用空间转录组学和AI算法研究4NQO诱导的舌癌细胞谱系多样性和进化轨迹 | 首次结合AI分类器和空间转录组学技术，详细描绘了化学诱导舌癌的时空演变和瘤内异质性 | 研究基于化学诱导的舌癌模型，可能与自然发生的舌癌存在差异 | 阐明舌癌的细胞行为特征和肿瘤进化过程 | 4NQO诱导的舌癌模型 | 数字病理学 | 舌癌 | 空间转录组测序 | AI分类器 | 空间转录组数据 | 未明确说明样本数量（舌癌组织） |
| 2203 | 2025-07-21 |
FN1 from cancer-associated fibroblasts orchestrates pancreatic cancer metastasis via integrin-PI3K/AKT signaling
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1595523
PMID:40678072
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研究论文 | 本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）中的FN1基因通过整合素-PI3K/AKT信号通路促进胰腺导管腺癌（PDAC）转移的分子机制 | 发现FN1作为PI3K通路中的关键枢纽基因，通过整合素受体激活PI3K/AKT通路，影响细胞侵袭和免疫微环境，并揭示了其双重作用 | 研究主要基于体外实验和临床数据分析，缺乏体内实验验证 | 阐明CAFs在PDAC转移中的作用及其分子机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 转录组测序、单细胞测序、Transwell迁移实验、Western blotting、qRT-PCR | 体外共培养模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | NA |
| 2204 | 2025-07-21 |
Cooling Blood and Detoxicating Formula Treats Psoriasis Through RHCG-Related Mechanisms
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5132158
PMID:40678620
|
研究论文 | 本研究探讨了凉血解毒方（CBDF）通过RHCG相关机制治疗银屑病的潜力 | 结合网络药理学、单细胞RNA测序和空间转录组学技术，首次揭示了CBDF中槲皮素和山奈酚等活性成分通过RHCG靶点调控炎症通路的作用机制 | 需要进一步的临床验证和机制研究 | 探索凉血解毒方治疗银屑病的分子机制 | 银屑病模型 | 分子药理学 | 银屑病 | 网络药理学、scRNA-seq、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2205 | 2025-07-21 |
Evaluating transcriptional tumour microenvironment response to immunotherapy using microarray analysis: From harvesting tumours to data analysis
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.004
PMID:40683680
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研究论文 | 本文介绍了一种使用微阵列转录组分析评估肿瘤对免疫疗法反应的实验方法 | 提出了一种成本效益高的微阵列转录组分析方法，用于评估免疫疗法的肿瘤微环境反应 | 该方法在需要详细转录组信息时可能不如scRNA-seq精确 | 评估肿瘤微环境对免疫疗法的转录反应 | 肿瘤微环境中的细胞和非细胞成分 | 数字病理学 | 癌症 | 微阵列转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2206 | 2025-07-21 |
Next-generation deconvolution of the tumor microenvironment with omnideconv
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.003
PMID:40683686
|
研究论文 | 介绍了一种名为omnideconv的R包，用于整合多种解卷积方法，简化其使用并统一语义，以量化乳腺癌患者RNA-seq数据的细胞组成 | 开发了omnideconv，一个整合多种解卷积方法的R包，解决了现有方法在编程语言、计算流程和输入/输出数据方面的多样性问题 | 未提及具体的性能比较或在实际应用中的局限性 | 开发一个统一的计算工具，用于从批量RNA-seq数据中估计细胞类型比例 | 乳腺癌微环境中的恶性细胞和正常细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 一个乳腺癌患者队列的批量RNA-seq数据 |
| 2207 | 2025-07-21 |
Guidelines for the assessment of high endothelial venule functionality and health
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.001
PMID:40683671
|
指南 | 本文提供了评估高内皮小静脉（HEVs）功能性和健康状况的指南 | 开发了在应激条件下（如炎症或淋巴结转移）评估HEV变化的指南，包括通过免疫荧光染色在蛋白质水平和单细胞RNA测序在RNA水平的评估 | 分离和培养HEVs会导致其表型丢失，因此体内评估是唯一可靠的检查方法 | 评估HEVs在应激条件下的变化 | 高内皮小静脉（HEVs） | NA | NA | 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质水平数据, RNA水平数据 | NA |
| 2208 | 2025-07-20 |
Secretory IgA dysfunction underlies poor prognosis in Fusobacterium-infected colorectal cancer
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2528428
PMID:40667611
|
研究论文 | 本研究探讨了具核梭杆菌(Fn)如何通过影响IgA浆细胞发育和分泌型IgA(sIgA)的产生，从而破坏结直肠癌(CRC)肿瘤微环境 | 揭示了Fn通过破坏与肿瘤相关巨噬细胞的通讯，损害sIgA产生的新机制，并鉴定了一个与Fn阳性患者相关的IgA成熟(IGAM)模块异常 | 研究样本量相对有限(42例CRC患者组织)，且机制研究主要依赖小鼠模型 | 阐明具核梭杆菌感染导致结直肠癌预后不良的免疫机制 | 42例CRC患者组织样本和两种小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 42例CRC患者组织样本和两种小鼠模型 |
| 2209 | 2025-07-20 |
RORγt eTACs mediate oral tolerance and Treg induction
2025-Aug-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250573
PMID:40298935
|
研究论文 | 该研究揭示了RORγt eTACs在口服耐受性和Treg细胞诱导中的关键作用 | 首次证明RORγt eTACs是口服耐受性诱导的必要细胞群体，并揭示了其独特的整合素β8表达特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚需进一步验证 | 阐明口服耐受性的细胞机制和关键调控细胞 | RORγt谱系抗原呈递细胞（包括ILC3s、树突状细胞和R-eTACs） | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 谱系追踪技术、单细胞测序 | 小鼠基因敲除模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量，使用基因工程小鼠模型 |
| 2210 | 2025-07-20 |
Thymic Microenvironment Remodeling in Cancer Cachexia as a Determinant of Checkpoint Inhibitor Efficacy and Toxicity
2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13874
PMID:40665793
|
research paper | 研究癌症恶病质对胸腺退化的影响及其与免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的关联 | 揭示了癌症恶病质通过破坏胸腺髓质成纤维细胞成熟度，影响T细胞阴性选择，从而扩展针对组织限制性抗原的TCR库 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者样本的验证仍需进一步扩大 | 探讨癌症恶病质对胸腺退化的影响及其与ICI治疗效果的关联 | 恶病质肝癌小鼠和接受抗PD-1/L1抗体治疗的晚期癌症患者 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞测序、免疫荧光、流式细胞术、单细胞TCR测序 | NA | 单细胞测序数据、血清抗体数据 | 恶病质肝癌小鼠模型和接受ICI治疗的癌症患者队列 |
| 2211 | 2025-07-20 |
ECM1 expression in chronic liver disease: Regulation by EGF/STAT1 and IFNγ/NRF2 signalling
2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101423
PMID:40671832
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞外基质蛋白1（ECM1）在慢性肝病（CLD）中的表达调控机制，揭示了EGF/STAT1和IFNγ/NRF2信号通路在健康或疾病状态下对ECM1表达的相反作用 | 首次揭示了EGF/STAT1和IFNγ/NRF2信号通路在调控ECM1表达中的相反作用，并证实ECM1具有开发为抗纤维化药物的潜力 | 研究样本量相对较小（小鼠模型n=2-6，CLD患者n=22），且未探讨ECM1在其他类型肝病中的作用 | 探究肝细胞在病理生理条件下ECM1的调控机制 | AML12细胞、小鼠和人类原代肝细胞、小鼠和患者的肝组织 | 肝脏病理学 | 慢性肝病 | scRNA-seq、bulk RNA-seq、启动子分析 | NA | RNA测序数据、组织样本 | 小鼠模型n=2-6，CLD患者n=22，Western饮食喂养小鼠n=8-10 |
| 2212 | 2025-07-20 |
Heterochronic parabiosis uncovers AdipoR1 as a critical player in retinal rejuvenation
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv6642
PMID:40668916
|
研究论文 | 本研究利用异时性联体共生（HP）结合单细胞RNA测序技术，揭示了AdipoR1在视网膜年轻化中的关键作用 | 首次发现AdipoR1及其下游AMPK信号通路在视网膜年轻化中的核心作用，并证实AdipoR1激动剂AdipoRon可逆转视网膜老化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类视网膜中验证 | 探索视网膜老化的分子机制并寻找抗衰老靶点 | 年轻、老年及HP配对小鼠的视网膜 | 分子生物学 | 老年性疾病 | 异时性联体共生（HP）、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体数量的小鼠视网膜样本 |
| 2213 | 2025-07-20 |
Hantaan virus-derived peptides that stabilize HLA-E could abrogate inhibition of CD56dimNKG2A+ NK cells
2025-Jul-18, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1012717
PMID:40680069
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研究论文 | 本研究探讨了Hantaan病毒（HTNV）感染引起的肾综合征出血热（HFRS）中，NKG2A-HLA-E轴介导的NK细胞反应的影响和机制 | 发现HTNV衍生的多肽通过HLA-E呈递可消除CD56dimNKG2A+ NK细胞的抑制，增强抗病毒免疫反应 | 研究主要基于体外实验，未在体内模型中验证 | 阐明HTNV感染中NKG2A-HLA-E轴介导的NK细胞反应机制 | HFRS患者和HTNV病毒 | 免疫学 | 肾综合征出血热 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、配体-受体结合实验、四聚体染色 | NA | 细胞表型和功能数据 | HFRS患者的NK细胞样本 |
| 2214 | 2025-07-20 |
Spatiotemporal analysis of Crohn's disease reveals PECAM2 signaling at the basis of inflammation-to-fibrosis transition
2025-Jul-18, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf130
PMID:40680170
|
研究论文 | 通过时空分析揭示克罗恩病炎症向纤维化转变的PECAM2信号机制 | 结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了PECAM2信号在克罗恩病纤维化过程中的关键作用，并提出了CD38抑制剂作为潜在治疗靶点 | 样本量较小（13例手术标本），且动物模型结果需要进一步临床验证 | 解析克罗恩病从慢性炎症向纤维化转变的分子机制 | 克罗恩病患者手术标本（炎症/纤维化组织及健康对照）和TNBS诱导的慢性结肠炎小鼠模型 | 数字病理 | 克罗恩病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、配体-受体互作分析、伪时间分析 | TNBS诱导的小鼠慢性炎症模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 13例手术标本（含健康对照）及独立验证队列 |
| 2215 | 2025-07-20 |
SPaSE: Spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101301
PMID:40480226
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研究论文 | 介绍了一种基于最优传输的算法SPaSE，用于在空间转录组数据上计算病理评分 | 提出了一种新的算法SPaSE，能够在空间转录组数据上量化病理影响，并预测不同病理严重程度的特征 | 未提及具体的技术限制或样本量的局限性 | 开发一种能够量化空间病理影响的计算方法 | 空间转录组数据 | 数字病理 | 心肌梗死 | 空间转录组学 | 最优传输算法 | 空间转录组数据 | 小鼠和人类心肌梗死数据，以及创伤性脑损伤和杜氏肌营养不良小鼠模型数据 |
| 2216 | 2025-07-20 |
Single-cell RNA sequencing in human atherosclerotic plaques reveals a novel smooth muscle cell subtype that possesses multi differentiation potential and shapes the microenvironment
2025-Jul-16, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01735-7
PMID:40668312
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类动脉粥样硬化斑块中一种新型平滑肌细胞亚型（SMC_C5），该亚型具有多向分化潜能并能塑造微环境 | 发现了一种新型平滑肌细胞亚型SMC_C5，揭示了其在动脉粥样硬化中的多向分化潜能及对微环境的影响 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分依赖于ApoE小鼠模型，可能需要更多人类样本验证 | 探究动脉粥样硬化斑块中平滑肌细胞亚型的异质性及其在疾病中的作用 | 人类冠状动脉斑块及ApoE小鼠主动脉斑块中的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, bulk RNA测序, pySCENIC | NA | RNA测序数据 | 整合了三个单细胞RNA测序数据集，并使用ApoE小鼠斑块进行验证 |
| 2217 | 2025-07-20 |
Rod-shaped microglia represent a morphologically distinct subpopulation of disease-associated microglia
2025-Jul-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03504-5
PMID:40671004
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研究论文 | 本研究识别了一种在谷氨酰半胱氨酸连接酶（GCLC）缺陷小鼠中发现的杆状小胶质细胞亚群，并探讨了其形成机制及其在神经退行性疾病早期反应中的作用 | 首次识别并描述了杆状小胶质细胞这一形态独特的亚群，揭示了其与疾病相关小胶质细胞（DAM）相似的基因表达谱，并提出了uPA信号和磷酸化GAP43在其形态变化中的潜在作用 | 研究主要基于GCLC缺陷小鼠模型，结果在人类疾病中的适用性尚需验证 | 探究小胶质细胞形态变化与基因表达谱的关联及其在神经退行性疾病中的作用机制 | 谷氨酰半胱氨酸连接酶（GCLC）缺陷小鼠中的杆状小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | GCLC-KO小鼠模型 | 基因表达数据、形态学数据 | GCLC缺陷小鼠的皮质组织 |
| 2218 | 2025-07-20 |
Campylobacter jejuni regulates cell cycle progression to potentiate host cell invasion
2025-Jul-16, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02348-z
PMID:40671100
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研究论文 | 该研究探讨了空肠弯曲菌如何通过调节宿主细胞周期来增强其入侵能力 | 首次揭示了空肠弯曲菌通过调控宿主细胞周期G1期来促进其入侵和炎症反应的机制 | 研究仅使用INT 407细胞系，未在动物模型或原代细胞中验证 | 阐明空肠弯曲菌感染宿主细胞的分子机制 | 空肠弯曲菌感染的INT 407细胞 | 细胞微生物学 | 肠道感染 | 流式细胞术、scRNA-seq、RT-qPCR、ELISA | NA | 基因表达数据、细胞周期数据、细胞图像 | 未明确说明细胞数量 |
| 2219 | 2025-07-20 |
Vagal Stimulation Rescues HFpEF by Altering Cardiac Resident Macrophage Function
2025-Jul-15, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326236
PMID:40662221
|
research paper | 该研究探讨了经皮迷走神经刺激（tVNS）如何通过改变心脏驻留巨噬细胞功能来改善保留射血分数的心力衰竭（HFpEF） | 揭示了tVNS通过减少表达Spp1的CCR2+心脏驻留巨噬细胞并诱导TLF+/MHC2+巨噬细胞表达Igf1来改善HFpEF的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究tVNS改善HFpEF的巨噬细胞介导机制 | HFpEF小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、超声心动图 | 小鼠HFpEF模型 | 基因表达数据、细胞数量数据 | 控制组、HFpEF+假刺激组和HFpEF+tVNS组的小鼠 |
| 2220 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |