单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
201	2025-04-16	Unraveling tumoral heterogeneity and angiogenesis-associated mechanisms of PD-1 and LAG-3 dual inhibition in lung cancers by single-cell RNA sequencing 2025-Mar, Chinese medical journal pulmonary and critical care medicine DOI:10.1016/j.pccm.2025.02.004 PMID:40226601	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的肿瘤异质性和血管生成相关机制	首次使用单细胞RNA测序技术分析PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的协同抗肿瘤机制，并发现其在鳞状细胞癌中的优越疗效	研究仅基于PDX模型，未涉及人体临床试验	阐明PD-1和LAG-3双重抑制在肺癌中的协同抗肿瘤机制	肺癌患者来源的异种移植(PDX)模型	数字病理	肺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	PDX模型	RNA测序数据	8127个细胞(包括2699个基底细胞、4109个恶性细胞和1319个上皮细胞)
202	2025-04-16	Programs, origins and immunomodulatory functions of myeloid cells in glioma 2025-Feb-26, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-025-08633-8 PMID:40011771	research paper	该研究通过整合单细胞RNA测序、染色质可及性、空间转录组学和胶质瘤类器官外植系统，系统地研究了胶质瘤中髓系细胞的免疫调节表型	发现了四种免疫调节表达程序，揭示了这些程序由微环境信号驱动，而非髓系细胞类型、发育起源或肿瘤突变状态，并预测了免疫治疗反应和总体生存率	研究中发现的免疫调节程序的具体机制和临床应用仍需进一步验证	理解胶质瘤中髓系细胞的免疫调节作用，并为开发更有效的免疫疗法奠定基础	胶质瘤中的髓系细胞	digital pathology	glioma	single-cell RNA sequencing, chromatin accessibility, spatial transcriptomics, glioma organoid explant systems	NA	RNA-seq, spatial transcriptomics	NA
203	2025-04-16	Engineered Extracellular Vesicles Modified by Angiopep-2 Peptide Promote Targeted Repair of Spinal Cord Injury and Brain Inflammation 2025-02-04, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c14675 PMID:39853366	研究论文	研究通过生物工程改造的细胞外囊泡（Ang2-EVs和M-Ang2-EVs）在脊髓损伤和脑炎症中的靶向修复作用	利用Angiopep-2肽段增强细胞外囊泡的靶向性，并通过褪黑激素预处理提高其抗炎功能	未提及临床试验结果，仅限于小鼠模型研究	开发更有效的工程化细胞外囊泡以靶向修复脊髓损伤和减轻脑炎症	脊髓损伤和脑炎症	生物医学工程	脊髓损伤	单细胞测序、免疫荧光实验、单核测序	NA	测序数据、免疫荧光图像	小鼠脊髓样本
204	2025-04-16	Single-cell transcriptomics analysis reveals dynamic changes and prognostic signature in tumor microenvironment of PDAC 2025-02-02, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-86950-8 PMID:39894886	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境的动态变化及预后标志物	定义了新的Treg和耗竭T细胞特征基因TNFRSF4，开发了一个新的预后模型，并鉴定了三种潜在的治疗药物	样本量相对较小（31个样本），且依赖于已发表的数据集	阐明PDAC进展过程中肿瘤微环境的动态变化并开发预后模型	胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	预后模型	单细胞转录组数据	31个样本（包括8个PDAC I期、9个PDAC II期、6个PDAC III期和8个PDAC IV期）
205	2025-04-16	Integrating bulk and single-cell RNA sequencing data: unveiling RNA methylation and autophagy-related signatures in chronic obstructive pulmonary disease patients 2025-02-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87437-2 PMID:39893187	研究论文	本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中RNA甲基化和自噬相关的特征	首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了RNA甲基化与自噬在COPD发病机制中的关键作用，并鉴定了FTO和IGF2BP2等关键RNA甲基化调节基因	研究主要依赖于公共数据库的数据，样本量可能有限；动物模型验证部分需要进一步扩展	研究RNA甲基化调节因子在COPD中的作用，并探索RNA甲基化与自噬在COPD发病机制中的关系	COPD患者和非COPD患者的RNA测序数据，以及COPD小鼠模型	生物信息学	慢性阻塞性肺疾病	批量RNA测序，单细胞RNA测序(scRNA-seq)，RT-qPCR，流式细胞术	WGCNA，逻辑回归模型	RNA测序数据	来自GEO数据库的COPD和非COPD患者数据集，以及COPD小鼠模型
206	2025-04-16	Comprehensive analysis reveals the tumor suppressor role of macrophage signature gene FCER1G in hepatocellular carcinoma 2025-02-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-88071-8 PMID:39893200	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和基因组分析，探索了肝癌中巨噬细胞的特征基因及其对患者预后的影响	揭示了FCER1G基因在肝癌中的肿瘤抑制作用，并开发了基于LASSO回归的预后预测模型	样本量较小（仅7个HCC样本），且在高风险组中未观察到MSI和TMB评分的显著差异	探索肝癌中巨噬细胞的特征基因及其对患者预后的影响	肝癌（HCC）患者	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序、基因组分析、LASSO回归	LASSO回归模型	单细胞RNA测序数据、基因组数据	7个HCC样本（来自GEO数据库），并在TCGA-LIHC队列中验证
207	2025-04-16	MSC-EVs and UCB-EVs promote skin wound healing and spatial transcriptome analysis 2025-02-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-87592-6 PMID:39893214	研究论文	研究探讨了脐带血间充质干细胞来源的细胞外囊泡（MSC-EVs）和人脐带血浆来源的细胞外囊泡（UCB-EVs）对皮肤伤口愈合和疤痕减少的影响	首次使用空间转录组学（ST）分析MSC-EVs和UCB-EVs对小鼠皮肤组织中主要细胞类型异质性和伤口愈合途径的影响	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体试验中验证	评估MSC-EVs和UCB-EVs对皮肤伤口愈合和疤痕形成的促进作用	小鼠皮肤伤口模型和人真皮成纤维细胞（HDF-a）	再生医学	皮肤创伤	空间转录组学（ST）、超速离心、透射电子显微镜、纳米颗粒追踪分析、Western blot	小鼠皮肤伤口模型	转录组数据、图像数据	未明确说明小鼠数量，使用HDF-a细胞进行体外实验
208	2025-04-16	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Macrophage Dynamics During MASH in Leptin-Deficient Rats 2025-01-10, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14020096 PMID:39851524	research paper	通过单细胞RNA测序揭示了瘦素缺乏大鼠在MASH过程中的巨噬细胞动态变化	首次在大鼠模型中研究了MASH期间肝巨噬细胞的异质性和功能动态，并发现了一种独特的M1到M2的转变过程	研究仅基于瘦素缺乏大鼠模型，结果可能无法完全反映人类MASH的情况	探究大鼠模型中MASH期间肝巨噬细胞的动态变化及其作用	瘦素缺乏大鼠的肝组织	digital pathology	metabolic dysfunction-associated steatohepatitis (MASH)	scRNA-seq	NA	RNA sequencing data	未明确说明样本数量，研究对象为瘦素缺乏大鼠的肝组织
209	2025-04-16	Immune Gene Expression Profiling in Individuals with Turner Syndrome, Graves' Disease, and a Healthy Female by Single-Cell RNA Sequencing: A Comparative Study 2025-01-10, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14020093 PMID:39851522	研究论文	通过单细胞RNA测序比较特纳综合征、Graves病和健康女性的免疫基因表达差异	首次使用scRNA-seq技术比较特纳综合征患者、健康女性和Graves病患者的抗原特异性CD4(+) T细胞的免疫基因表达差异	样本量较小，仅包括一名特纳综合征患者、一名健康女性和一名Graves病患者	分析特纳综合征患者与健康女性和Graves病患者之间免疫基因表达的差异	特纳综合征患者、健康女性和Graves病患者的抗原特异性CD4(+) T细胞	基因组学	特纳综合征, Graves病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	3名个体（1名特纳综合征患者、1名健康女性、1名Graves病患者）
210	2025-04-16	Cholecystokinin (CCK) Is a Mediator Between Nutritional Intake and Gonadal Development in Teleosts 2025-01-08, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14020078 PMID:39851506	研究论文	本研究探讨了胆囊收缩素（CCK）在鱼类营养摄入与性腺发育之间的中介作用	首次发现CCK通过下丘脑-垂体-性腺（HPG）轴调控鱼类生殖，并揭示了CCK对促性腺激素释放激素-3（GnRH3）和促卵泡激素（FSH）的刺激作用	研究主要基于体外实验，体内机制仍需进一步验证	阐明营养摄入通过CCK调控性腺发育的分子机制	草鱼（grass carp）的下丘脑、垂体和性腺组织	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序、原代细胞培养	NA	基因表达数据	NA
211	2025-04-16	Comprehensive Analysis Identifies THEMIS2 as a Potential Prognostic and Immunological Biomarker in Glioblastoma 2025-01-07, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14020066 PMID:39851494	研究论文	本文首次发现THEMIS2作为胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞介导的免疫抑制的关键调控因子	首次识别THEMIS2在胶质母细胞瘤免疫微环境中的关键作用，并揭示其作为预后标志物和治疗靶点的潜力	未提及研究样本量及实验验证的详细情况	探索胶质母细胞瘤免疫逃逸机制并寻找新的生物标志物	胶质母细胞瘤患者样本及肿瘤微环境中的免疫细胞	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
212	2025-04-16	Vascular smooth muscle cell-derived SO2 sulphenylated interferon regulatory factor 1 to inhibit VSMC senescence 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1516885 PMID:40223932	研究论文	本研究探讨了内源性二氧化硫（SO2）在血管平滑肌细胞（VSMC）衰老中的作用及其分子机制	首次揭示了SO2通过硫化干扰素调节因子1（IRF1）抑制VSMC衰老的新机制	研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类样本验证不足	探索SO2/AAT1通路在VSMC衰老中的作用机制	老年小鼠、VSMC特异性AAT1敲除小鼠、D-半乳糖处理的主动脉环和大鼠VSMC系A7r5	心血管疾病	心血管疾病	Western blot、实时定量PCR、SA-β-gal染色、生物素转换实验、定点诱变	基因敲除小鼠模型	蛋白质表达数据、基因表达数据、酶活性数据	老年小鼠（24月龄）、VSMC-AAT1-KO小鼠、大鼠VSMC系A7r5
213	2025-04-16	Bioinformatic Analysis of Apoptosis-Related Genes in Preeclampsia Using Public Transcriptomic and Single-Cell RNA Sequencing Datasets 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S507660 PMID:40224388	研究论文	通过公共转录组和单细胞RNA测序数据集分析子痫前期中凋亡相关基因的作用	结合scRNA-seq和五种算法识别子痫前期的生物标志物，并在单细胞水平验证其表达	数据来源于公共数据库，可能受限于原始数据的质量和样本量	探索子痫前期中凋亡相关基因及其细胞机制，作为潜在生物标志物	子痫前期患者的转录组和单细胞RNA测序数据	生物信息学	子痫前期	scRNA-seq, RT-qPCR, 差异表达分析	CytoHubba插件中的五种算法	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	公共数据库中的数据集，临床样本通过RT-qPCR验证
214	2025-04-16	Causal Associations of Inflammatory Cytokines With Osteosarcopenia: Insights From Mendelian Randomization and Single Cell Analysis 2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2 DOI:10.1155/mi/6005225 PMID:40224485	研究论文	通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，研究炎症细胞因子在骨肌减少症中的因果作用及其潜在机制	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，揭示了特定细胞因子在骨肌减少症中的因果作用和细胞特异性表达模式	需要进一步研究以确认这些发现及其对肌肉骨骼健康的影响	阐明循环细胞因子在骨肌减少症发病机制中的因果作用，并确定潜在的治疗靶点	骨肌减少症患者	生物医学研究	老年性疾病	孟德尔随机化(MR), 单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因组关联研究(GWAS)数据, 单细胞RNA测序数据	多个队列的公开GWAS数据, 人类肌肉和骨髓的单细胞RNA测序数据集
215	2025-04-16	Mendelian Randomization Combined with Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Role of the Key Gene PCLAF in the Pathogenesis of Atopic Dermatitis 2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology DOI:10.2147/CCID.S506139 PMID:40225314	研究论文	本研究结合单细胞转录组分析和孟德尔随机化方法，揭示了关键基因PCLAF在特应性皮炎发病机制中的作用	首次整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别出PCLAF等基因与特应性皮炎的关联及其在细胞周期调控和免疫逃逸中的作用	研究依赖于现有数据库的样本量，未进行实验验证	探索特应性皮炎的遗传和代谢通路	特应性皮炎患者和健康对照的基因表达数据	生物信息学	特应性皮炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 孟德尔随机化(MR), 基因集富集分析(GSEA)	edgeR, Seurat	RNA测序数据	未明确说明样本数量
216	2025-04-16	Targeting formyl peptide receptor 2 to suppress neuroinflammation in neuromyelitis optica spectrum disorder 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.107303 PMID:40225578	研究论文	本研究探讨了靶向甲酰肽受体2（FPR2）在抑制视神经脊髓炎谱系障碍（NMOSD）神经炎症中的作用	揭示了FPR2/mFpr2在调控小胶质细胞活性中的新作用，提出FPR2拮抗剂可能作为治疗NMOSD的新方法	研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用和临床转化仍需进一步验证	探索FPR2在NMOSD神经炎症中的具体作用及其治疗潜力	NMOSD患者和小鼠模型	神经免疫学	视神经脊髓炎谱系障碍	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、MRI、免疫染色	小鼠NMOSD模型	RNA测序数据、流式细胞数据、影像数据	NMOSD患者和健康对照者的外周血样本，以及NMOSD小鼠模型
217	2025-04-16	FOS-driven inflammatory CAFs promote colorectal cancer liver metastasis via the SFRP1-FGFR2-HIF1 axis 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.111625 PMID:40225580	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，结合体外和体内实验，揭示了炎症性癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过SFRP1-FGFR2-HIF1轴促进结直肠癌肝转移的机制	首次鉴定出一种与不良临床结果相关的炎症性CAF亚型（CFD iCAFs），并揭示了其通过FOS介导的SFRP1过表达促进肿瘤干性和上皮-间质转化（EMT）的分子机制	研究主要基于临床样本和小鼠模型，尚未在更大规模的临床队列中验证SFRP1作为治疗靶点的有效性	探究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌肝转移中的作用及其分子机制	结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移组织、SW480和CT26细胞系、BALB/c小鼠	digital pathology	colorectal cancer	single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics	subcutaneous xenografts, orthotopic tumor metastasis models	RNA-seq data, image	结直肠癌患者样本（非转移性原发肿瘤和转移性原发肿瘤伴肝转移）、6组体外实验、小鼠模型
218	2025-04-16	Deciphering single-cell landscape unravels cell-type-specific functional roles of RNA m6A modification in atherosclerosis 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.104179 PMID:40225569	研究论文	本研究通过单细胞测序数据揭示了RNA m6A修饰在动脉粥样硬化中细胞类型特异性功能的调控机制	首次在单细胞水平上全面解析了m6A修饰在动脉粥样硬化中的细胞类型特异性调控功能，并发现了ALKBH5、WTAP和METTL3等m6A调节因子的重要作用	研究主要基于单细胞测序数据的生物信息学分析，部分结论需要通过更多实验验证	阐明m6A修饰在动脉粥样硬化发生发展中的细胞类型特异性调控机制	动脉粥样硬化患者的单细胞测序数据	单细胞组学	心血管疾病	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序数据	动脉粥样硬化患者的单细胞样本
219	2025-04-16	Integrated Phenotypic and Transcriptomic Analyses of Osteoporosis in Type 2 Diabetic Mice 2025, International journal of medical sciences IF:3.2Q1 DOI:10.7150/ijms.109537 PMID:40225857	研究论文	该研究通过整合表型和转录组学分析，探讨了2型糖尿病小鼠骨质疏松症的早期特征及其分子机制	揭示了2型糖尿病早期骨质疏松的表型特征，鉴定了与疾病进展相关的基因表达变化，并明确了骨髓间充质干细胞的功能异常	研究仅使用小鼠模型，结果需要进一步在人类样本中验证	阐明2型糖尿病对骨骼的影响，特别是在疾病早期阶段	高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型	骨代谢研究	2型糖尿病和骨质疏松症	micro-CT、免疫荧光染色、ELISA、RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠疾病模型	影像数据、分子生物学数据、转录组数据	4周和16周高脂饮食喂养的小鼠
220	2025-04-16	Integrating Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data to Explore Sphingolipid Metabolism Molecular Signatures in Ovarian Cancer Prognosis: an Original Study 2025, International journal of medical sciences IF:3.2Q1 DOI:10.7150/ijms.107391 PMID:40225866	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索鞘脂代谢分子特征在卵巢癌预后中的作用	开发了基于鞘脂相关基因的新型分子亚型，并构建了预测卵巢癌患者预后、免疫细胞浸润特征和化疗敏感性的特征模型	研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制	探索鞘脂代谢分子特征在卵巢癌预后中的作用，并构建预后预测模型	卵巢癌患者	生物信息学	卵巢癌	单细胞RNA测序，批量RNA测序，WGCNA，COX回归，LASSO回归	预后预测模型	RNA测序数据	主要来自TCGA和GEO数据库的卵巢癌数据