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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2141 | 2026-04-12 |
Heterogeneous pericoerulear neurons tune arousal and exploratory behaviours
2025-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08952-w
PMID:40335695
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研究论文 | 本研究通过识别并表征蓝斑核周围异质性的GABA能神经元群,揭示了它们如何调控蓝斑核功能,进而控制全局觉醒水平和相关行为 | 首次在蓝斑核树突场中识别出一群在转录组、空间分布和功能上均具有多样性的GABA能神经元,并阐明了它们通过接收远程输入、调节蓝斑核放电模式来控制觉醒和探索行为的新机制 | NA | 探究局部神经调制输入如何控制蓝斑核功能,以及蓝斑核及其周围神经元在调控觉醒、回避状态和相关行为中的具体作用 | 小鼠的蓝斑核及蓝斑核周围区域的神经元 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 病毒示踪,单细胞RNA测序,空间转录组学,神经环路研究方法 | NA | 转录组数据,空间定位数据,行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2142 | 2026-04-12 |
Alterations in genomic features and the tumour immune microenvironment predict immunotherapy outcomes in advanced biliary tract cancer patients
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03011-7
PMID:40211026
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研究论文 | 本研究构建了一个多维策略,用于预测晚期胆道癌患者免疫治疗的预后和反应 | 通过整合基因组特征(如序列熵和突变)与肿瘤免疫微环境(如单细胞转录组数据中的细胞通讯分析),开发了集成模型EM-CXCL10,其预测性能优于传统指标如肿瘤突变负荷 | 样本量相对较小(60名患者),且部分分析基于公共单细胞数据集(GSE125449),可能限制模型的泛化能力 | 预测晚期胆道癌患者对免疫治疗(抗PD-1)的反应和预后,以指导个性化临床决策 | 晚期胆道癌患者 | 机器学习 | 胆道癌 | 520基因面板测序、多重循环细胞因子检测、单细胞转录组测序 | LASSO算法、Cox回归 | 基因组序列数据、细胞因子数据、单细胞转录组数据 | 60名晚期胆道癌患者,其中30名进行基因面板测序,50名进行细胞因子检测 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2143 | 2026-04-12 |
Single-cell analysis of CD14+CD16+ monocytes identifies a subpopulation with an enhanced migratory and inflammatory phenotype
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1475480
PMID:40051633
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析人类CD14+CD16+单核细胞,识别出一个具有增强迁移和炎症表型的亚群,该亚群可能对神经炎症疾病有重要贡献 | 首次在CD14+CD16+单核细胞中通过单细胞RNA测序识别出具有独特迁移和炎症特征的亚群(Group 1单核细胞),并关联其与神经炎症疾病的潜在机制 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏体内验证和临床样本的直接证据 | 探究CD14+CD16+单核细胞的异质性及其在神经炎症疾病中的作用 | 人类CD14+CD16+单核细胞 | 数字病理学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2144 | 2026-04-11 |
The cell-type-specific genetic architecture of chronic pain in brain and dorsal root ganglia
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI197583
PMID:41055971
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研究论文 | 本研究通过整合慢性疼痛的GWAS数据与人类大脑、背根神经节的单细胞RNA-Seq数据,以及人类大脑和小鼠背角的单细胞染色质可及性数据,揭示了慢性疼痛在脑和外周神经系统中的细胞类型特异性遗传结构 | 首次系统性地整合了GWAS与单细胞多组学数据,识别了慢性疼痛相关遗传变异在特定神经元亚型(如谷氨酸能神经元和hPEP.TRPV1/A1.2神经元)中的富集,并揭示了中枢与外周神经系统中细胞类型特异性的遗传机制 | 研究主要基于关联分析,未进行功能验证实验;数据来源包括小鼠模型,可能不完全反映人类生物学;样本量在单细胞分析中可能有限 | 阐明慢性疼痛的细胞类型特异性遗传结构,为靶向转化研究提供基础 | 人类大脑、背根神经节(hDRG)、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | GWAS, 单细胞RNA-Seq, 单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组关联数据, 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2145 | 2026-04-11 |
Patient phenotyping for molecular profiling of neck and low back pain - Study protocol
2025 Jul-Dec, Neurobiology of pain (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1016/j.ynpai.2025.100186
PMID:40501484
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研究论文 | 本文介绍了针对慢性颈痛和腰痛患者进行分子特征分析的研究方案,旨在通过表型分型促进转录组学发现 | 结合全面的患者表型分型与多组学技术(包括单细胞和空间转录组学),在人类疼痛背景下研究分子神经生物学机制 | 研究依赖于手术获取的组织样本,可能无法完全代表所有慢性疼痛患者群体,且控制组织来自器官捐献者,可能存在匹配偏差 | 通过分子特征分析,揭示慢性颈痛和腰痛的分子神经生物学和神经免疫学机制,以发现治疗靶点 | 接受C1-2和腰椎融合手术的慢性颈痛和腰痛患者,以及器官捐献者的对照组织 | 数字病理学 | 慢性疼痛 | 转录组学 | NA | 组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2146 | 2026-04-11 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,绘制了人类皮肤老化过程中表皮和真皮细胞衰老的图谱,并探讨了衰老细胞在光老化和时序老化中的作用 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并通过单细胞和空间分析揭示了衰老细胞在皮肤中的聚集趋势及其对色素沉着和胶原合成的影响 | NA | 通过细胞衰老的视角表征与年龄相关的皮肤功能障碍 | 人类皮肤中的表皮细胞(如黑色素细胞)和真皮细胞(如网状真皮成纤维细胞) | 数字病理学 | 皮肤老化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2147 | 2026-04-10 |
Standardized metrics for assessment and reproducibility of imaging-based spatial transcriptomics datasets
2025-Dec-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02811-9
PMID:41339526
|
研究论文 | 生成名为Spatial Touchstone (ST)的标准化数据集,包括来自多个全球地点的六种组织类型,在Xenium和CosMx平台上进行分析,并评估其可重复性和性能指标。 | 首次提出标准化操作流程(STSOPs)和开源软件SpatialQM,以及一个包含254个空间图谱的公共数据存储库,用于评估和比较成像类空间转录组学数据。 | 研究仅评估了Xenium和CosMx两个平台,可能未覆盖所有成像空间转录组学技术;样本来源和数量(254个空间谱)可能限制通用性 | 评估成像空间转录组学技术的标准化指标,提高数据可重复性和跨平台比较能力 | 六种组织类型的空间转录组学数据,使用Xenium和CosMx平台进行分析 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学,原位杂交技术 | NA | 空间转录组学数据,图像数据 | 254个空间谱,涵盖六种组织类型 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学,单细胞分析 | Xenium, CosMx | Xenium和CosMx平台用于成像空间转录组学分析,具有不同的化学方法 |
| 2148 | 2026-04-10 |
Autophagy Upregulation in Mutant Isocitrate Dehydrogenase 1 (IDH1) Glioma Uncovers a Novel Therapeutic Target
2025-Sep-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7483444/v1
PMID:40964044
|
研究论文 | 本研究揭示了突变型异柠檬酸脱氢酶1(mIDH1)胶质瘤中自噬上调作为关键生存途径,并探索了通过自噬抑制增强放射敏感性的新治疗策略 | 首次发现mIDH1胶质瘤中自噬上调作为能量来源,并利用合成蛋白纳米颗粒递送siRNA靶向Atg7抑制自噬,从而增强放射敏感性并诱导肿瘤消退 | 研究主要基于人类和小鼠细胞模型及小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索mIDH1胶质瘤的生存机制并开发新的治疗靶点 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及小鼠模型 | 癌症生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 2149 | 2026-04-10 |
Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412159122
PMID:40324076
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了特发性正常压力脑积水患者外周血和脑脊液的细胞图谱,揭示了与认知功能下降相关的免疫失调 | 首次创建了特发性正常压力脑积水的单细胞转录组图谱,并发现了外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变与认知功能的相关性 | 样本仅来自特发性正常压力脑积水患者,缺乏健康对照组或其他神经系统疾病对照 | 探究特发性正常压力脑积水的免疫失调机制及其与认知功能的关系 | 特发性正常压力脑积水患者的外周血和脑脊液细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 140,207个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2150 | 2026-04-10 |
Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565211
PMID:40264770
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析,识别了在多种疾病环境中常见的耐药性MDSCs和一个应激耐受基因共表达网络,作为MDSC的共同特征 | 首次结合炎症信号和细胞应激(血清饥饿)诱导出具有保留MDSC特征的细胞群(耐药性MDSCs),并识别了一个特异性于这些细胞的应激耐受基因共表达模块 | 研究主要基于体外诱导模型和已发表的转录组数据集,可能未完全反映体内复杂环境 | 识别跨多个疾病环境的MDSC共同分子特征,以帮助细胞分类 | 人源单核细胞性MDSCs(M-MDSCs)和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2151 | 2026-04-10 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(Treg)疗法在治疗自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病和促进器官移植耐受方面的应用,并探讨了如何从临床样本和数据中学习以优化Treg疗法 | 整合了临床样本数据与先进的多组学监测技术(如单细胞多组学分析、表观遗传分析和空间转录组学),以优化Treg疗法作为“活体药物” | NA | 优化调节性T细胞疗法,以建立跨多种临床环境的免疫耐受 | 调节性T细胞(Treg),包括多克隆、抗原特异性、转化型、TCR工程化和CAR工程化Treg | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、移植物抗宿主病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 2152 | 2026-04-09 |
Selective Activation of Na V 1.3 Restores Lymphatic Contractility in Age and Injury
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694435
PMID:41446152
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研究论文 | 本文研究了NaV 1.3通道在成年淋巴肌肉中的选择性表达及其在恢复老龄和辐射损伤中淋巴收缩功能的作用 | 首次发现NaV 1.3在成年淋巴肌肉中特异性表达,并证明其选择性激活可恢复老龄和损伤后的淋巴泵功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据有限,且Tf2在辐射损伤中的恢复效果仅为部分 | 探索NaV 1.3在淋巴肌肉生理中的作用,并测试其激活是否可改善老龄和辐射损伤中的淋巴泵功能 | 小鼠和人类淋巴管、淋巴肌肉细胞 | 生物医学研究 | 淋巴功能障碍 | 单细胞RNA测序、免疫染色、体内荧光淋巴造影、生物发光测定 | NA | 基因表达数据、图像数据、生理测量数据 | 年轻、老龄和辐射损伤小鼠,以及人类淋巴管样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2153 | 2026-04-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70278
PMID:41116748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,揭示了老年小鼠白色脂肪组织中Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累及其细胞毒性和炎症潜力 | 首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞,并证明其具有细胞毒性和促炎功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;样本量相对有限 | 比较生理衰老与高脂饮食诱导肥胖对白色脂肪组织免疫细胞组成的影响,以识别不同的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 来自年轻正常饮食、年轻高脂饮食和老年正常饮食小鼠的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2154 | 2026-04-09 |
Axon targeting of transcriptionally distinct pioneer neurons is regulated by retinoic acid signaling
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61044-1
PMID:40593691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼后侧线感觉神经元中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的异质性,并发现视黄酸信号下调对先驱神经元轴突正确靶向至关重要 | 首次通过单细胞RNA测序证明先驱神经元与跟随神经元是转录上不同的群体,并揭示视黄酸信号在调节先驱神经元轴突靶向中的关键作用 | 研究仅基于斑马鱼后侧线感觉神经元模型,结果在其他神经系统或物种中的普适性有待验证 | 探究神经系统发育过程中先驱神经元与跟随神经元在转录水平上的差异及其调控机制 | 斑马鱼后侧线感觉神经元,包括先驱神经元和跟随神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2155 | 2026-04-09 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白在宿主防御利什曼原虫感染中的作用,通过平衡骨髓细胞中的iNOS/Arg-1表达来促进寄生虫控制 | 首次揭示了GBPs在皮肤利什曼病中的关键作用,通过调节iNOS和Arg-1的表达平衡来影响寄生虫生长环境,独立于GBPs的寄生虫定位 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;体外实验可能无法完全模拟体内复杂免疫环境 | 探究GBPs在皮肤利什曼病免疫防御机制中的具体作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠的骨髓来源巨噬细胞和单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2156 | 2026-04-09 |
Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study
2025-04-18, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67880
PMID:40323789
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综述 | 本文通过文献计量学和可视化方法,系统分析了2010年至2023年间癌症单细胞测序领域的研究趋势、合作网络和知识传播 | 首次对癌症单细胞测序领域进行了大规模、跨时间维度的文献计量学与可视化分析,揭示了该领域的全球研究格局、核心贡献者及前沿方向 | 分析基于Web of Science数据库,可能未涵盖所有相关出版物;文献计量方法主要反映数量与关联,对研究质量的深度评估有限 | 阐明癌症单细胞测序领域的研究趋势、国际合作网络及知识传播路径 | 2010年至2023年间Web of Science核心合集中收录的癌症单细胞测序相关学术出版物 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献元数据 | 5,680篇出版物,涉及34,074位作者、3,129个机构、75个国家/地区及788种学术期刊 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2157 | 2026-04-09 |
An Efficient Method for Extracting Human Fallopian Tube Epithelia for Single-cell Analyses
2025-03-28, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67753
PMID:40228013
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研究论文 | 本文介绍了一种高效分离人输卵管上皮细胞用于单细胞分析的方法 | 开发了一种能在4-6小时内从新鲜输卵管中分离出高纯度上皮细胞单细胞悬液的新方法,减少了基质细胞污染 | 未明确说明该方法在疾病研究中的具体应用效果或长期培养的稳定性 | 建立一种高效分离人输卵管上皮细胞的方法,以支持单细胞分析等下游研究 | 人输卵管上皮细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞悬液 | 未指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2158 | 2026-04-09 |
Derivation of a Human Brain Organoid with Microglia Development
2025-01-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67491
PMID:39895643
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研究论文 | 本文开发了一种包含小胶质细胞发育的人类大脑类器官模型,用于研究早期神经免疫相互作用 | 通过将iPSC分化的高度纯化造血祖细胞整合到胚胎体中,成功构建了同时包含小胶质细胞和神经元的大脑类器官,克服了现有方法在细胞数量和质量上的不一致问题 | 未明确说明类器官中微胶质细胞与神经元相互作用的长期稳定性及模型在模拟特定神经疾病方面的验证程度 | 建立包含微胶质细胞的人类大脑类器官模型,以研究早期神经免疫相互作用及神经炎症疾病 | 人类诱导多能干细胞(iPSC)衍生的造血祖细胞和大脑类器官 | 数字病理学 | 神经炎症疾病 | 单细胞RNA测序(sc-RNA-seq)、免疫染色 | 3D类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2159 | 2026-04-07 |
Comprehensive Spatial Profiling of Species-agnostic Transcriptomes via Stereo-seq
2025-10-31, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68619
PMID:41248068
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Stereo-seq的空间物种无关转录组分析方法,用于FFPE组织,通过随机探针方法实现亚细胞分辨率 | 该方法采用随机引物进行空间条形码,不同于标准空间转录组学方法,能同时检测宿主和非宿主RNA,包括微生物、病毒和真菌RNA | 协议需考虑环境和处理污染物对组织内外RNA的区分影响 | 开发一种空间物种无关的转录组分析技术,以研究细胞类型和病原物种的相互作用 | FFPE组织中的宿主和非宿主RNA,包括细菌、病毒和真菌RNA | 空间转录组学 | NA | 空间物种无关转录组分析,随机探针方法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq方法使用0.22 µm大小的随机捕获珠,每0.5 µm在阵列中重复,实现基于测序的亚细胞分辨率 |
| 2160 | 2026-04-07 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-10-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
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研究论文 | 本文介绍了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡液、卵泡体细胞及未成熟卵母细胞的标准化实验方案 | 开发了无需酶法脱颗粒的卵丘细胞分离方法以保持转录组完整性,并建立了从新鲜卵泡液制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | 方案依赖于辅助生殖技术过程中产生的废弃生物材料,样本获取受临床流程限制 | 建立标准化方案以利用辅助生殖技术产生的生物副产物研究卵巢生理学 | 人类卵泡内容物(卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞、颗粒细胞等) | 生殖生物学 | 生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、密度梯度离心、体外卵母细胞成熟 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子、激素、代谢物、环境毒物数据 | 未明确说明具体样本数量,但方案适用于接受取卵手术的女性个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |