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当前共找到 10779 篇文献,本页显示第 2121 - 2140 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2121 2025-12-05
Linear structure unfolding : application to mouse brain in spatial transcriptomics
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
研究论文 本文提出了一种用于空间转录组学中分析细长弯曲形状或点云的方法,通过展开线性结构来研究细胞或转录本类型沿主轴的分布 结合k-means聚类和旅行商问题优化自动计算形状的中心线,实现沿中心线或垂直方向的细胞或转录本空间分布分析 NA 解决空间转录组学中特定形状区域(如细长弯曲结构)的计算分析问题 小鼠大脑组织中的细胞或RNA分子点云 空间转录组学 NA 空间转录组学 k-means聚类,旅行商问题优化 图像,点云数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2122 2025-12-05
Single-cell resolution uncovers neighboring cell subtypes that share steroidogenic capacity during fetal testis development
2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞技术揭示了小鼠胎儿睾丸发育过程中类固醇生成细胞(如胎儿Leydig细胞)的异质性及其在雄激素生产中的协同作用 通过单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序,首次发现胎儿Leydig细胞在类固醇生成基因表达上存在不同步性和不完整性,并揭示了邻近细胞类型间的合作机制 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他物种;且主要关注胎儿发育阶段,成年期变化未探讨 探究胎儿睾丸发育过程中单个及集体类固醇生成细胞对雄激素生产的贡献 小鼠胎儿睾丸中的类固醇生成细胞(包括胎儿Leydig细胞和其他间质细胞类型) 数字病理学 NA 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 NA 图像, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2123 2025-12-05
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,使其从膜上移位,从而促进突变p53介导的突变KRAS过度激活的分子机制 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常,从而解释突变p53与KRAS致癌协同作用的具体通路 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证仍需扩大规模;GAP17-1膜移位的确切结构机制有待进一步解析 探究突变p53与KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、组织芯片 NA 基因表达数据、组织病理数据 多种胰腺癌细胞系、三种基因工程小鼠模型(iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*)、临床前与临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2124 2025-12-05
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Lloki的新框架,用于整合不同平台的空间转录组学数据,无需共享基因面板 Lloki通过特征对齐和批次对齐任务,利用最优传输引导的特征传播和scGPT单细胞基础模型,实现了跨平台ST数据的统一集成,克服了基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性等挑战 NA 开发一个跨平台空间转录组学数据整合框架,以促进组织结构和细胞相互作用的深入理解 小鼠脑样本和卵巢癌数据集 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 scGPT 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 小鼠脑样本来自五种不同技术,以及五个卵巢癌数据集 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
2125 2025-12-05
Splenic TNF-α signaling potentiates the innate-to-adaptive transition of antiviral NK cells
2025-Mar-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了巨细胞病毒感染期间,脾脏TNF-α信号通路如何通过调控NF-κB信号促进NK细胞从固有免疫向适应性免疫的转变 首次发现脾脏微环境中TNF-α/TNFR2信号通过激活经典和非经典NF-κB通路,分别调控NK细胞的效应功能和适应性前体细胞分化,阐明了组织特异性信号在NK细胞免疫记忆形成中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人体内的验证尚需进一步研究;对TNF-α信号与其他细胞因子网络的相互作用探讨有限 探究病毒感染过程中NK细胞在脾脏微环境获得适应性免疫特征的分子机制 巨细胞病毒感染模型中的自然杀伤细胞 免疫学 病毒感染 单细胞RNA测序,纵向追踪 NA 基因表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2126 2025-12-05
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SIID的算法,用于整合不同空间转录组学平台的数据,通过联合非负矩阵分解模型实现基因表达的插补和细胞类型特异性表达的解卷积 首次提出能够同时处理空间转录组数据插补和解卷积的联合模型,通过空间对齐和联合非负矩阵分解,有效整合不同分辨率和技术特点的平台数据 算法性能依赖于配对数据集的质量和空间对齐的准确性,在技术平台差异过大时可能效果受限 开发能够整合不同空间转录组学平台数据的算法,实现基因表达插补和细胞类型解卷积 空间转录组学数据,特别是来自不同技术平台(如10x Genomics Visium和Xenium)的配对数据集 空间转录组学 乳腺癌, 结肠癌 空间转录组学技术 联合非负矩阵分解模型 空间基因表达数据 人类乳腺癌和结肠癌组织样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x Xenium 10x Visium(全转录组,多细胞分辨率), 10x Xenium(靶向数百个基因,亚细胞分辨率)
2127 2025-12-05
Immunological and Prognostic Profiling of Triple-Negative Breast Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing of T-Cell Exhaustion
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过单细胞和bulk RNA测序分析三阴性乳腺癌中的T细胞耗竭特征,构建风险评分模型并评估其与患者预后及免疫治疗响应的关系 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统分析三阴性乳腺癌中T细胞耗竭的免疫学特征,并构建基于TEX相关基因的风险评分模型用于预后评估 研究仅基于公开数据集GSE161529,缺乏独立验证队列和实验验证,样本量相对有限 评估T细胞耗竭特征对三阴性乳腺癌患者免疫治疗响应的影响,并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤微环境中的T细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 风险评分模型 RNA测序数据 12,477个高质量细胞,来自GSE161529数据集 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
2128 2025-12-05
Infiltration of CXCL9+ macrophages confers a favorable prognosis in breast cancer: Insights from an integrated single-cell RNA and bulk RNA sequencing study
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序,揭示了CXCL9+巨噬细胞在乳腺癌中的浸润与患者良好预后相关,并构建了基于相关基因的生存风险模型 首次通过单细胞和bulk RNA测序整合分析,识别出CXCL9+巨噬细胞作为乳腺癌预后良好的关键细胞亚群,并验证了其通过CXCL9/10/11-CXCR3轴激活T细胞和NK细胞的抑制肿瘤机制 研究主要基于测序数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源和数量未具体说明,可能影响结论的普适性 探究乳腺癌肿瘤微环境中细胞异质性,识别与生存预后相关的关键细胞类型,并开发免疫治疗新靶点 乳腺癌肿瘤组织中的免疫细胞(特别是巨噬细胞亚群)及乳腺癌细胞系 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, 体外细胞实验 反卷积算法, 生存风险模型 RNA测序数据, 细胞实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2129 2025-12-05
Integrated multi-omics analysis reveals necroptosis-related biomarker BIRC3 for early diagnosis and therapeutic targeting in preeclampsia
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合多组学分析,揭示了坏死性凋亡相关基因BIRC3作为先兆子痫早期诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 首次将坏死性凋亡与先兆子痫发病机制联系起来,并通过多组学验证确定了BIRC3作为新型诊断标志物 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;样本量有限且依赖于现有数据库 识别先兆子痫的坏死性凋亡相关生物标志物,并通过虚拟筛选寻找潜在天然化合物 先兆子痫患者胎盘组织及相关基因表达数据 生物信息学 先兆子痫 单细胞RNA测序,机器学习,分子对接 随机森林 基因表达数据 多个公共数据集(GSE66273、GSE44711、GSE173193) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2130 2025-12-05
Integrated single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analysis to investigate key adipogenesis genes in adipose-derived stem cells
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了脂肪来源干细胞(ADSCs)成脂分化过程中的关键基因及其调控网络 首次整合bulk和单细胞RNA-seq数据,系统揭示了ADSC成脂分化早期和晚期的阶段特异性转录调控因子,并构建了ceRNA网络 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qPCR,缺乏功能验证和体内实验 阐明ADSC成脂分化的全局和阶段特异性转录调控网络,为脂肪组织稳态和脂肪移植提供候选调控靶点 脂肪来源干细胞(ADSCs) 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qPCR NA RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2131 2025-12-05
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过综合转录组学、孟德尔随机化和机器学习分析,探讨了内质网应激相关基因DNAJB1在慢性阻塞性肺疾病中的风险作用和临床价值 首次将DNAJB1识别为COPD的风险基因,并利用单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法构建了一个包含九个关键基因的诊断标志物组合 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和具体数据细节未明确说明 识别与COPD发病和进展相关的遗传变异和新型生物标志物,以改善临床预后 慢性阻塞性肺疾病患者及相关基因数据 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞测序、微阵列数据分析 机器学习 转录组数据、单细胞测序数据、微阵列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2132 2025-12-05
Single-cell RNA-seq combined with bulk RNA-seq explores shared gene signatures between thyroid and breast cancers
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据,探索了甲状腺癌和乳腺癌之间的共享基因特征和潜在治疗靶点 结合单细胞和bulk转录组数据,应用细胞反卷积和WGCNA分析,首次系统性地识别了两种癌症共有的关键基因模块和信号通路 研究样本量有限,且主要基于转录组数据,缺乏功能实验验证这些基因在癌症发生发展中的具体机制 识别乳腺癌和甲状腺癌共有的关键基因和共享治疗靶点 乳腺癌和甲状腺癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织 生物信息学 乳腺癌, 甲状腺癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, RT-qPCR, 免疫组化 机器学习方法 转录组数据, 单细胞数据 未明确指定样本数量,但包括两种癌症患者的临床样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2133 2025-12-05
Potential marker genes for psoriasis revealed based on single-cell sequencing and Mendelian randomization analysis
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别了与银屑病风险相关的七个候选基因,并探讨了它们在CD4+ T细胞中的表达及免疫通路中的作用 首次结合单细胞转录组数据与孟德尔随机化分析来识别银屑病的遗传标记基因,并聚焦于CD4+ T细胞中的表达 研究依赖于公开数据库数据,样本量相对有限,且未进行实验验证 探究银屑病的分子机制,识别潜在的生物标志物和治疗靶点 银屑病患者和健康对照的皮肤样本 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 Seurat包用于数据处理 单细胞转录组数据 174个皮肤样本(92个来自银屑病患者,82个来自健康对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2134 2025-12-04
cGAS-STING signaling in the tumor microenvironment induces myeloid cell activation and favors T cell-mediated antitumor immunity
2025-Dec-31, Cancer biology & therapy IF:4.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序技术,揭示了STING激动剂通过重塑肿瘤微环境中的免疫细胞图谱,增强先天和适应性免疫反应,从而促进抗肿瘤免疫的机制 首次在胰腺癌同基因肿瘤模型中,通过单细胞转录组测序系统描绘了STING激动剂诱导的肿瘤微环境多细胞谱系转录重编程全景图 临床转化面临药代动力学限制和潜在全身毒性的挑战,需要进一步优化STING激动剂的递送方式和剂量 探究STING信号通路在肿瘤微环境中如何调控免疫细胞功能并促进T细胞介导的抗肿瘤免疫 胰腺癌同基因肿瘤模型中的肿瘤微环境免疫细胞 单细胞组学 胰腺癌 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2135 2025-12-04
Ets1-regulated endothelial-secreted factors promote compact myocardial growth and contribute to the pathogenesis of ventricular non-compaction
2025-Dec-02, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Ets1调控的内皮分泌因子在致密心肌生长中的作用,并探讨了其在心室致密化不全发病机制中的潜在治疗靶点 首次通过单细胞RNA测序技术系统分析了心室致密化不全中异常的心肌细胞和内皮细胞状态,并明确了Ets1在调控内皮分泌因子(如Notch1信号通路和ECM成分)中的关键作用 研究主要基于动物模型,尚未在人类患者中进行验证,且具体治疗策略的临床转化效果仍需进一步探索 探究心室致密化不全中致密心肌变薄的机制,并识别潜在的内皮分泌治疗因子 小鼠模型中的心肌细胞和内皮细胞,特别是Ets1基因条件性敲除后的心脏组织 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2136 2025-12-04
Transfer of Damaged Mitochondria from Cancer Cells to Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Tyrosine Kinase Inhibitor Tolerance in EGFR-Mutant Lung Cancer
2025-Dec-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究揭示了EGFR突变肺癌中,癌症相关成纤维细胞通过接收肿瘤细胞受损线粒体,促进酪氨酸激酶抑制剂耐受的新机制 首次发现RGS5+MYL9+ CAF作为“代谢池”接收肿瘤细胞受损线粒体,通过CCL11信号招募和Miro1/RhoA激活形成隧道纳米管,并证明Rho激酶抑制剂法舒地尔可阻断此过程 研究主要基于单细胞RNA测序和体内实验,临床转化效果需进一步验证 探究EGFR突变肺癌中酪氨酸激酶抑制剂耐受的机制 EGFR突变肺腺癌的耐药持续细胞和癌症相关成纤维细胞 单细胞组学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2137 2025-12-04
Elevated 5-HTR7 deteriorates dysregulated megakaryocytopoiesis in immune thrombocytopenic purpura via upregulating the PKA/Orai1/ERK1/2 pathway
2025-Dec-01, Haematologica IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了5-羟色胺受体7(5-HTR7)在免疫性血小板减少性紫癜(ITP)中通过上调PKA/Orai1/ERK1/2通路损害巨核细胞成熟并导致血小板减少的机制 首次揭示了5-HTR7在ITP发病机制中的具体作用,并阐明了其通过PKA/Orai1/ERK轴抑制钙离子内流从而损害巨核细胞成熟的新机制 研究主要基于体外实验和动物模型,其临床转化效果仍需进一步验证 探究5-HTR7在ITP中调控巨核细胞生成障碍的分子机制 ITP患者的巨核细胞及小鼠ITP模型 NA 免疫性血小板减少性紫癜 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、Western blot、共聚焦显微镜 NA 测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据 未明确具体样本数量,涉及ITP患者和健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2138 2025-12-04
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-Dec-01, Genes & development IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了早期小鼠皮下脂肪组织中DPP4+前脂肪细胞群的扩张机制,并发现IGF2在此过程中驱动细胞增殖而非分化 首次识别出断奶前小鼠皮下脂肪网状间质中表达IGF2的DPP4+前体细胞群,并阐明IGF2在促进前脂肪细胞扩张中的时间限制性作用 研究仅基于小鼠模型,未在人类组织中验证;单细胞测序数据可能受技术偏差影响 探究早期生命阶段脂肪组织快速扩张的细胞机制,以理解代谢健康性肥胖 断奶前和成年小鼠的皮下脂肪组织 单细胞组学 肥胖 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠皮下脂肪组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2139 2025-12-04
Depleting IL1R2+ Tumor-Infiltrating Regulatory T Cells with an ADCC-Prone Nanobody Construct Boosts the Efficacy of Anti-PD-1 Immunotherapy
2025-Dec-01, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)表面的IL1R2,开发了一种ADCC倾向的纳米抗体构建体,以增强抗PD-1免疫疗法的疗效 首次将IL1R2鉴定为高度活化和强抑制性肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)的表面标志物,并开发了具有优化ADCC功能的抗IL1R2纳米抗体-Fc构建体,可特异性清除IL1R2+ tiTregs,并与抗PD-1疗法产生协同抗肿瘤效应 研究主要基于小鼠模型和人类数据集的分析,尚未在临床环境中验证;IL1R2受体本身对tiTreg的丰度和活化并非必需,其具体功能机制有待进一步阐明 探索特异性靶向肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg)以增强免疫检查点阻断疗法疗效的策略 三阴性乳腺癌(TNBC)和结直肠癌小鼠模型以及人类TNBC和结直肠癌数据集中的肿瘤浸润调节性T细胞(tiTreg) 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌,结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞转录组和表位测序索引(CITE-seq),荟萃分析 NA 单细胞转录组数据,表位数据,测序数据 来自小鼠模型和人类数据集(TNBC和结直肠癌)的样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2140 2025-12-04
CCNE1 Exerts a Protective Effect on Parkinson's Disease by Regulating Ferroptosis-Related Proteins
2025-Dec, Brain and behavior IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析揭示了CCNE1通过上调PARP16表达调控铁死亡,从而对帕金森病发挥神经保护作用的分子机制 首次从分子层面阐明了CCNE1通过调控铁死亡关键蛋白PARP16发挥神经保护作用的机制,为帕金森病研究提供了新视角 孟德尔随机化分析存在潜在的多效性偏倚风险,且机制验证主要依赖于生物信息学分析 探究铁死亡相关蛋白如何通过遗传变异调控帕金森病风险 帕金森病患者相关的蛋白质与基因 生物信息学 帕金森病 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、转录组分析 两样本孟德尔随机化、中介分析 遗传变异数据、蛋白质定量性状位点数据、基因表达数据 基于UKB-PPP和deCODE研究的pQTL数据及PD GWAS数据,涉及210个显著相关蛋白 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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