单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2101	2025-03-01	Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287 PMID:39837060	研究论文	本研究通过单细胞测序技术揭示了乳腺癌脑转移中巨噬细胞在脑微环境重塑中的必要性	首次在小鼠模型中进行乳腺癌脑转移的单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞亚群在中枢神经系统中的变化及其在免疫逃逸和营养供应中的作用	研究样本量较小，仅分析了三个脑手术标本和小鼠模型的数据	全面研究脑肿瘤微环境，识别促进脑转移的促肿瘤机制及关键分子	乳腺癌脑转移的脑手术标本和小鼠模型	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	三个脑手术标本和小鼠模型
2102	2025-03-01	Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286 PMID:39842212	研究论文	本文通过生物信息学分析和实验验证了ANXA1在胶质瘤中的不利预后作用	首次通过单细胞测序技术揭示了ANXA1在胶质母细胞瘤细胞中的高表达及其在免疫细胞中的富集情况	ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性需要进一步研究	探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响	胶质瘤患者和胶质瘤细胞	数字病理学	胶质瘤	实时定量PCR、Western blotting、单细胞测序	NA	基因表达数据、实验数据	两个队列的胶质瘤患者样本
2103	2025-03-01	CD47 is a tumor cell-derived exosomal signature and regulates tumor immune microenvironment and immunotherapy responses 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102291 PMID:39864342	研究论文	本文探讨了CD47作为肿瘤细胞来源的外泌体标志物，在调节肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应中的作用	研究发现CD47是肿瘤来源外泌体的标志物，能够区分免疫热和免疫冷肿瘤，并反映免疫治疗反应	研究主要基于转录组和单细胞RNA测序数据，未涉及实验验证	识别能够区分免疫热和免疫冷肿瘤并反映免疫治疗反应的肿瘤来源外泌体标志物	卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者	肿瘤免疫学	卵巢癌、乳腺癌	转录组测序、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据、单细胞RNA测序数据	大量转录组和单细胞RNA测序数据集，包括卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者
2104	2025-03-01	Cellular heterogeneity and communication networks in gastric cancer: Single-cell analysis reveals β-hydroxybutyrylation-associated genes and immune infiltration characteristics 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102270 PMID:39884220	研究论文	本研究利用单细胞测序技术解析了胃癌的细胞异质性和细胞间通讯网络，重点研究了β-羟基丁酰化（Kbhb）相关基因及其对肿瘤微环境的影响	首次在单细胞水平上鉴定了胃癌中与β-羟基丁酰化相关的基因，并揭示了这些基因在免疫浸润和肿瘤微环境重塑中的关键作用	研究主要基于TCGA数据集，样本来源和多样性可能有限，且未进行实验验证	解析胃癌的细胞异质性和细胞间通讯网络，探索β-羟基丁酰化相关基因的预后价值和治疗潜力	胃癌患者	数字病理学	胃癌	单细胞测序	风险评分模型	单细胞基因表达数据	189,700个单细胞样本
2105	2025-03-01	Single-cell RNA sequencing integrated with bulk RNA sequencing analysis of clock circadian regulator with prognostic and immune microenvironment in thyroid cancer 2025-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102299 PMID:39892222	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了时钟昼夜节律调节器（CLOCK）在甲状腺癌进展及其免疫微环境中的作用	首次结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了CLOCK在甲状腺癌中的过表达及其对肿瘤生长和免疫微环境的影响	研究主要依赖于生物信息学分析和体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索CLOCK在甲状腺癌中的作用及其潜在机制	甲状腺癌	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序, 批量RNA测序	LASSO回归, Kaplan-Meier生存估计	RNA测序数据	小鼠模型和人类样本
2106	2025-03-01	Identification of a liver fibrosis and disease progression-related transcriptome signature in non-alcoholic fatty liver disease 2025-Mar, The international journal of biochemistry & cell biology DOI:10.1016/j.biocel.2025.106751 PMID:39909111	研究论文	本研究旨在建立一个转录组特征，以区分非酒精性脂肪肝病（NAFLD）患者的轻度或晚期纤维化，并监测疾病进展	通过最小绝对收缩选择算子回归，识别出11个核心基因的转录组特征，用于区分NAFLD患者的纤维化阶段和监测疾病进展	研究主要依赖于公开的基因表达数据库，可能受到数据质量和样本量的限制	建立NAFLD相关肝纤维化和疾病进展的转录组特征	NAFLD患者	数字病理学	非酒精性脂肪肝病	转录组分析	最小绝对收缩选择算子回归	转录组数据	六个批量转录组数据集的NAFLD患者
2107	2025-03-01	Intratumoral Injection of Cytotoxic Drugs Plus Hapten Elicits Significant Immune Responses in Sentinel Lymph Nodes: Implications for Cancer Immunotherapy 2025-Mar-01, Pancreas IF:1.7Q3 DOI:10.1097/MPA.0000000000002439 PMID:39999315	研究论文	研究通过瘤内注射细胞毒性药物加半抗原对胰腺癌原发部位治疗后，前哨淋巴结（SLNs）的细胞和基因组变化	揭示了靶向治疗如何调节淋巴结微环境以增强局部免疫反应，并可能提高全身抗肿瘤效果	未提及具体样本量，可能影响结果的普遍性	定义前哨淋巴结的转移和远隔效应的机制	胰腺癌患者的前哨淋巴结	癌症免疫治疗	胰腺癌	scRNA-seq	NA	基因组数据	NA
2108	2025-03-01	Targeting Zfp36 to combat cardiac hypertrophy: Insights into ferroptosis pathways 2025-Mar, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1 DOI:10.1002/ctm2.70247 PMID:40000392	研究论文	本研究探讨了Zfp36在心脏肥大中的调节作用，特别是通过Ythdc2/SLC7A11/GSH铁死亡途径的调节机制	首次证明了Zfp36通过抑制心肌细胞中的铁死亡来减轻心脏肥大，为针对铁死亡的治疗策略提供了新靶点	NA	研究Zfp36在心脏肥大中的调节功能及其在铁死亡中的作用机制	心肌细胞和心肌组织	生物医学	心血管疾病	单细胞测序分析	NA	基因表达数据	NA
2109	2025-03-01	Automated Laser-Assisted Single-Cell Sorting for Cell Functional and RNA Sequencing 2025-Feb-28, ACS sensors IF:8.2Q1 DOI:10.1021/acssensors.4c02417 PMID:39843241	研究论文	本文介绍了一种自动化、高效的激光辅助单细胞分选技术，用于细胞功能和RNA测序分析	结合激光诱导前向转移（LIFT）和高通量皮升微孔阵列，实现了自动化、高效率（>80%）的单细胞分离	NA	开发一种自动化、高效的单细胞分选技术，以支持下游的单细胞分析，如RNA测序	单细胞	生物医学工程	NA	激光诱导前向转移（LIFT）、单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	NA
2110	2025-03-01	Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma 2025-Feb-28, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.70012 PMID:40018995	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据的整合分析，探索了肝细胞癌（HCC）的异质性和复发特征，揭示了复发HCC中恶性细胞和免疫细胞的变化，并提出了MIF-(CD74+CXCR4)信号通路作为关键机制	开发了一个复发肿瘤细胞相关风险评分（RTRS），能够独立预测总体生存时间和无复发生存时间，且比传统临床变量具有更高的准确性	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制	探索肝细胞癌的异质性和复发特征，识别关键治疗靶点，设计有效的抗癌疗法	肝细胞癌（HCC）的原发和早期复发样本	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序，RT-qPCR	机器学习	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
2111	2025-03-01	Transcriptome Landscape of Cancer-Associated Fibroblasts in Human PDAC 2025-Feb-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415196 PMID:40019403	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序分析，全面描绘了人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组景观	识别了包括新发现的CAF亚型在内的九种不同的CAF亚型，并揭示了CAF亚型之间的分化可塑性及其与临床不良结果的关联	NA	研究胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的转录组特征及其动态转换	人类胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
2112	2025-03-01	The bone marrow NK cell profile predicts MRD negativity in patients with multiple myeloma treated with daratumumab-based therapy 2025-Feb-28, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024026455 PMID:40019438	研究论文	本研究通过单细胞转录组学、流式细胞术和功能实验，探讨了多发性骨髓瘤（MM）患者诊断时和治疗期间骨髓中自然杀伤（NK）细胞的变化	揭示了诊断时CD16+细胞毒性NK细胞比例降低与达雷妥尤单抗治疗下细胞因子产生减少和NK细胞脱颗粒能力下降的相关性，并发现CD16+骨髓NK细胞比例低的患者在接受达雷妥尤单抗治疗后达到MRD阴性的可能性降低	研究结果主要基于CASSIOPEIA试验的数据，可能不适用于其他治疗方案或患者群体	探讨骨髓NK细胞在多发性骨髓瘤患者接受达雷妥尤单抗治疗中的预测作用	多发性骨髓瘤患者	免疫治疗	多发性骨髓瘤	单细胞转录组学、流式细胞术、功能实验	NA	细胞数据	CASSIOPEIA试验中的多发性骨髓瘤患者
2113	2025-03-01	Immunomodulatory effects of traditional chinese medicine on cancer: insights from network pharmacology and single-cell RNA sequencing data on the treatment of lung adenocarcinoma with shenling baizhu powder 2025-Feb-28, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-025-01550-z PMID:40019596	研究论文	本研究通过网络药理学和单细胞RNA测序数据探讨了参苓白术散对肺腺癌的免疫治疗作用	结合网络药理学和单细胞RNA测序技术，揭示了参苓白术散通过调节巨噬细胞相关基因增强免疫功能的机制	研究机制尚不完全明确，需进一步临床研究验证	探讨参苓白术散对肺腺癌的免疫调节作用及其机制	肺腺癌患者及其免疫细胞	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	机器学习	RNA测序数据	未明确提及样本数量
2114	2025-03-01	Metabolic reprogramming in astrocytes prevents neuronal death through a UCHL1/PFKFB3/H4K8la positive feedback loop 2025-Feb-27, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01467-x PMID:40016338	研究论文	本文探讨了星形胶质细胞代谢重编程在脊髓损伤（SCI）后通过UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路防止神经元死亡的作用	揭示了UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路在星形胶质细胞代谢重编程中的关键作用，并提出了SCI治疗的潜在靶点	研究主要基于体外和体内实验，尚未进行临床试验验证	研究脊髓损伤后星形胶质细胞代谢重编程的作用及其机制	星形胶质细胞和神经元	生物医学	脊髓损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
2115	2025-03-01	Elucidating prognostic significance of purine metabolism in colorectal cancer through integrating data from transcriptomic, immunohistochemical, and single-cell RNA sequencing analysis 2025-Feb-27, Molecular oncology IF:5.0Q1 DOI:10.1002/1878-0261.70010 PMID:40017120	研究论文	本研究通过整合转录组、免疫组化和单细胞RNA测序数据，探讨了嘌呤代谢在结直肠癌中的预后意义	首次通过免疫组化验证嘌呤代谢作为结直肠癌预后标志物的临床相关性，并发现五个嘌呤代谢相关基因的低表达与不良预后相关	嘌呤代谢反应的可逆性可能影响研究结果的稳定性	评估嘌呤代谢在结直肠癌中的临床相关性及其作为预后标志物的潜力	结直肠癌患者	数字病理学	结直肠癌	转录组分析、免疫组化(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据、免疫组化数据、单细胞RNA测序数据	结直肠癌患者亚组（包括野生型TP53、突变型TP53和微卫星稳定表型）
2116	2025-03-01	Multi-omics analyses and machine learning prediction of oviductal responses in the presence of gametes and embryos 2025-Feb-26, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.100705 PMID:40009070	研究论文	本研究通过多组学分析和机器学习预测，探讨了小鼠输卵管在配子和胚胎存在下的适应性反应	首次结合bulk RNA-seq、scRNA-seq和蛋白质组学数据，利用基于transformer的机器学习模型预测转录因子对蛋白质丰度的影响	研究主要基于小鼠模型，与人类输卵管炎症反应的差异需要进一步验证	阐明输卵管与配子/胚胎之间的适应性相互作用	小鼠输卵管组织	机器学习	NA	bulk RNA-seq, scRNA-seq, 蛋白质组学	transformer	RNA-seq, 蛋白质组学数据	小鼠输卵管组织在不同交配后时间点的样本
2117	2025-03-01	NFE2-driven neutrophil polarization promotes pancreatic cancer liver metastasis progression 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115226 PMID:39827463	研究论文	本文探讨了胰腺癌肝转移中中性粒细胞的极化作用及其在转移进展中的关键角色	揭示了NFE2驱动的中性粒细胞极化在胰腺癌肝转移中的关键作用，并提出了其作为抗转移治疗潜在靶点的可能性	研究主要基于单细胞测序和空间转录组学数据，仍需进一步实验验证其机制	研究胰腺癌肝转移中中性粒细胞的极化机制及其对转移进展的影响	胰腺癌肝转移中的中性粒细胞	癌症研究	胰腺癌	单细胞测序, 空间转录组学	NA	单细胞测序数据, 空间转录组学数据	NA
2118	2025-03-01	Chronic intermittent fasting impairs β cell maturation and function in adolescent mice 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115225 PMID:39827461	研究论文	本文研究了间歇性禁食（IF）对不同年龄小鼠的系统代谢和β细胞功能的影响	揭示了慢性间歇性禁食对年轻小鼠β细胞成熟和功能的负面影响，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行了详细分析	研究主要基于小鼠模型，人类胰岛的研究结果仅部分支持，需要进一步验证	探讨间歇性禁食对不同年龄个体代谢和β细胞功能的影响	老年、中年和年轻小鼠，以及人类胰岛	代谢研究	糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	不同年龄的小鼠和人类胰岛样本
2119	2025-03-01	Early precursor-derived pituitary gland tissue-resident macrophages play a pivotal role in modulating hormonal balance 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115227 PMID:39841599	研究论文	本文通过单细胞转录组学、命运图谱和成像技术，揭示了垂体驻留巨噬细胞的异质性和空间特异性，并探讨了它们在调节垂体激素平衡中的作用	首次详细描述了垂体驻留巨噬细胞的异质性和空间特异性，并揭示了它们通过细胞外ATP介导的细胞间信号调节垂体激素平衡的机制	研究主要基于小鼠模型，人类垂体驻留巨噬细胞的特性和功能可能有所不同	探讨垂体驻留巨噬细胞在调节垂体激素平衡中的作用	垂体驻留巨噬细胞	免疫学	NA	单细胞转录组学、命运图谱、成像技术	NA	单细胞转录组数据、成像数据	NA
2120	2025-03-01	The spatial landscape of cancer hallmarks reveals patterns of tumor ecological dynamics and drug sensitivity 2025-Feb-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.115229 PMID:39864059	研究论文	本文通过空间转录组学技术，探索了10种癌症类型中63个未经治疗的原发性肿瘤的癌症标志物空间分布，揭示了肿瘤生态动力学模式和药物敏感性	首次展示了癌症标志物在肿瘤空间中的组织化分布，并发现肿瘤亚克隆之间的基因组距离与标志物活性差异相关，甚至导致克隆-标志物特化	研究样本量相对较小，仅涉及63个肿瘤样本和33名膀胱癌患者，可能限制了结果的普遍性	探索肿瘤生态动力学和药物敏感性，以改善对肿瘤生态的理解并帮助识别新的药物生物标志物	10种癌症类型中63个未经治疗的原发性肿瘤和33名膀胱癌患者	数字病理学	癌症	空间转录组学	NA	空间转录组数据	63个原发性肿瘤样本和33名膀胱癌患者