单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2081	2025-03-02	Pathological and molecular insights into intravenous leiomyomatosis: an integrative multi-omics study 2025-Feb-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-024-05919-9 PMID:40011937	研究论文	本文通过多组学方法研究静脉内平滑肌瘤病（IVL），揭示了其病理和分子变化	首次对IVL进行了全面的单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了其与子宫肌瘤的细胞组成差异及染色体10q缺失的重要性	由于IVL较为罕见，样本量有限，可能影响结果的普适性	研究IVL的病理和分子机制，以改善其诊断和治疗	IVL、子宫肌瘤和正常子宫肌层的组织样本	数字病理学	静脉内平滑肌瘤病	单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、H&E染色	NA	组织样本、RNA测序数据、蛋白质组数据	8对IVL和正常子宫肌层的新鲜冷冻组织样本
2082	2025-03-02	Exploring the hepatic-ophthalmic axis through immune modulation and cellular dynamics in diabetic retinopathy and non-alcoholic fatty liver disease 2025-Feb-26, Human genomics IF:3.8Q2 DOI:10.1186/s40246-025-00730-z PMID:40011971	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，探索了糖尿病视网膜病变（DR）和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的免疫调节和细胞动态变化	揭示了T细胞、巨噬细胞和内皮细胞在DR和NAFLD中的关键作用，特别是CD45信号通路的重要性，为这两种疾病的治疗提供了新的视角	研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据，可能受到数据质量和样本来源的限制	阐明DR和NAFLD中不同细胞群体之间的复杂相互作用和通讯途径	糖尿病视网膜病变（DR）和非酒精性脂肪肝病（NAFLD）	生物信息学	糖尿病视网膜病变, 非酒精性脂肪肝病	单细胞RNA测序, 基因表达差异分析, 伪时间分析, CellChat, GSEA, GSVA	NA	单细胞RNA测序数据	从GEO数据库中获取的PDR和NAFLD单细胞RNA测序数据
2083	2025-03-02	Association of 5α-reductase inhibitor prescription with immunotherapy efficacy in metastatic renal cell carcinoma: a multicenter retrospective analysis 2025-Feb-25, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011154 PMID:40010773	研究论文	本研究探讨了5α-还原酶抑制剂（5-ARIs）使用史对转移性肾细胞癌（mRCC）患者免疫检查点抑制剂（ICIs）疗效的影响	首次通过多中心回顾性分析，揭示了5-ARIs使用史与ICIs疗效的关联，并通过单细胞RNA测序提供了免疫学机制上的新见解	研究为回顾性分析，可能存在选择偏倚，且样本量相对较小	评估5-ARIs使用史对mRCC患者ICIs疗效的影响	185名接受ICIs治疗的mRCC患者	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	Cox比例风险模型	临床数据和RNA测序数据	185名mRCC患者
2084	2025-03-02	Single-cell analysis of neoplastic plasma cells identifies myeloma pathobiology mediators and potential targets 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101925 PMID:39855192	研究论文	本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）技术，区分了单克隆/肿瘤性浆细胞与多克隆/正常浆细胞，并发现了更多在前期患者中失调的基因	结合scRNA-seq和scBCR-seq技术，首次在单细胞水平上区分了肿瘤性和正常浆细胞，并验证了MAD2L1和MAT2A作为潜在治疗靶点的有效性	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证其疗效	探索多发性骨髓瘤的病理生物学机制并识别潜在的治疗靶点	多发性骨髓瘤患者的浆细胞	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
2085	2025-03-02	Spatially resolved transcriptomics reveal the determinants of primary resistance to immunotherapy in NSCLC with mature tertiary lymphoid structures 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101934 PMID:39909044	研究论文	本文通过空间转录组学和多重免疫荧光技术，揭示了非小细胞肺癌（NSCLC）中成熟三级淋巴结构（mTLSs）与免疫检查点抑制剂（ICIs）原发性耐药的决定因素	研究发现两种不同的癌症相关成纤维细胞（CAFs）亚群在mTLSs阳性的NSCLC中介导了ICIs的原发性耐药，并提出了新的治疗靶点	研究样本量较大（n=509），但未提及是否涵盖不同亚型的NSCLC或不同阶段的疾病	揭示NSCLC中mTLSs与ICIs疗效的决定因素，并探索新的治疗靶点	非小细胞肺癌（NSCLC）患者	数字病理学	肺癌	空间转录组学，多重免疫荧光（mIF）	NA	转录组数据，免疫荧光图像	509名NSCLC患者
2086	2025-03-02	Enhanced conversion of T cells into CAR T cells by modulation of the MAPK/ERK pathway 2025-Feb-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101970 PMID:39938523	研究论文	本文通过单细胞多组学分析，研究了T细胞在嵌合抗原受体（CAR）T细胞生成过程中的分子事件，揭示了MAPK/ERK通路在CAR T细胞生成中的作用	通过单细胞多组学分析揭示了CAR T细胞生成过程中的分子机制，特别是MAPK/ERK通路的作用	研究中使用的化学抑制剂可能对细胞有其他未知的影响，且样本来源仅限于健康供体和患者	研究CAR T细胞生成过程中的分子机制，以提高CAR T细胞的生成效率	T细胞	生物医学工程	NA	单细胞多组学分析	NA	单细胞转录组数据	健康供体和患者的T细胞
2087	2025-03-02	Multiple Myeloma Insights from Single-Cell Analysis: Clonal Evolution, the Microenvironment, Therapy Evasion, and Clinical Implications 2025-Feb-14, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17040653 PMID:40002248	综述	本文综述了多发性骨髓瘤（MM）的复杂性，包括克隆进化、遗传不稳定性、肿瘤微环境的作用以及治疗抵抗的机制	强调了单细胞技术（如单细胞转录组学、基因组学和多组学）在理解MM异质性和耐药机制中的关键作用	尽管技术先进，MM仍是一种无法治愈的疾病，临床应用面临高成本、数据复杂性和标准化生物信息学需求的挑战	旨在通过深入研究MM的进展机制，提高个性化治疗策略并改善患者预后	多发性骨髓瘤（MM）	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞转录组学、基因组学、多组学	NA	单细胞数据	NA
2088	2025-03-02	A unified framework for cell-type-specific eQTL prioritization by integrating bulk and scRNA-seq data 2025-Feb-06, American journal of human genetics IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.ajhg.2024.12.018 PMID:39824189	研究论文	本文提出了一种统计框架IBSEP，通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，增强细胞类型特异性eQTL的优先级排序	IBSEP框架通过层次线性模型整合bulk RNA-seq和scRNA-seq的汇总统计数据，克服了单一技术的局限性，提升了细胞类型特异性eQTL的识别能力	尽管IBSEP在识别细胞类型特异性eQTL方面表现出色，但其性能仍受限于scRNA-seq数据的小样本量和技术限制	研究目的是通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，提高细胞类型特异性eQTL的优先级排序，以更深入地理解复杂疾病的遗传基础	研究对象包括外周血单核细胞和大脑皮层数据集	基因组学	复杂疾病	bulk RNA-seq, scRNA-seq	层次线性模型	RNA-seq数据	包括外周血单核细胞和大脑皮层数据集
2089	2025-03-02	Single-cell analysis of cerebrospinal fluid reveals common features of neuroinflammation 2025-Jan-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101733 PMID:39708811	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同炎症、感染和非炎症性神经系统疾病患者脑脊液中免疫细胞的功能特征	揭示了脑脊液在细胞组成和基因表达方面与外周血的区别，并发现不同神经炎症性疾病中脑脊液的细胞和转录景观具有显著的相似性	未明确提及样本量大小，可能限制了结果的广泛适用性	探索神经炎症中脑脊液免疫细胞的功能特征，以寻找多发性硬化症等疾病的新药物靶点	不同炎症、感染和非炎症性神经系统疾病患者的脑脊液	生物信息学	神经系统疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
2090	2025-03-02	Mechanism of enhancing chemotherapy efficacy in pancreatic ductal adenocarcinoma with paricalcitol and hydroxychloroquine 2025-Jan-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101881 PMID:39730001	研究论文	本研究探讨了帕立骨化醇（P）和羟氯喹（H）联合使用在增强胰腺导管腺癌（PDAC）对吉西他滨（G）化疗敏感性中的作用	揭示了PH组合通过上调自噬和内质网应激相关转录物，减少Ki67、FAP和SMA表达成纤维细胞，增加M1极化和CD4、CD8 T细胞，减少调节性T细胞（Tregs）的分子机制	研究主要基于体外实验、小鼠模型和患者来源的异种移植模型，尚未在广泛临床应用中验证	阐明PH组合的分子特性及其在增强PDAC对吉西他滨化疗敏感性中的潜力	胰腺导管腺癌（PDAC）	NA	胰腺癌	蛋白质组学和单细胞RNA测序（RNA-seq）	NA	RNA-seq数据	体外实验、原位小鼠模型和患者来源的异种移植模型
2091	2025-03-02	Coupling of response biomarkers between tumor and peripheral blood in patients undergoing chemoimmunotherapy 2025-Jan-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101882 PMID:39731918	研究论文	本文研究了在接受化疗免疫治疗的患者中，肿瘤与外周血之间反应生物标志物的耦合关系	结合了外周血单核细胞的时间进程RNA测序和预处理肿瘤转录组数据，揭示了CD8 T效应记忆细胞在响应者外周血中的丰富性及其在治疗中的扩展	研究样本量较小（N=54），且为单臂试验，缺乏对照组	探索化疗免疫治疗中肿瘤与免疫细胞之间的复杂相互作用	接受化疗免疫治疗的间皮瘤患者	生物信息学	间皮瘤	RNA-seq, 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序（TCR-seq）	NA	RNA测序数据	54名患者
2092	2025-03-02	High cellular plasticity state of medulloblastoma local recurrence and distant dissemination 2025-Jan-21, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101914 PMID:39809264	研究论文	本文通过单细胞/单核RNA测序、单核转座酶可及染色质测序和空间转录组学分析，研究了髓母细胞瘤复发和扩散的细胞多样性和遗传特征	发现了一种名为“高细胞可塑性（HCP）”的亚群，该亚群在髓母细胞瘤进展过程中出现，并与复发相关	研究主要基于实验室模型，尚未在临床环境中验证	研究髓母细胞瘤复发和扩散的细胞多样性和遗传特征	髓母细胞瘤（MB）的局部复发和远处扩散	数字病理学	脑肿瘤	单细胞/单核RNA测序（sc/snRNA-seq）、单核转座酶可及染色质测序（snATAC-seq）、空间转录组学	NA	RNA测序数据、染色质可及性数据、空间转录组数据	未明确提及具体样本数量
2093	2025-03-02	FGFR2 directs inhibition of WNT signaling to regulate anterior fontanelle closure during skull development 2025-Jan-15, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204264 PMID:39775862	研究论文	本研究探讨了FGFR2如何通过调节WNT信号通路来调控颅骨发育过程中前囟的闭合	揭示了FGFR2通过调控WNT信号通路在颅骨发育中的新机制，特别是前囟闭合的过程	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究FGFR2在颅骨发育过程中前囟闭合的调控机制	小鼠前囟细胞	发育生物学	颅骨畸形	单细胞转录组学	小鼠遗传模型	基因表达数据	NA
2094	2025-03-02	Single-cell and spatial analysis reveals the interaction between ITLN1+ foam cells and SPP1+ macrophages in atherosclerosis 2025, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2 DOI:10.3389/fcvm.2025.1510082 PMID:40017519	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞在动脉粥样硬化中的相互作用	首次揭示了ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用及其在动脉粥样硬化中的关键作用	需要进一步验证这些机制以开发有效的免疫治疗策略	研究动脉粥样硬化中不同细胞群体的调控功能及其相互作用	血管平滑肌细胞（VSMC）衍生的ITLN1+泡沫细胞和SPP1+ FABP5+巨噬细胞	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序，空间转录组学分析	NA	RNA测序数据，空间转录组数据	NA
2095	2025-03-02	A novel classification method for LUAD that guides personalized immunotherapy on the basis of the cross-talk of coagulation- and macrophage-related genes 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1518102 PMID:40018029	研究论文	本研究提出了一种基于凝血和巨噬细胞相关基因交叉作用的新型分类方法，用于指导肺腺癌（LUAD）患者的个性化免疫治疗	通过结合凝血和巨噬细胞相关基因（COMAR基因）进行LUAD患者的分类，并构建了一个预后风险评分模型，该模型在预测接受抗PD-1/PD-L1免疫治疗的LUAD患者预后和临床结果方面表现出高效和稳健性	研究结果需要进一步的外部验证和更大规模的临床样本验证	探索基于凝血和巨噬细胞相关基因的新型分类方法，以更好地指导LUAD患者的精准治疗	肺腺癌（LUAD）患者	数字病理学	肺癌	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析	预后风险评分模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量，但使用了外部数据队列和临床样本进行验证
2096	2025-03-02	Modulation of double-negative T cells by Huang-Lian-Jie-Du Decoction attenuates neuroinflammation in ischemic stroke: insights from single-cell transcriptomics 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1537277 PMID:40018035	研究论文	本研究探讨了双阴性T细胞（DNTs）在缺血性卒中急性期的作用，并评估了黄连解毒汤（HLJD）对这些细胞的影响	通过单细胞转录组学技术，首次识别出DNTs的两种亚型：激活的细胞毒性表型（Kill+）和静止的免疫抑制表型（Kill-），并发现HLJD能够调节这两种亚型的平衡	需要进一步研究以阐明DNT介导的免疫反应机制，并探索HLJD在其他神经炎症疾病中的更广泛应用	探讨DNTs在缺血性卒中中的作用及HLJD的调节效果	双阴性T细胞（DNTs）和黄连解毒汤（HLJD）	神经科学	缺血性卒中	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序数据	NA
2097	2025-03-02	Elevated levels of IRF1 and CASP1 as pyroptosis-related biomarkers for intestinal epithelial cells in Crohn's disease 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1551547 PMID:40018047	研究论文	本研究通过差异表达分析、机器学习算法和单细胞测序分析，识别了与克罗恩病（CD）肠上皮细胞焦亡相关的关键基因，并验证了这些基因在临床样本和TNBS诱导的结肠炎大鼠模型中的表达	首次将IRF1和CASP1识别为克罗恩病肠上皮细胞焦亡的关键生物标志物，并揭示了其在CD不同亚型中的诊断价值	研究主要基于基因表达数据，缺乏对焦亡机制的直接功能验证	探索焦亡在克罗恩病肠上皮细胞中的作用及其相关生物标志物	克罗恩病患者和TNBS诱导的结肠炎大鼠模型	生物信息学	克罗恩病	差异表达分析、机器学习算法、单细胞测序分析	NA	基因表达数据	临床样本和TNBS诱导的结肠炎大鼠模型
2098	2025-03-02	Single-cell Analysis Highlights Anti-apoptotic Subpopulation Promoting Malignant Progression and Predicting Prognosis in Bladder Cancer 2025, Cancer informatics IF:2.4Q3 DOI:10.1177/11769351251323569 PMID:40018511	研究论文	本文通过单细胞分析揭示了膀胱癌中抗凋亡亚群在恶性进展和预后预测中的关键作用	识别了一个独特的抗凋亡肿瘤亚群，该亚群通过特定的信号通路与免疫和基质细胞相互作用，促进肿瘤进展，并开发了一个5基因风险模型来预测患者预后	NA	阐明膀胱癌肿瘤异质性对患者预后的影响，并探索抗凋亡亚群在肿瘤进展中的作用	膀胱癌肿瘤和类器官	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	Cox回归模型	单细胞RNA测序数据	NA
2099	2025-03-01	Single-cell immunopathology of recurrent acute generalized exanthematous pustulosis associated with vancomycin 2025-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global DOI:10.1016/j.jacig.2025.100426 PMID:40008097	研究论文	本文通过单细胞测序技术研究了一位由万古霉素引发的复发性急性泛发性发疹性脓疱病（AGEP）患者的免疫病理机制和遗传风险因素	首次在AGEP患者中应用单细胞测序技术，揭示了TH17样效应细胞在AGEP皮肤炎症中的关键作用，并探讨了HLA-A∗32:01等遗传风险因素	研究仅基于单一病例，样本量有限，结果可能需要更大规模的研究验证	探讨AGEP的免疫病理机制和遗传风险因素	一位复发性AGEP患者	数字病理	皮肤疾病	单细胞测序	NA	基因和蛋白质表达数据	1位患者，3个时间点的皮肤活检样本
2100	2025-03-01	Single-Cell RNA Sequencing to Guide Autologous Preterm Cord Mesenchymal Stromal Cell Therapy 2025-Mar, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1 DOI:10.1164/rccm.202403-0569OC PMID:39586004	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了脐带来源的间充质基质细胞（UC-MSCs）在治疗早产儿慢性肺病支气管肺发育不良（BPD）中的潜力	首次使用单细胞RNA测序技术比较了来自足月和早产捐赠者的UC-MSCs的转录组，并确定了与治疗潜力相关的特定基因和细胞间相互作用	研究样本量较小，且未涵盖所有可能的妊娠相关并发症	评估UC-MSCs在治疗早产儿BPD中的潜力，并确定妊娠相关并发症是否影响其治疗效果	脐带来源的间充质基质细胞（UC-MSCs）和人类新生儿真皮成纤维细胞	生物医学	支气管肺发育不良（BPD）	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	5名足月捐赠者、16名早产捐赠者和人类新生儿真皮成纤维细胞