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当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 2041 - 2060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2041 | 2025-11-20 |
T cell immune dysfunction and progression to severe COVID-19 in asthma revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Nov-18, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2025.0099
PMID:41253375
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究哮喘患者中T细胞免疫功能障碍与进展为重症COVID-19的关联 | 首次使用单细胞RNA测序揭示哮喘患者中T细胞比例减少和细胞毒性CD8+ T细胞扩增与重症COVID-19发展的关联 | 样本量较小（仅12名患者），特别是哮喘/重症COVID-19组仅有1名患者 | 评估哮喘患者免疫功能障碍与进展为重症COVID-19之间的关联 | 哮喘和非哮喘COVID-19患者的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名患者（4名哮喘，8名非哮喘），共155,565个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2042 | 2025-11-20 |
BM-MSC-derived migrasomes reverse stroke-induced thymic atrophy and immunosuppression via Pin1 delivery to thymic epithelial cells
2025-Nov-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03604-2
PMID:41241718
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研究论文 | 本研究揭示骨髓间充质干细胞通过分泌迁移体递送Pin1蛋白，逆转中风诱导的胸腺萎缩和免疫抑制 | 首次发现BM-MSC来源的迁移体能够穿越血胸屏障，通过递送细胞周期调节蛋白Pin1特异性促进胸腺上皮细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 解决中风后神经保护与免疫抑制之间的临床困境 | 骨髓间充质干细胞、迁移体、胸腺上皮细胞、T细胞 | 细胞生物学 | 中风 | 单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱、体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 中风模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 2043 | 2025-11-20 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
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研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法，用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间，并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 将高维单细胞和空间转录组数据转化为功能性通路见解 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,scATAC-seq | 多重对应分析,线性回归 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,scATAC-seq | NA | NA |
| 2044 | 2025-11-20 |
Enhancing Spatial Transcriptomics via Spatially Constrained Matrix Decomposition with EDGES
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508346
PMID:40842021
|
研究论文 | 本文开发了一种名为EDGES的空间约束矩阵分解框架，用于增强空间转录组数据的基因表达预测和去噪 | 通过图拉普拉斯正则化整合空间信息，同时协同整合细胞表示和基因特异性表示，确保预测基因表达与真实ST分布紧密对齐 | NA | 解决成像基空间转录组技术在基因检测能力和表达谱测量准确性方面的局限性 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2045 | 2025-11-20 |
stTrace: detecting spatial-temporal domains from spatial transcriptome to trace developmental path
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf606
PMID:41241818
|
研究论文 | 提出一种从空间转录组数据中检测时空域以追踪发育路径的算法stTrace | 整合细胞发育程度、基因表达和空间位置信息识别时空域，并揭示其层次发育关系 | NA | 开发从空间转录组数据追踪发育路径的算法 | 小鼠胚胎和人类乳腺癌数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | stTrace算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2046 | 2025-11-20 |
Characterization of tertiary lymphoid structure identifies competitive binding of CD40 and STING with TRAF2 driving IRF4-mediated B cell activation in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00944-2
PMID:40855365
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌中三级淋巴结构的特征，揭示了CD40和STING与TRAF2竞争性结合通过非经典NF-κB信号通路驱动IRF4介导的B细胞激活机制 | 首次发现CD40和STING与TRAF2的竞争性结合关系，阐明其通过调节IRF4表达促进B细胞激活的新机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探索三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌中的临床意义及其抗肿瘤作用的生物学机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和体外培养的B细胞 | 癌症免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外实验 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2047 | 2025-11-02 |
Duplicated genes find their space: Spatial transcriptomics illuminates evolutionary fates
2025-Oct-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf265
PMID:41175099
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2048 | 2025-11-20 |
Medium-Chain Fatty Acid exposure in non-transformed mammary glands leads to pro-tumorigenic alterations associated with aging
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.01.679891
PMID:41256444
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中链脂肪酸暴露会导致非转化乳腺组织出现类似衰老的前肿瘤性改变 | 首次揭示中链脂肪酸辛酸通过改变细胞间连接和细胞外基质相互作用，诱导乳腺组织产生与衰老相关的前肿瘤性变化 | 研究主要关注非转化乳腺组织，未在肿瘤模型中验证这些变化对癌症发展的直接影响 | 探索乳腺局部环境中影响乳腺癌发生的病因学和生物学因素 | 非转化乳腺组织 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2049 | 2025-11-20 |
Mechanisms of Sepsis From a Metabolic Immunology Perspective: A Bidirectional Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing Study of CD39 + Cells
2025-Oct-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002633
PMID:40663487
|
研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化和单细胞测序分析，探讨了CD39+细胞在脓毒症发病机制中的代谢免疫作用 | 首次整合双向孟德尔随机化和单细胞转录组学方法，揭示CD39+CD8+T细胞通过代谢中间产物如雄酮硫酸盐驱动脓毒症进展的机制 | 研究样本量相对有限，需要进一步验证代谢物与免疫表型之间的因果关系 | 研究脓毒症发病机制中免疫表型与代谢物之间的相互作用 | 脓毒症患者与对照组的免疫细胞，特别是CD39+CD8+T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 双向孟德尔随机化，单细胞RNA测序 | MR分析，单细胞聚类分析 | 基因组关联研究数据，代谢组数据，单细胞转录组数据 | 11,643例脓毒症病例，GSE167363数据集（脓毒症vs对照组） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2050 | 2025-11-20 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Crucial Role of Mitochondrial Fission-Fusion Imbalance in Heart Failure Progression
2025-Oct, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10662-7
PMID:40711504
|
研究论文 | 通过单细胞测序比较病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异，揭示线粒体融合/分裂失衡在心力衰竭进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统比较病理性和生理性心脏肥大的线粒体动态变化，发现融合/分裂比率的时间动态变化是决定心脏命运的关键因素 | 研究主要基于动物模型，需要进一步验证在人类心脏疾病中的适用性 | 阐明病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异，揭示心力衰竭的发病机制 | TAC诱导的病理性心脏肥大和运动诱导的生理性心脏肥大小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点（2周、5-8周、11周）的小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2051 | 2025-11-20 |
PFKFB3 Promotes Myofibroblast Differentiation and Cardiac Fibrosis Through its Intra- and Extra- Cellular Roles
2025-Oct, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10688-x
PMID:41166052
|
研究论文 | 本研究揭示了PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号传导双重机制驱动心肌纤维化的新机制 | 首次发现PFKFB3通过细胞内糖酵解调控和细胞外信号传导双重作用促进心肌纤维化 | NA | 探究PFKFB3在心肌纤维化发病机制中的作用 | 心肌成纤维细胞、心肌病患者、小鼠模型 | 单细胞测序 | 心肌病 | 单细胞RNA测序, Western blot, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 心肌病患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2052 | 2025-11-20 |
Nephrobase Cell+: Multimodal Single-Cell Foundation Model for Decoding Kidney Biology
2025-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.30.679471
PMID:41256511
|
研究论文 | 开发了首个肾脏特异性多模态单细胞基础模型Nephrobase Cell+，用于解码肾脏生物学 | 首个专注于肾脏的大型基础模型，采用器官规模的多模态预训练和专门的transformer架构 | NA | 开发肾脏特异性单细胞基础模型以改进肾脏生物学解码 | 人类、小鼠、大鼠和猪的肾脏单细胞数据 | 单细胞分析 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学 | transformer编码器-解码器架构,混合专家模块 | 单细胞和单核转录组数据,表观基因组数据,空间转录组数据 | 约39.5百万个单细胞和单核图谱，来自4,319个样本 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,单核ATAC-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2053 | 2025-11-20 |
CDK4 or CDK6 upregulation induces DNA replication stress and genomic instability to cause EGFR targeted therapy resistance in lung cancer
2025-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.12.584638
PMID:41256559
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研究论文 | 本研究揭示了CDK4或CDK6上调通过诱导DNA复制应激和基因组不稳定性导致EGFR突变肺癌对靶向治疗产生耐药性的机制 | 首次阐明CDK4/6上调通过复制应激和基因组不稳定性驱动EGFR靶向治疗耐药的具体分子机制 | 机制研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探究CDK4/6上调导致EGFR突变肺癌靶向治疗耐药的分子机制 | EGFR突变肺腺癌患者样本和临床前模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,拷贝数分析 | NA | 基因表达数据,拷贝数变异数据,单细胞测序数据 | EGFR突变肺腺癌患者活检样本和临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2054 | 2025-11-20 |
Inferring spatial single-cell-level interactions through interpreting cell state and niche correlations learned by self-supervised graph transformer
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.608964
PMID:41256640
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研究论文 | 提出一种基于自监督图变换器的模型GITIII，用于从空间转录组数据中推断单细胞水平的细胞间相互作用 | 将细胞视为单词，细胞周围环境视为上下文，通过自监督图变换器学习细胞状态与生态位相关性来推断细胞间相互作用 | NA | 开发能够从空间转录组数据中推断和解释单细胞水平细胞间相互作用的新方法 | 多个物种、器官和平台的四个空间转录组数据集中的细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤微环境，脑部疾病 | 空间转录组学，图神经网络 | 图变换器，自监督学习 | 空间转录组数据，单细胞数据 | 四个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2055 | 2025-11-20 |
Spatiomolecular mapping reveals anatomical organization of heterogeneous cell types in the human nucleus accumbens
2025-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675374
PMID:40964296
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，构建了人类伏隔核细胞类型和空间域的空间分子图谱 | 首次在人类大脑中发现连续的基因表达空间梯度，揭示了DRD1和DRD2中型多棘神经元更复杂的空间组织模式 | 研究基于10名神经典型成年捐赠者的死后组织样本，样本量相对有限 | 解析人类伏隔核细胞类型和空间组织的分子特征及其与神经精神疾病的关联 | 人类伏隔核组织样本 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 10名神经典型成年捐赠者的伏隔核组织 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2056 | 2025-11-20 |
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7603392/v1
PMID:41041542
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现结肠中存在不同发育阶段的iNKT细胞，并揭示杯状细胞通过CD1d介导的抗原呈递促进iNKT细胞扩增从而抑制结肠炎 | 首次证明成人结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞前体，并发现杯状细胞作为非经典抗原呈递细胞的新功能 | NA | 探究结肠iNKT细胞的发育特性和在结肠炎中的保护机制 | 人类和小鼠的结肠iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 | 免疫学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2057 | 2025-11-20 |
MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633094
PMID:39868215
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研究论文 | 介绍MetaLigand数据库工具，用于预测非肽配体介导的细胞间通讯 | 整合233种非肽配体的生物合成酶、转运蛋白基因和受体基因数据，结合从头合成和补救合成途径提高预测准确性 | NA | 开发预测非肽配体-受体相互作用和细胞间通讯的工具 | 非肽配体（脂质、氨基酸、碳水化合物、非肽神经递质和激素）及其介导的细胞间通讯 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 转录组数据分析，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 2058 | 2025-11-20 |
Plasma Proteome Profiling Identifies Biomarkers and Potential Drug Targets for Non-Small Cell Lung Cancer
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.107109
PMID:41049426
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研究论文 | 通过血浆蛋白质组分析和遗传学方法识别非小细胞肺癌的潜在生物标志物和药物靶点 | 首次通过蛋白质组范围的孟德尔随机化分析识别出8种与NSCLC病因有因果关系的血浆蛋白，并进行了多方法验证 | 研究主要基于遗传数据，需要进一步实验验证这些蛋白质在NSCLC发病机制中的具体作用 | 识别非小细胞肺癌的新型生物标志物和潜在药物靶点 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 蛋白质组分析、孟德尔随机化、GWAS、scRNA-seq、基因功能分析 | 孟德尔随机化、贝叶斯共定位、SMR、HEIDI | 遗传数据、蛋白质组数据、基因表达数据 | LUAD: 11,273例(GWAS) + 1,590例(FinnGen); LUSC: 7,426例(GWAS) + 1,510例(FinnGen) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2059 | 2025-11-20 |
Immune-related gene signatures of thin endometrium: a transcriptomic and single-cell study
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1626451
PMID:41113715
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞研究揭示薄型子宫内膜的免疫相关基因特征 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，发现薄型子宫内膜中免疫相关基因的差异表达特征 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 识别薄型子宫内膜相关的差异表达基因和免疫特征 | 薄型子宫内膜患者和健康对照者的子宫内膜组织 | 转录组学 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜患者和健康对照者的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2060 | 2025-11-19 |
Aldehyde dehydrogenase ALDH3A1 rescues cigarette smoke-induced emphysema by conferring alveolar type 2 to type 1 cell transition
2025-Dec-16, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了醛脱氢酶ALDH3A1通过促进肺泡Ⅱ型细胞向Ⅰ型细胞转化来挽救香烟烟雾诱导的肺气肿 | 首次发现AHR/ARNT/ALDH3A1信号通路在维持肺泡结构中的关键作用，并建立小鼠肺泡类器官模型模拟人类肺部变化 | 研究主要基于体外模型和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 探究香烟烟雾诱导肺气肿中肺泡Ⅱ型细胞向Ⅰ型细胞转化的调控机制 | 人类肺泡细胞、小鼠肺气肿模型、肺泡类器官 | 生物医学研究 | 肺气肿 | 单细胞RNA测序，肺泡类器官培养，基因过表达 | 动物模型，体外类器官模型 | 基因表达数据，肺功能数据，组织形态数据 | 未明确样本数量，使用人类肺泡细胞、小鼠模型和类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |