单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2021	2025-03-05	Tumor-initiating cells escape tumor immunity via CCL8 from tumor-associated macrophages in mice 2025-Jan-07, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI180893 PMID:39774471	研究论文	本研究揭示了肿瘤起始细胞（TICs）通过肿瘤相关巨噬细胞（Reg-TAMs）的CCL8介导的GAS6/AXL/MERTK信号通路逃避免疫清除的机制	首次结合单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和双重组酶谱系追踪技术，鉴定了WNT激活的恶性细胞亚群作为体内TICs，并揭示了TICs与Reg-TAMs之间的互作机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类肿瘤中进行验证	探究肿瘤起始细胞（TICs）如何逃避免疫清除，并寻找新的免疫治疗策略	肿瘤起始细胞（TICs）和肿瘤相关巨噬细胞（Reg-TAMs）	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、双重组酶谱系追踪、化学抑制剂、基因敲除小鼠模型	NA	RNA测序数据、基因表达数据	小鼠模型
2022	2025-03-05	Role of pericytes in regulating penile angiogenesis and nerve regeneration 2025-Jan-01, Asian journal of andrology IF:3.0Q1 DOI:10.4103/aja202455 PMID:39162179	综述	本文综述了周细胞在调节阴茎血管生成和神经再生中的作用，特别是在糖尿病性和神经性勃起功能障碍（ED）中的具体机制	本文通过综述2000年至2023年PubMed上的研究成果，深入探讨了周细胞功能障碍在ED发病机制中的重要作用，为未来研究提供了新的方向	本文主要基于文献综述，缺乏原始实验数据支持，且对周细胞在ED中的具体机制仍需进一步研究	分析周细胞在勃起功能障碍（ED）中的具体作用，特别是糖尿病性和神经性ED	周细胞及其在ED中的作用	生物医学	勃起功能障碍	单细胞RNA测序	NA	文献数据	NA
2023	2025-03-05	Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis Explored Changes in Midnolin-Related Immune Microenvironment and Constructed Combined Prognostic Model for Pancreatic Cancer 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S503326 PMID:40026303	研究论文	本文通过单细胞测序和转录组分析探索了与midnolin相关的免疫微环境变化，并构建了胰腺癌的联合预后模型	首次结合MIDN表达、10个midnolin相关基因的预后模型和M1细胞浸润构建联合预后模型，为胰腺癌的免疫治疗提供了新视角	未明确说明样本量及具体实验细节	探索midnolin相关基因及免疫浸润细胞在胰腺癌预后中的价值，并构建联合预后模型	胰腺癌	数字病理学	胰腺癌	单细胞测序, CIBERSORT, Cox回归, LASSO	联合预后模型	单细胞数据, 转录组数据	NA
2024	2025-03-05	Integration of Single Cell and Bulk RNA-Sequencing Reveals Key Genes and Immune Cell Infiltration to Construct a Predictive Model and Identify Drug Targets in Endometriosis 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S497643 PMID:40026309	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，并构建诊断和预测模型	首次整合单细胞和批量RNA测序数据，识别关键基因和免疫细胞浸润，构建高精度的预测模型并预测潜在药物靶点	研究样本量有限，且仅针对增殖期子宫内膜，未涵盖其他疾病阶段	探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，构建诊断和预测模型	子宫内膜异位症患者的增殖期子宫内膜和健康对照	数字病理学	子宫内膜异位症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq）、RT-qPCR	LASSO回归	基因表达数据	子宫内膜异位症患者和健康对照的基因表达数据
2025	2025-03-05	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peripheral Immune Cell Senescence and Inflammatory Phenotypes in Patients with Premature Ovarian Failure 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S496130 PMID:40026314	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了早发性卵巢功能不全（POF）患者外周免疫细胞的衰老和炎症表型，并探讨了外周与卵巢局部免疫反应之间的相互作用	首次利用单细胞RNA测序技术详细描绘了POF患者的外周免疫微环境，并识别了与疾病相关的关键基因和细胞类型	样本量较小，仅包括3名健康个体和4名POF患者，可能限制结果的普遍性	探讨POF患者外周免疫微环境的复杂性及其与卵巢局部免疫反应的相互作用	早发性卵巢功能不全（POF）患者的外周血单核细胞（PBMCs）	单细胞组学	早发性卵巢功能不全	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	3名健康个体和4名POF患者的外周血单核细胞
2026	2025-03-04	RNA research for drug discovery: Recent advances and critical insight 2025-May-05, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149342 PMID:39983851	综述	本文探讨了RNA研究领域的最新进展及其在药物开发中的关键作用	强调了反义寡核苷酸（ASOs）、mRNA疗法和RNA干扰（RNAi）等重要发现，以及高通量测序、单细胞RNA测序和表观转录组学等技术在揭示RNA生物学复杂性方面的进展	RNA稳定性、递送和脱靶效应等挑战仍然存在，需要持续创新和伦理考量	探讨RNA研究在药物发现中的转化潜力	RNA生物学及其在治疗多种疾病中的应用	生物信息学	多种疾病	高通量测序、单细胞RNA测序、表观转录组学	NA	RNA序列数据	NA
2027	2025-03-04	Integration of single-cell RNA sequencing and network pharmacology to elucidate the effect of Yantiao Formula on alleviating ALI by regulating the polarization of alveolar macrophages 2025-Mar-13, Journal of ethnopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jep.2025.119436 PMID:39914692	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和网络药理学，探讨了炎调方（YTF）通过调节肺泡巨噬细胞极化缓解急性肺损伤（ALI）的分子机制	首次结合单细胞RNA测序、网络药理学和分子对接技术，揭示了炎调方通过调节巨噬细胞极化缓解脓毒症诱导的急性肺损伤的机制	研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未进行临床试验验证	探讨炎调方治疗脓毒症诱导的急性肺损伤的潜在分子机制	脓毒症诱导的急性肺损伤模型	数字病理学	急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、网络药理学、分子对接	NA	RNA测序数据、药理学数据	NA
2028	2025-03-04	Identification of pathogenic PD-1+CD8+ T cells for effective chimeric antigen receptor therapy in a murine model of Sjögren's disease 2025-Mar-03, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.) DOI:10.1002/art.43144 PMID:40026078	研究论文	本研究旨在识别干燥综合征（SjD）中的致病性CD8+ T细胞，并开发针对性的治疗策略	首次识别出PD-1+CD8+ T细胞在干燥综合征中的致病作用，并展示了PD-1靶向CAR-T细胞疗法在SjD模型小鼠中的疗效	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行大规模临床试验	开发针对干燥综合征中致病性CD8+ T细胞的靶向治疗策略	干燥综合征患者和小鼠模型	免疫学	干燥综合征	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、T细胞受体（TCR）分析	CAR-T细胞疗法	RNA序列数据、流式细胞术数据	干燥综合征患者和小鼠模型的样本
2029	2025-03-04	Single-cell RNA sequencing in autoimmune diseases: New insights and challenges 2025-Mar, Pharmacology & therapeutics IF:12.0Q1 DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108807 PMID:39894174	研究论文	本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在自身免疫性疾病研究中的应用及其带来的新见解和挑战	利用scRNA-seq技术揭示自身免疫性疾病中细胞异质性的详细转录组信息，推动了对疾病机制、诊断、治疗和预后的理解	scRNA-seq技术本身存在一些局限性，需要进一步解决以推动研究进展	探索scRNA-seq在自身免疫性疾病研究中的应用及其潜力	自身免疫性疾病中的细胞类型及其分子机制	生物信息学	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
2030	2025-03-04	TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling 2025-Mar-01, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05241-y PMID:40025258	研究论文	本研究探讨了TCF7在膀胱癌进展中的作用及其调控机制，发现TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路，从而促进EMT和干细胞特性	揭示了TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路的新机制，为膀胱癌的诊断、治疗和预后提供了潜在策略	TCF7在膀胱癌中的具体生物学功能和转录调控机制仍需进一步研究	研究TCF7在膀胱癌进展中的作用及其调控机制	膀胱癌	癌症研究	膀胱癌	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA
2031	2025-03-04	IL-1β and associated molecules as prognostic biomarkers linked with immune cell infiltration in colorectal cancer: an integrated statistical and machine learning approach 2025-Feb-28, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01989-3 PMID:40019680	研究论文	本研究提出了一种结合生物信息学和机器学习的框架，用于增强结直肠癌（CRC）的诊断和预后生物标志物的识别	通过整合统计和机器学习方法，识别出27个枢纽基因，并验证了IL-1β作为预后和诊断生物标志物的潜力	研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制	增强结直肠癌的诊断和预后生物标志物的识别	结直肠癌（CRC）	生物信息学	结直肠癌	甲基化差异表达基因（MeDEGs）分析、scRNA-seq分析、启动子甲基化分析	K-最近邻（KNN）、人工神经网络（ANN）、随机森林（RF）	基因表达数据、甲基化数据	使用TCGA数据集，具体样本量未明确说明
2032	2025-03-04	Immunogenic cell death signature predicts survival and reveals the role of VEGFA + Mast cells in lung adenocarcinoma 2025-Feb-28, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91401-5 PMID:40021802	研究论文	本研究通过构建免疫原性细胞死亡（ICD）相关基因签名（IRS），预测肺腺癌患者的生存期，并揭示了VEGFA+肥大细胞在肿瘤微环境中的作用	首次构建了ICD相关基因签名（IRS），并验证了其在预测免疫治疗效果中的作用，同时揭示了肥大细胞在肿瘤微环境中的促癌机制	研究主要基于已有数据集，缺乏前瞻性临床验证	探索免疫原性细胞死亡（ICD）在肺腺癌中的作用，并开发预测免疫治疗效果的生物标志物	肺腺癌患者	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	七个独立数据集
2033	2025-03-04	Complex regulation of cardiac fibrosis: insights from immune cells and signaling pathways 2025-Feb-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06260-5 PMID:40022104	综述	本文探讨了心脏纤维化过程中免疫细胞的作用及其调控机制	揭示了免疫细胞在心脏纤维化中的多面性作用，并提出了针对纤维化的免疫治疗新策略	尚不清楚免疫细胞如何具体调控纤维化过程以及不同免疫细胞亚群的具体作用	研究心脏纤维化的调控机制，特别是免疫细胞的作用	心脏纤维化过程中的免疫细胞和信号通路	NA	心血管疾病	单细胞测序、多组学分析	NA	NA	NA
2034	2025-03-04	Myelin-reactive CD8+ T cells influence conventional dendritic cell subsets towards a mature and regulatory phenotype in experimental autoimmune encephalomyelitis 2025-Feb-28, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-025-03377-8 PMID:40022134	研究论文	本文研究了在多发性硬化症（MS）小鼠模型中，髓鞘反应性CD8+ T细胞如何通过影响常规树突状细胞（cDC）亚群，诱导其成熟和调节表型，从而抑制CD4 T细胞反应和减少实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的发病机制	揭示了髓鞘反应性CD8+ T细胞通过直接与cDC1相互作用并通过旁分泌机制调节CD11b cDC，诱导成熟和调节性树突状细胞的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类多发性硬化症患者中验证	探讨髓鞘反应性CD8+ T细胞在多发性硬化症中的作用机制	小鼠模型中的髓鞘反应性CD8+ T细胞和常规树突状细胞（cDC1和CD11b cDC）	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
2035	2025-03-04	Reawakening inflammation in the chronically injured spinal cord using lipopolysaccharide induces diverse microglial states 2025-Feb-28, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-025-03379-6 PMID:40022205	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了脊髓损伤（SCI）后不同时期小胶质细胞对脂多糖（LPS）的反应，探讨了LPS如何通过改变小胶质细胞状态促进神经可塑性	首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了SCI后不同时期小胶质细胞的状态变化，并揭示了LPS注射如何改变这些状态以促进神经可塑性	研究未完全阐明LPS诱导的神经炎症如何具体促进神经可塑性，且样本量有限	探讨SCI后小胶质细胞状态变化及其在LPS诱导的神经可塑性中的作用	脊髓损伤后的小胶质细胞	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
2036	2025-03-04	LETSmix: a spatially informed and learning-based domain adaptation method for cell-type deconvolution in spatial transcriptomics 2025-Feb-28, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01442-8 PMID:40022231	研究论文	本文提出了一种名为LETSmix的空间转录组学细胞类型去卷积方法，通过整合空间相关性来提高分辨率	LETSmix通过定制的LETS滤波器整合空间相关性，利用层注释、表达相似性、图像纹理特征和空间坐标来优化空间转录组数据，并采用mixup增强的域适应策略解决ST与单细胞RNA测序数据之间的差异	NA	提高空间转录组学中细胞类型去卷积的准确性	空间转录组数据	数字病理学	NA	空间转录组学，单细胞RNA测序	LETS滤波器	空间转录组数据，单细胞RNA测序数据	多种ST平台和组织类型
2037	2025-03-04	Decoding melanoma's cellular mosaic to unlock immunotherapy potential 2025-Feb-28, Trends in cell biology IF:13.0Q1 DOI:10.1016/j.tcb.2025.01.009 PMID:40023663	review	本文综述了单细胞多组学技术在揭示皮肤黑色素瘤生物学特性及免疫治疗耐药机制中的关键作用	利用单细胞测序和空间多组学技术，深入解析了肿瘤内异质性及其对癌症进展的影响	NA	探讨单细胞多组学技术如何揭示皮肤黑色素瘤的生物学特性及免疫治疗耐药机制	皮肤黑色素瘤	digital pathology	melanoma	单细胞测序, 空间多组学技术	NA	单细胞数据, 多组学数据	NA
2038	2025-03-04	Integrative analysis reveals the multilateral inflammatory mechanisms of CD14 monocytes in gout 2025-Feb-28, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1016/j.ard.2025.01.046 PMID:40023733	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了CD14单核细胞在痛风中的多边炎症机制	首次在单细胞水平上揭示了CD14单核细胞在痛风中的分子和细胞景观，特别是缺氧和脂肪酸代谢途径的作用	样本量相对较小（8名痛风患者和6名健康对照）	阐明CD14单核细胞在痛风炎症反应中的分子和细胞机制	痛风患者和健康对照的外周血单核细胞	生物信息学	痛风	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	8名痛风患者和6名健康对照
2039	2025-03-04	Dual function of MrgprB2 receptor-dependent neural immune axis in chronic pain 2025-Feb-28, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.02.037 PMID:40024332	研究论文	本文研究了MrgprB2受体依赖的神经免疫轴在化疗药物诱导的神经性疼痛（CINP）中的双向调节作用	揭示了MrgprB2/Tryptase/PAR2轴在CINP疼痛发展和缓解中的双向作用，强调了MrgprB2作为早期干预CINP的关键靶点	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨MrgprB2介导的神经免疫相互作用在CINP中的双向调节作用	野生型小鼠、MrgprD敲除小鼠、肥大细胞缺陷小鼠、MrgprB2敲除小鼠和MrgprB2-Cre tdTomato小鼠	神经免疫学	神经性疼痛	钙成像、细胞因子抗体阵列、单细胞测序数据库挖掘、免疫荧光、Western blotting、共免疫沉淀（Co-IP）	NA	实验数据	多种基因修饰小鼠模型
2040	2025-03-04	SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data 2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.10.637514 PMID:39990434	研究论文	本文介绍了一种名为SpaceBar的细胞条形码策略，能够同时进行克隆追踪和空间转录组分析	创新点在于使用96个合成条形码序列，通过成像空间转录组学（seqFISH）进行检测，每个细胞被标记为条形码的组合，从而在复杂组织环境中区分克隆动态和环境驱动的转录调控	NA	研究目的是开发一种能够同时进行克隆追踪和空间转录组分析的方法	研究对象是黑色素瘤细胞在肿瘤异种移植模型中的克隆身份和空间基因表达	空间转录组学	黑色素瘤	seqFISH	NA	空间转录组数据	NA