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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 2021 - 2040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2021 | 2026-04-29 |
UV induces common cutaneous amyloid-like melanosomal protein aggregates
2025-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.689083
PMID:41446198
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研究论文 | 研究表明紫外线诱导黑色素细胞中α-突触核蛋白等形成类淀粉样蛋白聚集体，导致常见色素性疾病和光老化 | 发现紫外线以类朊病毒方式诱导黑色素体蛋白自传播聚集，并首次将黑色素体蛋白病与常见色素异常和光老化联系起来 | 未提及具体局限性 | 阐明紫外线诱导黑色素体蛋白聚集的机制及其在色素性疾病中的作用 | 黑色素细胞、小鼠模型、临床色素性病变样本 | 数字病理学 | 色素性疾病, 帕金森病, 光老化 | RT-QuIC, CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | 多种临床色素性病变样本、原代黑色素细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2022 | 2026-04-29 |
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106049
PMID:40889558
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研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢的变化 | 首次通过多组学（转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学）联合分析，系统描述了阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的动态变化，并利用人类单细胞RNA测序数据验证了这些变化的临床相关性 | 尚未说明具体局限性 | 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的分子动态变化及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病模型APP/PS1小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞，以及人脑样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 多组学（转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学）、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物空间分布数据、单细胞转录组数据 | APP/PS1和WT小鼠在5个时间点（2、4、6、9、12月龄）的星形胶质细胞样本；人脑单细胞核RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 2023 | 2026-04-29 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
|
综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统中其他细胞类型的动态相互作用机制 | 利用单细胞测序和体内成像等新技术，揭示了OPC在神经发育、组织稳态维持和病理微环境重塑中与多种CNS细胞群进行广泛动态相互作用的功能可塑性 | NA | 综合OPC多模式功能的现有证据，评估非成髓鞘贡献，并探讨神经再生医学的有前景治疗靶点 | 少突胶质前体细胞（OPCs）及其与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和血管内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症、脑缺血 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2024 | 2026-04-29 |
CD1d+ Goblet Cells Expand Colon-Resident Immature, Intermediate and Differentiated iNKT Cells to Limit Colitis
2025-Sep-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7603392/v1
PMID:41041542
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现，结肠中存在类似胸腺未成熟和中间前体状态的iNKT细胞群，并且CD1d+杯状细胞通过形成抗原通道扩增这些细胞以限制结肠炎 | 颠覆了结肠iNKT细胞在断奶后固定不变的经典观点，首次证明成年结肠中存在具有可塑性的iNKT细胞亚群，并揭示杯状细胞作为非传统抗原呈递细胞调控iNKT细胞扩增的新机制 | 未明确说明 | 探究结肠iNKT细胞的异质性及其在结肠炎中的调控机制 | 人类和小鼠结肠中的iNKT细胞及CD1d+杯状细胞 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠结肠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2025 | 2026-04-29 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
|
协议 | 提出了一种使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 利用变分自编码器建模单细胞RNA测序数据中的剂量依赖性化学扰动效应，实现基因表达预测 | NA | 开发并验证一种预测化学扰动后基因表达的计算协议 | 单细胞基因表达数据及剂量响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2026 | 2026-04-29 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 该研究发现线粒体ATP的模式化分布能够预测组织折叠，揭示了胚胎发育中生物能量学的空间维度 | 首次发现化学能量（ATP）在形态发生过程中呈现空间模式，并且线粒体在细胞顶端富集是多种动物保守的机制，可利用这种亚细胞模式通过计算预测组织折叠 | 未明确说明研究的局限 | 研究胚胎发育期间线粒体ATP模式和空间分布与组织折叠之间的关系 | 果蝇、小鼠、鸡胚胎的上皮细胞 | 生物信息学 | NA | 时序成像、空间转录组学、氧耗率测量 | 计算模型 | 图像、转录组数据 | 涉及果蝇、小鼠和鸡胚胎等多种模式生物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2027 | 2026-04-29 |
Macrophages drive a fibrogenic gene program of periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670195
PMID:40894696
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法，整合MERSCOPE空间转录组学、bulk RNA-seq和SomaScan蛋白质组学，揭示巨噬细胞与肝星状细胞在原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞串扰机制 | 首次采用多组学整合分析（空间转录组、批量RNA-seq和蛋白质组）系统描绘PSC中导管周围纤维化区域的细胞-细胞相互作用，并鉴定出巨噬细胞中17个纤维化驱动基因和肝星状细胞中6个效应基因 | NA | 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中导管周围纤维化的细胞串扰和分子机制 | 儿童原发性硬化性胆管炎患者肝组织和血浆样本 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、bulk RNA-seq、SomaScan蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | MERSCOPE | MERSCOPE空间转录组平台 |
| 2028 | 2026-04-29 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
|
研究论文 | 通过分析新冠感染合并肺移植患者的免疫特征，发现其RBD特异性抗体显著降低，并利用单细胞RNA测序和多重细胞因子分析揭示了特定的细胞扩增和细胞因子变化 | 首次在COVID-19相关肺损伤合并肺移植患者中全面描述免疫特征，包括RBD抗体水平、单细胞转录组和细胞因子谱的综合分析 | 样本量有限且仅关注循环血液中的免疫细胞，未涉及肺部局部免疫环境 | 探究新冠感染合并肺移植患者的免疫学特征及其与疾病进展的关系 | COVID-19相关肺损伤接受肺移植的患者、非移植新冠患者、血清阴性对照 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子表达数据 | 多项组群对比研究，具体样本量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于白细胞单细胞RNA测序 |
| 2029 | 2026-04-29 |
Senolytic treatment with fisetin reverses age-related endothelial dysfunction partially mediated by SASP factor CXCL12
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670216
PMID:40894771
|
研究论文 | 使用单细胞转录组学评估非瑟酮（fisetin）抗衰老治疗对老年小鼠主动脉内皮细胞衰老和内皮功能障碍的影响，并发现SASP因子CXCL12是部分介导年龄相关性内皮功能障碍的关键因子 | 首次通过单细胞转录组学系统鉴定老年小鼠主动脉内皮细胞中SASP因子的表达变化，并验证非瑟酮可逆转CXCL12等SASP因子的表达，从而改善内皮功能 | 该研究主要基于小鼠模型，体外实验使用人内皮细胞，但尚需在人体中验证非瑟酮的抗衰老效果及其对CXCL12的调控作用 | 探究内皮细胞衰老相关信号通路、内皮来源SASP因子及其对年龄相关性内皮功能障碍的影响，并评估非瑟酮的干预效果 | 年轻（6月龄）和老年（27月龄）小鼠主动脉内皮细胞，以及培养的人内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共4组小鼠：年轻组和老年组（各含非瑟酮处理组和对照组），每组6只（原文未明确提及具体数量，但通常每组3-5只），另用体外分离的小鼠动脉和人内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2030 | 2026-04-29 |
Dynamical systems theory as an organizing principle for single-cell biology
2025-Aug-01, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00565-3
PMID:40750599
|
评论 | 本文提出将动力系统理论作为解释单细胞生物学的组织原则，旨在为单细胞转录组数据提供可解释的因果定量分析框架 | 将动力系统理论首次系统性地应用于单细胞生物学领域，为理解基因表达异质性和细胞轨迹提供因果定量视角 | 未具体阐述该理论在复杂生物系统中的实际验证和实施细节 | 建立单细胞基因表达数据的统一理论框架，融合动力系统理论以增强数据解释能力和医疗应用潜力 | 单细胞转录组数据中的基因表达异质性和细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | NA | 动力系统模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2031 | 2026-04-29 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2025-07-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf079
PMID:40509864
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研究论文 | 通过靶向单细胞表达谱分析，鉴定调控睡眠与代谢状态整合的神经元和基因 | 首次利用靶向单细胞测序技术对单个LHLK神经元进行转录组分析，鉴定出睡眠-代谢相互作用的新调控因子 | 仅限于果蝇模型，且仅关注单个神经元类型，可能遗漏其他相关神经元或全身性调控机制 | 研究单个神经元在睡眠与代谢交互中的转录变化及功能基因 | 果蝇（Drosophila melanogaster）的侧角亮氨酸激酶（LHLK）神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序（single-cell sequencing） | NA | 基因表达数据 | 果蝇LHLK神经元（喂食状态与24小时饥饿状态对比，具体样本未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞CEL-Seq | 靶向单细胞CEL-Seq对单个LHLK神经元进行RNA分离和测序 |
| 2032 | 2026-04-29 |
Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658533
PMID:40661498
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研究论文 | 研究发现，老年小鼠伤口愈合过程中细胞衰老反应减弱且发生了质变，从有益于愈合的细胞外基质重塑转变为有害的促炎状态，导致伤口闭合延迟 | 首次揭示了衰老相关伤口愈合延迟中，伤口微环境的衰老反应不仅数量减少，而且功能发生了从有益到有害的转变，并利用单细胞RNA测序鉴定出p16/p21/Ki67阳性衰老成纤维细胞的独特亚群 | NA | 探究衰老个体皮肤伤口愈合延迟中细胞衰老反应的变化及其机制 | 幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口组织，以及人伤口组织（来自年轻捐赠者） | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 若干幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2033 | 2026-04-29 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
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研究论文 | 发现脯氨酸能够显著缓解环境浓度下环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调控TCA循环代谢通量降低细菌质子动力势，从而抑制抗生素摄取并减少耐药亚群的形成，且该效应在土壤微宇宙实验中保持了微生物群落多样性 | 基于单一模式菌株（土壤分离大肠杆菌）和短期实验（24天），对其他抗生素和菌群的普适性验证有限 | 探索氨基酸类化合物在环境层面控制抗生素耐药性进化的可行性及机理 | 土壤分离大肠杆菌及土壤微生物群落 | 机器学习 | 传染性疾病 | 转录组学、碳代谢流分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、代谢通量数据、单细胞转录组数据 | 24天进化实验（18种氨基酸筛选）、土壤微宇宙实验（1组最优剂量5 mg/kg） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA-seq分析 |
| 2034 | 2026-04-29 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
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研究论文 | 利用空间转录组学和流式细胞术研究隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构，揭示替代激活的单核细胞来源髓系细胞促进肺真菌肉芽肿中细胞外病原体持续存在的机制 | 挑战了替代激活髓系细胞是真菌内在复制生态位的传统观点，发现真菌主要存在于细胞外环境，并首次提出Th2-髓系回路形成局部免疫抑制环境驱动真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和特定真菌病原体（隐球菌），可能不完全代表人类潜伏感染的真实情况 | 阐明潜伏真菌感染中无法产生杀菌免疫的潜在机制，寻找宿主导向治疗新靶点 | 肺部真菌肉芽肿中的免疫细胞（特别是单核细胞来源髓系细胞和CD4 T辅助2细胞） | 数字病理学 | 肺真菌感染 | 空间转录组学、流式细胞术、命运图谱、小鼠遗传工具 | NA | 空间转录组数据、流式细胞术数据 | 涉及小鼠模型样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 2035 | 2026-04-29 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-05-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 首次构建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，定义其分泌细胞和免疫细胞群体 | 首次对小鼠精囊进行单细胞RNA-seq分析，揭示了该组织的主要细胞类型及其转录组特征 | 未明确说明局限性 | 理解精囊的细胞组成和功能，为精囊在生殖和后代发育中的作用提供资源 | 小鼠精囊组织 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 基因表达数据 | 23只不同年龄的小鼠，暴露于多种饮食挑战 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2036 | 2026-04-29 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-May-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小麦叶片在PEG诱导干旱胁迫下的细胞应答机制 | 首次在单细胞水平系统分析干旱不敏感与敏感小麦幼苗在PEG诱导胁迫下的细胞异质性反应，并识别出多个细胞类型特异基因及主调控转录因子 | 仅依赖于PEG模拟干旱条件，未在自然干旱环境中验证；此外，研究局限于小麦叶片组织，未涵盖根部等其他关键器官 | 研究小麦叶片在干旱胁迫下的细胞层面应答机制 | 干旱不敏感和敏感的小麦幼苗叶片 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小麦品系（干旱不敏感和敏感）的幼苗，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2037 | 2026-04-29 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 研究滑液中常驻滑膜巨噬细胞在免疫调节中的作用及其与滑膜屏障完整性的关系 | 首次在人类滑液中发现常驻滑膜巨噬细胞，并建立新的外植体模型，揭示其在炎性关节炎中上调促纤维化和促破骨信号通路 | 未提及具体局限性 | 探究滑液中常驻滑膜巨噬细胞与滑膜屏障完整性的关联及其在关节炎免疫病理中的作用 | 人类滑液中的常驻滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 关节炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2038 | 2026-04-28 |
Ongoing genome doubling shapes evolvability and immunity in ovarian cancer
2025-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09240-3
PMID:40670783
|
research paper | 探讨全基因组加倍在高级别浆液性卵巢癌中作为持续突变过程对肿瘤演化性和免疫逃逸的影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示全基因组加倍是卵巢癌中的持续性突变过程，并开发了基于突变的WGD计时方法doubleTime来解析其驱动肿瘤演化的具体模式 | 未提及具体局限性，但样本来源仅限于高级别浆液性卵巢癌患者，可能限制对其他癌症类型的推广性 | 研究全基因组加倍在肿瘤体细胞演化及免疫逃逸中的作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 | machine learning | ovarian cancer | 单细胞全基因组测序、单细胞RNA测序、高分辨率免疫荧光显微镜 | NA | 基因组数据、转录组数据、图像数据 | 来自41名患者的70个高级别浆液性卵巢癌样本（30,260个肿瘤基因组） | NA | 单细胞全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2039 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing reveals tissue-specific transcriptomic changes induced by perfluorooctanesulfonic acid (PFOS) in larval zebrafish (Danio rerio)
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137515
PMID:39947082
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析PFOS暴露对斑马鱼幼虫组织特异性转录组的影响 | 首次使用单细胞RNA-seq揭示PFOS在斑马鱼幼虫中诱导的组织特异性转录组变化，并发现消化器官、肌肉和耳石是受影响最显著的组织 | 研究局限于单一浓度（16 µM）和短期暴露（3-72小时），未测试剂量-反应关系或长期效应 | 探究全氟辛烷磺酸（PFOS）对斑马鱼幼虫发育毒性的组织特异性分子机制 | 斑马鱼幼虫（Danio rerio） | 机器学习 | 发育毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 暴露于16 µM PFOS或0.01% DMSO的斑马鱼幼虫，共检测27,698个基因，其中2,390个差异表达 | 10x Genomics | 单细胞转录组 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2040 | 2026-04-28 |
Oncogene aberrations drive medulloblastoma progression, not initiation
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08973-5
PMID:40335697
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research paper | 本研究利用单细胞技术揭示癌基因异常驱动髓母细胞瘤进展而非起始的过程 | 首次通过单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序和空间转录组学技术，证明大规模染色体畸变是早期肿瘤起始事件，而单基因癌基因事件在后期出现并呈亚克隆性 | 未提及具体限制 | 阐明癌基因异常和广泛拷贝数变异在髓母细胞瘤肿瘤进化和治疗抵抗中的作用 | 3/4组髓母细胞瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序、空间转录组学 | 群体遗传学模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 一群已知MYC、MYCN和PRDM6癌基因改变的3/4组髓母细胞瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | NA |