单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 1981 - 2000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1981 | 2025-11-21 |
The role of IRF-1 in mediating T-cell immune imbalance in systemic lupus erythematosus and the construction of a diagnostic model
2025-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2581723
PMID:41261757
|
研究论文 | 本研究探讨IRF-1在系统性红斑狼疮T细胞免疫失衡中的作用并构建诊断模型 | 首次整合单细胞转录组、批量转录组和临床样本，揭示IRF-1在SLE T细胞亚群中的动态变化并构建机器学习诊断模型 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 阐明IRF-1在系统性红斑狼疮免疫失衡中的作用并开发诊断工具 | 系统性红斑狼疮患者和对照组的T细胞亚群 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 机器学习 | 广义线性模型, 偏最小二乘法, 六种机器学习模型 | 转录组数据, 临床数据 | 1079例SLE患者和137例对照（批量转录组），70例SLE患者和58例对照（临床样本） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1982 | 2025-11-21 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了默克尔细胞癌中表皮和真皮区域的基因表达差异 | 首次在空间分辨率下展示了表皮性默克尔细胞癌的转录组特征，发现其具有角质形成细胞分化特征 | 样本数量有限，且主要关注表皮性肿瘤区域 | 探索表皮微环境对默克尔细胞癌肿瘤细胞行为的调控作用 | 默克尔细胞癌肿瘤细胞，特别是表皮性和真皮性肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 默克尔细胞癌 | 高分辨率空间转录组学，单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1983 | 2025-11-21 |
Macrophage Phospholipase D3 promotes atherosclerosis via exacerbating foam cell formation and inducing inflammatory responses
2025-Dec, International journal of cardiology. Heart & vasculature
DOI:10.1016/j.ijcha.2025.101834
PMID:41245776
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞磷脂酶D3通过加剧泡沫细胞形成和诱导炎症反应促进动脉粥样硬化的机制 | 首次系统阐明PLD3在动脉粥样硬化中的功能作用及分子机制，发现其通过CD36介导的脂质积累和NF-κB驱动的炎症反应促进疾病进展 | 研究主要基于小鼠模型和THP-1细胞系，人类样本验证相对有限 | 探究PLD3在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠模型、THP-1源性巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blotting、慢病毒介导的基因敲降、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠、THP-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1984 | 2025-11-21 |
YAP/TAZ deletion in vascular smooth muscle cells mirrors atherosclerosis-associated transcriptional programs
2025-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2025.100487
PMID:41246212
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研究论文 | 本研究通过血管平滑肌细胞特异性缺失YAP/TAZ，揭示其转录程序与动脉粥样硬化发展的相似性 | 首次证明YAP/TAZ缺失诱导的VSMC转录变化能重现动脉粥样硬化关键特征，并鉴定出19个保守的YAP-TEAD靶基因 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究YAP/TAZ缺失对血管平滑肌细胞表型的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 转录组学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-seq, 启动子基序分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠VSMC样本（2周和8周YAP/TAZ缺失时间点） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1985 | 2025-11-21 |
CD9 antibody enhances the anti-leukemia efficacy of γδT cells in adult B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113752
PMID:41244573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定B细胞急性淋巴细胞白血病中的侵袭性preB_CD9+亚群，并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞的抗白血病疗效 | 首次发现CD9在B-ALL复发患者中高表达，并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞对CD9高表达白血病细胞的杀伤作用 | 样本量较小（10个样本），需要更大规模研究验证 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病的肿瘤微环境特征及免疫治疗新策略 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者样本和健康志愿者样本 | 单细胞测序分析 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个样本（3例复发患者，3例新诊断患者，4例健康志愿者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1986 | 2025-11-21 |
IGFBP7 and CCT2 are novel lactylation-driven mediators of endothelial-to-mesenchymal transition in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Nov-20, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01761-4
PMID:41261179
|
研究论文 | 本研究系统探讨了乳酸化修饰在特发性肺纤维化中的作用机制，发现IGFBP7和CCT2是乳酸化驱动的内皮-间质转化的新型介质 | 首次系统研究乳酸化在IPF中的作用，鉴定出IGFBP7和CCT2两个新的乳酸化特征基因，并揭示TGF-β通过代谢重编程促进乳酸化介导的内皮-间质转化机制 | NA | 探究乳酸化修饰在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者和健康人群的样本，血管内皮细胞 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞测序，bulk RNA测序，机器学习算法，Cox回归分析，孟德尔随机化，RNA干扰，伤口愈合实验 | 多种机器学习算法，Cox回归模型 | 基因表达数据，单细胞数据 | IPF患者和健康人群样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1987 | 2025-11-21 |
An easy and reproducible method for rapid tissue macroarray block construction
2025-Nov-20, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04326-9
PMID:41261245
|
研究论文 | 提出一种快速构建组织大阵列块的新方法，确保精确的组织定向且无需专用仪器 | 开发了使用海绵作为支架的快速组织大阵列构建技术，将处理时间减少10倍并解决组织定向难题 | 未提及方法验证的样本规模或与其他方法的直接比较数据 | 改进组织大阵列构建技术，提高病理诊断和研究效率 | 石蜡包埋组织样本 | 数字病理学 | NA | 组织大阵列构建技术 | NA | 组织样本 | 每个大阵列包含9-48个组织核心 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1988 | 2025-11-21 |
NONCODE v7.0: updated lncRNA resource integrating scRNA-seq data encompassing immune baseline, development, and disease
2025-Nov-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1132
PMID:41261731
|
研究论文 | NONCODE v7.0数据库通过整合单细胞RNA测序数据更新了长链非编码RNA资源 | 首次整合2061个人类单细胞RNA测序样本，涵盖免疫基线、生理发育和病理疾病三大核心类别，并提供单细胞定制的功能模块 | 数据库主要基于现有公开数据集，可能未覆盖所有组织类型和疾病状态 | 构建一个系统分析长链非编码RNA表达的综合数据库平台 | 人类长链非编码RNA及其在单细胞水平的表达特征 | 生物信息学 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 2061个人类单细胞RNA测序样本，来自229个数据集，包含1400万个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1989 | 2025-11-21 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2025-Nov-20, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
|
研究论文 | 本研究探讨内皮细胞CEPT1通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用机制 | 首次揭示CEPT1通过调控PPARα-VEGF-A信号轴促进糖尿病条件下缺血后血管生成和恢复的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限 | 阐明CEPT1在糖尿病相关外周动脉疾病中促进血管生成的作用机制 | 人类外周动脉疾病患者样本、内皮细胞特异性Cept1过表达转基因小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学 | 外周动脉疾病、糖尿病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 条件性基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者外周动脉样本、C57BL/6J转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1990 | 2025-11-21 |
Lung Microphysiological System Validates Novel Cell Therapy for Acute Respiratory Distress Syndrome
2025-Nov-20, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500225
PMID:41263118
|
研究论文 | 本研究通过新型肺微生理系统评估人脐带血来源间充质干细胞对急性呼吸窘迫综合征的治疗潜力 | 开发了模拟ARDS肺环境的新型微生理系统，首次比较hUCB-pMSCs与地塞米松的治疗效果并发现其激活血管生成通路的新机制 | 微生理系统可能无法完全模拟体内复杂环境，研究样本规模有限 | 评估hUCB-pMSCs作为ARDS替代疗法的疗效 | 人脐带血来源间充质干细胞(hUCB-pMSCs)和地塞米松 | 生物医学工程 | 急性呼吸窘迫综合征 | 荧光成像，单细胞RNA测序 | 微生理系统(MPS) | 图像，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1991 | 2025-11-21 |
Multiplexed RNA imaging and in situ profiling in living cells
2025-Nov-19, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06220a
PMID:41210282
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综述 | 本文探讨活细胞多重RNA成像技术及其与固定细胞空间转录组学方法的比较 | 开发了能够在活细胞中进行多重RNA成像的先进荧光探针技术，实现RNA定位、相互作用和浓度变化的实时监测 | 传统空间转录组学方法需要细胞固定和透化，只能提供静态快照 | 推进时空RNA分析技术，追踪RNA动态变化并揭示多种RNA物种间的时间关系 | 活细胞中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 多重RNA成像，荧光原位杂交，测序 | NA | RNA图像，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA分析 | NA | NA |
| 1992 | 2025-11-21 |
Targeting the origins of multiple myeloma along hematopoietic stem cell lymphoid lineage differentiation
2025-Nov-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu0114
PMID:41259534
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序追踪多发性骨髓瘤在B细胞谱系分化过程中的恶性转化机制 | 首次在B细胞分化过程中识别了1q扩增和17p缺失的起源阶段，并发现FCRL5通过IRF4/SPI1复合物驱动恶性转化 | 未明确说明样本规模和实验设计的局限性 | 探索多发性骨髓瘤起始细胞的恶性转化机制和驱动基因 | 多发性骨髓瘤患者的造血干细胞至淋巴谱系分化各阶段细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序, 遗传示踪分析 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1993 | 2025-11-21 |
Integrated transcriptome profiling of plasma exosomes reveals molecular stratification of exocrine and endocrine disorders and S100A8-mediated cell interactions in chronic pancreatitis
2025-Nov-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00832-x
PMID:41249153
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研究论文 | 通过血浆外泌体转录组测序建立慢性胰腺炎分子分型系统并揭示miR-24-3p/S100A8轴在疾病进展中的作用机制 | 首次建立基于血浆外泌体12个miRNA表达的3阶段分型系统，并发现外泌体miR-24-3p通过调控中性粒细胞S100A8影响胰腺星状细胞纤维化和巨噬细胞炎症的新机制 | 分型系统仅完成初步验证，需要更大样本量的前瞻性研究确认临床适用性 | 开发慢性胰腺炎外分泌和内分泌功能障碍的分子分型方法并探索其发病机制 | 慢性胰腺炎患者血浆外泌体、胰腺病变组织、CP小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性胰腺炎 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞测序数据 | CP患者队列和外部验证队列 | NA | 外泌体转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1994 | 2025-11-21 |
Butyrate modifies epigenetic and immune pathways in peripheral mononuclear cells from children with neurodevelopmental disorders associated with chromatin dysregulation
2025-Nov-18, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00792
PMID:41260988
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研究论文 | 本研究探讨了丁酸盐对染色质相关神经发育障碍儿童外周血单核细胞表观遗传和免疫通路的调控作用 | 首次在染色质相关神经发育障碍中鉴定出共同的核糖体-免疫RNA特征，并证明丁酸盐能逆转这些异常通路 | 样本量较小（总样本数21，单细胞测序仅6个样本），且仅针对外周血细胞进行研究 | 研究丁酸盐作为组蛋白去乙酰化酶抑制剂对神经发育障碍的治疗潜力 | 染色质相关神经发育障碍儿童（Kabuki综合征、CHARGE综合征、Rett综合征）和非单基因诊断神经发育障碍儿童的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 神经发育障碍 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 总样本21个（患者19个，对照2个），单细胞测序101,539个外周免疫细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1995 | 2025-11-21 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
|
研究论文 | 本研究揭示E-钙黏蛋白缺失通过上皮细胞内在机制和上皮-免疫互导导致气道重塑和哮喘样表型 | 首次发现E-钙黏蛋白在气道上皮祖细胞中的特异性缺失可诱发无需过敏原暴露的哮喘样表型，并识别出上皮细胞感知连接破坏并启动免疫防御的内在能力 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究E-钙黏蛋白在气道细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮细胞（特别是club细胞和纤毛细胞） | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1996 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术揭示了机械应力驱动的杨树木材异质性发育机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学和磷酸化蛋白质组学，系统解析了张力木形成的细胞类型、谱系关系和分子调控网络 | 研究主要聚焦于杨树特定发育阶段，在其他树种或发育时期的普适性有待验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞异质性发育机制 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材的木质部组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 代谢物数据, 蛋白质磷酸化数据 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1997 | 2025-11-21 |
Single-cell transcriptomics identifies chondrocyte differentiation dynamics in vivo and in vitro
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.031
PMID:40712580
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析体内外软骨细胞分化动态，建立评估和优化体外软骨生成方案的框架 | 首次结合胚胎长骨单细胞RNA测序数据与公共数据构建软骨内骨化图谱，并通过轨迹比对揭示体外分化中的脱靶现象 | 研究主要基于人类胚胎干细胞模型，尚未在更多细胞类型或临床样本中验证 | 优化体外软骨生成方案以更好地模拟体内发育过程 | 胚胎长骨组织、人类胚胎干细胞分化细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序(snRNA-seq) | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 胚胎长骨样本及公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1998 | 2025-11-21 |
Single-cell mapping reveals age-related alterations in periosteal progenitor cells and immune microenvironment
2025-Nov-17, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00263-9
PMID:41247564
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制了小鼠骨膜衰老过程中的细胞图谱，揭示了祖细胞和免疫微环境的年龄相关变化 | 首次在单细胞水平系统描绘骨膜衰老过程，发现不同祖细胞亚群具有独特的衰老轨迹，并揭示祖细胞-免疫细胞相互作用在骨稳态中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究骨膜衰老的细胞和分子机制 | 3月、9月和18月龄小鼠的骨膜组织 | 单细胞生物学 | 骨骼老化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个年龄组的小鼠骨膜样本（3月、9月、18月龄） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1999 | 2025-11-21 |
Breast cancer remodels lymphatics in sentinel lymph nodes
2025-Nov-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64981-z
PMID:41249124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析乳腺癌患者前哨淋巴结中淋巴管内皮细胞亚群的重塑过程 | 首次在人类乳腺癌样本中揭示肿瘤转移导致淋巴结淋巴管内皮细胞亚群重塑，并发现MGP基因在转移过程中的关键作用 | 研究仅限于初治乳腺癌女性患者，样本来源相对单一 | 探究乳腺癌转移对前哨淋巴结淋巴管内皮细胞的影响机制 | 乳腺癌女性患者的配对转移和非转移前哨淋巴结 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 乳腺癌患者配对的转移和非转移前哨淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2000 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial dissection of necroptosis spatiotemporal evolution driving lymph node metastasis in gastric cancer
2025-Nov-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02815-z
PMID:41249133
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞异质性和坏死性凋亡的时空演化机制 | 首次整合单细胞和空间分析技术揭示胃癌淋巴结转移过程中坏死性凋亡的时空演化特征，发现CHMP3基因和MDK-NCL信号通路在转移中的关键作用 | 样本量较小（仅4例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究胃癌淋巴结转移的驱动机制和肿瘤微环境异质性 | 胃癌患者原发肿瘤和配对转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 | 伪时序分析 | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 4例胃癌患者（4个原发肿瘤和2个配对转移淋巴结） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |