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当前共找到 10349 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2025-12-16
Integrated multi-omics elucidates PRNP knockdown-mediated chemosensitization to gemcitabine in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,系统探讨了胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制,并鉴定出朊病毒蛋白基因PRNP为关键耐药基因 首次整合多组学数据(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)并结合机器学习算法,系统揭示了PRNP通过双重通路(促进上皮-间质转化和抑制铁死亡)驱动吉西他滨耐药,并发现PRNP在化疗后特定癌症相关成纤维细胞亚群中富集,与免疫抑制肿瘤微环境的建立相关 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,临床验证尚不充分;耐药机制的具体信号通路细节有待进一步阐明 系统研究胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制,并识别新的治疗靶点 胰腺导管腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据 机器学习 胰腺癌 微阵列、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 机器学习算法 多组学数据 胰腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
182 2025-12-16
Single-cell transcriptomics reveals pathogen interactions and T cell reprogramming in HIV and Mycobacterium tuberculosis co-infection
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV和结核分枝杆菌共感染中的病原体相互作用及T细胞重编程机制 通过单细胞RNA测序结合有向无环图伪时间轨迹分析,首次系统描绘了从健康到HIV感染再到共感染的免疫细胞动态变化,并识别了Th1/Th17失衡和MHC-I偏向的T细胞信号重编程作为潜在干预靶点 研究样本来源于未治疗初诊患者,可能无法反映长期或治疗后的免疫状态变化,且仅关注外周血单个核细胞,未涉及组织特异性免疫反应 探究HIV和结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用机制及宿主免疫重塑过程 健康对照、HIV单感染和HIV-Mtb共感染初诊患者的未治疗外周血单个核细胞 数字病理学 艾滋病 单细胞RNA测序 有向无环图伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 健康对照、HIV单感染和HIV-Mtb共感染初诊患者的未治疗外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
183 2025-12-16
Mechanistic Study of CD90-Positive Synovial Fibroblasts in the Invasion and Recurrence of Pigmented Villonodular Synovitis
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合RNA测序和微阵列数据分析色素沉着绒毛结节性滑膜炎(PVNS)的转录组,揭示了CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞在滑膜侵袭和骨吸收中的关键作用 首次结合scRNA-seq数据识别了PVNS滑膜中的16个细胞亚群,并突出了CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞在炎症因子分泌、骨降解和侵袭特性中的新角色 研究主要基于公共数据集和体外实验,未来需要体内实验和临床样本验证这些细胞作为治疗靶点的潜力 探究PVNS的发病机制,特别是CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞在疾病侵袭和复发中的作用 色素沉着绒毛结节性滑膜炎(PVNS)和骨关节炎(OA)的滑膜组织 数字病理学 色素沉着绒毛结节性滑膜炎 RNA-seq, 微阵列, scRNA-seq, 免疫组织化学染色, 免疫荧光染色, Western blot, 流式细胞术, transwell迁移和侵袭实验, 伤口愈合实验 NA 基因表达谱数据, 单细胞RNA测序数据 来自GSE3698、GSE175626和GSE176133数据集的PVNS和OA滑膜样本 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
184 2025-12-16
Machine Learning and Mendelian Randomization Identify Allergic Rhinitis as Nasopharyngeal Carcinoma Risk Factor With Validated Potential Candidate Biomarkers
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究结合单细胞转录组学与孟德尔随机化方法,揭示了过敏性鼻炎与鼻咽癌之间的因果关系及潜在分子机制 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统解析鼻咽癌的细胞异质性并验证过敏性鼻炎作为风险因素的因果关联 样本量相对有限,且主要基于遗传变异分析,需要进一步实验验证分子机制 探究过敏性鼻炎与鼻咽癌发病之间的因果关系及分子通路 鼻咽癌组织样本及相邻正常组织 数字病理学 鼻咽癌 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析 NA 单细胞转录组数据,遗传变异数据 未明确具体数量,但涉及NPC及正常组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
185 2025-12-16
A Multi-Faceted Approach to Explore the Role of Inflammatory CAFs, Providing Prognostic Value and Therapeutic Implications in Lung Adenocarcinoma
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合公共数据库的批量RNA数据和单细胞RNA测序数据,识别了肺腺癌中的炎性癌症相关成纤维细胞亚群,并构建了一个基于iCAF特征的预后标志物,用于预测患者预后、免疫景观和治疗反应 首次在肺腺癌中系统性地识别并表征了炎性癌症相关成纤维细胞亚群,并利用多算法机器学习构建了一个新的预后标志物,同时通过功能实验验证了关键基因PFN2的促癌作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证;功能实验仅在细胞系中进行,缺乏体内模型验证 阐明肺腺癌中炎性癌症相关成纤维细胞的特性及其临床意义,并开发有效的预后预测工具 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的炎性癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 机器学习算法 RNA测序数据 来自多个公共数据库的肺腺癌患者队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
186 2025-12-16
Single-Cell Profiling Identifies Reward Behavior-Related Neurons and Alterations in the Ventral Tegmental Area Based on Arvcf-Knockout Mouse Model
2025, Research (Washington, D.C.)
研究论文 本研究基于Arvcf基因敲除小鼠模型,通过单细胞转录组学等技术,识别了腹侧被盖区中与奖赏行为相关的神经元亚群及其在尼古丁诱导奖赏中的作用 首次在单细胞分辨率下揭示了Arvcf基因敲除对腹侧被盖区神经元亚群的影响,并发现了一种与奖赏行为显著相关的谷氨酸能-多巴胺能组合神经元亚群 研究基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞类型或低表达基因 探究Arvcf基因在腹侧被盖区神经元多样性及奖赏行为相关细胞亚群中的作用机制 野生型和Arvcf基因敲除小鼠的腹侧被盖区组织,涉及尼古丁暴露处理 数字病理学 成瘾行为 单核RNA测序(snRNA-seq),神经蛋白质组学,多重免疫荧光成像,代谢物检测 小鼠基因敲除模型 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,成像数据 96,240个细胞,来自野生型和Arvcf基因敲除小鼠,有或无尼古丁处理 NA 单细胞RNA-seq NA NA
187 2025-12-15
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了APOBEC3家族成员(特别是APOBEC3A)通过IL-1α/AP-1信号通路促进膀胱尿路上皮癌的鳞状分化和肿瘤进展 首次建立了结合Pten/Trp53条件性敲除和Apobec3过表达的基因工程小鼠模型(UPPA),并系统阐明了APOBEC3通过IL-1α/AP-1信号轴驱动鳞状分化的分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证仍需扩大;IL-1α靶向治疗在膀胱癌中的具体疗效尚未进行临床前或临床试验评估 探究APOBEC3在膀胱尿路上皮癌发生发展中的生物学功能及其促进鳞状分化的分子机制 膀胱尿路上皮癌(UC) 肿瘤生物学 膀胱癌 bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 基因工程小鼠模型(UPPA) RNA-seq数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 UPPA小鼠膀胱肿瘤样本及人类UC样本(具体数量未明确说明) NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
188 2025-12-15
Ferroptosis inhibition protects against α-synuclein-related neuronal cell death
2025-Dec-14, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了铁死亡在帕金森病(PD)α-突触核蛋白(α-syn)相关神经元死亡中的作用,并通过体外模型和线虫模型验证了铁死亡抑制剂的保护效果 首次在人类PD患者死后脑组织中系统评估了多个铁死亡相关标志物的表达,并结合数字空间转录组学揭示了PD中铁死亡易感性增加的基因表达特征,同时通过多模型验证了α-syn与铁死亡通路之间的相互作用 铁死亡易感性存在细胞和模型依赖性,提示有效治疗策略可能需要更全面的方法,针对通路的多个方面并考虑干预时机 探究铁死亡在帕金森病α-突触核蛋白相关神经元死亡中的作用,并评估铁死亡抑制的神经保护潜力 帕金森病患者死后中脑组织、LUHMES神经元、小鼠皮层神经元(PCNs)、过表达α-syn的线虫模型 神经科学, 分子病理学 帕金森病 数字空间转录组学, 免疫组织化学, 体外细胞模型, 线虫模型 NA 组织样本, 基因表达数据, 细胞成像数据 10名PD患者和11名年龄匹配对照的死后中脑组织 NA 空间转录组学 NA NA
189 2025-12-15
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2025-Dec-13, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究探讨了克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制,揭示了circPLCE1/XYLB/Xu5P轴在调节磷酸戊糖途径和纤维生成中的作用 首次通过多层整合分析发现成纤维细胞中磷酸戊糖途径在克罗恩病肠道纤维化中的激活,并揭示了circPLCE1通过直接结合XYLB抑制其酶活性来调控该途径的新机制 研究主要基于体外细胞模型和动物模型,人类样本验证相对有限,且未探讨其他潜在调控因子或信号通路 探索克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制 人类肠道成纤维细胞、小鼠肠道纤维化模型、配对黏膜和黏膜下组织 数字病理学 克罗恩病 代谢组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、circRNA转录组学、代谢通量分析、Seahorse分析、RNA pull-down实验 NA 代谢组数据、转录组数据、空间转录组数据、circRNA数据 配对狭窄和非狭窄肠道段组织、原代人肠道肌成纤维细胞、葡聚糖硫酸钠诱导的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
190 2025-12-15
CD177 + neutrophils drive extracellular matrix remodelling and HGF-alpha release in ALPPS-induced liver regeneration
2025-Dec-13, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了在ALPPS手术诱导的肝脏再生过程中,CD177+中性粒细胞通过促进内皮细胞迁移、细胞外基质降解和HGF-α释放来驱动肝脏再生的免疫学机制 首次在单细胞水平上阐明了CD177+中性粒细胞亚群在ALPPS诱导的肝脏再生中的关键作用,并发现了其通过CD177-PECAM1相互作用促进内皮迁移以及通过分泌MMP9介导ECM降解和HGF-α释放的新机制 研究主要基于临床样本和小鼠模型,虽然样本量较大,但人类样本的异质性可能影响结果的普适性;CD177+中性粒细胞输注的治疗潜力仍需进一步临床验证 阐明ALPPS手术后肝脏再生的免疫学机制,特别是中性粒细胞在其中的作用 ALPPS患者的残余肝组织、小鼠ALPPS模型、CD177+中性粒细胞、内皮细胞、肝星状细胞 单细胞组学与空间转录组学 肝脏肿瘤与肝脏再生 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、流式细胞术、组织学分析、基因敲除、细胞输注 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据 世界最大的ALPPS临床队列患者样本及小鼠ALPPS模型 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
191 2025-12-15
Deciphering the gonadal cell atlas of Monopterus albus and cell fate during sex reversal based on single-cell RNA sequencing
2025-Dec-13, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了黄鳝性腺细胞图谱,揭示了性逆转过程中生殖细胞和体细胞的命运决定机制 首次在黄鳝中利用单细胞RNA测序技术全面解析性逆转过程中的性腺细胞动态,识别了具有双潜能分化能力的生殖干细胞亚群,并揭示了体细胞(如鞘细胞、间质细胞)在性逆转中的起源和功能转变 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本可能受个体差异影响;未深入探讨环境因素对性逆转的调控 解析黄鳝性逆转过程中生殖干细胞起源及体细胞角色,为脊椎动物性逆转和性发育障碍提供新见解 黄鳝的卵巢、卵睾和睾丸组织 单细胞组学 性发育障碍 单细胞RNA测序,RNA荧光原位杂交 NA 单细胞转录组数据,图像数据 卵巢、卵睾和睾丸组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
192 2025-12-15
Caspase 6 deficiency exacerbates inflammatory bowel disease via enterocyte necroptosis and bacterial translocation
2025-Dec-13, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了Caspase 6在炎症性肠病中的作用机制,发现其缺失会通过上调IECs中的RIPK1激活坏死性凋亡通路,并损害巨噬细胞的细菌清除能力 首次阐明Caspase 6通过调控肠上皮细胞坏死性凋亡和巨噬细胞杀菌功能在IBD中的保护作用,并发现其作用依赖于组织蛋白酶L 研究主要基于小鼠模型,在人体中的直接验证尚不充分;具体分子调控网络有待进一步解析 探究Caspase 6在炎症性肠病发生发展中的作用机制 IBD患者结肠组织、DSS诱导的IBD小鼠模型(全身性敲除和肠上皮细胞特异性敲除) 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
193 2025-12-15
Lipid accumulation in foam cells drives C1q-dependent synaptic loss and impairs motor function recovery after spinal cord injury
2025-Dec-13, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脊髓损伤后巨噬细胞亚群,特别是脂质负载的泡沫细胞,通过C1q依赖的突触吞噬导致突触丢失并阻碍运动功能恢复 首次建立了脂质代谢与C1q依赖性突触损伤之间的新联系,并识别出巴泽多昔芬作为潜在治疗候选物以减轻脂滴积累 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证;机制细节如C1q表达调控需深入探索 探究脊髓损伤后巨噬细胞功能机制及其对功能恢复的影响 脊髓损伤小鼠模型中的巨噬细胞亚群,特别是泡沫细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序,高内涵筛选 NA RNA测序数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
194 2025-12-15
ViTrace detects viral signatures in tumor transcriptomes using a hybrid language model
2025-Dec-13, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究开发了一种名为ViTrace的混合语言表示学习模型,用于从人类转录组数据中检测病毒序列 提出了一种基于混合语言表示学习的新方法,整合了DNA上下文、位置关系和氨基酸编码信息,克服了传统序列比对方法在病毒快速突变、高度分化和基因组不完整情况下的性能限制 模型仅基于7个属的13个物种进行训练,训练数据覆盖范围有限 开发一种能够从肿瘤转录组中准确识别病毒序列的工具,以揭示病毒在肿瘤发生和发展中的潜在作用 人类肿瘤转录组数据,特别是食管和口咽鳞状细胞癌的单细胞RNA-seq数据 自然语言处理 食管癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 混合语言表示学习模型 转录组序列数据 训练集:7个属的13个物种;测试集:10个门的167个属的935个物种的1179个病毒株 NA 单细胞RNA-seq NA NA
195 2025-12-15
SpatialRNA: a Python package for easy application of Graph Neural Network models on single-molecule spatial transcriptomics dataset
2025-Dec-13, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一个名为SpatialRNA的Python包,用于在单分子空间转录组学数据上轻松应用图神经网络模型 开发了一个高度可扩展的工具,能够从组织样本中轻松生成(子)图,并提供了在PyG框架下方便高效应用图神经网络模型的全面教程 未在摘要中明确提及 旨在促进图神经网络模型在单分子空间转录组学数据上的应用,以全面分割组织空间域并辅助生物学解释 单分子空间转录组学数据集 空间转录组学 NA 图像空间转录组学 图神经网络 空间转录组学数据 NA NA 单分子空间转录组学 NA NA
196 2025-12-15
Untangling the fusion of spatial omics and mechanobiology
2025-Dec-12, Progress in biomedical engineering (Bristol, England)
综述 本文探讨了空间转录组学与力学生物学的融合,提出了一种名为空间机械转录组学的整合平台,用于研究细胞物理特性与转录谱之间的关系 首次提出将空间转录组学与力学生物学数据整合在同一细胞中,创建空间机械转录组学平台,以关联细胞机械特性与转录差异 未提及具体实验验证或技术实施细节,目前仍处于概念探索阶段 探索整合空间转录组学和力学生物学数据,以预测疾病状态并推动精准诊断 细胞(特别是其物理特性和转录谱) 空间转录组学 肌肉萎缩症、癌症、青光眼等 空间转录组学、力学生物学测量 NA 空间转录组数据、机械数据(如细胞膜硬度) NA NA 空间转录组学 NA NA
197 2025-12-15
Immune cell uptake of glycinated nanoparticles conjugated to anti-fibrotic peptides enables their prolonged activity and oral administration
2025-Dec-12, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本研究开发了一种结合甘氨酸功能化可生物降解纳米颗粒与抗纤维化肽的递送平台,以实现肽类药物的口服给药和延长活性 首次将松弛素及其类似物与甘氨酸功能化的超顺磁性氧化铁纳米颗粒结合,通过口服给药实现抗纤维化疗效,并利用单细胞转录组学揭示了其被树突状细胞摄取的机制 研究仅在心肌病小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;长期安全性和免疫原性未充分评估 开发一种口服给药的抗纤维化肽类药物递送系统,以替代传统的注射给药方式 心肌病小鼠模型、松弛素(RLX)及其类似物B7-33、甘氨酸功能化超顺磁性氧化铁纳米颗粒(SPIONs) NA 心血管疾病 单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
198 2025-12-15
DOCK10 Regulates Insulin Hypersecretion in Insulinoma and Serves as a Diagnostic and Therapeutic Target
2025-Dec-11, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过建立胰岛素瘤生物样本库和类器官模型,识别出DOCK10基因在胰岛素分泌成分中特异性过表达,并验证其通过DOCK10-Cdc42轴调控胰岛素高分泌,为胰岛素瘤的诊断和治疗提供了新靶点 首次发现DOCK10基因在胰岛素瘤胰岛素分泌成分中特异性过表达,并揭示DOCK10-Cdc42轴在调控胰岛素高分泌中的新作用机制 NA 识别胰岛素瘤中胰岛素高分泌的分子机制,以改进诊断工具和治疗策略 人类胰岛素瘤手术标本、匹配的类器官、MIN6细胞和小鼠异种移植模型 数字病理学 胰腺神经内分泌肿瘤(胰岛素瘤) RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫组织化学 NA 转录组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
199 2025-12-15
CD44-mediated copper accumulation drives Ly6Chi macrophages activation in ulcerative colitis
2025-Dec-11, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了在溃疡性结肠炎中,CD44介导的铜积累驱动Ly6Chi巨噬细胞活化的关键机制 首次阐明CD44通过调控铜积累和ATP7A表达来激活Ly6Chi巨噬细胞,为溃疡性结肠炎的炎症发病机制提供了新见解 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证不足,且具体信号通路细节有待进一步探索 阐明CD44介导的铜积累在驱动溃疡性结肠炎中Ly6Chi巨噬细胞活化中的作用 Ly6Chi巨噬细胞、溃疡性结肠炎小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 数字病理学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 基于公共数据集GSE264408和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
200 2025-12-15
Apoferritin-conjugated melanin nanoparticles rescue photoreceptor degeneration via dual iron chelation and ROS scavenging in dry AMD therapy
2025-Dec-11, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一种结合载铁蛋白和黑色素纳米颗粒的生物仿生纳米颗粒AFn-MNP,用于治疗干性年龄相关性黄斑变性,通过铁螯合和活性氧清除机制挽救光感受器退化 首次将载铁蛋白与黑色素纳米颗粒结合,构建了具有双重铁螯合和抗氧化活性的纳米颗粒,并基于单细胞转录组分析揭示了光感受器铁死亡在疾病进展中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且长期安全性和疗效需进一步评估 开发一种针对干性年龄相关性黄斑变性的新型治疗方法,通过靶向铁死亡和氧化应激机制 视网膜组织,特别是光感受器细胞,以及NaIO诱导的氧化损伤模型小鼠 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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