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当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-09-20 |
Gene Regulatory Network Inference from Pseudotime-Ordered scRNA-seq Data via Time-Lagged Divergence Measures
2025-Sep, Bioinformatics research and applications : ... international symposium, ISBRA ... proceedings. ISBRA (Conference)
DOI:10.1145/3774976.3774995
PMID:41488124
|
研究论文 | 提出PseudoGRN框架，通过整合多种伪时间推断方法和时滞散度度量，从时间序列scRNA-seq数据中推断有向基因调控网络 | 首次统一多种伪时间推断方法、不同时滞散度度量、非冗余惩罚网络推断和偏相关分析，构建从时间序列scRNA-seq数据重建有向GRN的集成框架 | 数据时间分辨率稀疏、高维性和细胞异质性可能影响推断性能，仅在一个真实数据集上验证 | 从时间序列单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 时间序列scRNA-seq数据中的细胞和基因 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2026-09-20 |
Identifying Combinatorial Regulatory Genes for Cell Fate Decision via Reparameterizable Subset Explanations
2025-Aug, KDD : proceedings. International Conference on Knowledge Discovery & Data Mining
DOI:10.1145/3711896.3737000
PMID:41426294
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研究论文 | 本文提出MetaVelo，一种全局特征解释框架，用于识别影响细胞命运转换的关键调控基因集 | 将细胞命运转换建模为黑盒函数，采用可微分神经常微分方程（ODE）代理模型实现高效优化，通过重参数化问题为可控数据生成过程，克服细胞命运动态不可微的挑战 | 未明确提及 | 识别组合调控基因以理解细胞命运决定 | 细胞命运转换、调控基因集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程（Neural ODE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2026-09-20 |
Apoptosis inhibition reprograms alveolar myofibroblasts toward ductal myofibroblasts
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.26.654588
PMID:40492191
|
研究论文 | 通过抑制肺泡肌成纤维细胞凋亡，发现其可重编程为导管肌成纤维细胞，并揭示其命运可塑性和病理生理汇聚 | 首次通过诱导性BCL2过表达小鼠等位基因抑制AMF凋亡，证明AMF经凋亡清除，并发现其可成熟为DMF | 研究基于小鼠模型，结论是否适用于人类肺部发育和疾病尚需验证 | 探究肺泡肌成纤维细胞的凋亡清除及其命运可塑性 | 小鼠肺泡肌成纤维细胞、导管肌成纤维细胞及气道平滑肌细胞 | 单细胞转录组学、发育生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 184 | 2026-09-20 |
Time-Varying Gene Regulatory Networks Inference Using KL Divergence from Single Cell Data
2025-May, Proceedings of the ... International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology
DOI:10.1109/icbbt65815.2025.11276344
PMID:41488127
|
研究论文 | 提出一个结合KL散度时间变异度量、自回归模型和正则化方法从时间序列单细胞RNA测序数据推断时变基因调控网络的框架，并通过仿真和THP-1数据验证 | 将KL散度用于时间变异度量，与自回归模型及不同正则化方法结合，并利用偏相关分析细化相互作用符号，以推断时变调控网络 | 仅在10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集上验证，尚未在更大规模或更多真实生物学数据集上评估 | 从时间序列单细胞RNA测序数据中准确重建动态基因调控网络，以理解生物过程 | 时间序列scRNA-seq数据、基因调控网络、THP-1单核细胞分化过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自回归模型 | 基因表达数据 | 10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2026-09-20 |
Adipose-derived leptin and complement factor D mediate osteoarthritis severity and pain
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt5915
PMID:40279436
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研究论文 | 该研究利用脂肪萎缩小鼠模型、脂肪垫植入、异时联体共生及空间转录组学等方法，揭示脂肪分泌的瘦素和补体因子D介导骨关节炎严重程度与疼痛的机制 | 首次证明脂肪分泌因子是膝骨关节炎发生所必需的，揭示了脂肪-关节之间的交叉对话，并通过无监督多组学分析发现瘦素通过调控adipsin（补体因子D）活性来调节骨关节炎结构和疼痛表型 | 研究主要基于小鼠模型，脂肪-关节交叉对话的具体分子机制尚未完全阐明，瘦素和补体因子D在人类骨关节炎中的转化应用仍需进一步验证 | 探究瘦素在骨关节炎严重程度和疼痛中的具体作用，以及脂肪组织与关节之间的相互作用机制 | 脂肪萎缩小鼠、野生型小鼠的脂肪垫组织及骨关节炎模型 | 机器学习, 空间转录组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 图像, 文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 186 | 2026-09-20 |
Deciphering the generation of heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma metastasis via single-cell multiomics analysis
2025-02-04, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06154-6
PMID:39905485
|
研究论文 | 通过对食管鳞状细胞癌患者的癌与癌旁组织进行单细胞ATAC测序，并结合多种组学数据，揭示了染色质可及性在ESCC转移过程中驱动细胞异质性的分子机制 | 首次在单细胞水平上对四个不同病理分期（T1a、T2b、T3b、T4a）的ESCC患者进行scATAC-seq分析，并结合55个scRNA-seq数据集及ChIP-seq、CUT&Tag、Hi-C、bulk RNA-seq和bulk ATAC-seq等多组学数据进行整合分析，揭示了染色质三维结构调控SERPINH1转录从而促进EMT和转移的新机制，以及染色质元件激活在CD8+耗竭T细胞、Tregs、TAMs和CAFs中的作用 | 样本量较小，仅包含四个ESCC患者 | 探究染色质可及性在ESCC转移过程中如何驱动细胞异质性，以及调控元件在ESCC转移中的作用机制 | 四个病理分期为T1a、T2b、T3b或T4a的食管鳞状细胞癌患者的癌组织与癌旁非癌组织 | 单细胞多组学 | 食管鳞状细胞癌 | scATAC-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, CUT&Tag, Hi-C, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | 单细胞ATAC数据, 单细胞RNA数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 染色质构象数据 | 4例ESCC患者的癌与癌旁组织（scATAC-seq），整合55个scRNA-seq数据集及其他多种测序数据 | NA | single-cell ATAC-seq, single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 187 | 2026-09-20 |
The critical role of endoplasmic reticulum stress and the stimulator of interferon genes (STING) pathway in kidney fibrosis
2025-02, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.021
PMID:39566842
|
研究论文 | 本研究通过转录组学分析、小鼠模型和空间转录组学，揭示了内质网应激和STING通路在肾脏纤维化中的关键作用 | 首次发现STING是肾小管细胞中PERK和ER应激的重要上游调节因子，并证明STING与PERK存在物理相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，具体分子机制和临床转化潜力仍需进一步验证 | 探讨内质网应激在肾脏疾病中的精确激活机制和作用 | 慢性肾脏病患者肾脏、急性及慢性肾损伤小鼠模型（顺铂和单侧输尿管梗阻）、叶酸及TFAM敲除小鼠数据、人类肾脏空间转录组数据 | 空间转录组学, 分子病理学 | 肾脏疾病, 肾纤维化 | 转录组学分析, 空间转录组学, 基因敲除小鼠模型 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 图像 | NA | NA | 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2026-09-20 |
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2025-02, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026
PMID:39571905
|
研究论文 | 该文通过单细胞RNA测序比较正常与糖尿病肾病（DKD）患者肾脏样本，发现TRAIL及其受体DR5在足细胞中表达上调，并介导足细胞PANoptosis，从而促进DKD进展 | 首次揭示TRAIL/DR5轴通过诱导足细胞PANoptosis（凋亡、焦亡和坏死性凋亡）在糖尿病肾病中发挥关键自分泌作用，并验证了可溶性DR5-Fc的治疗潜力 | 未明确说明样本量有限、单细胞测序深度可能不足，以及动物模型与人类DKD的差异等局限性 | 探究TRAIL/DR5在糖尿病肾病足细胞损伤中的作用及其与PANoptosis的关系 | 人DKD肾脏样本、培养的人足细胞、高脂饮食联合链脲佐菌素诱导的肥胖糖尿病小鼠、BTBR ob/ob小鼠 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本 | 3例正常和3例DKD人类肾脏样本，以及多个小鼠模型和体外培养细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 189 | 2026-09-20 |
Hunger Games: A Modern Battle Between Stress and Appetite
2025-02, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70006
PMID:39936619
|
综述 | 本文综述了压力与进食信号在大脑中的相互作用机制，重点讨论了进食障碍的神经生物学基础、动物模型、肠道微生物组的作用以及未来研究方向 | 强调了下丘脑-外侧隔核-海马轴在整合压力和进食信号中的新机制，提出了肠道微生物组在进食障碍中的新兴作用，并指出单细胞测序和先进人类影像学等新兴工具可用于揭示进食障碍患者大脑的细胞和环路水平变化 | 文章为综述性质，未提供原始实验数据；许多问题仍未解决，如为何某些个体对压力具有韧性而另一些个体易患进食障碍；特定压力源对神经环路的影响尚未明确；海马-隔核-下丘脑连接的功能相关性尚不清楚 | 探讨压力与食欲之间的相互作用机制，阐明进食障碍的神经生物学基础，并展望未来研究方向 | 进食障碍相关的神经环路、动物模型及人类患者 | 神经科学 | 进食障碍 | 单细胞测序，人类影像学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 190 | 2026-09-20 |
Epithelial cell diversity and immune remodeling in bladder cancer progression: insights from single-cell transcriptomics
2025-01-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06138-6
PMID:39885578
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示膀胱癌从非肌层浸润性到肌层浸润性进展过程中上皮细胞多样性和免疫微环境重塑的动态变化 | 首次系统描绘膀胱癌进展过程中肿瘤微环境的单细胞转录组图谱，揭示了糖酵解增强、T细胞耗竭路径（从CD8+TCF7初始T细胞到CD8+STMN1终末耗竭T细胞）、LAMP3+树突状细胞转化以及VEGFA+肥大细胞促进血管生成等关键机制 | 样本量较小（仅11例），缺乏功能验证实验，未进行纵向追踪验证，单细胞转录组数据可能受批次效应影响 | 探索膀胱癌进展过程中肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境组分的变化，识别潜在治疗靶点 | 膀胱癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织，包括非肌层浸润性膀胱癌和肌层浸润性膀胱癌 | 数字病理学、机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、免疫组化、多重免疫荧光 | NA | 图像、文本 | 11例膀胱癌样本（4例NMIBC、4例MIBC、3例癌旁正常组织） | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2026-09-20 |
Prognostic models of immune-related cell death and stress unveil mechanisms driving macrophage phenotypic evolution in colorectal cancer
2025-01-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06143-9
PMID:39875913
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研究论文 | 该研究构建了免疫相关细胞死亡和应激（ICDS）预后模型，并揭示了肿瘤细胞通过铜死亡下调GAL3ST4表达抑制M2型巨噬细胞极化的机制 | 构建了免疫相关细胞死亡和应激（ICDS）预后模型，揭示了GAL3ST4促进巨噬细胞向M2促肿瘤表型转化，以及肿瘤细胞铜死亡抑制GAL3ST4表达进而抑制M2型巨噬细胞极化的新机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 构建结直肠癌免疫相关细胞死亡和应激预后模型，阐明免疫细胞浸润与程序性细胞死亡和应激之间的复杂相互作用，并揭示驱动巨噬细胞表型演变的机制 | 结直肠癌患者转录组数据及肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序， 机器学习， 富集分析， 反卷积算法， 拟时序分析， 细胞通讯分析， 生化实验 | 机器学习预后模型 | 转录组数据， 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库的结直肠癌转录组数据， 以及七个独立队列 | NA | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-09-20 |
UBE2J1 is identified as a novel plasma cell-related gene involved in the prognosis of high-grade serous ovarian cancer
2025-01-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06135-9
PMID:39876019
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序和批量测序数据分析高级别浆液性卵巢癌中浆细胞相关标志物，鉴定UBE2J1为预后相关的新癌基因，并通过体外和体内实验验证其功能 | 首次鉴定UBE2J1为高级别浆液性卵巢癌中浆细胞相关的新型预后标志物和癌基因，揭示其通过促进上皮间质转化促进肿瘤进展的新机制 | 单细胞测序数据来源于公共数据库，样本量有限；UBE2J1调控浆细胞与肿瘤微环境相互作用的具体分子机制尚未完全阐明 | 鉴定高级别浆液性卵巢癌中浆细胞的关键标志物并探索其在肿瘤预后中的作用 | 高级别浆液性卵巢癌组织及正常卵巢组织、HGSOC细胞系、体内肿瘤模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | LASSO回归， 单因素Cox回归 | 基因表达数据， 图像 | 来自GEO数据库的单细胞测序数据和TCGA-HGSOC队列的批量测序数据，具体样本量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2026-09-20 |
Single-cell analyses of intestinal epithelium reveal the dysregulation of gut immune microenvironment in systemic lupus erythematosus
2025-01-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06147-5
PMID:39871323
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析MRL/Lpr狼疮小鼠与对照组小鼠肠道上皮的免疫和结构微环境，揭示肠道免疫稳态失调在系统性红斑狼疮发病中的作用 | 首次在狼疮自身免疫背景下对肠道上皮进行高分辨率单细胞图谱分析，揭示了CD8αα+ IELs减少、CD8αβ+ IELs增加以及γδT细胞通过AHRR-氧化应激-铁死亡通路丢失的新机制，并发现硒 supplementation可逆转γδT细胞丢失并改善狼疮症状 | 研究主要基于MRL/Lpr小鼠模型，尚未在人类狼疮患者中验证；样本量有限；硒补充治疗的长期效果和安全性需要进一步评估 | 探究狼疮自身免疫背景下肠道免疫稳态是否被破坏，以及肠道上皮免疫和结构微环境的变化 | MRL/Lpr狼疮小鼠和MRL/Mpj对照小鼠的肠道上皮组织 | 单细胞组学、免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、qPCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | MRL/Lpr狼疮小鼠和MRL/Mpj对照小鼠的肠道上皮样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2026-09-20 |
Tumor-associated-fibrosis and active collagen-CD44 axis characterize a poor-prognosis subtype of gastric cancer and contribute to tumor immunosuppression
2025-01-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06070-9
PMID:39871345
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研究论文 | 该研究通过多组学数据整合识别了一个以纤维化为特征的胃癌不良预后亚型，并揭示了胶原-CD44信号轴在肿瘤免疫抑制中的关键作用 | 首次通过共识聚类识别了以肿瘤相关纤维化为主要特征的胃癌亚型，揭示了CAF与免疫细胞之间活跃的Collagen-CD44信号轴在肿瘤进展中的上调，并发现CD44高表达与免疫抑制细胞招募及免疫检查点上调相关 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性临床验证和体内外功能实验验证Collagen-CD44轴的直接治疗靶向效果 | 探索肿瘤相关纤维化在胃癌免疫抑制中的具体机制，识别纤维化相关胃癌亚型并寻找新的治疗靶点 | 胃癌患者样本，包括TCGA的375例胃癌样本、GEO的15例胃癌单细胞样本、19个免疫治疗队列及2个GWAS数据集 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，GWAS，共识聚类，拟时序分析 | NA | 图像，文本 | 375例TCGA胃癌样本，15例GEO胃癌单细胞样本，19个免疫治疗队列，2个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2026-09-20 |
Cell signaling communication within papillary craniopharyngioma revealed by an integrated analysis of single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing
2025-01-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06149-3
PMID:39871369
|
研究论文 | 通过对乳头状颅咽管瘤进行单细胞RNA测序和批量RNA测序的整合分析，揭示肿瘤细胞间的主要信号通讯 | 首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序分析乳头状颅咽管瘤中上皮细胞、成纤维细胞和中性粒细胞之间的信号通讯，发现ANXA1-FPR1和MIF-(CD74+CXCR2)等关键信号通路 | 样本量较小，仅使用了5个PCP样本进行单细胞RNA测序和11个肿瘤样本进行批量RNA测序 | 阐明乳头状颅咽管瘤肿瘤细胞间的主要信号通讯 | 乳头状颅咽管瘤肿瘤组织中的上皮细胞、成纤维细胞和中性粒细胞 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 文本 | 5个PCP样本用于单细胞RNA测序，11个肿瘤样本和5个正常对照用于批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2026-09-20 |
Single-cell profiling of SLC family transporters: uncovering the role of SLC7A1 in osteosarcoma
2025-01-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06086-1
PMID:39844299
|
研究论文 | 该研究通过单细胞测序和RNA-seq数据分析，构建了骨肉瘤中SLC家族转运蛋白的预后模型，并揭示了SLC7A1在骨肉瘤恶性进展和免疫微环境调控中的作用 | 首次系统性地在单细胞水平上解析了骨肉瘤中SLC家族转运蛋白的表达格局，构建了由九个基因组成的SLC相关预后模型，并发现SLC7A1是预后最差的标志物，同时揭示了SLC7A1调控肿瘤细胞与巨噬细胞互作的新机制，并通过虚拟筛选鉴定出千金藤素作为SLC7A1的潜在抑制剂 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析，体外实验验证尚需进一步的体内动物实验和临床试验来证实SLC7A1作为治疗靶点的有效性和安全性 | 系统解析SLC家族转运蛋白在骨肉瘤中的表达特征和预后价值，探究SLC7A1在骨肉瘤恶性进展和免疫微环境调控中的功能，并筛选靶向SLC7A1的潜在治疗药物 | 骨肉瘤细胞、骨肉瘤微环境中的各类细胞（尤其是髓系细胞和巨噬细胞）以及骨肉瘤患者样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | LASSO回归, CIBERSORT | 单细胞转录组数据, RNA-seq数据, 图像 | GSE152048和GSE162454单细胞测序数据集以及TARGET和GSE21257 RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 197 | 2026-09-20 |
Single-cell atlas reveals multi-faced responses of losartan on tubular mitochondria in diabetic kidney disease
2025-01-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06074-5
PMID:39838394
|
研究论文 | 该研究通过单核RNA测序技术构建了糖尿病肾病小鼠肾脏的单细胞图谱，揭示了氯沙坦对肾小管细胞线粒体的多方面保护作用 | 首次利用单核RNA测序技术全面揭示氯沙坦对糖尿病肾病肾小管细胞线粒体动态扰动的多方面治疗响应，并发现了一个具有线粒体自噬表型的特定肾小管亚群 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证仅限于初步的共定位和表达分析，样本量有限 | 利用单核RNA测序技术全面揭示氯沙坦对糖尿病肾病肾小管细胞线粒体的治疗响应及其保护机制 | 糖尿病肾病小鼠肾脏组织、HK-2细胞系以及糖尿病肾病患者肾脏标本 | 单细胞转录组学 | 糖尿病肾病 | 单核RNA测序, 基因本体富集分析, GSEA/GSVA评分, 免疫荧光, 蛋白质印迹, 电子显微镜, 激光共聚焦显微镜 | NA | 图像, 文本 | 小鼠分为CON、DKD、LST三组，HK-2细胞分为LG、HG、HG+LST三组，具体样本数量未提及 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2026-09-20 |
Amantadine modulates novel macrophage phenotypes to enhance neural repair following spinal cord injury
2025-01-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05916-y
PMID:39806436
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研究论文 | 该研究通过微阵列和单细胞RNA测序揭示脊髓损伤后巨噬细胞动态变化，并发现金刚烷胺可调节巨噬细胞表型促进神经修复 | 首次鉴定出三种巨噬细胞亚型（BAMs、IMs、CIMs）及其分化轨迹（Il-1b+ IMs → Mrc1+ BAMs → Arg1+ CIMs），并发现金刚烷胺通过调节HIF-1α和NF-κB通路调控该过程 | 研究仅基于小鼠模型，尚未进行临床转化验证；分子对接仅为假设，需进一步验证直接靶点 | 探究脊髓损伤后巨噬细胞表型动态变化及金刚烷胺对神经修复的调节作用 | 小鼠脊髓损伤模型及巨噬细胞 | 数字病理学, 机器学习 | 脊髓损伤 | 微阵列, 单细胞RNA测序, 高维基因共表达网络分析, slingshot轨迹分析, 免疫荧光染色, 流式细胞术, 蛋白质印迹, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 199 | 2026-09-20 |
The microenvironment cell index is a novel indicator for the prognosis and therapeutic regimen selection of cancers
2025-01-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05950-w
PMID:39806464
|
研究论文 | 该研究基于三阴性乳腺癌微环境细胞浸润构建了微环境细胞指数（MCI）预后模型，并探索了新的治疗策略 | 构建了由六种微环境细胞组成的MCI指数，并在此基础上结合空间分布特征开发了MCI增强（MCI-e）模型，能够更准确地预测三阴性乳腺癌患者的预后；同时发现抑制胰岛素信号通路可显著延长MCI高表达患者的肿瘤小鼠生存时间 | 研究主要基于生物信息学分析和动物实验验证，尚需大规模前瞻性临床试验进一步验证MCI和MCI-e模型的临床适用性 | 建立基于微环境细胞浸润的预后预测模型，并探索三阴性乳腺癌的新治疗策略 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者及荷瘤小鼠 | 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间分辨转录组学, 多重免疫荧光染色 | LASSO-Cox回归 | 图像, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 200 | 2026-09-20 |
Impact of potential biomarkers, SNRPE, COX7C, and RPS27, on idiopathic Parkinson's disease
2025-01, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01591-x
PMID:39467967
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研究论文 | 该研究通过全血基因表达数据集进行生物信息学分析，识别特发性帕金森病中的差异表达基因、通路及枢纽基因，并结合甲基化、microRNA及单细胞RNA测序数据验证潜在生物标志物 | 整合全血转录组、差异甲基化区域、差异表达microRNA及黑质单细胞RNA测序数据，系统识别并验证SNRPE、COX7C和RPS27作为特发性帕金森病的潜在生物标志物 | 未提及实验验证（如qPCR或蛋白水平验证），样本量未明确说明，单细胞RNA测序数据来源及具体样本信息不详 | 识别适用于特发性帕金森病的关键基因、分子机制及潜在生物标志物 | 特发性帕金森病患者的外周血样本及黑质组织 | 机器学习 | 帕金森病 | bulk RNA-seq, 甲基化测序, microRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 图像 | 未明确说明样本量 | NA | bulk RNA-seq, 甲基化测序, microRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |