单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 2744 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-04-02 |
Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection
2025-May, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2025.110496
PMID:40090183
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠T细胞和B细胞亚群在口蹄疫病毒(FMDV)感染中对记忆免疫反应的影响 | 首次利用单细胞RNA测鉴定了小鼠脾脏中大多数T和B细胞亚群的特定基因标记，揭示了FMDV感染对记忆细胞功能的独特影响机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在更大动物模型或人体中进行验证 | 探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制 | 小鼠脾脏中的T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠脾脏细胞 |
| 2 | 2025-04-02 |
Neuronal activity modulates the expression of secretagogin, a Ca2+ sensor protein, during mammalian forebrain development
2025-May, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70031
PMID:40165367
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研究论文 | 本研究探讨了神经元活动中钙离子传感器蛋白secretagogin的表达调控及其在哺乳动物前脑发育中的作用 | 揭示了secretagogin表达受神经元活动调控的新机制，并发现其在唐氏综合征胎儿中的表达延迟 | 研究主要集中于前脑和皮层神经元，未全面覆盖其他脑区 | 阐明secretagogin作为神经元标志物的表达调控机制及其与神经元活动的关系 | 人类胎儿前脑、小鼠皮层神经元、SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞 | 神经科学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学、体外培养 | Scgn-iCre::Ai9转基因小鼠 | 基因表达数据、免疫染色图像 | 人类胎儿样本、小鼠模型及体外培养细胞 |
| 3 | 2025-04-02 |
Single‑cell RNA‑Seq reveals PBMC profile alterations in a patient following a radiation accident
2025-May, Experimental and therapeutic medicine
IF:2.4Q3
DOI:10.3892/etm.2025.12846
PMID:40165803
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了辐射事故后患者外周血单个核细胞的动态变化 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析辐射暴露后PBMCs的转录组变化，并揭示了相关信号通路的失调 | 样本量较小，仅包括一名辐射患者和十名健康对照 | 研究辐射暴露对人体血液免疫反应的影响 | 辐射事故患者和健康对照者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 生物医学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | 1名辐射患者(两个时间点)和10名健康对照者的PBMCs细胞 |
| 4 | 2025-04-02 |
Single cell-resolved cellular, transcriptional, and epigenetic changes in mouse T cell populations linked to age-associated immune decline
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2425992122
PMID:40163732
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和单细胞TCR测序，全面分析了小鼠脾脏T细胞在不同年龄阶段的细胞、转录和表观遗传变化 | 首次在多时间点对小鼠脾脏T细胞进行全面的单细胞多组学分析，揭示了年龄相关的T细胞功能和组成变化 | 研究仅针对小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明衰老对T细胞生物学的具体影响 | 小鼠脾脏T细胞 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单细胞ATAC测序(scATAC-seq), 单细胞TCR测序 | NA | 单细胞多组学数据 | 10个不同年龄组的小鼠脾脏T细胞 |
| 5 | 2025-04-02 |
Single-cell atlas profiling revealed cellular characteristics and dynamic changes after PD-1 blockade therapy of brain metastases from laryngeal squamous cell carcinoma
2025-Apr, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-024-05064-3
PMID:39085744
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了喉鳞状细胞癌脑转移患者在PD-1阻断治疗后的细胞特征和动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序技术分析了PD-1阻断治疗前后喉鳞状细胞癌脑转移的肿瘤样本，揭示了治疗对癌细胞和免疫细胞功能的影响 | 样本量有限，且仅针对喉鳞状细胞癌脑转移患者，结果可能不适用于其他癌症类型 | 研究PD-1阻断治疗对喉鳞状细胞癌脑转移患者的治疗效果及其机制 | 喉鳞状细胞癌脑转移患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 喉鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 配对的治疗前后转移肿瘤样本及原发喉鳞状细胞癌数据集 |
| 6 | 2025-04-02 |
Different inflammatory, fibrotic, and immunological signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis
2025-Apr-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285598
PMID:39385733
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了前纤维化和明显原发性骨髓纤维化（PMF）的骨髓抽吸物，揭示了不同细胞类型在PMF进展中的炎症、纤维化和免疫特征差异 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了PMF进展中造血干细胞和祖细胞（HSPC）、巨核细胞和单核细胞亚群的炎症/纤维化特征变化，并发现EMT富集的巨核细胞亚群在明显PMF中显著增加 | 未发现PMF进展中的决定性亚群，样本量未明确说明 | 探究前纤维化和明显原发性骨髓纤维化（PMF）在炎症、纤维化和免疫特征上的差异 | 前纤维化PMF（pre-PMF）、明显PMF和其他骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者的骨髓抽吸物 | 单细胞测序分析 | 原发性骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7 | 2025-04-02 |
Central FGF19 signaling enhances energy homeostasis and adipose tissue thermogenesis through sympathetic activation in obese mice
2025-Apr-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00488.2024
PMID:40059865
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research paper | 研究探讨了中枢FGF19信号通过激活交感神经增强肥胖小鼠能量稳态和脂肪组织产热的机制 | 揭示了FGF19不仅通过减少食物摄入，还能通过激活交感神经增强白色和棕色脂肪组织的产热作用 | 研究主要在肥胖小鼠模型中进行，人类中的效果尚不明确 | 探究中枢FGF19信号对肥胖小鼠能量稳态和脂肪组织产热的影响 | 饮食诱导的肥胖（DIO）小鼠 | 代谢研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 肥胖小鼠模型 |
| 8 | 2025-04-02 |
Machine Learning Unveils Sphingolipid Metabolism's Role in Tumour Microenvironment and Immunotherapy in Lung Cancer
2025-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70435
PMID:40159631
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research paper | 该研究通过机器学习揭示了鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境（TME）和免疫治疗中的作用 | 首次使用机器学习算法（Lasso回归和生存SVM）结合转录组分析和临床样本，识别了鞘脂代谢相关基因在肺癌TME中的关键作用，并发现ASAH1和SMPD1作为强预后标志物 | 研究依赖于TCGA和GTEx数据库的样本，可能存在数据偏差，且未进行实验验证 | 探究鞘脂代谢在肺癌TME和免疫治疗中的作用 | 肺癌（LUAD和LUSC）的肿瘤微环境及免疫细胞 | machine learning | lung cancer | transcriptomic analysis, scRNA-seq, Lasso regression, survival SVM | Lasso regression, SVM | transcriptomic data, clinical samples, scRNA-seq data | TCGA和GTEx数据库的临床样本 |
| 9 | 2025-04-02 |
Transitional CXCL14+ cancer-associated fibroblasts enhance tumour metastasis and confer resistance to EGFR-TKIs, revealing therapeutic vulnerability to filgotinib in lung adenocarcinoma
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70281
PMID:40162549
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research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序数据，识别出一种独特的CXCL14+肌纤维母细胞性癌症相关成纤维细胞（myCAFs）亚群，并揭示了其在肺腺癌（LUAD）肿瘤转移和EGFR-TKIs耐药中的作用 | 发现了CXCL14+ myCAFs亚群在肺腺癌中的关键作用，并确定了Filgotinib作为逆转EGFR-TKIs耐药的有效药物 | 研究主要基于单细胞RNA测序和体外实验，临床样本验证仍需进一步扩大 | 探究癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肺腺癌肿瘤转移和EGFR-TKIs耐药中的具体作用机制 | 肺腺癌（LUAD）患者和肿瘤微环境中的CXCL14+ myCAFs亚群 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, spatial transcriptomics, immunohistochemistry, ELISA | NA | single-cell RNA sequencing data, spatial transcriptomic data, clinical tissue samples | 多个独立LUAD队列的临床组织样本和患者血浆样本 |
| 10 | 2025-04-02 |
Integrated multi-omics analyses provide new insights into genomic variation landscape and regulatory network candidate genes associated with walnut endocarp
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70113
PMID:40162720
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了核桃内果皮发育和壳厚度的遗传变异和调控网络候选基因 | 构建了核桃品种'湘灵'的高质量基因组组装和八个核桃物种的图形结构泛基因组，通过GWAS鉴定了与核桃驯化和改良相关的19个位点，并通过多组学分析揭示了与次生细胞生物合成和木质素积累相关的候选基因 | 研究主要集中于核桃内果皮发育和壳厚度的遗传变异，对其他性状的遗传基础研究较少 | 系统阐明核桃内果皮发育和壳厚度的遗传变异和调控网络 | 波斯核桃（Juglans regia）及其八个近缘种 | 基因组学 | NA | 多组学分析（包括转录组学、代谢组学、DNA甲基化和空间转录组学）和GWAS | NA | 基因组序列、转录组数据、代谢组数据、DNA甲基化数据和空间转录组数据 | 285个核桃种质资源 |
| 11 | 2025-04-02 |
scPANDA: PAN-Blood Data Annotator with a 10-Million Single-Cell Atlas
2025-Apr-01, Chinese medical sciences journal = Chung-kuo i hsueh k'o hsueh tsa chih
DOI:10.24920/004472
PMID:40164519
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research paper | 开发了一个名为scPANDA的PAN-blood单细胞数据注释工具，利用包含1000万个细胞的图谱进行精确的细胞类型注释 | 利用大规模单细胞图谱进行细胞类型注释，采用三层推断方法逐步细化细胞类型 | 未提及具体的技术限制或潜在问题 | 提高血液系统中细胞类型注释的准确性和可靠性 | 血液系统中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自16项研究的1000万个细胞 |
| 12 | 2025-04-02 |
Enhancer Extrachromosomal Circular DNA ANKRD28 Elicits Drug Resistance via POU2F2-Mediated Transcriptional Network in Multiple Myeloma
2025-Apr-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415695
PMID:40167268
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研究论文 | 本文研究了多发性骨髓瘤(MM)中药物抵抗的机制，特别是通过增强子环状DNA ANKRD28 (eccANKRD28)介导的转录网络 | 首次揭示了非编码环状DNA作为增强子在多发性骨髓瘤药物抵抗中的作用，并阐明了POU2F2介导的转录调控网络 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本数量有限，需要进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤药物抵抗的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者血清样本和耐药细胞系 | 表观遗传学 | 多发性骨髓瘤 | H3K27ac ChIP-seq, scRNA-seq, scATAC-seq, CUT&Tag, CRISPR/Cas9 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多发性骨髓瘤患者血清样本和耐药细胞系(具体数量未明确说明) |
| 13 | 2025-04-02 |
Inflammatory Milieu by Crosstalk between Glomerulus and Proximal Tubular Cells in Type 2 Diabetes Mellitus Kidney Disease
2025-Mar-31, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2024.0535
PMID:40160027
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序等技术，探讨了2型糖尿病肾病中肾小球和近端肾小管细胞间的炎症相互作用 | 首次在诱导型2型糖尿病肾病模型中应用单细胞RNA测序技术，并验证了CXCL12介导的T细胞浸润的关键作用 | 研究结果仍需在更大规模的人类样本中进一步验证 | 探索2型糖尿病肾病中肾小球和近端肾小管细胞间的炎症相互作用机制 | 诱导型2型糖尿病肾病小鼠模型及人类肾脏活检组织 | digital pathology | diabetic kidney disease | scRNA-seq, flow cytometry, histological analysis | NA | RNA-seq data, histological images, flow cytometry data | 诱导型T2DKD小鼠模型及人类肾脏活检组织（具体数量未明确说明） |
| 14 | 2025-04-02 |
Srsf3-Dependent APA Drives Macrophage Maturation and Limits Atherosclerosis
2025-Mar-31, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.326111
PMID:40160097
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research paper | 该研究揭示了Srsf3依赖的APA（选择性多聚腺苷酸化）在巨噬细胞成熟和动脉粥样硬化中的保护作用 | 首次揭示了Srsf3通过调控线粒体相关基因Aars2的3'UTR长度影响线粒体翻译效率，进而调控巨噬细胞成熟和动脉粥样硬化进程的分子机制 | 研究主要基于Apoe-/-小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究单核/巨噬细胞亚型在动脉粥样硬化斑块中的转化轨迹及其调控机制 | Apoe-/-小鼠动脉斑块中的单核/巨噬细胞亚型 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、3'端测序、流式细胞术、组织病理学分析、多核糖体分析、代谢组学分析 | NA | RNA测序数据、流式细胞数据、代谢组数据 | Apoe-/-小鼠动脉斑块样本及部分人类斑块样本 |
| 15 | 2025-04-02 |
Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update
2025-Mar-31, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001085
PMID:40160177
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综述 | 本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，揭示了银屑病的细胞多样性及其在疾病进展中的关键作用 | 利用单细胞和空间转录组学技术揭示了银屑病中免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞的亚型及其相互作用，特别是IL-17/IL-36和PRSS3-F2R通路的作用，以及代谢失调在慢性炎症中的关键角色 | NA | 探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对疾病机制的理解和治疗策略的影响 | 银屑病中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 16 | 2025-04-02 |
PPY-Induced iCAFs Cultivate an Immunosuppressive Microenvironment in Pancreatic Cancer
2025-Mar-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413432
PMID:40162859
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺多肽（PPY）在胰腺导管腺癌（PDAC）中通过诱导炎症性癌症相关成纤维细胞（iCAFs）塑造免疫抑制微环境的新机制 | 首次发现PPY作为iCAFs的新型诱导剂，并验证其通过非经典NF-κB通路激活的机制，为PDAC免疫治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证PPY靶向治疗的效果 | 探索PDAC免疫抑制微环境形成机制并寻找改善免疫治疗疗效的新策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）微环境中的炎症性癌症相关成纤维细胞（iCAFs） | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化（mIHC）、免疫共沉淀-质谱分析、分子对接 | KPC（Kras; Trp53; Pdx1-Cre）小鼠原位移植瘤模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、影像数据（PET-CT） | 人类PDAC组织微阵列、小鼠模型及共培养实验样本（具体数量未明确说明） |
| 17 | 2025-04-02 |
HISSTA: a human in situ single-cell transcriptome atlas
2025-Mar-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf142
PMID:40163697
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research paper | 介绍了一个名为HISSTA的数据库，用于存储和分析人类组织单细胞分辨率下的原位转录组数据 | HISSTA数据库是首个专注于单细胞分辨率原位转录组数据的综合性数据库，提供交互式可视化工具 | NA | 构建一个用户友好的数据库，以促进空间转录组数据的存储、分析和可视化 | 人类组织的单细胞转录组数据 | digital pathology | NA | MERFISH, CosMx SMI, Xenium | NA | spatial transcriptome data | 112个样本，2800万个细胞，覆盖16种组织类型 |
| 18 | 2025-04-02 |
Spatial transcriptomics of progression gene signature and tumor microenvironment leading to progression in mycosis fungoides
2025-Mar-31, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014495
PMID:40163757
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术，探究了蕈样肉芽肿（MF）疾病进展过程中的基因表达变化和肿瘤微环境特征 | 首次系统揭示了MF从斑片期到斑块期再到肿瘤期的动态转录组变化特征，并发现M2巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞（CAF）在早期MF进展中的关键作用 | 样本量相对有限，且未进行长期预后随访验证 | 识别早期MF患者疾病进展的生物标志物和微环境特征 | 蕈样肉芽肿（MF）患者组织样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 空间转录组学、免疫组织化学染色 | NA | 转录组数据、免疫组化图像 | 未明确说明具体样本数量，包含斑片期MF、斑块期MF和肿瘤期MF多阶段样本 |
| 19 | 2025-04-02 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Mar-31, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术探索了特发性多中心Castleman病(iMCD)患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-γ在疾病进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示iMCD中CCL单核细胞通过IFN-II信号通路与特定NK/NKT细胞相互作用，并发现血清IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗呈正相关 | 样本量较小(15例患者和4例健康对照)，且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证 | 探索iMCD的免疫发病机制，寻找早期预后分层标志物和新治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病(iMCD)患者的外周血单个核细胞(PBMCs)、淋巴结和骨髓样本 | 免疫学 | Castleman病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血样本，以及部分淋巴结和骨髓样本 |
| 20 | 2025-04-02 |
Deciphering shared molecular dysregulation across Parkinson's disease variants using a multi-modal network-based data integration and analysis
2025-Mar-31, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00914-3
PMID:40164620
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研究论文 | 通过整合多模态数据和构建知识图谱，探索帕金森病不同变异之间的共同分子失调机制 | 首次整合了多种单基因帕金森病模型的高通量成像和RNA测序数据，并构建知识图谱进行分析，同时在特发性帕金森病患者中验证了发现 | 研究主要基于体外器官模型，可能无法完全反映体内复杂情况 | 探索帕金森病不同变异之间的共同分子机制 | 帕金森病患者特异性中脑器官模型（LRRK2-G2019S、SNCA三倍体、GBA-N370S或MIRO1-R272Q突变）和特发性帕金森病患者 | 系统生物医学 | 帕金森病 | 高通量成像、RNA测序、单细胞RNA测序、知识图谱构建 | 知识图谱 | 图像数据、RNA测序数据 | 多种单基因帕金森病模型和特发性帕金森病患者的中脑器官样本 |