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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 1961 - 1980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1961 | 2025-10-07 |
Deciphering the Role of Cancer Stem Cells: Drivers of Tumor Evolution, Therapeutic Resistance, and Precision Medicine Strategies
2025-Jan-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030382
PMID:39941751
|
综述 | 全面分析癌症干细胞在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用及其精准医疗策略 | 系统整合CSC生物学特性与新兴技术应用，提出多学科协同研究框架 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 阐明癌症干细胞在肿瘤进化中的作用并探索精准医疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9，单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1962 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals cell heterogeneity and aberrantly activated pathways associated with microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1449624
PMID:39944086
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌微血管侵犯相关的细胞异质性和异常激活通路 | 首次在单细胞水平识别MVI阳性恶性细胞亚型，发现MARCKSL1基因通过PTN信号网络促进MVI进展 | 样本量较小（仅5例患者），需要进一步实验验证MARCKSL1的功能 | 探索肝细胞癌微血管侵犯的细胞异质性、生物标志物和细胞间信号相互作用 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据 | 5例肝细胞癌患者（其中3例显示微血管侵犯） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1963 | 2025-10-07 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
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研究论文 | 本研究鉴定出一种表达免疫抑制效应分子模拟调节性T细胞的胶质瘤干细胞亚群，该亚群通过TGFBR2驱动抑制CD4+和CD8+ T细胞功能 | 首次发现间充质胶质瘤干细胞通过TGFBR2（而非TGFBR1）驱动免疫抑制性Treg样表型，并鉴定出6基因特征标志物 | 研究主要基于患者来源细胞和临床样本，需要进一步体内验证 | 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中胶质瘤干细胞的免疫调节机制 | 患者来源的胶质瘤干细胞、临床胶质母细胞瘤标本、CD4+和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、分子操作、药理学干预 | NA | 测序数据、基因表达数据、临床数据 | 患者来源细胞和临床标本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1964 | 2025-10-07 |
Bronchoalveolar lavage single-cell transcriptomics reveals immune dysregulations driving COVID-19 severity
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309880
PMID:39928675
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19重症患者支气管肺泡灌洗液中免疫细胞失调机制 | 首次在单细胞水平系统揭示COVID-19重症患者中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞和T细胞的协同失调机制 | 基于二次数据分析，缺乏实验验证；样本量未明确说明 | 探索COVID-19疾病严重程度的免疫学机制 | COVID-19患者和健康对照的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1965 | 2025-10-07 |
Detection of hepatitis B virus mRNA from single cell RNA sequencing data without prior knowledge
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0314060
PMID:39932940
|
研究论文 | 本研究开发了一种无需先验知识即可从单细胞RNA测序数据中检测乙型肝炎病毒mRNA的方法 | 无需16S rRNA扩增或先验知识即可直接从scRNA-seq数据中检测病毒mRNA | 仅验证了乙型肝炎病毒，且依赖病毒mRNA具有poly-A尾的特征 | 开发从单细胞RNA测序数据中检测病毒mRNA的新方法 | 慢性乙型肝炎病毒感染患者的肝脏样本 | 单细胞测序分析 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 慢性HBV感染患者肝脏样本（包括有和无HBsAg消失的患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1966 | 2025-10-07 |
Integrative multi-omics analysis for identifying novel therapeutic targets and predicting immunotherapy efficacy in lung adenocarcinoma
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2024.91
PMID:39935429
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别肺腺癌的新型治疗靶点并预测免疫治疗疗效 | 识别了11个不同的细胞亚群和两种分子亚型，开发了多组学驱动的机器学习特征，发现RRM1作为化疗反应的关键生物标志物 | NA | 阐明肺腺癌的细胞亚群和分子亚型，识别关键生物标志物，探索潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者队列 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 全基因组关联研究 | 贝叶斯反卷积, 机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1967 | 2025-10-07 |
Identification of WDR74 and TNFRSF12A as biomarkers for early osteoarthritis using machine learning and immunohistochemistry
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1517646
PMID:39935469
|
研究论文 | 通过机器学习和免疫组化技术鉴定WDR74和TNFRSF12A作为早期骨关节炎的生物标志物 | 首次整合泛素化相关基因表达数据与机器学习方法识别早期骨关节炎生物标志物 | 研究样本来源单一（GEO数据库），需要更多临床样本验证 | 改善早期骨关节炎的诊断和预后 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化 | XGBoost | 基因表达数据，图像数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和人膝关节标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1968 | 2025-10-07 |
Exploring Core Genes Associated with Sepsis and Systemic Inflammatory Response Syndrome Using Single-Cell Sequencing Technology
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S448900
PMID:39935525
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术探索脓毒症和全身炎症反应综合征的核心基因 | 首次通过单细胞转录组分析揭示脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本中免疫细胞亚群的差异表达基因 | 样本量有限，缺乏独立验证队列 | 识别脓毒症和SIRS的独特生物标志物和免疫应答模式 | 脓毒症死亡患者和全身炎症反应综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症，全身炎症反应综合征 | 单细胞RNA测序 | UMAP细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1969 | 2025-10-07 |
Tgfβ signaling stimulates glycolysis to promote the genesis of synovial joint interzone in developing mouse embryonic limbs
2025-Jan-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq4991
PMID:39772668
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现滑膜关节初始区细胞形成需要糖酵解增强，且这一过程部分依赖于Tgfβ信号通路 | 首次揭示糖酵解在软骨细胞向关节初始区细胞转化中的关键作用，并阐明Tgfβ信号通过mTOR和Hif1α激活糖酵解的分子机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究滑膜关节初始区细胞形成的分子机制 | 小鼠胚胎膝关节原基 | 发育生物学 | 关节发育异常 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎膝关节原基细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1970 | 2025-10-07 |
APMAT analysis reveals the association between CD8 T cell receptors, cognate antigen, and T cell phenotype and persistence
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631993
PMID:39829843
|
研究论文 | 开发APMAT框架用于高通量捕获和分析CD8 T细胞，揭示抗原-TCR对的理化特征与T细胞表型和持久性的关联 | 首次提出整合实验与计算的APMAT框架，能够同时捕获抗原、TCR序列和单细胞转录组数据 | 研究样本仅限于HLA A*02:01基因型的COVID-19参与者 | 阐明CD8 T细胞受体、抗原和T细胞表型之间的关联关系 | CD8 T细胞及其受体、SARS-CoV-2病毒抗原 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, TCR测序 | 计算分析框架 | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | 62名HLA A*02:01 COVID-19参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1971 | 2025-10-07 |
TDO2 + cancer-associated fibroblasts mediate cutaneous squamous cell carcinoma immune escape via impeding infiltration of CD8 + T cells
2025-Jan-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03921-0
PMID:39751882
|
研究论文 | 本研究揭示TDO2+癌症相关成纤维细胞通过抑制CD8+T细胞浸润介导皮肤鳞状细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次报道TDO2在cSCC的CAFs中高表达及其通过抑制CD8+T细胞浸润促进免疫逃逸的作用机制 | NA | 探索皮肤鳞状细胞癌免疫逃逸的分子机制 | 皮肤鳞状细胞癌组织、癌症相关成纤维细胞、CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1972 | 2025-10-07 |
Identification of EGR1 as a Key Diagnostic Biomarker in Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) Through Machine Learning and Immune Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499396
PMID:39925925
|
研究论文 | 通过机器学习和免疫分析鉴定EGR1作为代谢功能障碍相关脂肪性肝病的关键诊断生物标志物 | 首次结合多种机器学习方法和免疫分析鉴定EGR1作为MASLD的关键诊断生物标志物，并构建了TF-miRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证 | 识别MASLD的有效诊断生物标志物并探索其发病机制 | MASLD患者基因表达数据、AML-12细胞系、MCD小鼠模型 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、机器学习算法 | LASSO, SVM, Random Forest | 基因表达数据 | 六个GEO数据集，包括训练集和验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 1973 | 2025-10-07 |
Crosstalk of SPINK4 Expression With Patient Mortality, Immunotherapy and Metastasis in Pan-Cancer Based on Integrated Multi-Omics Analyses
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S487126
PMID:39926372
|
研究论文 | 基于多组学分析揭示SPINK4基因表达与泛癌患者死亡率、免疫治疗和转移的相互作用 | 首次系统研究SPINK4在泛癌中的表达特征及其与肿瘤微环境、干细胞特性、免疫浸润和化疗敏感性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库分析，实验验证仅限于结肠腺癌细胞系 | 探究SPINK4在不同癌症类型中的功能及其与肿瘤进展的关系 | 泛癌患者组织样本和结肠腺癌细胞系(HCT116和RKO) | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析,单细胞测序,伤口愈合实验,Transwell实验 | Kaplan-Meier生存分析,Pearson相关分析 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | TCGA数据库中的泛癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 1974 | 2025-10-07 |
Progress in Assessing Retinal Microglia Using Single-Cell RNA Sequencing
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-76550-6_24
PMID:39930187
|
研究论文 | 比较两种视网膜细胞制备方法和三种数据库整合算法在评估视网膜小胶质细胞方面的效果 | 首次系统比较胶原酶消化+FACS富集与木瓜蛋白酶全视网膜消化两种方法，以及CCA、RPCA和Harmony三种整合算法在视网膜小胶质细胞研究中的表现 | 仅针对健康视网膜进行研究，未涉及病变状态下的验证 | 评估不同细胞制备方法和数据分析算法在视网膜小胶质细胞研究中的适用性 | 视网膜小胶质细胞 | 单细胞分析 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | CCA, RPCA, Harmony | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1975 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of SEPN1 in glioma: Prognostic roles, functional implications, and potential therapeutic interventions
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318501
PMID:39919065
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了SEPN1在胶质瘤中的预后价值、功能作用及潜在治疗干预 | 首次系统阐明SEPN1在胶质瘤中的致癌作用，开发了SEPN1相关风险评分(SRS)，并基于此识别潜在抗胶质瘤药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证SEPN1的具体分子机制 | 探究SEPN1在泛癌中的表达特征和预后意义，特别聚焦于胶质瘤 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA、CGGA、GEO和ZN-GC多个队列的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1976 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1977 | 2025-10-07 |
Epithelial and immune transcriptomic characteristics and possible regulatory mechanisms in asthma exacerbation: insights from integrated studies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512053
PMID:39917297
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序分析哮喘急性加重期的上皮细胞和免疫细胞特征，并鉴定关键调控基因 | 首次系统性地整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示哮喘急性加重期上皮细胞和免疫细胞的异质性及关键调控基因 | 研究样本量未明确说明，需要进一步实验验证关键基因的功能机制 | 探索哮喘急性加重的上皮细胞和免疫细胞转录组特征及调控机制 | 哮喘患者的上皮细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1978 | 2025-10-07 |
RGS10 Deficiency Alleviated Intestinal Mucosal Inflammation Through Suppression of Th1/Th17 Cell Immune Responses in Ulcerative Colitis
2025-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13869
PMID:39428350
|
研究论文 | 本研究揭示了RGS10通过调控Th1/Th17细胞分化在溃疡性结肠炎肠道黏膜炎症中的作用机制 | 首次发现RGS10在UC患者CD4 T细胞中高表达，并阐明其通过结合PTPN2调控STAT1/STAT3磷酸化影响Th1/Th17细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究RGS10在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者样本和RGS10基因敲除小鼠 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 免疫荧光, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | UC患者和健康对照样本，RGS10敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1979 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_13
PMID:39900764
|
研究论文 | 介绍SciDAP平台如何简化单细胞测序数据分析流程 | 开发了基于通用工作流语言的便携可重复分析流程，为非计算背景的生物学家提供用户友好的单细胞数据分析方案 | 未提及平台性能的具体量化评估数据 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞测序数据分析流程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言的计算分析平台 |
| 1980 | 2025-10-07 |
Improving doublet cell removal efficiency through multiple algorithm runs
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.009
PMID:39911841
|
研究论文 | 提出一种多轮双细胞去除策略，通过多次运行算法提高单细胞RNA测序数据中双细胞的去除效率 | 首次提出多轮双细胞去除策略，通过循环运行算法减少随机性，显著提升双细胞检测效果 | 未明确说明计算成本增加程度，且策略效果依赖于基础算法的性能 | 提高单细胞RNA测序数据分析中双细胞去除的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | DoubletFinder, cxds, bcds, hybrid | 单细胞RNA测序数据 | 14个真实数据集、29个条形码标记数据集和106个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |