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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1941 | 2025-10-07 |
Advancements in single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics: transforming biomedical research
2025, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2025.13922
PMID:39980637
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术的发展及其在生物医学研究中的变革性应用 | 强调空间转录组学在保留RNA转录组空间信息方面的突破性进展,克服了传统单细胞测序技术丢失空间信息的局限性 | 传统单细胞RNA测序技术无法保留RNA转录组的空间信息,因为该过程需要组织解离和细胞分离 | 探讨单细胞测序和空间转录组学技术的最新发展、相关挑战及其在生物医学领域的应用 | 单细胞RNA测序和空间转录组学技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1942 | 2025-10-07 |
Cancer stem cells and tumor-associated macrophages as mates in tumor progression: mechanisms of crosstalk and advanced bioinformatic tools to dissect their phenotypes and interaction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529847
PMID:39981232
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综述 | 本文系统阐述癌症干细胞与肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展中的相互作用机制及生物信息学分析工具 | 整合前沿生物信息学工具(单细胞RNA测序、空间转录组学、轨迹分析)解析CSC-TAM相互作用的表型和机制 | NA | 阐明癌症干细胞与肿瘤微环境免疫细胞(特别是肿瘤相关巨噬细胞)相互作用的分子机制 | 癌症干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1943 | 2025-10-07 |
An anoikis-related signature predicts prognosis and immunotherapy response in gastrointestinal cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1477913
PMID:39981252
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于失巢凋亡相关基因的预后特征(Anoscore),用于预测胃肠道癌症患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于失巢凋亡相关基因的预后评分系统,并验证其在胃肠道癌症预后预测和个性化治疗方案选择中的价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索失巢凋亡相关基因在胃肠道癌症预后中的作用 | 食管癌、胃癌、结肠癌和直肠癌患者 | 生物信息学 | 胃肠道癌症 | RNA测序、单细胞测序分析、无监督聚类分析、Cox回归分析 | LASSO回归、Cox回归模型 | RNA测序数据、临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃肠道癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1944 | 2025-10-07 |
A single-cell mass cytometry-based atlas of the developing mouse brain
2025-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01786-1
PMID:39695302
|
研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术构建了发育中小鼠大脑的蛋白质表达图谱 | 首次在单细胞水平系统表征发育中小鼠大脑的蛋白质丰度,揭示了与RNA表达差异的功能性细胞状态 | 研究仅针对特定发育时间点的小鼠模型,未涵盖所有脑区发育阶段 | 构建发育中小鼠大脑的单细胞蛋白质表达图谱 | C57/BL6小鼠胚胎期E11.5至出生后P4的整个大脑及四个脑区组织 | 单细胞分析 | NA | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,免疫组织化学,RNAscope原位杂交 | NA | 单细胞蛋白质表达数据,单细胞RNA表达数据 | 24,290,787个细胞,每个样本2-4个生物学重复 | NA | 单细胞蛋白质组学,单细胞RNA测序 | NA | 40抗体panel的质谱流式分析 |
| 1945 | 2025-10-07 |
Mendelian randomization and multiomics comprehensively reveal the causal relationship and potential mechanism between atrial fibrillation and gastric cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1446661
PMID:39963672
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析全面揭示心房颤动与胃癌之间的因果关系及潜在机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、蛋白互作网络、单细胞测序和发育轨迹分析,系统揭示AF与GC的因果关联及成纤维细胞在其中的关键作用 | 研究基于遗传工具变量和公共数据库,需进一步实验验证机制 | 探究心房颤动与胃癌之间的因果关系及分子机制 | 心房颤动患者与胃癌患者的遗传和分子数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA-seq, 蛋白互作网络分析, 富集分析, 转录因子分析 | 两样本孟德尔随机化模型 | 遗传数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 136个AF相关SNPs, 62个AF-GC共关联基因, TCGA-STAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量测序 | NA | NA |
| 1946 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of M2 macrophage-related gene prognostic model and single-cell sequence to predict immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1519677
PMID:39963673
|
研究论文 | 通过整合分析M2巨噬细胞相关基因构建预后模型,结合单细胞测序预测肺腺癌患者的免疫治疗反应 | 首次结合M2巨噬细胞相关基因构建预后特征,并利用单细胞转录组分析揭示分子亚型和异质性 | 研究基于公共数据库的芯片数据,需要进一步实验验证 | 预测肺腺癌患者的免疫治疗疗效和预后 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | WGCNA, LASSO分析, 单细胞转录组分析 | 风险特征模型 | 基因表达芯片数据 | 来自GSE26939和GSE19188数据集的样本 | NA | 基因表达芯片, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1947 | 2025-10-07 |
Identification of Five NK Cell-Related Hub Genes in COPD Using Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S491298
PMID:39963682
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定COPD中五个NK细胞相关枢纽基因 | 首次通过单细胞RNA测序结合生物信息学方法系统分析COPD中NK细胞亚群的特征基因,并鉴定出五个关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于RT-qPCR,需要进一步的功能实验验证 | 探索COPD免疫浸润中的关键基因 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, 伪时间分析 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用GSE57148和GSE8581数据集,包含COPD患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1948 | 2025-10-07 |
SPP1 as a Prognostic and Immunotherapeutic Biomarker in Gliomas and Other Cancer Types: A Pan-Cancer Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505237
PMID:39963684
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨SPP1作为胶质瘤和其他癌症预后及免疫治疗生物标志物的作用 | 首次在泛癌水平系统分析SPP1的预后价值和免疫治疗潜力,并通过单细胞测序揭示其在胶质瘤微环境中的特异性表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析,临床验证数据有限,需要进一步实验和临床试验确认 | 评估SPP1作为癌症预后和免疫治疗生物标志物的潜力 | 胶质瘤(包括胶质母细胞瘤)及其他26种肿瘤类型 | 生物信息学 | 胶质瘤, 泛癌 | 单细胞测序, 基因敲低, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床生存数据 | 来自TCGA、GEO和TISCH数据库的多癌种样本,包括27种肿瘤类型 | UCSC, GEO, TISCH | 单细胞RNA-seq, 泛癌分析 | TCGA Pan-Cancer, TCGA-GBM, UALCAN | UCSC TCGA泛癌数据集、TCGA胶质母细胞瘤数据集、UALCAN分析平台 |
| 1949 | 2025-10-07 |
Competing endogenous RNA networks in ovarian cancer: from bench to bedside
2025, EXCLI journal
IF:3.8Q1
DOI:10.17179/excli2024-7827
PMID:39967908
|
综述 | 全面综述卵巢癌中竞争性内源RNA网络的作用机制及其临床应用前景 | 整合单细胞RNA测序与个性化医疗视角,系统阐述ceRNA网络在卵巢癌中的新型调控机制 | 属于综述性文章,未包含原始实验数据验证 | 探讨ceRNA网络在卵巢癌发生发展中的作用及临床转化价值 | 卵巢癌细胞中的miRNA、circRNA、lncRNA及其构成的ceRNA调控网络 | 自然语言处理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1950 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a potential role of ATF3 in brain metastasis of lung adenocarcinoma
2025-Jan-24, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-784
PMID:39958219
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示ATF3在肺腺癌脑转移中的潜在作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术解析肺腺癌脑转移的细胞组成空间分布,发现ATF3是间质-上皮转化程序的潜在调控因子 | 样本量较小(3例自测样本+10例公共数据验证) | 解析肺腺癌脑转移的细胞组成空间分布并识别潜在治疗靶点 | 肺腺癌脑转移肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, Western blotting, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 3例LUAD脑转移样本(自测)+10例LUAD脑转移样本(公共数据) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 1951 | 2025-10-07 |
Evaluation of Salivary Diagnostics: Applications, Benefits, Challenges, and Future Prospects in Dental and Systemic Disease Detection
2025-Jan, Cureus
DOI:10.7759/cureus.77520
PMID:39958008
|
综述 | 本文评估了唾液诊断在口腔和全身疾病检测中的应用、优势、挑战及未来前景 | 系统总结了唾液诊断技术的最新进展,包括唾液组学、单细胞测序等新兴技术在疾病诊断中的应用 | 存在唾液样本变异性和标准化方面的挑战,需要进一步研究解决 | 评估唾液诊断技术在疾病检测中的临床应用价值和发展前景 | 人类唾液样本及相关生物标志物 | 医学诊断 | 糖尿病、心血管疾病、癌症(胰腺癌、前列腺癌) | ELISA、唾液组学、单细胞测序、定量质谱、拉曼光谱 | NA | 生物标志物数据、文献资料 | 基于文献综述,未指定具体样本数量 | NA | 单细胞测序、质谱分析、光谱分析 | NA | NA |
| 1952 | 2025-10-07 |
Transcriptomic analysis of EGFR co-expression and activation in glioblastoma reveals associations with its ligands
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae229
PMID:39959305
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了胶质母细胞瘤中EGFR共表达和激活机制,及其与配体的关联 | 首次系统比较GBM和LUAD中EGFR信号传导模式的差异,并发现BTC和EREG配体与EGFR表达的负相关关系 | 样本量相对有限(TCGA-GBM: 169例,Intellance-2: 166例),且为回顾性分析 | 阐明GBM和LUAD之间EGFR激活和调控分子机制的差异 | 胶质母细胞瘤和肺腺癌患者 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | TCGA-GBM队列169例,Intellance-2队列166例 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1953 | 2025-10-07 |
Dual Role of α-MSH in Colitis Progression: Mediating Neutrophil Differentiation via Bone Marrow
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503621
PMID:39959638
|
研究论文 | 本研究揭示了结肠炎通过激活下丘脑-垂体轴促进α-MSH分泌,进而调控骨髓造血干细胞分化为中性粒细胞的分子机制 | 首次发现α-MSH在结肠炎进展中的双重作用机制,既能增强急性期病原体清除,又能在缓解期诱导持续炎症反应 | 研究主要基于小鼠DSS诱导的结肠炎模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究下丘脑-垂体轴在炎症性肠病发病过程中的作用机制 | DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 免疫荧光,RT-qPCR,ELISA,流式细胞术,腺相关病毒介导的基因沉默,联体共生,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1954 | 2025-10-07 |
TIMD4hiMHCⅡhi Macrophages Preserve Heart Function Through Retnla
2025-Jan, JACC. Basic to translational science
DOI:10.1016/j.jacbts.2024.08.009
PMID:39906591
|
研究论文 | 研究发现TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞通过Retnla基因保护心脏功能 | 首次确认TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞亚群的存在及其通过Retnla/RELMα保护心脏功能的新机制 | NA | 探究TIMD4hiMHCⅡhi巨噬细胞在心脏功能保护中的作用机制 | 心脏组织巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序,遗传命运图谱 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1955 | 2025-10-07 |
Long Non-Coding RNAs in Ovarian Cancer: Mechanistic Insights and Clinical Applications
2025-Jan-30, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030472
PMID:39941838
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综述 | 本文探讨长链非编码RNA在卵巢癌中的分子机制及其临床转化潜力 | 系统阐述lncRNAs在卵巢癌中作为癌基因和抑癌基因的双重调控作用,并评估单细胞测序等新兴技术对肿瘤异质性的解析能力 | NA | 分析lncRNAs在卵巢癌发病机制中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 卵巢癌相关长链非编码RNA(如HOTAIR、GAS5) | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、组学分析、生物信息学 | NA | 文献数据、组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1956 | 2025-10-07 |
Stem cell expression of CXCR4 regulates tissue composition in the vomeronasal organ
2025-Jan-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.263451
PMID:39639824
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了CXCR4在犁鼻器干细胞中的表达及其对组织组成的调控作用 | 首次发现CXCR4在犁鼻器增殖干细胞和基底神经元谱系中的表达,并证明其条件性敲除会改变干细胞数量和神经元成熟过程 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在其他物种验证;对87个转录因子的功能验证仍需进一步实验 | 探究CXCR4在犁鼻器干细胞分化和组织组成调控中的作用机制 | 小鼠犁鼻器组织及其干细胞和神经元谱系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,谱系追踪,计算基因扰动分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1957 | 2025-10-07 |
Heterogeneity in Cancer
2025-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030441
PMID:39941808
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综述 | 本文探讨癌症异质性对肿瘤学的挑战及其临床意义 | 强调通过新兴分子诊断技术揭示癌症异质性的多维复杂性,并探索其在转移灶治疗耐药和复发中的作用 | NA | 讨论癌症异质性的临床意义,推动个性化治疗方法的开发 | 癌症患者、转移灶和个体病变 | 肿瘤学 | 癌症 | 下一代测序、单细胞转录组学、液体活检技术、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1958 | 2025-10-07 |
The Cell States of Sea Urchin During Metamorphosis Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jan-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031059
PMID:39940825
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示海胆变态过程中的细胞状态变化 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统描绘海胆变态过程中幼虫和幼体的细胞状态,揭示了六种主要细胞群体及其亚群的动态变化 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,对分子机制的研究深度有限 | 探究海胆变态过程中的细胞状态变化和分子机制 | 海胆幼虫和幼体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1959 | 2025-10-07 |
Single-Cell Analysis Dissects the Effects of Vitamin D on Genetic Senescence Signatures Across Murine Tissues
2025-Jan-24, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17030429
PMID:39940287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析维生素D对小鼠多个组织中细胞衰老遗传特征的影响 | 首次在多个组织中系统评估维生素D对细胞衰老特征的影响,并揭示其通过调节炎症和代谢过程缓解衰老负担的机制 | 研究基于公共数据库的小鼠组织数据,缺乏人体验证 | 探究维生素D在细胞衰老过程中的作用机制及其在年龄相关疾病中的治疗潜力 | 小鼠的骨组织、前列腺和皮肤组织 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 三个小鼠组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1960 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics in Human Cardiac Tissue
2025-Jan-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26030995
PMID:39940764
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综述 | 本文综述了空间转录组学在人类心脏组织中的应用现状、技术平台和研究进展 | 聚焦商业化的空间转录组学平台,为初学者提供实用指南,并强调其在心脏研究中的多领域应用潜力 | 存在技术挑战限制了其广泛应用和普及 | 探索空间转录组学在人类心脏研究中的应用价值 | 人类心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |