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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2025-10-07 |
Heterogeneity in Cancer
2025-Jan-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030441
PMID:39941808
|
综述 | 本文探讨癌症异质性对肿瘤学的挑战及其临床意义 | 强调通过新兴分子诊断技术揭示癌症异质性的多维复杂性,并探索其在转移灶治疗耐药和复发中的作用 | NA | 讨论癌症异质性的临床意义,推动个性化治疗方法的开发 | 癌症患者、转移灶和个体病变 | 肿瘤学 | 癌症 | 下一代测序、单细胞转录组学、液体活检技术、人工智能 | NA | 分子数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1862 | 2025-10-07 |
The Cell States of Sea Urchin During Metamorphosis Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jan-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26031059
PMID:39940825
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示海胆变态过程中的细胞状态变化 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统描绘海胆变态过程中幼虫和幼体的细胞状态,揭示了六种主要细胞群体及其亚群的动态变化 | 未明确说明样本数量和技术重复情况,对分子机制的研究深度有限 | 探究海胆变态过程中的细胞状态变化和分子机制 | 海胆幼虫和幼体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1863 | 2025-10-07 |
Single-Cell Analysis Dissects the Effects of Vitamin D on Genetic Senescence Signatures Across Murine Tissues
2025-Jan-24, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17030429
PMID:39940287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析维生素D对小鼠多个组织中细胞衰老遗传特征的影响 | 首次在多个组织中系统评估维生素D对细胞衰老特征的影响,并揭示其通过调节炎症和代谢过程缓解衰老负担的机制 | 研究基于公共数据库的小鼠组织数据,缺乏人体验证 | 探究维生素D在细胞衰老过程中的作用机制及其在年龄相关疾病中的治疗潜力 | 小鼠的骨组织、前列腺和皮肤组织 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 三个小鼠组织数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1864 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics in Human Cardiac Tissue
2025-Jan-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26030995
PMID:39940764
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综述 | 本文综述了空间转录组学在人类心脏组织中的应用现状、技术平台和研究进展 | 聚焦商业化的空间转录组学平台,为初学者提供实用指南,并强调其在心脏研究中的多领域应用潜力 | 存在技术挑战限制了其广泛应用和普及 | 探索空间转录组学在人类心脏研究中的应用价值 | 人类心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1865 | 2025-10-07 |
Deciphering the Role of Cancer Stem Cells: Drivers of Tumor Evolution, Therapeutic Resistance, and Precision Medicine Strategies
2025-Jan-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17030382
PMID:39941751
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综述 | 全面分析癌症干细胞在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用及其精准医疗策略 | 系统整合CSC生物学特性与新兴技术应用,提出多学科协同研究框架 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 阐明癌症干细胞在肿瘤进化中的作用并探索精准医疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9,单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1866 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals cell heterogeneity and aberrantly activated pathways associated with microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1449624
PMID:39944086
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌微血管侵犯相关的细胞异质性和异常激活通路 | 首次在单细胞水平识别MVI阳性恶性细胞亚型,发现MARCKSL1基因通过PTN信号网络促进MVI进展 | 样本量较小(仅5例患者),需要进一步实验验证MARCKSL1的功能 | 探索肝细胞癌微血管侵犯的细胞异质性、生物标志物和细胞间信号相互作用 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据 | 5例肝细胞癌患者(其中3例显示微血管侵犯) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1867 | 2025-10-07 |
The quality of SIV-specific fCD8 T cells limits SIV RNA production in Tfh cells during antiretroviral therapy
2025-Jan-31, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00812-24
PMID:39641620
|
研究论文 | 本研究探讨了SIV特异性滤泡CD8 T细胞在抗逆转录病毒治疗期间对Tfh细胞中SIV RNA产生的限制作用 | 首次在SIV慢性感染模型中系统分析滤泡CD8 T细胞对潜伏感染Tfh细胞的影响,并发现其频率与Tfh细胞中病毒RNA量呈负相关 | 研究样本量有限(15只食蟹猴),且为动物模型研究,结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 研究HIV/SIV特异性滤泡CD8 T细胞在抗逆转录病毒治疗期间对潜伏感染细胞的调控作用 | 食蟹猴(15只)的Tfh细胞和滤泡CD8 T细胞 | 免疫学 | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序, 激活诱导标记分析, 组织切片分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 组织学数据 | 15只食蟹猴(8只进展者,7只自然控制者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1868 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of SLC family transporters: uncovering the role of SLC7A1 in osteosarcoma
2025-Jan-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06086-1
PMID:39844299
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析揭示SLC7A1在骨肉瘤恶性进展中的作用机制 | 首次在骨肉瘤中系统分析SLC转运蛋白家族表达谱,发现SLC7A1的关键作用并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究SLC家族转运蛋白在骨肉瘤中的作用并寻找新的治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO回归, 虚拟对接 | 预后特征模型 | 单细胞测序数据, RNA-seq数据 | GSE152048、GSE162454、TARGET和GSE21257四个队列的数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1869 | 2025-10-07 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
|
研究论文 | 本研究鉴定出一种表达免疫抑制效应分子模拟调节性T细胞的胶质瘤干细胞亚群,该亚群通过TGFBR2驱动抑制CD4+和CD8+ T细胞功能 | 首次发现间充质胶质瘤干细胞通过TGFBR2(而非TGFBR1)驱动免疫抑制性Treg样表型,并鉴定出6基因特征标志物 | 研究主要基于患者来源细胞和临床样本,需要进一步体内验证 | 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中胶质瘤干细胞的免疫调节机制 | 患者来源的胶质瘤干细胞、临床胶质母细胞瘤标本、CD4+和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序、生物信息学分析、分子操作、药理学干预 | NA | 测序数据、基因表达数据、临床数据 | 患者来源细胞和临床标本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1870 | 2025-10-07 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-Jan, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00298-9
PMID:39548236
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了APOBEC3A在鳞状上皮和鳞状细胞癌中通过GRHL3转录因子表达的分化信号机制 | 首次发现APOBEC3A表达受GRHL3调控并局限于终末分化细胞,而在鳞癌中该表达扩展至增殖细胞 | 研究主要聚焦于鳞状上皮和鳞癌,其他类型癌症中的机制尚需进一步验证 | 探究APOBEC脱氨酶在正常组织和癌症中的表达调控机制及其在肿瘤发生中的作用 | 健康黏膜上皮和恶性黏膜上皮组织 | 单细胞生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,空间转录组学,功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1871 | 2025-10-07 |
Bronchoalveolar lavage single-cell transcriptomics reveals immune dysregulations driving COVID-19 severity
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0309880
PMID:39928675
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19重症患者支气管肺泡灌洗液中免疫细胞失调机制 | 首次在单细胞水平系统揭示COVID-19重症患者中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞和T细胞的协同失调机制 | 基于二次数据分析,缺乏实验验证;样本量未明确说明 | 探索COVID-19疾病严重程度的免疫学机制 | COVID-19患者和健康对照的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1872 | 2025-10-07 |
Detection of hepatitis B virus mRNA from single cell RNA sequencing data without prior knowledge
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0314060
PMID:39932940
|
研究论文 | 本研究开发了一种无需先验知识即可从单细胞RNA测序数据中检测乙型肝炎病毒mRNA的方法 | 无需16S rRNA扩增或先验知识即可直接从scRNA-seq数据中检测病毒mRNA | 仅验证了乙型肝炎病毒,且依赖病毒mRNA具有poly-A尾的特征 | 开发从单细胞RNA测序数据中检测病毒mRNA的新方法 | 慢性乙型肝炎病毒感染患者的肝脏样本 | 单细胞测序分析 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 慢性HBV感染患者肝脏样本(包括有和无HBsAg消失的患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1873 | 2025-10-07 |
Integrative multi-omics analysis for identifying novel therapeutic targets and predicting immunotherapy efficacy in lung adenocarcinoma
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2024.91
PMID:39935429
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研究论文 | 通过整合多组学分析识别肺腺癌的新型治疗靶点并预测免疫治疗疗效 | 识别了11个不同的细胞亚群和两种分子亚型,开发了多组学驱动的机器学习特征,发现RRM1作为化疗反应的关键生物标志物 | NA | 阐明肺腺癌的细胞亚群和分子亚型,识别关键生物标志物,探索潜在治疗靶点 | 肺腺癌患者队列 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 全基因组关联研究 | 贝叶斯反卷积, 机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1874 | 2025-10-07 |
Identification of WDR74 and TNFRSF12A as biomarkers for early osteoarthritis using machine learning and immunohistochemistry
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1517646
PMID:39935469
|
研究论文 | 通过机器学习和免疫组化技术鉴定WDR74和TNFRSF12A作为早期骨关节炎的生物标志物 | 首次整合泛素化相关基因表达数据与机器学习方法识别早期骨关节炎生物标志物 | 研究样本来源单一(GEO数据库),需要更多临床样本验证 | 改善早期骨关节炎的诊断和预后 | 骨关节炎患者的软骨细胞 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化 | XGBoost | 基因表达数据,图像数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和人膝关节标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1875 | 2025-10-07 |
Exploring Core Genes Associated with Sepsis and Systemic Inflammatory Response Syndrome Using Single-Cell Sequencing Technology
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S448900
PMID:39935525
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术探索脓毒症和全身炎症反应综合征的核心基因 | 首次通过单细胞转录组分析揭示脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本中免疫细胞亚群的差异表达基因 | 样本量有限,缺乏独立验证队列 | 识别脓毒症和SIRS的独特生物标志物和免疫应答模式 | 脓毒症死亡患者和全身炎症反应综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症,全身炎症反应综合征 | 单细胞RNA测序 | UMAP细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1876 | 2025-10-07 |
Tgfβ signaling stimulates glycolysis to promote the genesis of synovial joint interzone in developing mouse embryonic limbs
2025-Jan-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq4991
PMID:39772668
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现滑膜关节初始区细胞形成需要糖酵解增强,且这一过程部分依赖于Tgfβ信号通路 | 首次揭示糖酵解在软骨细胞向关节初始区细胞转化中的关键作用,并阐明Tgfβ信号通过mTOR和Hif1α激活糖酵解的分子机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究滑膜关节初始区细胞形成的分子机制 | 小鼠胚胎膝关节原基 | 发育生物学 | 关节发育异常 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎膝关节原基细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1877 | 2025-10-07 |
APMAT analysis reveals the association between CD8 T cell receptors, cognate antigen, and T cell phenotype and persistence
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631993
PMID:39829843
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研究论文 | 开发APMAT框架用于高通量捕获和分析CD8 T细胞,揭示抗原-TCR对的理化特征与T细胞表型和持久性的关联 | 首次提出整合实验与计算的APMAT框架,能够同时捕获抗原、TCR序列和单细胞转录组数据 | 研究样本仅限于HLA A*02:01基因型的COVID-19参与者 | 阐明CD8 T细胞受体、抗原和T细胞表型之间的关联关系 | CD8 T细胞及其受体、SARS-CoV-2病毒抗原 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, TCR测序 | 计算分析框架 | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | 62名HLA A*02:01 COVID-19参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1878 | 2025-10-07 |
TDO2 + cancer-associated fibroblasts mediate cutaneous squamous cell carcinoma immune escape via impeding infiltration of CD8 + T cells
2025-Jan-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03921-0
PMID:39751882
|
研究论文 | 本研究揭示TDO2+癌症相关成纤维细胞通过抑制CD8+T细胞浸润介导皮肤鳞状细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次报道TDO2在cSCC的CAFs中高表达及其通过抑制CD8+T细胞浸润促进免疫逃逸的作用机制 | NA | 探索皮肤鳞状细胞癌免疫逃逸的分子机制 | 皮肤鳞状细胞癌组织、癌症相关成纤维细胞、CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1879 | 2025-10-07 |
Identification of EGR1 as a Key Diagnostic Biomarker in Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) Through Machine Learning and Immune Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499396
PMID:39925925
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研究论文 | 通过机器学习和免疫分析鉴定EGR1作为代谢功能障碍相关脂肪性肝病的关键诊断生物标志物 | 首次结合多种机器学习方法和免疫分析鉴定EGR1作为MASLD的关键诊断生物标志物,并构建了TF-miRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证 | 识别MASLD的有效诊断生物标志物并探索其发病机制 | MASLD患者基因表达数据、AML-12细胞系、MCD小鼠模型 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、机器学习算法 | LASSO, SVM, Random Forest | 基因表达数据 | 六个GEO数据集,包括训练集和验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 1880 | 2025-10-07 |
Crosstalk of SPINK4 Expression With Patient Mortality, Immunotherapy and Metastasis in Pan-Cancer Based on Integrated Multi-Omics Analyses
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S487126
PMID:39926372
|
研究论文 | 基于多组学分析揭示SPINK4基因表达与泛癌患者死亡率、免疫治疗和转移的相互作用 | 首次系统研究SPINK4在泛癌中的表达特征及其与肿瘤微环境、干细胞特性、免疫浸润和化疗敏感性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库分析,实验验证仅限于结肠腺癌细胞系 | 探究SPINK4在不同癌症类型中的功能及其与肿瘤进展的关系 | 泛癌患者组织样本和结肠腺癌细胞系(HCT116和RKO) | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析,单细胞测序,伤口愈合实验,Transwell实验 | Kaplan-Meier生存分析,Pearson相关分析 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | TCGA数据库中的泛癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |