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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1821 | 2025-10-07 |
KLRD1 (CD94): A Prognostic Biomarker and Therapeutic Candidate in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104762
PMID:39781341
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了KLRD1在头颈鳞状细胞癌中的预后价值和免疫治疗潜力 | 首次系统评估KLRD1在多种癌症中的表达模式及其与预后的关系,并发现其在头颈鳞状细胞癌中作为独立预后因子的价值 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索KLRD1在癌症中的表达特征、预后价值和免疫治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和多种癌症类型的基因组数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学数据分析, 免疫浸润分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 来自TCGA、GTEx和GEO数据库的多癌症类型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1822 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis unveils cell subtypes of acral melanoma cells at the early and late differentiation stages
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.102045
PMID:39781353
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示肢端黑色素瘤在早期和晚期分化阶段的细胞亚型 | 首次识别出C3 ID2+黑色素瘤细胞作为早期亚群和C4 PCLAF+细胞作为晚期亚群在肢端黑色素瘤演化中的作用 | 仅包含6例患者样本,样本量有限,且黑色素瘤相关研究仍需进一步完善 | 研究肢端黑色素瘤的异质性及其进展机制 | 肢端黑色素瘤患者的黑色素瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 6例黑色素瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1823 | 2025-10-07 |
Elucidating the Role of Estrogen Effects in Leukemia: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.100610
PMID:39781360
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法探索雌激素及其受体与白血病之间的因果关系 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法相结合研究雌激素与白血病的分子关系 | 方法学间存在不一致性,需要更大样本量和更高测序深度来阐明相互作用的复杂性 | 阐明雌激素效应在白血病中的作用机制 | 雌激素及其受体、白血病及相关蛋白 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 遗传风险评分分析 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞转录组数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1824 | 2025-10-07 |
TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3-mediated Mechano-metabolic Axis Promotes Skin Fibrosis
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.104484
PMID:39781462
|
研究论文 | 本研究揭示了TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3机械代谢轴在皮肤纤维化疾病中的作用机制 | 首次发现TAGLN通过RhoA/ROCK2通路调控SLC2A3表达,建立机械环境与细胞代谢之间的联系 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化仍需进一步验证 | 探究TAGLN在皮肤纤维化发病机制中的作用 | 皮肤成纤维细胞和博来霉素诱导的小鼠皮肤纤维化模型 | 细胞生物学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞测序,RNA-seq,Transwell,伤口愈合实验,胶原凝胶收缩实验,免疫荧光 | NA | 基因表达数据,细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |
| 1825 | 2025-10-07 |
Intestinal Subtype as a Biomarker of Response to Neoadjuvant Immunochemotherapy in Locally Advanced Gastric Adenocarcinoma: Insights from a Prospective Phase II Trial
2025-Jan-06, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2436
PMID:39495175
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研究论文 | 本研究通过前瞻性II期临床试验发现肠道亚型可作为局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗疗效的生物标志物 | 首次发现Lauren分型中的肠道亚型与NAIC疗效相关,并构建了基于DNA损伤修复活性癌细胞和CLEC9A+树突状细胞的机器学习预测模型 | 单臂II期研究设计,样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探索局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗的疗效预测生物标志物 | 局部晚期胃腺癌患者 | 数字病理学 | 胃腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NaiveBayes | 转录组数据 | 104个样本(来自两个独立队列的75名患者)和105个初治胃腺癌单细胞RNA测序数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1826 | 2025-10-07 |
Mapping epidermal and dermal cellular senescence in human skin aging
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14358
PMID:39370688
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术研究人类皮肤衰老中表皮和真皮细胞衰老的特征 | 开发了皮肤特异性细胞衰老基因集SenSkin™,并首次在单细胞水平系统揭示光老化和时序性衰老中不同皮肤细胞类型的衰老特征 | 研究主要关注特定细胞类型(黑色素细胞和成纤维细胞),可能未完全覆盖所有皮肤细胞类型的衰老特征 | 探究人类皮肤衰老过程中表皮和真皮细胞衰老的分子机制和空间分布特征 | 人类皮肤组织中的黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1827 | 2025-10-07 |
Senescence landscape in the liver following sepsis and senolytics as potential therapeutics
2025-Jan, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14354
PMID:39444093
|
研究论文 | 本研究揭示了脓毒症诱导的肝脏细胞衰老景观及其对预后的影响 | 首次描述了脓毒症肝脏中的衰老景观,并证明衰老清除剂可显著降低脓毒症死亡率 | 研究仅使用小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究脓毒症诱导的肝脏细胞衰老机制及潜在治疗策略 | CLP诱导的脓毒症小鼠模型肝脏组织 | 生物医学研究 | 脓毒症 | 单细胞测序,RNAscope,共聚焦显微镜,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据,流式数据 | 脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1828 | 2025-01-07 |
Targeting MAPK14 in microglial cells: neuroimmune implications of Panax ginseng in post-stroke inflammation
2025-Jan-06, The Journal of pharmacy and pharmacology
IF:2.8Q2
DOI:10.1093/jpp/rgae067
PMID:38902954
|
研究论文 | 本研究探讨了人参和三七皂苷(PNS)通过分子机制减轻缺血性中风后的神经炎症损伤并促进神经修复 | 揭示了Ginsenoside-Rc通过调节MAPK14活性抑制神经炎症的创新机制 | 研究主要基于实验模型,尚未进行临床试验验证 | 阐明人参和三七皂苷在缺血性中风后神经炎症损伤中的作用及其分子机制 | 小胶质细胞和神经炎症反应 | 神经科学 | 中风 | 单细胞测序、转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1829 | 2025-01-07 |
A pan-immune panorama of bacterial pneumonia revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
2025-Jan-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02093-8
PMID:39757231
|
研究论文 | 本文通过大规模单细胞转录组图谱揭示了细菌性肺炎的全免疫全景 | 首次使用单细胞RNA测序技术对444,146个支气管肺泡灌洗液细胞进行分析,揭示了细菌性肺炎中免疫反应的异质性及其与疾病严重程度的关系 | 样本量相对较小,仅包括74名个体,且未涵盖所有可能的细菌性肺炎亚型 | 深入了解细菌性肺炎的发病机制,寻找潜在的治疗靶点 | 74名个体,包括58名轻度(n=22)和重度(n=36)细菌性肺炎患者以及16名健康捐赠者 | 数字病理学 | 细菌性肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 444,146个支气管肺泡灌洗液细胞,来自74名个体 | NA | NA | NA | NA |
| 1830 | 2025-01-07 |
Single-cell RNA-sequencing and genome-wide Mendelian randomisation along with abundant machine learning methods identify a novel B cells signature in gastric cancer
2025-Jan-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01759-1
PMID:39760915
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和全基因组孟德尔随机化结合多种机器学习方法,识别出胃癌中的一种新型B细胞特征 | 结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和机器学习方法,识别出胃癌中的新型B细胞特征,并发现NFKBIE作为潜在的生物标志物和治疗靶点 | 研究依赖于公开数据库的数据,可能存在样本选择偏差 | 识别胃癌中的新型B细胞特征,并探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 胃癌患者的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序、孟德尔随机化、机器学习 | 机器学习集成方法 | RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1831 | 2025-01-07 |
Optimized methods for scRNA-seq and snRNA-seq of skeletal muscle stored in nucleic acid stabilizing preservative
2025-Jan-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07445-2
PMID:39755918
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研究论文 | 本文开发了一种从保存在Allprotect®组织试剂中的人类骨骼肌中获取高质量细胞和细胞核的协议,用于单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) | 开发了一种从存档组织中获取高质量单细胞基因组材料的新协议,解决了国际多中心研究和存档组织研究中新鲜起始材料的障碍 | 流式细胞仪分选虽然成功富集了更高质量的细胞和细胞核,但导致输入材料总体减少 | 优化从存档骨骼肌组织中获取高质量单细胞和单核RNA测序材料的方法 | 人类骨骼肌组织 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1832 | 2025-01-07 |
The molecular mechanism of gemcitabine in inhibiting the HIF-1α/VEGFB/FGF2/FGFR1 signaling pathway for ovarian cancer treatment
2025-Jan-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01723-5
PMID:39752011
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研究论文 | 本研究通过分析卵巢癌单细胞RNA测序数据和吉西他滨治疗后的转录组数据,揭示了缺氧诱导因子1α(HIF-1α)在调节治疗过程中的关键作用 | 揭示了HIF-1α在吉西他滨治疗卵巢癌中的分子机制,特别是其通过调节VEGF-B表达抑制FGF2/FGFR1信号通路的角色 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内实验验证 | 探索吉西他滨治疗卵巢癌的分子机制 | 卵巢癌细胞 | 分子生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),转录组分析 | NA | RNA测序数据,转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1833 | 2025-01-07 |
Machine learning based identification of an amino acid metabolism related signature for predicting prognosis and immune microenvironment in pancreatic cancer
2025-Jan-03, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-024-13374-4
PMID:39754071
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研究论文 | 本研究通过整合10种机器学习算法,识别出与胰腺癌预后和免疫微环境相关的氨基酸代谢特征,并验证了其在不同队列中的有效性 | 结合10种机器学习方法,首次识别出基于4个基因的氨基酸代谢特征,并揭示了其与胰腺癌预后、免疫微环境及治疗反应的关联 | 研究依赖于机器学习算法的组合,可能存在模型选择和参数优化的局限性 | 探索氨基酸代谢特征在胰腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 胰腺癌患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 机器学习算法、GSEA、TMB分析、药物敏感性分析、CIBERSORT、ssGSEA、单细胞转录组学、qPCR、免疫组化 | 多种机器学习算法组合 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床数据 | 内部和外部队列的胰腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1834 | 2025-01-07 |
Potential role of P4HB in the tumor microenvironment and its clinical prognostic value: a comprehensive pan-cancer analysis and experimental validation with a focus on KIRC
2025-Jan-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03575-z
PMID:39754183
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研究论文 | 本文通过全面的泛癌分析和实验验证,探讨了P4HB在肿瘤微环境中的潜在作用及其在肾透明细胞癌(KIRC)中的临床预后价值 | 首次全面分析了P4HB在泛癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系,并通过实验验证了P4HB在肾透明细胞癌中的致癌作用 | 研究主要基于TCGA和HPA数据库,实验验证仅限于肾透明细胞癌细胞,未涉及其他癌症类型 | 探讨P4HB在肿瘤微环境中的作用及其在肾透明细胞癌中的临床预后价值 | 泛癌数据及肾透明细胞癌细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序、免疫细胞浸润分析、集落形成实验、伤口愈合实验 | NA | RNA和蛋白质表达数据 | TCGA数据库中的泛癌数据及肾透明细胞癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1835 | 2025-01-07 |
The Kidney Precision Medicine Project and Single-Cell Biology of the Injured Proximal Tubule
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.09.006
PMID:39332674
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在健康和疾病状态下近端小管亚型理解中的主要进展,并介绍了肾脏精准医学项目的scRNA-seq图谱中定义的主要细胞状态 | 通过整合肾脏精准医学项目与其他重要研究的scRNA-seq数据,明确了近端小管细胞在损伤和再生过程中的关键转录组标记 | 不同研究可能使用不同的命名法或聚类分辨率来定义细胞状态亚型,可能导致数据整合和比较的复杂性 | 理解近端小管细胞在损伤和再生过程中的关键转录组标记 | 近端小管细胞 | 精准医学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1836 | 2025-01-07 |
Aspiration of acidified milk induces milk allergy by activating alveolar macrophages in mice
2025-Jan, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2024.08.001
PMID:39209584
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研究论文 | 本研究通过开发一种新型小鼠模型,探讨了胃食管反流(GER)在牛奶过敏(CMA)发展中的潜在致病机制,并阐明了肺部先天免疫与CMA之间的免疫学联系 | 开发了一种利用天然抗原并遵循生理性气道致敏途径的新型小鼠模型,命名为酸化牛奶吸入诱导过敏模型,该模型可能更接近临床场景 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证 | 探讨胃食管反流在牛奶过敏发展中的作用及其免疫学机制 | 小鼠 | 免疫学 | 牛奶过敏 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠模型 | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1837 | 2025-01-07 |
TPD52 as a Therapeutic Target Identified by Machine Learning Shapes the Immune Microenvironment in Breast Cancer
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70333
PMID:39757112
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研究论文 | 本研究利用机器学习方法探讨了肿瘤蛋白D52(TPD52)在乳腺癌中作为关键免疫调节因子的作用 | 通过机器学习方法识别TPD52作为乳腺癌免疫微环境的关键调节因子,并结合单细胞RNA测序和体外验证进行研究 | 未提及具体样本量,可能限制了结果的普适性 | 探讨TPD52在乳腺癌免疫微环境中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌及其免疫微环境 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1838 | 2025-01-06 |
Increased lamina propria B cells play roles in fructose-induced hypertension of Dahl salt-sensitive rats
2025-Jan-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123314
PMID:39675553
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研究论文 | 本文研究了高果糖饮食对Dahl盐敏感大鼠高血压的影响,特别是肠道固有层B细胞的作用 | 通过单细胞RNA测序技术,首次揭示了高果糖饮食诱导的高血压中肠道固有层B细胞的作用 | 研究仅针对Dahl盐敏感大鼠,未涉及其他动物模型或人类样本 | 探讨高果糖饮食诱导的高血压中免疫细胞的作用 | Dahl盐敏感大鼠和Dahl盐抵抗大鼠 | 免疫学 | 高血压 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | Dahl盐敏感大鼠和Dahl盐抵抗大鼠,每组接受自来水或20%果糖溶液4周 | NA | NA | NA | NA |
| 1839 | 2025-01-06 |
Transcriptomic DN3 clock neuron subtypes regulate Drosophila sleep
2025-Jan-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr4580
PMID:39752484
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术,对果蝇大脑中的时钟神经元进行了全面的转录组细胞类型普查,特别关注了DN3神经元亚型及其在睡眠调节中的作用 | 首次对果蝇大脑中DN3时钟神经元进行了全面的转录组分析,揭示了其12个不同的基因表达簇,并发现这些神经元通过G蛋白偶联受体促进睡眠 | 研究主要集中于果蝇模型,结果在人类或其他哺乳动物中的适用性尚不明确 | 探索时钟神经元在睡眠调节中的作用 | 果蝇大脑中的DN3时钟神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 果蝇大脑中的DN3时钟神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 1840 | 2025-01-06 |
Transcriptome and DNA methylation profiling during the NSN to SN transition in mouse oocytes
2025-Jan-03, BMC molecular and cell biology
IF:2.4Q4
DOI:10.1186/s12860-024-00527-3
PMID:39754059
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和DNA甲基化分析,探讨了小鼠卵母细胞从非包围核仁(NSN)到包围核仁(SN)阶段的转变过程中的分子变化 | 开发了一个分类器,能够从单细胞或批量RNA-seq数据中推断染色质状态,并识别了SN卵母细胞中与不寻常染色质修饰组合相关的晚期甲基化区域 | 研究主要集中在小鼠卵母细胞,结果可能不直接适用于其他物种 | 探讨小鼠卵母细胞在NSN到SN转变过程中的转录组和DNA甲基化变化 | 小鼠卵母细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞亚硫酸氢盐测序(scBS-seq) | NA | 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |