单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2025-10-07 |
The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage†
2025-Jan-14, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae136
PMID:39303127
|
研究论文 | 通过单细胞测序发现复发性流产患者母胎界面中dNK1/2和EVT1细胞亚群的缺失 | 首次鉴定出同时表达dNK1和dNK2生物标志物的新NK细胞亚群dNK1/2，并发现其在复发性流产组织中缺失 | NA | 研究复发性流产患者母胎界面的细胞特征异常 | 复发性流产患者和健康捐赠者的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 复发性流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 复发性流产患者和健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1782 | 2025-10-07 |
PerturbDB for unraveling gene functions and regulatory networks
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae777
PMID:39265120
|
研究论文 | 开发了PerturbDB平台，用于整合和分析Perturb-Seq数据集以揭示基因功能和调控网络 | 首个用户友好的Perturb-Seq数据整合平台，通过基因聚类和化学扰动整合识别潜在抑制剂 | 平台依赖现有公开数据集，未提及对新数据类型的扩展支持 | 构建基因功能研究和调控网络解析的平台工具 | 基因功能、调控网络、癌症相关基因 | 生物信息学 | 癌症 | Perturb-Seq, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | Mixscape算法 | 单细胞转录组数据 | 4,518,521个单细胞转录组，涉及10,194个基因在19种细胞系中的敲低实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1783 | 2025-10-07 |
MAPbrain: a multi-omics atlas of the primate brain
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae911
PMID:39420633
|
研究论文 | 介绍了一个名为MAPbrain的灵长类大脑多组学图谱平台 | 开发了首个整合转录组学、表观基因组学和空间转录组学数据的灵长类大脑多组学图谱 | 未明确说明数据整合和分析方法的具体技术限制 | 理解基因如何影响大脑发育及神经系统疾病机制 | 灵长类大脑发育过程 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 多组学技术 | NA | 转录组学、表观基因组学、空间转录组学数据 | 2100万大脑细胞，来自38个关键脑区和436个亚区，涵盖胚胎和成年阶段，包含人类和非人灵长类的164个时间点 | NA | 多组学整合分析 | MAPbrain | 在线交互式多组学分析平台，支持用户数据上传和整合分析 |
| 1784 | 2025-10-07 |
scTWAS Atlas: an integrative knowledgebase of single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae931
PMID:39420631
|
研究论文 | 介绍scTWAS Atlas知识库，这是一个整合单细胞转录组全关联研究数据的综合性数据库 | 开发首个整合文献整理和数据分析的scTWAS综合知识库，提供交互式知识图谱和多组学水平调控网络 | 当前版本仅涵盖34个性状、30种细胞类型和9种细胞条件，覆盖范围有待扩展 | 构建单细胞转录组全关联研究的综合知识库，解决细胞类型异质性解释难题 | 基因-性状关联、细胞类型特异性调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组全关联研究(scTWAS)、单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)分析 | NA | 基因表达数据、关联分析数据、多组学数据 | 2,765,211个关联，涵盖34个性状、30种细胞类型、9种细胞条件和16,470个基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1785 | 2025-10-07 |
CancerSCEM 2.0: an updated data resource of single-cell expression map across various human cancers
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae954
PMID:39460627
|
研究论文 | 介绍单细胞表达图谱数据库CancerSCEM 2.0的更新内容与功能增强 | 新增拷贝数变异评估、转录因子富集、伪时间轨迹构建、生物特征评分等功能，并首次引入单细胞水平癌症代谢图谱 | 未提及具体的技术验证或数据质量评估细节 | 构建和优化人类癌症单细胞表达图谱数据库 | 127个研究项目中的1466个单细胞RNA测序数据集，涵盖74种癌症类型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1466个数据集，涵盖肿瘤、匹配正常组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1786 | 2025-10-07 |
ncPlantDB: a plant ncRNA database with potential ncPEP information and cell type-specific interaction
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1017
PMID:39470718
|
研究论文 | 介绍了一个整合植物非编码RNA和ncRNA编码肽数据的综合数据库ncPlantDB | 首个提供植物ncRNA编码肽信息和细胞类型特异性相互作用网络的综合数据库 | NA | 构建一个包含ncPEP信息和细胞类型特异性相互作用的植物ncRNA数据库 | 43种植物物种的非编码RNA和ncRNA编码肽 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, Ribo-seq分析, 文献挖掘 | NA | 基因组数据, 序列数据, 相互作用数据 | 包含353,140个ncRNAs, 3,799个ncPEPs和4,647,071个相互作用 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1787 | 2025-10-07 |
scLTdb: a comprehensive single-cell lineage tracing database
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae913
PMID:39470724
|
研究论文 | 开发了一个全面的单细胞谱系追踪数据库scLTdb，包含109个经过人工整理和标准化分析的数据集 | 首次构建了专门针对单细胞谱系追踪技术的综合数据库，提供交互式分析模块和细胞命运相关基因特征识别功能 | NA | 构建单细胞谱系追踪数据库以促进对细胞命运决定和谱系分化的理解 | 单细胞谱系追踪数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞谱系追踪技术 | NA | 单细胞测序数据 | 109个数据集 | NA | 单细胞谱系追踪 | NA | NA |
| 1788 | 2025-10-07 |
LnCeCell 2.0: an updated resource for lncRNA-associated ceRNA networks and web tools based on single-cell and spatial transcriptomics sequencing data
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae947
PMID:39470723
|
研究论文 | 介绍更新版lncRNA相关ceRNA网络资源LnCeCell 2.0，整合单细胞和空间转录组测序数据 | 首次将单细胞和空间转录组测序数据整合到ceRNA网络分析中，提供细胞特异性和空间位点特异性的ceRNA互作网络 | NA | 构建精细调控的lncRNA-ceRNA网络资源平台 | lncRNA、ceRNA网络、单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 多种疾病（86种疾病/表型） | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 测序数据、网络数据、临床信息 | 1,002,988个细胞、367,971个空间位点、20,326名癌症患者 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1789 | 2025-10-07 |
Diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia: an overview of the current genomic classification, diagnostic approaches, and future directions
2025-Jan, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15338
PMID:39403021
|
综述 | 概述B细胞急性淋巴细胞白血病的当前基因组分类、诊断方法和未来发展方向 | 重点介绍光学基因组图谱、甲基化分析和单细胞测序等新技术在B-ALL诊断中的应用前景 | NA | 总结B-ALL的最新诊断标准和检测方法，探讨新技术在提高诊断准确性中的作用 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL） | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 下一代测序, 全基因组转录组测序, 光学基因组图谱, 甲基化分析, 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1790 | 2025-10-07 |
c-JUN interacts with HDAC1 as a potential combinatorial therapeutic target in acute myeloid leukemia
2025-Jan-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113927
PMID:39721452
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现c-JUN与HDAC1在急性髓系白血病中的相互作用，并验证其作为联合治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平发现c-JUN在HSC-Prog中的特异性激活，并证实c-JUN与HDAC1的相互作用可作为AML联合治疗新靶点 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步临床验证；样本规模有限 | 探索急性髓系白血病的新型治疗靶点和联合治疗策略 | 急性髓系白血病细胞、造血干细胞祖细胞(HSC-Prog)、小鼠异种移植模型 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 批量RNA测序, 蛋白质印迹, 共免疫沉淀, 流式细胞术, 活体成像 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 活体成像数据 | TCGA-LAML数据集和患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1791 | 2025-01-16 |
Single-cell transcriptomics and epigenomics point to CD58-CD2 interaction in controlling primary melanoma growth and immunity
2025-Jan-15, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12651
PMID:39812166
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1792 | 2025-10-07 |
Prospects of neutrophilic implications against pathobiology of chronic obstructive pulmonary disease: Pharmacological insights and technological advances
2025-Jan-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113634
PMID:39577220
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综述 | 探讨中性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的核心作用及靶向治疗前景 | 系统阐述中性粒细胞通过吞噬作用、脱颗粒和中性粒细胞胞外诱捕网形成在COPD中的关键机制，并提出单细胞RNA测序技术用于探索新型生物标志物 | NA | 阐明中性粒细胞在COPD发病机制中的作用并探索新型治疗策略 | 慢性阻塞性肺疾病患者的中性粒细胞及其生物学活动 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1793 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing of Zebrafish Olfactory Epithelium Identifies Odor-Responsive Candidate Olfactory Receptors
2025-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.13191
PMID:39789807
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析斑马鱼嗅觉上皮细胞，识别出对特定气味刺激响应的候选嗅觉受体 | 优化了斑马鱼嗅觉组织的单细胞分离方法，首次在嗅觉感觉神经元集群中验证了不同嗅觉受体家族的非重叠表达模式，并成功通过即刻早期基因表达关联分析鉴定出对特定气味响应的候选受体 | 研究仅针对斑马鱼模型，结果向其他物种的普适性需要进一步验证 | 利用单细胞RNA测序技术解析斑马鱼嗅觉系统的细胞类型组成和气味响应机制 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 斑马鱼嗅觉玫瑰花结组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1794 | 2025-10-07 |
Advances in modeling cellular state dynamics: integrating omics data and predictive techniques
2025, Animal cells and systems
IF:2.5Q1
DOI:10.1080/19768354.2024.2449518
PMID:39807350
|
综述 | 本文全面综述了细胞状态动态建模的最新方法及其在生物过程研究中的应用 | 整合多组学数据与预测技术，系统比较不同建模方法的优劣并指导模型选择策略 | NA | 开发更稳健可解释的细胞状态动态模型以推进精准医疗 | 细胞状态动态变化过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组学 | 深度学习, 生物分子网络模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1795 | 2025-01-15 |
Characterizing tertiary lymphoid structures associated single-cell atlas in breast cancer patients
2025-Jan-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03635-y
PMID:39806382
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，研究了乳腺癌患者中与三级淋巴结构（TLS）相关的区域，并识别了18种细胞类型及其相互作用 | 首次在单细胞水平上详细描述了乳腺癌中TLS相关区域的细胞组成和细胞间通讯，揭示了巨噬细胞在TLS中的谱系转变和特定T细胞与B细胞的强相互作用 | 研究主要依赖于高分辨率技术，可能受限于样本量和技术的覆盖范围 | 探索乳腺癌中TLS相关区域的细胞组成和功能，以增强对免疫治疗反应的理解 | 乳腺癌患者的TLS相关区域 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学（ST） | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 四个独立的乳腺癌数据集，包括一个来自10×Xenium平台的细胞级分辨率数据集和三个来自10×Visium平台的斑点级数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1796 | 2025-01-15 |
Rapid and quantitative functional interrogation of human enhancer variant activity in live mice
2025-Jan-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55500-7
PMID:39762235
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dual-enSERT的Cas9双色荧光报告系统，用于快速定量比较活体小鼠中增强子等位基因的活性 | 开发了dual-enSERT系统，能够在不到两周的时间内对活体小鼠中的增强子等位基因活性进行快速定量比较，并结合单细胞转录组学分析基因表达 | NA | 研究非编码变异在先天性障碍中的功能影响 | 增强子变异 | 基因功能分析 | 先天性障碍、自闭症谱系障碍、颅面畸形 | Cas9双色荧光报告系统、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 十五种未表征的罕见和常见非编码变异 | NA | NA | NA | NA |
| 1797 | 2025-10-07 |
Identification of cancer-associated fibroblast subtypes and prognostic model development in breast cancer: role of the RUNX1/SDC1 axis in promoting invasion and metastasis
2025-01-03, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-024-09950-w
PMID:39753834
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别乳腺癌相关成纤维细胞亚型并开发预后模型，揭示RUNX1/SDC1轴促进乳腺癌侵袭转移的机制 | 首次系统鉴定CAF分子亚型并构建CAF相关预后模型，发现RUNX1转录调控SDC1促进细胞外基质重塑的新机制 | 未明确说明样本量及临床验证队列规模，机制研究缺乏体内实验验证 | 探索乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 乳腺癌组织和癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1798 | 2025-10-07 |
Genetic analysis uncovers potential mechanisms linking juvenile ldiopathic arthritisto breast cancer: A Bioinformatic Pilot study
2025-Jan, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2024.09.004
PMID:39729926
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研究论文 | 通过生物信息学方法探索青少年特发性关节炎与乳腺癌风险的潜在关联机制 | 首次整合WGCNA、共识机器学习标记和单细胞RNA测序分析，识别出PRRG4等关键基因在JIA和乳腺癌中的共同作用 | 这是一项初步研究，样本量有限，需要进一步实验验证 | 研究青少年特发性关节炎对癌症风险的潜在影响机制 | 青少年特发性关节炎和乳腺癌相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 青少年特发性关节炎,乳腺癌 | Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, 机器学习 | 共识机器学习 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的批量测序数据及单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1799 | 2025-10-07 |
Immune Dysregulation and Cellular Composition in Lichen Sclerosus Revealed by Integrative Epigenetic Analysis with Cell Type Deconvolution
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S481324
PMID:39802516
|
研究论文 | 通过整合表观遗传分析和细胞类型反卷积揭示硬化性苔藓中的免疫失调和细胞组成变化 | 首次结合DNA甲基化和单细胞RNA测序分析硬化性苔藓，使用EpiSCORE反卷积方法识别细胞类型特异性变化 | 样本数量未明确说明，研究结果需要更大规模验证 | 探究硬化性苔藓的发病机制和潜在治疗靶点 | 硬化性苔藓患者与正常皮肤组织的比较 | 表观遗传学 | 皮肤炎症性疾病 | DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | EpiSCORE反卷积模型 | 表观遗传数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 1800 | 2025-01-14 |
Major cell types in the coronary thrombosis of acute myocardial infarction patients revealed by scRNA-seq
2025-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70181
PMID:39804415
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |