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当前共找到 2188 篇文献,本页显示第 161 - 180 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
161 2026-07-10
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-01-17, Science (New York, N.Y.)
研究论文 通过单细胞RNA测序分析33例胶质瘤,在IDH野生型胶质母细胞瘤中鉴定出两种不同的髓源性抑制细胞亚群,并揭示其与肿瘤干细胞的相互作用 首次在人类胶质母细胞瘤中鉴定出早期祖细胞型MDSC和单核细胞型MDSC两种亚群,并发现它们与代谢性干细胞样肿瘤细胞在假栅栏区的空间共定位和配体-受体相互作用的分子机制 未提及具体局限性 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤生长和免疫逃逸中的作用 33例胶质瘤的免疫细胞和肿瘤细胞 计算生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 33例胶质瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,10x Visium空间转录组学平台
162 2026-07-10
Single-cell RNA sequencing: an emerging tool revealing dysregulated innate and adaptive immune response at single cell level in Kawasaki disease
2025-01, Expert review of clinical immunology IF:3.9Q2
综述 本文强调了单细胞RNA测序技术在川崎病中揭示先天性和适应性免疫反应失调的关键作用 首次系统综述scRNA-seq在川崎病免疫细胞转录组谱和信号通路表征中的高分辨率应用潜力 依赖现有文献数据,缺乏原始实验验证;scRNA-seq技术本身存在成本高、数据分析复杂等局限性 探讨scRNA-seq在川崎病诊断、预后和个性化治疗中的诊断和治疗潜力 川崎病患者的免疫细胞转录组和信号/反应通路 机器学习 川崎病 scRNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
163 2026-07-10
Understanding developing kidneys and Wilms tumors one cell at a time
2025, Current topics in developmental biology
综述 综述了单细胞测序技术在正常肾脏发育和肾母细胞瘤研究中的应用,讨论了不同技术的优劣及其组合策略 系统总结了单细胞测序技术在肾脏发育和肾母细胞瘤领域的应用,并分析了不同技术组合如何最大化生物学理解 未提供实验数据验证,仅基于现有文献综述技术现状 探讨单细胞测序技术在肾脏发育和肾母细胞瘤研究中的应用及技术选择策略 发育中的肾脏和肾母细胞瘤 数字病理学 肾母细胞瘤 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
164 2026-07-10
Genomic Exploration of Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Gene Expression and Variation in Morbidly Obese Individuals
2025, Journal of obesity IF:3.8Q2
研究论文 利用整合生物信息学分析,包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,探索非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的差异表达基因及其遗传变异,重点关注肥胖患者中NAFLD的发病机制 鉴定了与代谢、免疫和脂质功能相关的新基因(如和),并在肥胖患者肝细胞中过表达,同时发现这些基因的新型致病性变异可能与NAFLD相关 研究可能受限于样本代表性、验证范围或致病性变异的直接功能验证不足 通过基因表达和遗传变异分析,阐明NAFLD的疾病机制并识别潜在治疗靶点和生物标志物 肥胖患者的肝组织及相关基因(如和) 数字病理学 非酒精性脂肪性肝病 RNA-seq,单细胞RNA-seq NA 基因表达数据,遗传变异数据 NA NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
165 2026-07-04
Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 利用负载全肿瘤抗原的纳米颗粒检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞,以预测免疫治疗效果 提出一种基于纳米颗粒负载全细胞肿瘤抗原的方法,可高效激活并检测泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞,将ETASTs与其他T细胞的差异转化为激活与非激活状态,并通过测量激活状态和细胞毒性功能标志物进行区分 NA 开发一种高效、非侵入性的生物标志物,用于预测肺癌及其他癌症的免疫治疗效果 肺癌患者、健康个体及良性肺结节患者血液中的效应肿瘤抗原特异性T细胞 机器学习 肺癌 纳米颗粒负载全肿瘤抗原、单细胞测序 NA 生物标志物数据 肺癌患者、健康个体及良性肺结节患者样本 NA 单细胞测序 NA NA
166 2026-07-04
Deficiency of FABP7 Triggers Premature Neural Differentiation in Idiopathic Normocephalic Autism Organoids
2025-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过正常头围自闭症患者类器官模型,发现FABP7缺乏引发神经干细胞过早分化,并揭示FABP7/MEK通路在自闭症发病中的作用 首次在正常头围自闭症患者的脑类器官模型中鉴定出FABP7表达下调及其通过MEK通路调控神经干细胞过早分化的分子机制 主要基于体外类器官模型和动物实验,需要进一步在人体组织中验证FABP7/MEK通路的临床相关性 探究正常头围自闭症患者神经干细胞异常分化的分子机制 来自前瞻性出生队列的正常头围自闭症患者诱导多能干细胞来源的脑类器官 数字病理学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、组织形态学数据 多个细胞系和时间序列样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒进行scRNA-seq
167 2026-07-04
Spatial differences in gene expression across the dorsal raphe nucleus in a model of early Alzheimer's disease
2025-01, Journal of Alzheimer's disease : JAD
研究论文 利用空间基因表达技术研究早期阿尔茨海默病模型中背侧缝核的基因表达差异 首次在早期阿尔茨海默病的小鼠模型中应用空间转录组学技术,发现背侧缝核内不同亚区域对tau蛋白病理性损害的差异性易感,并鉴定了相关长链非编码RNA Map2k3os的可能调控作用 需要进一步研究Map2k3os的相互作用机制,并强调汇聚数据验证以克服空间转录组学技术的局限性 识别5-羟色胺神经元对阿尔茨海默病病理性损害的易感或抵抗的潜在遗传因素 过表达人tau蛋白的htau小鼠的背侧缝核 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学、RNAscope、免疫组化 NA 基因表达数据、图像 htau小鼠(早期阿尔茨海默病临床前模型)的背侧缝核组织样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium空间基因表达平台
168 2026-07-03
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合单细胞和批量转录组分析揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享致病机制及预后生物标志物 通过整合单细胞与批量RNA测序数据,首次系统揭示乳腺癌和甲状腺癌共享的分子机制,并构建了基于101种机器学习算法的预后模型,发现SMR3B作为共享预后基因 研究主要基于生物信息学分析,功能性验证仅在细胞水平进行,缺乏临床样本和体内实验的进一步验证 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制,并鉴定共同的预后生物标志物和治疗靶点 乳腺癌和甲状腺癌的共享分子特征及肿瘤微环境 数字病理学 乳腺癌, 甲状腺癌 RNA-seq, 单细胞转录组测序 机器学习算法 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
169 2026-07-02
Neoadjuvant therapy-associated malignant phenotype score predicts prognosis and highlights the roles of MIF signaling and DUXAP8 in ESCC
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和批量转录组数据,建立新辅助治疗相关的恶性表型评分,预测食管鳞癌预后并揭示MIF信号通路和DUXAP8的作用 首次构建基于恶性上皮细胞转录重塑的新辅助治疗相关恶性表型评分,并整合单细胞和批量转录组数据,识别了MIF信号通路和长链非编码RNA DUXAP8作为潜在治疗靶点 未提及明确的局限性,但可能包括样本量有限、缺乏独立外部验证队列以及功能验证仅针对单一基因DUXAP8 开发基于恶性细胞内在分子特征的预后评分,并探索与新辅助治疗反应相关的分子机制,以改善食管鳞癌患者的预后分层和个体化治疗决策 食管鳞癌患者在术前行新辅助治疗前后的恶性上皮细胞 机器学习 食管癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO-Cox回归、免疫组织化学、qRT-PCR LASSO-Cox回归模型 单细胞转录组数据、批量转录组数据 单细胞RNA测序数据(ESCC患者治疗前后)、TCGA和GEO队列的批量RNA-seq数据,以及TCGA-ESCA和GSE53624队列用于验证 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
170 2026-07-02
TIMP1 as a context-dependent biomarker linking cancer progression and cardiovascular disorders: a multi-level and bioinformatics study
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多层级生物信息学分析,揭示TIMP1作为连接癌症进展与心血管疾病的上下文依赖性生物标志物的作用 首次系统性地跨疾病分析TIMP1在多种癌症与心血管疾病中的表达模式、调控机制及功能差异,发现其作为连接肿瘤生物学与心血管疾病的潜在中介分子 主要基于公开数据库的生物信息学分析,细胞系实验仅用于靶向验证,缺乏体内动物模型和临床试验验证 探究TIMP1在癌症与心血管疾病中的系统性表达模式及其作为跨疾病生物标志物的潜力 结直肠癌、胃癌、动脉粥样硬化、心力衰竭等疾病的组织样本及细胞系 生物信息学 结直肠癌, 胃癌, 动脉粥样硬化, 心力衰竭 微阵列分析, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学, Western blotting, Transwell实验 NA 转录组数据, 单细胞数据, 基因表达数据, 临床数据 公共数据库多队列数据,包括TCGA/GTEx及GEO数据集(如GSE63032, GSE100927, GSE5406),具体样本量未明确 Illumina 微阵列, 单细胞RNA-seq Illumina微阵列, 单细胞测序平台(未具体说明) 基于公开数据集的分析,平台细节未完全提供
171 2026-07-02
Integrating single-cell RNA sequencing with spatial transcriptomics reveal the fibrosis-related genes in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合单细胞RNA测序与空间转录组学揭示肝细胞癌中纤维化相关基因 首次通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq多组学数据,系统鉴定肝细胞癌肿瘤微环境中纤维化相关的预后基因,并通过细胞实验验证YIPF4基因促进肝癌细胞增殖和迁移的功能 NA 鉴定肝细胞癌肿瘤微环境中与纤维化相关的预后基因,为临床治疗决策提供依据 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及单细胞、空间转录组数据 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序、随机生存森林算法、EDU掺入实验、Transwell迁移实验、CCK-8增殖实验 随机生存森林 基因表达数据、空间转录组数据 GSE149614和GSE245908数据集中的肝细胞癌样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
172 2026-07-02
Multimodal analysis of TAAD pathogenesis: SHAP-enhanced interpretable models and single-cell sequencing analysis reveal immune microenvironment alterations
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合多组学转录组数据和单细胞测序数据,结合SHAP可解释性机器学习模型,揭示了Stanford A型主动脉夹层(TAAD)的免疫微环境改变和发病机制 首次利用SHAP增强的可解释机器学习模型结合单细胞测序技术,系统鉴定出SIX4、SCNN1B和PCDH11X三个关键调控基因,并明确SIX4在血管平滑肌细胞表型转换和免疫信号调控中的核心作用 未明确说明,但可能包括样本量有限、功能验证仅在体外进行、缺乏体内实验验证等 阐明Stanford A型主动脉夹层的分子机制并识别可靠的生物标志物 Stanford A型主动脉夹层患者样本及健康对照 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 随机森林, SVM-RFE 转录组数据, 单细胞转录组数据 整合了4个转录组数据集和2个单细胞转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
173 2026-07-02
Decoding cellular stress states for toxicology using single-cell transcriptomics
2025, NAM journal
研究论文 利用单细胞转录组学技术分析化学物质诱导的细胞应激状态,揭示毒性反应中的动态细胞转变 首次将单细胞转录组技术应用于环境毒理学领域,系统解析了多种应激反应通路在单细胞水平的异质性响应模式,并发现细胞在稳态、适应性反应和终末状态间动态转变的证据 仅使用HepaRG细胞系,未涉及原代细胞或体内模型;仅检测24小时单一时间点,无法捕捉长期或动态响应;化学物质浓度范围有限,可能遗漏低剂量效应 评估单细胞转录组学在毒理学中解码细胞应激状态的能力,揭示化学物质诱导的细胞适应性与终末状态转变机制 HepaRG细胞系暴露于依托泊苷、布雷菲德菌素A、放线菌酮、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮和衣霉素 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) NA 基因表达矩阵 约40,000个HepaRG细胞,暴露于7种化学物质,每种化学物质3个浓度梯度 BioSpyder 单细胞RNA-seq TempO-LINC® TempO-LINC®单细胞转录组平台
174 2026-06-30
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-01, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
综述 本文综述了单细胞组学在肺动脉高压研究中的关键进展,深入探讨了这些技术如何开启理解这一复杂疾病的新纪元 通过单细胞转录组学技术,以更高分辨率解析肺部的细胞生态系统,识别传统批量分析中隐藏的新型治疗靶点,并利用连接组分析揭示细胞相互作用和亚型转化 包括需要提高单细胞RNA测序分辨率以捕捉更细微的细胞变化,克服人体组织样本处理的后勤障碍,以及整合多种组学方法的必要性 阐述单细胞组学在肺动脉高压研究中的应用和前景,推动精准医疗的实现 肺动脉高压相关的细胞类型,如内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 数字病理学 肺动脉高压 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 综述论文,未涉及具体样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
175 2026-06-29
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025, Brain, behavior and evolution
综述 探讨星形胶质细胞在灵长类大脑进化中通过基因表达变化所发挥的扩展作用 综合分析了星形胶质细胞在灵长类进化中的基因表达和基因调控变化,利用诱导多能干细胞和单细胞RNA测序等新技术来理解该细胞类型的动态和复杂性 不适用 理解星形胶质细胞在灵长类大脑进化中的变化及其在神经系统疾病中的潜在作用 星形胶质细胞在灵长类(包括人类)大脑进化中的基因表达和基因调控 自然语言处理 神经系统疾病, 阿尔茨海默病, 帕金森病 单细胞RNA测序, 诱导多能干细胞 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
176 2026-06-26
Telomemore enables single-cell analysis of cell cycle and chromatin condensation
2025-01-24, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一个名为Telomemore的新工具,通过分析单细胞ATAC-seq数据中的端粒样读取(主要来自亚端粒区域)来量化染色质凝聚状态,并表明这些读取可作为染色质凝聚的生物标志物,同时揭示高活性Tn5转座酶不会复制其目标序列的9 bp 首次将亚端粒读取作为染色质凝聚的生物标志物,颠覆了ATAC-seq端粒样读取用于推断端粒长度的传统认知,并发现高活性Tn5不复制目标序列,提供了新的单细胞数据分析维度 未明确讨论亚端粒读取在复杂组织或疾病样本中的适用性,以及对不同Tn5批次或实验条件的鲁棒性,可能受限于现有公共数据集的异质性 探索从单细胞ATAC-seq数据中提取额外信息的新方法,特别是染色质凝聚状态,以增强单细胞数据解读 成纤维细胞和B细胞的多组学图谱,以及多个公共单细胞ATAC-seq数据集 单细胞组学 NA ATAC-seq、多组学(ATAC+RNA)、长读长测序 NA 单细胞ATAC-seq数据、单细胞多组学数据、长读长测序数据 多个公共数据集(未具体说明样本数量)以及新生成的多组学成纤维细胞和B细胞图谱(未明确样本数) NA 单细胞ATAC-seq NA NA
177 2026-06-26
A comprehensive analysis framework for evaluating commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-01-11, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本研究建立了一个综合分析框架,评估九种商业单细胞RNA测序技术,使用来自单供体的外周血单核细胞进行性能、时间和成本比较 引入读取利用度指标,用于区分不同单细胞RNA测序试剂盒在将测序读段转换为有效计数方面的效率,并基于此评估灵敏度和成本影响 信息不足 系统比较商业化单细胞RNA测序技术,为单细胞研究的有效实施提供指导 来自单个供体的外周血单核细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 169262个外周血单核细胞 10x Genomics, BD Biosciences 单细胞RNA测序 Chromium Fixed RNA Profiling试剂盒, Rhapsody WTA试剂盒 NA
178 2026-06-26
Endothelial Angpt2 Promotes Adipocyte Progenitor Cells Maturation to Increase Visceral Adipose Tissue Accumulation
2025-01, Diabetes/metabolism research and reviews
研究论文 本研究揭示了内皮细胞通过Angpt2促进脂肪祖细胞成熟,从而增加内脏脂肪组织积累的机制 首次发现内皮细胞通过JAK1/STAT3信号激活分泌Angpt2,诱导脂肪祖细胞从MSLN表型转变为CFD表型,促进内脏脂肪积累 样本量较小(仅13份内脏脂肪样本),且主要基于人类scRNA-seq数据和小鼠模型验证 阐明内脏脂肪组织积累的分子机制 人类内脏脂肪组织中的内皮细胞、巨噬细胞和脂肪祖细胞 数字病理学 肥胖及相关代谢疾病 单细胞RNA测序、PCR、Western blot、免疫荧光染色、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 5名肥胖合并糖尿病、9名肥胖和1名正常BMI个体的13份内脏脂肪组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
179 2026-06-26
Loss of FTH1 Induces Ferritinophagy-Mediated Ferroptosis in Anaemia of Myelodysplastic Syndromes
2025-01, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
research paper FTH1缺失通过诱导铁蛋白自噬介导的铁死亡在骨髓增生异常综合征贫血中的作用 首次揭示FTH1缺失通过铁蛋白自噬途径诱导铁死亡,并表明FTH1可作为MDS贫血的新治疗靶点 FTH1在MDS病理生理中的具体机制尚不完全清楚,研究主要基于细胞实验和临床样本,需进一步动物模型验证 评估FTH1在骨髓增生异常综合征贫血患者中的作用及其机制 MDS患者Lin-细胞、GlycoA有核红细胞、K562和SKM1细胞 machine learning myelodysplastic syndromes shRNA敲低、单细胞测序 NA 基因表达数据 MDS患者和对照组样本 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 单细胞测序对Lin-细胞进行测序
180 2026-06-26
Integrated Analysis of Bulk RNA Sequencing, eQTL, GWAS, and Single-Cell RNA Sequencing Reveals Key Genes in Hepatocellular Carcinoma
2025-01, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 整合批量RNA测序、eQTL、GWAS和单细胞RNA测序数据,揭示肝细胞癌中的关键基因 通过多组学数据整合分析,结合eQTL、孟德尔随机化和单细胞RNA测序,识别出SERPING1和STEAP3两个可能对肝细胞癌发病和进展至关重要的基因,并揭示其在肿瘤微环境和免疫治疗中的潜在作用 仅利用公开数据集进行分析,可能受数据质量和样本异质性影响;结果需进一步在更大样本和临床队列中验证 识别肝细胞癌中的关键基因并阐明其分子机制,为诊断和治疗提供新靶点 肝细胞癌患者肿瘤样本及正常对照组织中的基因表达数据和遗传变异信息 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, eQTL分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组化, Western blot, qPCR NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 遗传变异数据 使用来自TCGA和GEO的公开HCC数据集,具体样本数未明确 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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