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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2025-10-07 |
Gene function revealed at the moment of stochastic gene silencing
2025-01-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07530-0
PMID:39828795
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研究论文 | 提出一种利用单细胞随机基因沉默方法推断基因功能的新技术 | 开发了scSGS方法,利用单细胞基因表达的自然变异性来推断基因功能,避免了传统基因敲除研究中的存活偏差 | NA | 开发一种新的基因功能预测方法 | 基因功能与调控关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1702 | 2025-10-07 |
The Role of Zuo Jin Wan in Modulating the Tumor Microenvironment of Colorectal Cancer
2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 研究左金丸通过调节结直肠癌肿瘤微环境中多种细胞类型发挥免疫调节作用 | 首次在单细胞水平揭示左金丸对结直肠癌肿瘤微环境的全面调节作用,发现其可下调TIMP1和MTDH基因表达 | 研究主要基于数据库分析和体外验证,缺乏体内实验和临床数据支持 | 探索左金丸在结直肠癌免疫调节中的作用机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的恶性细胞、免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 通路富集分析 | NA | 基因表达数据 | 基于已发表研究的单细胞RNA测序数据(PMID: 32451460, 32103181, 32561858) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1703 | 2025-10-07 |
Novel insights into Cntnap4 in Alzheimer's disease: Intestinal flora interaction
2025-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138508
PMID:39647729
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研究论文 | 本研究探讨Cntnap4基因在阿尔茨海默病中的作用及其与肠道菌群的相互作用 | 首次揭示Cntnap4缺陷通过影响肠道菌群组成加剧AD病理,并证明GABA补充可改善认知障碍 | 研究主要基于动物模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明Cntnap4基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用及其与肠道菌群的关联 | 阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,高通量转录组测序,16s rRNA测序,动物实验 | 动物模型 | 基因表达数据,微生物组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq, 16s rRNA sequencing | NA | NA |
| 1704 | 2025-10-07 |
Glucocorticoid receptor inhibits Th2 immune responses by down-regulating Pparg and Gata3 in schistosomiasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518586
PMID:40196108
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研究论文 | 本研究探讨糖皮质激素受体通过下调Pparg和Gata3抑制血吸虫病中Th2免疫应答的机制 | 首次整合RNA测序和单细胞测序揭示GR激活通过下调关键转录因子Gata3和Pparg抑制Th2免疫应答 | 需要进一步研究靶向GR激活治疗血吸虫病的可行性和安全性 | 研究GR激活对血吸虫病中肝脏Th2免疫应答的影响 | 日本血吸虫感染小鼠和Th2细胞 | 免疫学 | 血吸虫病 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 血吸虫感染小鼠模型和体外Th2细胞 | NA | 单细胞测序,RNA测序 | NA | NA |
| 1705 | 2025-10-07 |
A tumor-infiltrating B lymphocytes -related index based on machine-learning predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1524120
PMID:40196113
|
研究论文 | 基于机器学习构建肿瘤浸润B淋巴细胞相关指数预测肺腺癌预后和免疫治疗反应 | 首次系统性地利用十种机器学习算法和101种算法组合构建TILB相关指数,全面分析其在肺腺癌中的作用 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证 | 开发预测肺腺癌预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 肺腺癌患者和肿瘤浸润B淋巴细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 多种机器学习算法组合 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA、GSE31210、GSE72094、GSE91061和GSE126044多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1706 | 2025-10-07 |
Immune cells differentiation in osteoarthritic cartilage damage: friends or foes?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1545284
PMID:40201177
|
综述 | 本文综述了骨关节炎中免疫细胞分化的双重作用及其在疾病进展中的复杂网络 | 系统阐述骨关节炎中免疫细胞'亦敌亦友'的双重特性,并比较其与类风湿关节炎在免疫治疗方面的异同 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 阐明骨关节炎中免疫细胞的分化特征及其在疾病进展中的作用机制 | 骨关节炎患者的免疫细胞及其与关节组织的相互作用 | 免疫学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 免疫组学 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1707 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing advances in revealing the development and progression of MASH: the identifications and interactions of non-parenchymal cells
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1513993
PMID:40201243
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示代谢相关脂肪性肝炎中非实质细胞发育和进展方面的应用 | 系统总结了单细胞转录组测序技术对MASH中非实质细胞异质性和细胞相互作用的最新发现 | 作为综述文章,主要基于已有研究进行总结,未提供原始实验数据 | 探讨单细胞RNA测序技术在MASH研究中的应用,理解非实质细胞在疾病中的作用机制 | 肝脏非实质细胞(包括Kupffer细胞、肝星状细胞和肝窦内皮细胞) | 数字病理学 | 代谢相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1708 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing and spatial transcriptomics reveal the evolution of glucose metabolism in hepatocellular carcinoma and identify G6PD as a potential therapeutic target
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1553722
PMID:40201344
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演化特征,并验证G6PD作为潜在治疗靶点 | 首次从时空维度解析肝细胞癌葡萄糖代谢演化规律,发现G6PD通过谷胱甘肽代谢和ROS产生调控肿瘤进展 | 样本量有限(7例单细胞测序样本,4例空间转录组样本),需更大规模验证 | 探索肝细胞癌中葡萄糖代谢的时空演化特征并寻找治疗靶点 | 肝细胞癌组织及癌旁组织 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 高通量测序, 伤口愈合实验, CCK-8实验, transwell实验 | 伪时间分析, Cox回归分析 | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 7例HCC及癌旁组织(单细胞测序),4例HCC组织(空间转录组) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1709 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the role of aggrephagy-related patterns in tumor microenvironment, prognosis and immunotherapy in endometrial cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1560625
PMID:40201347
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究聚集性自噬相关模式在子宫内膜癌肿瘤微环境、预后和免疫治疗中的作用 | 首次在子宫内膜癌中系统分析聚集性自噬相关基因在肿瘤微环境中的作用,并发现TUBA1A+巨噬细胞亚型与良好预后的关联 | 样本量相对有限(5个肿瘤样本),需要更大规模研究验证 | 阐明聚集性自噬在子宫内膜癌肿瘤微环境中的功能及其对预后和免疫治疗的影响 | 子宫内膜癌患者肿瘤样本中的单细胞 | 单细胞测序分析 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | 非负矩阵分解算法,CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 5个子宫内膜癌肿瘤样本中的36,227个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1710 | 2025-10-07 |
Comprehensive Analyses of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data From M2 Macrophages to Elucidate the Immune Prognostic Signature in Patients with Gastric Cancer Peritoneal Metastasis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S506143
PMID:40201390
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据构建M2巨噬细胞相关基因的预后风险模型,用于预测胃癌腹膜转移患者的预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析识别M2巨噬细胞相关基因,构建了针对胃癌腹膜转移的预后预测模型 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要进一步的前瞻性临床验证 | 构建能够有效预测胃癌腹膜转移患者预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 胃癌腹膜转移患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, LASSO分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | TCGA、GSE62254和IMvigor210等多个队列数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1711 | 2025-10-07 |
Transcriptomics in the Study of Antiviral Innate Immunity
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4108-8_10
PMID:39192121
|
综述 | 本章介绍多种转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用、意义和实验流程 | 重点介绍了单细胞测序和空间转录组学等新兴技术在该领域的应用前景 | NA | 探讨转录组学技术在抗病毒天然免疫研究中的应用 | 抗病毒天然免疫相关的RNA分子 | 自然语言处理 | NA | 微阵列, RNA测序, 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | RNA分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1712 | 2025-10-07 |
Identification of Alzheimer's disease biomarkers and their immune function characterization
2025, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/188721
PMID:40190307
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法识别阿尔茨海默病生物标志物并分析其免疫功能特征 | 结合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,首次发现RBM3、GOLGA8A和ALS2等生物标志物与AD中CD8 T细胞浸润的关联 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏实验验证 | 探究阿尔茨海默病的生物标志物及其免疫机制 | 阿尔茨海默病患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习算法 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE122063、GSE97760、GSM4996463、GSM4996462) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1713 | 2025-10-07 |
The single-cell transcriptional landscape of lung cells from PCV2d-infected mice
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1554961
PMID:40196036
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PCV2d感染小鼠肺组织中10种细胞类型的转录组特征和免疫应答机制 | 首次系统绘制PCV2d感染小鼠肺组织的单细胞转录组图谱,鉴定出高病毒载量的单核巨噬细胞及其通过CD40-CD40L和CXCL14-CXCR4介导的细胞互作网络 | 研究仅使用BALB/c小鼠模型,未验证其他动物模型或临床样本 | 探究PCV2d亚型感染的生物学特性及其驱动的炎症性肺损伤机制 | PCV2d感染BALB/c小鼠的肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PCV2d感染和未感染对照小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1714 | 2025-10-07 |
A prognostic model based on autophagy-and senescence-related genes for gastric cancer: implications for immunotherapy and personalized treatment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1509771
PMID:40182050
|
研究论文 | 基于自噬和衰老相关基因构建胃癌预后模型并评估其对免疫治疗和个性化治疗的指导价值 | 首次联合分析自噬和衰老相关基因构建胃癌预后特征,并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗疗效的关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发能够预测胃癌预后和免疫治疗反应的生物标志物模型 | 胃癌患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序,基因表达谱分析,药物敏感性分析 | Cox回归,LASSO回归,共识聚类 | 基因表达数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1715 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveals the Prognostic Significance of HOXC9-Related Immune Gene Signatures in Hepatocellular Carcinoma
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S509625
PMID:40177614
|
研究论文 | 本研究整合了bulk和单细胞RNA测序数据,构建了基于HOXC9相关免疫基因的风险评分模型,并评估其在肝细胞癌中的预后价值 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序数据构建HOXC9相关免疫基因风险评分模型,揭示了其在肝细胞癌预后评估和免疫治疗预测中的新作用 | 研究数据主要来自公共数据库TCGA和GEO,需要进一步实验验证 | 构建HOXC9相关免疫基因风险评分模型并评估其在肝细胞癌预后和免疫治疗中的价值 | 肝细胞癌患者样本和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归分析, CIBERSORT, ESTIMATE算法, 细胞实验 | 风险评分模型, LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1716 | 2025-10-07 |
A novel lactylation-related gene signature to predict prognosis and treatment response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1549724
PMID:40161374
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研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸化相关基因的特征模型,用于预测肺腺癌患者的预后和治疗反应 | 首次在肺腺癌中系统研究乳酸化相关基因特征,构建了风险预后模型并验证其与免疫浸润和化疗敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要更多前瞻性临床研究验证 | 探索乳酸化相关基因在肺腺癌预后预测和治疗反应评估中的价值 | 肺腺癌患者和肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA测序,单细胞测序,LASSO回归分析 | 风险预后模型,列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者样本 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1717 | 2025-10-07 |
Early Detection of Malignant Cells in Gastric Lavage via Hexokinase 2 and Single-Cell Sequencing for Gastric Cancer Diagnosis
2025, Risk management and healthcare policy
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/RMHP.S510123
PMID:40161902
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过胃灌洗液中HK2标记和单细胞测序检测脱落肿瘤细胞的新方法,用于胃癌早期诊断 | 首次将代谢标记物HK2与单细胞测序技术结合应用于胃灌洗液检测,实现胃癌早期诊断 | 样本量相对有限(60例),对重度不典型增生的敏感性仅为57% | 开发一种非侵入性的胃癌早期诊断方法 | 胃灌洗液中的脱落肿瘤细胞 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞测序,基因组拷贝数变异分析 | NA | 单细胞基因组数据 | 60例(10例胃癌,26例癌前病变,15例良性胃病,9例健康对照) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1718 | 2025-10-07 |
Analysis and Validation of Mitophagy-Related Genes in Diabetic Foot Ulcers
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504001
PMID:40162084
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,鉴定并验证了与糖尿病足溃疡相关的线粒体自噬关键基因 | 首次在糖尿病足溃疡中系统分析线粒体自噬相关基因,结合机器学习算法、免疫细胞浸润分析和单细胞RNA测序验证 | 样本量有限,需要更大队列研究;对炎症机制的机制性联系探索不够深入 | 鉴定糖尿病足溃疡发病机制中与线粒体自噬相关的关键基因 | 糖尿病足溃疡患者皮肤组织 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, Western blot, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 使用GEO数据库中的多个数据集(GSE80178, GSE68183, GSE165816) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1719 | 2025-10-07 |
scCCTR: An iterative selection-based semi-supervised clustering model for single-cell RNA-seq data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.018
PMID:40165824
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研究论文 | 提出一种基于迭代选择的半监督聚类模型scCCTR,用于单细胞RNA测序数据分析 | 通过迭代选择高置信度细胞和标签来指导深度学习模型,结合Transformer神经网络的多头注意力机制提升聚类精度 | NA | 开发更准确有效的单细胞RNA测序数据聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1720 | 2025-10-07 |
Inflammation and cancer: molecular mechanisms and clinical consequences
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564572
PMID:40165901
|
综述 | 本文综述了炎症与癌症之间的分子机制及临床关联,重点关注癌症相关炎症对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 整合单细胞RNA测序和空间分子成像分析等先进技术,系统阐明慢性炎症与癌症的联系机制 | NA | 探讨炎症在癌症发生发展中的分子机制和临床后果 | 癌症相关炎症、肿瘤微环境、胃肠道癌症 | NA | 癌症、胃肠道癌症 | 单细胞RNA测序、空间分子成像分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |