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当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 1701 - 1720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1701 | 2025-10-07 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveal cellular heterogeneity and a novel cancer-promoting Treg cell subset in human clear-cell renal cell carcinoma
2025-Jan-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010183
PMID:39755578
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组学揭示人透明细胞肾细胞癌中的细胞异质性和新型促癌Treg细胞亚群 | 识别了具有末端效应Treg细胞分子特征但表达多种细胞因子的特殊Treg细胞亚群，并揭示了其与MRC1+FOLR2+TAMs在肿瘤-正常组织界面形成正反馈环的协同促癌机制 | 样本量相对较小（4例单细胞测序，15例体外验证），需要在更大队列中进一步验证 | 研究ccRCC中免疫抑制细胞的空间和功能异质性及其相互作用机制 | 透明细胞肾细胞癌患者组织样本 | 单细胞转录组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据, 组织微阵列数据 | 4例单细胞测序样本（来自肿瘤核心、肿瘤-正常界面和远端正常组织多个区域），15例体外验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1702 | 2025-01-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Age-Related Changes in Epidermal Cell Populations and Interactions
2025-Jan-03, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.12.013
PMID:39756533
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1703 | 2025-10-07 |
RASGRF2 as a potential pathogenic gene mediating the progression of alcoholic hepatitis to alcohol-related cirrhosis and hepatocellular carcinoma
2025-Jan-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01853-4
PMID:39875737
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研究论文 | 本研究通过多组转录组数据分析发现RASGRF2是介导酒精性肝炎向酒精性肝硬化和肝细胞癌进展的关键致病基因 | 首次通过多数据库整合分析结合机器学习算法鉴定出RASGRF2作为AH向AC和HCC进展的核心共享基因，并利用单细胞和空间转录组数据进行了验证 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于HepG2细胞系，缺乏更广泛的体内功能验证 | 探索酒精性肝炎向肝硬化和肝细胞癌进展的分子机制 | 酒精性肝炎、酒精性肝硬化、肝细胞癌患者组织样本及HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序、免疫浸润分析、免疫组化、细胞功能实验 | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多个转录组数据库的样本数据，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1704 | 2025-10-07 |
Computational Identification of Migrating T cells in Spatial Transcriptomics Data
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619870
PMID:39484480
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研究论文 | 开发了一种利用空间转录组数据追踪T细胞迁移模式的计算方法ReMiTT | 首次提出基于空间转录组数据计算识别T细胞迁移轨迹的计算方法 | NA | 研究T细胞在肿瘤微环境中的迁移模式 | 肿瘤组织中的T细胞 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | ReMiTT | 空间转录组数据 | 多个肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1705 | 2025-10-07 |
The Role of Dectin-1-Akt-RNF146 Pathway in β-Glucan Induced Immune Trained State of Monocyte in Sepsis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482213
PMID:39881796
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研究论文 | 本研究探讨了Dectin-1-Akt-RNF146通路在β-葡聚糖诱导的单核细胞免疫训练状态中的作用及其在脓毒症中的机制 | 首次揭示RNF146通过dectin-1-Akt-mTOR通路调控单核细胞免疫训练状态，为逆转脓毒症免疫抑制提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明β-葡聚糖诱导的免疫训练在脓毒症中的作用机制 | 脓毒症患者外周血单核细胞、脓毒症小鼠模型、RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞系 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 脓毒症患者PBMCs、小鼠模型和细胞系（具体数量未明确说明） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1706 | 2025-10-07 |
Therapeutic potential and mechanisms of umbilical cord mesenchymal stem cells differentiating into tendon cells and promotion of rotator cuff tendon-bone healing
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251315185
PMID:39882545
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研究论文 | 本研究探讨脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其促进肩袖肌腱-骨愈合的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序分析脐带间充质干细胞向肌腱细胞分化过程中的关键细胞亚群和信号通路，并揭示Hes1基因在促进分化和肩袖损伤修复中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 探索脐带间充质干细胞分化为肌腱细胞的机制及其在肩袖损伤修复中的应用价值 | 脐带间充质干细胞、肌腱细胞、肩袖损伤动物模型 | 干细胞研究 | 肩袖损伤 | 单细胞测序、基因过表达、细胞诱导分化 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1707 | 2025-10-07 |
To describe the subsets of malignant epithelial cells in gastric cancer, their developmental trajectories and drug resistance characteristics
2025-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01715-5
PMID:39869282
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胃癌细胞亚群，揭示其发育轨迹和耐药特性 | 首次在单细胞水平系统鉴定胃癌中5个恶性上皮细胞亚群，构建具有预测能力的预后风险评分模型 | 样本来源和数量有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 解析胃癌细胞异质性及其与治疗抵抗的关系 | 胃癌组织样本中的细胞 | 单细胞基因组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险评分模型 | 单细胞转录组数据 | 262,532个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 1708 | 2025-10-07 |
Fetal fibroblast heterogeneity defines dermal architecture during human embryonic skin development
2025-Jan-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.12.027
PMID:39880186
|
研究论文 | 本研究通过分析人类胚胎皮肤发育过程中的成纤维细胞异质性，揭示了8个不同的成纤维细胞群体及其时空分布特征 | 首次系统描绘了人类胚胎皮肤发育过程中成纤维细胞的异质性图谱，发现了发育阶段特异性的细胞群体动态变化和空间分布模式 | 研究样本仅涵盖8-16孕周的胚胎皮肤，缺乏更早期和更晚期的发育阶段数据 | 探究人类胚胎皮肤发育过程中成纤维细胞的异质性及其在皮肤结构形成中的作用 | 人类胚胎皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，单分子荧光原位杂交 | 聚类分析，基于分区的图抽象，伪时间分析 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 8和16孕周的人类胚胎皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1709 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals microenvironmental infiltration of myeloid cells and pancreatic prognostic markers in PDAC
2025-Jan-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01830-x
PMID:39847195
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示PDAC中髓系细胞的微环境浸润特征并建立胰腺癌预后预测模型 | 首次在单细胞水平系统解析PDAC髓系细胞异质性，发现TAM-spp1细胞与不良预后密切相关，并构建了8基因风险预测模型 | 研究基于公共数据库数据，缺乏独立验证队列和实验验证 | 探究胰腺导管腺癌中髓系细胞的异质性及其对预后的影响 | 胰腺导管腺癌患者的单细胞RNA测序数据和基因表达数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因集变异分析, CIBERSORT, LASSO回归, Cox回归分析 | 风险预测模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自多个公共数据库的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1710 | 2025-10-07 |
Sleeve gastrectomy reveals the plasticity of the human gastric epithelium
2025-Jan-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56135-y
PMID:39833151
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研究论文 | 本研究通过组织学和单细胞RNA测序揭示了袖状胃切除术后人类胃上皮的可塑性变化 | 首次在分子和细胞水平展示袖状胃切除术后胃上皮重塑，发现壁细胞亚群和肠嗜铬样细胞的适应性变化 | 研究样本仅包括12名女性患者，样本量有限 | 探究袖状胃切除术后胃上皮的适应性变化机制 | 人类胃上皮组织 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 组织学, 单细胞RNA测序, 数学建模 | 非线性比例积分控制模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 12名女性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1711 | 2025-10-07 |
A practical guide for choosing an optimal spatial transcriptomics technology from seven major commercially available options
2025-Jan-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11235-3
PMID:39833687
|
指南 | 本文分析和比较七种主要商业化空间转录组技术平台，为研究人员选择最适合其需求的平台提供实用指导 | 首次系统性地对七种主要商业化空间转录组平台进行全面比较分析 | 仅涵盖商业化平台，未包括实验性或早期开发阶段的技术 | 为研究人员提供选择合适空间转录组技术的实用指南 | 七种主要商业化空间转录组技术平台 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1712 | 2025-10-07 |
From Genes to Clinical Practice: Exploring the Genomic Underpinnings of Endometrial Cancer
2025-Jan-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17020320
PMID:39858102
|
综述 | 探讨子宫内膜癌的基因组基础及其向临床实践的转化 | 整合单细胞基因组学和空间转录组学等多组学技术，提供识别新型生物标志物和治疗靶点的整体视角 | 患者反应存在变异性、基因组数据整合到临床工作流程存在挑战以及伦理考量 | 探索子宫内膜癌的基因组基础并推动精准医疗发展 | 子宫内膜癌及其分子亚型 | 基因组学 | 子宫内膜癌 | 单细胞基因组学, 空间转录组学, 多组学技术 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1713 | 2025-10-07 |
Primitive to visceral endoderm maturation is essential for mouse epiblast survival beyond implantation
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111671
PMID:39868030
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠胚胎植入后原始内胚层向脏壁内胚层成熟的分子机制及其对胚胎外胚层存活的重要性 | 首次在胚胎植入后关键时期（E5.0）通过单细胞RNA测序揭示BMP信号上调和Sox7表达短暂增加驱动原始内胚层向脏壁内胚层转化的动态信号活动 | 研究主要聚焦于Hnf1b基因缺陷模型，可能未涵盖其他潜在调控机制；样本时间点相对有限 | 探索小鼠胚胎植入后原始内胚层向脏壁内胚层成熟的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 小鼠胚胎（包括野生型和Hnf1b-/-突变体）在胚胎第5.0天的发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎第5.0天的小鼠胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1714 | 2025-10-07 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 开发了一种基于群体学习的去中心化单细胞测序数据细胞类型注释方法 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释，实现了隐私保护的分布式模型训练 | NA | 开发标准化、自动化的细胞类型注释方法，同时保护患者隐私 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞测序数据 | 单细胞分析 | NA | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 单细胞测序数据 | 多个实验室生成的多组织数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1715 | 2025-10-07 |
PPARG/SPP1/CD44 signaling pathway in alveolar macrophages: Mechanisms of lipid dysregulation and therapeutic targets in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41628
PMID:39866448
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研究论文 | 本研究揭示了肺泡巨噬细胞中PPARG/SPP1/CD44信号通路在特发性肺纤维化脂质代谢失调中的作用机制 | 首次提出肺泡巨噬细胞中PPARG/SPP1/CD44信号通路调控脂质代谢并促进肺纤维化进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索特发性肺纤维化中脂质代谢失调的分子机制并寻找治疗靶点 | 肺泡巨噬细胞和脂质代谢相关基因 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 机器学习, 网络药理学 | 机器学习 | 基因表达数据 | 12个bulk RNA-seq数据集和2个单细胞RNA-seq数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1716 | 2025-10-07 |
The Progression of Mycosis Fungoides During Treatment with Mogamulizumab: A BIO-MUSE Case Study of the Tumor and Immune Response in Peripheral Blood and Tissue
2025-Jan-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010186
PMID:39857770
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病例研究 | 通过单细胞测序和空间转录组学分析一例蕈样肉芽肿患者在莫格利珠单抗治疗期间的疾病进展机制 | 首次结合外周血单细胞RNA测序与组织空间转录组学分析MF疾病进展的分子特征 | 单病例研究，样本量有限，需要更大规模验证 | 探索蕈样肉芽肿疾病进展的分子机制和生物标志物 | 一例接受莫格利珠单抗治疗的晚期蕈样肉芽肿患者 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，数字空间分析 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 1例患者的多时间点样本 | 10x Genomics, NanoString | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, GeoMx DSP | 10x单细胞RNA测序用于CD3+外周T细胞，GeoMx数字空间分析用于皮肤活检组织 |
| 1717 | 2025-10-07 |
Debiasing Sinkhorn divergence in optimal transport of cellular dynamics
2025-Jan-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.11.632566
PMID:39868085
|
研究论文 | 本文通过最优传输理论分析单细胞RNA测序数据，研究细胞动态过程中的Sinkhorn散度去偏方法 | 提出在细胞动态最优传输中使用Sinkhorn散度平衡熵正则化引起的算法偏差 | Sinkhorn散度的有效性依赖于时间点稀疏性，在某些细胞类型和稀疏时间点下效果不显著 | 提高单细胞RNA测序数据分析中细胞命运预测的准确性 | 小鼠胚胎成纤维细胞重编程和表皮形态发生过程中的细胞动态 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 最优传输，Sinkhorn散度 | 单细胞RNA测序数据 | 多个时间点（密集时间点、9个时间点、5个时间点）的细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1718 | 2025-10-07 |
Identifying MTHFD1 and LGALS4 as Potential Therapeutic Targets in Prostate Cancer Through Multi-Omics Mendelian Randomization Analysis
2025-Jan-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13010185
PMID:39857769
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化分析鉴定MTHFD1和LGALS4作为前列腺癌的潜在治疗靶点 | 首次通过整合eQTL和pQTL数据进行多组学孟德尔随机化分析，识别出前列腺癌的潜在治疗靶点 | 需要未来实验验证这些候选蛋白的实用性和有效性 | 筛选前列腺癌的药物靶点以改善治疗前景 | 前列腺腺癌(PRAD) | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,生存分析,免疫微环境评估 | SMR, HEIDI, IVW, Wald ratio, weighted median, MR-Egger | eQTL数据,pQTL数据,基因表达谱,单细胞RNA测序数据 | eQTLGen联盟、UK Biobank Proteome Plasma Proteins、deCODE健康数据集、TCGA数据库、GSE176031数据集 | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 1719 | 2025-10-07 |
Exploring RNA-Seq Data Analysis Through Visualization Techniques and Tools: A Systematic Review of Opportunities and Limitations for Clinical Applications
2025-Jan-12, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12010056
PMID:39851330
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系统综述 | 系统综述RNA-seq数据可视化技术与工具在临床应用中的机遇与局限性 | 首次系统性地分类和评估不同类型RNA-seq数据（环状RNA、单细胞RNA、批量RNA和长链非编码RNA）的可视化工具及其临床应用 | 仅纳入2017-2024年期间的英文全文研究，可能存在发表偏倚 | 概述当前用于从RNA-seq数据构建临床推论的最先进数据可视化技术与工具 | RNA-seq数据可视化工具和技术 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 33项符合纳入标准的研究 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1720 | 2025-10-07 |
Ex Vivo Regional Gene Therapy Compared to Recombinant BMP-2 for the Treatment of Critical-Size Bone Defects: An In Vivo Single-Cell RNA-Sequencing Study
2025-Jan-01, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12010029
PMID:39851303
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较区域基因治疗与重组BMP-2在临界尺寸骨缺损修复中的细胞和转录机制差异 | 首次在临界尺寸骨缺损模型中应用单细胞RNA测序技术比较两种BMP-2介导的骨再生策略 | 研究仅基于6只大鼠的小样本量，需要更大规模验证 | 比较区域基因治疗与重组BMP-2在骨缺损修复中的细胞和分子机制差异 | 大鼠临界尺寸股骨缺损模型中的血肿组织细胞 | 单细胞测序分析 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6只大鼠（每组3只） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |