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当前共找到 2176 篇文献，本页显示第 1681 - 1700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1681 | 2025-10-07 |
Deep learning-based models for preimplantation mouse and human embryos based on single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02511-3
PMID:39543284
|
研究论文 | 开发基于单细胞RNA测序的深度学习模型，用于识别小鼠和人类胚胎发育过程中的细胞类型、谱系和状态 | 利用深度学习工具整合和分类多个单细胞转录组数据集，建立能够无偏倚识别细胞类型并同时确定模型所用基因集的分类模型 | 研究材料难以获取和处理，主要依赖公开可用数据 | 定义小鼠和人类胚胎细胞类型、谱系和状态，为早期胚胎发生提供动态参考 | 小鼠和人类早期胚胎发育及多能干细胞模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的小鼠和人类胚胎发育阶段数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1682 | 2025-10-07 |
Integrated proteomics and scRNA-seq analyses of ovarian cancer reveal molecular subtype-associated cell landscapes and immunotherapy targets
2025-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02894-2
PMID:39548315
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，揭示了卵巢癌分子亚型相关的细胞景观和免疫治疗靶点 | 首次结合蛋白质组学和单细胞RNA测序对卵巢癌进行综合分析，识别了四种具有临床意义的蛋白质组亚型，并发现CD40作为C2亚型的特异性预后因子 | 样本量相对有限，特别是单细胞RNA测序仅包含8个肿瘤样本 | 探索卵巢癌分子亚型与治疗意义之间的联系 | 154例上皮性卵巢癌肿瘤样本、29例正常输卵管样本和8例额外卵巢癌肿瘤 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 质谱蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 154个肿瘤样本 + 29个正常样本 + 8个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 1683 | 2025-10-07 |
The role of FOXK2-FBXO32 in breast cancer tumorigenesis: Insights into ribosome-associated pathways
2025-Jan, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15482
PMID:39552461
|
研究论文 | 本研究探讨FOXK2-FBXO32轴在乳腺癌肿瘤发生中的作用及其在核糖体相关通路中的机制 | 首次通过单细胞测序分析FOXK2基因在泛癌中的表达模式，并发现其下游基因FBXO32与癌症免疫应答的关联 | 需要进一步研究FOXK2和FBXO32在癌症中的具体作用机制，以及靶向FOXK2治疗癌症的潜在益处 | 寻找能够预测肿瘤免疫治疗效果和预后的新生物标志物 | 多种癌症类型（前列腺癌、子宫内膜癌、膀胱癌、结直肠癌、胰腺癌、胃癌、肺癌、甲状腺癌）的肿瘤和癌旁组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA-seq, ChIP-seq, 免疫浸润分析算法 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1684 | 2025-10-07 |
Repurposing large-format microarrays for scalable spatial transcriptomics
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02501-5
PMID:39562752
|
研究论文 | 开发了一种利用传统寡核苷酸微阵列进行空间转录组分析的新方法Array-seq | 将传统DNA微阵列重新用于空间转录组分析，实现了低成本、易操作且可扩展的空间分子研究平台 | NA | 开发易于采用、低成本且可扩展的空间转录组分析工具 | 小鼠组织切片、多器官切片、连续切片和完整人类器官 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 下一代测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 微阵列技术 | Array-seq | 基于定制设计探针的微阵列载玻片，包含侧翼有共同序列的独特条形码 |
| 1685 | 2025-10-07 |
Cryptotanshinone alleviates immunosuppression in endometriosis by targeting MDSCs through JAK2/STAT3 pathway
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156227
PMID:39580997
|
研究论文 | 本研究探讨了隐丹参酮通过JAK2/STAT3通路调控髓源性抑制细胞，从而缓解子宫内膜异位症免疫抑制的机制 | 首次证明隐丹参酮通过靶向JAK2/STAT3通路调节MDSCs，是治疗子宫内膜异位症的潜在天然化合物 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 研究隐丹参酮通过JAK2/STAT3信号通路调节MDSCs的治疗潜力及其对EMS免疫微环境和病灶生长的影响 | 子宫内膜异位症患者组织样本、C57BL/6J小鼠模型、骨髓源性MDSCs | 生物医学研究 | 子宫内膜异位症 | 转录组测序、单细胞RNA测序、网络药理学分析、表面等离子共振、细胞热位移分析、流式细胞术、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 使用公共数据库GSE141549和GSE213216数据，建立小鼠模型进行体内外验证 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1686 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell aging atlas of healthy mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2025-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00751-8
PMID:39587369
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率构建健康乳腺组织衰老图谱，揭示衰老与癌症共享的表观基因组和转录组特征 | 首次在单细胞分辨率系统揭示乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组重编程，并发现衰老特征与人类乳腺癌的潜在联系 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织细胞和分子程序，及其与癌症发生的关联 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1687 | 2025-10-07 |
PKMζ, a Brain-specific PKCζ Isoform, is Required for Glycolysis and Myofibroblastic Activation of Hepatic Stellate Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101429
PMID:39542399
|
研究论文 | 本研究揭示了脑特异性PKCζ异构体PKMζ在肝星状细胞糖酵解和肌成纤维细胞活化中的关键作用 | 首次发现PKMζ通过磷酸化VASP促进Glut1在质膜上的锚定，驱动肝星状细胞的代谢重编程和活化 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚未在人类肝脏疾病中进行临床验证 | 阐明肝星状细胞中葡萄糖转运蛋白Glut1在质膜上锚定/停靠的分子机制 | 人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移瘤相关成纤维细胞 | 细胞生物学 | 肝纤维化、结直肠肝转移 | RT-PCR、Western blotting、免疫荧光、shRNA、过表达、生物素化、2-NBDG检测、Seahorse糖酵解压力测试、位点定向突变、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 原代人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 1688 | 2025-10-07 |
A comprehensive human embryo reference tool using single-cell RNA-sequencing data
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02493-2
PMID:39543283
|
研究论文 | 开发了一个基于单细胞RNA测序数据的综合人类胚胎参考工具，用于评估人类胚胎模型 | 整合了六个已发表的人类胚胎数据集，构建了首个从受精卵到原肠胚发育阶段的通用参考工具 | 依赖于已发表数据集，可能受原始数据质量和注释准确性的限制 | 建立人类胚胎发育的标准化参考工具，用于胚胎模型的验证和评估 | 人类胚胎发育过程（从受精卵到原肠胚阶段） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) | 单细胞转录组数据 | 整合六个已发表人类数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1689 | 2025-10-07 |
Identification of novel metabolism-related biomarkers of Kawasaki disease by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1541939
PMID:40276515
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别川崎病的新型代谢相关生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析川崎病中胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关特征基因，并利用机器学习算法鉴定出VIM、CLIC1和ITGB2作为新型诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证这些基因在川崎病发病机制中的具体功能 | 识别川崎病中与胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关的特征细胞和基因，探索其在疾病发病机制中的作用 | 川崎病患者免疫细胞（单核细胞和自然杀伤细胞） | 生物信息学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 实时定量PCR, ROC曲线分析 | hdWGCNA, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 公共数据集GSE1687323和GSE68004，验证数据集GSE73461 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1690 | 2025-10-07 |
Pan-cancer analysis identified CD248 as a potential target for multiple tumor types
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1554632
PMID:40276611
|
研究论文 | 通过泛癌分析鉴定CD248作为多种肿瘤类型的潜在治疗靶点 | 首次通过多数据库整合分析和实验验证，系统性地揭示了CD248在泛癌中的表达特征、预后价值及功能机制 | 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 | 探索CD248在多种肿瘤类型中的表达模式、临床意义和生物学功能 | 多种肿瘤类型（重点关注头颈鳞状细胞癌）及相应细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析 | qRT-PCR, Western blot, transwell assay, scratch wound healing assay, EdU assay, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床预后数据, 单细胞测序数据 | 多种肿瘤数据库数据及HNSC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1691 | 2025-10-07 |
Development of the TP53 mutation associated hypopharyngeal squamous cell carcinoma prognostic model through bulk multi-omics sequencing and single-cell sequencing
2025 Jan-Feb, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2024.101499
PMID:39341197
|
研究论文 | 本研究基于TP53突变构建了下咽鳞状细胞癌预后模型，并通过单细胞测序验证了模型相关基因的表达特征 | 首次结合bulk多组学测序和单细胞测序技术，构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后风险评分模型 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性验证队列 | 构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后预测模型 | 下咽鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 下咽鳞状细胞癌 | bulk多组学测序, 单细胞测序, GSEA, Cox分析, LASSO分析 | 预后风险评分模型 | 基因组突变数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和6个GEO数据集的下咽鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1692 | 2025-10-07 |
Single-cell Profiling of Intrahepatic Immune Cells Reveals an Expansion of Tissue-resident Cytotoxic CD4+ T Lymphocyte Subset Associated With Pathogenesis of Alcoholic-associated Liver Diseases
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101411
PMID:39349248
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示酒精相关肝病中组织驻留细胞毒性CD4+ T淋巴细胞亚群的扩增及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在酒精相关肝病中发现以GZMK表达为特征的细胞毒性CD4+ T淋巴细胞亚群显著扩增，并揭示其组织驻留特性和终末效应状态 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证发现 | 探索酒精相关肝病中肝脏免疫细胞的转录组特征和免疫病理机制 | 健康个体、代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者和酒精相关肝病患者的肝脏样本 | 单细胞生物学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体、MASLD和ALD患者的肝脏样本，包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1693 | 2025-10-07 |
The Human Milk-derived Peptide Drives Rapid Regulation of Macrophage Inflammation Responses in the Neonatal Intestine
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101420
PMID:39414025
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研究论文 | 本研究鉴定了人乳细胞外囊泡中的一种新型肽CASB135-150，发现其通过靶向肠道巨噬细胞快速调节炎症反应并保护新生儿肠道健康 | 首次在人乳细胞外囊泡中鉴定出β-酪蛋白衍生肽CASB135-150，并阐明其通过破坏FHL2/TRAF6复合物抑制NF-κB信号通路的分子机制 | 研究主要基于大鼠坏死性小肠结肠炎模型，尚未在人类临床研究中验证 | 探索人乳肽在调节新生儿先天免疫稳态和肠道健康中的作用 | 人乳细胞外囊泡肽、大鼠坏死性小肠结肠炎模型、骨髓源性巨噬细胞、肠道巨噬细胞 | 免疫学 | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析,蛋白质相互作用分析,免疫共沉淀,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,组织图像数据 | 大鼠坏死性小肠结肠炎模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 1694 | 2025-10-07 |
Impact of potential biomarkers, SNRPE, COX7C, and RPS27, on idiopathic Parkinson's disease
2025-Jan, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01591-x
PMID:39467967
|
研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定特发性帕金森病的潜在生物标志物SNRPE、COX7C和RPS27 | 首次通过整合全血基因表达、DNA甲基化、microRNA和单细胞RNA测序数据系统筛选帕金森病生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 识别特发性帕金森病的关键基因和分子机制 | 特发性帕金森病患者 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因表达分析,DNA甲基化分析,microRNA分析,单细胞RNA测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据,甲基化数据,microRNA数据,单细胞RNA测序数据 | 特发性帕金森病患者全血样本 | NA | 单细胞RNA测序,全血基因表达分析 | NA | NA |
| 1695 | 2025-10-07 |
Machine learning identification of NK cell immune characteristics in hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and bulk RNA sequencing
2025-Jan, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01581-z
PMID:39433650
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和bulk RNA测序结合机器学习方法，鉴定肝细胞癌中NK细胞的免疫特征标志物CD7 | 首次结合单细胞测序和bulk RNA测序，利用机器学习方法系统鉴定肝细胞癌中NK细胞的免疫特征标志物CD7 | 样本量较小（8例正常肝组织和8例HCC肿瘤组织），需要更大样本验证 | 鉴定肝细胞癌中具有NK细胞免疫特征的分子标志物 | 肝细胞癌组织中的NK细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，RT-qPCR，MTS，流式细胞术 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据 | 8例正常肝组织和8例HCC肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1696 | 2025-10-07 |
Therapeutic targets for hepatocellular carcinoma identified using proteomics and Mendelian randomization
2025-Jan, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16785
PMID:39477889
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和孟德尔随机化方法识别肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 首次整合血浆蛋白质组数据与HCC数据，应用MR方法系统识别10个与HCC风险相关的蛋白质生物标志物 | 研究依赖于公开数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别肝细胞癌的潜在治疗靶点和蛋白标志物 | 肝细胞癌患者和蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学, 孟德尔随机化, 单细胞测序, KEGG通路分析, PPI分析 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据 | 多个GWAS研究队列(7个已发表GWAS), DeCODE队列, FinnGen队列, UK Biobank | NA | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 1697 | 2025-10-07 |
RAC2 as a Tumor-Suppressive Biomarker Associated with T Cell Infiltration in Breast Cancer
2025-Jan, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2024.0142
PMID:39479793
|
研究论文 | 本研究探讨RAC2在乳腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 首次系统揭示RAC2作为抑癌生物标志物与T细胞浸润的关联，并验证其诊断和预后价值 | 研究主要基于公共数据库分析，需要进一步实验验证 | 探索RAC2在乳腺癌中的作用机制及其临床价值 | 乳腺癌组织和正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化分析, 基因集富集分析 | ROC曲线分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1698 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 high-expression macrophages mediate renal tubular epithelial cell damage in acute kidney injury following acute type A aortic dissection surgery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1530741
PMID:40270593
|
研究论文 | 本研究探讨S100A8/A9高表达巨噬细胞在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中对肾小管上皮细胞的损伤机制 | 首次揭示S100A8/A9通过促进巨噬细胞向M1表型转化并激活TNF信号通路导致急性肾损伤的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在人体临床样本中验证 | 阐明S100A8/A9在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中的分子机制 | 肾小管上皮细胞(TCMK-1)、巨噬细胞(RAW264.7)、AKI小鼠模型 | 分子生物学 | 急性肾损伤、心血管疾病 | 转录组测序、单细胞测序、分子生物学实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 细胞系和小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 1699 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing in diffuse large B-cell lymphoma: tumor heterogeneity, microenvironment, resistance, and prognostic markers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1583250
PMID:40270607
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的关键发现，包括肿瘤异质性、微环境相互作用、耐药机制和预后生物标志物 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学和单细胞多组学技术，为DLBCL的精准治疗策略开发提供新见解 | NA | 总结单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的应用和发现 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1700 | 2025-10-07 |
Mapping Cell Identity from scRNA-seq: A primer on computational methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.051
PMID:40270709
|
综述 | 本文提供了单细胞RNA测序中细胞身份注释计算方法的简明概述 | 将现有细胞注释工具系统分类为五大类别，并讨论其关键优势、局限性和应用范围 | 主要面向新用户和非计算科学家，可能未涵盖所有高级技术细节 | 为单细胞RNA测序数据中的细胞身份注释计算方法提供入门指南 | 单细胞RNA测序数据和相关的计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |