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当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 1661 - 1680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-10-07 |
Exploring Core Genes Associated with Sepsis and Systemic Inflammatory Response Syndrome Using Single-Cell Sequencing Technology
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S448900
PMID:39935525
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术探索脓毒症和全身炎症反应综合征的核心基因 | 首次通过单细胞转录组分析揭示脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本中免疫细胞亚群的差异表达基因 | 样本量有限，缺乏独立验证队列 | 识别脓毒症和SIRS的独特生物标志物和免疫应答模式 | 脓毒症死亡患者和全身炎症反应综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 脓毒症，全身炎症反应综合征 | 单细胞RNA测序 | UMAP细胞聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 脓毒症死亡组和SIRS患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1662 | 2025-10-07 |
Tgfβ signaling stimulates glycolysis to promote the genesis of synovial joint interzone in developing mouse embryonic limbs
2025-Jan-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq4991
PMID:39772668
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现滑膜关节初始区细胞形成需要糖酵解增强，且这一过程部分依赖于Tgfβ信号通路 | 首次揭示糖酵解在软骨细胞向关节初始区细胞转化中的关键作用，并阐明Tgfβ信号通过mTOR和Hif1α激活糖酵解的分子机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究滑膜关节初始区细胞形成的分子机制 | 小鼠胚胎膝关节原基 | 发育生物学 | 关节发育异常 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎膝关节原基细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1663 | 2025-10-07 |
APMAT analysis reveals the association between CD8 T cell receptors, cognate antigen, and T cell phenotype and persistence
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631993
PMID:39829843
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研究论文 | 开发APMAT框架用于高通量捕获和分析CD8 T细胞，揭示抗原-TCR对的理化特征与T细胞表型和持久性的关联 | 首次提出整合实验与计算的APMAT框架，能够同时捕获抗原、TCR序列和单细胞转录组数据 | 研究样本仅限于HLA A*02:01基因型的COVID-19参与者 | 阐明CD8 T细胞受体、抗原和T细胞表型之间的关联关系 | CD8 T细胞及其受体、SARS-CoV-2病毒抗原 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序, TCR测序 | 计算分析框架 | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | 62名HLA A*02:01 COVID-19参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1664 | 2025-10-07 |
TDO2 + cancer-associated fibroblasts mediate cutaneous squamous cell carcinoma immune escape via impeding infiltration of CD8 + T cells
2025-Jan-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03921-0
PMID:39751882
|
研究论文 | 本研究揭示TDO2+癌症相关成纤维细胞通过抑制CD8+T细胞浸润介导皮肤鳞状细胞癌免疫逃逸的机制 | 首次报道TDO2在cSCC的CAFs中高表达及其通过抑制CD8+T细胞浸润促进免疫逃逸的作用机制 | NA | 探索皮肤鳞状细胞癌免疫逃逸的分子机制 | 皮肤鳞状细胞癌组织、癌症相关成纤维细胞、CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1665 | 2025-10-07 |
Identification of EGR1 as a Key Diagnostic Biomarker in Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) Through Machine Learning and Immune Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499396
PMID:39925925
|
研究论文 | 通过机器学习和免疫分析鉴定EGR1作为代谢功能障碍相关脂肪性肝病的关键诊断生物标志物 | 首次结合多种机器学习方法和免疫分析鉴定EGR1作为MASLD的关键诊断生物标志物，并构建了TF-miRNA-mRNA调控网络 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多实验验证 | 识别MASLD的有效诊断生物标志物并探索其发病机制 | MASLD患者基因表达数据、AML-12细胞系、MCD小鼠模型 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 微阵列分析、单细胞RNA测序、机器学习算法 | LASSO, SVM, Random Forest | 基因表达数据 | 六个GEO数据集，包括训练集和验证集 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 1666 | 2025-10-07 |
Crosstalk of SPINK4 Expression With Patient Mortality, Immunotherapy and Metastasis in Pan-Cancer Based on Integrated Multi-Omics Analyses
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S487126
PMID:39926372
|
研究论文 | 基于多组学分析揭示SPINK4基因表达与泛癌患者死亡率、免疫治疗和转移的相互作用 | 首次系统研究SPINK4在泛癌中的表达特征及其与肿瘤微环境、干细胞特性、免疫浸润和化疗敏感性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库分析，实验验证仅限于结肠腺癌细胞系 | 探究SPINK4在不同癌症类型中的功能及其与肿瘤进展的关系 | 泛癌患者组织样本和结肠腺癌细胞系(HCT116和RKO) | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析,单细胞测序,伤口愈合实验,Transwell实验 | Kaplan-Meier生存分析,Pearson相关分析 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | TCGA数据库中的泛癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 1667 | 2025-10-07 |
Progress in Assessing Retinal Microglia Using Single-Cell RNA Sequencing
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-76550-6_24
PMID:39930187
|
研究论文 | 比较两种视网膜细胞制备方法和三种数据库整合算法在评估视网膜小胶质细胞方面的效果 | 首次系统比较胶原酶消化+FACS富集与木瓜蛋白酶全视网膜消化两种方法，以及CCA、RPCA和Harmony三种整合算法在视网膜小胶质细胞研究中的表现 | 仅针对健康视网膜进行研究，未涉及病变状态下的验证 | 评估不同细胞制备方法和数据分析算法在视网膜小胶质细胞研究中的适用性 | 视网膜小胶质细胞 | 单细胞分析 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | CCA, RPCA, Harmony | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1668 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of SEPN1 in glioma: Prognostic roles, functional implications, and potential therapeutic interventions
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318501
PMID:39919065
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了SEPN1在胶质瘤中的预后价值、功能作用及潜在治疗干预 | 首次系统阐明SEPN1在胶质瘤中的致癌作用，开发了SEPN1相关风险评分(SRS)，并基于此识别潜在抗胶质瘤药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证SEPN1的具体分子机制 | 探究SEPN1在泛癌中的表达特征和预后意义，特别聚焦于胶质瘤 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA、CGGA、GEO和ZN-GC多个队列的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1669 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1670 | 2025-10-07 |
Epithelial and immune transcriptomic characteristics and possible regulatory mechanisms in asthma exacerbation: insights from integrated studies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512053
PMID:39917297
|
研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序分析哮喘急性加重期的上皮细胞和免疫细胞特征，并鉴定关键调控基因 | 首次系统性地整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示哮喘急性加重期上皮细胞和免疫细胞的异质性及关键调控基因 | 研究样本量未明确说明，需要进一步实验验证关键基因的功能机制 | 探索哮喘急性加重的上皮细胞和免疫细胞转录组特征及调控机制 | 哮喘患者的上皮细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1671 | 2025-10-07 |
RGS10 Deficiency Alleviated Intestinal Mucosal Inflammation Through Suppression of Th1/Th17 Cell Immune Responses in Ulcerative Colitis
2025-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13869
PMID:39428350
|
研究论文 | 本研究揭示了RGS10通过调控Th1/Th17细胞分化在溃疡性结肠炎肠道黏膜炎症中的作用机制 | 首次发现RGS10在UC患者CD4 T细胞中高表达，并阐明其通过结合PTPN2调控STAT1/STAT3磷酸化影响Th1/Th17细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究RGS10在溃疡性结肠炎发病机制中的作用 | 溃疡性结肠炎患者样本和RGS10基因敲除小鼠 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 免疫荧光, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | UC患者和健康对照样本，RGS10敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1672 | 2025-10-07 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_13
PMID:39900764
|
研究论文 | 介绍SciDAP平台如何简化单细胞测序数据分析流程 | 开发了基于通用工作流语言的便携可重复分析流程，为非计算背景的生物学家提供用户友好的单细胞数据分析方案 | 未提及平台性能的具体量化评估数据 | 解决单细胞测序数据分析的复杂性和可重复性问题 | 单细胞测序数据分析流程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | SciDAP | 基于通用工作流语言的计算分析平台 |
| 1673 | 2025-10-07 |
Improving doublet cell removal efficiency through multiple algorithm runs
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.009
PMID:39911841
|
研究论文 | 提出一种多轮双细胞去除策略，通过多次运行算法提高单细胞RNA测序数据中双细胞的去除效率 | 首次提出多轮双细胞去除策略，通过循环运行算法减少随机性，显著提升双细胞检测效果 | 未明确说明计算成本增加程度，且策略效果依赖于基础算法的性能 | 提高单细胞RNA测序数据分析中双细胞去除的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | DoubletFinder, cxds, bcds, hybrid | 单细胞RNA测序数据 | 14个真实数据集、29个条形码标记数据集和106个合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1674 | 2025-10-07 |
GraphVelo allows for accurate inference of multimodal velocities and molecular mechanisms for single cells
2025-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626638
PMID:39677753
|
研究论文 | 提出基于图机器学习的方法GraphVelo，用于从单细胞数据中准确推断多模态速度和分子机制 | 通过图机器学习方法将RNA速度扩展到多模态数据，保留向量大小和方向信息，揭示基因、病毒与宿主细胞之间的定量非线性调控关系 | 需要依赖现有方法推断的RNA速度作为输入，对复杂转录动态、低表达或缺乏剪接动态的基因可能仍有局限 | 开发能够从高通量单细胞快照数据中提取时间分辨信息的方法 | 单细胞数据，包括病毒-宿主相互作用组和多组学数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, 多组学分析 | 图机器学习 | 单细胞RNA测序数据，多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学 | NA | NA |
| 1675 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Evolutionary Reconfiguration of Embryonic Cell Fate Specification in the Sea Urchin Heliocidaris erythrogramma
2025-Jan-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evae258
PMID:39587400
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较两种海胆胚胎发育过程，揭示进化过程中细胞命运决定机制的重构 | 首次在进化发育生物学中应用比较单细胞转录组时间序列分析，发现细胞命运决定与主要信号中心在进化过程中发生时空分离 | 研究主要基于转录组数据，需要后续实验验证调控相互作用的改变 | 探究海胆进化过程中胚胎发育机制的演化改变 | Heliocidaris erythrogramma和Lytechinus variegatus两种海胆的胚胎细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种海胆物种的胚胎发育时间序列样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1676 | 2025-02-06 |
Biologically inspired heterogeneous learning for accurate, efficient and low-latency neural network
2025-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwae301
PMID:39758128
|
研究论文 | 本文提出了一种受生物启发的异质学习机制，用于构建准确、高效且低延迟的神经网络 | 结合了自抑制突触和神经元异质性的神经科学发现，创新性地提出了具有增强学习和记忆能力的脉冲神经网络（SNN） | 未明确提及具体限制 | 追求与生物神经网络相媲美的准确性、效率和低延迟的人工神经网络 | 脉冲神经网络（SNN）及其在AI任务中的应用 | 机器学习 | 脑部疾病 | scRNA-seq | SNN | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 1677 | 2025-02-05 |
Bioinformatics combining machine learning and single-cell sequencing analysis to identify common mechanisms and biomarkers of rheumatoid arthritis and ischemic heart failure
2025-Jan-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e41641
PMID:39897930
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞测序分析，旨在识别类风湿性关节炎（RA）和缺血性心力衰竭（IHF）的共同机制和生物标志物 | 通过整合多个RA和IHF数据集的RNA测序数据，识别出177个共同差异表达基因，并通过PPI网络分析和机器学习确定了五个枢纽基因，揭示了炎症免疫反应在RA患者IHF进展中的关键作用 | 研究依赖于现有数据集，可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别RA和IHF的共同机制和生物标志物，为早期诊断、个性化治疗和预防策略提供方向 | 类风湿性关节炎（RA）和缺血性心力衰竭（IHF）患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎, 缺血性心力衰竭 | RNA测序, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习 | RNA测序数据 | 五个RA和IHF数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1678 | 2025-02-05 |
Multi-omics analysis of core E3 ubiquitin ligase identifies prognostic biomarkers associated with immune infiltration and drug sensitivity in lung adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.104837
PMID:39895786
|
研究论文 | 本文通过多组学分析核心E3泛素连接酶，识别了与肺腺癌免疫浸润和药物敏感性相关的预后生物标志物 | 首次系统研究了E3泛素连接酶在肺腺癌中的表达、预后、免疫浸润、药物敏感性及潜在分子机制，并发现其与不良预后和特定免疫细胞浸润相关 | 研究主要基于数据库分析和计算机模拟，缺乏实验验证 | 研究E3泛素连接酶在肺腺癌中的调控作用及其作为预后和药物敏感性标志物的潜力 | 肺腺癌（LUAD）患者及肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 多组学分析、免疫荧光分析、免疫组化、单细胞分析、空间转录组学、分子对接 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、免疫浸润数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1679 | 2025-02-05 |
Integrating of Radiomics and Single-cell Transcriptomics Uncovers the Crucial Role of γδ T Cells in Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105586
PMID:39895781
|
研究论文 | 本研究通过整合放射组学和单细胞转录组学，揭示了γδ T细胞在肺腺癌中的关键作用 | 首次结合多组学数据研究γδ T细胞在肺腺癌中的功能，并建立了基于放射组学的预测模型 | γδ T细胞在肿瘤中的双重作用及其对肺腺癌的影响仍存在争议 | 探讨γδ T细胞在肺腺癌中的功能及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 放射组学、单细胞转录组学 | 预测模型 | CT图像、单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1680 | 2025-02-05 |
Integration of Single-Cell and Bulk Transcriptomes to Identify a Poor Prognostic Tumor Subgroup to Predict the Prognosis of Patients with Early-stage Lung Adenocarcinoma
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.105926
PMID:39895784
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，识别了早期肺腺癌的不良预后肿瘤亚群，并构建了预后模型 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征，并开发了一个基于KRT8和PERP的新型预后模型 | 研究主要依赖于已发表的文献和数据库中的细胞标记物，可能限制了新细胞类型的发现 | 研究早期肺腺癌的肿瘤微环境特征并开发预后模型 | 早期肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），逆转录定量聚合酶链反应（RT-qPCR），蛋白质印迹（western blot） | 预后模型 | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |