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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2025-10-07 |
Cross one single body 49 tissues single-cell transcriptome reveals detailed macrophage heterogeneity during pig pregnancy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574120
PMID:40242774
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研究论文 | 通过单头健康怀孕猪49个组织的单细胞转录组测序,揭示妊娠期间巨噬细胞的详细异质性 | 首次在单一个体水平构建了涵盖49个组织的巨噬细胞单细胞转录组图谱,揭示了妊娠期巨噬细胞的跨组织异质性和物种间保守性 | 研究仅基于单一个体,样本量有限,需要在更多个体中验证结果 | 研究妊娠期间巨噬细胞的转录组异质性和组织特异性适应机制 | 健康怀孕猪的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关生理变化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 单头怀孕猪的49个组织,共114,881个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1662 | 2025-04-19 |
Editorial: Spatial transcriptome and single-cell sequencing for exploring molecular mechanisms of neuroimmunity and discovering novel markers of neurological diseases
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1582019
PMID:40248015
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1663 | 2025-10-07 |
Interferon-γ Signaling in Eosinophilic Esophagitis Affects Epithelial Barrier Function and Programmed Cell Death
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101466
PMID:39884574
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示嗜酸性食管炎中上皮细胞是干扰素反应特征基因表达最高的细胞类型,并发现IFN-γ对上皮屏障功能和细胞凋亡的显著影响 | 研究样本量有限,器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究嗜酸性食管炎中干扰素信号对食管上皮细胞功能的影响机制 | 嗜酸性食管炎患者的上皮细胞和器官模型 | 单细胞基因组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 器官培养 | 器官模型 | 基因表达数据 | 嗜酸性食管炎患者活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1664 | 2025-10-07 |
Cellular Crosstalk Promotes Hepatic Progenitor Cell Proliferation and Stellate Cell Activation in 3D Co-culture
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101472
PMID:39892785
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研究论文 | 开发3D共培养系统研究肝祖细胞与星状细胞间的相互作用及其在肝损伤中的作用 | 建立首个能实时观察肝祖细胞增殖与星状细胞激活的3D共培养模型,并发现两种细胞需直接接触才能相互影响 | 研究主要基于小鼠细胞,人类样本验证有限;3D培养系统可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究肝损伤过程中肝祖细胞与星状细胞间的功能相互作用机制 | 小鼠肝星状细胞和肝祖细胞(未分化肝内胆管细胞类器官) | 细胞生物学 | 肝纤维化 | 3D共培养、荧光标记、细胞分选、基因表达分析、空间转录组学 | 3D器官共培养系统 | 基因表达数据、形态学观察数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1665 | 2025-10-07 |
Exploring the impact of cuproptosis on prostate cancer prognosis via RNA methylation regulation based on single cell and bulk RNA sequencing data
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1573611
PMID:40235543
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据探索铜死亡和RNA甲基化调控对前列腺癌预后的影响 | 首次将铜死亡与RNA甲基化调控因子结合构建前列腺癌预后模型,并通过单细胞测序揭示免疫特征 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索铜死亡和RNA甲基化调控在前列腺癌预后中的作用机制 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR,免疫组化 | LASSO Cox回归模型 | 基因组数据,临床数据,单细胞测序数据 | TCGA前列腺癌数据集及外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1666 | 2025-10-07 |
Unveiling purine metabolism dysregulation orchestrated immunosuppression in advanced pancreatic cancer and concentrating on the central role of NT5E
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569088
PMID:40236698
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示胰腺癌中嘌呤代谢失调如何促进免疫抑制微环境形成,并确定NT5E在此过程中的核心作用 | 首次在胰腺癌微环境中系统分析嘌呤代谢异质性,发现NT5E是逆转免疫抑制的关键靶点 | 研究样本量有限,需要进一步临床验证 | 探究胰腺癌嘌呤代谢重编程与免疫抑制微环境的关系 | 胰腺癌患者肿瘤微环境中的各类细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞共培养 | AUCell, Ucell, Cellchat | 转录组数据, 空间数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1667 | 2025-10-07 |
PM2.5 exposure reprograms cell cycle dynamics in uterine immune cells at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561290
PMID:40236703
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PM2.5暴露对小鼠子宫免疫细胞周期动态的重编程作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示PM2.5暴露对子宫免疫细胞周期动态的细胞类型特异性影响 | 研究仅基于小鼠模型,样本量为9,000个细胞,需要进一步验证 | 探究PM2.5暴露对生殖系统免疫细胞周期调控的细胞机制 | 小鼠子宫免疫细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9,000个平衡细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1668 | 2025-10-07 |
Multidimensional transcriptomics based to illuminate the mechanisms of taurine metabolism in immune resistance of pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567805
PMID:40230840
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了牛磺酸代谢在胰腺癌免疫抵抗中的作用机制 | 首次识别了四种不同的肿瘤细胞亚群,建立了'牛磺酸-免疫互作'标准,发现了LY6D作为潜在治疗靶点 | NA | 探索牛磺酸代谢紊乱与胰腺癌免疫治疗之间的潜在治疗关系 | 胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | Seurat, DoubletFinder, Harmony, GSVA, CellChat | 单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1669 | 2025-10-07 |
CD121b-positive neutrophils predict immunosuppression in septic shock
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565797
PMID:40230851
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脓毒症休克患者外周血中存在CD121b阳性中性粒细胞亚群,并证实其与免疫抑制状态相关 | 首次在脓毒症休克患者中鉴定出具有免疫抑制特性的CD10-CD121b+中性粒细胞亚群,并发现其与疾病严重程度正相关 | 样本量有限,需要更大规模研究验证CD121b作为生物标志物的可靠性 | 探讨中性粒细胞在脓毒症休克免疫抑制中的具体作用机制 | 健康供者和脓毒症休克患者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症休克 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 人源化小鼠模型 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 健康供者和脓毒症休克患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1670 | 2025-10-07 |
Discovering biomarkers associated with infiltration of CD8+ T cells and tumor-associated fibrosis in colon adenocarcinoma using single-cell RNA sequencing and gene co-expression network
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1496640
PMID:40230854
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析,发现与结肠腺癌中CD8+ T细胞浸润和肿瘤相关纤维化相关的生物标志物 | 首次结合单细胞转录组分析、WGCNA和蛋白质相互作用网络,鉴定出LARS2、SEZ6L2和SOX7三个与CD8+ T细胞相关的关键基因 | 研究数据来源于公共数据库GEO,需要进一步实验验证 | 鉴定与结肠腺癌预后相关的生物标志物,阐明CD8+ T细胞和肿瘤相关纤维化的作用机制 | 结肠腺癌样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 实时PCR, 免疫组化, 蛋白质印迹 | LASSO回归, Cox回归, WGCNA | 基因表达数据 | GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1671 | 2025-10-07 |
The role of transketolase in the immunotherapy and prognosis of hepatocellular carcinoma: a multi-omics approach
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529029
PMID:40230848
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研究论文 | 通过多组学方法探讨转酮醇酶在肝细胞癌免疫治疗和预后中的作用 | 首次采用多组学方法系统分析TKT在HCC中的表达模式,结合单细胞分析和空间转录组学揭示其在免疫细胞浸润和细胞分化中的新功能 | 需要进一步研究来完全阐明TKT在免疫治疗中的具体作用机制 | 探索转酮醇酶在肝细胞癌免疫治疗和预后中的生物学作用 | 肝细胞癌患者样本和癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 甲基化分析, 单细胞分析, 空间转录组学, RT-qPCR, siRNA转染, 荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀 | 列线图模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 空间表达数据 | 多种癌症样本和HCC患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1672 | 2025-10-07 |
Modeling reproductive and pregnancy-associated tissues using organ-on-chip platforms: challenges, limitations, and the high throughput data frontier
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1568389
PMID:40236940
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综述 | 本文综述了器官芯片技术在生殖和妊娠相关组织建模中的应用、挑战及高通量数据前沿 | 探讨了利用空间转录组学、飞行时间成像细胞术和外泌体分析等新方法克服器官芯片平台限制的创新途径 | 设备限制、分子和生化检测方法的不足、细胞数量少、上清液体积低以及制造材料限制 | 评估器官芯片技术在生殖和妊娠相关组织建模中的现状、挑战和发展前景 | 生殖和妊娠相关器官芯片平台 | 生物医学工程 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学, 飞行时间成像细胞术, 外泌体分析, 显微成像, 免疫细胞化学, 实时聚合酶链反应, 细胞因子多重分析 | 器官芯片模型 | 图像, 分子数据, 细胞因子数据 | NA | NA | 器官芯片, 微生理系统 | NA | NA |
| 1673 | 2025-10-07 |
Vascular smooth muscle cell-derived SO2 sulphenylated interferon regulatory factor 1 to inhibit VSMC senescence
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1516885
PMID:40223932
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研究论文 | 本研究揭示了内源性二氧化硫通过亚磺酰化干扰素调节因子1抑制血管平滑肌细胞衰老的分子机制 | 首次发现SO2通过IRF1蛋白C83位点的亚磺酰化修饰抑制VSMC衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,人类临床相关性需要进一步验证 | 探索内源性SO2在血管平滑肌细胞衰老中的作用及其分子通路 | 老年小鼠、VSMC特异性AAT1敲除小鼠、D-半乳糖处理的主动脉环和大鼠VSMC系A7r5 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | Western blot、单细胞RNA测序、实时定量PCR、SA-β-gal染色、生物素转换实验、定点突变 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据、细胞染色数据 | 老年小鼠(24月龄)、基因修饰小鼠模型、细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1674 | 2025-10-07 |
Bioinformatic Analysis of Apoptosis-Related Genes in Preeclampsia Using Public Transcriptomic and Single-Cell RNA Sequencing Datasets
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S507660
PMID:40224388
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研究论文 | 通过公共转录组和单细胞RNA测序数据分析先兆子痫中凋亡相关基因及其细胞机制 | 首次结合转录组学和单细胞RNA测序技术系统分析先兆子痫中凋亡相关基因,并构建诊断列线图 | 所有数据均来自公共数据库,需进一步实验验证 | 探索先兆子痫中凋亡相关基因作为生物标志物的潜力及其细胞机制 | 先兆子痫患者胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR | CytoHubba算法, 诊断列线图 | 基因表达数据 | 公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1675 | 2025-10-07 |
Causal Associations of Inflammatory Cytokines With Osteosarcopenia: Insights From Mendelian Randomization and Single Cell Analysis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/6005225
PMID:40224485
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序分析炎症细胞因子与骨少肌症的因果关系 | 首次整合孟德尔随机化和单细胞RNA测序方法研究细胞因子在骨少肌症中的因果作用 | 研究结果为初步发现,需要进一步研究验证 | 阐明循环细胞因子在骨少肌症发病机制中的因果作用 | 骨少肌症(骨质疏松和肌肉减少症共存)患者 | 生物医学研究 | 老年疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | 两样本孟德尔随机化 | 基因组关联研究数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个队列的公开GWAS数据,分析91种循环细胞因子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1676 | 2025-10-07 |
Mendelian Randomization Combined with Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Role of the Key Gene PCLAF in the Pathogenesis of Atopic Dermatitis
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S506139
PMID:40225314
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研究论文 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组分析揭示PCLAF基因在特应性皮炎发病机制中的关键作用 | 首次将孟德尔随机化与单细胞转录组分析相结合,系统性地识别特应性皮炎的关键致病基因和代谢通路 | 研究结果需要进一步实验验证,样本来源和数量可能存在限制 | 探索特应性皮炎的遗传和代谢分子机制 | 特应性皮炎相关的基因和细胞类型 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 基因集富集分析 | edgeR, Seurat | 基因表达数据, eQTL数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1677 | 2025-10-07 |
Targeting formyl peptide receptor 2 to suppress neuroinflammation in neuromyelitis optica spectrum disorder
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107303
PMID:40225578
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研究论文 | 本研究探讨了甲酰肽受体2(FPR2)在视神经脊髓炎谱系障碍(NMOSD)神经炎症中的作用及其治疗潜力 | 首次揭示FPR2/mFpr2通过调控小胶质细胞活性参与NMOSD神经炎症的新机制 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证有限 | 研究FPR2在NMOSD神经炎症中的作用及FPR2拮抗剂的治疗潜力 | NMOSD患者外周血样本和NMOSD小鼠模型 | 神经免疫学 | 视神经脊髓炎谱系障碍 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,MRI,免疫染色 | NA | 基因表达数据,影像数据,细胞计数数据 | NMOSD患者和健康对照的外周血样本,NMOSD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1678 | 2025-10-07 |
FOS-driven inflammatory CAFs promote colorectal cancer liver metastasis via the SFRP1-FGFR2-HIF1 axis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.111625
PMID:40225580
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了FOS驱动的炎症性癌症相关成纤维细胞通过SFRP1-FGFR2-HIF1轴促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次鉴定出与不良预后相关的炎症性CAF亚型(CFD iCAFs),并阐明其通过FOS介导的SFRP1过表达促进肿瘤干细胞性和上皮间质转化的新机制 | 未明确说明样本数量,机制研究主要依赖细胞系和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌肝转移中的作用机制 | 结直肠癌患者样本(非转移性原发肿瘤和转移性原发肿瘤)、SW480和CT26细胞系、BALB/c小鼠 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 动物模型 | 皮下异种移植模型, 原位肿瘤转移模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1679 | 2025-10-07 |
Deciphering single-cell landscape unravels cell-type-specific functional roles of RNA m6A modification in atherosclerosis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104179
PMID:40225569
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了m6A修饰在动脉粥样硬化中细胞类型特异性功能调控机制 | 首次在单细胞水平构建了动脉粥样硬化中m6A修饰的调控图谱,揭示了细胞类型特异性的调控功能 | NA | 阐明m6A修饰在动脉粥样硬化中的细胞类型特异性调控功能 | 动脉粥样硬化患者样本中的多种细胞类型(内皮细胞、平滑肌细胞、巨噬细胞等) | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1680 | 2025-10-07 |
Integrated Phenotypic and Transcriptomic Analyses of Osteoporosis in Type 2 Diabetic Mice
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109537
PMID:40225857
|
研究论文 | 本研究通过整合表型和转录组分析,揭示了2型糖尿病早期骨质疏松的表型特征及骨髓间充质干细胞的功能异常 | 首次在2型糖尿病早期阶段系统揭示骨质疏松表型,并通过单细胞RNA测序发现骨髓间充质干细胞在糖尿病性骨质疏松中的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型,结果需要进一步在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病对骨骼的影响,特别是在疾病早期阶段 | 高脂饮食诱导的2型糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 骨质疏松 | RNA测序,单细胞RNA测序,微计算机断层扫描,免疫荧光染色,酶联免疫吸附测定 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 4周和16周高脂饮食喂养的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |