单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 2148 篇文献,本页显示第 1641 - 1660 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1641 2025-10-07
Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析鉴定出抗性MDSCs和应激耐受基因共表达网络作为多种疾病环境中MDSCs的共同特征 首次发现炎症信号与细胞应激共同诱导产生具有保留MDSC特征的抗性MDSCs,并鉴定出特异性应激耐受基因模块 研究主要基于体外诱导模型,需要更多体内验证 鉴定不同组织来源MDSCs的共同分子特征 髓源性抑制细胞(MDSCs) 单细胞转录组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 GM-CSF+ IL-6诱导的人MDSCs,血清饥饿处理的PBMCs,以及已发表的批量与单细胞转录组数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1642 2025-10-07
Mapping immunotherapy potential: spatial transcriptomics in the unraveling of tumor-immune microenvironments in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 探讨空间转录组学技术在解析头颈部鳞状细胞癌肿瘤-免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的指导意义 整合空间与分子信息揭示肿瘤-免疫微环境的复杂空间结构,为个性化免疫治疗提供新视角 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 提升头颈部鳞状细胞癌免疫检查点抑制剂治疗效果 头颈部鳞状细胞癌的肿瘤-免疫微环境 空间转录组学 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1643 2025-10-07
A Novel Prognostic Signature Integrating Immune and Glycolytic Pathways for Enhanced Prognosis and Immunotherapy Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究建立了一个整合免疫和糖酵解相关基因的预后特征模型,用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 首次构建了整合免疫和糖酵解通路的预后特征模型,并在单细胞水平验证了其与肿瘤免疫微环境的关联 NA 开发肝细胞癌预后预测模型并评估其在免疫治疗中的应用价值 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 RNA测序,单细胞测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线分析 多变量Cox回归模型,预后列线图 基因表达数据,临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 NA RNA-seq,单细胞测序 NA NA
1644 2025-10-07
Inflammatory Cell Interactions in the Rotator Cuff Microenvironment: Insights From Single-Cell Sequencing
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
综述 通过单细胞RNA测序技术揭示肩袖损伤微环境中免疫细胞与非免疫细胞的相互作用机制 首次系统整合单细胞测序技术解析肩袖损伤微环境中的细胞互作网络,发现慢性炎症的分子特征 NA 探讨肩袖损伤微环境中细胞相互作用对炎症和组织修复的影响 肩袖损伤微环境中的巨噬细胞、T细胞、成纤维细胞和肌成纤维细胞 数字病理学 运动系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1645 2025-10-07
Evolutionary convergence of sensory circuits in the pallium of amniotes
2025-01-02, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过比较鸟类、蜥蜴和哺乳动物的端脑感觉回路发育与演化,揭示了羊膜动物高阶感觉处理的趋同进化现象 首次结合细胞生成时间分析、单细胞RNA与空间转录组学及数学模型,系统比较不同羊膜动物端脑感觉回路的发育演化关系 仅研究了三种代表性物种(鸡、壁虎、小鼠),可能无法完全代表所有羊膜动物的多样性 探究羊膜动物端脑中结构和功能等效的感觉回路的进化关系 鸟类(鸡)、蜥蜴(壁虎)和哺乳动物(小鼠)的端脑感觉回路 神经科学 NA 细胞生成时间分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,数学建模 NA 基因表达数据,空间转录组数据,发育时间数据 三种物种(鸡、壁虎、小鼠)的端脑组织样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1646 2025-10-07
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的实验方案 开发了角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液分离方案,并应用于自噬缺陷模型研究 NA 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的贡献 小鼠角膜缘上皮干细胞 单细胞测序 眼科疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1647 2025-10-07
Identification and Characterization of Prognostic Macrophage Subpopulations for Human Esophageal Carcinoma
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析食管癌组织中巨噬细胞的异质性、分化轨迹和细胞间通讯,并鉴定出一个与预后相关的巨噬细胞亚型 首次在单细胞水平系统分析食管癌中巨噬细胞的多样性,鉴定出HSPA6+巨噬细胞这一预后相关亚型,并揭示其与肥大细胞和单核细胞的通讯增强 研究基于公共数据库的scRNA-seq数据,样本量有限,需要进一步实验验证 分析食管癌中巨噬细胞的多样性、分化轨迹和细胞间通讯及其预后意义 食管癌组织和癌旁组织中的巨噬细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 Seurat, Monocle2, Cell Chat 单细胞RNA测序数据 GSE154763数据集中的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1648 2025-10-07
Comprehensive multiomics analysis identifies PYCARD as a key pyroptosis-related gene in osteoarthritis synovial macrophages
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析确定了PYCARD是骨关节炎滑膜巨噬细胞中关键的焦亡相关基因 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统识别了骨关节炎中巨噬细胞焦亡的核心基因PYCARD 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证PYCARD在骨关节炎发病机制中的具体作用 探索焦亡在骨关节炎发病机制中的作用,并识别关键治疗靶点 骨关节炎患者的滑膜组织和滑膜巨噬细胞 生物信息学 骨关节炎 RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 蛋白互作网络分析, 富集分析 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1649 2025-10-07
Two chemotherapeutic agents expand stem-like CD62L+CD8+ T cells in antitumor immune responses
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示两种化疗药物地西他滨和5-氟尿嘧啶能够通过扩增干细胞样CD8+T细胞增强抗肿瘤免疫反应 首次阐明化疗药物通过促进干细胞样CD8+T细胞分化扩增来增强抗肿瘤免疫的新机制,并发现转录因子Eomes在此过程中的特异性调控作用 研究主要基于小鼠肿瘤模型,人类临床相关性需进一步验证;Eomes敲除仅部分影响地西他滨的作用机制 探究化疗药物对干细胞样CD8+T细胞亚群在抗肿瘤免疫应答中的调控作用 结直肠癌患者样本、野生型和Eomes条件性敲除小鼠的CT26和B16肿瘤模型 免疫学 结直肠癌 单细胞测序、流式细胞术 NA 单细胞测序数据、流式细胞数据 人类结直肠肿瘤样本、小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1650 2025-10-07
Repertoire-based mapping and time-tracking of T helper cell subsets in scRNA-Seq
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发了一种利用免疫受体库数据将表型分选的T辅助细胞亚群映射到单细胞RNA测序谱的方法 开发了TCR-Track方法,利用免疫受体库数据精确映射T辅助细胞亚群,优于基于CITE-Seq的映射方法 研究样本数量有限,仅包含122名供体 解析单细胞RNA测序聚类与传统表征的T辅助细胞亚群之间的关系 CD4+ T辅助细胞亚群 单细胞生物学 COVID-19 单细胞RNA测序,CITE-Seq,免疫受体库分析 NA 单细胞RNA测序数据,免疫受体库数据 122名供体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1651 2025-10-07
Single-cell and spatial transcriptomic insights into glioma cellular heterogeneity and metabolic adaptations
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 整合单细胞和空间转录组技术解析胶质母细胞瘤的细胞异质性与代谢重编程 首次系统整合单细胞RNA测序与空间转录组技术揭示胶质瘤细胞亚群的空间分布特征及其代谢适应性 存在代谢冗余和时空动态变化等未解决挑战 解码胶质母细胞瘤代谢景观并探索新型治疗策略 胶质母细胞瘤细胞亚群(恶性增殖细胞、干细胞样细胞、间充质样细胞、免疫相关细胞) 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1652 2025-10-07
Longitudinal Changes in Peripheral and Alveolar Monocyte and Inflammatory Biomarkers are Distinct in Hypercapnia Patients Following Pulmonary Sepsis-Induced ARDS
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 比较肺炎败血症诱发的ARDS患者中高碳酸血症与非高碳酸血症患者的单核细胞和炎症生物标志物的纵向变化 首次通过单细胞RNA测序揭示高碳酸血症患者单核细胞表型和细胞因子风暴基因的独特变化模式 样本量相对较小(61例患者),研究时间较短(仅7天随访) 探究高碳酸血症在肺炎败血症诱发ARDS中的免疫学机制 肺炎败血症诱发的ARDS患者,包括高碳酸血症和非高碳酸血症两组 单细胞组学 急性呼吸窘迫综合征 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据,临床数据 61例重症肺炎患者(11例非败血症对照,50例ARDS患者,其中26例高碳酸血症) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1653 2025-10-07
Integrated multi-omics analysis reveals the functional and prognostic significance of lactylation-related gene PRDX1 in breast cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 通过整合多组学分析揭示乳酸化相关基因PRDX1在乳腺癌中的功能和预后意义 首次系统研究乳酸化相关基因在乳腺癌中的作用,发现PRDX1是关键基因,并构建了基于PRDX1阳性单核细胞的预后预测模型 需要进一步整合其他生物标志物以提高个性化医疗的精确度 研究乳酸化相关基因在乳腺癌中的调控机制和预后意义 乳腺癌患者和相关的基因表达数据 生物信息学 乳腺癌 多组学分析,包括GWAS、单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序 Cox回归,LASSO回归 基因组数据,转录组数据 来自TCGA和GEO数据库的多个乳腺癌数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
1654 2025-10-07
Immune Landscape Variation in Antineutrophil Cytoplasmic Antibody-Associated Vasculitis Circulation Before and After Plasmapheresis by Single-Cell Transcriptome
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析探讨血浆置换前后ANCA相关性血管炎患者外周血免疫细胞的变化 开发了新的单核细胞分类方法,并发现特定单核细胞亚群与AAV疾病活动性的相关性 样本量有限,机制研究仍需深入验证 阐明血浆置换治疗ANCA相关性血管炎的免疫机制 ANCA相关性血管炎患者的外周血单个核细胞 单细胞组学 ANCA相关性血管炎 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 AAV患者治疗前后配对样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1655 2025-10-07
Comprehensive evaluation of methods for identifying tissues or cell types of origin of the plasma cell-free transcriptome
2025, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 系统评估七种解卷积方法在识别血浆游离RNA组织或细胞来源方面的性能 首次综合比较多种解卷积方法在cfRNA溯源分析中的表现,并采用单细胞RNA测序数据作为参考进行深入评估 未明确说明样本规模和具体疾病类型,评估方法可能受限于现有数据集的完整性 评估不同解卷积方法在识别血浆游离RNA组织细胞来源方面的准确性和稳健性 血浆游离RNA及其组织细胞来源 生物信息学 NA 单细胞RNA测序, 转录组分析, 解卷积算法 七种不同的解卷积方法 RNA测序数据, 模拟cfRNA数据, 真实血浆cfRNA数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1656 2025-10-07
Integrative machine learning approach for identification of new molecular scaffold and prediction of inhibition responses in cancer cells using multi-omics data
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,识别新的分子支架并预测癌细胞中的抑制反应 结合机器学习与多组学数据预测药物反应,并采用相似性搜索方法从ChEMBL数据库识别潜在先导化合物 研究为计算机模拟分析,尚未进行实验验证 开发预测癌症细胞药物抑制反应的方法并识别新的治疗分子 癌细胞系和MDM2抑制剂 机器学习 癌症 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学 机器学习 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1657 2025-10-07
Understanding developing kidneys and Wilms tumors one cell at a time
2025, Current topics in developmental biology
综述 本文总结了单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的应用现状与技术选择 系统比较不同单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的适用性,并提出技术组合策略 NA 评估单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的最佳应用方案 肾脏发育过程与Wilms肿瘤 生物医学 Wilms肿瘤 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1658 2025-10-07
Cancer-associated fibroblasts: multidimensional players in liver cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 本文综述了癌症相关成纤维细胞在肝癌微环境中的多维作用及其亚群功能 利用单细胞RNA测序技术结合基因工程小鼠模型,首次在肝癌前微环境和肝内胆管癌微环境中鉴定出多种CAF亚群 NA 阐明不同CAF亚群在肝癌发展中的具体作用和调控机制 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚群 肿瘤微环境研究 肝癌 单细胞RNA测序 基因工程小鼠模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1659 2025-10-07
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Circadian Rhythm Disruption-Related Genes Associated with Prognosis and Drug Resistance in Colorectal Cancer Patients
2025, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 通过整合单细胞和批量RNA测序数据,鉴定与结直肠癌预后和耐药相关的昼夜节律紊乱基因 首次系统揭示昼夜节律相关基因在结直肠癌中的表达特征及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 NA 探索昼夜节律相关基因在结直肠癌中的作用机制及其临床意义 结直肠癌患者样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, GSEA 预后模型 基因表达数据 GSE178318数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1660 2025-10-07
An Integrative Analysis of Transcriptome Combined with Machine Learning and Single-Cell RNA-Seq for the Common Biomarkers in Crohn's Disease and Kidney Stone Disease
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 通过整合转录组分析结合机器学习和单细胞RNA测序技术,鉴定克罗恩病和肾结石病的共同生物标志物 首次整合机器学习算法和单细胞RNA测序技术识别克罗恩病与肾结石病的共同生物标志物 研究基于公共数据库数据,样本量有限,需要进一步实验验证 识别能够预测克罗恩病合并肾结石病的生物标志物 克罗恩病和肾结石病患者数据及人肠道细胞和近端肾小管上皮细胞模型 生物信息学 克罗恩病,肾结石病 转录组分析,机器学习,单细胞RNA测序 Limma,WGCNA,机器学习算法 基因表达数据 三个克罗恩病数据集和一个肾结石病数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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