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当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-10-07 |
TimeFlies: an snRNA-seq aging clock for the fruit fly head sheds light on sex-biased aging
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625273
PMID:39896546
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研究论文 | 开发了一种名为TimeFlies的单细胞RNA测序衰老时钟，用于果蝇头部年龄预测并揭示性别差异的衰老机制 | 首个基于全基因组基因表达谱的泛细胞类型单细胞转录组衰老时钟，能够识别新的生物标志物并揭示性别特异性衰老途径 | 研究仅限于果蝇头部组织，尚未在其他组织或物种中验证 | 开发单细胞转录组衰老时钟并研究衰老过程中的性别差异 | 果蝇头部细胞 | 单细胞测序分析 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1622 | 2025-10-07 |
Integrating Bulk and Single-Cell Transcriptomic Data to Identify Ferroptosis-Associated Inflammatory Gene in Alzheimer's Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497418
PMID:39959647
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了铁死亡相关炎症基因SLC11A1在阿尔茨海默病中的关键作用 | 首次发现SLC11A1在AD促炎小胶质细胞和外周血单核细胞中显著上调，并识别出一个同时表达外周血单核细胞特征标记的微胶质细胞亚群 | 铁死亡、免疫炎症与脑-外周血轴之间的具体分子联系仍需进一步验证 | 探索铁死亡与免疫炎症在阿尔茨海默病中的分子机制 | 阿尔茨海默病患者脑组织和外周血样本，实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠脑组织 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异基因表达分析, WGCNA, RT-qPCR, 免疫荧光 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | AD患者脑组织和外周血样本，EAE小鼠脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1623 | 2025-02-23 |
EPB41L4A-AS1 regulates cervical cancer by proliferative cells: mendelian randomization and single-cell transcriptomics analyses
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-949
PMID:39974380
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，探讨了增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 首次揭示了EPB41L4A-AS1通过调控增殖细胞在宫颈癌中的作用 | 研究主要基于单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，未涉及临床试验验证 | 探讨增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 宫颈癌组织中的增殖细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化、MTT、流式细胞术、GSEA、WGCNA | NA | 单细胞转录组数据 | 宫颈癌组织与健康组织的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1624 | 2025-02-23 |
By integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing, plasma cells signature and tertiary lymphoid structures were verified to contribute to outcome in lung adenocarcinoma
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1746
PMID:39974398
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，验证了浆细胞特征和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，首次系统性地探讨了浆细胞和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的具体作用 | 研究主要依赖于公开数据库的数据，缺乏独立验证队列 | 探讨三级淋巴结构和浆细胞在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1625 | 2025-10-07 |
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.11.627873
PMID:39896473
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研究论文 | 开发了一种名为CMDuo的分子工具平台，用于在单细胞水平上追踪和分析肿瘤细胞群体中的细胞融合事件 | 通过结合报告基因表达和工程化荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码，首次实现了对单个细胞融合事件起源和结果的高通量映射 | NA | 研究细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞 | 单细胞分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | CMDuo | ClonMapper Duo平台，结合报告基因表达和工程化荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码 |
| 1626 | 2025-10-07 |
Classifying cell cycle states and a quiescent-like G0 state using single-cell transcriptomics
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.16.589816
PMID:38659838
|
研究论文 | 开发了一种高分辨率细胞周期分类器ccAFv2，用于单细胞转录组数据中细胞周期状态和静止样G0状态的分类 | 能够区分六个细胞周期状态和一个静止样G0状态，并包含可调参数过滤不确定分类，在分类更多状态的同时性能优于或相当于现有方法 | G0、G1和Late G1状态在神经上皮细胞类型中表现良好，但在其他细胞类型中准确性较低 | 开发高精度的细胞周期状态分类工具 | 人类神经干细胞及来自三个胚层的各种细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞周期分类器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1627 | 2025-10-07 |
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf002
PMID:39960663
|
研究论文 | 开发了一种名为SpaSNE的空间感知降维方法，用于可视化空间分辨分析数据 | 首次将空间信息整合到t-SNE降维方法中，专门针对空间分辨分析数据设计 | NA | 开发适用于空间分辨分析数据的降维和可视化方法 | 空间分辨分析数据 | 空间转录组学 | NA | 空间分辨分析技术 | t-SNE, UMAP, SpaSNE | 空间分子数据 | 多个公共数据集，涵盖不同疾病、组织和细胞类型 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单分子荧光原位杂交 | Visium, STARmap, MERFISH | 10x Visium空间转录组平台 |
| 1628 | 2025-10-07 |
Exploring the cellular and molecular basis of murine cardiac development through spatiotemporal transcriptome sequencing
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf012
PMID:39960664
|
研究论文 | 利用空间转录组测序技术探索小鼠心脏发育过程并构建早期心脏发育的时空细胞图谱 | 首次构建了小鼠早期心脏发育的全面时空细胞图谱，揭示了心脏细胞谱系的空间组织和关键基因动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 探索小鼠心脏发育的细胞和分子基础 | 小鼠心脏发育过程 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1629 | 2025-02-23 |
The landscape of cell regulatory and communication networks in the human dental follicle
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1535245
PMID:39974190
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙囊的细胞组成和调控网络，揭示了牙囊在发育和生物学功能中的复杂调控机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析了人类牙囊的细胞组成和基因调控网络，揭示了血管和免疫细胞在牙囊生物学活动中的相互作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 揭示人类牙囊的细胞组成和调控机制，以理解其在牙周组织发育和生物学功能中的作用 | 人类牙囊 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1630 | 2025-02-23 |
Research hotspots and frontiers in the tumor microenvironment of colorectal cancer: a bibliometric study from 2014 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1525280
PMID:39975599
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究现状、热点和未来趋势 | 首次对2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究进行文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和未来趋势 | 研究仅基于Web of Science核心合集数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 提供结直肠癌肿瘤微环境领域的当前研究状态、热点和未来趋势的全面图景 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 748篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 1631 | 2025-10-07 |
Advancements in single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics: transforming biomedical research
2025, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2025.13922
PMID:39980637
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术的发展及其在生物医学研究中的变革性应用 | 强调空间转录组学在保留RNA转录组空间信息方面的突破性进展，克服了传统单细胞测序技术丢失空间信息的局限性 | 传统单细胞RNA测序技术无法保留RNA转录组的空间信息，因为该过程需要组织解离和细胞分离 | 探讨单细胞测序和空间转录组学技术的最新发展、相关挑战及其在生物医学领域的应用 | 单细胞RNA测序和空间转录组学技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1632 | 2025-10-07 |
Cancer stem cells and tumor-associated macrophages as mates in tumor progression: mechanisms of crosstalk and advanced bioinformatic tools to dissect their phenotypes and interaction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529847
PMID:39981232
|
综述 | 本文系统阐述癌症干细胞与肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤进展中的相互作用机制及生物信息学分析工具 | 整合前沿生物信息学工具（单细胞RNA测序、空间转录组学、轨迹分析）解析CSC-TAM相互作用的表型和机制 | NA | 阐明癌症干细胞与肿瘤微环境免疫细胞（特别是肿瘤相关巨噬细胞）相互作用的分子机制 | 癌症干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 轨迹分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1633 | 2025-10-07 |
An anoikis-related signature predicts prognosis and immunotherapy response in gastrointestinal cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1477913
PMID:39981252
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于失巢凋亡相关基因的预后特征(Anoscore)，用于预测胃肠道癌症患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建了基于失巢凋亡相关基因的预后评分系统，并验证其在胃肠道癌症预后预测和个性化治疗方案选择中的价值 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证 | 探索失巢凋亡相关基因在胃肠道癌症预后中的作用 | 食管癌、胃癌、结肠癌和直肠癌患者 | 生物信息学 | 胃肠道癌症 | RNA测序、单细胞测序分析、无监督聚类分析、Cox回归分析 | LASSO回归、Cox回归模型 | RNA测序数据、临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃肠道癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1634 | 2025-10-07 |
A single-cell mass cytometry-based atlas of the developing mouse brain
2025-Jan, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-024-01786-1
PMID:39695302
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术构建了发育中小鼠大脑的蛋白质表达图谱 | 首次在单细胞水平系统表征发育中小鼠大脑的蛋白质丰度，揭示了与RNA表达差异的功能性细胞状态 | 研究仅针对特定发育时间点的小鼠模型，未涵盖所有脑区发育阶段 | 构建发育中小鼠大脑的单细胞蛋白质表达图谱 | C57/BL6小鼠胚胎期E11.5至出生后P4的整个大脑及四个脑区组织 | 单细胞分析 | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组织化学，RNAscope原位杂交 | NA | 单细胞蛋白质表达数据，单细胞RNA表达数据 | 24,290,787个细胞，每个样本2-4个生物学重复 | NA | 单细胞蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | 40抗体panel的质谱流式分析 |
| 1635 | 2025-10-07 |
Mendelian randomization and multiomics comprehensively reveal the causal relationship and potential mechanism between atrial fibrillation and gastric cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1446661
PMID:39963672
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和多组学分析全面揭示心房颤动与胃癌之间的因果关系及潜在机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、蛋白互作网络、单细胞测序和发育轨迹分析，系统揭示AF与GC的因果关联及成纤维细胞在其中的关键作用 | 研究基于遗传工具变量和公共数据库，需进一步实验验证机制 | 探究心房颤动与胃癌之间的因果关系及分子机制 | 心房颤动患者与胃癌患者的遗传和分子数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA-seq, 蛋白互作网络分析, 富集分析, 转录因子分析 | 两样本孟德尔随机化模型 | 遗传数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 136个AF相关SNPs, 62个AF-GC共关联基因, TCGA-STAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 高通量测序 | NA | NA |
| 1636 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of M2 macrophage-related gene prognostic model and single-cell sequence to predict immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1519677
PMID:39963673
|
研究论文 | 通过整合分析M2巨噬细胞相关基因构建预后模型，结合单细胞测序预测肺腺癌患者的免疫治疗反应 | 首次结合M2巨噬细胞相关基因构建预后特征，并利用单细胞转录组分析揭示分子亚型和异质性 | 研究基于公共数据库的芯片数据，需要进一步实验验证 | 预测肺腺癌患者的免疫治疗疗效和预后 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | WGCNA, LASSO分析, 单细胞转录组分析 | 风险特征模型 | 基因表达芯片数据 | 来自GSE26939和GSE19188数据集的样本 | NA | 基因表达芯片, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1637 | 2025-10-07 |
Identification of Five NK Cell-Related Hub Genes in COPD Using Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S491298
PMID:39963682
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定COPD中五个NK细胞相关枢纽基因 | 首次通过单细胞RNA测序结合生物信息学方法系统分析COPD中NK细胞亚群的特征基因，并鉴定出五个关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于RT-qPCR，需要进一步的功能实验验证 | 探索COPD免疫浸润中的关键基因 | 慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, 伪时间分析 | LASSO回归 | 基因表达数据 | 使用GSE57148和GSE8581数据集，包含COPD患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1638 | 2025-10-07 |
SPP1 as a Prognostic and Immunotherapeutic Biomarker in Gliomas and Other Cancer Types: A Pan-Cancer Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505237
PMID:39963684
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析探讨SPP1作为胶质瘤和其他癌症预后及免疫治疗生物标志物的作用 | 首次在泛癌水平系统分析SPP1的预后价值和免疫治疗潜力，并通过单细胞测序揭示其在胶质瘤微环境中的特异性表达模式 | 研究主要基于生物信息学分析，临床验证数据有限，需要进一步实验和临床试验确认 | 评估SPP1作为癌症预后和免疫治疗生物标志物的潜力 | 胶质瘤（包括胶质母细胞瘤）及其他26种肿瘤类型 | 生物信息学 | 胶质瘤, 泛癌 | 单细胞测序, 基因敲低, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床生存数据 | 来自TCGA、GEO和TISCH数据库的多癌种样本，包括27种肿瘤类型 | UCSC, GEO, TISCH | 单细胞RNA-seq, 泛癌分析 | TCGA Pan-Cancer, TCGA-GBM, UALCAN | UCSC TCGA泛癌数据集、TCGA胶质母细胞瘤数据集、UALCAN分析平台 |
| 1639 | 2025-10-07 |
Competing endogenous RNA networks in ovarian cancer: from bench to bedside
2025, EXCLI journal
IF:3.8Q1
DOI:10.17179/excli2024-7827
PMID:39967908
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综述 | 全面综述卵巢癌中竞争性内源RNA网络的作用机制及其临床应用前景 | 整合单细胞RNA测序与个性化医疗视角，系统阐述ceRNA网络在卵巢癌中的新型调控机制 | 属于综述性文章，未包含原始实验数据验证 | 探讨ceRNA网络在卵巢癌发生发展中的作用及临床转化价值 | 卵巢癌细胞中的miRNA、circRNA、lncRNA及其构成的ceRNA调控网络 | 自然语言处理 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1640 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a potential role of ATF3 in brain metastasis of lung adenocarcinoma
2025-Jan-24, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-24-784
PMID:39958219
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示ATF3在肺腺癌脑转移中的潜在作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术解析肺腺癌脑转移的细胞组成空间分布，发现ATF3是间质-上皮转化程序的潜在调控因子 | 样本量较小（3例自测样本+10例公共数据验证） | 解析肺腺癌脑转移的细胞组成空间分布并识别潜在治疗靶点 | 肺腺癌脑转移肿瘤组织 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, Western blotting, qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 3例LUAD脑转移样本（自测）+10例LUAD脑转移样本（公共数据） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |