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当前共找到 2168 篇文献，本页显示第 1621 - 1640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-10-07 |
Ginkgo biloba extract EGb 761® ameliorates cognitive impairment and alleviates TNFα response in 5xFAD Alzheimer's disease model mice
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156327
PMID:39778487
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研究论文 | 本研究探讨银杏叶提取物EGb 761®在5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠中的认知改善作用及其抗炎机制 | 首次系统揭示EGb 761®通过影响疾病相关小胶质细胞DAM2亚型发挥抗炎作用，并发现其疗效具有性别特异性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证；单细胞RNA测序仅针对雄性小鼠前额叶皮层 | 探究EGb 761®在阿尔茨海默病中的药理作用机制和性别依赖性效应 | 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型小鼠 | 神经药理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，器官型脑切片培养，行为学测试，基因表达分析 | 动物模型（小鼠） | 基因表达数据，行为数据，组织病理数据 | 8周龄5xFAD和野生型小鼠，治疗周期8周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1622 | 2025-10-07 |
scRNA-Seq-Based Transcriptome Profiling and Relevant Bioinformatics Approaches to Uncover Novel Insights in Studying Human Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_9
PMID:40301258
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究人类精子发生过程及其在病理条件下的分子机制 | 揭示了支持细胞在精子发生中的关键作用及其在病理条件下的功能紊乱 | NA | 研究人类精子发生的细胞和分子机制 | 人类睾丸组织中的支持细胞、间质细胞和生殖细胞 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1623 | 2025-10-07 |
Computational Approaches in Spatial Transcriptomics for the Study of Mammalian Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_8
PMID:40301257
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物精子发生研究中的计算方法与应用 | 将空间转录组学技术引入精子发生研究，从单细胞水平扩展到二维空间坐标系统，揭示睾丸组织中细胞类型的空间定位和分子互作 | NA | 探讨空间转录组学计算方法在哺乳动物精子发生研究中的应用 | 啮齿类和人类睾丸组织中的精子发生过程 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1624 | 2025-10-07 |
Enhancer RNA in cancer: identification, expression, resources, relationship with immunity, drugs, and prognosis
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf007
PMID:40285345
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综述 | 本综述系统阐述了增强子RNA在癌症中的鉴定方法、表达特征、功能机制及其与免疫治疗、药物反应和预后的关联 | 全面整合eRNA在肿瘤免疫微环境重编程中的作用，提出eRNA特征作为免疫治疗反应和化疗耐药性监测的预测生物标志物 | 属于综述性文章，未涉及原始实验数据验证 | 系统总结eRNA在癌症生物学中的调控功能及其临床转化潜力 | 增强子RNA及其在癌症中的调控机制 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 表观基因组整合分析 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表观基因组学 | NA | NA |
| 1625 | 2025-10-07 |
The Potential Biological Roles and Clinical Significance of Anaphase-Promoting Complex Subunit 1 in Colorectal Cancer
2025 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748251330059
PMID:40229946
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研究论文 | 本研究全面评估了ANAPC1在结直肠癌中的异常表达模式、生物学行为及临床意义 | 首次整合大规模mRNA表达数据、单细胞RNA测序和免疫组化数据，全面揭示ANAPC1在结直肠癌中的生物学功能 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探讨ANAPC1在结直肠癌发生发展中的潜在生物学作用和临床意义 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, western blot, CCK-8, 伤口愈合实验, 细胞周期分析, 细胞凋亡检测 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像, 体外实验数据 | 2329个mRNA表达数据样本, 416个组织样本, HCT-116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2025-10-07 |
Macrophages and cardiac lesion in zebrafish: what can single-cell RNA sequencing reveal?
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1570582
PMID:40290186
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼心脏损伤中巨噬细胞的作用 | 首次系统综述单细胞RNA测序在斑马鱼心脏再生过程中巨噬细胞表型可塑性研究的应用 | 缺乏损伤后期时间点的研究数据，不同损伤模型间的比较不够充分 | 探讨单细胞RNA测序在揭示斑马鱼心脏损伤再生过程中巨噬细胞作用的研究价值 | 斑马鱼心脏损伤模型中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1627 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics and experimental techniques to decode ubiquitinated protein modifications in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545472
PMID:40290433
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和实验技术，系统探索了泛素化修饰在肝细胞癌肿瘤微环境中的调控作用 | 首次系统整合多组学数据和空间转录组学分析肝细胞癌中泛素化修饰的细胞类型特异性作用，并鉴定UBE2C作为关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证和临床样本的直接验证 | 探索泛素化修饰在肝细胞癌肿瘤微环境形成和免疫调节中的作用机制 | 肝细胞癌组织、肿瘤微环境中的浆细胞、成纤维细胞、内皮细胞和上皮-间质转化细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、空间转录组学、transwell实验、CCK8实验、伤口愈合实验 | NA | 多组学数据、转录组数据、空间转录组数据、实验数据 | 多个公共肝细胞癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1628 | 2025-10-07 |
Identification and Experimental Validation of PANoptosis-Related Genes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis by Bioinformatics Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505229
PMID:40291456
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别并实验验证特发性肺纤维化中与PANoptosis相关的基因 | 首次在IPF中建立包含IGF1、GPX3、GADD45β、SMAD7和TIMP3的五基因PANoptosis相关特征 | 需要进一步研究阐明这些基因在IPF发病机制中的生物学功能和机制 | 识别特发性肺纤维化中与PANoptosis相关的差异表达基因并解释其免疫景观和细胞分布特征 | 特发性肺纤维化患者和博来霉素诱导的肺纤维化模型 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 生物信息学分析，机器学习算法，单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集和博来霉素诱导的肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1629 | 2025-10-07 |
Dynamic changes in lactate-related genes in microglia and their role in immune cell interactions after ischemic stroke
2025, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2025-1178
PMID:40292254
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研究论文 | 本研究揭示了缺血性卒中后小胶质细胞中乳酸相关基因的动态变化及其与免疫细胞的相互作用 | 首次系统识别了缺血性卒中后小胶质细胞中关键的乳酸相关基因，并阐明了它们在疾病不同阶段的动态调控作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 阐明缺血性卒中后小胶质细胞中乳酸相关基因的动态变化及其与免疫细胞的关联 | 小鼠缺血性卒中模型中的小胶质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 差异表达分析, t-SNE, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 三个公共数据集(GSE30655, GSE35338, GSE174574, GSE225948) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1630 | 2025-10-07 |
Mechanistic study of the regulation of mitochondrial function by the GPNMB/Nrf2/NF-κB signaling pathway mediated by Quzhi Tang to alleviate chondrocyte senescence
2025-Jan-31, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2024.119165
PMID:39617085
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研究论文 | 本研究探讨祛痹汤通过调控GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路修复线粒体损伤并缓解软骨细胞衰老的机制 | 首次结合单细胞转录组分析识别衰老关键靶点GPNMB，并阐明祛痹汤通过该靶点调控线粒体功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床样本中验证 | 探究祛痹汤治疗膝骨关节炎的药理机制 | 小鼠软骨细胞及软骨组织 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组分析，siRNA干扰，慢病毒转染，分子生物学方法 | NA | 转录组数据，组织病理学数据 | 小鼠软骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1631 | 2025-10-07 |
mSphere of Influence: How the single cell contributes to the collective
2025-Jan-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00431-24
PMID:39660837
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评论 | 本文讨论了细菌单细胞RNA测序技术如何帮助理解单个细胞对微生物生态系统过程的贡献 | 重点介绍了两种新兴的细菌单细胞RNA测序方法及其在微生物生态学研究中的应用价值 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何促进对微生物生态系统中单个细胞作用的理解 | 人类微生物组中的细菌单细胞 | 微生物生态学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 组合索引法和分池条形码法两种细菌单细胞RNA测序技术 |
| 1632 | 2025-10-07 |
The role of CD101 and Tim3 in the immune microenvironment of gastric cancer and their potential as prognostic biomarkers
2025-Jan-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113835
PMID:39700955
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研究论文 | 本研究探讨CD101和Tim3在胃癌免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次系统分析CD101-Tim3+ CD8+ T细胞和CD101+Tim3+ CD8+ T细胞的差异表达基因，并构建基于14个预后基因的风险评分模型 | 未明确说明样本来源和样本量，缺乏外部验证队列 | 阐明胃癌的分子机制，发现新的生物标志物和治疗策略 | 胃癌患者及其免疫微环境中的CD8+ T细胞亚群 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 细胞通讯分析, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1633 | 2025-10-07 |
SLAM-seq reveals independent contributions of RNA processing and stability to gene expression in African trypanosomes
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1203
PMID:39673807
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研究论文 | 本研究通过开发代谢RNA标记方法，揭示了RNA加工和稳定性对非洲锥虫基因表达的独立贡献 | 开发了高效的代谢RNA标记方法，结合超短代谢标记和TT-seq技术，首次在非洲锥虫中全局量化RNA加工速率和半衰期 | 研究聚焦于单一寄生虫物种，结果在其他生物中的普适性需要进一步验证 | 探究RNA加工和降解等转录后过程对基因表达的调控作用 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei）——一种被认为缺乏转录调控的单细胞寄生虫 | 分子生物学 | 寄生虫感染 | SLAM-seq, TT-seq, 单细胞RNA测序, 代谢RNA标记 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢测序 | NA | NA |
| 1634 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of cerebrospinal fluid reveals common features of neuroinflammation
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101733
PMID:39708811
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脑脊液免疫细胞，揭示不同神经系统疾病中神经炎症的共同特征 | 首次系统比较不同神经疾病中脑脊液免疫细胞的转录组特征，发现跨疾病的共同神经炎症特征 | 样本来源和数量可能限制结论的普适性，需要更大规模验证 | 探索脑脊液免疫细胞在不同神经系统疾病中的功能特征和转录组变化 | 患有炎症性、感染性和非炎症性神经系统疾病患者的脑脊液样本 | 单细胞 genomics | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种神经系统疾病患者的脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1635 | 2025-10-07 |
Evaluation of T Cell Receptor Construction Methods from scRNA-Seq Data
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae086
PMID:39666949
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研究论文 | 评估从单细胞RNA测序数据构建T细胞受体的不同方法性能 | 开发了新型模拟器YASIM-scTCR，并首次对多种TCR构建方法进行了系统性基准测试 | 研究主要基于模拟和实验数据集，未涉及所有可能的真实临床场景 | 评估不同TCR构建方法的性能并指导方法选择 | T细胞受体构建方法和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1636 | 2025-10-07 |
Applications of Nanotechnology for Spatial Omics: Biological Structures and Functions at Nanoscale Resolution
2025-01-14, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c11505
PMID:39704725
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综述 | 探讨纳米技术在空间组学中的应用及其对生物结构和功能纳米级分辨率研究的推动作用 | 系统阐述纳米技术如何突破传统空间组学的分辨率限制，实现纳米级精度的生物分子空间分布分析 | 作为综述文章，未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献总结 | 综述纳米技术在空间组学各领域的应用进展与发展前景 | 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学和多组学方法 | 空间组学 | NA | 超分辨率显微镜、质谱成像、DNA纳米结构、微流控芯片、DNA条形码 | NA | 空间分子分布数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学, 空间表观基因组学, 空间多组学 | NA | NA |
| 1637 | 2025-10-07 |
A comprehensive analysis framework for evaluating commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1186
PMID:39675380
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研究论文 | 本研究对九种商业单细胞RNA测序技术进行了全面评估和比较 | 引入了读取利用率指标来区分不同scRNA-seq试剂盒的性能，并首次对四种技术类别的九种商业试剂盒进行系统性比较 | 仅使用单一供体的外周血单个核细胞进行评估，可能无法完全代表其他细胞类型或样本的适用性 | 评估商业单细胞RNA测序技术的性能、成本和实用性 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 169,262个细胞 | 10x Genomics, BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | Chromium Fixed RNA Profiling kit, Rhapsody WTA kit | 10x Genomics Chromium Fixed RNA Profiling（基于探针的RNA检测方法）, BD Rhapsody WTA kit |
| 1638 | 2025-10-07 |
Integrating Prior Knowledge Using Transformer for Gene Regulatory Network Inference
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409990
PMID:39605181
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的基因调控网络推断框架GRNPT，整合大型语言模型和时序卷积网络自编码器 | 首次将大型语言模型嵌入与scRNA-seq轨迹数据结合，能够预测未见细胞类型和调控因子的调控关系 | NA | 开发更准确和通用的基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, 大型语言模型, 时序卷积网络自编码器 | 基因表达数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1639 | 2025-10-07 |
Accurate Spatial Heterogeneity Dissection and Gene Regulation Interpretation for Spatial Transcriptomics using Dual Graph Contrastive Learning
2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410081
PMID:39605202
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研究论文 | 开发了一种名为stDCL的双图对比学习方法，用于空间转录组数据的空间域识别和基因调控解释 | 提出双图对比学习框架，同时捕捉空间结构和基因调控信息，实现高精度的空间异质性解析 | NA | 准确解析空间转录组数据的空间异质性并解释基因调控机制 | 空间转录组数据，包括复杂皮层数据集和阿尔茨海默病相关星形胶质细胞亚型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 图对比学习，图嵌入自编码器 | 双图对比学习，图嵌入自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1640 | 2025-10-07 |
Qingfei Yin alleviates Streptococcus pneumoniae pneumonia by promoting complete autophagy to suppress necroptosis
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156280
PMID:39637472
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研究论文 | 本研究探讨清肺饮通过促进完全自噬抑制坏死性凋亡缓解肺炎链球菌肺炎的作用机制 | 首次结合单细胞转录组学揭示清肺饮通过下调p62表达促进完全自噬进而抑制坏死性凋亡的新机制 | 研究主要聚焦肺上皮细胞，其他细胞类型的作用尚未深入探讨 | 探究清肺饮治疗肺炎链球菌肺炎的分子机制 | 肺炎链球菌感染的小鼠模型和TC-1小鼠肺上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞转录组测序, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 吖啶橙染色, 碘化丙啶染色 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | 113,353个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |