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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621 | 2025-10-07 |
Therapeutic targets for hepatocellular carcinoma identified using proteomics and Mendelian randomization
2025-Jan, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16785
PMID:39477889
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和孟德尔随机化方法识别肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 首次整合血浆蛋白质组数据与HCC数据,应用MR方法系统识别10个与HCC风险相关的蛋白质生物标志物 | 研究依赖于公开数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别肝细胞癌的潜在治疗靶点和蛋白标志物 | 肝细胞癌患者和蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学, 孟德尔随机化, 单细胞测序, KEGG通路分析, PPI分析 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据 | 多个GWAS研究队列(7个已发表GWAS), DeCODE队列, FinnGen队列, UK Biobank | NA | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 1622 | 2025-10-07 |
RAC2 as a Tumor-Suppressive Biomarker Associated with T Cell Infiltration in Breast Cancer
2025-Jan, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2024.0142
PMID:39479793
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研究论文 | 本研究探讨RAC2在乳腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 首次系统揭示RAC2作为抑癌生物标志物与T细胞浸润的关联,并验证其诊断和预后价值 | 研究主要基于公共数据库分析,需要进一步实验验证 | 探索RAC2在乳腺癌中的作用机制及其临床价值 | 乳腺癌组织和正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化分析, 基因集富集分析 | ROC曲线分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1623 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 high-expression macrophages mediate renal tubular epithelial cell damage in acute kidney injury following acute type A aortic dissection surgery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1530741
PMID:40270593
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研究论文 | 本研究探讨S100A8/A9高表达巨噬细胞在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中对肾小管上皮细胞的损伤机制 | 首次揭示S100A8/A9通过促进巨噬细胞向M1表型转化并激活TNF信号通路导致急性肾损伤的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在人体临床样本中验证 | 阐明S100A8/A9在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中的分子机制 | 肾小管上皮细胞(TCMK-1)、巨噬细胞(RAW264.7)、AKI小鼠模型 | 分子生物学 | 急性肾损伤、心血管疾病 | 转录组测序、单细胞测序、分子生物学实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 1624 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing in diffuse large B-cell lymphoma: tumor heterogeneity, microenvironment, resistance, and prognostic markers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1583250
PMID:40270607
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的关键发现,包括肿瘤异质性、微环境相互作用、耐药机制和预后生物标志物 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学和单细胞多组学技术,为DLBCL的精准治疗策略开发提供新见解 | NA | 总结单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的应用和发现 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1625 | 2025-10-07 |
Mapping Cell Identity from scRNA-seq: A primer on computational methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.051
PMID:40270709
|
综述 | 本文提供了单细胞RNA测序中细胞身份注释计算方法的简明概述 | 将现有细胞注释工具系统分类为五大类别,并讨论其关键优势、局限性和应用范围 | 主要面向新用户和非计算科学家,可能未涵盖所有高级技术细节 | 为单细胞RNA测序数据中的细胞身份注释计算方法提供入门指南 | 单细胞RNA测序数据和相关的计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1626 | 2025-10-07 |
Investigation of the role of GEM in systemic lupus erythematosus through multi-omics joint analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569605
PMID:40270963
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研究论文 | 通过多组学联合分析探究GEM基因在系统性红斑狼疮中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序与功能实验相结合揭示GEM在SLE成纤维细胞亚群中的关键调控作用 | GEM调控成纤维细胞功能的具体分子通路尚未完全阐明 | 阐明GEM基因在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的成纤维细胞 | 生物医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 功能细胞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1627 | 2025-10-07 |
Epithelial and macrophage cell interaction in cervical cancer through single-cell RNA-sequencing and spatial analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537785
PMID:40270962
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析研究宫颈癌中上皮细胞与巨噬细胞的相互作用 | 结合单细胞RNA测序、空间转录组分析和细胞通讯分析,揭示宫颈癌微环境中上皮细胞与巨噬细胞的特异性相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性验证 | 探索宫颈癌肿瘤微环境的细胞组成和免疫景观 | 宫颈癌患者组织样本 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 基因集变异分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1628 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2025-Jan-24, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae313
PMID:39133553
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较CD4+、CD8+和TCR-γδ+皮肤T细胞淋巴瘤的分子表型差异 | 首次在单细胞水平系统比较不同T细胞表型皮肤淋巴瘤的分子特征,揭示了亚型特异性表型差异 | 样本量有限(18例活检),仅分析了皮肤组织样本 | 对不同T细胞表型的皮肤T细胞淋巴瘤进行全面的分子特征表征 | 皮肤T细胞淋巴瘤患者的皮肤活检组织 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1629 | 2025-10-07 |
Microbiota-induced S100A11-RAGE axis underlies immune evasion in right-sided colon adenomas and is a therapeutic target to boost anti-PD1 efficacy
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332193
PMID:39251326
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌入侵并激活S100A11-RAGE轴促进免疫逃逸的机制 | 首次发现右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌易位,并鉴定出S100A11+上皮细胞群体及其通过RAGE受体介导的免疫抑制机制 | NA | 阐明左右侧结肠腺瘤的差异特征及其在结肠癌免疫治疗中的意义 | 左右侧结肠腺瘤、临床标本、小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1630 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Hearts in Patients with Fetal Tetralogy of Fallot
2025, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000540406
PMID:39097963
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析法洛四联症胎儿心脏与正常胎儿心脏的细胞特征差异 | 首次在胎儿法洛四联症中应用单细胞RNA测序技术进行细胞水平研究 | 样本量较小(仅一个患病样本和一个正常样本) | 探索法洛四联症的细胞学特征和疾病标志物差异基因 | 法洛四联症胎儿心脏和正常胎儿心脏的右心室组织 | 单细胞组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Cell Ranger | 单细胞基因表达数据 | 2个样本(1个TOF患者,1个健康对照),共25,203个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | Cell Ranger分析流程 |
| 1631 | 2025-10-07 |
Identification of a Novel Activated NK-Associated Gene Score Associated with Diagnosis and Biological Therapy Response in Ulcerative Colitis
2025, Digestion
IF:3.0Q2
DOI:10.1159/000540939
PMID:39182484
|
研究论文 | 本研究建立了一种新型活化NK相关基因评分(ANAG评分),用于溃疡性结肠炎的精确诊断和生物治疗疗效预测 | 首次开发了基于四个关键基因(SELP, TIMP1, MMP7, ABCG2)的活化NK相关基因评分系统,能够准确诊断溃疡性结肠炎并预测生物治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步临床验证;样本量未明确说明 | 探讨活化NK相关基因评分在溃疡性结肠炎中的诊断价值及其对生物治疗反应的预测价值 | 溃疡性结肠炎患者组织和细胞数据 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光 | LASSO回归, PPI分析, ssGSEA, CIBERSORT | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1632 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals the features of adaptive immune responses in the liver of a mouse model of dengue fever
2025-Jan, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12454
PMID:38988280
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究登革热小鼠模型中肝脏适应性免疫反应特征 | 首次在登革热小鼠模型中应用单细胞测序技术分析肝脏T细胞免疫反应特征及巨噬细胞与T细胞的免疫相互作用 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类患者中验证 | 探究登革热严重肝损伤中适应性免疫反应的特征和机制 | 轻度或重度登革热小鼠模型的肝组织 | 单细胞生物学 | 登革热 | 单细胞测序,流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据 | 登革热小鼠模型肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1633 | 2025-10-07 |
Critical role of Slc22a8 in maintaining blood-brain barrier integrity after experimental cerebral ischemia-reperfusion
2025-Jan, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X241264401
PMID:39068534
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现Slc22a8在维持脑缺血再灌注后血脑屏障完整性中的关键作用 | 首次通过整合多组学数据鉴定出Slc22a8作为血脑屏障完整性的关键调控因子,并验证其通过Wnt/β-catenin信号通路发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 探究脑缺血再灌注过程中血脑屏障破坏的调控机制 | 小鼠脑缺血再灌注模型中的内皮细胞和周细胞 | 生物医学 | 缺血性脑卒中 | 多组学分析,转录组测序,单细胞RNA测序 | 小鼠大脑中动脉闭塞/再灌注模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 三个转录组测序数据集,E13.5小鼠血脑屏障和非血脑屏障内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 1634 | 2025-10-07 |
Prediction of tumor-reactive T cell receptors from scRNA-seq data for personalized T cell therapy
2025-Jan, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02161-y
PMID:38454173
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研究论文 | 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的机器学习方法,用于预测肿瘤反应性T细胞受体,以加速个性化T细胞疗法 | 首次结合高通量TCR克隆和反应性验证训练机器学习分类器,以抗原无关的方式识别肿瘤反应性TILs | 未明确说明样本来源的癌症类型多样性及模型验证的广泛性 | 开发快速识别肿瘤反应性TCR的方法以加速个性化T细胞疗法 | 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)及其T细胞受体(TCRs) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序,高通量TCR克隆,机器学习 | 机器学习分类器 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1635 | 2025-10-07 |
Glucose deprivation and identification of TXNIP as an immunometabolic modulator of T cell activation in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1548509
PMID:40260243
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研究论文 | 本研究探讨葡萄糖缺乏条件下TXNIP作为T细胞活化免疫代谢调节剂的作用机制 | 首次将TXNIP鉴定为连接免疫代谢与T细胞活化的关键调节因子,并证明其缺失可增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索葡萄糖限制条件下T细胞免疫反应的调节机制 | 人类T细胞和肿瘤浸润T细胞 | 免疫代谢 | 癌症 | 混合淋巴细胞反应、多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质分泌数据、细胞功能数据 | 癌症患者的肿瘤浸润T细胞和原代人类T细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1636 | 2025-10-07 |
Combination of anlotinib with immunotherapy enhanced both anti-angiogenesis and immune response in high-grade serous ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1539616
PMID:40260248
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研究论文 | 本研究探讨安罗替尼联合免疫疗法在高级别浆液性卵巢癌中的抗血管生成和免疫调节作用 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中系统评估安罗替尼联合免疫治疗的协同作用机制,通过单细胞RNA测序揭示肿瘤微环境变化 | 样本量较小(36例患者),为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 评估安罗替尼联合免疫疗法对高级别浆液性卵巢癌的治疗效果和作用机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者和PBMC-PDX模型 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,患者来源异种移植模型 | PBMC-PDX模型 | 临床数据,单细胞转录组数据 | 36例高级别浆液性卵巢癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1637 | 2025-10-07 |
Type I IFN receptor blockade alleviates liver fibrosis through macrophage-derived STAT3 signaling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1528382
PMID:40260261
|
研究论文 | 本研究通过阻断I型干扰素受体揭示其通过调节巨噬细胞STAT3信号通路缓解肝纤维化的机制 | 首次证明IFNAR-1阻断通过改变巨噬细胞P-STAT3/P-STAT1比例促进M2型分化,从而缓解肝纤维化 | 研究仅使用CCl4诱导的小鼠模型,未验证其他肝纤维化模型 | 探究I型干扰素信号在肝纤维化中的作用机制 | CCl4处理的肝纤维化小鼠模型 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1638 | 2025-10-07 |
Cancer-associated fibroblasts gene signature: a novel approach to survival prediction and immunotherapy guidance in colon cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1532306
PMID:40264753
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析开发了结肠癌相关成纤维细胞基因特征,用于生存预测和免疫治疗指导 | 首次基于单细胞测序数据构建结肠癌相关成纤维细胞基因特征,并验证其在预后预测和治疗指导中的应用价值 | 需要外部队列验证基因特征的普适性,且细胞实验仅限于HCT116和HT29两种细胞系 | 开发结肠癌相关成纤维细胞基因特征用于生存预测和免疫治疗指导 | 结肠腺癌患者和HCT116、HT29结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞实验 | 基因特征模型, 列线图 | 基因表达数据 | 结肠癌患者队列和两种结肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1639 | 2025-10-07 |
Expression of innate immunity genes in human hematopoietic stem/progenitor cells - single cell RNA-seq analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1515856
PMID:40264766
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类造血干细胞/祖细胞中先天免疫基因的表达 | 首次在单细胞分辨率下研究造血干细胞/祖细胞中complosome系统的表达 | 仅分析了两种HSPC群体(CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+) | 探究人类造血干细胞/祖细胞中complosome系统和其他免疫相关蛋白的基因表达 | 人类造血干细胞/祖细胞(HSPCs) | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两种HSPC群体:CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+ | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1640 | 2025-10-07 |
Stimulation of regulatory dendritic cells suppresses cytotoxic T cell function and alleviates DEN-induced liver injury, fibrosis and hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565486
PMID:40264769
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研究论文 | 本研究探讨了通过TLR2激活的乳酸菌混合物刺激调节性树突状细胞,从而抑制细胞毒性T细胞功能并缓解DEN诱导的肝损伤、纤维化和肝细胞癌 | 首次证明TLR2激活的乳酸菌可通过诱导调节性树突状细胞积累,重塑肝脏免疫微环境,抑制细胞毒性T细胞功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;机制研究主要依赖TLR2敲除模型 | 探索调节性树突状细胞在肝脏免疫调节和肝癌发生中的作用机制 | 野生型和TLR2敲除小鼠的肝组织及免疫细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学分析,基因表达分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,流式细胞数据,组织学图像 | 野生型和TLR2敲除小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |