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当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 1581 - 1600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1581 | 2025-10-07 |
Integrative Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Plasma Cell Related Genes and Constructs a Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S509749
PMID:40040881
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据识别浆细胞相关基因并构建肝细胞癌预后模型 | 首次发现浆细胞是肝细胞癌发展的关键细胞簇，并基于浆细胞相关基因构建了八基因预后模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于SSR3基因的体外功能验证 | 识别与肝细胞癌发展最相关的肿瘤免疫微环境细胞类型及其作用机制 | 肝细胞癌患者的正常组织和肿瘤组织 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外功能验证 | 预后模型, 列线图 | 基因表达数据 | 内部和外部数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1582 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impaired epidermal differentiation and pathological microenvironment in diabetic foot ulcer
2025, Burns & trauma
IF:6.3Q1
DOI:10.1093/burnst/tkae065
PMID:40040959
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示糖尿病足溃疡中表皮分化受损和病理微环境的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘糖尿病足溃疡的表皮分化表型和动态变化，鉴定出两种关键角质形成细胞亚型BC-2和DAK | 样本来源和数量未明确说明，需要进一步功能验证实验 | 探究糖尿病足溃疡再上皮化受损的潜在机制 | 人正常皮肤、急性伤口和糖尿病足溃疡组织 | 单细胞组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 激光捕获显微切割测序, 多重免疫组织化学 | 伪时间分析, 谱系推断分析, 细胞间相互作用分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 1583 | 2025-10-07 |
Identification of cancer-associated fibroblast signature genes for prognostic prediction in colorectal cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1476092
PMID:40041860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据识别结直肠癌中癌症相关成纤维细胞特征基因，并建立预后预测模型 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA方法系统识别CAFs特征基因，并建立具有预后预测价值的风险模型 | 研究依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别结直肠癌中癌症相关成纤维细胞相关基因并建立预后预测模型 | 结直肠癌患者和细胞系（HCT116、HT29、NCM460） | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，qRT-PCR，WGCNA，LASSO算法 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据库结直肠癌样本和GEO数据库单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1584 | 2025-10-07 |
Deciphering novel mitochondrial signatures: multi-omics analysis uncovers cross-disease markers and oligodendrocyte pathways in Alzheimer's disease and glioblastoma
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1536142
PMID:40018519
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研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤中的线粒体标志物和少突胶质细胞通路 | 识别出四个跨疾病的线粒体标志物(EFHD1, SASH1, FAM110B, SLC25A18)，并发现少突胶质细胞通过APP信号通路参与疾病进展 | 当前研究缺乏有效代表AD和GBM中线粒体动力学的细胞特异性标志物 | 识别与线粒体功能障碍相关的细胞特异性标志物，探索AD和GBM的共同分子机制 | 阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病,胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序,DNA甲基化分析,机器学习 | 10种机器学习算法 | 单细胞转录组数据,甲基化数据,基因表达数据 | 来自ROSMAP, ADNI, TCGA和CGGA队列的AD和GBM患者样本 | NA | 单核RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1585 | 2025-10-07 |
Cytotoxic KLRG1+ IL-7R- effector CD8+ T cells distinguish kidney transplant recipients controlling cytomegalovirus reactivation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1542531
PMID:40028342
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾移植受者控制巨细胞病毒再激活的CD8+ T细胞特征 | 首次发现CD28lo KLRG1hi IL-7Rlo HLA-DRhi CD8+ T细胞可作为区分CMV再激活患者的关键标志物 | 样本量较小（8例单细胞测序），需要在更大队列中验证 | 研究肾移植受者CD8+ T细胞对巨细胞病毒免疫反应的转录调控机制 | 肾移植受者（KTRs）的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序，免疫表型分析 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞术数据 | 8例肾移植受者（单细胞测序），62例肾移植受者（验证队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1586 | 2025-10-07 |
Single-cell dual-omics reveals translational and transcriptional landscapes and regulations in oocytes from ovarian endometriosis patients
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1534648
PMID:40034233
|
研究论文 | 本研究通过单细胞双组学测序揭示了卵巢子宫内膜异位症患者卵母细胞的翻译组和转录组特征 | 首次对卵巢子宫内膜异位症患者GV期卵母细胞进行单细胞转录组和翻译组联合分析，发现2480个差异表达基因 | 样本来源仅限于特定类型的不孕患者，未涉及其他类型的子宫内膜异位症 | 探究卵巢子宫内膜异位症导致卵母细胞质量下降的分子机制 | 卵巢子宫内膜异位症患者和因输卵管或男性因素不孕的对照者的卵母细胞 | 单细胞组学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序, 单细胞翻译组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 卵巢子宫内膜异位症患者和对照组的不孕患者卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞翻译组测序 | NA | NA |
| 1587 | 2025-10-07 |
An integrated transcriptomic analysis unveils the regulatory roles of RNA binding proteins during human spermatogenesis
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1522394
PMID:40034235
|
研究论文 | 通过整合转录组分析揭示RNA结合蛋白在人类精子发生过程中的调控作用 | 首次系统揭示RBP在睾丸发育和精子发生过程中的动态表达模式，并发现RPL10、RPL39和SETX作为非梗阻性无精子症的潜在诊断生物标志物 | 基于已发表的测序数据进行分析，缺乏实验验证 | 研究RNA结合蛋白在人类睾丸发育和精子发生过程中的调控机制 | 人类睾丸发育和精子发生过程中的各种细胞类型，非梗阻性无精子症患者 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1588 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptome analysis in bladder cancer: Current status and future perspectives
2025 Jan-Mar, Bladder cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1177/23523735251322017
PMID:40034247
|
综述 | 综述膀胱癌研究中单细胞RNA测序和空间转录组技术的应用现状与未来展望 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组技术解析膀胱癌异质性和肿瘤微环境 | 存在技术限制和临床应用可及性等挑战 | 探讨单细胞和空间技术在膀胱疾病研究中的应用价值 | 膀胱疾病相关研究文献 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 1589 | 2025-10-07 |
The role of macrophages in liver metastasis: mechanisms and therapeutic prospects
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1542197
PMID:40034694
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞在肿瘤微环境中促进肝癌转移的机制及其治疗前景 | 系统阐述了巨噬细胞在肝转移微环境中的多重调控机制，特别关注了单细胞测序技术带来的新见解 | NA | 探讨巨噬细胞在肝转移中的作用机制及潜在治疗靶点 | 巨噬细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、肝转移肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌转移 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1590 | 2025-10-07 |
WCSGNet: a graph neural network approach using weighted cell-specific networks for cell-type annotation in scRNA-seq
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1553352
PMID:40034748
|
研究论文 | 提出一种基于图神经网络的细胞类型自动注释方法WCSGNet，利用加权细胞特异性网络改进单细胞RNA测序数据分析 | 首次使用加权细胞特异性网络(WCSNs)来捕获单个细胞内的独特基因相互作用模式，克服了现有方法忽略细胞特异性基因关联网络的局限性 | 未明确说明方法在超大型数据集上的可扩展性以及在噪声数据下的鲁棒性 | 开发更准确的单细胞RNA测序数据细胞类型自动注释方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1591 | 2025-10-07 |
Shiba: A versatile computational method for systematic identification of differential RNA splicing across platforms
2025-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.30.596331
PMID:38895326
|
研究论文 | 开发了一种名为Shiba的计算方法，用于系统识别不同RNA测序平台上的差异RNA剪接 | 整合了转录本组装、剪接事件识别、读数计数和差异剪接分析，能够捕获注释和未注释的剪接事件，解决了连接读段不平衡问题 | NA | 开发一种跨平台的差异RNA剪接识别计算方法 | RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 统计框架 | RNA测序数据 | n=1 RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1592 | 2025-10-07 |
Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis Explored Changes in Midnolin-Related Immune Microenvironment and Constructed Combined Prognostic Model for Pancreatic Cancer
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S503326
PMID:40026303
|
研究论文 | 通过单细胞测序和转录组分析探索midnolin相关免疫微环境变化并构建胰腺癌联合预后模型 | 首次将MIDN、midnolin相关基因和midnolin相关免疫浸润细胞整合构建胰腺癌联合预后模型 | NA | 评估MIDN及相关因子在胰腺癌预后中的价值并构建预后模型 | 胰腺癌患者数据及胰腺癌细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,转录组分析,CIBERSORT,Cox回归,LASSO | Cox回归模型,LASSO模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1593 | 2025-10-07 |
Integration of Single Cell and Bulk RNA-Sequencing Reveals Key Genes and Immune Cell Infiltration to Construct a Predictive Model and Identify Drug Targets in Endometriosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497643
PMID:40026309
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示子宫内膜异位症的关键基因和免疫细胞浸润特征，构建预测模型并识别潜在药物靶点 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析子宫内膜异位症，识别出8个关键基因构建高精度预测模型，并发现相关免疫细胞浸润变化 | 样本来源仅限于基因表达综合数据库，需要进一步实验验证 | 探索子宫内膜异位症的免疫机制和分子差异，开发疾病诊断和预测模型 | 子宫内膜异位症患者和健康对照者的增生期内膜组织 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1594 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peripheral Immune Cell Senescence and Inflammatory Phenotypes in Patients with Premature Ovarian Failure
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S496130
PMID:40026314
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示早发性卵巢功能不全患者外周免疫细胞衰老和炎症表型 | 首次在单细胞水平系统描绘POF患者外周免疫细胞特征，发现非经典单核细胞通过CCL5介导CD8+效应T细胞趋化和卵巢损伤的新机制 | 样本量较小（3例健康对照和4例POF患者），需要在更大队列中验证发现 | 探究早发性卵巢功能不全的免疫学机制 | 早发性卵巢功能不全患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 早发性卵巢功能不全 | 单细胞RNA测序 | SCENIC分析、拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 3例健康对照和4例POF患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1595 | 2025-10-07 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and Cystic Fibrosis disease
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634747
PMID:39974899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肠道BEST4+细胞是pH感应神经足细胞，并揭示了其在囊性纤维化疾病中的新作用机制 | 首次将BEST4+细胞鉴定为CFTR高表达细胞，发现其具有pH感应功能并参与囊性纤维化疾病发病机制 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肠道BEST4+细胞的分子特征及其在囊性纤维化疾病中的作用 | 人类和大鼠肠道上皮细胞，特别是BEST4+细胞亚群 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫定位 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 野生型和ΔF508囊性纤维化大鼠空肠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1596 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial analysis reveals the interaction between ITLN1+ foam cells and SPP1+ macrophages in atherosclerosis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1510082
PMID:40017519
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了动脉粥样硬化中ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用机制 | 首次发现VSMC来源的ITLN1+泡沫细胞与SPP1+FABP5+巨噬细胞通过MIF-(CD74+CD44)和SPP1-CD44配体-受体轴相互作用 | 需要进一步验证这些机制以开发有效的免疫治疗策略 | 研究动脉粥样硬化发病机制中不同细胞群体的调控功能 | 动脉粥样硬化斑块中的细胞群体，特别是VSMC来源的ITLN1+泡沫细胞和SPP1+FABP5+巨噬细胞 | 单细胞分析, 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 伪时间轨迹分析 | CellChat, GO分析, KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1597 | 2025-10-07 |
Single-cell Analysis Highlights Anti-apoptotic Subpopulation Promoting Malignant Progression and Predicting Prognosis in Bladder Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251323569
PMID:40018511
|
研究论文 | 通过单细胞分析识别膀胱癌中具有抗凋亡特性的肿瘤亚群及其在肿瘤进展中的作用 | 首次在膀胱癌中鉴定出具有抗凋亡特性的肿瘤亚群，揭示了该亚群通过特定信号通路与微环境相互作用促进肿瘤进展的机制 | NA | 阐明膀胱癌肿瘤异质性对患者预后的影响机制 | 膀胱癌肿瘤样本和类器官 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型, 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1598 | 2025-10-07 |
Fast, flexible analysis of differences in cellular composition with crumblr
2025-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635498
PMID:39975411
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研究论文 | 开发了一种名为crumblr的可扩展统计方法，用于分析细胞组成差异 | 采用精度加权线性混合模型处理计数比率数据，并在细胞谱系层次结构的多个水平上进行统计检验 | NA | 识别细胞类型频率变化的统计分析方法 | 单细胞RNA测序数据集（衰老、结核感染、前列腺癌骨转移、SARS-CoV-2感染） | 生物信息学 | 结核病, 前列腺癌, COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 线性混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1599 | 2025-10-07 |
Optimizing duodenal tissue acquisition for mechanistic studies of duodenal ablation in type 2 diabetes
2025, Endoscopy international open
IF:2.2Q2
DOI:10.1055/a-2503-2135
PMID:40007651
|
研究论文 | 本文开发了一种优化的十二指肠组织采集方案，用于研究十二指肠消融对2型糖尿病和代谢综合征的影响 | 设计了使用十二指肠冷圈套切除术创建组织微阵列和进行单细胞RNA测序的优化组织采集方案 | 样本量相对较小（DIRECT研究9名患者），需要进一步验证 | 优化十二指肠组织采集方法，以支持十二指肠消融在2型糖尿病和代谢综合征中的机制研究 | 接受上消化道介入内镜检查的患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，组织微阵列技术 | NA | 组织样本，基因表达数据 | DIRECT研究：9名患者，16个冷圈套切除术；EMINENT-2研究：38个冷圈套样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1600 | 2025-10-07 |
Integrated Bioinformatic Analyses Reveal Thioredoxin as a Putative Marker of Cancer Stem Cells and Prognosis in Prostate Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251319872
PMID:40008390
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研究论文 | 通过生物信息学分析发现硫氧还蛋白可作为前列腺癌干细胞标记物和预后预测因子 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别硫氧还蛋白作为前列腺癌干细胞的潜在标记物，并揭示其与预后的关联 | 样本量有限，需要进一步的体外和体内实验验证TXN对前列腺癌干细胞的功能调控作用 | 识别调控前列腺癌干细胞特性并预测预后的新因子 | 前列腺癌组织和前列腺癌干细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,轨迹分析 | Seurat,monocle 3 | 单细胞RNA测序数据 | 2个前列腺癌组织的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |