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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-01-08 |
Serum CHI3L1 levels correlate with disease activity in rheumatoid arthritis and reveal potential molecular mechanisms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729989
PMID:41488645
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研究论文 | 本研究探讨了CHI3L1在类风湿关节炎中的分子调控机制及其与疾病活动的关联,并评估了其作为诊断和监测生物标志物的潜力 | 整合了转录组学、单细胞RNA测序和临床血清检测,首次系统揭示了CHI3L1在RA中的成纤维细胞特异性表达及其与免疫失调的关联,并通过药物预测和分子对接提出了潜在治疗候选药物 | 研究为探索性分析,需要进一步的功能实验和前瞻性研究进行验证 | 阐明CHI3L1在类风湿关节炎中的分子调控机制及其与疾病活动的关联,评估其作为诊断、动态监测和精准治疗靶点的潜力 | 类风湿关节炎患者 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 转录组学分析, 单细胞RNA-seq, 化学发光免疫测定, 分子对接 | Wilcoxon检验, ROC曲线, WGCNA, CIBERSORT | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 临床血清数据 | RA患者102例, 对照79例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-01-08 |
Multi-omics profiling unravel the immune landscape diversity by prognostic signatures of immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1735893
PMID:41488652
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研究论文 | 本研究通过多组学分析开发了一个四基因预后特征,用于预测三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应和生存结局 | 整合了多重免疫荧光、bulk RNA测序和单细胞RNA测序,构建了一个反映肿瘤免疫微环境异质性的四基因预后特征 | 研究基于回顾性队列,需要前瞻性验证;样本量有限,可能影响模型的泛化能力 | 开发一个能够预测三阴性乳腺癌患者免疫治疗反应和预后的生物标志物特征 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光,bulk RNA测序,单细胞RNA测序,CIBERSORT,CellChat分析,基因敲低和过表达功能实验 | 预后特征模型 | 图像,RNA测序数据 | 一个内部队列和三个独立外部队列的TNBC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2026-01-07 |
The Single-Cell Landscape of Peripheral and Tumor-infiltrating Immune Cells in HPV- HNSCC
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632928
PMID:39868329
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中免疫细胞的动态变化及其与疾病进展的关系 | 首次整合两个单细胞RNA测序数据集,全面分析HPV阴性HNSCC中免疫细胞的分子特征和细胞间通讯模式,并发现细胞毒性免疫细胞作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 样本量相对较小(29个样本),且仅针对HPV阴性HNSCC,可能无法推广到其他亚型 | 探索HPV阴性头颈鳞状细胞癌的复杂免疫景观,以识别潜在的治疗靶点 | HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的外周血单个核细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 单细胞组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,高度多重免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据,免疫荧光图像 | 29个样本,近300,000个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-01-07 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631962
PMID:39829764
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学数据,构建了甲状腺癌进展的图谱,识别了与疾病进展相关的成纤维细胞亚群 | 结合单细胞测序、空间转录组学和批量RNA测序,首次在甲状腺癌中定义了炎症性和肌成纤维性癌症相关成纤维细胞亚群及其空间分布 | NA | 研究甲状腺癌进展过程中的基质细胞亚群和肿瘤-基质相互作用 | 甲状腺癌样本,包括分化良好和未分化的类型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-01-07 |
Construction and validation of an anoikis-related prognostic model for lung adenocarcinoma based on bulk and single-cell transcriptomic data
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335788
PMID:41187171
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研究论文 | 本研究基于批量转录组和单细胞转录组数据,构建并验证了一个与失巢凋亡相关的肺腺癌预后模型 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据,利用机器学习方法开发了一个包含7个基因的失巢凋亡相关预后模型,并深入探讨了TIMP1在肿瘤微环境中的作用 | 模型仅在GEO数据库的两个队列中进行了验证,需要更多独立队列和前瞻性研究来确认其临床适用性 | 开发并验证一个用于肺腺癌预后预测的失巢凋亡相关基因模型 | 肺腺癌患者及其转录组数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多重免疫荧光 | Cox回归, LASSO回归, 随机森林 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的两个肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-01-05 |
Refining breast cancer genetic risk and biology through multi-ancestry fine-mapping analyses of 192 risk regions
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02031-y
PMID:39753771
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研究论文 | 通过多祖先精细定位分析192个风险区域,精炼乳腺癌遗传风险和生物学机制 | 整合多祖先基因组数据,识别了332个独立关联信号(包括131个新信号),并确定了195个候选易感基因,支持多祖先数据在精细定位中的价值 | 未明确提及,但可能包括功能验证的局限性或样本多样性不足 | 精细定位已知乳腺癌风险位点,揭示因果变异和靶基因 | 172,737例女性乳腺癌病例和242,009例对照(非洲、亚洲和欧洲祖先) | 基因组学 | 乳腺癌 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序、体外实验 | NA | 基因组关联数据、功能基因组学数据 | 414,746个样本(病例和对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 147 | 2026-01-05 |
Microfluidics and molecular diagnostics in renal cell carcinoma: advances, challenges, and future directions
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1674789
PMID:41479787
|
综述 | 本文全面探讨了肾细胞癌的临床病理学现状,并重点回顾了微流控和分子诊断技术的最新进展及其在肾癌管理中的应用 | 整合了微流控平台与分子诊断技术,用于分析循环肿瘤细胞、循环肿瘤DNA和外泌体等生物标志物,并探讨了单细胞测序、空间转录组学等新技术在肿瘤异质性和治疗耐药性研究中的应用 | 临床转化面临检测标准化和监管障碍等挑战 | 探讨微流控和分子诊断技术在肾细胞癌管理中的进展、挑战和未来方向,以推动精准医疗 | 肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, 下一代测序, 多组学整合 | NA | 生物标志物数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 下一代测序 | NA | NA |
| 148 | 2026-01-05 |
Macrophage-driven immunopathology in pulmonary arterial hypertension: from mechanisms to targeted therapies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1721071
PMID:41479889
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综述 | 本文综述了巨噬细胞极化在肺动脉高压发病机制中的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 强调了巨噬细胞极化通过M1/M2表型驱动局部炎症和纤维化,并揭示了“肺-心免疫轴”在右心室重塑中的间接影响,同时指出巨噬细胞异质性、单细胞转录组学和精准免疫调节策略作为未来研究方向 | NA | 探讨巨噬细胞驱动的免疫病理在肺动脉高压中的机制,并评估靶向治疗策略 | 肺动脉高压的发病机制,特别是巨噬细胞在血管重塑和炎症中的作用 | NA | 肺动脉高压 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2026-01-05 |
Dynamic genetic regulation of CD4+ T cells in obstructive sleep apnea: integrating context-specific eQTL, Mendelian randomization, single-cell sequencing, and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1691347
PMID:41479897
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研究论文 | 本研究整合了多种分析方法,探究了CD4+ T细胞在阻塞性睡眠呼吸暂停发病机制中的动态遗传调控机制 | 首次整合了情境特异性eQTL分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序和实验验证,系统揭示了CD4+ T细胞在OSA中的时间动态性和细胞类型特异性免疫调控 | 样本仅来自欧洲血统的119名供体,可能限制了结果在其他人群中的普适性;研究主要关注CD4+ T细胞,其他免疫细胞的作用未充分探讨 | 探究阻塞性睡眠呼吸暂停中CD4+ T细胞的动态遗传调控机制,特别是在间歇性缺氧诱导的免疫和炎症反应中的作用 | 来自119名欧洲血统供体的CD4+ T细胞,以及间歇性缺氧小鼠模型 | 生物信息学 | 阻塞性睡眠呼吸暂停 | 情境特异性eQTL分析, 孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, qPCR | NA | 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | 119名欧洲血统供体的CD4+ T细胞(在0小时、16小时、40小时和5天多个时间点) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-01-04 |
Microglia depletion reduces human neuronal APOE4-related pathologies in a chimeric Alzheimer's disease model
2025-Jan-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.10.005
PMID:39500314
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研究论文 | 本研究通过在小鼠海马中移植人类iPSC来源的神经元,并利用小胶质细胞耗竭技术,探讨了小胶质细胞对神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理的影响 | 首次在嵌合模型中结合神经元APOE基因型和小胶质细胞耗竭,揭示了APOE4与小胶质细胞协同促进Aβ和tau病理形成的机制 | 研究基于嵌合小鼠模型,可能不完全反映人类AD的复杂环境;样本量未明确说明 | 探究小胶质细胞在神经元APOE4相关阿尔茨海默病病理形成中的作用 | 人类iPSC来源的神经元(APOE4、APOE3和APOE-KO基因型)移植到人类APOE3或APOE4敲入小鼠海马中 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 嵌合小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2026-01-04 |
Histopathologic Analysis of Human Kidney Spatial Transcriptomics Data: Toward Precision Pathology
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.011
PMID:39097165
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研究论文 | 本研究通过形态学方法分析人类肾脏空间转录组学数据,旨在推进精准病理学的发展 | 首次将基于形态学的分析方法应用于人类肾脏空间转录组学数据,以病理学为基础识别聚类,并成功投影到其他样本中 | 仅基于单一人类肾脏样本进行建模,未涉及大规模验证或多种疾病状态的比较 | 探索基于形态学的空间转录组学数据分析方法,以提升对慢性肾脏病病变机制的理解 | 人类肾脏组织样本,包括健康与疾病状态 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学 | NA | 图像与空间转录组学数据 | 单个人类肾脏样本,并扩展到肾切除或针吸活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 152 | 2026-01-04 |
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.012
PMID:39097166
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的应用,整合形态学与分子生物学以提升对组织生物学和疾病机制的理解 | 整合了空间转录组学技术与肾脏疾病研究,强调了高分辨率空间技术在生命科学中的革命性潜力 | NA | 探讨空间转录组学技术在肾脏疾病研究中的科学和潜在医学价值 | 肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2026-01-04 |
Differential TGF-β1/SMAD4 Signaling Regulates PMN-MDSC Differentiation and Reshapes the Immune Microenvironment in Breast Cancer
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S566995
PMID:41476671
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研究论文 | 本研究探讨了TGF-β1/SMAD4信号通路如何调节多形核髓源性抑制细胞的分化并重塑乳腺癌免疫微环境 | 结合单细胞RNA测序与空间转录组学分析乳腺癌组织中中性粒细胞亚群的异质性,并揭示了TGF-β1在正常与荷瘤小鼠中对PMN-MDSC分化的差异调控作用 | 需要进一步在临床环境中验证TGF-β1通路作为治疗靶点的疗效 | 阐明TGF-β1/SMAD4信号通路调控PMN-MDSC分化及调节乳腺癌免疫微环境的机制 | 乳腺癌组织中的中性粒细胞亚群、4T1小鼠乳腺癌转移模型及脾源性造血干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 流式细胞术, Western blotting | NA | 基因表达谱, 图像 | 使用GSE176078数据集及建立的4T1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2026-01-04 |
Inhibitors of KAT2A Alleviate the Progression of AKI by Alleviating Macrophage Ferritinophagy
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S568586
PMID:41476772
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术,揭示了组蛋白乙酰转移酶KAT2A通过调控NCOA4介导的巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING炎症信号通路,促进急性肾损伤(AKI)的进展,并发现KAT2A抑制剂MB-3可减轻AKI的病理变化 | 首次阐明了KAT2A在AKI中通过调节巨噬细胞铁蛋白自噬和cGAS-STING信号通路的作用机制,并验证了KAT2A抑制剂MB-3的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,人类样本验证有限,且MB-3的长期疗效和安全性尚未在临床中评估 | 探究KAT2A在急性肾损伤(AKI)进展中的作用机制,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠肾脏组织、RAW264.7巨噬细胞系、人类AKI活检样本 | 单细胞测序与分子病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、基因敲低与过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量,涉及小鼠模型、细胞系和人类活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2026-01-04 |
IL-18 receptor axis in allergic conjunctivitis: a multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1704591
PMID:41476961
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研究论文 | 本研究通过整合多组学策略,揭示了过敏性结膜炎中IL-18受体/IFN-γ轴在NK细胞和T细胞中的作用及其与疾病严重程度的相关性 | 首次通过整合人类GWAS数据、小鼠单细胞RNA测序和体内验证,系统性地将IL-18受体信号轴与过敏性结膜炎的病理机制和严重程度联系起来,超越了传统的Th2中心模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序数据仅来自小鼠模型,未直接应用于人类患者样本 | 识别过敏性结膜炎相关的候选基因并描绘免疫通路,特别关注可能导致疾病异质性的细胞类型特异性机制 | 过敏性结膜炎患者(通过GWAS数据)和卵清蛋白诱导的过敏性结膜炎小鼠模型 | 数字病理学 | 过敏性结膜炎 | GWAS分析(FUSION, MAGMA, UTMOST)、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及人类GWAS数据和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-01-04 |
Machine learning-derived cellular senescence index for predicting prognosis and drug sensitivity in patients with renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727099
PMID:41476960
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别肾透明细胞癌中的衰老细胞,并整合多种机器学习算法构建了一个仅含9个基因的衰老相关评分模型,用于预测患者预后和药物敏感性 | 结合十种机器学习算法生成101种组合模型,从中筛选出最优的Lasso-StepCox模型,构建了显著少于典型范围(15-30个基因)的最小化基因特征(仅9个基因),并基于此开发了衰老相关评分模型(SRSM) | 未明确说明样本量大小,且模型验证主要依赖于内部数据,需要进一步的外部验证 | 开发一个可量化的衰老相关评分模型,用于肾透明细胞癌患者的预后分层和治疗靶向 | 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | plsRcox, Ridge, Enet, CoxBoost, Lasso, StepCox, RSF, SuperPC, GBM, survivalSVM, Lasso-StepCox | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-01-04 |
Single-cell analysis reveals shared adaptive responses across different types of podocyte injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1698284
PMID:41476974
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了不同肾脏疾病中足细胞损伤的异质性和共享适应性反应 | 首次整合多种肾脏疾病的单细胞数据,系统比较足细胞损伤机制,并识别出跨疾病的共享适应性反应路径 | 样本量相对有限,且主要基于转录组数据,功能验证不足 | 探究不同肾脏疾病中足细胞损伤的分子机制和共享适应性反应 | 人类肾脏组织中的足细胞及其他肾细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16个样本,共73,684个细胞,来自健康对照和IgA肾病、特发性膜性肾病、急性肾损伤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-01-03 |
Club (Clara) cells in human prostate: A survival guide for conventional histologists/histopathologists
2025-Jan-02, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-25-029
PMID:41480713
|
综述 | 本文综述了人类前列腺中Club(Clara)细胞的当前知识,包括其形态、功能和在疾病中的表型转换 | 整合了单细胞RNA测序和RNA原位等先进研究方法,构建了正常和病理前列腺的三维细胞图谱,并首次系统探讨了前列腺Cc细胞的抗炎、再生和免疫调节潜力 | 作为综述文章,未提供新的实验数据,且主要基于现有文献和作者原始材料,可能受限于当前研究进展 | 全面总结前列腺Club(Clara)细胞的生物学特性、功能及其在前列腺疾病中的作用 | 人类前列腺中的Club(Clara)细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, RNA原位 | NA | 文本, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-01-03 |
Unveiling Cancer-Related Metaplastic Cells in Both Helicobacter pylori Infection and Autoimmune Gastritis
2025-Jan, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.08.032
PMID:39236896
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了幽门螺杆菌感染和自身免疫性胃炎中癌症相关化生细胞的相似性 | 首次在幽门螺杆菌感染和自身免疫性胃炎中鉴定出表达ANPEP/CD13的癌症相关化生细胞亚型 | 未明确说明样本量大小及具体单细胞测序平台细节 | 比较幽门螺杆菌感染和自身免疫性胃炎诱导的胃化生细胞特征及其癌症风险 | 小鼠模型和人类参与者(幽门螺杆菌感染及自身免疫性胃炎患者) | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学,免疫荧光,组织病理学评估 | NA | 转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-01-03 |
Isolation and Preparation of Embryonic Zebrafish Retinal Cells for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4087-6_6
PMID:39240518
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研究论文 | 本文描述了一种从斑马鱼胚胎眼睛中可重复制备高质量单细胞悬液的方法,用于单细胞RNA测序 | 提供了针对斑马鱼胚胎眼睛组织的标准化单细胞分离和质量控制方法,解决了该领域获取高质量单细胞悬液的技术难题 | 方法主要针对胚胎期斑马鱼眼睛组织,在其他发育阶段或再生组织中的适用性需要进一步验证 | 建立斑马鱼眼睛组织单细胞RNA测序的标准化实验流程 | 斑马鱼胚胎视网膜细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10× Genomics v3.1系统 |