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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-01-29 |
Single-cell transcriptional profiling revealed the protective effects of Buddleoside in sepsis-associated acute liver injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1713180
PMID:41601688
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了天然化合物Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用及其免疫调节机制 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明Buddleoside通过调节内皮细胞、中性粒细胞和巨噬细胞亚群来缓解脓毒症相关急性肝损伤的分子机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证;机制研究主要依赖转录组数据,缺乏蛋白质功能验证 | 评估Buddleoside对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用并探索其免疫调节机制 | 小鼠脓毒症相关急性肝损伤模型中的肝脏细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症相关急性肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 142 | 2026-01-29 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis reveals shared pathogenesis and prognostic biomarkers in breast and thyroid cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1710915
PMID:41601694
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,揭示了乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制及预后生物标志物 | 首次结合单细胞和批量转录组数据,系统探索乳腺癌与甲状腺癌的共病分子机制,并利用机器学习构建预后模型,验证了SMR3B作为共享预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分有限,且样本来源和数量可能影响结果的普适性 | 阐明乳腺癌和甲状腺癌的共享发病机制,并识别共同的预后生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌和甲状腺癌的转录组数据,包括单细胞和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌, 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 差异表达基因分析, 功能富集分析, 拷贝数变异分析, 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 143 | 2026-01-29 |
P2RY13+ dendritic cells correlate with enhanced antigen presentation and lymphocyte activation in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1708670
PMID:41601785
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性表达于树突状细胞,并阐明了其通过增强抗原呈递和T细胞激活来促进抗肿瘤免疫的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下确定了P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的特异性细胞表达谱(树突状细胞),并系统性地将其表达与免疫浸润、细胞间通讯及预后关联起来 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证来证实P2RY13在树突状细胞中的功能机制 | 探究P2RY13在肺腺癌肿瘤微环境中的细胞特异性表达、功能及其与免疫调节和预后的关系 | 肺腺癌患者肿瘤组织及正常组织的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,生物信息学算法 | Seurat, CIBERSORT, MCP-counter, quanTIseq, TIMER, ESTIMATE, CellChat, AUCell, UCell, AddModuleScore, GSVA, JASMINE, singscore, ssGSEA, viper | 转录组数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 来自TCGA、GEO(GSE68465和GSE31210)和单细胞数据集(GSE131907)的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2026-01-29 |
Cellular senescence in age-related cardiovascular disease: past and future
2025, Frontiers in aging
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/fragi.2025.1721744
PMID:41602167
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综述 | 本文综述了细胞衰老在年龄相关心血管疾病中的作用,并提出了一个以衰老相关分泌表型为核心、解释少数衰老细胞如何系统性影响心血管微环境的统一框架 | 超越对通路的简单罗列,提出了一个以少数衰老细胞如何重编程心血管微环境为核心、整合关键调控网络的统一框架,并前瞻性地讨论了靶向衰老的治疗策略 | 机制复杂性高,动物模型和体外系统存在局限性 | 阐明细胞衰老在年龄相关心血管疾病发生发展中的作用机制,并探讨靶向衰老作为延缓心血管衰老和治疗相关疾病的新策略 | 衰老细胞及其分泌表型对主要心血管细胞类型(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞)的影响 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2026-01-29 |
JAK-centric explainable few-shot gene-expression diagnosis framework for alopecia via MultiPLIER priors and relation-style set-to-set comparison
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1753206
PMID:41602548
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研究论文 | 本文开发了一个基于JAK-STAT信号通路的可解释少样本基因表达诊断框架,用于区分斑秃和雄激素性脱发 | 提出了一种结合生物学先验知识(MultiPLIER潜在变量)和关系式集合比较的少样本深度学习分类器,增强了小样本条件下的诊断鲁棒性和机制可解释性 | 研究样本量有限,且框架在更广泛疾病类型中的应用仍需验证 | 开发可解释的AI框架,用于小样本转录组诊断,以区分斑秃和雄激素性脱发 | 斑秃和雄激素性脱发患者的头皮样本 | 机器学习 | 脱发疾病 | RNA-seq | 少样本深度学习分类器(Relation-style set-to-set comparator) | 基因表达数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及独立AA/AGA/健康头皮样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 146 | 2026-01-29 |
Spatiotemporal dynamics of spermatogenesis: insights from high-resolution spatial transcriptomics and pseudotime trajectories in mouse testes
2025, Frontiers in reproductive health
IF:2.3Q3
DOI:10.3389/frph.2025.1747902
PMID:41602862
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了小鼠睾丸中精子发生的时空动态过程 | 采用Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率)结合Salus Cellbins算法,首次在单细胞水平上解析了睾丸的空间转录组特征,克服了传统空间转录组学分辨率不足的问题 | 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类样本;高分辨率技术可能受限于样本处理和成本 | 探究精子发生的分子基础和时空动态,以增进对男性生殖生物学的理解 | 小鼠睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | Salus-STS | Salus-STS高分辨率空间转录组学(约1微米分辨率) |
| 147 | 2026-01-26 |
Elucidating the role of SHROOM4 in non-small cell lung cancer: expression patterns, clinical correlations, and potential functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1723844
PMID:41573567
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床相关性及其潜在功能 | 首次系统研究SHROOM4在NSCLC中的表达及其与临床预后的关联,并发现其通过影响肿瘤微环境和信号通路(如血管生成和Wnt/Beta-Catenin途径)参与肺癌进展 | 研究主要基于公共数据库的生物信息学分析,实验验证有限,需要进一步的功能研究来确认SHROOM4的具体作用机制 | 阐明SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床意义及其潜在生物学功能 | 非小细胞肺癌(NSCLC)组织,特别是肺鳞状细胞癌(LUSC)组织及对应正常组织 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA-seq,差异表达分析 | NA | mRNA表达数据,蛋白质表达数据,单细胞RNA-seq数据 | 公共数据库中的肺癌组织样本及验证用的LUSC组织与正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 148 | 2026-01-26 |
Study on the spatiotemporal regulation of interferon-stimulated genes during Zika virus infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1702266
PMID:41573570
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研究论文 | 本研究通过整合多系统转录组数据、细胞实验和生物信息学分析,系统探讨了寨卡病毒感染期间干扰素刺激基因的时空调控特征和功能 | 整合了人脑类器官、单核细胞来源的树突状细胞和患者外周血单个核细胞的多系统转录组数据,结合单细胞转录组学揭示了细胞异质性,并通过交叉分析筛选出跨系统共享的干扰素刺激基因 | NA | 阐明宿主干扰素刺激基因在寨卡病毒感染中的抗病毒机制,为治疗策略开发提供关键靶点和理论支持 | 寨卡病毒感染期间的人脑类器官、单核细胞来源的树突状细胞、患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 寨卡病毒感染 | 转录组学、单细胞转录组学、生物信息学分析、siRNA敲低实验 | LASSO回归 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2026-01-25 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析,识别出FAM189A2作为肺癌的关键预后基因 | 结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,构建了一个八基因LASSO-Cox风险模型,并在多个独立队列中验证,首次将FAM189A2鉴定为肺癌的潜在肿瘤抑制基因和生物标志物 | 研究样本量相对较小(13个原发性肺癌肿瘤),且主要基于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 探究肺癌恶性细胞状态与患者预后及治疗脆弱性的关联,并开发预后风险模型 | 肺癌肿瘤组织及匹配的正常肺组织细胞,以及外部验证队列中的肺癌患者数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | LASSO-Cox风险模型 | 转录组数据 | 13个原发性肺癌肿瘤及匹配正常组织(48,149个细胞),外加多个外部验证队列(GSE131907、TCGA-LUAD、GSE30219、GSE31210) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 150 | 2026-01-25 |
Decoding HSP90AA1-driven inflammatory signaling in the uveal melanoma microenvironment: an integrated analysis at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1730622
PMID:41567202
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研究论文 | 本研究通过整合计算生物学筛选与单细胞分辨率分析,解码了HSP90AA1作为葡萄膜黑色素瘤炎症和免疫微环境关键调节因子的作用 | 首次在单细胞分辨率下系统解析了HSP90AA1在葡萄膜黑色素瘤微环境中的表达谱和功能,揭示了其通过调控NF-κB、STAT3等炎症信号通路影响肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证相对有限,且未深入探讨HSP90AA1抑制剂的具体治疗策略 | 识别和验证介导葡萄膜黑色素瘤炎症与免疫信号转导的关键分子调节因子,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 葡萄膜黑色素瘤肿瘤微环境中的细胞群体,特别是恶性细胞、CD8+ T细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低,体外功能实验,体内异种移植模型 | 网络计算筛选模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 151 | 2026-01-25 |
Integrative analysis of bulk and single-cell transcriptomics identifies factors related to immunosuppressive microenvironment to predict unfavorable prognosis in inflammatory breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727590
PMID:41567210
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞转录组数据,识别了与免疫抑制微环境相关的因子,以预测炎性乳腺癌的不良预后 | 结合bulk和单细胞转录组学分析,揭示了GZMB和SPP1作为炎性乳腺癌中免疫抑制相关预后生物标志物的潜在作用,并明确了浆细胞样树突状细胞在重塑免疫抑制微环境中的关键角色 | 免疫组化分析的样本量极小,可能影响结果的可靠性 | 探究炎性乳腺癌肿瘤微环境的异质性及细胞间通讯,识别与免疫抑制微环境和不良预后相关的生物标志物 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序, 免疫组化 | WGCNA | 转录组数据, 图像数据 | 未明确具体样本数量,但提及免疫组化分析基于极小的样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 152 | 2026-01-25 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
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综述 | 本文综述了肌少症的组学研究,从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用,并提出了一个双层的“共性-特异性”框架 | 提出了一个双层的“共性-特异性”框架来解释肌少症的病理机制,并针对慢性肝病共病背景提出了“多弱信号协同累积”假说 | 目前组学研究结果多为相关性,对临床转化构成挑战,未来需要从静态分析转向动态机制解析 | 系统梳理肌少症的分子机制,并特别关注其在慢性肝病共病背景下的病理网络扰动 | 肌少症,以及慢性肝病相关的肌少症 | NA | 老年病 | 多组学技术 | NA | NA | 整合了10项肌少症组学研究和6项慢性肝病相关肌少症研究 | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 153 | 2026-01-25 |
BMP4 dose dictates lineage specification bias in human periodontal ligament stem cells
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1738051
PMID:41568233
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外功能实验,系统探究了BMP4剂量如何调控人牙周膜干细胞向成骨和肌腱谱系的分化 | 首次在单细胞水平揭示了BMP4剂量依赖性调控人牙周膜干细胞谱系分化的双相动力学机制,并明确了BMP受体在成骨和肌腱分化中的特异性作用 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内验证;样本量相对有限;未探讨其他可能影响分化的协同因子 | 探究BMP4剂量对人牙周膜干细胞谱系分化的调控机制,以优化基于PDLSC的牙周再生治疗策略 | 人牙周膜干细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,体外实验数据 | 未明确具体样本数量,但涉及人牙周膜干细胞亚群分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 154 | 2026-01-25 |
Growth Hormone Alleviates Atherosclerosis Through Regulating the Activity of PI3K/AKT Pathway: Insights From Single-Cell Sequence and Mechanism Exploration
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/9710652
PMID:41089172
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了生长激素通过调节PI3K/AKT通路活性缓解动脉粥样硬化的机制 | 结合单细胞RNA测序数据与机制探索,首次系统揭示了生长激素通过PI3K/AKT通路在动脉粥样硬化中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;体外实验使用ox-LDL模拟损伤,可能与体内复杂环境存在差异 | 探究生长激素对动脉粥样硬化的影响及其分子机制 | 小鼠动脉血管平滑肌细胞、C57BL/6和ApoE-/-小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 液相色谱-质谱联用, 蛋白质印迹分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 代谢组学数据, 基因表达数据 | 小鼠动脉组织样本(包括健康与动脉粥样硬化组织),具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 155 | 2026-01-24 |
Heterogeneity analysis and prognostic model construction of HPV negative oral squamous cell carcinoma T cells using ScRNA-seq and bulk-RNA analysis
2025-Jan-23, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01525-6
PMID:39849233
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据,分析了HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞的异质性,并构建了一个基于T细胞相关基因的预后风险模型 | 首次在HPV阴性口腔鳞状细胞癌中结合单细胞和bulk转录组数据系统分析T细胞异质性,并构建了基于T细胞相关基因的预后模型,为预测患者生存和免疫浸润水平提供了新见解 | 样本量相对有限(14个肿瘤样本和6个正常样本),模型需要在更大的独立队列中进行验证 | 评估HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞标记基因的表达谱,构建预后风险模型,并研究风险评分与免疫治疗反应的相关性 | HPV阴性口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, qRT-PCR | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 | 14个HPV阴性OSCC样本和6个正常样本,共28,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 156 | 2026-01-24 |
Unraveling the potential mechanism and prognostic value of pentose phosphate pathway in hepatocellular carcinoma: a comprehensive analysis integrating bulk transcriptomics and single-cell sequencing data
2025-Jan-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01521-w
PMID:39798003
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研究论文 | 本研究整合了批量转录组学和单细胞测序数据,构建了一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型,用于肝细胞癌患者的风险评估和预后预测 | 首次整合批量转录组学和单细胞测序数据,构建了一个与戊糖磷酸途径相关的十基因特征模型,并验证了其在预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应方面的价值 | 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测能力 | 构建一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型,用于肝细胞癌患者的风险评估、预后预测和个体化治疗指导 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 | 惩罚性Cox回归模型, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA, GEO和ICGC数据库的多个队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 157 | 2026-01-24 |
Pig jejunal single-cell RNA landscapes revealing breed-specific immunology differentiation at various domestication stages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530214
PMID:40151618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了野猪、金华猪和杜洛克猪空肠组织的免疫细胞图谱,揭示了不同驯化阶段猪品种间免疫功能的差异和进化 | 首次在单细胞分辨率下构建了猪空肠组织的免疫细胞图谱,开发了免疫细胞评估系统,并识别了与驯化相关的品种特异性基因模式 | 研究仅关注空肠组织,可能未全面反映整个肠道的免疫变化;样本量相对有限,未来可扩展至更多品种和部位 | 探究猪在驯化过程中肠道免疫功能的进化变化和细胞异质性 | 野猪、中国地方品种(金华猪)和集约化品种(杜洛克猪)的空肠组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 26,246个细胞,来自三个猪品种的空肠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 158 | 2026-01-24 |
Hydrogen improves the efficacy of tetrandrine in the treatment of silicosis by inhibiting vascular endothelial mesenchymal transition caused by oxidative stress
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1668524
PMID:41561355
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研究论文 | 本研究探讨了氢气如何通过抑制氧化应激诱导的血管内皮间质转化,来提高汉防己甲素治疗矽肺的疗效 | 首次提出氢气通过抑制凋亡肺泡巨噬细胞释放淀粉样前体蛋白及其与血管内皮细胞CD74的相互作用,来缓解肺血管狭窄,从而提高治疗药物在肺组织中的浓度 | 研究基于小鼠模型,结论在人体中的有效性尚需进一步验证 | 探究汉防己甲素在肺组织中浓度低的原因,并提出联合氢气吸入的治疗方案以提高矽肺治疗效果 | 矽肺小鼠模型 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 159 | 2026-01-24 |
Downregulation of OPCML is associated with activation of AKT signaling and aggressive phenotypes in glioblastoma cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1710073
PMID:41561740
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研究论文 | 本研究探讨了OPCML在胶质母细胞瘤中的下调与AKT信号通路激活及侵袭性表型的关系 | 首次在单细胞分辨率下定位OPCML在胶质母细胞瘤中的表达,并揭示其通过调节PI3K-AKT-mTOR信号通路影响肿瘤侵袭性 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内模型验证;临床相关性分析依赖于公共数据库,可能存在样本偏差 | 阐明OPCML在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其临床意义 | 胶质母细胞瘤细胞系(U87和U251)及公共数据库中的患者数据 | 生物信息学与分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、微阵列、Western blotting、siRNA敲低、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床数据 | 两个批量微阵列队列、单细胞RNA测序数据、TCGA和HPA数据库中的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2026-01-24 |
Integrative bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals COL1A2-driven ECM remodeling and focal adhesion signaling associated with the transition from non-muscle-invasive to muscle-invasive bladder cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1716324
PMID:41561769
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了COL1A2驱动的细胞外基质重塑和黏着斑信号在膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润转变过程中的关键作用 | 首次整合bulk和单细胞转录组数据,系统揭示了COL1A2介导的基质CAFs与EMT上皮细胞间的细胞通讯轴在膀胱癌进展中的机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究COL1A2在膀胱癌进展中的作用机制及其作为预后生物标志物的潜力 | 膀胱癌(非肌层浸润型和肌层浸润型) | 生物信息学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, ssGSEA, 细胞通讯分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析 | 转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的膀胱癌样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |