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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2025-05-10 |
METTL1-driven nucleotide metabolism reprograms the immune microenvironment in hepatocellular carcinoma: a multi-omics approach for prognostic biomarker discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582203
PMID:40330476
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research paper | 本研究揭示了METTL1通过驱动核苷酸代谢重编程在肝细胞癌（HCC）中调节肿瘤免疫微环境的新机制，并开发了一个基于多组学方法的预后生物标志物模型 | 首次揭示了METTL1驱动的核苷酸代谢重编程在HCC免疫微环境重塑中的关键作用，并构建了整合METTL1表达和免疫检查点特征的预后预测模型 | 研究主要基于计算分析和体外实验，需要更多体内实验和临床样本验证 | 探索HCC中代谢和免疫失调的分子机制，并开发预后预测模型 | 肝细胞癌（HCC）患者样本和细胞模型 | digital pathology | liver cancer | 多组学分析（包括单细胞RNA测序）、NMF聚类、WGCNA、机器学习算法 | 预后预测模型（基于多种机器学习算法） | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | 来自TCGA、GEO和ICGC数据库的HCC患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1562 | 2025-05-10 |
Comprehensive analysis of plasma cell heterogeneity and immune interactions in multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1549742
PMID:40330467
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转录组数据分析，深入探讨了多发性骨髓瘤中浆细胞的异质性及其免疫相互作用 | 首次通过单细胞测序鉴定出10种主要细胞类型，并构建了预后预测模型，揭示了风险组与免疫特征的关联 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制 | 探索多发性骨髓瘤发展的潜在机制，为改进治疗方法和提高患者预后提供新方向 | 多发性骨髓瘤中的浆细胞及其异质性 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序，转录组分析，NMF，WGCNA，LASSO，multiCox回归分析 | 预后预测模型 | 转录组数据 | 多个公共数据库中的样本，具体数量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 1563 | 2025-05-10 |
Multi-omics identification of a polyamine metabolism related signature for hepatocellular carcinoma and revealing tumor microenvironment characteristics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1570378
PMID:40330470
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研究论文 | 本研究通过多组学方法鉴定了一个与多胺代谢相关的肝细胞癌特征，并揭示了肿瘤微环境特征 | 使用101种机器学习算法构建了一个包含9个基因的多胺代谢相关特征（PMRS），并验证了其在肝细胞癌患者中的预后价值 | 研究结果需要进一步的临床实验验证 | 探索多胺代谢在肝细胞癌中的作用，并开发预后风险特征 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法（未指定具体模型） | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1564 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Role of Macrophage-Mediated CD44-AKT-CCL2 Pathways in Renal Tubule Injury during Calcium Oxalate Crystal Formation
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0690
PMID:40330661
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了巨噬细胞介导的CD44-AKT-CCL2通路在草酸钙晶体形成过程中肾小管损伤的作用 | 发现了肾小管损伤和S1近端小管细胞通过SPP1-CD44对与巨噬细胞的主要通讯方式，以及CD44-AKT通路介导的CCL2分泌在草酸钙晶体形成中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 深入了解草酸钙晶体形成过程中肾脏功能的改变及其分子机制 | 小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠草酸钙模型 | RNA测序数据 | 5个时间点的小鼠肾脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1565 | 2025-05-10 |
The first single-cell sequencing of Plasmodiophora brassicae reveals genetic diversity and clonal dynamics
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1581233
PMID:40330724
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研究论文 | 首次对芸薹根肿菌进行单细胞测序，揭示其遗传多样性和克隆动态 | 首次对芸薹根肿菌进行单细胞测序，揭示了其遗传多样性和克隆动态，支持了平衡选择维持病原体种群内多基因型的假说 | 研究仅基于单个根的样本，可能无法完全代表田间种群的遗传多样性 | 研究芸薹根肿菌的遗传多样性和繁殖生物学 | 芸薹根肿菌 | 基因组学 | 植物病害 | 单细胞测序 | NA | DNA序列数据 | 4,000个原生质体（来自单个根），其中500个细胞进行了更详细的分析 | NA | NA | NA | NA |
| 1566 | 2025-05-10 |
Neuroinflammation and stress-induced pathophysiology in major depressive disorder: mechanisms and therapeutic implications
2025, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2025.1538026
PMID:40336842
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综述 | 本文综述了神经炎症与压力诱导的病理生理学在重度抑郁症中的作用机制及治疗意义 | 聚焦于压力诱导的神经炎症过程及其在抑郁症发病和进展中的作用，探讨了抗炎活性小分子在治疗中的潜在效果 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有研究的总结和分析 | 探讨神经炎症在重度抑郁症中的机制及治疗潜力 | 神经炎症过程，特别是小胶质细胞和星形胶质细胞的过度激活及促炎细胞因子水平升高 | 神经科学 | 重度抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1567 | 2025-05-10 |
Spatial visualization provides insight into immune modulation by an L-DBF vaccine formulation against Shigella
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577040
PMID:40336950
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研究论文 | 本研究探讨了L-DBF疫苗配方在肺部免疫调节中的作用，通过空间转录组学方法分析了两剂L-DBF/ME疫苗对肺部免疫景观的影响 | 首次使用空间转录组学方法揭示L-DBF/ME疫苗如何重塑肺部免疫架构，包括B细胞、T细胞标记物表达的变化，以及成纤维细胞和心肌细胞的重新编程 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 评估L-DBF/ME疫苗配方对肺部免疫反应的调节作用 | L-DBF疫苗配方及其对肺部免疫系统的影响 | 免疫学 | 志贺菌病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1568 | 2025-05-07 |
Analysis of synthetic polymer hydrogel-based generation of leukemia stem cells
2025-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151149
PMID:39700762
|
研究论文 | 本文通过合成聚合物水凝胶培养K562白血病细胞，使其获得白血病干细胞特性，并研究了AKR1B1和TSPYL5在干细胞特性生成中的关键作用 | 首次利用合成聚合物水凝胶培养系统快速生成白血病干细胞，并鉴定出AKR1B1和TSPYL5作为潜在的干细胞治疗靶点 | 研究仅针对K562白血病细胞系，未在其他白血病模型或体内实验中验证 | 开发快速生成白血病干细胞的方法并探索其治疗靶点 | K562白血病细胞 | 癌症研究 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | K562细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 1569 | 2025-05-07 |
TBX3 shapes an immunosuppressive microenvironment and induces immunotherapy resistance
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.103175
PMID:39897553
|
research paper | 该研究探讨了TBX3在膀胱癌免疫抑制微环境中的作用及其对免疫治疗抵抗的影响 | 首次系统性地揭示了TBX3通过调节TGFβ1表达促进免疫抑制微环境形成的分子机制，并验证了TBX3作为免疫治疗疗效预测标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证TBX3的临床应用价值 | 探索膀胱癌免疫治疗抵抗的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 膀胱癌组织和细胞 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、高通量细胞因子阵列、ProcartaPlex多重免疫分析、TissueFAXS全景组织定量分析 | NA | RNA测序数据、组织微阵列数据 | 多个公共数据库样本和真实世界免疫治疗队列 | NA | NA | NA | NA |
| 1570 | 2025-05-07 |
Glycosphingolipids-Dependent Phospholipid Metabolism Enhances Cancer Initiation and Progression through SMPD1/GLTP/B3GALT4/ST8SIA6 Signaling Axis: A Novel Therapeutic Target
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.103834
PMID:39898245
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序数据和TCGA数据库，研究鞘脂代谢在结直肠癌发生发展中的关键作用 | 发现鞘脂代谢失调在结直肠癌发展中的关键作用，并确定了几个潜在的治疗靶点 | 未提及实验验证或临床前研究的具体结果 | 探索结直肠癌发生发展的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 结直肠癌细胞 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1571 | 2025-05-07 |
Comprehensive Pan-Cancer Analysis of RAC1 Decoding the Impact on Cancer Prognosis and B cell immune Regulation
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.104488
PMID:39898257
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研究论文 | 本文对RAC1在33种癌症类型中的表达及其对癌症预后和B细胞免疫调节的影响进行了全面分析 | 揭示了RAC1在多种癌症中的高表达及其与不良预后的关联，首次系统研究了RAC1在肿瘤免疫微环境中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探索RAC1在泛癌水平上的表达特征及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 33种癌症类型中的RAC1表达 | 癌症基因组学 | 泛癌分析 | 基因组变异分析（CNV、TMB、MSI）、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | 预后特征模型 | 基因组数据、转录组数据 | 33种癌症类型的多组学数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1572 | 2025-05-07 |
Integrating Tissue Microarray to GeoMx® Digital Spatial Profiler : Spatial Transcriptomics Assay with Bioinformatics Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4276-4_9
PMID:39900760
|
研究论文 | 本文介绍了如何将组织微阵列整合到GeoMx®数字空间分析仪中，进行空间转录组学检测及生物信息学分析 | 详细描述了数字空间分析仪（DSP）的NGS检测协议及生物信息学分析流程，特别关注组织微阵列的整合及GeoMx RNA检测的特定方法 | 依赖于NanoString公司提供的GeoMX DSP指南和GeoMx数据分析手册的当前版本，需定期检查更新 | 推动空间转录组学技术在疾病研究和治疗中的应用 | 组织微阵列和GeoMx RNA检测 | 空间转录组学 | NA | NGS, RNA-Seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1573 | 2025-05-07 |
Analysis of downstream targets of PAX6 and LHX2, fundamental regulators of the developing mammalian neocortex
2025, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39912400
|
研究论文 | 分析PAX6和LHX2这两个哺乳动物大脑皮层发育中的基本调控因子的下游靶基因 | 比较了PAX6和LHX2的染色质占据情况以及各自缺失时的转录失调，识别了共同直接和间接靶基因，并分析了它们在神经发生过程中的表达模式 | 未进行实验验证所提出的假设 | 探究PAX6和LHX2在哺乳动物大脑皮层发育中的基因调控网络 | PAX6和LHX2转录因子及其下游靶基因 | 发育生物学 | NA | 染色质占据分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1574 | 2025-10-07 |
Development of a hypoxia-responsive macrophage prognostic model using single-cell and bulk RNA sequencing in pancreatic cancer
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322618
PMID:40315225
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和TCGA-PAAD数据库数据，开发了一个包含13个关键基因的缺氧反应性巨噬细胞预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建胰腺癌缺氧相关预后模型，并发现KRTCAP2作为关键生物标志物 | NA | 构建胰腺癌缺氧相关预后模型以预测化疗敏感性和总生存期 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归, Lasso回归, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据 | TCGA-PAAD数据库及单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1575 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing identifies and validates T cell-related prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322706
PMID:40315269
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，构建并验证了肝细胞癌中T细胞相关的预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别T细胞相关预后基因，并构建包含PTTG1、LMNB1、SLC38A1和BATF的四基因预后模型 | 样本量相对有限，单细胞数据仅来自10名患者，验证队列规模较小 | 开发肝细胞癌的预后预测模型，改善患者风险分层和个性化治疗策略 | 肝细胞癌患者及其肿瘤组织中的T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，免疫组化，LASSO回归，Cox回归分析 | LASSO回归模型，Cox比例风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床预后数据，免疫组化图像 | 10例HCC患者的scRNA-seq数据（6,281个T细胞），TCGA和ICGC数据库的bulk RNA-seq数据，25例患者组织的IHC验证 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1576 | 2025-10-07 |
Multiomics Approach Distinguishes SPTBN4 as a Key Molecule in Diagnosis, Prognosis, and Immune Suppression of Testicular Seminomas
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/3530098
PMID:40321316
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别SPTBN4作为睾丸精原细胞瘤诊断、预后和免疫抑制的关键分子标志物 | 首次整合单细胞转录组测序、高维加权基因共表达网络分析和药物敏感性分析，系统揭示SPTBN4在睾丸精原细胞瘤中的核心作用 | 研究主要基于公共数据集和计算分析，需要进一步实验验证 | 探索睾丸精原细胞瘤的分子异质性并识别关键生物标志物 | 睾丸精原细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 睾丸精原细胞瘤 | 单细胞RNA转录组测序, 高维加权基因共表达网络分析, 药物敏感性分析 | hdWGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 临床生存数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1577 | 2025-10-07 |
Inferred developmental origins of brain tumors from single-cell RNA-sequencing data
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf016
PMID:40321621
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研究论文 | 本研究开发了COORS计算工具，通过单细胞RNA测序数据推断脑肿瘤的发育起源 | 开发了基于发育人脑单细胞数据训练的COORS计算工具，能够注释脑肿瘤中的发育样细胞状态 | NA | 识别脑肿瘤的发育起源 | 脑肿瘤单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1578 | 2025-10-07 |
A prognostic glycolysis-related gene signature in osteosarcoma: implications for metabolic programming, immune microenvironment, and drug response
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19369
PMID:40321814
|
研究论文 | 本研究建立了一个基于糖酵解相关基因的骨肉瘤预后风险特征模型 | 首次基于糖酵解相关基因构建骨肉瘤预后风险特征，并探索其与肿瘤微环境和药物反应的关系 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立骨肉瘤糖酵解相关基因风险特征并评估其预后价值 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | mRNA表达谱分析，单细胞RNA测序，RT-PCR | 非负矩阵分解，Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的三个数据集(GSE16091, GSE39058, GSE21257) | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1579 | 2025-10-07 |
scSMD: a deep learning method for accurate clustering of single cells based on auto-encoder
2025-Jan-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06047-x
PMID:39881248
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研究论文 | 提出一种基于自编码器的深度学习模型scSMD，用于单细胞RNA测序数据的准确聚类分析 | 整合非线性降维技术与多孔扩张注意力门控组件，基于卷积自编码器和负二项分布，能有效捕获细胞聚类特征并动态调整特征权重 | NA | 探索深度学习在单细胞数据聚类中的应用，特别关注处理稀疏高维数据 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 卷积自编码器, SMD深度学习模型 | 基因表达数据 | 公共数据集和专有骨肉瘤数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1580 | 2025-10-07 |
Epidermal stem cell derived exosomes-induced dedifferentiation of myofibroblasts inhibits scarring via the miR-203a-3p/PIK3CA axis
2025-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03157-9
PMID:39881312
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研究论文 | 本研究通过表皮干细胞来源的外泌体诱导肌成纤维细胞去分化，揭示miR-203a-3p/PIK3CA轴在抑制瘢痕形成中的作用机制 | 首次发现表皮干细胞外泌体通过miR-203a-3p靶向抑制PIK3CA表达，阻断PI3K/AKT/mTOR通路过度激活，促进肌成纤维细胞去分化 | NA | 探究表皮干细胞外泌体抑制增生性瘢痕形成的分子机制 | 增生性瘢痕组织、肌成纤维细胞、表皮干细胞外泌体 | 细胞生物学 | 增生性瘢痕 | 比较转录组学、单细胞测序、miRNA测序、超速离心、Western blotting、免疫荧光 | NA | 转录组数据、单细胞数据、miRNA数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |