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当前共找到 2188 篇文献，本页显示第 1541 - 1560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2025-10-06 |
Single-cell combined transcriptome probes prognostic mechanisms of sialylation-related genes in cervical cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1534247
PMID:40352586
|
研究论文 | 基于唾液酸化相关基因构建宫颈癌预后模型并探索其机制 | 首次结合转录组和单细胞RNA测序数据系统研究唾液酸化相关基因在宫颈癌中的预后价值 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发宫颈癌预后模型并探索唾液酸化相关基因的作用机制 | 宫颈癌患者 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, qRT-PCR | LASSO Cox回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 4个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1542 | 2025-10-06 |
Overexpression of MMP14 is associated with poor prognosis and immune cell infiltration in colon cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564375
PMID:40352589
|
研究论文 | 本研究探讨MMP14在结肠癌中的过表达与预后不良及免疫细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞转录组分析揭示MMP14在肝转移组成纤维细胞中高表达，并构建基于MMP14共表达基因的三基因风险预测模型 | 需要更多体外和体内实验验证研究结果，样本量有限 | 研究MMP14在免疫功能中的调控作用及其对结直肠癌预后的影响 | 结直肠癌组织和细胞系COLO205 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序,单细胞转录组分析,qRT-PCR,Western blotting,免疫荧光,HE染色 | 机器学习,Cox回归分析 | 基因表达数据,临床数据,单细胞数据 | 4对结直肠癌患者肿瘤与癌旁组织，公共数据库(TCGA和GEO)数据 | NA | 转录组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1543 | 2025-10-06 |
RGS14 binds to GNAI3 and regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cells by affecting PLPP2 expression and MAPK signaling
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1593595
PMID:40352663
|
研究论文 | 本研究揭示了RGS14通过结合GNAI3调控PLPP2表达和MAPK信号通路，影响人类精原干细胞增殖与凋亡的分子机制 | 首次发现RGS14-GNAI3-PLPP2调控轴在精原干细胞稳态维持中的关键作用，并阐明其在非梗阻性无精子症发病机制中的功能 | 研究主要基于细胞系实验，需要进一步在动物模型中验证该调控通路的生理功能 | 探究非梗阻性无精子症患者精原干细胞功能障碍的调控网络机制 | 人类精原干细胞和非梗阻性无精子症患者睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序，RNA测序，免疫荧光，蛋白质相互作用分析，免疫共沉淀 | NA | 单细胞转录组数据，RNA测序数据，蛋白质相互作用数据 | 非梗阻性无精子症患者与正常睾丸组织的精原干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1544 | 2025-10-06 |
The miR-941/FOXN4/TGF-β feedback loop induces N2 polarization of neutrophils and enhances tumor progression of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561081
PMID:40352924
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-941/FOXN4/TGF-β反馈环路通过诱导中性粒细胞N2极化促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现miR-941通过靶向FOXN4调控TGF-β信号通路，形成反馈环路驱动肿瘤相关中性粒细胞的N2极化 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探讨miR-941在肺腺癌肿瘤相关中性粒细胞中的作用机制 | 肺腺癌患者肿瘤相关中性粒细胞、A549和H1299细胞系、小鼠移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 荧光素酶报告实验, Western blot, ELISA | miReact算法, 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 肺腺癌患者样本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1545 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq data have prevalent blood contamination but can be rescued by Originator, a computational tool separating single-cell RNA-Seq by genetic and contextual information
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588144
PMID:38617220
|
研究论文 | 开发了一种名为Originator的计算工具，用于识别和分离单细胞RNA测序数据中的血液污染细胞 | 提出首个结合遗传信息和背景信息来分离单细胞RNA测序数据中血液污染细胞的计算框架 | 未提及方法在特定组织类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中普遍存在的血液污染问题 | 人类复杂组织中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多种人工混合和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1546 | 2025-10-06 |
Polymorphisms in immunosuppression-related genes are associated with AML
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530510
PMID:39975548
|
研究论文 | 本研究通过检测免疫抑制相关基因的多态性，分析其与急性髓系白血病易感性、治疗反应和预后的关联 | 首次系统研究五个免疫抑制相关基因(CIITA、CD200、CD163、MRC1和LILRB4)中九个SNP与AML的关联 | 样本量相对有限(307例患者和316例对照)，仅检测了特定基因的SNP | 探讨免疫抑制相关基因多态性在AML发病机制和治疗预后中的作用 | 307例AML患者和316例健康对照个体 | 生物医学研究 | 急性髓系白血病 | SNP基因分型、单细胞转录组学 | NA | DNA样本、基因分型数据 | 307例AML患者和316例健康对照 | Agena Bioscience | SNP基因分型 | MassARRAY | MassARRAY平台 |
| 1547 | 2025-10-06 |
Unveiling macrophage dynamics and efferocytosis-related targets in diabetic kidney disease: insights from single-cell and bulk RNA-sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521554
PMID:40046045
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示糖尿病肾病中巨噬细胞动态变化及胞葬作用相关靶点 | 首次系统阐明糖尿病肾病中巨噬细胞亚型动态转变过程，并识别出CD36、ITGAM和CX3CR1三个关键胞葬作用调控基因 | 研究主要基于早期糖尿病肾病样本，晚期疾病阶段的验证相对有限 | 阐明糖尿病肾病中巨噬细胞异质性、表型动态变化及胞葬作用关键靶点 | 糖尿病肾病患者的免疫细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 伪时间轨迹分析 | 差异表达基因分析 | RNA测序数据 | 早期人类糖尿病肾病测序数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | CD45富集的免疫细胞单细胞RNA测序，NephroseqV5平台临床数据分析 |
| 1548 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics in islet transplantation for diabetes treatment: advancing towards personalized therapies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1554876
PMID:40051625
|
综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在胰岛移植治疗糖尿病中的应用及其推动个性化治疗的潜力 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面揭示胰岛移植中的细胞多样性、功能状态及组织微环境相互作用 | 未涉及具体实验数据，主要基于现有研究综述，且未详细讨论技术实施中的具体操作挑战 | 探索先进组学技术如何提升胰岛移植疗效并推动糖尿病个性化治疗发展 | 胰岛移植过程中的细胞类型、基因表达特征及组织微环境 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1549 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for hepatocellular carcinoma based on microvascular invasion characteristic genes by spatial transcriptomics sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529569
PMID:40051627
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组测序开发了基于微血管入侵特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次利用空间转录组测序技术筛选MVI区域特异性基因，构建了7基因预后模型并在多个外部验证队列中证实其优越性 | 仅使用4个不同分级的MVI样本进行空间转录组测序，样本量有限 | 开发基于微血管入侵特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 肝细胞癌患者和微血管入侵样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | Cox回归, LASSO回归, 随机生存森林 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, 图像数据 | 4个不同分级的MVI样本用于空间转录组测序，三个外部验证队列 | NA | 空间转录组测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1550 | 2025-10-06 |
Tumor microenvironment-driven resistance to immunotherapy in non-small cell lung cancer: strategies for Cold-to-Hot tumor transformation
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2025.14
PMID:40342732
|
综述 | 本文综述了非小细胞肺癌肿瘤微环境驱动的免疫治疗耐药机制及冷肿瘤向热肿瘤转化的策略 | 提出了将冷肿瘤转化为热肿瘤的多维框架，整合了新兴机制如中性粒细胞胞外诱捕网、三级淋巴结构和外泌体信号网络 | NA | 克服非小细胞肺癌免疫治疗耐药性，实现冷肿瘤向热肿瘤的转化 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、纳米医学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1551 | 2025-10-06 |
The Low Tumorigenic Risk and Subtypes of Cardiomyocytes Derived from Human-induced Pluripotent Stem Cells
2025, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
研究论文 | 本研究评估了人诱导多能干细胞来源心肌细胞的肿瘤形成风险和亚型组成 | 首次通过单细胞RNA测序和全外显子组测序系统评估hiPSC-CMs的肿瘤风险并解析其细胞亚型组成 | 研究仅在NOD-SCID小鼠模型中进行了3个月的肿瘤形成观察，缺乏更长期的随访数据 | 评估hiPSC-CMs的肿瘤形成风险并鉴定其细胞亚型组成 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,全外显子组测序,流式细胞术,电生理学 | NA | 基因表达数据,基因组数据,细胞表型数据 | 分化第25天的hiPSC-CMs | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 1552 | 2025-10-06 |
A novel classification method for LUAD that guides personalized immunotherapy on the basis of the cross-talk of coagulation- and macrophage-related genes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518102
PMID:40018029
|
研究论文 | 基于凝血和巨噬细胞相关基因的交叉作用，开发了一种新的肺腺癌分类方法以指导个性化免疫治疗 | 首次整合凝血相关基因和巨噬细胞相关基因，定义了33个COMAR基因并建立了肺腺癌三种新亚型分类系统 | 需要外部数据队列和临床样本进一步验证模型的普适性 | 探索基于凝血和巨噬细胞的新型分类方法，以更好地指导肺腺癌患者的精准治疗 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | WGCNA, scRNA-seq分析, 无监督聚类分析, 差异表达基因分析 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但使用了外部数据队列和临床样本进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1553 | 2025-10-06 |
Modulation of double-negative T cells by Huang-Lian-Jie-Du Decoction attenuates neuroinflammation in ischemic stroke: insights from single-cell transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537277
PMID:40018035
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了黄连解毒汤通过调节双阴性T细胞亚型平衡减轻缺血性脑卒中神经炎症的机制 | 首次在缺血性脑卒中中发现双阴性T细胞存在活化细胞毒性和静息免疫抑制两种功能亚型，并揭示中药复方黄连解毒汤可通过调节这两种亚型平衡发挥神经保护作用 | 双阴性T细胞介导免疫反应的具体机制尚未完全阐明，黄连解毒汤在其他神经炎症疾病中的应用需要进一步研究 | 探讨黄连解毒汤对缺血性脑卒中急性期双阴性T细胞的调节作用及其神经保护机制 | 缺血性脑卒中模型中的双阴性T细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1554 | 2025-10-06 |
Elevated levels of IRF1 and CASP1 as pyroptosis-related biomarkers for intestinal epithelial cells in Crohn's disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1551547
PMID:40018047
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别出IRF1和CASP1作为克罗恩病肠道上皮细胞焦亡相关的关键生物标志物 | 首次系统识别并验证IRF1和CASP1在克罗恩病肠道上皮细胞焦亡中的关键作用，并证明其在不同CD亚型中的诊断价值 | 研究主要聚焦于IRF1和CASP1，其他焦亡相关基因的作用仍需进一步探索 | 探索焦亡在克罗恩病肠道上皮细胞中的作用机制并识别关键生物标志物 | 克罗恩病患者肠道上皮细胞、TNBS诱导的结肠炎大鼠模型 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 差异表达分析、机器学习算法、单细胞测序分析、RT-PCR、蛋白质印迹 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本、TNBS诱导的结肠炎大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1555 | 2025-05-12 |
Integration of bulk RNA-seq and scRNA-seq reveals transcriptomic signatures associated with deep vein thrombosis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1551879
PMID:40342960
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，揭示了与深静脉血栓形成(DVT)相关的转录组特征，并识别了潜在的遗传标记 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq技术，识别了DVT相关的8个高度特征性基因，并验证了CXCR4作为潜在遗传标记的作用 | 样本量相对较小(内部测试集11例患者+6例对照，外部测试集12例患者+6例对照)，需要更大规模研究验证 | 识别和验证与深静脉血栓形成(DVT)相关的最具特征性的基因 | DVT患者和对照组的全血样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, 机器学习算法, 免疫荧光 | WGCNA, 机器学习算法 | RNA-seq数据 | 内部测试集17例(11患者+6对照)，外部测试集18例(12患者+6对照)，scRNA-seq 6例(3患者+3对照) | NA | NA | NA | NA |
| 1556 | 2025-05-12 |
Decoding immune cell interactions during cardiac allograft vasculopathy: insights derived from bioinformatic strategies
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1568528
PMID:40342971
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review | 本文综述了单细胞和多组学方法在心脏同种异体移植血管病变（CAV）研究中的应用，总结了最新发现并讨论了其对理解CAV发病机制的意义 | 总结了单细胞RNA测序等先进技术在揭示CAV中免疫-内皮-基质相互作用方面的突破性发现 | 目前将这些技术应用于CAV的研究仍然较少，限制了这些发现向临床实践的转化 | 理解心脏移植后慢性同种异体移植血管病变（CAV）的发病机制 | 心脏移植受者的血管病变 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1557 | 2025-05-12 |
Leveraging transcriptome-wide association studies identifies the relationship between upper respiratory flora and cell type-specific gene expression in severe respiratory disease
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322864
PMID:40343915
|
研究论文 | 本研究利用转录组范围关联研究（TWAS）探讨了上呼吸道菌群与严重流感样疾病（ILI）中免疫细胞特异性基因表达的关系 | 首次结合GWAS数据和scRNA-seq数据，通过TWAS方法揭示了上呼吸道菌群与免疫细胞基因表达的关联，并识别了影响ILI进展的关键免疫细胞类型和通路 | 研究样本量相对有限（1195例GWAS数据），且仅关注了严重ILI患者 | 探究上呼吸道菌群如何通过调节免疫细胞功能影响ILI的疾病进展 | 上呼吸道菌群和免疫细胞（如CD4+T效应记忆细胞、cDCs、NK细胞等） | 基因组学与免疫学 | 呼吸道疾病 | GWAS、scRNA-seq、LDSC、MAGMA、scDRS、FUSION | TWAS | 基因组数据和单细胞转录组数据 | 1195例严重ILI相关的GWAS数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1558 | 2025-05-12 |
scRNA-seq and scATAC-seq analyses highlight the role of TNF signaling pathway in chronic obstructive pulmonary disease model mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322538
PMID:40343927
|
研究论文 | 通过scRNA-seq和scATAC-seq分析，研究TNF信号通路在慢性阻塞性肺疾病模型小鼠中的作用 | 结合scRNA-seq和scATAC-seq技术，揭示了TNF信号通路在COPD模型小鼠中的重要作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究TNF信号通路在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用 | C57BL/6小鼠的肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | COPD小鼠模型 | 单细胞测序数据 | 未明确说明数量的小鼠肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1559 | 2025-05-10 |
Single-cell sequencing elucidates the mechanism of NUSAP1 in glioma and its diagnostic and prognostic significance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1512867
PMID:39975552
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索NUSAP1在神经胶质瘤中的作用机制及其诊断和预后意义 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据结合基础实验，揭示了NUSAP1作为神经胶质瘤终末亚群的关键标记物及其与不良预后的关联 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的RNA-seq和微阵列数据，可能需要更多独立样本验证 | 探索神经胶质瘤的个性化精准治疗策略 | 神经胶质瘤细胞亚群 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA-seq, 微阵列 | NA | RNA-seq数据, 微阵列数据, scRNA-seq数据 | 来自TCGA和GEO数据库的神经胶质瘤患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1560 | 2025-05-10 |
Advancing personalized, predictive, and preventive medicine in bladder cancer: a multi-omics and machine learning approach for novel prognostic modeling, immune profiling, and therapeutic target discovery
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572034
PMID:40330458
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别并分析了膀胱癌中与免疫原性细胞死亡相关的多组学特征，构建了一个预后标志物ICDRS，并探讨了其临床和生物学意义 | 利用多组学数据和机器学习算法构建了膀胱癌的预后标志物ICDRS，揭示了其与免疫细胞浸润、肿瘤微环境及药物敏感性的关联 | 研究依赖于公开数据集，样本量有限，且未进行实验验证 | 推进膀胱癌的个性化、预测性和预防性医学研究 | 膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序(bulk RNA-seq), WGCNA, ssGSEA | Lasso, Ridge, CoxBoost | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据9个样本，批量RNA测序数据TCGA-BLCA 403个样本，GSE13507 160个样本 | NA | NA | NA | NA |