单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1942 篇文献，本页显示第 1521 - 1540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1521 | 2025-10-07 |
The role of TRAF2 in pan-cancer revealed by integrating informatics and experimental validation
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1563435
PMID:40144665
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证揭示TRAF2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 首次系统整合多组学数据和实验验证，全面揭示TRAF2在泛癌中的表达特征、表观遗传调控、免疫微环境作用及其在肝细胞癌中的功能 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证主要集中在肝细胞癌，需要更多癌症类型的实验验证 | 阐明TRAF2在癌症发生发展中的作用机制及其临床意义 | 人类正常组织和肿瘤组织，肝细胞癌细胞系HepG2 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析，单细胞测序，免疫荧光染色，siRNA敲低 | Cox回归分析，Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据，表观遗传数据，单细胞测序数据，免疫组化数据 | 多个公共数据库的泛癌数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，免疫荧光，基因敲低 | NA | NA |
| 1522 | 2025-10-07 |
Utilizing sc-linker to integrate single-cell RNA sequencing and human genetics to identify cell types and driver genes associated with non-small cell lung cancer
2025-Jan-23, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13525-1
PMID:39849454
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和人类遗传学数据，识别与非小细胞肺癌相关的细胞类型和驱动基因 | 使用sc-linker框架首次整合scRNA-seq、表观基因组SNP-基因映射和GWAS汇总统计数据，识别肺癌相关的特定细胞类型和驱动基因 | 研究主要基于计算分析，需要实验验证来确认RAB31的功能作用 | 识别与非小细胞肺癌相关的特定细胞类型和驱动基因 | 非小细胞肺癌患者和正常肺组织 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, 表观基因组分析 | sc-linker框架, MAGMA | 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1523 | 2025-10-07 |
The multi-target mechanism of action of Selaginella doederleinii Hieron in the treatment of nasopharyngeal carcinoma: a network pharmacology and multi-omics analysis
2025-01-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83921-3
PMID:39747499
|
研究论文 | 通过网络药理学和多组学分析探讨卷柏治疗鼻咽癌的多靶点作用机制 | 首次结合网络药理学、多组学分析和分子对接技术系统揭示卷柏治疗鼻咽癌的多靶点协同作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索卷柏治疗鼻咽癌的作用机制 | 卷柏活性成分及其与鼻咽癌相关靶点的相互作用 | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 网络药理学, WGCNA分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | 蛋白互作网络, 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据, 化合物靶点数据 | GSE53819数据集及多个数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1524 | 2025-10-07 |
Discrepancies between human and murine model cerebral aneurysms at single-cell resolution
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1512938
PMID:40134579
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析比较人类与小鼠模型脑动脉瘤的细胞和分子差异 | 首次在单细胞分辨率系统比较人类与小鼠脑动脉瘤模型的细胞表型和分子特征差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA测序数据集，缺乏实验验证 | 探究人类与小鼠脑动脉瘤模型在细胞和分子水平的差异 | 人类和小鼠模型的脑动脉瘤组织 | 单细胞组学 | 脑动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 轨迹分析, 基因调控网络分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1525 | 2025-10-07 |
TM4SF1 overexpression in tumor-associated endothelial cells promotes microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1526177
PMID:40123905
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现肿瘤相关内皮细胞中TM4SF1过表达通过影响上皮-间质转化促进肝细胞癌微血管侵袭 | 首次在单细胞水平揭示TM4SF1在肿瘤相关内皮细胞中的表达与肝细胞癌微血管侵袭的关联机制 | 样本量较小（初始3例MVI和2例非MVI患者），需要更大规模验证 | 探究肿瘤相关内皮细胞在肝细胞癌微血管侵袭中的作用机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤相关内皮细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 病理标本 | 初始5例患者（3例MVI+2例非MVI），另加5个空间转录组数据集和4例术后病理标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1526 | 2025-10-07 |
Genetic factors associated with erectile dysfunction- mendelian randomisation analysis
2025, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
DOI:10.62347/BVHS3637
PMID:40124574
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析识别与勃起功能障碍相关的遗传保护基因 | 首次利用孟德尔随机化方法系统识别ED相关遗传保护基因，发现TRIP10基因的显著保护作用 | 研究样本主要来自芬兰人群，可能存在人群特异性限制 | 探索勃起功能障碍的遗传保护机制 | 勃起功能障碍患者和对照人群 | 遗传学 | 勃起功能障碍 | GWAS, eQTL分析, 孟德尔随机化, 单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 表达量数据 | 1,154例病例和94,024例对照，共95,178人 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1527 | 2025-10-07 |
Distinct Immunological Features Compared to Lichen Planus and Oral Lichen Planus
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S506313
PMID:40125076
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析比较了口腔扁平苔藓和扁平苔藓的免疫特征差异 | 首次鉴定出PTGDS作为OLP诊断标志物及新型CXCR4高-TSC22D3高CD4细胞毒性T细胞亚群 | 样本量有限（16例患者和5例对照），需要进一步验证 | 阐明口腔扁平苔藓与扁平苔藓的免疫病理机制差异 | 口腔扁平苔藓患者和扁平苔藓患者的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞转录组测序，ELISA | NA | 单细胞转录组数据 | 16例OLP患者和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1528 | 2025-10-07 |
Elucidating Molecule-Crosstalk of Neutrophil Extracellular Traps Between Cardiovascular Disease and Psoriasis: Insights Into Mendelian Randomization, Single-Cell RNA Analysis, Shared Targets and the Role of Resveratrol
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S493416
PMID:40125083
|
研究论文 | 通过整合多种组学方法揭示中性粒细胞胞外诱捕网在左心室肥厚和银屑病之间的分子互作机制 | 首次整合孟德尔随机化、单细胞RNA分析和分子对接方法系统研究NETs在心血管疾病与银屑病间的分子串扰 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步验证 | 探索左心室肥厚与银屑病之间的分子互作机制，特别关注NETs相关通路 | 左心室肥厚和银屑病患者 | 生物信息学 | 心血管疾病,银屑病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,孟德尔随机化,分子对接 | 预测模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1529 | 2025-10-07 |
Causal Correlations Between Plasma Metabolites, Inflammatory Proteins, and Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Mendelian Randomization and Bioinformatics-Based Investigation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S513526
PMID:40125086
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和生物信息学方法探讨血浆代谢物、炎症蛋白与慢性阻塞性肺疾病之间的因果关系 | 首次系统性地通过MR方法验证代谢物与COPD的因果关系，并识别出三种关键中介蛋白和NRXN3的保护作用机制 | MR方法依赖于遗传工具变量的假设，且样本来源和人群特征可能限制结果的普适性 | 探究代谢、炎症与COPD之间的因果关系及中介机制 | 血浆代谢物、炎症蛋白和慢性阻塞性肺疾病患者 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 孟德尔随机化, 蛋白互作网络分析, GO/KEGG富集分析, 单细胞测序, 转录组分析 | MR, PPI网络, 富集分析 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及多组学数据集和人肺组织验证 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 1530 | 2025-10-07 |
Exploring the Association Between Immune Cell Phenotypes and Osteoporosis Mediated by Inflammatory Cytokines: Insights from GWAS and Single-Cell Transcriptomics
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S510102
PMID:40125424
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组学探索免疫细胞表型通过炎症细胞因子介导骨质疏松症的机制 | 首次结合GWAS、孟德尔随机化和单细胞转录组学系统分析免疫细胞与骨质疏松的因果关系，发现IgD⁺CD24⁺ B细胞通过IL-17C介导骨质疏松的新机制 | 研究样本来源和数量未明确说明，部分炎症因子存在重叠可能影响分析准确性 | 阐明免疫细胞表型通过炎症细胞因子介导骨质疏松症的因果机制 | 731种免疫细胞类型、91种炎症因子、5种骨质疏松类型、骨质疏松患者和地塞米松诱导的骨质疏松模型 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 两样本孟德尔随机化、中介分析、共定位分析、单细胞转录组测序、微CT、流式细胞术、ELISA、Western blotting、免疫组化 | 贝叶斯共定位模型、单细胞聚类分析 | 基因组数据、转录组数据、影像数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1531 | 2025-10-07 |
Cloning and validating systems for high throughput molecular recording
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.01.015
PMID:40121084
|
研究论文 | 本文描述了构建分子记录谱系追踪系统的优化克隆和验证流程 | 利用CRISPR-Cas9条形码编辑技术在基因组整合的工程DNA盒中产生突变，通过单细胞RNA测序读取并生成高分辨率谱系树 | NA | 开发高通量分子记录技术用于细胞历史追踪 | 细胞发育、分化和肿瘤进化过程中的细胞轨迹 | 生物技术 | 肿瘤 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1532 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals disease-specific CD8+ T cell clonal expansion and a high frequency of transcriptionally distinct double-negative T cells in diabetic NOD mice
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317987
PMID:40106422
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示糖尿病NOD小鼠中疾病特异性CD8+ T细胞克隆扩增和转录独特双阴性T细胞的高频出现 | 首次在单细胞分辨率下同时分析T细胞转录组和T细胞受体库，发现疾病依赖性CD8+ T细胞发育和独特双阴性T细胞群体 | 研究结果需要未来进一步验证，未在人类样本中确认发现 | 识别与1型糖尿病进展相关的T细胞克隆扩增和转录组特征 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的外周血和胰岛T细胞 | 单细胞基因组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | NOD小鼠纵向收集的外周血和胰岛样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1533 | 2025-10-07 |
A single-cell RNA sequencing atlas of the healthy canine lung: a foundation for comparative studies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1501603
PMID:40114924
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建健康犬肺组织的细胞图谱，为比较研究提供基础 | 首次系统描绘健康犬肺组织的单细胞转录组图谱，发现46个转录特征不同的细胞亚群，包括罕见细胞类型 | 仅使用4只犬的样本，样本量有限 | 建立健康犬肺组织的单细胞转录组参考图谱，为肺部疾病研究提供分子基础 | 健康犬肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4只犬的26,278个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 液滴式单细胞RNA测序 |
| 1534 | 2025-10-07 |
Targeting glycolysis in esophageal squamous cell carcinoma: single-cell and multi-omics insights for risk stratification and personalized therapy
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1559546
PMID:40115255
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和多组学方法研究食管鳞状细胞癌中糖酵解代谢的作用机制，并开发风险分层模型 | 首次在ESCC中整合单细胞转录组学和多组学数据识别糖酵解活性细胞亚型，并建立基于七基因的糖酵解相关风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索糖酵解在食管鳞状细胞癌进展中的作用机制，开发风险分层和个性化治疗策略 | 食管鳞状细胞癌患者组织和细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多组学分析, Western blotting | 非负矩阵分解(NMF), Cox回归 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库的食管鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 多组学 | NA | NA |
| 1535 | 2025-10-07 |
[Nafamostat Mesylate Alleviates Renal Ischemia-Reperfusion Injury in a Rat Model Through HMGB1 Modulation: An Omics Analysis -Based Study of the Protective Effect and the Mechanisms Involved]
2025-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250160506
PMID:40109453
|
研究论文 | 本研究通过组学分析探讨甲磺酸萘莫司他在大鼠肾脏缺血再灌注损伤模型中的保护作用及其机制 | 首次结合单细胞RNA测序和HMGB1调控机制研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用 | 样本量较小（每组7只大鼠），仅观察24小时时间点，机制研究仍需进一步验证 | 研究甲磺酸萘莫司他对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及分子机制 | 健康雄性Sprague-Dawley大鼠 | NA | 肾脏缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blotting, HE染色, TUNEL染色 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织病理学图像 | 21只SD大鼠（每组7只） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序 |
| 1536 | 2025-10-07 |
Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling
2025-Jan-09, Neurochemical research
IF:3.7Q2
DOI:10.1007/s11064-024-04326-2
PMID:39789409
|
研究论文 | 本研究通过荧光标记技术识别了新生小鼠脑室下区的星形胶质细胞前体细胞亚群，并证明谷氨酸信号调控其迁移过程 | 首次发现tdTomato标记的胶质前体细胞亚群，并证明谷氨酸信号通过离子型谷氨酸受体和谷氨酸转运体调控其向皮层的迁移 | 研究主要基于转基因小鼠模型，人类相关性需进一步验证；体外器官型切片培养可能无法完全模拟体内环境 | 探究星形胶质细胞前体细胞的发育起源和迁移调控机制 | 新生小鼠脑室下区的胶质前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光，器官型切片培养 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 新生小鼠（PND1-PND7）脑组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1537 | 2025-10-07 |
LKB1 inactivation promotes epigenetic remodeling-induced lineage plasticity and antiandrogen resistance in prostate cancer
2025-Jan, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01025-z
PMID:39743630
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LKB1失活在前列腺癌中促进表观遗传重塑诱导的谱系可塑性和抗雄激素耐药性的机制 | 首次发现LKB1失活通过引起全基因组DNA低甲基化驱动AR非依赖性谱系可塑性，并提出靶向DNA低甲基化的治疗策略 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，在人类患者中的临床验证仍需进一步研究 | 探索雄激素受体非依赖性谱系可塑性的分子机制并开发潜在治疗策略 | 人类和小鼠前列腺癌样本 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,全基因组亚硫酸氢盐测序 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 1538 | 2025-10-07 |
Identification and Evaluation of Lipocalin-2 in Sepsis-Associated Encephalopathy via Machine Learning Approaches
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S504390
PMID:40109658
|
研究论文 | 通过机器学习方法识别和评估脂质运载蛋白-2在脓毒症相关脑病中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法系统性地识别LCN2作为中性粒细胞诱导SAE的关键基因 | 研究主要基于动物模型，需要在人类患者中进行进一步验证 | 识别脓毒症相关脑病的关键基因并探索潜在靶向治疗 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型 | 机器学习 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 行为测试 | 四种二分类机器学习算法, AddModuleScore算法, CellCall算法 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质印迹数据, 行为学数据 | 脓毒症患者和脓毒症小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1539 | 2025-10-07 |
Integrated single-cell analysis reveals the regulatory network of disulfidptosis-related lncRNAs in bladder cancer: constructing a prognostic model and predicting treatment response
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1527036
PMID:40110199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析构建了膀胱癌中双硫死亡相关lncRNAs的调控网络和预后模型 | 首次将双硫死亡与lncRNAs结合构建膀胱癌预后模型，并揭示其与免疫状态和治疗反应的关系 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 探索双硫死亡相关lncRNAs作为膀胱癌预后生物标志物的潜力 | 膀胱癌患者 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, RNA测序, RT-qPCR, LASSO回归, Cox回归 | 预后模型, nomogram | 单细胞测序数据, RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1540 | 2025-10-07 |
Aspartate beta-hydroxylase is a prognostic factor in gallbladder cancer with the function of promoting tumorigenesis and chemoresistance
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1452345
PMID:40110547
|
研究论文 | 本研究探讨天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)在胆囊癌中的促癌作用及化疗耐药机制 | 首次通过孟德尔随机化方法确认ASPH是胆囊癌的致病基因，并发现其通过调控免疫检查点和上皮间质转化促进肿瘤进展 | 研究样本量有限(215例)，且主要基于回顾性分析 | 探索胆囊癌的新型生物标志物及其在肿瘤发生和化疗耐药中的作用机制 | 胆囊癌患者组织样本和单细胞测序数据 | 癌症生物学 | 胆囊癌 | RNA测序, 单细胞测序, 免疫组织化学, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 单细胞测序数据 | 215例胆囊癌患者 | NA | 单细胞测序, RNA测序 | NA | NA |