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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 1521 - 1540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1521 | 2025-10-07 |
Integration of unpaired single cell omics data by deep transfer graph convolutional network
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012625
PMID:39821189
|
研究论文 | 提出基于图卷积网络的深度迁移模型scTGCN，用于整合未配对的单细胞组学数据 | 开发了能够保持生物变异性的深度迁移图卷积网络，可在低内存消耗下快速整合数十万个细胞 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞组学数据中从scRNA-seq到scATAC-seq的标签迁移性能 | 单细胞RNA测序数据和单细胞染色质可及性数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞组学数据 | 数十万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多模态组学 | NA | APSA-seq, CITE-seq |
| 1522 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular reprogramming and changes of immune cell subsets following tetramethylpyrazine treatment in LPS-induced acute lung injury
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18772
PMID:39822976
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示川芎嗪在LPS诱导的急性肺损伤中对细胞重编程和免疫细胞亚群的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示川芎嗪通过调节免疫细胞亚群和转录因子FOSL1/JunB发挥肺保护作用的新机制 | 研究仅基于小鼠模型，未进行临床验证；细胞亚群功能验证不够充分 | 探究川芎嗪对急性肺损伤肺组织微环境的保护作用及分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，免疫组织化学，酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1523 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Genes as Cutting-Edge Signatures for Abdominal Aortic Aneurysm Diagnosis: Potential for Innovative Therapeutic Interventions
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70323
PMID:39823264
|
研究论文 | 本研究通过识别细胞衰老相关基因并验证其在腹主动脉瘤诊断中的潜力，揭示了细胞衰老在AAA进展中的关键作用 | 首次系统识别并验证ETS1和ITPR3作为腹主动脉瘤诊断生物标志物，结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术 | 样本量相对有限，需要更大规模临床验证 | 识别与腹主动脉瘤发展相关的细胞衰老基因并评估其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤患者样本和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, WB, IF, RT-qPCR, 机器学习算法 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本, 组织样本 | GSE57691训练集和两个独立验证数据集，人类血清样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1524 | 2025-10-07 |
BuDDI: Bulk Deconvolution with Domain Invariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012742
PMID:39823522
|
研究论文 | 提出一种名为BuDDI的批量数据反卷积方法，通过域适应技术整合批量数据和单细胞RNA测序数据，预测细胞类型特异性扰动效应 | 利用域适应技术学习独立的潜在空间，能够在不使用单细胞扰动数据的情况下预测细胞类型特异性扰动响应 | NA | 开发能够从批量数据预测细胞类型特异性扰动效应的方法 | 批量RNA测序数据和单细胞RNA测序参考数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1525 | 2025-10-07 |
Macrophage Infiltration and ITGB2 Expression in ESCC: A Novel Correlation
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70604
PMID:39825491
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据发现并验证了食管鳞癌中巨噬细胞浸润与ITGB2表达的正相关性 | 首次发现ITGB2在浸润巨噬细胞中的表达随其向促肿瘤表型极化而增加，并提出了ITGB2敲除M1巨噬细胞回输的新型免疫治疗策略 | NA | 探索食管鳞癌中与肿瘤免疫相关的关键分子和治疗策略 | 食管鳞癌组织样本和免疫细胞 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | 高通量测序、基因芯片、单细胞测序、生物信息学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1526 | 2025-10-07 |
Unveiling the mechanism of micro-and-nano plastic phytotoxicity on terrestrial plants: A comprehensive review of omics approaches
2025-Jan, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109257
PMID:39818003
|
综述 | 本文综述了组学方法在揭示微纳塑料对陆生植物毒性机制方面的应用 | 系统整合了多种前沿组学技术（包括4D组学、表型组学、空间转录组学和单细胞组学）在微纳塑料植物毒性研究中的应用 | NA | 阐明微纳塑料对陆生植物的毒性机制 | 陆生植物 | 环境毒理学 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学、微生物组学、4D组学、表型组学、空间转录组学、单细胞组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞组学 | NA | NA |
| 1527 | 2025-10-07 |
High cellular plasticity state of medulloblastoma local recurrence and distant dissemination
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101914
PMID:39809264
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示髓母细胞瘤复发和扩散过程中的细胞多样性和高可塑性状态 | 首次在髓母细胞瘤进展过程中发现高细胞可塑性亚群，并鉴定PTPRZ1作为潜在治疗靶点 | 研究样本数量有限，临床前模型需要进一步验证 | 解析髓母细胞瘤复发和扩散的细胞机制 | 髓母细胞瘤SHH和Group_3亚型患者样本 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,空间基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,单核ATAC测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1528 | 2025-10-07 |
De novo root regeneration from leaf explant: a mechanistic review of key factors behind cell fate transition
2025-Jan-14, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-025-04616-1
PMID:39808280
|
综述 | 本文系统综述了叶片外植体从头根再生过程中的细胞命运转换机制 | 提出了包含基因调控网络的更新版DNRR模型，揭示了特殊细胞、转换细胞与再生能力细胞在细胞命运转换中的协同作用 | 所提出的特殊细胞信号传导机制仍需进一步研究，且对根到根再生和茎到根再生的理解尚不完整 | 阐明植物叶片外植体从头根再生的分子机制和细胞框架 | 拟南芥叶片外植体 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1529 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptomics in blood of patients with chronic obstructive pulmonary disease
2025-Jan-14, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-024-03475-y
PMID:39810158
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析慢性阻塞性肺疾病患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 首次在慢性阻塞性肺疾病患者外周血中应用单细胞转录组技术分析单核细胞/巨噬细胞的基因表达差异 | 样本量较小（7名健康对照和8名患者），仅分析了外周血样本 | 探究慢性阻塞性肺疾病患者外周血单个核细胞的转录组特征 | 慢性阻塞性肺疾病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | 计算分析 | 单细胞转录组数据 | 7名健康对照和8名患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium Instrument和cDNA合成试剂盒 |
| 1530 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics unveils multifaceted immune heterogeneity in early-onset versus late-onset cervical cancer
2025-Jan-14, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03654-z
PMID:39810181
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学比较早发性与晚发性宫颈癌的免疫异质性 | 首次在单细胞水平揭示EOCC和LOCC的多维度免疫异质性，发现EOCC上皮细胞具有双重免疫表型 | 样本量较小（仅8个样本），需要更大规模研究验证 | 比较早发性与晚发性宫颈癌的免疫学特征差异 | 宫颈癌患者（4例早发性，4例晚发性） | 单细胞组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例宫颈癌样本（4例EOCC，4例LOCC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1531 | 2025-10-07 |
Metabolically activated and highly polyfunctional intratumoral VISTA+ regulatory B cells are associated with tumor recurrence in early-stage NSCLC
2025-Jan-14, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02209-2
PMID:39810191
|
研究论文 | 本研究通过多色流式细胞术、质谱流式细胞术和空间转录组学技术，揭示了非小细胞肺癌肿瘤微环境中VISTA+调节性B细胞的代谢特征及其通过VISTA-PSGL-1轴与T细胞相互作用促进肿瘤复发的机制 | 首次系统揭示了VISTA+调节性B细胞在NSCLC肿瘤微环境中的多功能性、高代谢活性及其通过VISTA-PSGL-1轴与T细胞相互作用的新机制 | 研究样本量未明确说明，机制验证主要依赖计算预测和相关性分析，缺乏直接的体内功能验证 | 探究非小细胞肺癌肿瘤微环境中B细胞表型特征、代谢谱及其与T细胞的相互作用 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 多色流式细胞术, 质谱流式细胞术, 空间转录组学, 液相色谱-串联质谱, NicheNet, PENCIL | NA | 流式细胞数据, 质谱数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1532 | 2025-10-07 |
SenPred: a single-cell RNA sequencing-based machine learning pipeline to classify deeply senescent dermal fibroblast cells for the detection of an in vivo senescent cell burden
2025-Jan-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-024-01418-0
PMID:39810225
|
研究论文 | 开发基于单细胞RNA测序的机器学习流程SenPred，用于分类深度衰老的真皮成纤维细胞以检测体内衰老细胞负荷 | 首个结合2D和3D培养的深度衰老成纤维细胞单细胞转录组数据构建的机器学习流程，能高精度预测体内衰老细胞负荷 | 模型仅适用于人类真皮成纤维细胞的衰老检测，不适用于肺成纤维细胞或全皮肤样本，且基于当前可用数据集的概念验证研究 | 开发准确分类衰老细胞的机器学习方法以检测体内衰老细胞负荷 | 真皮成纤维细胞，特别是深度衰老状态下的细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习流程 | 单细胞转录组数据 | 2D和3D培养的深度衰老成纤维细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1533 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of Ewing's sarcoma reveals that the MIF-CD74 axis is a target for immunotherapy
2025-Jan-13, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-024-02020-y
PMID:39800691
|
研究论文 | 通过整合分析尤文氏肉瘤发现MIF-CD74轴是免疫治疗的新靶点 | 首次通过单细胞RNA测序揭示尤文氏肉瘤中MIF-CD74轴的关键免疫调节作用，并证明其阻断可重塑肿瘤免疫微环境 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 探索尤文氏肉瘤的免疫治疗新靶点 | 尤文氏肉瘤肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞分析 | 骨癌 | 单细胞RNA测序, 细胞功能实验, 人源化模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1534 | 2025-10-07 |
Neutrophil adhesion to vessel walls impairs pulmonary circulation in COVID-19 pathology
2025-Jan-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55272-0
PMID:39805823
|
研究论文 | 本研究通过双光子成像技术揭示中性粒细胞黏附血管壁导致肺循环障碍是COVID-19重症化的关键机制 | 首次通过活体双光子成像直接观察SARS-CoV-2感染模型中中性粒细胞黏附行为与肺灌注损伤的因果关系 | 研究主要基于小鼠模型，需在人类患者中进一步验证 | 阐明COVID-19重症患者微血栓形成的详细分子机制 | SARS-CoV-2感染小鼠模型和COVID-19患者外周血单核细胞 | 病理生理学 | COVID-19 | 活体双光子成像, 单细胞RNA测序 | NA | 影像数据, 基因表达数据 | SARS-CoV-2感染小鼠模型和COVID-19患者外周血单核细胞scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1535 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing in diabetic retinopathy: progress and prospects
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-06066-x
PMID:39806376
|
综述 | 本文综述单细胞测序技术在糖尿病视网膜病变研究中的进展与应用前景 | 系统总结单细胞测序在解析糖尿病视网膜病变细胞异质性、构建视网膜细胞图谱及整合多组学数据方面的技术优势 | 作为综述文章未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行归纳分析 | 探讨单细胞测序技术在糖尿病视网膜病变研究中的应用价值与发展方向 | 视网膜组织、视网膜类器官、细胞外囊泡 | 数字病理 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 1536 | 2025-10-07 |
Integrin α8 is a useful cell surface marker of alveolar lipofibroblasts
2025-Jan-13, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03103-1
PMID:39806390
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研究论文 | 本研究鉴定整合素α8作为肺泡脂成纤维细胞的有效表面标志物 | 首次发现整合素α8可作为野生型小鼠肺中肺泡脂成纤维细胞的表面标志物，无需基因特异性报告小鼠系 | 肺成纤维细胞亚群之间的功能区分仍需进一步研究 | 鉴定肺脂成纤维细胞的合适表面标志物并研究其特性 | 小鼠肺成纤维细胞亚群 | 细胞生物学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序, LipidTOX染色, Oil Red O染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 新生、成年和老年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1537 | 2025-10-07 |
Amantadine modulates novel macrophage phenotypes to enhance neural repair following spinal cord injury
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05916-y
PMID:39806436
|
研究论文 | 本研究探讨金刚烷胺通过调节巨噬细胞表型促进脊髓损伤后神经修复的作用机制 | 首次发现金刚烷胺可调节巨噬细胞从炎症表型向修复表型分化，并通过HIF-1α和NF-κB通路促进神经再生 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索金刚烷胺在脊髓损伤后调节巨噬细胞表型促进神经修复的分子机制 | 小鼠脊髓损伤模型和巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,高维基因共表达网络分析,轨迹分析,免疫荧光染色,流式细胞术,蛋白质印迹,分子对接 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据,蛋白质数据 | 小鼠脊髓损伤模型（3天和7天时间点） | NA | 单细胞RNA测序,微阵列分析 | NA | NA |
| 1538 | 2025-10-07 |
The microenvironment cell index is a novel indicator for the prognosis and therapeutic regimen selection of cancers
2025-Jan-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05950-w
PMID:39806464
|
研究论文 | 本研究构建了基于微环境细胞浸润的预后预测模型MCI，并验证其在三阴性乳腺癌预后和治疗方案选择中的价值 | 首次提出微环境细胞指数(MCI)概念，结合六种微环境细胞构建预后模型，并通过单细胞测序、空间转录组学和多色免疫荧光验证 | 研究主要基于三阴性乳腺癌，在其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 建立基于微环境细胞浸润的预后预测模型并探索新的治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者和荷瘤小鼠 | 数字病理学 | 乳腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 多色免疫荧光染色 | LASSO-Cox回归分析 | RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1539 | 2025-10-07 |
Lipid nanoparticles deliver DNA-encoded biologics and induce potent protective immunity
2025-Jan-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02211-8
PMID:39806486
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研究论文 | 本研究评估了脂质纳米颗粒递送DNA编码生物制剂的效能及其诱导的保护性免疫反应 | 发现Moderna Spikevax mRNA疫苗中使用的LNP-M配方在DNA递送中表现出稳定的纳米结构、高表达效率和低毒性，并能诱导更强的免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果仍需验证 | 评估不同LNP配方递送DNA编码生物制剂的效能和免疫保护效果 | DNA编码的疫苗和癌症免疫治疗制剂 | 生物医学工程 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠模型 | Moderna | 脂质纳米颗粒递送技术 | LNP-M | Moderna Spikevax mRNA疫苗中使用的脂质纳米颗粒配方 |
| 1540 | 2025-10-07 |
TRIAGE: an R package for regulatory gene analysis
2025-Jan-12, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf004
PMID:39800877
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研究论文 | 开发了一个专门用于分析调控基因的R软件包TRIAGE | 利用联盟级别的H3K27me3数据富集细胞类型特异性调控区域，专门设计用于批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据的调控元件分析 | NA | 解决标准RNA-seq分析工作流程在揭示细胞身份和功能调控基础方面的局限性 | 调控基因和调控元件 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 三个独立的转录组数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |