单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 1441 - 1460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1441 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomic insights into glioma cellular heterogeneity and metabolic adaptations
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561388
PMID:40255400
|
综述 | 整合单细胞和空间转录组技术解析胶质母细胞瘤的细胞异质性与代谢重编程 | 首次系统整合单细胞RNA测序与空间转录组技术揭示胶质瘤细胞亚群的空间分布特征及其代谢适应性 | 存在代谢冗余和时空动态变化等未解决挑战 | 解码胶质母细胞瘤代谢景观并探索新型治疗策略 | 胶质母细胞瘤细胞亚群（恶性增殖细胞、干细胞样细胞、间充质样细胞、免疫相关细胞） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1442 | 2025-10-07 |
Longitudinal Changes in Peripheral and Alveolar Monocyte and Inflammatory Biomarkers are Distinct in Hypercapnia Patients Following Pulmonary Sepsis-Induced ARDS
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S508311
PMID:40255660
|
研究论文 | 比较肺炎败血症诱发的ARDS患者中高碳酸血症与非高碳酸血症患者的单核细胞和炎症生物标志物的纵向变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示高碳酸血症患者单核细胞表型和细胞因子风暴基因的独特变化模式 | 样本量相对较小（61例患者），研究时间较短（仅7天随访） | 探究高碳酸血症在肺炎败血症诱发ARDS中的免疫学机制 | 肺炎败血症诱发的ARDS患者，包括高碳酸血症和非高碳酸血症两组 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，临床数据 | 61例重症肺炎患者（11例非败血症对照，50例ARDS患者，其中26例高碳酸血症） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1443 | 2025-10-07 |
Integrated multi-omics analysis reveals the functional and prognostic significance of lactylation-related gene PRDX1 in breast cancer
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1580622
PMID:40256656
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示乳酸化相关基因PRDX1在乳腺癌中的功能和预后意义 | 首次系统研究乳酸化相关基因在乳腺癌中的作用，发现PRDX1是关键基因，并构建了基于PRDX1阳性单核细胞的预后预测模型 | 需要进一步整合其他生物标志物以提高个性化医疗的精确度 | 研究乳酸化相关基因在乳腺癌中的调控机制和预后意义 | 乳腺癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 多组学分析，包括GWAS、单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序 | Cox回归，LASSO回归 | 基因组数据，转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个乳腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1444 | 2025-10-07 |
Immune Landscape Variation in Antineutrophil Cytoplasmic Antibody-Associated Vasculitis Circulation Before and After Plasmapheresis by Single-Cell Transcriptome
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5531382
PMID:40256686
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨血浆置换前后ANCA相关性血管炎患者外周血免疫细胞的变化 | 开发了新的单核细胞分类方法，并发现特定单核细胞亚群与AAV疾病活动性的相关性 | 样本量有限，机制研究仍需深入验证 | 阐明血浆置换治疗ANCA相关性血管炎的免疫机制 | ANCA相关性血管炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | ANCA相关性血管炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | AAV患者治疗前后配对样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1445 | 2025-10-07 |
Comprehensive evaluation of methods for identifying tissues or cell types of origin of the plasma cell-free transcriptome
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19241
PMID:40256737
|
研究论文 | 系统评估七种解卷积方法在识别血浆游离RNA组织或细胞来源方面的性能 | 首次综合比较多种解卷积方法在cfRNA溯源分析中的表现，并采用单细胞RNA测序数据作为参考进行深入评估 | 未明确说明样本规模和具体疾病类型，评估方法可能受限于现有数据集的完整性 | 评估不同解卷积方法在识别血浆游离RNA组织细胞来源方面的准确性和稳健性 | 血浆游离RNA及其组织细胞来源 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 解卷积算法 | 七种不同的解卷积方法 | RNA测序数据, 模拟cfRNA数据, 真实血浆cfRNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1446 | 2025-10-07 |
Integrative machine learning approach for identification of new molecular scaffold and prediction of inhibition responses in cancer cells using multi-omics data
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf006
PMID:40251828
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，识别新的分子支架并预测癌细胞中的抑制反应 | 结合机器学习与多组学数据预测药物反应，并采用相似性搜索方法从ChEMBL数据库识别潜在先导化合物 | 研究为计算机模拟分析，尚未进行实验验证 | 开发预测癌症细胞药物抑制反应的方法并识别新的治疗分子 | 癌细胞系和MDM2抑制剂 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1447 | 2025-10-07 |
Understanding developing kidneys and Wilms tumors one cell at a time
2025, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2024.11.005
PMID:40254343
|
综述 | 本文总结了单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的应用现状与技术选择 | 系统比较不同单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的适用性，并提出技术组合策略 | NA | 评估单细胞测序技术在肾脏发育和Wilms肿瘤研究中的最佳应用方案 | 肾脏发育过程与Wilms肿瘤 | 生物医学 | Wilms肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1448 | 2025-10-07 |
Cancer-associated fibroblasts: multidimensional players in liver cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1454546
PMID:40248197
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞在肝癌微环境中的多维作用及其亚群功能 | 利用单细胞RNA测序技术结合基因工程小鼠模型，首次在肝癌前微环境和肝内胆管癌微环境中鉴定出多种CAF亚群 | NA | 阐明不同CAF亚群在肝癌发展中的具体作用和调控机制 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚群 | 肿瘤微环境研究 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1449 | 2025-10-07 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identifies Circadian Rhythm Disruption-Related Genes Associated with Prognosis and Drug Resistance in Colorectal Cancer Patients
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S499806
PMID:40241740
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，鉴定与结直肠癌预后和耐药相关的昼夜节律紊乱基因 | 首次系统揭示昼夜节律相关基因在结直肠癌中的表达特征及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 | NA | 探索昼夜节律相关基因在结直肠癌中的作用机制及其临床意义 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, WGCNA, GSEA | 预后模型 | 基因表达数据 | GSE178318数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1450 | 2025-10-07 |
An Integrative Analysis of Transcriptome Combined with Machine Learning and Single-Cell RNA-Seq for the Common Biomarkers in Crohn's Disease and Kidney Stone Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S502513
PMID:40242727
|
研究论文 | 通过整合转录组分析结合机器学习和单细胞RNA测序技术，鉴定克罗恩病和肾结石病的共同生物标志物 | 首次整合机器学习算法和单细胞RNA测序技术识别克罗恩病与肾结石病的共同生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，样本量有限，需要进一步实验验证 | 识别能够预测克罗恩病合并肾结石病的生物标志物 | 克罗恩病和肾结石病患者数据及人肠道细胞和近端肾小管上皮细胞模型 | 生物信息学 | 克罗恩病,肾结石病 | 转录组分析,机器学习,单细胞RNA测序 | Limma,WGCNA,机器学习算法 | 基因表达数据 | 三个克罗恩病数据集和一个肾结石病数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1451 | 2025-10-07 |
Cross one single body 49 tissues single-cell transcriptome reveals detailed macrophage heterogeneity during pig pregnancy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574120
PMID:40242774
|
研究论文 | 通过单头健康怀孕猪49个组织的单细胞转录组测序，揭示妊娠期间巨噬细胞的详细异质性 | 首次在单一个体水平构建了涵盖49个组织的巨噬细胞单细胞转录组图谱，揭示了妊娠期巨噬细胞的跨组织异质性和物种间保守性 | 研究仅基于单一个体，样本量有限，需要在更多个体中验证结果 | 研究妊娠期间巨噬细胞的转录组异质性和组织特异性适应机制 | 健康怀孕猪的巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关生理变化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 单头怀孕猪的49个组织，共114,881个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1452 | 2025-04-19 |
Editorial: Spatial transcriptome and single-cell sequencing for exploring molecular mechanisms of neuroimmunity and discovering novel markers of neurological diseases
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1582019
PMID:40248015
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1453 | 2025-10-07 |
Interferon-γ Signaling in Eosinophilic Esophagitis Affects Epithelial Barrier Function and Programmed Cell Death
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101466
PMID:39884574
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究干扰素-γ信号在嗜酸性食管炎中对上皮屏障功能和程序性细胞死亡的影响 | 首次在单细胞水平揭示嗜酸性食管炎中上皮细胞是干扰素反应特征基因表达最高的细胞类型，并发现IFN-γ对上皮屏障功能和细胞凋亡的显著影响 | 研究样本量有限，器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究嗜酸性食管炎中干扰素信号对食管上皮细胞功能的影响机制 | 嗜酸性食管炎患者的上皮细胞和器官模型 | 单细胞基因组学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 器官培养 | 器官模型 | 基因表达数据 | 嗜酸性食管炎患者活检组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1454 | 2025-10-07 |
Cellular Crosstalk Promotes Hepatic Progenitor Cell Proliferation and Stellate Cell Activation in 3D Co-culture
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101472
PMID:39892785
|
研究论文 | 开发3D共培养系统研究肝祖细胞与星状细胞间的相互作用及其在肝损伤中的作用 | 建立首个能实时观察肝祖细胞增殖与星状细胞激活的3D共培养模型，并发现两种细胞需直接接触才能相互影响 | 研究主要基于小鼠细胞，人类样本验证有限；3D培养系统可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究肝损伤过程中肝祖细胞与星状细胞间的功能相互作用机制 | 小鼠肝星状细胞和肝祖细胞（未分化肝内胆管细胞类器官） | 细胞生物学 | 肝纤维化 | 3D共培养、荧光标记、细胞分选、基因表达分析、空间转录组学 | 3D器官共培养系统 | 基因表达数据、形态学观察数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1455 | 2025-10-07 |
Exploring the impact of cuproptosis on prostate cancer prognosis via RNA methylation regulation based on single cell and bulk RNA sequencing data
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1573611
PMID:40235543
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序数据探索铜死亡和RNA甲基化调控对前列腺癌预后的影响 | 首次将铜死亡与RNA甲基化调控因子结合构建前列腺癌预后模型，并通过单细胞测序揭示免疫特征 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 探索铜死亡和RNA甲基化调控在前列腺癌预后中的作用机制 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR,免疫组化 | LASSO Cox回归模型 | 基因组数据,临床数据,单细胞测序数据 | TCGA前列腺癌数据集及外部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1456 | 2025-10-07 |
Unveiling purine metabolism dysregulation orchestrated immunosuppression in advanced pancreatic cancer and concentrating on the central role of NT5E
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569088
PMID:40236698
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示胰腺癌中嘌呤代谢失调如何促进免疫抑制微环境形成，并确定NT5E在此过程中的核心作用 | 首次在胰腺癌微环境中系统分析嘌呤代谢异质性，发现NT5E是逆转免疫抑制的关键靶点 | 研究样本量有限，需要进一步临床验证 | 探究胰腺癌嘌呤代谢重编程与免疫抑制微环境的关系 | 胰腺癌患者肿瘤微环境中的各类细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞共培养 | AUCell, Ucell, Cellchat | 转录组数据, 空间数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1457 | 2025-10-07 |
PM2.5 exposure reprograms cell cycle dynamics in uterine immune cells at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561290
PMID:40236703
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PM2.5暴露对小鼠子宫免疫细胞周期动态的重编程作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示PM2.5暴露对子宫免疫细胞周期动态的细胞类型特异性影响 | 研究仅基于小鼠模型，样本量为9,000个细胞，需要进一步验证 | 探究PM2.5暴露对生殖系统免疫细胞周期调控的细胞机制 | 小鼠子宫免疫细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9,000个平衡细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1458 | 2025-10-07 |
Multidimensional transcriptomics based to illuminate the mechanisms of taurine metabolism in immune resistance of pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567805
PMID:40230840
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了牛磺酸代谢在胰腺癌免疫抵抗中的作用机制 | 首次识别了四种不同的肿瘤细胞亚群，建立了'牛磺酸-免疫互作'标准，发现了LY6D作为潜在治疗靶点 | NA | 探索牛磺酸代谢紊乱与胰腺癌免疫治疗之间的潜在治疗关系 | 胰腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | Seurat, DoubletFinder, Harmony, GSVA, CellChat | 单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1459 | 2025-10-07 |
CD121b-positive neutrophils predict immunosuppression in septic shock
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1565797
PMID:40230851
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脓毒症休克患者外周血中存在CD121b阳性中性粒细胞亚群，并证实其与免疫抑制状态相关 | 首次在脓毒症休克患者中鉴定出具有免疫抑制特性的CD10-CD121b+中性粒细胞亚群，并发现其与疾病严重程度正相关 | 样本量有限，需要更大规模研究验证CD121b作为生物标志物的可靠性 | 探讨中性粒细胞在脓毒症休克免疫抑制中的具体作用机制 | 健康供者和脓毒症休克患者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症休克 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 人源化小鼠模型 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 健康供者和脓毒症休克患者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1460 | 2025-10-07 |
Discovering biomarkers associated with infiltration of CD8+ T cells and tumor-associated fibrosis in colon adenocarcinoma using single-cell RNA sequencing and gene co-expression network
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1496640
PMID:40230854
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因共表达网络分析，发现与结肠腺癌中CD8+ T细胞浸润和肿瘤相关纤维化相关的生物标志物 | 首次结合单细胞转录组分析、WGCNA和蛋白质相互作用网络，鉴定出LARS2、SEZ6L2和SOX7三个与CD8+ T细胞相关的关键基因 | 研究数据来源于公共数据库GEO，需要进一步实验验证 | 鉴定与结肠腺癌预后相关的生物标志物，阐明CD8+ T细胞和肿瘤相关纤维化的作用机制 | 结肠腺癌样本和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 实时PCR, 免疫组化, 蛋白质印迹 | LASSO回归, Cox回归, WGCNA | 基因表达数据 | GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |