单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1950 篇文献,本页显示第 1421 - 1440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1421 2025-10-07
The Single-Cell Landscape of Peripheral and Tumor-infiltrating Immune Cells in HPV- HNSCC
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了HPV阴性头颈鳞癌中外周和肿瘤浸润免疫细胞的动态变化 首次在HPV阴性头颈鳞癌中整合多个单细胞数据集,系统描绘了免疫细胞在肿瘤进展和淋巴结转移过程中的动态变化 样本量相对有限(29个样本),需要更大规模研究验证发现 探索HPV阴性头颈鳞癌的复杂免疫景观以识别潜在治疗靶点 头颈鳞癌患者的外周血单核细胞和肿瘤浸润免疫细胞 单细胞组学 头颈鳞癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光检测 NA 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 29个样本,近300,000个免疫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1422 2025-10-07
Single-cell sequencing reveals the features of adaptive immune responses in the liver of a mouse model of dengue fever
2025-Jan, Animal models and experimental medicine IF:3.8Q2
研究论文 通过单细胞测序技术研究登革热小鼠模型中肝脏适应性免疫反应特征 首次在登革热小鼠模型中应用单细胞测序技术分析肝脏T细胞免疫反应特征及巨噬细胞与T细胞的免疫相互作用 研究仅限于小鼠模型,未在人类患者中验证 探究登革热严重肝损伤中适应性免疫反应的特征和机制 轻度或重度登革热小鼠模型的肝组织 单细胞生物学 登革热 单细胞测序,流式细胞术 NA 单细胞基因表达数据 登革热小鼠模型肝组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1423 2025-10-07
Critical role of Slc22a8 in maintaining blood-brain barrier integrity after experimental cerebral ischemia-reperfusion
2025-Jan, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过多组学分析发现Slc22a8在维持脑缺血再灌注后血脑屏障完整性中的关键作用 首次通过整合多组学数据鉴定出Slc22a8作为血脑屏障完整性的关键调控因子,并验证其通过Wnt/β-catenin信号通路发挥作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 探究脑缺血再灌注过程中血脑屏障破坏的调控机制 小鼠脑缺血再灌注模型中的内皮细胞和周细胞 生物医学 缺血性脑卒中 多组学分析,转录组测序,单细胞RNA测序 小鼠大脑中动脉闭塞/再灌注模型 转录组数据,单细胞RNA测序数据 三个转录组测序数据集,E13.5小鼠血脑屏障和非血脑屏障内皮细胞 NA 单细胞RNA-seq,转录组测序 NA NA
1424 2025-10-07
Prediction of tumor-reactive T cell receptors from scRNA-seq data for personalized T cell therapy
2025-Jan, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 开发了一种基于单细胞RNA测序数据的机器学习方法,用于预测肿瘤反应性T细胞受体,以加速个性化T细胞疗法 首次结合高通量TCR克隆和反应性验证训练机器学习分类器,以抗原无关的方式识别肿瘤反应性TILs 未明确说明样本来源的癌症类型多样性及模型验证的广泛性 开发快速识别肿瘤反应性TCR的方法以加速个性化T细胞疗法 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)及其T细胞受体(TCRs) 机器学习 癌症 单细胞RNA测序,高通量TCR克隆,机器学习 机器学习分类器 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1425 2025-10-07
Glucose deprivation and identification of TXNIP as an immunometabolic modulator of T cell activation in cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨葡萄糖缺乏条件下TXNIP作为T细胞活化免疫代谢调节剂的作用机制 首次将TXNIP鉴定为连接免疫代谢与T细胞活化的关键调节因子,并证明其缺失可增强抗肿瘤免疫反应 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 探索葡萄糖限制条件下T细胞免疫反应的调节机制 人类T细胞和肿瘤浸润T细胞 免疫代谢 癌症 混合淋巴细胞反应、多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质分泌数据、细胞功能数据 癌症患者的肿瘤浸润T细胞和原代人类T细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1426 2025-10-07
Combination of anlotinib with immunotherapy enhanced both anti-angiogenesis and immune response in high-grade serous ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨安罗替尼联合免疫疗法在高级别浆液性卵巢癌中的抗血管生成和免疫调节作用 首次在高级别浆液性卵巢癌中系统评估安罗替尼联合免疫治疗的协同作用机制,通过单细胞RNA测序揭示肿瘤微环境变化 样本量较小(36例患者),为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 评估安罗替尼联合免疫疗法对高级别浆液性卵巢癌的治疗效果和作用机制 高级别浆液性卵巢癌患者和PBMC-PDX模型 肿瘤免疫学 卵巢癌 单细胞RNA测序,患者来源异种移植模型 PBMC-PDX模型 临床数据,单细胞转录组数据 36例高级别浆液性卵巢癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1427 2025-10-07
Type I IFN receptor blockade alleviates liver fibrosis through macrophage-derived STAT3 signaling
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过阻断I型干扰素受体揭示其通过调节巨噬细胞STAT3信号通路缓解肝纤维化的机制 首次证明IFNAR-1阻断通过改变巨噬细胞P-STAT3/P-STAT1比例促进M2型分化,从而缓解肝纤维化 研究仅使用CCl4诱导的小鼠模型,未验证其他肝纤维化模型 探究I型干扰素信号在肝纤维化中的作用机制 CCl4处理的肝纤维化小鼠模型 NA 肝纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
1428 2025-10-07
Cancer-associated fibroblasts gene signature: a novel approach to survival prediction and immunotherapy guidance in colon cancer
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析开发了结肠癌相关成纤维细胞基因特征,用于生存预测和免疫治疗指导 首次基于单细胞测序数据构建结肠癌相关成纤维细胞基因特征,并验证其在预后预测和治疗指导中的应用价值 需要外部队列验证基因特征的普适性,且细胞实验仅限于HCT116和HT29两种细胞系 开发结肠癌相关成纤维细胞基因特征用于生存预测和免疫治疗指导 结肠腺癌患者和HCT116、HT29结肠癌细胞系 生物信息学 结肠癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞实验 基因特征模型, 列线图 基因表达数据 结肠癌患者队列和两种结肠癌细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1429 2025-10-07
Expression of innate immunity genes in human hematopoietic stem/progenitor cells - single cell RNA-seq analysis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类造血干细胞/祖细胞中先天免疫基因的表达 首次在单细胞分辨率下研究造血干细胞/祖细胞中complosome系统的表达 仅分析了两种HSPC群体(CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+) 探究人类造血干细胞/祖细胞中complosome系统和其他免疫相关蛋白的基因表达 人类造血干细胞/祖细胞(HSPCs) 单细胞测序分析 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 两种HSPC群体:CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+ NA 单细胞RNA-seq NA NA
1430 2025-10-07
Stimulation of regulatory dendritic cells suppresses cytotoxic T cell function and alleviates DEN-induced liver injury, fibrosis and hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了通过TLR2激活的乳酸菌混合物刺激调节性树突状细胞,从而抑制细胞毒性T细胞功能并缓解DEN诱导的肝损伤、纤维化和肝细胞癌 首次证明TLR2激活的乳酸菌可通过诱导调节性树突状细胞积累,重塑肝脏免疫微环境,抑制细胞毒性T细胞功能 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;机制研究主要依赖TLR2敲除模型 探索调节性树突状细胞在肝脏免疫调节和肝癌发生中的作用机制 野生型和TLR2敲除小鼠的肝组织及免疫细胞 免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学分析,基因表达分析 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据,流式细胞数据,组织学图像 野生型和TLR2敲除小鼠肝组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1431 2025-10-07
Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析鉴定出抗性MDSCs和应激耐受基因共表达网络作为多种疾病环境中MDSCs的共同特征 首次发现炎症信号与细胞应激共同诱导产生具有保留MDSC特征的抗性MDSCs,并鉴定出特异性应激耐受基因模块 研究主要基于体外诱导模型,需要更多体内验证 鉴定不同组织来源MDSCs的共同分子特征 髓源性抑制细胞(MDSCs) 单细胞转录组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 GM-CSF+ IL-6诱导的人MDSCs,血清饥饿处理的PBMCs,以及已发表的批量与单细胞转录组数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1432 2025-10-07
Mapping immunotherapy potential: spatial transcriptomics in the unraveling of tumor-immune microenvironments in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 探讨空间转录组学技术在解析头颈部鳞状细胞癌肿瘤-免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的指导意义 整合空间与分子信息揭示肿瘤-免疫微环境的复杂空间结构,为个性化免疫治疗提供新视角 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 提升头颈部鳞状细胞癌免疫检查点抑制剂治疗效果 头颈部鳞状细胞癌的肿瘤-免疫微环境 空间转录组学 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1433 2025-10-07
A Novel Prognostic Signature Integrating Immune and Glycolytic Pathways for Enhanced Prognosis and Immunotherapy Prediction in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2
研究论文 本研究建立了一个整合免疫和糖酵解相关基因的预后特征模型,用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 首次构建了整合免疫和糖酵解通路的预后特征模型,并在单细胞水平验证了其与肿瘤免疫微环境的关联 NA 开发肝细胞癌预后预测模型并评估其在免疫治疗中的应用价值 肝细胞癌患者 生物信息学 肝细胞癌 RNA测序,单细胞测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线分析 多变量Cox回归模型,预后列线图 基因表达数据,临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 NA RNA-seq,单细胞测序 NA NA
1434 2025-10-07
Inflammatory Cell Interactions in the Rotator Cuff Microenvironment: Insights From Single-Cell Sequencing
2025, International journal of genomics IF:2.6Q2
综述 通过单细胞RNA测序技术揭示肩袖损伤微环境中免疫细胞与非免疫细胞的相互作用机制 首次系统整合单细胞测序技术解析肩袖损伤微环境中的细胞互作网络,发现慢性炎症的分子特征 NA 探讨肩袖损伤微环境中细胞相互作用对炎症和组织修复的影响 肩袖损伤微环境中的巨噬细胞、T细胞、成纤维细胞和肌成纤维细胞 数字病理学 运动系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1435 2025-10-07
Evolutionary convergence of sensory circuits in the pallium of amniotes
2025-01-02, Science (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过比较鸟类、蜥蜴和哺乳动物的端脑感觉回路发育与演化,揭示了羊膜动物高阶感觉处理的趋同进化现象 首次结合细胞生成时间分析、单细胞RNA与空间转录组学及数学模型,系统比较不同羊膜动物端脑感觉回路的发育演化关系 仅研究了三种代表性物种(鸡、壁虎、小鼠),可能无法完全代表所有羊膜动物的多样性 探究羊膜动物端脑中结构和功能等效的感觉回路的进化关系 鸟类(鸡)、蜥蜴(壁虎)和哺乳动物(小鼠)的端脑感觉回路 神经科学 NA 细胞生成时间分析,单细胞RNA测序,空间转录组学,数学建模 NA 基因表达数据,空间转录组数据,发育时间数据 三种物种(鸡、壁虎、小鼠)的端脑组织样本 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
1436 2025-10-07
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的实验方案 开发了角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液分离方案,并应用于自噬缺陷模型研究 NA 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的贡献 小鼠角膜缘上皮干细胞 单细胞测序 眼科疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1437 2025-10-07
Identification and Characterization of Prognostic Macrophage Subpopulations for Human Esophageal Carcinoma
2025, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析食管癌组织中巨噬细胞的异质性、分化轨迹和细胞间通讯,并鉴定出一个与预后相关的巨噬细胞亚型 首次在单细胞水平系统分析食管癌中巨噬细胞的多样性,鉴定出HSPA6+巨噬细胞这一预后相关亚型,并揭示其与肥大细胞和单核细胞的通讯增强 研究基于公共数据库的scRNA-seq数据,样本量有限,需要进一步实验验证 分析食管癌中巨噬细胞的多样性、分化轨迹和细胞间通讯及其预后意义 食管癌组织和癌旁组织中的巨噬细胞 数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序 Seurat, Monocle2, Cell Chat 单细胞RNA测序数据 GSE154763数据集中的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1438 2025-10-07
Comprehensive multiomics analysis identifies PYCARD as a key pyroptosis-related gene in osteoarthritis synovial macrophages
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析确定了PYCARD是骨关节炎滑膜巨噬细胞中关键的焦亡相关基因 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,系统识别了骨关节炎中巨噬细胞焦亡的核心基因PYCARD 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证PYCARD在骨关节炎发病机制中的具体作用 探索焦亡在骨关节炎发病机制中的作用,并识别关键治疗靶点 骨关节炎患者的滑膜组织和滑膜巨噬细胞 生物信息学 骨关节炎 RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 蛋白互作网络分析, 富集分析 LASSO-Cox回归模型 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
1439 2025-10-07
Two chemotherapeutic agents expand stem-like CD62L+CD8+ T cells in antitumor immune responses
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示两种化疗药物地西他滨和5-氟尿嘧啶能够通过扩增干细胞样CD8+T细胞增强抗肿瘤免疫反应 首次阐明化疗药物通过促进干细胞样CD8+T细胞分化扩增来增强抗肿瘤免疫的新机制,并发现转录因子Eomes在此过程中的特异性调控作用 研究主要基于小鼠肿瘤模型,人类临床相关性需进一步验证;Eomes敲除仅部分影响地西他滨的作用机制 探究化疗药物对干细胞样CD8+T细胞亚群在抗肿瘤免疫应答中的调控作用 结直肠癌患者样本、野生型和Eomes条件性敲除小鼠的CT26和B16肿瘤模型 免疫学 结直肠癌 单细胞测序、流式细胞术 NA 单细胞测序数据、流式细胞数据 人类结直肠肿瘤样本、小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1440 2025-10-07
Repertoire-based mapping and time-tracking of T helper cell subsets in scRNA-Seq
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究开发了一种利用免疫受体库数据将表型分选的T辅助细胞亚群映射到单细胞RNA测序谱的方法 开发了TCR-Track方法,利用免疫受体库数据精确映射T辅助细胞亚群,优于基于CITE-Seq的映射方法 研究样本数量有限,仅包含122名供体 解析单细胞RNA测序聚类与传统表征的T辅助细胞亚群之间的关系 CD4+ T辅助细胞亚群 单细胞生物学 COVID-19 单细胞RNA测序,CITE-Seq,免疫受体库分析 NA 单细胞RNA测序数据,免疫受体库数据 122名供体 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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