单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-10-07 |
A comprehensive human embryo reference tool using single-cell RNA-sequencing data
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02493-2
PMID:39543283
|
研究论文 | 开发了一个基于单细胞RNA测序数据的综合人类胚胎参考工具，用于评估人类胚胎模型 | 整合了六个已发表的人类胚胎数据集，构建了首个从受精卵到原肠胚发育阶段的通用参考工具 | 依赖于已发表数据集，可能受原始数据质量和注释准确性的限制 | 建立人类胚胎发育的标准化参考工具，用于胚胎模型的验证和评估 | 人类胚胎发育过程（从受精卵到原肠胚阶段） | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) | 单细胞转录组数据 | 整合六个已发表人类数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1402 | 2025-10-07 |
Identification of novel metabolism-related biomarkers of Kawasaki disease by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1541939
PMID:40276515
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别川崎病的新型代谢相关生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析川崎病中胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关特征基因，并利用机器学习算法鉴定出VIM、CLIC1和ITGB2作为新型诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证这些基因在川崎病发病机制中的具体功能 | 识别川崎病中与胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关的特征细胞和基因，探索其在疾病发病机制中的作用 | 川崎病患者免疫细胞（单核细胞和自然杀伤细胞） | 生物信息学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 实时定量PCR, ROC曲线分析 | hdWGCNA, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 公共数据集GSE1687323和GSE68004，验证数据集GSE73461 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1403 | 2025-10-07 |
Pan-cancer analysis identified CD248 as a potential target for multiple tumor types
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1554632
PMID:40276611
|
研究论文 | 通过泛癌分析鉴定CD248作为多种肿瘤类型的潜在治疗靶点 | 首次通过多数据库整合分析和实验验证，系统性地揭示了CD248在泛癌中的表达特征、预后价值及功能机制 | 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 | 探索CD248在多种肿瘤类型中的表达模式、临床意义和生物学功能 | 多种肿瘤类型（重点关注头颈鳞状细胞癌）及相应细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析 | qRT-PCR, Western blot, transwell assay, scratch wound healing assay, EdU assay, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床预后数据, 单细胞测序数据 | 多种肿瘤数据库数据及HNSC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1404 | 2025-10-07 |
p53 mutation biases squamocolumnar junction progenitor cells towards dysplasia rather than metaplasia in Barrett's oesophagus
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332095
PMID:39353725
|
研究论文 | 本研究探讨p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展过程中对贲门祖细胞命运和功能的影响 | 首次揭示p53突变通过Notch信号通路激活抑制干细胞分化，直接导致发育异常而非通过化生阶段 | 研究基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明p53突变在Barrett食管癌变过程中的作用机制 | 贲门祖细胞(Cck2r+ cardia progenitor cells) | 分子病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,类器官培养,原位移植 | L2-IL1β小鼠模型 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1405 | 2025-10-07 |
Development of the TP53 mutation associated hypopharyngeal squamous cell carcinoma prognostic model through bulk multi-omics sequencing and single-cell sequencing
2025 Jan-Feb, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2024.101499
PMID:39341197
|
研究论文 | 本研究基于TP53突变构建了下咽鳞状细胞癌预后模型，并通过单细胞测序验证了模型相关基因的表达特征 | 首次结合bulk多组学测序和单细胞测序技术，构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后风险评分模型 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏独立的前瞻性验证队列 | 构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后预测模型 | 下咽鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 下咽鳞状细胞癌 | bulk多组学测序, 单细胞测序, GSEA, Cox分析, LASSO分析 | 预后风险评分模型 | 基因组突变数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和6个GEO数据集的下咽鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1406 | 2025-10-07 |
Single-cell Profiling of Intrahepatic Immune Cells Reveals an Expansion of Tissue-resident Cytotoxic CD4+ T Lymphocyte Subset Associated With Pathogenesis of Alcoholic-associated Liver Diseases
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101411
PMID:39349248
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示酒精相关肝病中组织驻留细胞毒性CD4+ T淋巴细胞亚群的扩增及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在酒精相关肝病中发现以GZMK表达为特征的细胞毒性CD4+ T淋巴细胞亚群显著扩增，并揭示其组织驻留特性和终末效应状态 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证发现 | 探索酒精相关肝病中肝脏免疫细胞的转录组特征和免疫病理机制 | 健康个体、代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者和酒精相关肝病患者的肝脏样本 | 单细胞生物学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体、MASLD和ALD患者的肝脏样本，包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1407 | 2025-10-07 |
The Human Milk-derived Peptide Drives Rapid Regulation of Macrophage Inflammation Responses in the Neonatal Intestine
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101420
PMID:39414025
|
研究论文 | 本研究鉴定了人乳细胞外囊泡中的一种新型肽CASB135-150，发现其通过靶向肠道巨噬细胞快速调节炎症反应并保护新生儿肠道健康 | 首次在人乳细胞外囊泡中鉴定出β-酪蛋白衍生肽CASB135-150，并阐明其通过破坏FHL2/TRAF6复合物抑制NF-κB信号通路的分子机制 | 研究主要基于大鼠坏死性小肠结肠炎模型，尚未在人类临床研究中验证 | 探索人乳肽在调节新生儿先天免疫稳态和肠道健康中的作用 | 人乳细胞外囊泡肽、大鼠坏死性小肠结肠炎模型、骨髓源性巨噬细胞、肠道巨噬细胞 | 免疫学 | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析,蛋白质相互作用分析,免疫共沉淀,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,组织图像数据 | 大鼠坏死性小肠结肠炎模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 1408 | 2025-10-07 |
Impact of potential biomarkers, SNRPE, COX7C, and RPS27, on idiopathic Parkinson's disease
2025-Jan, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01591-x
PMID:39467967
|
研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定特发性帕金森病的潜在生物标志物SNRPE、COX7C和RPS27 | 首次通过整合全血基因表达、DNA甲基化、microRNA和单细胞RNA测序数据系统筛选帕金森病生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证 | 识别特发性帕金森病的关键基因和分子机制 | 特发性帕金森病患者 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因表达分析,DNA甲基化分析,microRNA分析,单细胞RNA测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据,甲基化数据,microRNA数据,单细胞RNA测序数据 | 特发性帕金森病患者全血样本 | NA | 单细胞RNA测序,全血基因表达分析 | NA | NA |
| 1409 | 2025-10-07 |
Machine learning identification of NK cell immune characteristics in hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and bulk RNA sequencing
2025-Jan, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01581-z
PMID:39433650
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和bulk RNA测序结合机器学习方法，鉴定肝细胞癌中NK细胞的免疫特征标志物CD7 | 首次结合单细胞测序和bulk RNA测序，利用机器学习方法系统鉴定肝细胞癌中NK细胞的免疫特征标志物CD7 | 样本量较小（8例正常肝组织和8例HCC肿瘤组织），需要更大样本验证 | 鉴定肝细胞癌中具有NK细胞免疫特征的分子标志物 | 肝细胞癌组织中的NK细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，RT-qPCR，MTS，流式细胞术 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据 | 8例正常肝组织和8例HCC肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1410 | 2025-10-07 |
Therapeutic targets for hepatocellular carcinoma identified using proteomics and Mendelian randomization
2025-Jan, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16785
PMID:39477889
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和孟德尔随机化方法识别肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 首次整合血浆蛋白质组数据与HCC数据，应用MR方法系统识别10个与HCC风险相关的蛋白质生物标志物 | 研究依赖于公开数据库数据，需要进一步实验验证 | 识别肝细胞癌的潜在治疗靶点和蛋白标志物 | 肝细胞癌患者和蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学, 孟德尔随机化, 单细胞测序, KEGG通路分析, PPI分析 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据 | 多个GWAS研究队列(7个已发表GWAS), DeCODE队列, FinnGen队列, UK Biobank | NA | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 1411 | 2025-10-07 |
RAC2 as a Tumor-Suppressive Biomarker Associated with T Cell Infiltration in Breast Cancer
2025-Jan, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2024.0142
PMID:39479793
|
研究论文 | 本研究探讨RAC2在乳腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 首次系统揭示RAC2作为抑癌生物标志物与T细胞浸润的关联，并验证其诊断和预后价值 | 研究主要基于公共数据库分析，需要进一步实验验证 | 探索RAC2在乳腺癌中的作用机制及其临床价值 | 乳腺癌组织和正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化分析, 基因集富集分析 | ROC曲线分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1412 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 high-expression macrophages mediate renal tubular epithelial cell damage in acute kidney injury following acute type A aortic dissection surgery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1530741
PMID:40270593
|
研究论文 | 本研究探讨S100A8/A9高表达巨噬细胞在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中对肾小管上皮细胞的损伤机制 | 首次揭示S100A8/A9通过促进巨噬细胞向M1表型转化并激活TNF信号通路导致急性肾损伤的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未在人体临床样本中验证 | 阐明S100A8/A9在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中的分子机制 | 肾小管上皮细胞(TCMK-1)、巨噬细胞(RAW264.7)、AKI小鼠模型 | 分子生物学 | 急性肾损伤、心血管疾病 | 转录组测序、单细胞测序、分子生物学实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 细胞系和小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 1413 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing in diffuse large B-cell lymphoma: tumor heterogeneity, microenvironment, resistance, and prognostic markers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1583250
PMID:40270607
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的关键发现，包括肿瘤异质性、微环境相互作用、耐药机制和预后生物标志物 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学和单细胞多组学技术，为DLBCL的精准治疗策略开发提供新见解 | NA | 总结单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的应用和发现 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1414 | 2025-10-07 |
Mapping Cell Identity from scRNA-seq: A primer on computational methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.051
PMID:40270709
|
综述 | 本文提供了单细胞RNA测序中细胞身份注释计算方法的简明概述 | 将现有细胞注释工具系统分类为五大类别，并讨论其关键优势、局限性和应用范围 | 主要面向新用户和非计算科学家，可能未涵盖所有高级技术细节 | 为单细胞RNA测序数据中的细胞身份注释计算方法提供入门指南 | 单细胞RNA测序数据和相关的计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1415 | 2025-10-07 |
Investigation of the role of GEM in systemic lupus erythematosus through multi-omics joint analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1569605
PMID:40270963
|
研究论文 | 通过多组学联合分析探究GEM基因在系统性红斑狼疮中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序与功能实验相结合揭示GEM在SLE成纤维细胞亚群中的关键调控作用 | GEM调控成纤维细胞功能的具体分子通路尚未完全阐明 | 阐明GEM基因在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的成纤维细胞 | 生物医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 功能细胞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1416 | 2025-10-07 |
Epithelial and macrophage cell interaction in cervical cancer through single-cell RNA-sequencing and spatial analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537785
PMID:40270962
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间分析研究宫颈癌中上皮细胞与巨噬细胞的相互作用 | 结合单细胞RNA测序、空间转录组分析和细胞通讯分析，揭示宫颈癌微环境中上皮细胞与巨噬细胞的特异性相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性验证 | 探索宫颈癌肿瘤微环境的细胞组成和免疫景观 | 宫颈癌患者组织样本 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 基因集变异分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1417 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing comparison of CD4+, CD8+ and T-cell receptor γδ+ cutaneous T-cell lymphomas reveals subset-specific molecular phenotypes
2025-Jan-24, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljae313
PMID:39133553
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较CD4+、CD8+和TCR-γδ+皮肤T细胞淋巴瘤的分子表型差异 | 首次在单细胞水平系统比较不同T细胞表型皮肤淋巴瘤的分子特征，揭示了亚型特异性表型差异 | 样本量有限（18例活检），仅分析了皮肤组织样本 | 对不同T细胞表型的皮肤T细胞淋巴瘤进行全面的分子特征表征 | 皮肤T细胞淋巴瘤患者的皮肤活检组织 | 单细胞组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1418 | 2025-10-07 |
Microbiota-induced S100A11-RAGE axis underlies immune evasion in right-sided colon adenomas and is a therapeutic target to boost anti-PD1 efficacy
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332193
PMID:39251326
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌入侵并激活S100A11-RAGE轴促进免疫逃逸的机制 | 首次发现右侧结肠腺瘤中杯状细胞功能障碍导致细菌易位，并鉴定出S100A11+上皮细胞群体及其通过RAGE受体介导的免疫抑制机制 | NA | 阐明左右侧结肠腺瘤的差异特征及其在结肠癌免疫治疗中的意义 | 左右侧结肠腺瘤、临床标本、小鼠模型 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1419 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Hearts in Patients with Fetal Tetralogy of Fallot
2025, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000540406
PMID:39097963
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析法洛四联症胎儿心脏与正常胎儿心脏的细胞特征差异 | 首次在胎儿法洛四联症中应用单细胞RNA测序技术进行细胞水平研究 | 样本量较小（仅一个患病样本和一个正常样本） | 探索法洛四联症的细胞学特征和疾病标志物差异基因 | 法洛四联症胎儿心脏和正常胎儿心脏的右心室组织 | 单细胞组学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Cell Ranger | 单细胞基因表达数据 | 2个样本（1个TOF患者，1个健康对照），共25,203个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | Cell Ranger分析流程 |
| 1420 | 2025-10-07 |
Identification of a Novel Activated NK-Associated Gene Score Associated with Diagnosis and Biological Therapy Response in Ulcerative Colitis
2025, Digestion
IF:3.0Q2
DOI:10.1159/000540939
PMID:39182484
|
研究论文 | 本研究建立了一种新型活化NK相关基因评分(ANAG评分)，用于溃疡性结肠炎的精确诊断和生物治疗疗效预测 | 首次开发了基于四个关键基因(SELP, TIMP1, MMP7, ABCG2)的活化NK相关基因评分系统，能够准确诊断溃疡性结肠炎并预测生物治疗反应 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步临床验证；样本量未明确说明 | 探讨活化NK相关基因评分在溃疡性结肠炎中的诊断价值及其对生物治疗反应的预测价值 | 溃疡性结肠炎患者组织和细胞数据 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光 | LASSO回归, PPI分析, ssGSEA, CIBERSORT | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |