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当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2025-05-07 |
Analysis of downstream targets of PAX6 and LHX2, fundamental regulators of the developing mammalian neocortex
2025, Journal of biosciences
IF:2.1Q2
PMID:39912400
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研究论文 | 分析PAX6和LHX2这两个哺乳动物大脑皮层发育中的基本调控因子的下游靶基因 | 比较了PAX6和LHX2的染色质占据情况以及各自缺失时的转录失调，识别了共同直接和间接靶基因，并分析了它们在神经发生过程中的表达模式 | 未进行实验验证所提出的假设 | 探究PAX6和LHX2在哺乳动物大脑皮层发育中的基因调控网络 | PAX6和LHX2转录因子及其下游靶基因 | 发育生物学 | NA | 染色质占据分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1402 | 2025-10-07 |
Development of a hypoxia-responsive macrophage prognostic model using single-cell and bulk RNA sequencing in pancreatic cancer
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322618
PMID:40315225
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和TCGA-PAAD数据库数据，开发了一个包含13个关键基因的缺氧反应性巨噬细胞预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据构建胰腺癌缺氧相关预后模型，并发现KRTCAP2作为关键生物标志物 | NA | 构建胰腺癌缺氧相关预后模型以预测化疗敏感性和总生存期 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Cox回归, Lasso回归, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据 | TCGA-PAAD数据库及单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1403 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing identifies and validates T cell-related prognostic model in hepatocellular carcinoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322706
PMID:40315269
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，构建并验证了肝细胞癌中T细胞相关的预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据识别T细胞相关预后基因，并构建包含PTTG1、LMNB1、SLC38A1和BATF的四基因预后模型 | 样本量相对有限，单细胞数据仅来自10名患者，验证队列规模较小 | 开发肝细胞癌的预后预测模型，改善患者风险分层和个性化治疗策略 | 肝细胞癌患者及其肿瘤组织中的T细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，免疫组化，LASSO回归，Cox回归分析 | LASSO回归模型，Cox比例风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床预后数据，免疫组化图像 | 10例HCC患者的scRNA-seq数据（6,281个T细胞），TCGA和ICGC数据库的bulk RNA-seq数据，25例患者组织的IHC验证 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1404 | 2025-10-07 |
Multiomics Approach Distinguishes SPTBN4 as a Key Molecule in Diagnosis, Prognosis, and Immune Suppression of Testicular Seminomas
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/3530098
PMID:40321316
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别SPTBN4作为睾丸精原细胞瘤诊断、预后和免疫抑制的关键分子标志物 | 首次整合单细胞转录组测序、高维加权基因共表达网络分析和药物敏感性分析，系统揭示SPTBN4在睾丸精原细胞瘤中的核心作用 | 研究主要基于公共数据集和计算分析，需要进一步实验验证 | 探索睾丸精原细胞瘤的分子异质性并识别关键生物标志物 | 睾丸精原细胞瘤组织样本 | 生物信息学 | 睾丸精原细胞瘤 | 单细胞RNA转录组测序, 高维加权基因共表达网络分析, 药物敏感性分析 | hdWGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 临床生存数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1405 | 2025-10-07 |
Inferred developmental origins of brain tumors from single-cell RNA-sequencing data
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf016
PMID:40321621
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研究论文 | 本研究开发了COORS计算工具，通过单细胞RNA测序数据推断脑肿瘤的发育起源 | 开发了基于发育人脑单细胞数据训练的COORS计算工具，能够注释脑肿瘤中的发育样细胞状态 | NA | 识别脑肿瘤的发育起源 | 脑肿瘤单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 多层感知机 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1406 | 2025-10-07 |
A prognostic glycolysis-related gene signature in osteosarcoma: implications for metabolic programming, immune microenvironment, and drug response
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19369
PMID:40321814
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研究论文 | 本研究建立了一个基于糖酵解相关基因的骨肉瘤预后风险特征模型 | 首次基于糖酵解相关基因构建骨肉瘤预后风险特征，并探索其与肿瘤微环境和药物反应的关系 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 建立骨肉瘤糖酵解相关基因风险特征并评估其预后价值 | 骨肉瘤患者 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | mRNA表达谱分析，单细胞RNA测序，RT-PCR | 非负矩阵分解，Cox回归分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的三个数据集(GSE16091, GSE39058, GSE21257) | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1407 | 2025-10-07 |
scSMD: a deep learning method for accurate clustering of single cells based on auto-encoder
2025-Jan-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06047-x
PMID:39881248
|
研究论文 | 提出一种基于自编码器的深度学习模型scSMD，用于单细胞RNA测序数据的准确聚类分析 | 整合非线性降维技术与多孔扩张注意力门控组件，基于卷积自编码器和负二项分布，能有效捕获细胞聚类特征并动态调整特征权重 | NA | 探索深度学习在单细胞数据聚类中的应用，特别关注处理稀疏高维数据 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 卷积自编码器, SMD深度学习模型 | 基因表达数据 | 公共数据集和专有骨肉瘤数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1408 | 2025-10-07 |
Epidermal stem cell derived exosomes-induced dedifferentiation of myofibroblasts inhibits scarring via the miR-203a-3p/PIK3CA axis
2025-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03157-9
PMID:39881312
|
研究论文 | 本研究通过表皮干细胞来源的外泌体诱导肌成纤维细胞去分化，揭示miR-203a-3p/PIK3CA轴在抑制瘢痕形成中的作用机制 | 首次发现表皮干细胞外泌体通过miR-203a-3p靶向抑制PIK3CA表达，阻断PI3K/AKT/mTOR通路过度激活，促进肌成纤维细胞去分化 | NA | 探究表皮干细胞外泌体抑制增生性瘢痕形成的分子机制 | 增生性瘢痕组织、肌成纤维细胞、表皮干细胞外泌体 | 细胞生物学 | 增生性瘢痕 | 比较转录组学、单细胞测序、miRNA测序、超速离心、Western blotting、免疫荧光 | NA | 转录组数据、单细胞数据、miRNA数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1409 | 2025-10-07 |
Exploring the role of oxidative stress in carotid atherosclerosis: insights from transcriptomic data and single-cell sequencing combined with machine learning
2025-Jan-29, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00600-7
PMID:39881407
|
研究论文 | 本研究通过转录组数据和单细胞测序结合机器学习，探索氧化应激在颈动脉粥样硬化中的作用机制 | 结合预测模型与单细胞数据分析，揭示了IDH1和CD36等氧化应激相关基因在驻留样巨噬细胞和泡沫巨噬细胞中的关键作用 | NA | 识别与颈动脉粥样斑块形成、进展和稳定相关的关键氧化应激基因和免疫细胞浸润 | 颈动脉粥样硬化斑块 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞测序, 机器学习 | 预测模型 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1410 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of normal and KRASG12D-malformed lymphatic vessels
2025-Jan-28, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185181
PMID:39874106
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建正常和KRASG12D畸形淋巴管的细胞图谱 | 首次在单细胞水平识别了6种淋巴管内皮细胞亚型，并揭示了KRASG12D突变对淋巴管成熟过程的影响 | 研究仅针对小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 阐明KRAS突变导致复杂淋巴管异常的分子机制 | 野生型和KrasG12D突变小鼠的肺部淋巴管内皮细胞 | 单细胞组学 | 复杂淋巴管异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年野生型小鼠和KrasG12D突变小鼠的肺部淋巴管细胞，涵盖4个发育阶段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1411 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage during PRRSV infection with different virulence
2025-Jan-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54676-2
PMID:39875369
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术研究不同毒力PRRSV感染期间支气管肺泡灌洗液的免疫细胞组成变化 | 首次在单细胞水平揭示不同毒力PRRSV感染的免疫细胞动态变化，发现旁观者细胞死亡机制和M2样巨噬细胞的保护作用 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细特征 | 解析不同毒力PRRSV感染的免疫应答机制和致病机理 | PRRSV感染猪模型的支气管肺泡灌洗液免疫细胞 | 单细胞组学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1412 | 2025-10-07 |
Prognostic models of immune-related cell death and stress unveil mechanisms driving macrophage phenotypic evolution in colorectal cancer
2025-Jan-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06143-9
PMID:39875913
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研究论文 | 构建免疫相关细胞死亡和应激预后模型，揭示结直肠癌中巨噬细胞表型演变的机制 | 首次构建ICDS预后模型，发现铜死亡通过下调GAL3ST4抑制M2样巨噬细胞极化的新机制 | NA | 探索结直肠癌肿瘤微环境中免疫细胞浸润、程序性细胞死亡和应激之间的复杂相互作用 | 结直肠癌患者样本和肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 转录组分析, 机器学习, 生化实验 | 预后模型 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的大量结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1413 | 2025-10-07 |
UBE2J1 is identified as a novel plasma cell-related gene involved in the prognosis of high-grade serous ovarian cancer
2025-Jan-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06135-9
PMID:39876019
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别浆细胞相关基因UBE2J1作为高级别浆液性卵巢癌的新型预后标志物和致癌基因 | 首次发现UBE2J1作为浆细胞相关基因在高级别浆液性卵巢癌中的预后价值和致癌功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 探索浆细胞在高级别浆液性卵巢癌中的作用并识别关键标志物 | 高级别浆液性卵巢癌组织和细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, CCK-8, Transwell, 集落形成, 伤口愈合, 免疫荧光, 体内肿瘤生长实验 | Cox回归, LASSO回归, GSVA分析 | 基因表达数据, 实验数据 | GEO和TCGA数据库中的高级别浆液性卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1414 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics identify a novel macrophage population associated with bone invasion in pituitary neuroendocrine tumors
2025-Jan-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03296-9
PMID:39865310
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现了一种与垂体神经内分泌肿瘤骨侵袭相关的新型TNF-α+ TAM巨噬细胞亚群 | 首次识别出TNF-α+ TAM巨噬细胞亚群，并阐明其通过IL34/CSF1R轴促进骨侵袭的机制 | 样本量相对有限（15例病例），需要更大规模研究验证 | 探究垂体神经内分泌肿瘤骨侵袭的分子机制 | 骨侵袭性和非骨侵袭性垂体神经内分泌肿瘤患者组织样本 | 单细胞转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例病例（10例骨侵袭性，5例非骨侵袭性），共87,287个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1415 | 2025-10-07 |
Combined PARP14 inhibition and PD-1 blockade promotes cytotoxic T cell quiescence and modulates macrophage polarization in relapsed melanoma
2025-Jan-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010683
PMID:39870492
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研究论文 | 本研究探讨PARP14抑制剂联合PD-1阻断在复发性黑色素瘤中对T细胞静息状态和巨噬细胞极化的调节作用 | 首次揭示PARP14抑制联合PD-1阻断可诱导细胞毒性T细胞进入静息状态并调节巨噬细胞极化 | 肿瘤细胞通过激活替代性免疫逃逸通路产生适应性耐药 | 探索克服黑色素瘤免疫检查点抑制剂耐药的新策略 | 黑色素瘤临床前模型和单细胞RNA测序数据 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 临床前模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1416 | 2025-10-07 |
Integrating representation learning, permutation, and optimization to detect lineage-related gene expression patterns
2025-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56388-7
PMID:39870610
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研究论文 | 开发了一种名为PORCELAN的计算方法，用于识别与细胞谱系紧密相关的基因表达模式 | 整合了表示学习、排列和优化三种计算方法来检测谱系相关的基因表达模式 | 方法仅在合成数据和特定生物系统（肺癌小鼠模型、小鼠和线虫胚胎发育）中进行了验证 | 检测与细胞谱系相关的基因表达模式，研究细胞状态记忆在分裂过程中的维持机制 | 肺癌小鼠模型、小鼠胚胎发育、秀丽隐杆线虫胚胎发育 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 表示学习模型 | 单细胞RNA测序数据、谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1417 | 2025-10-07 |
STAIG: Spatial transcriptomics analysis via image-aided graph contrastive learning for domain exploration and alignment-free integration
2025-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56276-0
PMID:39870633
|
研究论文 | 提出一种名为STAIG的深度学习模型，通过图像辅助图对比学习整合基因表达、空间坐标和组织学图像，用于空间转录组学分析 | 首次将图对比学习与高性能特征提取相结合，能够无需预对齐整合组织切片并消除批次效应，且支持多种平台数据输入 | NA | 开发空间转录组学分析工具，用于精确识别空间区域和探索肿瘤微环境 | 空间转录组学数据（基因表达、空间坐标、组织学图像） | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 图对比学习 | 基因表达数据、空间坐标、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1418 | 2025-10-07 |
Monocytes serve as Shiga toxin carriers during the development of hemolytic uremic syndrome
2025-Jan-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00689-8
PMID:39871175
|
研究论文 | 本研究揭示了单核细胞在志贺毒素诱导的溶血性尿毒症综合征中作为毒素载体的关键作用 | 首次确定单核细胞是志贺毒素2型向肾脏区域转运的主要载体，并发现其通过Toll样受体4与毒素结合 | 动物模型研究结果向人类临床应用的转化仍需进一步验证 | 阐明志贺毒素在溶血性尿毒症综合征发展过程中的转运机制 | 单核细胞、中性粒细胞、人肾小球内皮细胞、小鼠模型 | 单细胞测序 | 溶血性尿毒症综合征 | 单细胞测序分析、流式细胞术、细胞结合实验 | NA | 单细胞测序数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1419 | 2025-10-07 |
Wnt signalling facilitates neuronal differentiation of cochlear Frizzled10-positive cells in mouse cochlea via glypican 6 modulation
2025-Jan-27, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02039-9
PMID:39871249
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠耳蜗中Frizzled10阳性细胞通过Wnt信号通路和glypican 6调控实现神经元分化的机制 | 首次鉴定出耳蜗FZD10+细胞作为神经前体细胞的重要亚群，并阐明Wnt信号通过GPC6调控其神经元分化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类耳蜗中的相关性尚未验证 | 探究耳蜗FZD10+细胞的神经元分化能力及其调控机制 | 小鼠耳蜗Frizzled10阳性细胞 | 神经生物学 | 感音神经性听力损失 | 单细胞RNA测序，伪时序分析，信号通路网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1420 | 2025-10-07 |
HMOX1 as a potential drug target for upper and lower airway diseases: insights from multi-omics analysis
2025-Jan-27, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03124-w
PMID:39871287
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研究论文 | 通过多组学分析探讨HMOX1作为上下气道疾病潜在药物靶点的作用 | 首次通过双向双样本孟德尔随机化分析确定HMOX1与上下气道疾病的因果关系，并结合单细胞RNA测序和分子对接技术筛选潜在治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索HMOX1在上下气道疾病中的潜在治疗作用 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)、过敏性鼻炎(AR)和哮喘(AS)患者 | 生物信息学 | 呼吸系统疾病 | 基因集富集分析,随机森林算法,双向双样本孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,分子对接 | 随机森林,孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的样本数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |