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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-30 |
Proximity-based proteomics (BioID) uncovers the Rho GTPase interactome in kidney podocytes
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1625950
PMID:41306285
|
研究论文 | 本研究通过邻近标记技术绘制了肾足细胞中Rho GTPases的相互作用网络 | 首次在足细胞中系统绘制RhoA、Rac1和Cdc42的相互作用组,发现约50%的相互作用是足细胞特有的,并鉴定出KIAA1522作为新型Cdc42效应子和ARHGEF12作为关键RhoA调节因子 | NA | 揭示肾足细胞中Rho GTPases的信号网络及其在足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾足细胞、HEK293细胞、HeLa细胞、斑马鱼模型 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | 邻近依赖性生物素标记(BioID)、单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据 | NA | NA | 邻近标记蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-11-30 |
A metabolic-radioimmune signature predicts therapy response and immune reprogramming in non-small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1693277
PMID:41306526
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据建立基于放射抵抗相关代谢基因的预后特征,用于预测非小细胞肺癌的放疗反应和免疫治疗疗效 | 首次系统描绘放疗诱导的肿瘤微环境代谢重编程全景图,并构建具有预后预测价值的放射抵抗相关代谢基因特征 | 研究主要基于回顾性数据分析,需要更多前瞻性临床研究验证 | 优化非小细胞肺癌治疗分层和放射增敏剂发现 | 非小细胞肺癌肿瘤细胞、免疫细胞和肿瘤引流淋巴结 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 分子对接, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | Cox回归模型, WGCNA, 诺莫图 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA放疗队列和独立放射免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-11-30 |
Targeting Matrix Metalloproteinase-9 to Alleviate T Cell Exhaustion and Improve Sepsis Prognosis
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0996
PMID:41306770
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研究论文 | 本研究通过构建分子互作扰动网络,首次揭示脓毒症免疫异质性的网络生物学基础,并确定单核细胞来源的MMP9是驱动CD4 T细胞功能障碍的关键调节因子 | 首次构建脓毒症免疫异质性的分子互作扰动网络,发现MMP9通过双重机制调控T细胞耗竭,并验证选择性MMP9抑制剂可逆转T细胞功能障碍 | NA | 阐明脓毒症免疫异质性的分子机制并寻找有效治疗靶点 | 人类外周血样本和免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,功能验证 | NA | 转录组数据,蛋白质数据,功能实验数据 | 1,862例人类外周血样本,超过450,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2025-11-30 |
Ocular surface health and disease: insight from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1683167
PMID:41306916
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在眼表组织健康与疾病研究中的原理、应用及局限性 | 首次系统总结scRNA-seq在眼表组织细胞多样性解析和疾病机制研究中的综合应用 | 技术本身存在检测灵敏度限制和细胞捕获偏差,且眼表组织样本获取难度较大 | 探讨单细胞RNA测序技术在眼表组织研究和疾病机制解析中的应用价值 | 眼表组织(角膜、睑板腺、结膜、泪腺)及相关疾病 | 单细胞组学 | 眼表疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2025-11-30 |
Multi-omics reveals that NOTCH1 promotes cervical cancer progression and reduces radiosensitivity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1703032
PMID:41306984
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了NOTCH1在促进宫颈癌进展和降低放疗敏感性中的作用机制 | 首次从单细胞水平揭示NOTCH1在宫颈癌恶性细胞中的表达特征及其通过MIF配体-受体通路影响浆细胞分化的新机制 | NA | 阐明NOTCH1在宫颈癌进展和放疗抵抗中的分子机制 | 宫颈癌组织和细胞系 | 生物医学 | 宫颈癌 | 单细胞测序,cDNA微阵列,高通量测序,免疫组织化学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2025-11-30 |
The Role of Vitamin D Metabolism-Related Genes in Recurrent Pregnancy Loss and Their Immune Microenvironmental Changes
2025, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S541670
PMID:41307047
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示了维生素D代谢相关基因DOCK11和ETV2在复发性流产中的作用机制 | 首次将维生素D代谢基因与复发性流产的免疫微环境变化联系起来,并发现DOCK11和ETV2作为新型生物标志物 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 阐明维生素D代谢在复发性流产发生中的潜在机制 | 复发性流产患者的基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 复发性流产 | 转录组测序, RT-qPCR, Western blotting, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-30 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
|
综述 | 本章重点阐述多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学机制中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,结合单细胞测序、空间转录组学等高通量工具,重建连接遗传风险、基因调控、蛋白质功能障碍和代谢失衡的分子网络 | 面临数据异质性和标准化有限的挑战 | 推进神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化(ALS)等神经退行性疾病 | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序,空间转录组学,质谱分析,基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学 | NA | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,神经影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 128 | 2025-11-30 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
|
综述 | 本章概述精准医学如何重塑神经退行性疾病的认知、诊断和治疗方式 | 整合基因治疗、药物基因组学和个性化生活方式策略,并引入单细胞转录组学、数字孪生等未来工具 | 存在试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等应用挑战 | 推动精准医学在神经退行性疾病领域从研究向临床实践转化 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病患者 | 精准医学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、成像技术、数字工具、生物标志物分析 | 数字孪生 | 遗传数据、分子数据、生物标志物、临床特征、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2025-11-29 |
The Expression of the LDLR, LDLRAP1, and PCSK9 Genes has Prognostic Significance in Triple-negative Breast Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨胆固醇摄取基因在三阴性乳腺癌中的预后意义 | 首次系统评估LDLR、LDLRAP1和PCSK9等胆固醇摄取基因在不同乳腺癌亚型中的预后价值差异 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 评估胆固醇摄取基因对乳腺癌患者总生存期的预后意义及其在不同亚型间的差异 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | mRNA测序,单细胞测序 | DESeq2,Fisher检验 | 基因表达数据 | 癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌肿瘤样本 | NA | mRNA测序,单细胞测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-11-29 |
Double-Responsive Macrophage-Derived Exosomes Alleviate Acute Lung Injury
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0277
PMID:41293091
|
研究论文 | 本研究开发了一种EGFR单克隆抗体修饰的巨噬细胞来源外泌体miR-126a-3p,用于治疗脓毒症引起的急性肺损伤 | 首次构建了具有巨噬细胞靶向能力的双响应外泌体递送系统,通过抑制PIK3R2/NLRP3信号通路和铁死亡发挥治疗作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠急性肺损伤模型,尚未在临床患者中验证 | 探索新型外泌体治疗方法对急性肺损伤的治疗效果及机制 | 巨噬细胞、外泌体、miR-126a-3p、急性肺损伤小鼠模型 | 生物医学工程 | 急性肺损伤 | 单细胞测序、miRNA芯片、免疫荧光、电穿孔技术、小动物成像 | NA | 基因表达数据、成像数据、细胞表型数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-11-29 |
The Strontium Ion Reprograms Monocyte Subsets via TRPM2 Channel Regulation to Enhance Osseointegration
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0286
PMID:41293090
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研究论文 | 本研究揭示了锶离子通过调控TRPM2通道重编程单核细胞亚群以增强骨整合的机制 | 首次阐明锶修饰生物材料通过TRPM2-Ca-NLRP3轴调控单核细胞亚群分布和功能的免疫调节机制 | 未明确说明样本规模,且机制研究主要集中于单核细胞,其他免疫细胞的作用未深入探讨 | 探究锶离子对单核细胞亚群动态重编程的机制及其在骨整合中的作用 | 单核细胞亚群、钛植入物、骨髓间充质基质细胞 | 免疫工程 | 骨整合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2025-11-29 |
Clinical application and drug resistance mechanism of gemcitabine
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1702720
PMID:41293424
|
综述 | 系统综述吉西他滨的耐药机制并探索新型递药系统和联合治疗策略的突破方向 | 整合单细胞测序和人工智能药物敏感性预测等前沿技术,提出通过动态监测多组学生物标志物构建'预防-监测-干预'全链条管理体系 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨吉西他滨的临床应用及耐药机制 | 吉西他滨及其耐药机制 | NA | 肿瘤 | 单细胞测序,人工智能药物敏感性预测,多组学生物标志物监测 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 133 | 2025-11-29 |
Decoding IL-1 receptor 1 and 2 expression profiles across organs in sepsis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1675870
PMID:41293423
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术验证,系统分析了脓毒症中IL-1R1和IL-1R2受体在不同器官中的细胞类型特异性表达动态 | 首次在单细胞水平揭示IL-1受体在脓毒症中具有器官特异性和细胞类型特异性的表达模式 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 阐明IL-1受体在脓毒症中的表达动态及其在免疫调节和组织特异性反应中的作用 | 小鼠盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症模型中的肺、肝、心脏和小肠组织 | 单细胞生物学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-11-29 |
Integrative Multi-Omics and Functional Validation Reveal the Role of the TACE Refractoriness-Associated Gene ATP1B3 in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S537990
PMID:41293558
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和功能验证,揭示了ATP1B3基因在肝细胞癌TACE耐药性和肿瘤进展中的关键作用 | 首次将ATP1B3鉴定为与TACE耐药性相关的关键基因,并通过单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤-免疫细胞相互作用中的功能 | 样本量相对有限(104例患者),需要在更大队列中进一步验证 | 识别与肝细胞癌TACE耐药性相关的基因并探索其功能机制 | 104例接受TACE治疗的肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 功能验证实验 | 无监督聚类, Cox回归, lasso回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 104例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 135 | 2025-11-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals CCL3+ Classical Monocyte Subset Linked to Autoimmune Pathogenesis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S547283
PMID:41293646
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研究论文 | 通过整合六种自身免疫性疾病的单细胞RNA测序数据,揭示了CCL3+经典单核细胞亚群在自身免疫发病机制中的关键作用 | 首次在多种自身免疫性疾病中发现并鉴定了一个新的CCL3+经典单核细胞亚群,该亚群具有强烈的炎症特性和趋化作用 | 研究主要基于外周血单核细胞,未深入探讨组织特异性变化 | 表征自身免疫疾病中单核巨噬细胞的共享和疾病特异性改变,以增进对自身免疫疾病免疫景观的理解 | 自身免疫疾病患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学染色,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 350,043个外周血免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2025-11-29 |
Relationship between SPP1 (Osteopontin) and extracellular matrix dynamics: a comprehensive review
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1700652
PMID:41293726
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综述 | 本综述系统总结了SPP1(骨桥蛋白)在细胞外基质动态调控中的核心作用及其在多种疾病中的病理机制 | 首次提出SPP1作为病理性ECM动态的主调控因子,强调保守的SPP1+巨噬细胞-ECM相互作用机制 | 缺乏体内验证数据,特别是在骨关节炎模型中的验证 | 阐明SPP1介导的细胞外基质失调机制及其作为中心病理枢纽的作用 | SPP1(骨桥蛋白)及其与胶原蛋白和其他ECM组分的相互作用 | 生物医学研究 | 纤维化疾病、转移性疾病、骨关节炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习、体内/体外实验 | NA | 多组学数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2025-11-28 |
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Jan-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5743704/v1
PMID:39801521
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研究论文 | 提出多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法,整合多尺度拓扑表示与空间深度学习技术 | 首次在空间转录组学分析中考虑多尺度细胞-细胞相互作用,结合多尺度拓扑表示与先进空间深度学习技术 | NA | 改进空间转录组数据分析方法,更好地识别空间域和细胞间相互作用 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 空间深度学习 | 空间基因表达数据 | 37个基准空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2025-11-28 |
SLC16A3 is a Prognostic Marker and Affects Immune Regulation in Bladder Cancer
2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究系统分析了SLC16A3在膀胱癌中的表达及其与预后的关系,探讨了其通过调节代谢和m6A甲基化影响免疫浸润的机制 | 首次系统分析SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节功能,建立了可靠的预后模型 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探讨SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节机制 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序,逆转录定量PCR,免疫组织化学,生物信息学分析 | 预后模型 | 基因表达数据,临床数据,单细胞测序数据 | 412例膀胱癌患者和3,115个膀胱癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomics profiling reveals cellular origins and molecular drivers underlying melanoma brain metastasis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336502
PMID:41284647
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子驱动机制 | 首次识别出与脑转移相关的肿瘤细胞亚群MBMATCs,并开发了能够预测脑转移风险的MBM-Index生物标志物 | 样本量相对有限(26个黑色素瘤样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子机制 | 黑色素瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 26个黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-11-28 |
Integrative Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal Mitochondrial Metabolism-Related Biomarkers in IgA Nephropathy with Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S565202
PMID:41287774
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研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物CYP27B1和PCK1 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA测序分析揭示IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物,并确定近端肾小管细胞为关键细胞类型 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 确定线粒体代谢相关生物标志物在IgA肾病中的作用 | IgA肾病患者的转录组数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 逆转录定量PCR | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |