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当前共找到 2168 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-03-02 |
Enhanced resistance to Listeria infection in mice surviving sepsis: the role of lipid metabolism and myeloid cell reprogramming
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1588987
PMID:40520167
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研究论文 | 本研究探讨了败血症存活小鼠通过脂质代谢和髓系细胞重编程增强对李斯特菌感染的抵抗力 | 揭示了败血症存活后髓系细胞的脂质代谢重编程如何增强对细胞内病原体的免疫保护，为败血症幸存者的免疫恢复提供了新机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；未深入探讨脂质代谢变化的具体分子通路 | 探究败血症存活后免疫系统如何通过脂质代谢和髓系细胞重编程增强对二次感染的抵抗力 | 败血症存活小鼠及其脾脏CD11b+Ly6Chigh髓系细胞 | 免疫学 | 败血症 | 单细胞RNA测序、定量RT-PCR、免疫组化、血清细胞因子检测、血浆脂质组学 | NA | RNA序列数据、脂质组学数据、细胞表型数据 | 小鼠模型（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-03-01 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
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综述 | 本章强调多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据，结合单细胞测序、空间转录组学和高通量质谱等工具，重建分子网络并实现患者分子亚型分层 | 面临数据异质性和标准化不足等挑战 | 推动神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化（ALS） | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、质谱分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2026-03-01 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
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综述 | 本章概述了精准医学如何重塑神经退行性疾病的理解、诊断和治疗方式 | 整合了遗传、分子、生物标志物、影像技术和数字工具等多维度信息，推动精准医学从研究向临床实践转化 | 面临试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等挑战 | 探讨精准医学在神经退行性疾病中的应用，旨在改善诊断、治疗和疾病管理 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、影像技术、数字工具 | NA | 遗传数据、分子数据、生物标志物数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 124 | 2026-02-27 |
CREB Drives Acinar to Ductal Cells Reprogramming and Promotes Pancreatic Cancer Progression in Preclinical Models of Alcoholic Pancreatitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101606
PMID:40812683
|
研究论文 | 本研究探讨了在酒精性慢性胰腺炎背景下，CREB与致癌KrasG12D/+在促进胰腺癌进展中的分子相互作用 | 揭示了CREB在酒精性胰腺炎模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并加速胰腺癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明慢性炎症下CREB与Kras*协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 胰腺腺泡细胞、导管病变、胰腺上皮内瘤变 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、Western blotting、磷酸激酶阵列、定量PCR、谱系追踪 | 遗传工程小鼠模型（KC, KCC-/-） | 基因表达数据、组织学图像 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 125 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2025, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2025.1693937
PMID:41334557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了体外冲击波疗法治疗糖尿病伤口组织的细胞图谱，揭示了该疗法促进组织修复的细胞机制 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了体外冲击波疗法对糖尿病伤口组织的细胞动态和转录重编程影响，并阐明了其通过调节巨噬细胞、成纤维细胞和内皮细胞状态以及增强免疫细胞通讯网络来促进修复的机制 | 研究主要基于转录组层面的分析，缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入探索；样本量相对有限，且为观察性研究，因果关系需进一步验证 | 探究体外冲击波疗法促进糖尿病伤口愈合的细胞和分子机制 | 糖尿病伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约39,475个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 126 | 2026-01-23 |
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1773404
PMID:41567218
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correction | 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 127 | 2026-02-20 |
Upregulation of interferon-γ activation in patients with anti-interferon-γ autoantibodies immunodeficiency syndrome: insights from single-cell analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659383
PMID:41710026
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征的免疫图谱，揭示了其Th1偏向、IFN-γ驱动的疾病机制 | 首次对AIGAs免疫缺陷综合征进行单细胞RNA测序分析，绘制了其免疫细胞亚群图谱，并揭示了CD4+ Tem与CD14+单核细胞间的交互作用驱动持续Th1炎症的新机制 | 样本量较小（8名患者和3名健康对照），且研究主要基于外周血单核细胞，可能未完全反映组织特异性免疫变化 | 阐明抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征的致病机制和免疫景观 | 抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 8名AIGAs患者（4名感染期，4名稳定期）和3名健康对照用于scRNA-seq；扩展队列包括15名患者和10名对照用于流式验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-02-19 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomes reveals the prognostic value of polyamine metabolism biomarkers and immune microenvironment features in gastric cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1658975
PMID:41693709
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了多胺代谢生物标志物和免疫微环境特征在胃癌中的预后价值 | 首次在胃癌中整合单细胞和批量RNA-seq数据，系统评估多胺代谢相关基因的预后意义，并构建了一个基于13个基因的稳健预后模型 | 研究主要基于公共数据集，缺乏前瞻性临床验证，且样本量可能有限 | 评估多胺代谢相关基因在胃癌预后和免疫微环境中的作用，并开发预后分层模型 | 胃癌患者的转录组数据，包括单细胞和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq，机器学习算法 | StepCox，弹性网络，以及10种机器学习算法的组合 | 转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-02-19 |
KLF4 orchestrates a Ccl2+ fibroblast-mediated inflammatory network driving preterm birth
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1700275
PMID:41694684
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了KLF4通过调控Ccl2+成纤维细胞亚群介导的炎症网络在早产发病机制中的关键作用 | 首次结合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法，鉴定出KLF4是早产的遗传风险因子，并阐明了Ccl2+成纤维细胞亚群在KLF4依赖的炎症调控网络中的核心作用 | 研究主要基于小鼠和大鼠模型，虽进行了临床样本验证，但在人类中的直接机制证据仍需进一步探索；单细胞数据集来源有限 | 阐明早产的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 早产小鼠模型、大鼠宫内感染模型、人类早产患者外周血和胎盘组织 | 单细胞组学 | 早产 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 胎盘外植体培养 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 临床样本数据 | 来自公共数据集GSE200289和E-MTAB-11491的小鼠单细胞数据，以及FinnGen和IEU GWAS数据库的eQTL数据，并进行了体内外实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-02-19 |
M2 macrophage infiltration drives tumor progression and identifies a multigene prognostic signature in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659048
PMID:41704537
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示了M2肿瘤相关巨噬细胞在食管癌进展中的机制作用，并构建了一个四基因预后模型 | 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据整合分析，识别了M2巨噬细胞相关的关键基因，并构建了一个新的四基因预后特征，同时通过体内外实验验证了IL1RN和IL36G在肿瘤进展中的功能作用 | NA | 阐明M2肿瘤相关巨噬细胞在食管癌进展中的机制作用，并构建一个M2巨噬细胞相关基因特征用于预后预测 | 食管癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 多变量Cox回归分析 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-02-18 |
Deconvolution and Phylogeny Inference of Diverse Variant Types Integrating Bulk DNA-seq with Single-cell RNA-seq
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634791
PMID:39975330
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研究论文 | 本文开发了一种名为TUSV-int的方法，通过整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，进行去卷积和系统发育推断，以解决癌症克隆结构重建中的技术限制 | TUSV-int首次整合bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，利用整数线性规划同时处理SNV、CNA和SV等多种变异类型，提高了克隆谱系树的分辨率 | 方法依赖于scRNA-seq数据的可用性，且scDNA-seq的高成本和挑战性可能限制大规模队列应用，对结构变异和拷贝数变异的观测在RNA-seq中仍存在困难 | 开发一种整合多组学数据的方法，以改进癌症克隆谱系树的重建和突变历史解析 | 癌症基因组数据，包括bulk DNA-seq和scRNA-seq数据，专注于乳腺癌数据集 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk DNA-seq, scRNA-seq | 整数线性规划 | 基因组序列数据，RNA序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk DNA-seq | NA | NA |
| 132 | 2026-02-16 |
Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2025-Jan-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05983-1
PMID:39762897
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研究论文 | 本研究通过整合分析扩张型心肌病（DCM）和正常心脏组织的单细胞RNA测序（scRNA-seq）与批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，揭示了DCM中非心肌细胞的异质性，并识别了参与疾病过程的新型细胞亚群 | 首次构建了DCM的单细胞转录图谱，并利用多种机器学习算法（xCell, EPIC, MCP counter, CIBERSORT）高精度地识别了DCM相关细胞类型，发现了具有不同功能的成纤维细胞和巨噬细胞新亚群（如增殖性F3细胞、肌成纤维细胞F6细胞、M2-like1和M2-like2巨噬细胞），并揭示了GAS6-MERTK轴在细胞间通讯中的潜在作用 | 样本量相对较小（7个DCM样本和3个正常样本），研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 揭示扩张型心肌病（DCM）中非心肌细胞的异质性及其在疾病发生中的作用，探索潜在的免疫治疗靶点 | 人类心脏组织（来自DCM患者和正常供体） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 机器学习算法（包括xCell, EPIC, MCP counter, CIBERSORT） | 基因表达数据（转录组） | 总计70,958个单细胞数据点，来源于7个DCM样本和3个正常心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-02-16 |
Integrating traditional omics and AI-driven approaches for discovery and validation of novel MicroRNA biomarkers and therapeutic targets in thyroid cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1727032
PMID:41684520
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研究论文 | 本研究整合传统组学技术与人工智能方法，结合单细胞验证，以发现和验证甲状腺癌中新型microRNA生物标志物和治疗靶点 | 将批量转录组学的荟萃分析与机器学习特征选择、单细胞空间图谱相结合，增强了生物标志物的发现和验证能力 | 未明确说明样本来源的多样性或潜在偏差，且单细胞数据仅来自23个样本，可能限制普遍性 | 发现和验证甲状腺癌中可靠的生物标志物和治疗靶点 | 甲状腺癌样本、TPC-1和BHT101细胞系、以及小鼠异种移植模型 | 机器学习 | 甲状腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi, 功能实验 | 机器学习特征选择 | 转录组数据, 单细胞数据 | 3个批量RNA-seq数据集和23个甲状腺癌样本的196,145个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2026-02-15 |
ABCA8-positive lipid-metabolic CAFs mediate immunotherapy resistance in TNBC
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1729275
PMID:41675524
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学，揭示了ABCA8阳性脂质代谢相关癌症相关成纤维细胞（lpCAFs）通过脂质代谢重编程促进M2巨噬细胞极化，从而在三阴性乳腺癌（TNBC）中建立免疫抑制性肿瘤微环境并介导免疫检查点阻断（ICB）治疗抵抗的机制 | 首次利用整合的单细胞和空间转录组学数据，在TNBC中鉴定出ABCA8+ lpCAFs和APOE+ LAMs在免疫-基质交界处共定位，并阐明其通过脂质代谢重编程驱动免疫抑制性TME的新机制 | 研究主要基于体外共培养实验和回顾性数据分析，缺乏体内模型验证；样本量相对有限，且未涵盖所有TNBC亚型 | 阐明TNBC中ICB治疗抵抗的关键细胞机制，特别是脂质介导的基质-免疫相互作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）肿瘤微环境中的细胞，特别是癌症相关成纤维细胞（CAFs）和巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学，多模态交叉分析（MIA）算法，BODIPY染色，油红O染色，qPCR，流式细胞术，Western blotting | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | 3个TNBC数据集的scRNA-seq数据，43个TNBC样本的空间转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 135 | 2026-02-15 |
Single-cell RNA-sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals the transcriptome profile of Microtus fortis immune cells during the early phase of infection with Schistosoma japonicum
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1739541
PMID:41675929
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了东方田鼠和昆明小鼠在感染日本血吸虫早期外周血单个核细胞的转录组变化，揭示了东方田鼠作为非许可宿主的免疫反应机制 | 首次在单细胞水平上比较了东方田鼠（自然非许可宿主）和昆明小鼠（易感宿主）在感染日本血吸虫早期外周血免疫细胞的转录组差异，揭示了Cxcl9在单核细胞中的特异性上调以及Th2细胞和抗体分泌细胞的独特激活模式 | 研究仅关注了感染后10天的时间点，未能提供免疫反应的动态变化过程；样本量相对较小，可能影响统计效力；且仅分析了外周血单个核细胞，未涉及其他组织或细胞类型 | 探究东方田鼠对日本血吸虫感染的天然抵抗力的分子机制 | 东方田鼠（Microtus fortis）和昆明小鼠的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未感染动物（对照组）和感染后10天的动物样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2026-02-15 |
Applications of AI to single-cell and spatial transcriptomics: current state-of-the-art and challenges
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1715821
PMID:41676376
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综述 | 本文综述了人工智能在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用现状、主流算法及其面临的挑战 | 系统梳理了AI在10个单细胞/空间转录组核心分析任务中的应用，并评估了不同算法在实际研究中的适用性 | 未提供具体的实验验证数据，主要基于文献综述和方法学比较 | 评估人工智能技术在单细胞和空间转录组学数据分析中的应用效果与发展趋势 | 单细胞转录组学与空间转录组学数据分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 137 | 2026-02-14 |
A metabolic-radioimmune signature predicts therapy response and immune reprogramming in non-small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1693277
PMID:41306526
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研究论文 | 本研究系统探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中放疗诱导的肿瘤微环境（TME）代谢重塑，并基于放疗抵抗相关代谢基因（RRMGs）建立了一个预测模型，以优化治疗分层和放疗增敏剂发现 | 首次系统整合了NSCLC肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结（TDLNs）的批量转录组数据和肿瘤组织的单细胞RNA-seq数据，利用scFEA算法重建代谢通量图，并识别出7个关键的RRMGs构建预后模型，同时预测并实验验证了新的放疗增敏剂 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平或代谢组学的直接验证；模型在独立队列中的验证AUC相对较低（0.618），可能需要更多样本进一步验证；实验验证仅限于细胞水平，缺乏体内模型或临床前研究 | 优化NSCLC的放疗治疗分层，发现新的放疗增敏剂，并理解放疗诱导的代谢重编程如何驱动治疗抵抗 | 非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结（TDLNs）和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, WGCNA, Cox回归, CIBERSORT, TIDE算法, scFEA算法, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 分子对接 | 预后风险模型（基于RRMGs）, 列线图 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | TCGA放疗队列和独立放疗免疫治疗队列的数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2026-02-14 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SLC12A7在多种癌症中上调，与不良预后相关，并可能作为免疫治疗靶点 | 首次对SLC12A7进行泛癌分析，结合单细胞RNA测序数据揭示其在肿瘤微环境中的异质性，并通过体外实验验证其在肝细胞癌中的促癌功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，体外实验仅针对肝细胞癌细胞系，缺乏体内验证和临床样本的直接验证 | 阐明SLC12A7在癌症中的潜在致癌作用，评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的价值 | 多种癌症类型，重点关注肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学分析，单细胞RNA测序，体外功能实验 | NA | 转录组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库的多个癌症数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 139 | 2026-02-14 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics combined with whole-exome sequencing reveal key hub genes and epithelial heterogeneity in bladder cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1748105
PMID:41669266
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组、空间转录组和全外显子组测序数据，揭示了膀胱癌上皮细胞的异质性，并鉴定了与肿瘤突变负荷相关的关键枢纽基因 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和WES数据，结合TMB分析，系统解析膀胱癌上皮细胞亚群，并利用Ro/e算法识别出关键的TMB相关上皮亚群Epi14 | 样本量相对有限（13个单细胞样本，30个WES样本），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性队列验证 | 阐明膀胱癌上皮细胞的异质性及其在肿瘤发生发展中的作用，并鉴定与肿瘤突变负荷相关的关键基因 | 膀胱癌患者组织样本中的上皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 空间转录组学, qPCR, Western blot | 随机生存森林, UMAP, Monocle2, CellChat, CytoTRACE, spacexr, PROGENy | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 外显子组测序数据, 批量转录组数据 | 13个单细胞RNA-seq样本, 514个批量转录组样本, 30个WES样本, 共77,263个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 140 | 2026-02-12 |
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2025.1726096
PMID:41647192
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研究论文 | 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者胃肠道中MRGPRX2表达肥大细胞的增加及其在炎症性肠病（IBD）中的作用 | 首次在HαT背景下，结合空间转录组学和质谱流式细胞术，揭示了胃肠道肥大细胞表型改变及MRGPRX2表达上调与IBD活动的关联 | 样本量较小（空间转录组学n=8，质谱流式n=14），且仅针对特定肠道部位（降结肠和小肠）进行分析，可能限制结果的普适性 | 阐明HαT对胃肠道肥大细胞表型及MRGPRX2表达的影响，探索其在IBD症状发生中的潜在机制 | 遗传性α-类胰蛋白酶血症（HαT）患者及匹配的非HαT对照者的肠道组织样本 | 空间转录组学 | 炎症性肠病 | 空间转录组分析、质谱流式细胞术（CyTOF）、微滴数字PCR（ddPCR）、基因分型 | NA | 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 | 854份生物样本库IBD样本进行基因分型；空间转录组分析8例（HαT=4，对照=4）；质谱流式分析14例（HαT=5，对照=9） | NA | 空间转录组学、单细胞蛋白质组学 | NA | NA |