单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 1361 - 1380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1361 | 2025-10-06 |
Spatial Metabolomics and Transcriptomics Reveal Metabolic Reprogramming and Cellular Interactions in Nasopharyngeal Carcinoma with High PD-1 Expression and Therapeutic Response
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.102822
PMID:40083932
|
研究论文 | 本研究通过空间代谢组学和转录组学分析，揭示鼻咽癌中代谢重编程与细胞相互作用对PD-1表达和治疗反应的调控机制 | 首次整合空间代谢组学与空间转录组学技术，系统揭示鼻咽癌代谢重编程与细胞间相互作用的时空特征及其与治疗反应的关系 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证；功能验证主要基于细胞模型，缺乏体内实验证据 | 探索鼻咽癌不同治疗反应和PD-1表达水平下的空间代谢和基因表达变化 | 鼻咽癌患者组织样本 | 空间多组学 | 鼻咽癌 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 免疫组化, 基因沉默, 功能分析 | NA | 空间代谢组数据, 空间转录组数据, 公共数据库数据 | 鼻咽癌患者组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1362 | 2025-10-06 |
The allogenic non-proteinogenic amino acid BMAA-based vaccine breaks up the immune tolerance against colorectal cancer
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104722
PMID:40083927
|
研究论文 | 开发基于非蛋白氨基酸BMAA的疫苗通过人工引入新抗原打破结直肠癌的免疫耐受 | 首次利用非蛋白丝氨酸类似物BMAA的错掺机制人工创建新抗原，开发自组装纳米颗粒疫苗 | 目前仅在结直肠癌小鼠模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 开发新型免疫疗法打破结直肠癌的免疫耐受 | 微卫星稳定型结直肠癌小鼠模型 | 免疫治疗 | 结直肠癌 | 质谱分析，单细胞测序 | NA | 质谱数据，单细胞测序数据 | 结直肠癌小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1363 | 2025-10-06 |
The TMBIM1-YBX1 axis orchestrates MDSC recruitment and immunosuppressive microenvironment in pancreatic cancer
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.111180
PMID:40083936
|
研究论文 | 本研究揭示了TMBIM1/YBX1轴通过上调CCL2和PD-L1表达驱动胰腺癌免疫抑制微环境形成的机制 | 首次发现TMBIM1通过与转录因子YBX1结合调控PD-L1和CCL2表达，从而促进MDSC招募和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于细胞系和动物模型，需要进一步临床验证 | 探究TMBIM1在胰腺癌免疫抑制微环境中的作用及其治疗潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系PANC-1、C57BL/6J小鼠模型 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、ELISA、实时定量PCR、流式细胞术、趋化实验 | 动物异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 细胞系和小鼠模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1364 | 2025-10-06 |
Specific immune landscape of heatstroke distinguished from sepsis and aseptic inflammation
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.108212
PMID:40084252
|
研究论文 | 本研究通过比较热射病、脓毒症和无菌性炎症的免疫特征，揭示了热射病特有的免疫景观 | 首次系统比较热射病与脓毒症和无菌性炎症的免疫特征差异，发现TLR4单核细胞相对丰度升高是热射病特异性特征 | 样本量有限（每组40例），未涉及机制验证实验 | 识别热射病特有的免疫特征，为热射病免疫治疗提供理论基础 | 热射病患者、脓毒症患者、心肺转流术诱导的无菌性炎症患者及健康对照 | 免疫学 | 热射病 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、蛋白芯片检测 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、蛋白芯片数据 | 160例样本（4组各40例，年龄性别匹配） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1365 | 2025-10-06 |
What single-cell RNA sequencing taught us about MGMT expression in glioblastoma
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf058
PMID:40351834
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析胶质母细胞瘤中MGMT基因表达特征 | 首次通过单细胞水平分析揭示MGMT表达呈连续谱特征，挑战传统二元分型方法 | 依赖公开数据，部分研究未明确MGMTp甲基化检测方法，样本量有限 | 评估胶质母细胞瘤中MGMT基因在单细胞水平的表达特征 | 胶质母细胞瘤患者肿瘤细胞 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 3项研究数据集（包括CPTAC、Neftel和Wang研究） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1366 | 2025-10-06 |
Recombinant interleukin-7 treatment of refractory Mycobacterium avium complex lung disease (IMPULSE-7): a pilot phase II, single-center, randomized, clinical trial
2025 Jan-Dec, Therapeutic advances in infectious disease
IF:3.8Q2
DOI:10.1177/20499361251339300
PMID:40351870
|
研究论文 | 评估重组白细胞介素-7治疗难治性鸟分枝杆菌复合体肺病效果的II期临床试验 | 首次在难治性MAC-LD患者中评估IL-7的免疫治疗潜力，并采用单细胞RNA测序探索免疫抑制机制 | 样本量小（仅8名参与者），研究结果可能受限于患者数量不足 | 评估IL-7治疗难治性鸟分枝杆菌复合体肺病的疗效和安全性 | 难治性鸟分枝杆菌复合体肺病患者 | 临床医学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、基因表达数据 | 8名参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1367 | 2025-10-06 |
Single-cell combined transcriptome probes prognostic mechanisms of sialylation-related genes in cervical cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1534247
PMID:40352586
|
研究论文 | 基于唾液酸化相关基因构建宫颈癌预后模型并探索其机制 | 首次结合转录组和单细胞RNA测序数据系统研究唾液酸化相关基因在宫颈癌中的预后价值 | 研究样本量有限，需要更大规模验证 | 开发宫颈癌预后模型并探索唾液酸化相关基因的作用机制 | 宫颈癌患者 | 数字病理 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, qRT-PCR | LASSO Cox回归 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 4个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1368 | 2025-10-06 |
Overexpression of MMP14 is associated with poor prognosis and immune cell infiltration in colon cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1564375
PMID:40352589
|
研究论文 | 本研究探讨MMP14在结肠癌中的过表达与预后不良及免疫细胞浸润的关系 | 首次通过单细胞转录组分析揭示MMP14在肝转移组成纤维细胞中高表达，并构建基于MMP14共表达基因的三基因风险预测模型 | 需要更多体外和体内实验验证研究结果，样本量有限 | 研究MMP14在免疫功能中的调控作用及其对结直肠癌预后的影响 | 结直肠癌组织和细胞系COLO205 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序,单细胞转录组分析,qRT-PCR,Western blotting,免疫荧光,HE染色 | 机器学习,Cox回归分析 | 基因表达数据,临床数据,单细胞数据 | 4对结直肠癌患者肿瘤与癌旁组织，公共数据库(TCGA和GEO)数据 | NA | 转录组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1369 | 2025-10-06 |
RGS14 binds to GNAI3 and regulates the proliferation and apoptosis of human spermatogonial stem cells by affecting PLPP2 expression and MAPK signaling
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1593595
PMID:40352663
|
研究论文 | 本研究揭示了RGS14通过结合GNAI3调控PLPP2表达和MAPK信号通路，影响人类精原干细胞增殖与凋亡的分子机制 | 首次发现RGS14-GNAI3-PLPP2调控轴在精原干细胞稳态维持中的关键作用，并阐明其在非梗阻性无精子症发病机制中的功能 | 研究主要基于细胞系实验，需要进一步在动物模型中验证该调控通路的生理功能 | 探究非梗阻性无精子症患者精原干细胞功能障碍的调控网络机制 | 人类精原干细胞和非梗阻性无精子症患者睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序，RNA测序，免疫荧光，蛋白质相互作用分析，免疫共沉淀 | NA | 单细胞转录组数据，RNA测序数据，蛋白质相互作用数据 | 非梗阻性无精子症患者与正常睾丸组织的精原干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1370 | 2025-10-06 |
The miR-941/FOXN4/TGF-β feedback loop induces N2 polarization of neutrophils and enhances tumor progression of lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1561081
PMID:40352924
|
研究论文 | 本研究揭示了miR-941/FOXN4/TGF-β反馈环路通过诱导中性粒细胞N2极化促进肺腺癌进展的机制 | 首次发现miR-941通过靶向FOXN4调控TGF-β信号通路，形成反馈环路驱动肿瘤相关中性粒细胞的N2极化 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探讨miR-941在肺腺癌肿瘤相关中性粒细胞中的作用机制 | 肺腺癌患者肿瘤相关中性粒细胞、A549和H1299细胞系、小鼠移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 荧光素酶报告实验, Western blot, ELISA | miReact算法, 生物信息学分析 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 肺腺癌患者样本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1371 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-Seq data have prevalent blood contamination but can be rescued by Originator, a computational tool separating single-cell RNA-Seq by genetic and contextual information
2025-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.04.588144
PMID:38617220
|
研究论文 | 开发了一种名为Originator的计算工具，用于识别和分离单细胞RNA测序数据中的血液污染细胞 | 提出首个结合遗传信息和背景信息来分离单细胞RNA测序数据中血液污染细胞的计算框架 | 未提及方法在特定组织类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中普遍存在的血液污染问题 | 人类复杂组织中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 单细胞RNA测序数据 | 多种人工混合和真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1372 | 2025-10-06 |
Polymorphisms in immunosuppression-related genes are associated with AML
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530510
PMID:39975548
|
研究论文 | 本研究通过检测免疫抑制相关基因的多态性，分析其与急性髓系白血病易感性、治疗反应和预后的关联 | 首次系统研究五个免疫抑制相关基因(CIITA、CD200、CD163、MRC1和LILRB4)中九个SNP与AML的关联 | 样本量相对有限(307例患者和316例对照)，仅检测了特定基因的SNP | 探讨免疫抑制相关基因多态性在AML发病机制和治疗预后中的作用 | 307例AML患者和316例健康对照个体 | 生物医学研究 | 急性髓系白血病 | SNP基因分型、单细胞转录组学 | NA | DNA样本、基因分型数据 | 307例AML患者和316例健康对照 | Agena Bioscience | SNP基因分型 | MassARRAY | MassARRAY平台 |
| 1373 | 2025-10-06 |
Unveiling macrophage dynamics and efferocytosis-related targets in diabetic kidney disease: insights from single-cell and bulk RNA-sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521554
PMID:40046045
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示糖尿病肾病中巨噬细胞动态变化及胞葬作用相关靶点 | 首次系统阐明糖尿病肾病中巨噬细胞亚型动态转变过程，并识别出CD36、ITGAM和CX3CR1三个关键胞葬作用调控基因 | 研究主要基于早期糖尿病肾病样本，晚期疾病阶段的验证相对有限 | 阐明糖尿病肾病中巨噬细胞异质性、表型动态变化及胞葬作用关键靶点 | 糖尿病肾病患者的免疫细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 伪时间轨迹分析 | 差异表达基因分析 | RNA测序数据 | 早期人类糖尿病肾病测序数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | CD45富集的免疫细胞单细胞RNA测序，NephroseqV5平台临床数据分析 |
| 1374 | 2025-10-06 |
Single-cell genomics and spatial transcriptomics in islet transplantation for diabetes treatment: advancing towards personalized therapies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1554876
PMID:40051625
|
综述 | 本文综述了单细胞基因组学和空间转录组学在胰岛移植治疗糖尿病中的应用及其推动个性化治疗的潜力 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，全面揭示胰岛移植中的细胞多样性、功能状态及组织微环境相互作用 | 未涉及具体实验数据，主要基于现有研究综述，且未详细讨论技术实施中的具体操作挑战 | 探索先进组学技术如何提升胰岛移植疗效并推动糖尿病个性化治疗发展 | 胰岛移植过程中的细胞类型、基因表达特征及组织微环境 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1375 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for hepatocellular carcinoma based on microvascular invasion characteristic genes by spatial transcriptomics sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1529569
PMID:40051627
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组测序开发了基于微血管入侵特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次利用空间转录组测序技术筛选MVI区域特异性基因，构建了7基因预后模型并在多个外部验证队列中证实其优越性 | 仅使用4个不同分级的MVI样本进行空间转录组测序，样本量有限 | 开发基于微血管入侵特征基因的肝细胞癌预后预测模型 | 肝细胞癌患者和微血管入侵样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组测序, 单核RNA测序, 多重免疫荧光 | Cox回归, LASSO回归, 随机生存森林 | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, 图像数据 | 4个不同分级的MVI样本用于空间转录组测序，三个外部验证队列 | NA | 空间转录组测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1376 | 2025-10-06 |
Tumor microenvironment-driven resistance to immunotherapy in non-small cell lung cancer: strategies for Cold-to-Hot tumor transformation
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2025.14
PMID:40342732
|
综述 | 本文综述了非小细胞肺癌肿瘤微环境驱动的免疫治疗耐药机制及冷肿瘤向热肿瘤转化的策略 | 提出了将冷肿瘤转化为热肿瘤的多维框架，整合了新兴机制如中性粒细胞胞外诱捕网、三级淋巴结构和外泌体信号网络 | NA | 克服非小细胞肺癌免疫治疗耐药性，实现冷肿瘤向热肿瘤的转化 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序、空间转录组学、纳米医学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1377 | 2025-10-06 |
The Low Tumorigenic Risk and Subtypes of Cardiomyocytes Derived from Human-induced Pluripotent Stem Cells
2025, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
研究论文 | 本研究评估了人诱导多能干细胞来源心肌细胞的肿瘤形成风险和亚型组成 | 首次通过单细胞RNA测序和全外显子组测序系统评估hiPSC-CMs的肿瘤风险并解析其细胞亚型组成 | 研究仅在NOD-SCID小鼠模型中进行了3个月的肿瘤形成观察，缺乏更长期的随访数据 | 评估hiPSC-CMs的肿瘤形成风险并鉴定其细胞亚型组成 | 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,全外显子组测序,流式细胞术,电生理学 | NA | 基因表达数据,基因组数据,细胞表型数据 | 分化第25天的hiPSC-CMs | NA | 单细胞RNA测序,全外显子组测序 | NA | NA |
| 1378 | 2025-10-06 |
A novel classification method for LUAD that guides personalized immunotherapy on the basis of the cross-talk of coagulation- and macrophage-related genes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518102
PMID:40018029
|
研究论文 | 基于凝血和巨噬细胞相关基因的交叉作用，开发了一种新的肺腺癌分类方法以指导个性化免疫治疗 | 首次整合凝血相关基因和巨噬细胞相关基因，定义了33个COMAR基因并建立了肺腺癌三种新亚型分类系统 | 需要外部数据队列和临床样本进一步验证模型的普适性 | 探索基于凝血和巨噬细胞的新型分类方法，以更好地指导肺腺癌患者的精准治疗 | 肺腺癌(LUAD)患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | WGCNA, scRNA-seq分析, 无监督聚类分析, 差异表达基因分析 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，但使用了外部数据队列和临床样本进行验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1379 | 2025-10-06 |
Modulation of double-negative T cells by Huang-Lian-Jie-Du Decoction attenuates neuroinflammation in ischemic stroke: insights from single-cell transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537277
PMID:40018035
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了黄连解毒汤通过调节双阴性T细胞亚型平衡减轻缺血性脑卒中神经炎症的机制 | 首次在缺血性脑卒中中发现双阴性T细胞存在活化细胞毒性和静息免疫抑制两种功能亚型，并揭示中药复方黄连解毒汤可通过调节这两种亚型平衡发挥神经保护作用 | 双阴性T细胞介导免疫反应的具体机制尚未完全阐明，黄连解毒汤在其他神经炎症疾病中的应用需要进一步研究 | 探讨黄连解毒汤对缺血性脑卒中急性期双阴性T细胞的调节作用及其神经保护机制 | 缺血性脑卒中模型中的双阴性T细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1380 | 2025-10-06 |
Elevated levels of IRF1 and CASP1 as pyroptosis-related biomarkers for intestinal epithelial cells in Crohn's disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1551547
PMID:40018047
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，识别出IRF1和CASP1作为克罗恩病肠道上皮细胞焦亡相关的关键生物标志物 | 首次系统识别并验证IRF1和CASP1在克罗恩病肠道上皮细胞焦亡中的关键作用，并证明其在不同CD亚型中的诊断价值 | 研究主要聚焦于IRF1和CASP1，其他焦亡相关基因的作用仍需进一步探索 | 探索焦亡在克罗恩病肠道上皮细胞中的作用机制并识别关键生物标志物 | 克罗恩病患者肠道上皮细胞、TNBS诱导的结肠炎大鼠模型 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 差异表达分析、机器学习算法、单细胞测序分析、RT-PCR、蛋白质印迹 | 机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | GEO数据库数据集、临床样本、TNBS诱导的结肠炎大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |