单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2151 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2025-05-16 |
Genomic Exploration of Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Gene Expression and Variation in Morbidly Obese Individuals
2025, Journal of obesity
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/jobe/9245699
PMID:40365443
|
研究论文 | 通过基因表达和变异分析探索非酒精性脂肪肝病（NAFLD）的基因组特征 | 整合生物信息学分析（包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）揭示了NAFLD进展中的关键基因及其变异，并发现了与代谢、免疫和脂质功能相关的新致病变异 | 研究主要聚焦于肥胖患者，可能无法完全代表所有NAFLD患者群体 | 探索NAFLD的致病机制并识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 肥胖患者的肝细胞基因表达和遗传变异 | 基因组学 | 非酒精性脂肪肝病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1342 | 2025-05-16 |
Egg-driven immunosuppression and granuloma zonation in Peyer's patches of mice with Schistosoma japonicum infection
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1587166
PMID:40365538
|
research paper | 该研究揭示了日本血吸虫感染小鼠模型中卵沉积对Peyer斑块（PPs）结构和免疫功能的破坏作用，以及肠道肉芽肿的细胞组成和免疫抑制机制 | 首次描述了肠道肉芽肿的分层细胞分布特征，并发现卵沉积驱动B细胞凋亡、T细胞耗竭以及髓系细胞纤维化通路的激活 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类还需进一步验证 | 探究日本血吸虫卵沉积对Peyer斑块免疫功能和肠道肉芽肿细胞组成的影响 | 感染日本血吸虫的小鼠模型及其Peyer斑块 | 免疫学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1343 | 2025-05-16 |
Quantitative Analysis of Tomato Flower Pedicel Abscission and Single-Cell Transcriptome Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4470-6_16
PMID:40366596
|
研究论文 | 本文详细描述了番茄花梗外植体的脱落测定方法及单细胞转录组测序技术 | 采用单细胞转录组学这一新方法解析花梗脱落区细胞的特性 | NA | 研究植物器官脱落的调控机制以提高作物产量和品质 | 番茄花梗 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 不同基因型的番茄花梗样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1344 | 2025-05-15 |
MS4A7 based metabolic gene signature as a prognostic predictor in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1591446
PMID:40356720
|
研究论文 | 本研究探讨了MS4A7基因在肺腺癌预后和免疫微环境动态中的作用，并开发了一个基于代谢基因的预后预测模型 | 首次将MS4A7基因与肺腺癌的预后和免疫微环境动态联系起来，并开发了一个高预测准确性的预后模型 | 研究依赖于TCGA数据库的RNA-seq数据，可能无法完全代表所有肺腺癌患者的异质性 | 探索MS4A7基因在肺腺癌预后和免疫微环境中的作用 | 肺腺癌患者和MS4A7基因 | 数字病理 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归 | RNA-seq数据 | 500名肺腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 1345 | 2025-05-15 |
Single-cell transcriptomics and functional validation revealed PLEKHA5-L as a promoter of growth and migration in brain metastatic melanoma cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1560954
PMID:40356756
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和功能验证揭示了PLEKHA5-L作为促进脑转移黑色素瘤细胞生长和迁移的分子 | 首次在单细胞水平上发现PLEKHA5在脑转移黑色素瘤中的表达增加，并验证了PLEKHA5-L通过上调HRAS、AKT3等癌基因促进黑色素瘤的迁移和增殖 | 样本量较小（7个黑色素瘤样本），且仅在动物模型中验证了PLEKHA5的表达 | 研究促进黑色素瘤脑转移的分子机制，寻找潜在的治疗靶点 | 黑色素瘤细胞，特别是脑转移的黑色素瘤细胞 | 癌症研究 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，RNA干扰，慢病毒载体过表达，CCK8测试，集落形成测试，transwell小室实验，RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 7个黑色素瘤样本（4个原发，3个脑转移） | NA | NA | NA | NA |
| 1346 | 2025-05-15 |
An immune cell activation signature reflected hepatocellular carcinoma heterogeneity and predicted clinical outcomes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534611
PMID:40356904
|
研究论文 | 本研究开发了一个六基因特征，用于预测肝细胞癌（HCC）患者的预后，并探讨了候选基因RORC在HCC进展中的作用 | 开发了一个新的六基因特征，能够有效预测HCC患者的预后，并揭示了候选基因RORC在HCC进展中的调控机制及其与多药耐药性的关联 | 研究依赖于公共数据集进行验证，可能受到数据质量和样本量的限制 | 识别可靠的免疫激活相关预后标志物，以预测HCC患者的临床结果 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 基因表达分析、单细胞测序、免疫组化（IHC） | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、免疫组化数据 | 三个独立的GEO数据集中的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1347 | 2025-05-15 |
Identification of B cell antigens in solid cancer: initial insights and functional implications
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571570
PMID:40356924
|
review | 本文综述了B细胞在实体癌中的抗原识别及其功能意义 | 强调了B细胞抗原在癌症免疫反应中的重要性，并利用单细胞测序技术进行抗原特异性研究 | NA | 探索B细胞在癌症中的抗原识别及其功能 | B细胞抗原 | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序、重组单克隆抗体生产、癌症结合筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1348 | 2025-05-15 |
Exploring WNT pathway dysregulation in serrated colorectal cancer for improved diagnostic and therapeutic strategies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1586867
PMID:40357363
|
研究论文 | 本研究探讨了WNT通路在锯齿状结直肠癌(SCC)中的异常调控，旨在通过多组学数据开发一种WNT驱动的分型模型以识别SCC患者 | 整合了批量数据和单细胞数据到多组学框架中，开发了WNT驱动的分型模型，并探索了针对SCC的潜在药物靶点 | 研究中使用的样本量虽然较大，但SCC作为一种罕见亚型，样本代表性可能有限 | 探索WNT通路在结直肠癌中的改变，开发识别SCC患者的分型模型 | 1751例结直肠癌患者的多组学数据和33例正常及癌组织的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学分析，单细胞转录组测序 | 无监督聚类模型 | 基因组数据，转录组数据 | 1751例结直肠癌患者(来自TCGA和GEO数据库)，33例正常和癌组织(来自SMC研究队列) | NA | NA | NA | NA |
| 1349 | 2025-05-15 |
Single-cell transcriptomic construction of fibroblast score for analysis of immune infiltration in primary and metastatic ovarian cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1549541
PMID:40357367
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据构建成纤维细胞评分，分析原发性和转移性卵巢癌中的免疫浸润 | 构建了一种新的成纤维细胞评分（Fib score），并发现TIMP3通过调控CXCL12/CXCR4信号轴影响卵巢癌的预后、免疫抑制和耐药性 | 研究仅基于单细胞转录组数据，未进行实验验证 | 探索原发性和转移性卵巢癌中的免疫浸润及成纤维细胞差异标志物在卵巢癌免疫调节中的作用 | 原发性和转移性卵巢癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | COX单因素分析 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1350 | 2025-10-06 |
Left/right asymmetrically expressed ephrin and Flamingo proteins regulate lateralized axon growth in C. elegans
2025-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.09.014
PMID:39341445
|
研究论文 | 本研究通过候选基因方法和单细胞RNA测序分析，发现EFN-2和FMI-1是HLH-16的下游靶标，在秀丽隐杆线虫AIY神经元谱系中左右不对称表达，并协同调控轴突生长的左右不对称性 | 首次在线虫神经系统中鉴定出ephrin蛋白EFN-2和Flamingo蛋白FMI-1的左右不对称表达，并揭示它们通过L1CAM家族受体SAX-7非经典通路协同调控轴突生长 | 研究主要聚焦于AIY神经元谱系，其他神经元类型中的分子不对称性尚未系统探索 | 探究左右不对称表达的分子机制及其在神经系统发育中的功能意义 | 秀丽隐杆线虫的AIY神经元谱系 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，候选基因方法 | NA | 基因表达数据，显微成像数据 | 秀丽隐杆线虫AIY神经元谱系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1351 | 2025-10-06 |
Pronounced early differentiation underlies zebra finch gonadal germ cell development
2025-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2024.08.006
PMID:39214328
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了鸡和斑胸草雀生殖细胞发育的种间差异 | 首次在斑胸草雀中发现两种不同的早期生殖细胞类型，并揭示其表达斑胸草雀特有的生殖限制染色体基因 | 研究仅比较了两种鸟类物种，可能无法完全代表所有鸟类的生殖细胞发育多样性 | 探究鸟类生殖细胞发育的种间差异，特别是新鸟下纲物种的生殖细胞发育特征 | 鸡和斑胸草雀的早期胚胎性腺组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 鸡和斑胸草雀的早期胚胎性腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1352 | 2025-10-06 |
Cellular and molecular determinants mediating the dysregulated germinal center immune dynamics in systemic lupus erythematosus
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530327
PMID:40070830
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多重成像技术揭示系统性红斑狼疮淋巴结滤泡中免疫细胞动态失调的分子机制 | 首次结合空间转录组学与多重成像技术系统揭示SLE滤泡内TFH细胞分化失调、Bcl6hi细胞减少及自身反应性ABC细胞富集的空间分子特征 | 样本来源限于淋巴结组织，未涉及其他免疫器官；机制研究主要基于相关性分析 | 探究系统性红斑狼疮滤泡免疫微环境中细胞和分子决定因素 | 系统性红斑狼疮患者的淋巴结滤泡组织 | 空间转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 空间转录组学，多重成像 | NA | 空间转录组数据，多重成像数据 | SLE患者与对照组的淋巴结样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1353 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing reveals cellular heterogeneity and immune microenvironment characteristics between ocular adnexal mucosa-associated lymphoid lymphoma and IgG4-related ophthalmic disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1508559
PMID:40078987
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术比较眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4相关眼病的细胞异质性和免疫微环境特征 | 首次对眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4相关眼病进行单细胞转录组测序比较分析，揭示了两种疾病的细胞组成和免疫微环境差异 | 样本量较小（仅6例患者），需要更大规模研究验证 | 探究眼附属器MALT淋巴瘤和IgG4相关眼病的分子发病机制差异 | 眼附属器泪腺区域组织样本 | 单细胞测序分析 | 眼附属器淋巴瘤, IgG4相关眼病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫荧光检测 | 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例MALT淋巴瘤，3例IgG4-ROD） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1354 | 2025-10-06 |
Development of a tertiary lymphoid structure-based prognostic model for breast cancer: integrating single-cell sequencing and machine learning to enhance patient outcomes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534928
PMID:40078998
|
研究论文 | 开发基于三级淋巴结构的乳腺癌预后模型，整合单细胞测序和机器学习技术 | 首次将三级淋巴结构与单细胞测序和机器学习结合构建乳腺癌预后模型 | 基于回顾性队列研究，需要前瞻性验证 | 开发乳腺癌预后预测模型以改善患者结局 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | 机器学习预测模型 | 转录组数据，基因组数据 | 9,551名患者来自13个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1355 | 2025-10-06 |
The sentinels of coronary artery disease: heterogeneous monocytes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1428978
PMID:40079002
|
综述 | 探讨冠状动脉疾病中单核细胞异质性的作用及其临床意义 | 提出单核细胞作为冠状动脉疾病的“哨兵”角色，系统阐述其异质性在疾病不同亚型和病理阶段的特征 | NA | 探索单核细胞异质性在冠状动脉疾病中的作用机制和临床价值 | 冠状动脉疾病患者的单核细胞 | 免疫学 | 冠状动脉疾病 | 高参数流式细胞术、单细胞测序 | NA | 临床数据、分子表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1356 | 2025-10-06 |
Analysis of single-cell and spatial transcriptomics in TNBC cell-cell interactions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521388
PMID:40079015
|
综述 | 概述单细胞RNA测序和空间转录组学在TNBC肿瘤微环境细胞相互作用研究中的应用 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统揭示TNBC肿瘤异质性和细胞间相互作用 | NA | 增强对三阴性乳腺癌细胞水平的理解以开发有效治疗靶点 | 三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞、T细胞、B细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1357 | 2025-10-06 |
Molecular Mechanisms of Ischemia/Reperfusion Injury and Graft Dysfunction in Liver Transplantation: Insights from Multi-Omics Studies in Rodent Animal Models
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.109449
PMID:40083684
|
综述 | 本文总结了啮齿动物肝脏移植模型中缺血再灌注损伤和移植功能障碍的分子机制，重点介绍了多组学研究的最新进展 | 整合多组学数据和单细胞RNA测序等先进技术，在啮齿动物模型中揭示肝脏移植病理生理过程的新视角 | 主要基于啮齿动物模型，需要与人类数据进行跨物种验证 | 理解肝脏移植中缺血再灌注损伤和移植功能障碍的分子机制，改善移植预后 | 啮齿动物肝脏移植模型 | 多组学分析 | 肝脏移植相关并发症 | 单细胞RNA测序, 空间组学, 机器学习 | 机器学习算法 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | NA |
| 1358 | 2025-10-06 |
Contact Cooling-Induced ELOVL4 Enhances Skin Wound Healing by Promoting the Inflammation-to-Proliferation Phase Transition
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.107871
PMID:40083712
|
研究论文 | 研究发现接触冷却通过诱导ELOVL4表达促进皮肤伤口愈合，加速炎症期向增殖期转变 | 首次揭示适宜温度通过上调ELOVL4表达促进伤口愈合的机制，并鉴定DHA和EPA为关键效应分子 | NA | 探究温度调控皮肤伤口愈合的分子机制 | 皮肤损伤模型和皮肤类器官 | 分子生物学 | 皮肤创伤 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1359 | 2025-10-06 |
NSUN2-mediated m5C modification drives alternative splicing reprogramming and promotes multidrug resistance in anaplastic thyroid cancer through the NSUN2/SRSF6/UAP1 signaling axis
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104713
PMID:40083919
|
研究论文 | 本研究揭示了NSUN2通过m5C修饰调控可变剪接重编程促进未分化甲状腺癌多药耐药的新机制 | 首次发现NSUN2/SRSF6/UAP1信号轴通过调控可变剪接促进ABC转运蛋白稳定性，从而介导多药耐药 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 阐明未分化甲状腺癌多药耐药的分子机制并寻找新的治疗靶点 | 未分化甲状腺癌细胞系、小鼠模型 | 癌症生物学 | 甲状腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、MeRIP-seq、蛋白质组学、流式细胞术、免疫沉淀 | 基因敲除模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、表观遗传数据 | 未分化甲状腺癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1360 | 2025-10-06 |
YBX1-driven TUBB6 upregulation facilitates ocular angiogenesis via WNT3A-FZD8 pathway
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104573
PMID:40083923
|
研究论文 | 本研究揭示了YBX1驱动的TUBB6上调通过WNT3A-FZD8通路促进眼部血管生成的新机制 | 首次发现YBX1通过结合TUBB6的3'UTR维持其mRNA稳定性，并阐明TUBB6通过调控WNT3A和FZD8影响WNT信号通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究眼部病理性新生血管形成的分子机制 | 氧诱导视网膜病变小鼠、激光诱导脉络膜新生血管小鼠、增殖性糖尿病视网膜病变患者、新生血管性年龄相关性黄斑变性患者 | 分子生物学 | 眼部血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, Transwell迁移实验, 伤口愈合实验, 管形成实验, 流式细胞术, 免疫荧光染色 | 基因敲除模型 | RNA测序数据, 细胞功能实验数据 | 小鼠疾病模型和人类患者内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |