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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2025-10-07 |
Orthologous marker groups reveal broad cell identity conservation across plant single-cell transcriptomes
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55755-0
PMID:39747890
|
研究论文 | 开发了一种名为OMG的计算方法,用于识别植物单细胞转录组中的细胞类型并比较跨物种细胞类型保守性 | 提出无需跨物种数据整合即可准确确定物种间细胞相似性的新计算策略 | NA | 解决植物单细胞RNA测序中细胞类型标记基因稀缺和表达模式分歧的问题 | 15种不同植物物种的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100万个细胞,268个细胞簇,涵盖15种植物物种 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1342 | 2025-10-07 |
Physiological premature aging of ovarian blood vessels leads to decline in fertility in middle-aged mice
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55509-y
PMID:39747922
|
研究论文 | 通过全器官成像和单细胞测序技术揭示中年小鼠卵巢血管生理性早衰导致生育力下降的机制 | 首次发现卵巢血管内皮细胞衰老是导致生育力下降的主要因素,并验证了红景天苷可逆转血管衰老 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究中年雌性生育力下降的机制及干预策略 | 中年雌性小鼠的卵巢血管系统 | 生殖医学 | 生育力下降 | 单细胞测序, 全器官成像, 基因修饰小鼠模型 | NA | 图像数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1343 | 2025-10-07 |
Decoding the role of SLC25A5 in osteosarcoma drug resistance and CD8+ T cell exhaustion: The therapeutic potential of phyllanthin
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156291
PMID:39752785
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析骨肉瘤肿瘤免疫微环境,揭示SLC25A5基因在促进CD8+ T细胞耗竭和药物抵抗中的作用,并发现叶下珠素通过抑制SLC25A5表达增强化疗敏感性 | 首次探索骨肉瘤的单细胞时空进化,发现SLC25A5在药物抵抗和免疫逃逸中的新致病作用,提出叶下珠素作为潜在治疗药物 | NA | 研究骨肉瘤的发病机制及药物抵抗机制 | 骨肉瘤细胞、CD8+ T细胞、肿瘤免疫微环境 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、功能实验验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1344 | 2025-10-07 |
Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19
2025-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02022-z
PMID:39753770
|
研究论文 | 通过分析血液DNA病毒组与自身免疫疾病和COVID-19的关联 | 首次在人群规模上系统量化血液DNA病毒组成分与自身免疫疾病的关联,并发现eHHV-6B整合到22号染色体 | 研究主要基于日本人群,需要在其他人群中验证 | 探索人类病毒组与自身免疫和传染病的关联机制 | 6321名日本个体,包括自身免疫疾病患者、COVID-19患者和健康对照 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 全基因组测序、GWAS、长读长测序、单细胞RNA测序、表位作图 | NA | 基因组测序数据 | 6321名日本个体 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1345 | 2025-10-07 |
Exploring the therapeutic potential of fibroadipogenic progenitors in muscle disease
2025 Jan-Feb, Journal of neuromuscular diseases
IF:3.2Q2
DOI:10.1177/22143602241298545
PMID:39973455
|
综述 | 探讨纤维脂肪生成祖细胞在肌肉疾病中的治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序等新技术对FAPs功能特化的最新认知,提出靶向FAPs的治疗干预策略 | NA | 解析FAPs在肌肉稳态维持和疾病发生中的作用机制 | 纤维脂肪生成祖细胞及其与肌肉驻留细胞的相互作用 | NA | 肌病和肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1346 | 2025-10-07 |
Intercellular Communication Network of CellChat Uncovers Mechanisms of Kidney Fibrosis Based on Single-Cell RNA Sequencing
2025, Kidney & blood pressure research
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000545209
PMID:40112793
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析细胞间通讯网络,揭示恩格列净在非糖尿病慢性肾病模型中抑制肾纤维化的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与CellChat分析方法,系统揭示恩格列净通过调节M2巨噬细胞介导的细胞间通讯网络抑制肾纤维化的新机制 | 研究仅基于大鼠模型,尚未在人体验证;样本量有限 | 探究恩格列净对非糖尿病慢性肾病模型中肾纤维化的影响及其作用机制 | 5/6肾切除大鼠模型 | 单细胞组学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | CellChat细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据 | 三组大鼠模型(假手术组、5/6肾切除安慰剂组、5/6肾切除恩格列净治疗组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1347 | 2025-10-07 |
Multi-omics Analysis of Histone-related Genes in Osteosarcoma: A Multidimensional Integrated Study Revealing Drug Sensitivity and Immune Microenvironment Characteristics
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338251336275
PMID:40241525
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和临床信息,系统分析骨肉瘤中组蛋白修饰的空间异质性及其临床意义 | 首次系统揭示骨肉瘤中组蛋白修饰的空间异质性,提出'表观遗传-免疫'调控网络假说并开发基于组蛋白修饰的预后模型 | NA | 研究骨肉瘤中组蛋白修饰的临床意义及其与免疫微环境和药物敏感性的关系 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO Cox回归, 细胞通讯网络分析 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1348 | 2025-10-07 |
A novel Wnt/β-catenin signaling gene signature for progression and metastasis of gastric cancer
2025, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2024.054366
PMID:40296906
|
研究论文 | 本研究通过识别Wnt/β-catenin信号通路相关基因特征,开发了胃癌预后预测模型并揭示了AEBP1与TCF3在胃癌转移中的协同作用机制 | 首次发现AEBP1和TCF3在细胞核内相互作用并协同增强Wnt信号通路基因表达,促进胃癌侵袭转移 | 研究未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 | 开发胃癌预后预测基因特征并探索其分子机制 | 胃癌细胞及相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | LASSO回归, 单细胞RNA测序, 双荧光素酶报告基因检测, 基因敲低和过表达实验 | LASSO回归模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1349 | 2025-10-07 |
Ginkgo biloba extract EGb 761® ameliorates cognitive impairment and alleviates TNFα response in 5xFAD Alzheimer's disease model mice
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156327
PMID:39778487
|
研究论文 | 本研究探讨银杏叶提取物EGb 761®在5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠中的认知改善作用及其抗炎机制 | 首次系统揭示EGb 761®通过影响疾病相关小胶质细胞DAM2亚型发挥抗炎作用,并发现其疗效具有性别特异性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证;单细胞RNA测序仅针对雄性小鼠前额叶皮层 | 探究EGb 761®在阿尔茨海默病中的药理作用机制和性别依赖性效应 | 5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠和野生型小鼠 | 神经药理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,器官型脑切片培养,行为学测试,基因表达分析 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据,行为数据,组织病理数据 | 8周龄5xFAD和野生型小鼠,治疗周期8周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1350 | 2025-10-07 |
scRNA-Seq-Based Transcriptome Profiling and Relevant Bioinformatics Approaches to Uncover Novel Insights in Studying Human Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_9
PMID:40301258
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术研究人类精子发生过程及其在病理条件下的分子机制 | 揭示了支持细胞在精子发生中的关键作用及其在病理条件下的功能紊乱 | NA | 研究人类精子发生的细胞和分子机制 | 人类睾丸组织中的支持细胞、间质细胞和生殖细胞 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1351 | 2025-10-07 |
Computational Approaches in Spatial Transcriptomics for the Study of Mammalian Spermatogenesis
2025, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-82990-1_8
PMID:40301257
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在哺乳动物精子发生研究中的计算方法与应用 | 将空间转录组学技术引入精子发生研究,从单细胞水平扩展到二维空间坐标系统,揭示睾丸组织中细胞类型的空间定位和分子互作 | NA | 探讨空间转录组学计算方法在哺乳动物精子发生研究中的应用 | 啮齿类和人类睾丸组织中的精子发生过程 | 空间转录组学 | 男性不育 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1352 | 2025-10-07 |
Enhancer RNA in cancer: identification, expression, resources, relationship with immunity, drugs, and prognosis
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf007
PMID:40285345
|
综述 | 本综述系统阐述了增强子RNA在癌症中的鉴定方法、表达特征、功能机制及其与免疫治疗、药物反应和预后的关联 | 全面整合eRNA在肿瘤免疫微环境重编程中的作用,提出eRNA特征作为免疫治疗反应和化疗耐药性监测的预测生物标志物 | 属于综述性文章,未涉及原始实验数据验证 | 系统总结eRNA在癌症生物学中的调控功能及其临床转化潜力 | 增强子RNA及其在癌症中的调控机制 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 表观基因组整合分析 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表观基因组学 | NA | NA |
| 1353 | 2025-10-07 |
The Potential Biological Roles and Clinical Significance of Anaphase-Promoting Complex Subunit 1 in Colorectal Cancer
2025 Jan-Dec, Cancer control : journal of the Moffitt Cancer Center
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10732748251330059
PMID:40229946
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研究论文 | 本研究全面评估了ANAPC1在结直肠癌中的异常表达模式、生物学行为及临床意义 | 首次整合大规模mRNA表达数据、单细胞RNA测序和免疫组化数据,全面揭示ANAPC1在结直肠癌中的生物学功能 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探讨ANAPC1在结直肠癌发生发展中的潜在生物学作用和临床意义 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RT-PCR, western blot, CCK-8, 伤口愈合实验, 细胞周期分析, 细胞凋亡检测 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像, 体外实验数据 | 2329个mRNA表达数据样本, 416个组织样本, HCT-116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1354 | 2025-10-07 |
Macrophages and cardiac lesion in zebrafish: what can single-cell RNA sequencing reveal?
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1570582
PMID:40290186
|
综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术揭示斑马鱼心脏损伤中巨噬细胞的作用 | 首次系统综述单细胞RNA测序在斑马鱼心脏再生过程中巨噬细胞表型可塑性研究的应用 | 缺乏损伤后期时间点的研究数据,不同损伤模型间的比较不够充分 | 探讨单细胞RNA测序在揭示斑马鱼心脏损伤再生过程中巨噬细胞作用的研究价值 | 斑马鱼心脏损伤模型中的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1355 | 2025-10-07 |
Integrating multi-omics and experimental techniques to decode ubiquitinated protein modifications in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1545472
PMID:40290433
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和实验技术,系统探索了泛素化修饰在肝细胞癌肿瘤微环境中的调控作用 | 首次系统整合多组学数据和空间转录组学分析肝细胞癌中泛素化修饰的细胞类型特异性作用,并鉴定UBE2C作为关键调控因子 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接验证 | 探索泛素化修饰在肝细胞癌肿瘤微环境形成和免疫调节中的作用机制 | 肝细胞癌组织、肿瘤微环境中的浆细胞、成纤维细胞、内皮细胞和上皮-间质转化细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、空间转录组学、transwell实验、CCK8实验、伤口愈合实验 | NA | 多组学数据、转录组数据、空间转录组数据、实验数据 | 多个公共肝细胞癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1356 | 2025-10-07 |
Identification and Experimental Validation of PANoptosis-Related Genes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis by Bioinformatics Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505229
PMID:40291456
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别并实验验证特发性肺纤维化中与PANoptosis相关的基因 | 首次在IPF中建立包含IGF1、GPX3、GADD45β、SMAD7和TIMP3的五基因PANoptosis相关特征 | 需要进一步研究阐明这些基因在IPF发病机制中的生物学功能和机制 | 识别特发性肺纤维化中与PANoptosis相关的差异表达基因并解释其免疫景观和细胞分布特征 | 特发性肺纤维化患者和博来霉素诱导的肺纤维化模型 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 生物信息学分析,机器学习算法,单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集和博来霉素诱导的肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1357 | 2025-10-07 |
Dynamic changes in lactate-related genes in microglia and their role in immune cell interactions after ischemic stroke
2025, Open medicine (Warsaw, Poland)
DOI:10.1515/med-2025-1178
PMID:40292254
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研究论文 | 本研究揭示了缺血性卒中后小胶质细胞中乳酸相关基因的动态变化及其与免疫细胞的相互作用 | 首次系统识别了缺血性卒中后小胶质细胞中关键的乳酸相关基因,并阐明了它们在疾病不同阶段的动态调控作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 阐明缺血性卒中后小胶质细胞中乳酸相关基因的动态变化及其与免疫细胞的关联 | 小鼠缺血性卒中模型中的小胶质细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 差异表达分析, t-SNE, CIBERSORT | NA | 基因表达数据 | 三个公共数据集(GSE30655, GSE35338, GSE174574, GSE225948) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1358 | 2025-10-07 |
Mechanistic study of the regulation of mitochondrial function by the GPNMB/Nrf2/NF-κB signaling pathway mediated by Quzhi Tang to alleviate chondrocyte senescence
2025-Jan-31, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2024.119165
PMID:39617085
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研究论文 | 本研究探讨祛痹汤通过调控GPNMB/Nrf2/NF-κB信号通路修复线粒体损伤并缓解软骨细胞衰老的机制 | 首次结合单细胞转录组分析识别衰老关键靶点GPNMB,并阐明祛痹汤通过该靶点调控线粒体功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床样本中验证 | 探究祛痹汤治疗膝骨关节炎的药理机制 | 小鼠软骨细胞及软骨组织 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组分析,siRNA干扰,慢病毒转染,分子生物学方法 | NA | 转录组数据,组织病理学数据 | 小鼠软骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1359 | 2025-10-07 |
mSphere of Influence: How the single cell contributes to the collective
2025-Jan-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00431-24
PMID:39660837
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评论 | 本文讨论了细菌单细胞RNA测序技术如何帮助理解单个细胞对微生物生态系统过程的贡献 | 重点介绍了两种新兴的细菌单细胞RNA测序方法及其在微生物生态学研究中的应用价值 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何促进对微生物生态系统中单个细胞作用的理解 | 人类微生物组中的细菌单细胞 | 微生物生态学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 组合索引法和分池条形码法两种细菌单细胞RNA测序技术 |
| 1360 | 2025-10-07 |
The role of CD101 and Tim3 in the immune microenvironment of gastric cancer and their potential as prognostic biomarkers
2025-Jan-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113835
PMID:39700955
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研究论文 | 本研究探讨CD101和Tim3在胃癌免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次系统分析CD101-Tim3+ CD8+ T细胞和CD101+Tim3+ CD8+ T细胞的差异表达基因,并构建基于14个预后基因的风险评分模型 | 未明确说明样本来源和样本量,缺乏外部验证队列 | 阐明胃癌的分子机制,发现新的生物标志物和治疗策略 | 胃癌患者及其免疫微环境中的CD8+ T细胞亚群 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 细胞通讯分析, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |