单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1950 篇文献，本页显示第 1321 - 1340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1321 | 2025-10-07 |
PD-1 activation mitigates lupus nephritis by suppressing hyperactive and heterogeneous PD-1+CD8+ T cells
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.107418
PMID:40303350
|
研究论文 | 本研究揭示PD-1+CD8+ T细胞在狼疮性肾炎中的过度活跃特性，并通过PD-L1 Fc融合蛋白治疗验证其治疗潜力 | 首次系统阐明PD-1+CD8+ T细胞在自身免疫疾病中的非耗竭特性，发现其具有克隆扩增和过度活化特征 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究PD-1+CD8+ T细胞在狼疮性肾炎中的作用机制及治疗策略 | 狼疮性肾炎患者和NZB/W F1小鼠 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, q-PCR, 流式细胞术, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | 狼疮性肾炎患者和NZB/W F1小鼠（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1322 | 2025-10-07 |
Identification of disulfidptosis in esophageal squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq data to predict prognosis and treatment response
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567793
PMID:40303412
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA-seq数据识别食管鳞状细胞癌中的二硫键死亡特征，构建预后模型并预测治疗反应 | 首次在食管鳞癌中系统识别二硫键死亡相关分子亚型，构建具有独立预后价值的特征模型，并发现潜在靶向药物 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 建立食管鳞癌预后预测模型并探索治疗靶点 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞测序 | Cox回归, LASSO-Cox回归 | 基因表达数据 | GSE53625和TCGA-ESCC队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1323 | 2025-10-07 |
Heterogenous cancer-associated fibroblasts related tumor microenvironment marked by CD10/KLF4/TIAM1 were identified in pancreatic adenocarcinoma by integrated transcriptomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1557698
PMID:40303408
|
研究论文 | 通过整合转录组学识别胰腺导管腺癌中CD10/KLF4/TIAM1标记的异质性癌症相关成纤维细胞相关肿瘤微环境 | 首次系统识别胰腺癌中三种不同的CAF相关TME亚型，并发现关键CAF亚群与肿瘤细胞和巨噬细胞的相互作用机制 | 研究样本量有限，需要进一步验证CAF亚型在治疗反应中的具体作用机制 | 探索胰腺导管腺癌肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞亚型的组成、比例及其临床意义 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 整合转录组学，多重免疫组织化学，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，转录组分析 | NA | NA |
| 1324 | 2025-10-07 |
Decoding immune cell dynamics in ischemic stroke: insights from single-cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1549518
PMID:40303468
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析解码缺血性卒中中的免疫细胞动态 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析缺血性卒中中的细胞类型、吞噬作用及相关分子机制 | 样本量相对有限（5,582个单细胞），仅基于生物信息学分析需要实验验证 | 研究缺血性卒中的细胞类型和分子生物学过程 | 健康对照和缺血性卒中患者的单细胞 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序 | UMAP, iTALK | 基因表达数据 | 5,582个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1325 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of Renal Endothelial Cells, Interact with Neighboring Cells, and Endothelial Injury in Chronic Kidney Disease: Mechanisms and Therapeutic Implications
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.108299
PMID:40303495
|
综述 | 探讨肾脏内皮细胞异质性及其与邻近细胞相互作用在慢性肾脏病中的机制与治疗意义 | 整合单细胞测序技术揭示肾脏内皮细胞异质性及其微环境影响的最新研究进展 | 作为综述文章，未包含原始实验数据验证 | 阐明慢性肾脏病中内皮细胞异质性及损伤机制，探索治疗策略 | 肾脏内皮细胞及其与邻近细胞的相互作用 | 单细胞生物学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1326 | 2025-10-07 |
Comprehensive Characterization of the Oxidative Stress Profiles in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.109008
PMID:40303487
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk-RNA测序和单细胞RNA测序数据，系统揭示了坏死性小肠结肠炎中氧化应激特征及相关机制 | 首次整合bulk-RNA和单细胞RNA测序数据系统分析NEC中氧化应激特征，识别了关键枢纽基因和四种巨噬细胞亚型 | 枢纽基因列表在摘要中未完整呈现，具体药物名称也未明确列出 | 阐明坏死性小肠结肠炎中氧化应激特征，识别关键基因和相关机制，探索潜在治疗药物 | 坏死性小肠结肠炎组织和细胞，NEC小鼠模型 | 生物信息学 | 坏死性小肠结肠炎 | bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 免疫荧光染色, 差异分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | NEC小鼠模型 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1327 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of m6A-SNPs and single-cell RNA sequencing reveals key drivers of endocrine combined with CDK4/6 inhibitor therapy resistance in ER+ breast cancer
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1590363
PMID:40303916
|
研究论文 | 通过整合m6A-SNPs和单细胞RNA测序分析，揭示ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药的关键驱动因素 | 首次结合m6A-SNPs和单细胞RNA测序技术，在单细胞分辨率下解析ER+乳腺癌治疗耐药的分子机制 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索m6A修饰在ER+乳腺癌对内分泌联合CDK4/6抑制剂治疗耐药中的作用机制 | ER阳性乳腺癌患者 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 伪时间轨迹分析 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据, GWAS数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1328 | 2025-10-07 |
Single Cell Transcriptomics Genomics Based on Machine Learning Algorithm: Constructing and Validating Neutrophil Extracellular Trap Gene Model in COPD
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S516139
PMID:40308227
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学数据，通过机器学习算法构建并验证了针对吸烟和非吸烟COPD患者的中性粒细胞胞外诱捕网特征基因模型 | 首次针对吸烟和非吸烟COPD患者分别构建了NET特征基因模型，并进行了内外验证 | 样本量相对有限，需要在更大队列中进一步验证模型的普适性 | 识别不同COPD患者中的中性粒细胞胞外诱捕网特征基因 | COPD和非COPD个体的中性粒细胞 | 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | COPD和非COPD个体的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1329 | 2025-10-07 |
The suppressive role of GLS in radiosensitivity and irradiation-induced immune response in LUAD: integrating bioinformatics and experimental insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582587
PMID:40308578
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验验证揭示了谷氨酰胺酶(GLS)在肺腺癌放射敏感性和放疗诱导免疫应答中的抑制作用 | 首次系统阐明GLS通过调控铁死亡和免疫景观重塑在肺腺癌放疗中的双重调节作用，并建立了GLS-DSBr预后预测模型 | GLS调控免疫应答的具体分子机制仍需进一步深入研究 | 探究GLS在肺腺癌放射敏感性和放疗诱导免疫应答中的作用机制及临床价值 | 肺腺癌(LUAD)细胞、动物模型和2,066例LUAD患者数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq、单细胞转录组学、空间转录组学、流式细胞术、共培养实验 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 2,066例LUAD患者 | NA | bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1330 | 2025-10-07 |
Harnessing single-cell and multi-omics insights: STING pathway-based predictive signature for immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1575084
PMID:40308576
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组数据，开发了基于STING通路的肺腺癌免疫治疗反应预测标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据，开发STING通路相关特征，并通过动物实验验证关键基因ERRFI1的免疫调节功能 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证预测模型的临床适用性 | 探索STING信号通路与肺腺癌免疫治疗反应的关系，开发预测性生物标志物 | 肺腺癌患者样本数据和小鼠模型 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 多色流式细胞术, 生物信息学分析 | 101种机器学习框架 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GEO和TCGA数据库的公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1331 | 2025-10-07 |
The single-cell atlas of short-chain fatty acid receptors in human and mice hearts
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1538384
PMID:40308581
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据绘制人和小鼠心脏中短链脂肪酸受体FFAR2/3的分布图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘FFAR2/3受体在正常和梗死心脏中的分布特征 | 基于公共数据库分析，缺乏实验验证 | 阐明短链脂肪酸受体在心脏中的分布模式和作用机制 | 人和小鼠心脏组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个公共单细胞RNA-seq和单核RNA-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclear RNA-seq | NA | NA |
| 1332 | 2025-10-07 |
Multi-omics landscape of alternative splicing in diffuse midline glioma reveals immune- and neural-driven subtypes with implications for spliceosome-targeted therapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587009
PMID:40308585
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了弥漫性中线胶质瘤中可变剪接的景观，识别了神经和免疫驱动的亚型 | 首次在H3K27突变弥漫性中线胶质瘤中系统分析可变剪接景观，并基于RNA结合蛋白建立了新的疾病亚型分类 | 研究主要基于细胞系和已发表数据集，需要进一步在临床样本中验证 | 探索可变剪接在弥漫性中线胶质瘤中的作用及其治疗意义 | H3WT和H3K27突变弥漫性中线胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 弥漫性中线胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 患者来源的细胞系和已发表数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1333 | 2025-10-07 |
Artificial intelligence-assisted RNA-binding protein signature for prognostic stratification and therapeutic guidance in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583103
PMID:40308601
|
研究论文 | 开发人工智能辅助的RNA结合蛋白特征模型用于乳腺癌预后分层和治疗指导 | 首次构建基于三个关键RBP基因的人工智能辅助特征模型，在14个队列9000+患者中验证其预后价值并揭示相关分子机制 | 需要在更多样化人群中验证结果，并扩展功能分析研究 | 提高乳腺癌预后准确性并指导个性化治疗 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，基因组分析 | 机器学习模型组合 | 基因组数据，转录组数据，单细胞数据 | 14个队列9000+患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1334 | 2025-10-07 |
SUMOylation substrate encoding genes as prognostic biomarkers in pancreatic ductal adenocarcinoma with functional assessment of SAF-B2
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1532658
PMID:40308776
|
研究论文 | 本研究通过构建SUMOylation相关预后模型Sscore，揭示了SAFB2在胰腺导管腺癌中的肿瘤抑制功能 | 首次构建基于SUMOylation底物编码基因的预后模型Sscore，并发现SAFB2通过抑制Wnt/β-Catenin通路发挥抑癌作用 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要进一步体内实验验证 | 探讨SUMOylation在胰腺导管腺癌中的预后价值及相关分子机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | Western blot, 单细胞RNA测序, LASSO回归, Cox回归 | 预后风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1335 | 2025-10-07 |
Animal and vegetal materials of mouse oocytes segregate at first zygotic cleavage: a simple mechanism that makes the two-cell blastomeres differ reciprocally from the start
2025-Jan-17, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaae045
PMID:39786543
|
研究论文 | 本研究通过控制小鼠卵母细胞受精位点，揭示了第一次合子分裂时动植物物质分离的机制 | 首次证明哺乳动物第一次卵裂会分离动植物物质，使两个卵裂球从一开始就具有差异 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步验证在其他哺乳动物中的适用性 | 探究两个细胞期胚胎卵裂球差异形成的机制 | 小鼠卵母细胞和两个细胞期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析、ICSI（卵胞浆内单精子注射）、图像分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 不同受精位点的小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1336 | 2025-10-07 |
Transcriptional dynamics during karyogamy in rice zygotes
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204497
PMID:39777484
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水稻合子核配过程中的基因表达动态 | 首次在植物合子中系统分析核配期间的转录动态，发现父本等位基因在核融合开始时激活表达 | 仅关注早期发育阶段（6小时内），未涉及更后期的胚胎发育过程 | 探究植物合子核配过程中的转录调控机制 | 水稻合子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，时间序列分析 | NA | 转录组数据 | 六个发育时间点的水稻合子（15分钟，30分钟，1小时，2小时，4小时，6小时） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1337 | 2025-10-07 |
[WWP1 plays a positive role in ameloblast differentiation and enamel formation in mice]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨了WWP1在小鼠成釉细胞分化和釉质形成中的积极作用 | 首次通过单细胞RNA测序和基因敲除模型系统揭示了WWP1在釉质发育中的关键功能 | 研究仅限于小鼠模型，样本量相对较小（每组3-6只小鼠） | 研究WWP1在釉质发育中的作用机制 | 小鼠切牙组织和下颌第一磨牙牙胚 | 发育生物学 | 牙釉质发育异常 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 显微CT, 扫描电镜, 能量色散谱, 免疫荧光, Western blot | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质表达数据 | P1和P7每组3只小鼠，P14、P28、2月龄和3月龄每组6只小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1338 | 2025-10-07 |
[Advances in tooth development studies based on single-cell RNA sequencing]
2025-Jan-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 总结单细胞RNA测序技术在牙齿发育研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示牙齿发育过程中的细胞异质性和发育轨迹 | NA | 阐明牙齿发育的复杂生物学过程并识别潜在治疗靶点 | 牙齿发育过程中的上皮细胞和间充质细胞 | 单细胞生物学 | 口腔发育疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1339 | 2025-10-07 |
Tumor-initiating cells escape tumor immunity via CCL8 from tumor-associated macrophages in mice
2025-Jan-07, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI180893
PMID:39774471
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤起始细胞通过肿瘤相关巨噬细胞分泌的CCL8逃避免疫清除的机制 | 首次发现WNT激活的恶性细胞亚群作为肿瘤起始细胞，并阐明其通过GAS6/AXL/MERTK信号通路与调节性TAMs相互作用介导免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究肿瘤起始细胞逃避免疫清除的分子机制 | 小鼠肿瘤模型中的肿瘤起始细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,双重组酶谱系追踪,基因敲除 | Axl/Mertk条件性双敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1340 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies CXADR as a fate determinant of the placental exchange surface
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55597-w
PMID:39747179
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别CXADR作为胎盘交换表面命运决定因子的研究 | 首次发现连接区前体细胞与迷路层Syncytiotrophoblast-I谱系具有相似分化轨迹，并鉴定CXADR作为调控胎盘迷路层两个合体层分化动态的关键表面蛋白 | 研究仅基于小鼠模型，人类胎盘发育可能存在差异 | 解析滋养层细胞谱系分化的分子机制及其在胎盘形成中的作用 | 小鼠滋养层干细胞及其早期分化过程 | 单细胞生物学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠滋养层干细胞分化过程中的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |