单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1323 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2024-12-12 |
Single-cell analysis combined with transcriptome sequencing identifies autophagy hub genes in macrophages after spinal cord injury
2025-Jan, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110412
PMID:39612968
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组测序联合分析，揭示了脊髓损伤后巨噬细胞中自噬枢纽基因的变化 | 首次通过单细胞RNA测序和转录组测序的联合分析，揭示了脊髓损伤后巨噬细胞中自噬枢纽基因的变化 | 实验仅限于脊髓损伤后的巨噬细胞，未涉及其他细胞类型或疾病模型 | 探索脊髓损伤后巨噬细胞中自噬枢纽基因的变化及其分子机制 | 脊髓损伤后的巨噬细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和转录组测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1302 | 2024-12-11 |
Identification of cancer-associated fibrolast subtypes and distinctive role of MFAP5 in CT-detected extramural venous invasion in gastric cancer
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102188
PMID:39531783
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研究论文 | 研究报告了MFAP5+癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中通过调节乳酸化修饰促进CT检测到的壁外静脉侵犯（EMVI）的形成 | 首次揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌中通过调节乳酸化修饰促进EMVI形成的作用，为胃癌的诊断和治疗提供了新的参考 | 研究样本量较小，仅涉及13名胃癌患者，可能影响结果的普适性 | 探讨癌症相关成纤维细胞在胃癌中的作用及其对壁外静脉侵犯的影响 | 胃癌患者的病理样本和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序、免疫组化、慢病毒敲低 | NA | 基因表达数据、图像 | 13名胃癌患者的病理样本 |
| 1303 | 2024-12-11 |
Machine learning-derived natural killer cell signature predicts prognosis and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2024.102180
PMID:39536695
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研究论文 | 本文通过整合多种机器学习算法，建立了一个与自然杀伤细胞相关的风险模型，用于预测透明细胞肾细胞癌患者的预后和治疗反应 | 本文创新性地整合了十种不同的机器学习算法，建立了包含18个基因的风险模型，能够准确预测透明细胞肾细胞癌患者的预后，并揭示了自然杀伤细胞与其他细胞亚群之间的复杂信号相互作用 | 本文主要基于TCGA和GEO数据库的数据进行分析，未涉及大规模的临床验证 | 研究自然杀伤细胞在透明细胞肾细胞癌中的作用，并建立预测患者预后和治疗反应的风险模型 | 透明细胞肾细胞癌患者的转录组数据、临床数据以及自然杀伤细胞的功能和表达模式 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、IHC、CCK8检测、流式细胞术 | Coxboost plus plsRcox | 转录组数据 | TCGA数据库中的透明细胞肾细胞癌转录组数据和临床数据，以及GEO数据库中的单细胞测序数据 |
| 1304 | 2024-12-10 |
Local ablation disrupts immune evasion in pancreatic cancer
2025-Jan-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.217327
PMID:39580047
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研究论文 | 研究局部消融技术在胰腺癌中打破免疫逃逸的作用 | 首次探讨了局部消融技术在胰腺癌中激活宿主免疫系统并克服免疫治疗抵抗的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本，需要进一步的临床试验验证 | 探讨局部消融技术在胰腺癌中的免疫调节作用及其与免疫治疗的协同效应 | 胰腺癌模型、人类胰腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 局部消融技术 | NA | 空间转录组学、组织学技术 | 小鼠模型、人类样本 |
| 1305 | 2024-12-09 |
Granuloma Annulare Exhibits Mixed Immune and Macrophage Polarization Profiles with Spatial Transcriptomics
2025-Jan, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2024.04.024
PMID:38844128
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研究论文 | 研究了环状肉芽肿（GA）的空间转录组学特征，揭示了其免疫和巨噬细胞极化的混合模式 | 首次使用空间转录组学技术分析GA的空间基因表达模式，揭示了GA微环境中T辅助1和T辅助2信号的混合特征以及M1和M2巨噬细胞的极化特性 | 研究样本量较小，仅涉及6名患者，可能影响结果的普遍性 | 通过空间转录组学技术深入理解环状肉芽肿（GA）的空间基因表达模式 | 环状肉芽肿（GA）患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 6名环状肉芽肿（GA）患者 |
| 1306 | 2024-12-07 |
Neonatal inflammation impairs developmentally-associated microglia and promotes a highly reactive microglial subset
2025-Jan, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.09.019
PMID:39322088
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研究论文 | 研究新生儿炎症对小鼠神经发育障碍模型中脑髓样细胞亚群的影响 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别出表达补体受体C5ar1的特定微胶质细胞亚群，并发现其在炎症途径中高度激活 | NA | 探讨新生儿炎症对神经发育障碍中微胶质细胞发育轨迹的影响 | 小鼠神经发育障碍模型中的脑髓样细胞亚群 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 1307 | 2024-12-05 |
Endothelial Angpt2 Promotes Adipocyte Progenitor Cells Maturation to Increase Visceral Adipose Tissue Accumulation
2025-Jan, Diabetes/metabolism research and reviews
DOI:10.1002/dmrr.70012
PMID:39628006
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研究论文 | 研究探讨了内皮细胞Angpt2在促进脂肪前体细胞成熟和内脏脂肪组织积累中的作用 | 揭示了JAK1/STAT3信号通路激活下内皮细胞分泌的Angpt2通过整合素-α5β1信号促进脂肪前体细胞从MSLN表型向CFD表型转变，从而促进内脏脂肪组织积累的新机制 | 研究样本量较小，且仅限于肥胖和糖尿病患者，可能影响结果的普适性 | 探究内脏脂肪组织积累的具体机制 | 内脏脂肪组织、内皮细胞、脂肪前体细胞 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序(scRNAseq)、PCR、WB、免疫荧光染色、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 13个内脏脂肪组织样本，来自5名肥胖和糖尿病患者、9名肥胖患者和1名正常BMI个体 |
| 1308 | 2024-11-27 |
Droplet-Based Single-Cell 3' mRNA Sequencing of Marburg Virus-Infected Samples
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4256-6_27
PMID:39585636
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研究论文 | 描述了一种基于液滴的单细胞3' mRNA测序方法，用于研究马尔堡病毒感染的样本 | 使用10× Chromium Next GEM单细胞基因组学技术，首次在体内研究马尔堡病毒感染的非人灵长类血液样本 | 研究在BSL-4实验室进行，操作复杂且需要严格的生物安全措施 | 揭示病毒与宿主相互作用的转录组复杂性 | 马尔堡病毒感染的单细胞样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 非人灵长类血液样本 |
| 1309 | 2024-11-25 |
The impact of cathepsins on liver hepatocellular carcinoma: Insights from genetic and functional analyses
2025-Jan-30, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.149064
PMID:39486661
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研究论文 | 研究探讨了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次系统研究了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用，并揭示了其在细胞增殖和信号传导中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和现有数据库分析，缺乏临床试验验证 | 探讨组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌及其相关组织蛋白酶E的表达和功能 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、免疫组化分析、siRNA技术 | NA | RNA | 包括HepG2和Huh7细胞系在内的多个样本 |
| 1310 | 2024-11-24 |
Using Callus as an Ex Vivo System for Chromatin Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4228-3_18
PMID:39576610
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综述 | 本文综述了下一代测序技术在表观遗传学研究中的应用，并探讨了使用子叶衍生愈伤组织作为体外系统进行染色质分析的优势 | 本文提出了使用子叶衍生愈伤组织作为简单、易获取且稳健的平台，用于高通量多组学分析 | 本文未提及具体的实验数据或结果，主要集中在方法论的讨论上 | 探讨表观遗传机制的复杂性及其在基因调控中的作用 | DNA甲基化和组蛋白修饰谱 | 表观遗传学 | NA | 下一代测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 1311 | 2024-11-22 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-Jan-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究探讨了神经炎症通过小胶质细胞吞噬PNNs导致PV阳性中间神经元功能障碍和相关γ振荡，从而引发小鼠认知障碍的机制 | 首次揭示了小胶质细胞吞噬PNNs在神经炎症诱导的认知障碍中的关键作用，并提出ApoE可能介导这一过程 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨神经炎症导致认知障碍的具体机制 | 小鼠的认知功能、神经振荡、小胶质细胞基因表达 | 神经科学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 |
| 1312 | 2024-11-20 |
Research progress and the prospect of using single-cell sequencing technology to explore the characteristics of the tumor microenvironment
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101239
PMID:39552788
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤微环境研究中的进展和应用前景 | 本文提出了单细胞多组学测序技术的整合，并探讨了其在生物研究和医学调查中的潜力 | 本文讨论了使用单细胞测序技术探索肿瘤微环境的优缺点 | 解决肿瘤内异质性问题，为精准癌症治疗提供支持 | 肿瘤微环境中的细胞异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 1313 | 2024-11-18 |
Dissection of Gene Expression at the Single-Cell Level: scRNA-seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4192-7_9
PMID:39546202
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在基因表达研究中的应用 | scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率揭示基因表达特征，识别与疾病相关的新细胞类型 | NA | 深入理解基因表达的单细胞分辨率 | 单细胞RNA测序技术及其在基因表达研究中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数千到数百万个转录本 |
| 1314 | 2024-11-15 |
Analysis of the pluripotent and germline marker gene expression, and the state of X chromosome reactivation of primordial germ cells in pig gonads
2025-Jan-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 研究分析了猪性腺原始生殖细胞（PGCs）的多能性和性染色体再激活状态 | 首次揭示了猪性腺PGCs的异质性，并鉴定了GDF3作为其特异性表面标记 | NA | 评估猪性腺PGCs的多能性状态、特定基因表达模式和性染色体再激活 | 猪性腺原始生殖细胞（PGCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1315 | 2024-11-09 |
ERP44 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for glioma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Jan-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2024.148963
PMID:39341519
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研究论文 | 研究探讨了ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响 | 首次整合蛋白质组学、单细胞和批量RNA测序数据，研究ERP44在胶质瘤患者中的潜在功能 | NA | 探讨ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响 | ERP44在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)，批量RNA测序，蛋白质组学 | NA | RNA | 使用了TCGA数据集、GSE50161、GSE4290以及qRT-PCR验证的数据 |
| 1316 | 2024-11-08 |
High-throughput and multimodal profiling of antigen-specific T cells with a droplet-based cell-cell interaction screening platform
2025-Jan-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116815
PMID:39348735
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研究论文 | 开发了一种基于液滴的细胞间相互作用筛选平台DropCCI，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞 | 提出了DropCCI方法，通过液滴封装DNA条码和抗原负载的抗原呈递细胞，结合点击化学修饰的T细胞，实现了高通量、无污染的多模态分析 | NA | 开发一种新的策略，用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞，以改进T细胞免疫疗法的设计 | 抗原特异性T细胞 | 生物技术 | NA | 点击化学 | NA | 单细胞组学数据 | NA |
| 1317 | 2024-10-24 |
High-throughput single-cell sequencing of activated sludge microbiome
2025-Jan, Environmental science and ecotechnology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.ese.2024.100493
PMID:39430728
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研究论文 | 研究通过高通量单细胞测序技术分析了活性污泥微生物群落，揭示了微生物群落中的基因组异质性和潜在的新物种 | 首次应用高通量单细胞测序技术分析活性污泥微生物群落，揭示了微生物暗物质的存在，并发现了大量的抗生素抗性基因、质粒片段和噬菌体基因组 | 研究主要集中在活性污泥微生物群落，未涉及其他环境中的微生物群落 | 探索活性污泥微生物群落的基因组异质性，揭示微生物暗物质和水平基因转移过程 | 活性污泥微生物群落 | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 15,110个单细胞 |
| 1318 | 2024-10-21 |
Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4188-0_5
PMID:39424722
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研究论文 | 本文描述了一种从单个人类B细胞中克隆抗体的策略 | 该方法能够在单细胞水平上无偏差地表征人类抗体库，并通过RT-PCR技术生成重组单克隆抗体 | NA | 研究B细胞淋巴瘤的克隆进化和抗体反应性 | 人类B细胞及其抗体反应性 | NA | 淋巴瘤 | RT-PCR | NA | NA | 单个人类B细胞 |
| 1319 | 2024-10-21 |
Single Cell VDJ Sequencing of Normal and Malignant B and T Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4188-0_14
PMID:39424731
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研究论文 | 本文介绍了单细胞VDJ测序技术在正常和恶性B细胞及T细胞中的应用和分析方法 | 本文扩展了单细胞测序技术的应用范围，包括表面分子表达、DNA可及性、抗原特异性以及B或T细胞受体库的分析 | NA | 探讨单细胞VDJ测序技术在肿瘤研究中的应用，特别是B和T细胞克隆在淋巴瘤、白血病及其他类型癌症中的作用 | 正常和恶性B细胞及T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 最多可达60,000个细胞 |
| 1320 | 2024-10-16 |
Profiling the cell diversity and tissue structure of aqueous humor circulatory system in human eyes using spatial single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2024.101304
PMID:39403690
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |