单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1543 篇文献，本页显示第 1281 - 1300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1281 | 2025-02-05 |
Sonic hedgehog medulloblastoma cells in co-culture with cerebellar organoids converge towards in vivo malignant cell states
2025 Jan-Dec, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdae218
PMID:39896075
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研究论文 | 本研究通过将Sonic hedgehog髓母细胞瘤（SHH-MB）细胞与小脑类器官共培养，探讨了非恶性肿瘤微环境对SHH-MB细胞表型特性的影响 | 开发了一种新型的体外SHH-MB模型，揭示了微环境对肿瘤细胞状态的非细胞自主性诱导作用 | 研究仅基于两种SHH-MB细胞系，可能无法完全代表所有SHH-MB亚型的特性 | 识别由非恶性肿瘤微环境驱动的SHH-MB细胞表型特性 | Sonic hedgehog髓母细胞瘤（SHH-MB）细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 两种SHH-MB细胞系与小脑类器官共培养 |
| 1282 | 2025-02-05 |
Single-cell analysis reveals islet autoantigen's immune activation in type 1 diabetes patients
2025-Jan, Journal of clinical biochemistry and nutrition
IF:2.0Q3
DOI:10.3164/jcbn.24-86
PMID:39896168
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术，全面检测了1型糖尿病患者外周血单核细胞在GAD、IA-2和胰岛素抗原重叠肽刺激下的基因表达和T细胞受体库 | 首次在单细胞水平上揭示了1型糖尿病患者胰岛自身抗原的免疫激活机制，并发现了T细胞受体β链在特定配对中的单克隆增加 | 样本量较小，仅包括20名男性患者，且仅对其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 | 研究1型糖尿病的发病机制，寻找潜在的治疗靶点 | 1型糖尿病患者的外周血单核细胞 | 单细胞测序 | 1型糖尿病 | 单细胞测序，T细胞受体库分析 | NA | 单细胞基因表达数据，T细胞受体序列数据 | 20名男性1型糖尿病患者，其中4名进行了BD Rhapsody系统分析 |
| 1283 | 2025-02-05 |
CLEC11A-Driven Molecular Mechanisms in Intervertebral Disc Degeneration: A Comprehensive Multi-Omics Study
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505296
PMID:39897524
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CLEC11A在椎间盘退变（IVDD）中的分子机制 | 结合MR、转录组测序和单细胞转录组学，首次揭示了CLEC11A通过调控炎症介质ARTN和血清代谢物在IVDD中的关键作用 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证 | 揭示IVDD的遗传发病机制和关键驱动因素 | 椎间盘退变（IVDD） | 生物信息学 | 椎间盘退变 | MR、转录组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA |
| 1284 | 2025-02-04 |
DUX4-stimulated genes define the antiviral response to herpesviruses in human trophoblasts
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634317
PMID:39896594
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研究论文 | 本文研究了人类滋养层细胞对七种致畸病毒的反应，发现疱疹病毒诱导了DUX4刺激基因（DSGs）的表达，这些基因在滋养层细胞中具有独特的抗病毒功能 | 揭示了DUX4及其刺激基因（DSGs）在滋养层细胞中作为抗疱疹病毒防御机制的关键作用，填补了滋养层细胞对致畸病毒反应理解的空白 | 研究仅限于七种致畸病毒，且主要关注疱疹病毒，未涵盖所有可能的病毒类型 | 探讨滋养层细胞对致畸病毒的抗病毒反应机制 | 人类滋养层细胞 | 分子生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类滋养层细胞器官样体 |
| 1285 | 2025-02-04 |
Accurate tiling of spatial single-cell data with Tessera
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633630
PMID:39896464
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1286 | 2025-02-03 |
Sp3 ameliorated experimental autoimmune encephalomyelitis by triggering Socs3 in Th17 cells
2025-Jan-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.051
PMID:39884649
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研究论文 | 本研究探讨了Sp3在Th17细胞介导的实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的作用及其分子机制 | 揭示了Sp3通过上调Socs3抑制RORγt表达及Stat3和Smad2/3的磷酸化，从而改善EAE症状的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索Sp3对Th17细胞介导的EAE的影响及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型小鼠及Th17细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | scRNA-seq数据分析、流式细胞术、ELISA、PCR、WB、免疫荧光和报告基因技术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | Sp3+/+CD4Cre小鼠和Sp3+/-基因敲除小鼠 |
| 1287 | 2025-01-31 |
Epidermal stem cell derived exosomes-induced dedifferentiation of myofibroblasts inhibits scarring via the miR-203a-3p/PIK3CA axis
2025-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03157-9
PMID:39881312
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学和单细胞测序技术，探讨了表皮干细胞来源的外泌体（EpiSC-EVs）通过miR-203a-3p/PIK3CA轴抑制肌成纤维细胞去分化，从而减少瘢痕形成的机制 | 首次揭示了EpiSC-EVs通过miR-203a-3p抑制PIK3CA表达和PI3K/AKT/mTOR通路过度激活，从而促进肌成纤维细胞去分化的分子机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证其安全性和有效性 | 探索抑制瘢痕形成的分子机制和潜在治疗方法 | 肌成纤维细胞和瘢痕组织 | 细胞生物学 | 瘢痕 | 比较转录组学、单细胞测序、miRNA测序、超速离心、过滤、Western blotting、免疫荧光 | NA | 转录组数据、单细胞数据、miRNA数据 | NA |
| 1288 | 2025-02-02 |
Cholesterol restriction primes antiviral innate immunity via SREBP1-driven noncanonical type I IFNs
2025-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00346-9
PMID:39668245
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研究论文 | 本文探讨了胆固醇代谢与先天免疫反应之间的关系，特别是通过SREBP1驱动的非经典I型干扰素（IFN）表达来增强RIG-I依赖的抗病毒反应 | 揭示了胆固醇合成限制通过SREBP1转录因子依赖的方式诱导非经典I型IFN（如IFN-ω）的表达，从而增强RIG-I介导的信号传导 | 研究主要集中于特定细胞类型和小鼠模型，尚未在更广泛的生物体或临床环境中验证 | 研究胆固醇代谢如何影响先天免疫反应，特别是RIG-I依赖的抗病毒反应 | 特定细胞类型和小鼠模型 | 免疫学 | 病毒感染 | 化学筛选、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和特定细胞类型 |
| 1289 | 2025-02-01 |
Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage during PRRSV infection with different virulence
2025-Jan-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54676-2
PMID:39875369
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，评估了不同毒力PRRSV感染期间支气管肺泡灌洗液中免疫细胞组成的变化及其临床结果 | 揭示了高毒力和中等毒力PRRSV感染在肺损伤时间点、免疫细胞组成变化及机制上的差异，特别是发现了抗炎M2样巨噬细胞在肺恢复中的作用 | 研究主要关注PRRSV感染，结果可能不直接适用于其他呼吸道病毒感染 | 理解PRRSV不同毒力水平对免疫细胞组成和临床结果的影响，以促进疾病管理和疫苗开发 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 生物信息学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1290 | 2025-02-01 |
RASGRF2 as a potential pathogenic gene mediating the progression of alcoholic hepatitis to alcohol-related cirrhosis and hepatocellular carcinoma
2025-Jan-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01853-4
PMID:39875737
|
研究论文 | 本研究通过多转录组数据库分析，确定了酒精性肝炎（AH）和肝细胞癌（HCC）之间的潜在共享基因，并验证了RASGRF2作为核心共享基因的作用 | 首次通过多转录组数据库和机器学习算法筛选出AH和HCC之间的共享基因，并验证了RASGRF2在AH向酒精性肝硬化（AC）和HCC进展中的致病作用 | 研究主要依赖于转录组数据和体外实验，缺乏体内实验验证 | 确定AH和HCC之间的共享基因，并验证其在疾病进展中的作用 | 酒精性肝炎（AH）、酒精性肝硬化（AC）和肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析、免疫浸润分析、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多个转录组数据库和独立验证队列的数据 |
| 1291 | 2025-02-01 |
Prognostic models of immune-related cell death and stress unveil mechanisms driving macrophage phenotypic evolution in colorectal cancer
2025-Jan-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06143-9
PMID:39875913
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研究论文 | 本文构建了一个与免疫相关的细胞死亡和应激（ICDS）预后模型，揭示了肿瘤细胞通过铜死亡下调GAL3ST4表达以抑制M2样巨噬细胞极化的机制 | 首次构建了ICDS预后模型，并揭示了肿瘤细胞通过铜死亡调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于转录组数据，缺乏更多实验验证 | 揭示结直肠癌中免疫细胞浸润、程序性细胞死亡和应激之间的复杂相互作用，以指导治疗策略和改善患者预后 | 结直肠癌患者的转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、生化实验 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的大量结直肠癌样本 |
| 1292 | 2025-02-01 |
UBE2J1 is identified as a novel plasma cell-related gene involved in the prognosis of high-grade serous ovarian cancer
2025-Jan-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06135-9
PMID:39876019
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别了高浆液性卵巢癌（HGSOC）中的关键免疫细胞类型，并揭示了UBE2J1作为HGSOC的新型预后标志物和致癌基因 | 首次将UBE2J1识别为HGSOC的新型预后标志物和致癌基因，揭示了其在细胞增殖、侵袭、迁移和肿瘤生长中的关键作用 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏独立验证队列 | 识别HGSOC中的关键免疫细胞标志物并探索其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 | 高浆液性卵巢癌（HGSOC）患者和细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、CCK-8、Transwell、克隆形成、伤口愈合、免疫荧光和体内肿瘤生长实验 | NA | 单细胞测序数据、批量测序数据 | 来自GEO和TCGA数据库的HGSOC样本 |
| 1293 | 2025-02-01 |
Integrating representation learning, permutation, and optimization to detect lineage-related gene expression patterns
2025-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56388-7
PMID:39870610
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研究论文 | 本文开发了一种名为PORCELAN的方法，用于识别与细胞谱系紧密相关的基因或子树，并应用于小鼠肺癌模型和胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | PORCELAN方法结合了表示学习、排列和优化技术，能够识别与细胞谱系紧密相关的基因或子树，为研究细胞状态记忆提供了新工具 | 方法主要应用于小鼠模型和C. elegans的胚胎发育数据，尚未在更广泛的生物系统中验证 | 研究细胞谱系相关的基因表达模式，特别是在肺癌进展和胚胎发育中的细胞状态记忆 | 小鼠肺癌模型、小鼠和C. elegans的胚胎发育 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 表示学习、排列和优化 | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠肺癌模型、小鼠和C. elegans的胚胎发育数据 |
| 1294 | 2025-02-01 |
Computational Identification of Migrating T cells in Spatial Transcriptomics Data
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619870
PMID:39484480
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研究论文 | 本研究开发了一种名为ReMiTT的计算方法，利用空间转录组数据追踪T细胞在肿瘤组织中的迁移模式 | ReMiTT方法首次利用空间转录组数据追踪T细胞迁移，揭示了迁移路径上的关键基因和通路 | 研究主要基于计算模型，缺乏实验验证 | 研究T细胞在肿瘤微环境中的迁移模式及其与肿瘤免疫逃逸的关系 | T细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | ReMiTT | 空间转录组数据 | 多个肿瘤样本 |
| 1295 | 2025-02-01 |
The Role of Dectin-1-Akt-RNF146 Pathway in β-Glucan Induced Immune Trained State of Monocyte in Sepsis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482213
PMID:39881796
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研究论文 | 本文探讨了Dectin-1-Akt-RNF146通路在β-葡聚糖诱导的单核细胞免疫训练状态中的作用，特别是在脓毒症中的应用 | 揭示了RNF146和Akt在脓毒症免疫抑制期的作用，并发现β-葡聚糖预处理可通过Dectin-1-Akt-mTOR通路逆转免疫抑制，促进免疫训练状态 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人类患者中进行验证 | 研究脓毒症中免疫训练状态的分子机制及其潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的外周血单核细胞、脓毒症小鼠模型及小鼠单核/巨噬细胞系RAW264.7 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠双打击模型、RAW264.7细胞系 | RNA测序数据、细胞实验数据 | 脓毒症患者的外周血单核细胞、小鼠模型及RAW264.7细胞系 |
| 1296 | 2025-02-01 |
Therapeutic potential and mechanisms of umbilical cord mesenchymal stem cells differentiating into tendon cells and promotion of rotator cuff tendon-bone healing
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251315185
PMID:39882545
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研究论文 | 本文探讨了脐带间充质干细胞（UCMSCs）分化为肌腱细胞的机制及其在促进肩袖肌腱-骨愈合中的潜力 | 通过单细胞测序分析分化过程中的关键细胞亚群和信号通路，并发现Hes1基因的过表达显著促进了UCMSCs向肌腱细胞的分化 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验 | 探索UCMSCs分化为肌腱细胞的机制及其在肩袖损伤修复中的应用 | 脐带间充质干细胞（UCMSCs）和肩袖肌腱损伤 | 细胞治疗 | 肩袖损伤 | 单细胞测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 1297 | 2025-01-31 |
mSphere of Influence: How the single cell contributes to the collective
2025-Jan-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00431-24
PMID:39660837
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评论 | 本文讨论了单细胞RNA测序技术在微生物生态学中的应用，特别是如何通过单细胞研究揭示细菌在生态系统层面的作用 | 介绍了两种新的单细胞RNA测序技术，这些技术为研究细菌单细胞在生态系统中的作用提供了新方法 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何帮助理解细菌单细胞在生态系统中的作用 | 细菌单细胞 | 微生物生态学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1298 | 2025-01-31 |
Single-cell transcriptomics identify a novel macrophage population associated with bone invasion in pituitary neuroendocrine tumors
2025-Jan-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03296-9
PMID:39865310
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了与骨侵袭性垂体神经内分泌肿瘤（BI PitNETs）相关的巨噬细胞亚群，并揭示了其在促进骨侵袭中的关键作用 | 识别了一种新型的TNF-α+ TAM巨噬细胞亚群，并阐明了其通过IL34/CSF1R轴促进骨侵袭的机制 | 样本量相对较小，仅包括10例骨侵袭性PitNETs和5例非骨侵袭性PitNETs | 揭示骨侵袭性垂体神经内分泌肿瘤的肿瘤微环境变化及其促进骨侵袭的机制 | 骨侵袭性垂体神经内分泌肿瘤（BI PitNETs）和非骨侵袭性垂体神经内分泌肿瘤（Non-BI PitNETs） | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 15例（10例骨侵袭性PitNETs和5例非骨侵袭性PitNETs） |
| 1299 | 2025-01-28 |
To describe the subsets of malignant epithelial cells in gastric cancer, their developmental trajectories and drug resistance characteristics
2025-Jan-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-01715-5
PMID:39869282
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胃癌样本中的细胞亚群，揭示了恶性上皮细胞的发育轨迹和耐药特性 | 通过单细胞RNA测序技术，首次在胃癌中识别了32个不同的细胞簇和10种主要细胞类型，并构建了预后风险评分模型 | 研究依赖于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 研究胃癌的细胞和分子异质性，探索潜在的治疗靶点和生物标志物 | 胃癌样本中的262,532个细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（10× Genomics平台） | 预后风险评分模型 | RNA测序数据 | 262,532个细胞 |
| 1300 | 2025-01-31 |
Combined PARP14 inhibition and PD-1 blockade promotes cytotoxic T cell quiescence and modulates macrophage polarization in relapsed melanoma
2025-Jan-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010683
PMID:39870492
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研究论文 | 本文探讨了PARP14抑制与PD-1阻断联合治疗在复发性黑色素瘤中的应用，通过调节T细胞静止和巨噬细胞极化来增强治疗效果 | 首次结合PARP14抑制与PD-1阻断，揭示了其对T细胞静止和巨噬细胞极化的影响，并提出了一种新的治疗策略以克服免疫检查点抑制剂的耐药性 | 尽管增强了免疫反应，肿瘤细胞仍通过激活替代的免疫逃逸途径产生适应性耐药 | 研究PARP14抑制与PD-1阻断联合治疗在复发性黑色素瘤中的效果及其机制 | 复发性黑色素瘤患者及临床前模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |