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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2025-10-06 |
Ligand-receptor dynamics in heterophily-aware graph neural networks for enhanced cell type prediction from single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1547231
PMID:40421418
|
研究论文 | 本研究探索了异质性感知图神经网络在单细胞RNA测序数据分析中的应用，通过整合配体-受体动态信息提升细胞类型预测准确性 | 通过提取配体-受体关联并构建具有不同边同质性比例的细胞-细胞关联网络，增强了细胞通讯通路的生物学相关性和准确性，特别关注异质性数据处理方法 | 研究仅基于六个数据集进行验证，需要更多样化的数据集来进一步验证方法的普适性 | 提升单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据和细胞-细胞相互作用网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络, GraphSAGE, 图注意力网络, MixHop, 门控双核GNN | 基因表达数据, 配体-受体相互作用数据 | 六个不同的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1262 | 2025-10-06 |
Identification of PRKCQ-AS1 as a Keratinocyte-Derived Exosomal lncRNA That Promotes Th17 Differentiation and IL-17 secretion in Psoriasis Through Bioinformatics, Machine Learning Algorithms, and Cell Experiments
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S521553
PMID:40433053
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学、机器学习算法和细胞实验，鉴定出角质形成细胞来源的外泌体lncRNA PRKCQ-AS1可通过激活STAT3信号通路促进Th17细胞分化和IL-17分泌，从而参与银屑病发病机制 | 首次鉴定PRKCQ-AS1作为角质形成细胞来源的外泌体lncRNA在银屑病中的作用机制，并通过多种机器学习算法和实验验证其功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，需要进一步的体内实验验证 | 探索调控银屑病Th17/IL-17轴的关键外泌体ncRNA及其作用机制 | 银屑病相关的ncRNA、Th17细胞、角质形成细胞、CD4+T细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | RNA测序、单细胞RNA测序、全基因组关联研究、机器学习算法、免疫荧光、qRT-PCR、Western blot | 加权基因共表达网络分析、五种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞数据、GWAS数据 | 来自GEO数据库的批量RNA测序数据集、大规模单细胞RNA测序数据 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1263 | 2025-10-06 |
Reversing VTN deficiency inhibits the progression of pancreatic cancer and enhances sensitivity to anti-PD1 immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1578870
PMID:40433359
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研究论文 | 本研究揭示细胞外基质蛋白玻连蛋白(VTN)在胰腺癌中的双重功能：抑制肿瘤进展并增强抗PD1免疫疗法敏感性 | 首次系统阐明VTN在胰腺癌中的双重调控作用，发现其既能抑制肿瘤恶性表型又能调节免疫治疗反应 | 研究主要基于临床前模型，需要进一步临床验证 | 探索VTN作为胰腺癌预后生物标志物和免疫治疗增敏靶点的潜力 | 胰腺癌细胞系、小鼠皮下肿瘤模型、公共数据库临床样本 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、功能实验、机制研究 | 同基因小鼠皮下肿瘤模型 | 基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1264 | 2025-10-06 |
Glypican-3 regulated epithelial mesenchymal transformation-related genes in osteosarcoma: based on comprehensive tumor microenvironment profiling
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566061
PMID:40433364
|
研究论文 | 本研究通过综合分析骨肉瘤肿瘤微环境，揭示了Glypican-3调控上皮间质转化相关基因的作用机制 | 首次基于EMT相关基因构建骨肉瘤预后模型，并结合单细胞RNA测序技术验证模型基因在细胞亚群中的表达特征 | 研究样本量有限，功能验证仅在MG-63细胞系中进行，需要更多临床样本验证 | 探索EMT在骨肉瘤发生发展和免疫治疗反应中的作用机制 | 骨肉瘤患者样本和MG-63细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，LASSO算法，基因敲除 | 预后预测模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个骨肉瘤转录组数据集和验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1265 | 2025-10-06 |
Investigating the molecular mechanisms associated with ulcerative colitis through the application of single-cell combined spatial transcriptome sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1534768
PMID:40433374
|
研究论文 | 通过单细胞联合空间转录组测序研究溃疡性结肠炎的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组技术系统分析UC相关单核细胞亚型，并鉴定出GNG5和TIMP1两个关键调控基因 | 研究样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异，需要进一步的功能验证实验 | 阐明溃疡性结肠炎的发病分子机制 | 溃疡性结肠炎患者样本和DSS诱导的结肠炎小鼠模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, Western blotting | LASSO, SVM | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1266 | 2025-10-06 |
CD4+T and CD8+T cells profile in lung inflammation and fibrosis: targets and potential therapeutic drugs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1562892
PMID:40433386
|
综述 | 本文总结了CD4+T细胞和CD8+T细胞在肺纤维化中的作用及其潜在治疗靶点 | 通过调节T淋巴细胞不同亚群比例及相关信号通路为延缓肺纤维化进程提供新的治疗视角 | 主要基于现有研究总结，缺乏原始实验数据验证 | 探讨T淋巴细胞亚群在肺纤维化中的作用机制和潜在治疗策略 | 肺纤维化患者和矽肺病小鼠模型中的T淋巴细胞 | 免疫学 | 肺纤维化 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1267 | 2025-10-06 |
CDT1 is a Potential Therapeutic Target for the Progression of NAFLD to HCC and the Exacerbation of Cancer
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了NAFLD向HCC进展过程中的关键基因CDT1，并验证其作为潜在治疗靶点 | 首次通过机器学习模型结合单细胞测序分析确定CDT1是NAFLD向HCC进展中最关键的基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 识别NAFLD向HCC进展的潜在治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)和肝细胞癌(HCC)患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 二代测序, 单细胞测序, 机器学习 | Cox比例风险模型, Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的大样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 伪时序分析 | NA | NA |
| 1268 | 2025-10-06 |
Multihormone-producing capabilities of normal pancreatic islet cells-spatial transcriptomics analysis using Xenium
2025, Biomedical research (Tokyo, Japan)
DOI:10.2220/biomedres.46.129
PMID:40436764
|
研究论文 | 通过Xenium空间转录组学分析研究成人胰岛细胞的多激素产生能力 | 首次使用Xenium空间转录组技术揭示成人胰岛细胞具有同时产生多种胰腺激素的基因表达潜力 | 样本量较小（仅3例患者），仅基于基因转录水平推测激素产生能力，未验证蛋白质表达 | 阐明成人胰岛细胞是否严格维持单一激素产生能力或保留多激素产生可塑性 | 人胰腺胰岛细胞 | 空间转录组学 | 胰腺肿瘤 | 空间转录组学分析 | NA | 空间基因表达数据 | 3例胰腺肿瘤患者的11个胰岛，共773个胰岛细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间基因表达平台，使用477个探针 |
| 1269 | 2025-10-06 |
A single-cell RNA sequencing dataset of peripheral blood cells in long COVID patients on herbal therapy
2025-Jan-30, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-04510-1
PMID:39885244
|
研究论文 | 本研究提供了一个关于长新冠患者在接受草药治疗后外周血细胞的单细胞RNA测序数据集 | 首次提供了针对长新冠患者草药治疗前后免疫细胞群体的单细胞转录组数据资源 | 对草药治疗长新冠的有效性和安全性理解仍然有限 | 深入理解草药在长新冠管理中的作用 | 长新冠患者的外周血细胞 | 单细胞转录组学 | 长新冠 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 181,205个通过质量控制的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1270 | 2025-10-06 |
A quantitative prediction method utilizing whole omics data for biosensing
2025-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84323-1
PMID:39870652
|
研究论文 | 开发了一种利用全组学数据进行生物传感的定量预测方法OmicSense | 使用高斯混合模型作为概率分布，能够准确预测每个生物标志物的目标变量，对背景噪声具有鲁棒性且不会过拟合 | NA | 开发一种能够充分利用组学数据构建生物标志物的定量预测方法 | 转录组、代谢组和微生物组数据集 | 机器学习 | NA | 全组学数据分析 | 高斯混合模型 | 组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 代谢组学, 微生物组学 | NA | NA |
| 1271 | 2025-10-06 |
Regionalized cell and gene signatures govern esophageal epithelial homeostasis
2025-01-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.09.025
PMID:39426382
|
研究论文 | 通过区域解析的单细胞测序构建成年小鼠食道细胞图谱，揭示食道区域化特征和上皮稳态调控机制 | 首次采用区域解析的Smart-seq3单细胞测序技术，发现位置依赖性转录特征和功能差异的基底祖细胞状态 | 研究仅限于小鼠模型，人类食道的区域化特征可能有所不同 | 解析食道区域化细胞和基因特征对上皮稳态的调控机制 | 成年小鼠食道组织 | 单细胞组学 | 食道疾病 | 单细胞RNA测序，器官样共培养，体内模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠食道组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq3 | 区域解析的Smart-seq3单细胞测序 |
| 1272 | 2025-10-06 |
Elucidating the role of pyrimidine metabolism in prostate cancer and its therapeutic implications
2025-01-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86052-5
PMID:39814835
|
研究论文 | 本研究探讨嘧啶代谢在前列腺癌中的作用及其与免疫微环境、药物敏感性和肿瘤突变负荷的关联 | 首次通过单细胞RNA测序揭示嘧啶代谢在前列腺癌不同亚组中的差异表达模式及其与免疫细胞调控的关联 | 研究样本量有限，需要更大规模验证嘧啶代谢与治疗反应的具体机制 | 阐明嘧啶代谢在前列腺癌进展中的分子机制及其治疗意义 | 前列腺癌样本及其代谢特征 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1273 | 2025-10-06 |
Integrated bioinformatics analysis identified cuproptosis-related hub gene Mpeg1 as potential biomarker in spinal cord injury
2025-01-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86170-0
PMID:39814871
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定铜死亡相关枢纽基因Mpeg1作为脊髓损伤的潜在生物标志物 | 首次将铜死亡机制与脊髓损伤相关联，并识别出关键基因Mpeg1在损伤后小胶质细胞中的高表达 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仍需进一步深入 | 探索铜死亡在脊髓损伤中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤模型和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | RNA测序, ssGSEA, WGCNA, PPI分析, 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析模型 | 基因表达数据 | GEO数据库中的1、3、7天损伤后脊髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1274 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq data to explore the key role of fatty acid metabolism in hepatocellular carcinoma
2025-01-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85506-0
PMID:39814999
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，探索脂肪酸代谢在肝细胞癌中的关键作用 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析脂质代谢基因在肝细胞癌中的作用，并鉴定PTGES3为关键基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索脂质代谢在肝细胞癌进展中的机制并寻找潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,WGCNA,分子对接,体外实验 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),一致性聚类分析 | 转录组数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1275 | 2025-10-06 |
Multimodal screen identifies noise-regulatory proteins
2025-01-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.09.015
PMID:39406240
|
研究论文 | 通过多模态筛选方法鉴定能够调控基因表达噪声的蛋白质 | 首次系统性识别出32个可能调控基因表达噪声的蛋白质，并证明SON蛋白能在不改变平均表达水平的情况下调控转录噪声 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎干细胞，在其它细胞类型和生物系统中的普适性需要进一步验证 | 探索是否存在能够独立于平均表达水平调控基因表达噪声的蛋白质或通路 | 小鼠胚胎干细胞和基因表达噪声调控机制 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,调控因子富集分析,长读长测序,总RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
| 1276 | 2025-10-06 |
scAI-SNP: a method for inferring ancestry from single-cell data
2025, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00029-4
PMID:40401145
|
研究论文 | 开发了一种从单细胞数据推断祖先来源的计算方法 | 首次提出直接从单细胞基因组学数据推断祖先的方法，解决了单细胞图谱中祖先信息缺失的问题 | 依赖于1000 Genomes Project数据集，可能无法覆盖所有人群多样性 | 开发从单细胞数据推断祖先来源的计算工具 | 单细胞基因组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 3201个个体，来自26个人群组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1277 | 2025-10-06 |
Bulk and single-cell RNA sequencing identify prognostic signatures related to FGFBP2+ NK cell in hepatocellular carcinoma
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19337
PMID:40416605
|
研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序识别了与FGFBP2+ NK细胞相关的肝细胞癌预后标志物 | 首次系统描绘FGFBP2+ NK细胞在肝细胞癌中的异质性、伪时间轨迹和细胞间通讯，并建立基于八个基因特征的预后风险评分模型 | 数据主要来源于公共数据库，需要进一步实验验证 | 识别与FGFBP2+ NK细胞相关的肝细胞癌预后标志物 | 肝细胞癌样本和FGFBP2+ NK细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外实验 | RiskScore模型, Seurat, Monocle2, CellChat, oncoPredict | RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1278 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal correlation between RNA methylation-related miRNA risk model and immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1553239
PMID:40416872
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示RNA甲基化相关miRNA风险模型与肝细胞癌免疫浸润的关联 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，构建RNA甲基化相关miRNA风险模型，并发现miR-4739通过调控SPP1+巨噬细胞促进肝癌进展的新机制 | 研究样本量有限，主要基于生物信息学分析，实验验证主要在体外细胞系中进行 | 探究RNA甲基化相关miRNA在肝细胞癌免疫微环境中的作用及预后价值 | 肝细胞癌患者样本和Huh-7肝癌细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, miRNA测序, 机器学习 | 风险评分模型, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 肝细胞癌患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1279 | 2025-10-06 |
Uncovering key regulatory pathways and prognostic biomarkers in the tumor microenvironment of high-grade serous ovarian cancer through single-cell RNA sequencing and experimental validation
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1591430
PMID:40416874
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和实验验证揭示高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中的关键调控通路和预后生物标志物 | 首次通过单细胞RNA测序分析HGSOC肿瘤微环境，发现PTN信号通路的关键调控作用和SDC4作为预后生物标志物的潜力 | 需要进一步研究以完全阐明SDC4在卵巢癌进展中的功能作用 | 识别HGSOC肿瘤微环境中的新型调控靶点和信号通路 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blotting, 生物信息学分析 | 无监督聚类, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, TCGA数据集, 实验验证数据 | scRNA-seq数据集GSE146026, TCGA数据集, OVCAR3和SKOV3卵巢癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1280 | 2025-10-06 |
Acetylcholine from tuft cells promotes M2 macrophages polarization in Hirschsprung-associated enterocolitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1559966
PMID:40416975
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研究论文 | 本研究探讨了簇细胞分泌的乙酰胆碱在先天性巨结肠相关小肠结肠炎中促进M2巨噬细胞极化的机制 | 首次发现簇细胞通过分泌乙酰胆碱促进M2巨噬细胞极化，揭示了不同肠段炎症差异的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人体临床试验中验证 | 探索乙酰胆碱在HAEC中的抗炎机制，为HAEC防治提供新方向 | Ednrb-/-小鼠模型、肠道类器官、巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 先天性巨结肠相关小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blot、RT-qPCR、ELISA、类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、细胞培养数据 | Ednrb-/-小鼠模型及体外培养系统 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |