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当前共找到 2164 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell and transcriptome sequencing data reveal the value of IL1RAP in gastric cancer microenvironment and prognosis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584619
PMID:40444099
|
研究论文 | 通过整合单细胞和转录组测序数据揭示IL1RAP在胃癌微环境及预后中的关键作用 | 首次系统整合单细胞与转录组数据揭示IL1RAP在胃癌免疫微环境中的调控机制及其免疫治疗预测价值 | 研究基于公共数据库数据，需进一步实验验证机制 | 探究IL1RAP在胃癌肿瘤微环境中的作用及预后价值 | 胃癌患者样本数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞测序,转录组测序,机器学习 | 多种机器学习算法 | 转录组数据,单细胞数据 | 胃癌患者公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1242 | 2025-10-06 |
Exploring the level of metabolic reprogramming and the role of prognostic factor SF3A3 in hepatocellular carcinoma through integrated single-cell landscape analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0323559
PMID:40424306
|
研究论文 | 通过整合单细胞景观分析探索肝细胞癌中代谢重编程水平及预后因子SF3A3的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示HCC代谢重编程异质性，发现SF3A3作为新型诊断和独立预后生物标志物 | 使用公共数据库数据，缺乏实验验证样本 | 研究肝细胞癌代谢重编程异质性并识别新的治疗靶点 | 肝细胞癌细胞及肿瘤微环境中的单核吞噬细胞、上皮细胞、内皮细胞、NK/T细胞、B细胞等 | 单细胞分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，拷贝数变异分析，基因本体富集分析，伪时序分析 | 诊断模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1243 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers associated with inflammatory response in Parkinson's disease by bioinformatics and machine learning
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0320257
PMID:40435035
|
研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法筛选与帕金森病炎症反应相关的生物标志物基因 | 结合LASSO、SVM-RFE和随机森林三种机器学习算法筛选生物标志物，并进行了单细胞转录组数据分析 | NA | 筛选与帕金森病炎症反应相关的生物标志物基因 | 帕金森病患者相关基因表达数据 | 机器学习 | 帕金森病 | 生物信息学分析，机器学习 | LASSO, SVM-RFE, Random Forest | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 1244 | 2025-10-06 |
Intercellular communication between FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in prostate cancer via multi-omics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560998
PMID:40438108
|
研究论文 | 通过多组学技术揭示前列腺癌中FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞间的细胞通讯机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序系统揭示FAP+成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在前列腺癌中的特异性相互作用网络 | 样本量相对有限（23个前列腺样本），需要更大规模验证 | 探索前列腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯机制，寻找新的治疗靶点 | 前列腺癌肿瘤微环境中的FAP+成纤维细胞和SPP1+巨噬细胞 | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 23个前列腺样本的23,519个单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1245 | 2025-10-06 |
Unraveling the immune evasion mechanisms in the tumor microenvironment of head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1597202
PMID:40438103
|
综述 | 系统阐述头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中免疫逃逸机制及其治疗策略 | 提出HNSCC免疫逃逸的'三位一体'调控网络新框架，包含代谢重编程、基质细胞驱动和表观遗传重塑三大机制，并首次提出'谱系可塑性驱动免疫适应'新范式 | 对特定免疫逃逸通路理解仍不完整，缺乏个性化治疗策略 | 解析HNSCC肿瘤微环境中的免疫逃逸机制并探索免疫治疗新策略 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 1246 | 2025-10-06 |
Tumor-infiltrating immune cell signature score reveals prognostic biomarkers and therapeutic targets for colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1583327
PMID:40438100
|
研究论文 | 本研究通过整合结直肠癌转录组数据构建了肿瘤浸润免疫细胞特征评分模型，用于预后预测和免疫治疗反应评估 | 开发了基于五个关键TIIC-RNA的预后模型，在TCGA-CRC和外部验证数据集中表现优于22个现有预后模型 | 需要进一步评估TIIC特征评分的临床实用性，并在不同人群和治疗环境中验证其相关性 | 探索肿瘤浸润免疫细胞相关基因在结直肠癌中的预后价值，发现新的生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，机器学习 | 随机生存森林，LASSO回归，Cox比例风险回归 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | TCGA-CRC数据集和外部验证数据集 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 1247 | 2025-10-06 |
Construction of a stromal cell-related prognostic signature based on a 101-combination machine learning framework for predicting prognosis and immunotherapy response in triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1544348
PMID:40438115
|
研究论文 | 基于101种机器学习组合框架构建基质细胞相关预后特征，用于预测三阴性乳腺癌的预后和免疫治疗反应 | 首次整合10种机器学习算法和101种模型组合，开发基于myCAF、VSMC和周细胞标记基因的预后特征 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究进一步验证 | 识别基质细胞标记基因并开发预后特征，预测TNBC生存结局和免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者和细胞系 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，免疫组化，RNA干扰，CCK-8检测，凋亡检测，伤口愈合检测 | 101种机器学习组合框架 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 来自GEO数据库的单细胞RNA测序数据集和独立验证队列GSE91061 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1248 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome conservation in a multispecies comparative analysis of fresh and cryopreserved insulinoma cell lines
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00025-4
PMID:40438246
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对多种胰岛素瘤细胞系进行跨物种比较分析，并评估冷冻保存对单细胞转录组的影响 | 首次在胰岛素瘤中进行跨物种单细胞转录组比较分析，并系统评估冷冻保存对胰岛素瘤细胞转录组的影响 | 研究仅使用细胞系而非原代肿瘤组织，可能无法完全反映体内肿瘤的复杂性 | 理解胰岛素瘤的单细胞转录组景观，评估冷冻保存对转录组的影响 | 犬类和人类胰岛素瘤细胞系（canINS, CM, INS-1和MIN6） | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | Seurat | 单细胞转录组数据 | 四种胰岛素瘤细胞系的新鲜和冷冻保存样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1249 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis of canine insulinoma reveals distinct sub-populations of insulin-expressing cancer cells
2025, Veterinary oncology (London, England)
DOI:10.1186/s44356-025-00026-3
PMID:40438247
|
研究论文 | 首次对犬胰岛素瘤进行单细胞转录组分析，揭示胰岛素表达癌细胞的不同亚群 | 首次在任何物种中对自然发生的胰岛素瘤进行单细胞RNA测序分析，发现了两个转录特征不同的胰岛素表达肿瘤细胞亚群 | 研究规模较小，仅包含两只犬的三个肿瘤样本 | 绘制犬胰岛素瘤的单细胞转录组图谱，探索肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征 | 犬胰岛素瘤组织样本，包括两个原发肿瘤和一个转移灶 | 单细胞转录组学 | 胰岛素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5,532个细胞，来自两只拳师犬的两个胰岛素瘤和一个转移灶 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1250 | 2025-10-06 |
Biomarker identification associated with M2 tumor-associated macrophage infiltration in glioblastoma
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1545608
PMID:40438577
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据，识别与胶质母细胞瘤中M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析识别M2 TAM相关基因，并构建胶质母细胞瘤预后特征模型 | 研究样本量未明确说明，需要外部验证确认模型的普适性 | 识别胶质母细胞瘤中与M2型肿瘤相关巨噬细胞浸润相关的预后生物标志物 | 胶质母细胞瘤患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, WGCNA, Cox回归, LASSO回归 | 预后特征模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1251 | 2025-10-06 |
Polyamine metabolism dysregulation contributes to muscle fiber vulnerability in ALS
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115123
PMID:39932195
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析发现多胺代谢失调是ALS中肌肉纤维易损性的关键因素 | 首次在ALS骨骼肌中通过空间转录组学鉴定出多胺代谢通路异常，并证明恢复多胺稳态可挽救肌肉表型 | 研究基于SOD1小鼠模型，结果需要在其他ALS模型和人类样本中进一步验证 | 探究ALS疾病进展中神经支配改变如何干扰肌肉稳态 | SOD1小鼠模型的骨骼肌组织 | 空间转录组学 | 肌萎缩侧索硬化(ALS) | 空间转录组学 | SOD1小鼠模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1252 | 2025-10-06 |
Gut bacterial L-lysine alters metabolism and histone methylation to drive dendritic cell tolerance
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115125
PMID:39932193
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道细菌产生的L-赖氨酸通过调控树突状细胞代谢和组蛋白甲基化促进免疫耐受的新机制 | 首次发现肠道共生菌来源的L-赖氨酸通过AMPK/AcCoA-mTOR轴激活SGOC代谢，增加SAM和DOT1L表达，增强H3K79me2组蛋白修饰，从而诱导树突状细胞免疫耐受 | NA | 探究细菌代谢物如何诱导树突状细胞免疫耐受的分子机制 | 树突状细胞、小鼠免疫炎症疾病模型、Phgdh条件性基因敲除小鼠 | 免疫学 | 免疫炎症疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除技术 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1253 | 2025-10-06 |
Spatial integration of multi-omics data from serial sections using the novel Multi-Omics Imaging Integration Toolset
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf035
PMID:40366868
|
研究论文 | 开发了一种用于整合空间多组学数据的Python框架工具集 | 提出了名为GreedyFHist的非刚性配准算法，用于处理连续切片的配准问题 | 仅在新鲜冷冻连续切片上进行了验证，未涉及其他类型样本 | 开发空间多组学数据整合工具以更好地理解癌症生物学 | 前列腺组织样本 | 空间组学数据分析 | 前列腺癌 | 质谱成像, 空间转录组学 | 非刚性配准算法 | 图像, 空间组学数据 | 244张新鲜冷冻连续切片图像 | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 1254 | 2025-10-06 |
Whole-exome sequencing association study reveals genetic effects on tumor microenvironment components in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182768
PMID:39744943
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研究论文 | 通过全外显子组测序关联研究揭示鼻咽癌肿瘤微环境成分的遗传效应 | 发现了3个与鼻咽癌易感性相关的遗传变异，开发了优化的复合多基因风险评分模型，首次揭示多基因风险通过EBV感染状态介导，并阐明遗传变异通过调控EBV生命周期和内皮细胞功能影响鼻咽癌发病机制 | NA | 探索鼻咽癌的遗传基础及其与肿瘤微环境成分的相互作用 | 鼻咽癌患者 | 基因组学 | 鼻咽癌 | 全外显子组测序，单细胞RNA测序，多组学分析 | 复合多基因风险评分模型 | 基因组数据，转录组数据 | 6,969例鼻咽癌病例和7,100例对照（全外显子组测序），356例批量转录组数据，56例单细胞RNA测序数据 | NA | 全外显子组测序，单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1255 | 2025-10-06 |
Further evidence of biallelic NAV3 variants associated with recessive neurodevelopmental disorder with dysmorphism, developmental delay, intellectual disability, and behavioral abnormalities
2025-Jan, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-024-02718-6
PMID:39708122
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研究论文 | 本研究通过外显子组测序在三个近亲结婚家系中发现了NAV3基因的双等位基因变异与神经发育障碍的关联 | 首次在三个独立近亲家系中鉴定出NAV3基因的三种新型双等位蛋白截断变异，进一步证实了NAV3与神经发育障碍的因果关系 | 研究样本量较小（仅5名患者），且所有家系均为近亲结婚背景，可能限制了变异的普遍性验证 | 验证NAV3基因双等位变异与常染色体隐性神经发育障碍的关联 | 来自三个无关近亲家系的五名神经发育障碍患者 | 医学遗传学 | 神经发育障碍 | 外显子组测序，单细胞测序数据分析 | NA | 基因组测序数据，单细胞表达数据 | 5名患者（来自3个家系） | NA | 外显子组测序，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1256 | 2025-10-06 |
Potential Role of CD99 Signaling Pathway in Schwann Cell Dysfunction in Diabetic Foot Ulcers Based on Single-Cell Transcriptome Analysis
2025, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/9935400
PMID:40420926
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析探究CD99信号通路在糖尿病足溃疡雪旺细胞功能障碍中的潜在作用 | 首次发现CD99信号通路在糖尿病足溃疡非愈合组中上调，并在小鼠伤口模型中验证了CD99在脱髓鞘区域的高表达 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于小鼠模型，需要进一步临床验证 | 探究糖尿病足溃疡中雪旺细胞功能障碍的分子机制 | 糖尿病足溃疡患者的足部皮肤样本和小鼠伤口模型 | 单细胞转录组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | CellChat包，轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | 涵盖非糖尿病患者、无DFU糖尿病患者、DFU愈合者和DFU非愈合者的足部皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1257 | 2025-10-06 |
Exploring shared pathogenic mechanisms and biomarkers in hepatic fibrosis and inflammatory bowel disease through bioinformatics and machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1533246
PMID:40421012
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研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法探索肝纤维化和炎症性肠病的共同致病机制和生物标志物 | 首次整合多种生物信息学方法和机器学习算法系统识别HF和IBD的共享诊断生物标志物 | 研究基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索肝纤维化和炎症性肠病的共同致病机制和诊断生物标志物 | 肝纤维化和炎症性肠病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肝纤维化, 炎症性肠病 | 生物信息学分析, 机器学习, 单细胞测序 | 逻辑回归, WGCNA, CIBERSORT | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1258 | 2025-10-06 |
Investigation of the Significance of Blood Signatures on Sepsis-Induced Acute Lung Injury in Sepsis Within 24 Hours
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5684300
PMID:40421173
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习方法探讨了脓毒症患者外周血生物标志物对脓毒症诱导的急性肺损伤的影响 | 首次结合多种机器学习算法识别C3AR1和SLPI作为脓毒症关键生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证SLPI在脓毒症早期免疫器官细胞中的表达升高 | 研究主要基于公共数据库数据，样本来源有限，需要进一步临床验证 | 研究脓毒症发病24小时内血液生物标志物对脓毒症诱导急性肺损伤的意义 | 脓毒症患者和脓毒症诱导的急性肺损伤动物模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT, 生物信息学分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 两个GEO数据集(GSE54514和GSE95233) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1259 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics and machine learning unveil ferroptosis features in tumor-associated macrophages: Prognostic model and therapeutic strategies for lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1598756
PMID:40421217
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习方法，揭示了肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的铁死亡特征，并构建了预后风险模型 | 首次基于巨噬细胞铁死亡相关基因构建肺腺癌预后模型，揭示了高风险组的免疫微环境特征和药物敏感性差异 | 研究主要基于公共数据库分析，需要更多实验验证；样本量相对有限 | 筛选巨噬细胞中铁死亡相关关键基因，构建肺腺癌预后风险模型 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，Western blot | LASSO, SVM, XGBoost, Cox回归 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | TCGA-LUAD、GSE131907和GSE13213数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1260 | 2025-10-06 |
Deciphering Intercellular Communication of the Immune Landscape within Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Microenvironment at Single-Cell Resolution
2025 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000545663
PMID:40421435
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了常染色体显性多囊肾病微环境中免疫细胞间的复杂通讯网络 | 首次在单细胞分辨率下系统解析ADPKD微环境中免疫细胞互作网络，发现M2样巨噬细胞亚群通过IL-10信号促进囊肿细胞增殖的新机制 | 样本量较小（7例ADPKD和3例健康对照），需更大规模研究验证发现 | 解析ADPKD肾脏微环境中关键细胞类型及其相互作用机制 | ADPKD患者和健康人的肾脏组织样本 | 单细胞生物学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | CellChat, VISION, pySCENIC, Monocle V3 | 单细胞转录组数据 | 7例ADPKD患者和3例健康人肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |