单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 2177 篇文献，本页显示第 1221 - 1240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA seq data analysis reveals molecular markers and possible treatment targets for laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC): an in-silico approach
2025, In silico pharmacology
DOI:10.1007/s40203-025-00382-w
PMID:40539082
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据分析喉鳞状细胞癌的分子标志物和潜在治疗靶点 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析喉鳞状细胞癌的细胞异质性，识别出12个细胞簇和20个核心基因 | 基于生物信息学分析方法，缺乏实验验证 | 探索喉鳞状细胞癌的诊断生物标志物和治疗靶点 | 喉鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序 | 主成分分析，基因本体富集分析，KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据 | GSE252490数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1222 | 2025-10-06 |
Copper Metabolism-Related Genes as Biomarkers in Colon Adenoma and Cancer
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S521512
PMID:40524750
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探讨铜代谢在结肠腺瘤进展为结直肠癌中的作用并识别潜在生物标志物 | 首次系统整合铜代谢相关基因与结肠腺瘤-癌进展过程的差异表达基因，结合多种机器学习算法识别生物标志物 | 需要进一步的临床验证 | 阐明铜代谢在结肠腺瘤向结直肠癌进展中的作用，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 结肠腺瘤和结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，定量PCR | 五种机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的结肠腺瘤数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1223 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals cellular differences and potential mechanisms in congenital pulmonary airway malformation
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1548177
PMID:40529122
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术分析先天性肺气道畸形(CPAM)与正常组织的细胞差异 | 首次应用单细胞测序技术系统揭示CPAM病变组织中的关键细胞类型差异和潜在分子机制 | 未明确说明样本数量和具体实验设计细节 | 探究先天性肺气道畸形的病理过程和细胞分子机制 | CPAM病变组织和正常肺组织 | 单细胞组学 | 先天性肺气道畸形 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1224 | 2025-10-06 |
Research advances in the study of traditional Chinese medicine formula granules on signaling pathway-mediated disease mechanisms
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1609211
PMID:40529488
|
综述 | 系统综述中药配方颗粒通过信号通路调控疾病机制的研究进展与未来方向 | 整合多组学技术探索复方混合物的超分子协同效应，提出从单一成分分析向复杂系统研究的转变 | 当前研究存在单一成分分析、复方混合物协同机制不明确、转化应用临床证据不足等挑战 | 阐明中药配方颗粒通过信号通路介导的疾病调控机制，推动其在现代精准医疗中的应用 | 中药配方颗粒及其活性成分（如小檗碱、川芎嗪、姜黄素类似物等） | NA | 炎症、肿瘤、代谢紊乱、纤维化、骨关节炎、骨质疏松症、类风湿关节炎、急性肺损伤 | 代谢组学、空间转录组学、多组学技术 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1225 | 2025-10-06 |
Cancer-Derived Exosomal LINC01615 Induces M2 Polarization of Tumor-Associated Macrophages via RBMX-EZH2 Axis to Promote Colorectal Cancer Progression
2025, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S499381
PMID:40529536
|
研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞通过外泌体传递LINC01615诱导肿瘤相关巨噬细胞M2极化的分子机制 | 首次发现外泌体LINC01615通过RBMX-EZH2轴调控巨噬细胞极化，揭示了肿瘤微环境中细胞间通讯的新机制 | 未明确LINC01615在其他癌症类型中的普适性，临床转化潜力需进一步验证 | 探究癌症来源外泌体lncRNA在肿瘤相关巨噬细胞M2极化中的作用机制 | 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、外泌体 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, RNA免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, Western blot, qRT-PCR | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1226 | 2025-10-06 |
Integrated machine learning and single-cell analysis reveal the prognostic and therapeutic potential of SUMOylation-related genes in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577781
PMID:40534859
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析，揭示了SUMOylation相关基因在卵巢癌中的预后和治疗潜力 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序数据相结合，系统鉴定卵巢癌中SUMOylation相关基因的预后价值 | 研究样本量相对有限，需要在更大规模队列中验证 | 鉴定卵巢癌中SUMOylation相关基因作为预后生物标志物和治疗靶点 | 卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，多组学数据分析 | 集成机器学习框架 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 213名卵巢癌患者样本和ID8小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1227 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts in clear cell renal cell carcinoma: functional heterogeneity, tumor microenvironment crosstalk, and therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1617968
PMID:40534854
|
综述 | 本文系统阐述了透明细胞肾细胞癌中癌症相关成纤维细胞的功能异质性、与肿瘤微环境的相互作用及治疗机遇 | 首次系统整合CAF在ccRCC中的多功能作用机制，并提出通过单细胞测序和空间多组学技术破解'CAF-TME-耐药'恶性循环的新策略 | CAF异质性和双重功能角色阻碍临床转化，缺乏特异性生物标志物 | 探索CAF在ccRCC肿瘤微环境中的功能机制并开发针对性治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌中的癌症相关成纤维细胞及其肿瘤微环境 | 肿瘤微环境研究 | 肾细胞癌 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间多组学 | NA | NA |
| 1228 | 2025-10-06 |
Role of CD28+ PD-1+ Tc cells in immune response and prognosis prediction in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1576193
PMID:40534863
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨CD28+PD-1+ Tc细胞在肝细胞癌中的免疫应答作用和预后预测价值 | 首次建立肝细胞癌单细胞转录图谱，系统揭示CD28+PD-1+ Tc细胞的分子特征及其与预后的关联 | 样本量有限（仅10例HCC样本），需要更大规模研究验证 | 阐明CD28+PD-1+ Tc细胞在肝细胞癌中的预后意义和分子特征 | 肝细胞癌患者组织样本中的T细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 富集分析 | 轨迹分析, 细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 10例肝细胞癌样本及对应正常样本，共鉴定25,644个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1229 | 2025-10-06 |
Integrated transcriptomics and machine learning reveal REN as a dual regulator of tumor stemness and NK cell evasion in Wilms tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612987
PMID:40534868
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和机器学习技术，揭示REN基因在Wilms肿瘤中同时调控肿瘤干性和NK细胞免疫逃逸的双重作用机制 | 首次发现REN基因在Wilms肿瘤中具有调控肿瘤干性和NK细胞免疫逃逸的双重功能，并开发了癌症干性预后指数(CSPI)用于患者风险分层 | 研究主要基于体外功能验证，缺乏体内动物模型验证；对T细胞功能影响有限 | 探索Wilms肿瘤中肿瘤干性和免疫逃逸的分子驱动机制 | Wilms肿瘤患者样本和肿瘤细胞 | 机器学习 | Wilms肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 分子对接模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1230 | 2025-10-06 |
Role of ADME genes in breast cancer prognosis: an analysis of risk scoring models based on multi-omics data
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1582862
PMID:40535120
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析构建了基于ADME基因的乳腺癌预后风险评分模型 | 首次将ADME基因与乳腺癌预后关联，并开发了整合临床参数的风险评分模型 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证 | 探索ADME基因在乳腺癌预后评估中的作用并开发预后模型 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组 | Cox回归, stepAIC | 基因表达数据 | TCGA-BRCA、METABRIC和GSE58812队列的患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1231 | 2025-10-06 |
Current status, hotspots and frontiers of ion channel-related research in glioblastoma: a bibliometric analysis from 2005 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588598
PMID:40535121
|
文献计量分析 | 通过文献计量学方法分析2005-2024年胶质母细胞瘤离子通道研究领域的知识结构和研究热点 | 首次系统性地对胶质母细胞瘤离子通道研究领域进行文献计量分析，识别研究热点和前沿趋势 | 仅基于Web of Science数据库的文献，可能存在收录范围限制 | 探索胶质母细胞瘤离子通道研究领域的发展态势、知识结构和研究前沿 | 胶质母细胞瘤离子通道相关研究文献 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 998篇文献（764篇文章和234篇综述） | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 1232 | 2025-10-06 |
Identifying a prognostic signature for clear cell renal cell carcinoma: the convergence of single-cell and bulk sequencing with machine learning
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1560095
PMID:40535574
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据与机器学习方法，构建了一个用于预测透明细胞肾细胞癌预后的特征模型 | 开发了包含10种方法的整合机器学习流程构建共识特征模型，并首次将单细胞RNA测序分析与功能实验验证相结合 | 需要更多独立队列验证模型的普适性，功能实验仅限于细胞水平验证 | 构建能够预测透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应的机器学习特征模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和肿瘤细胞 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, CCK-8检测 | 整合机器学习模型 | 基因表达数据 | 四个独立数据集的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1233 | 2025-10-06 |
Revealing Potential Therapeutic Targets in Gastric Cancer through Inflammation and Protein-Protein Interaction Hub Networks
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.112218
PMID:40535808
|
研究论文 | 通过炎症和蛋白质-蛋白质相互作用枢纽网络揭示胃癌潜在治疗靶点 | 发现SPP1-CD44配体-受体轴作为驱动肿瘤进展的新型炎症信号通路 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 识别胃癌的炎症相关生物标志物和治疗靶点 | 胃癌基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据 | 4个bulk RNA-seq数据集和2个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1234 | 2025-10-06 |
A Comprehensive Analysis of the Role of DSN1 in Pan-Cancer Prognosis and Immunotherapy
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.111585
PMID:40535813
|
研究论文 | 通过多组学数据分析探讨DSN1基因在泛癌预后和免疫治疗中的作用 | 首次在泛癌层面系统分析DSN1的表达模式及其与预后、免疫特征和治疗反应的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证在不同癌种中的具体应用 | 探索DSN1在癌症发生发展及免疫治疗中的作用机制 | 多种癌症类型和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序, mRNA表达分析, 蛋白质表达分析, 基因集富集分析, DNA甲基化分析 | 生存分析模型, 相关性分析 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据, 临床预后数据 | 来自公共数据库的多种癌症样本数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1235 | 2025-10-06 |
A Potential Contribution of S100A11 to Skin Fibrosis and Pulmonary Involvement in Systemic Sclerosis
2025-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70026
PMID:40525602
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A11在系统性硬化症皮肤纤维化和肺部受累中的潜在作用 | 首次发现S100A11在SSc真皮成纤维细胞中高表达，且血清水平与皮肤厚度评分和间质性肺病参数相关 | 研究样本量有限，需要进一步功能实验验证S100A11的具体作用机制 | 探究S100A11在系统性硬化症纤维化过程中的潜在病理生理作用 | 系统性硬化症患者皮肤标本和血清样本 | 病理学 | 系统性硬化症 | 免疫组织化学染色,单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验 | NA | 组织图像,基因表达数据,血清蛋白水平数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤标本及血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1236 | 2025-10-06 |
Enhanced Spatial Transcriptomics Analysis of Mouse Lung Tissues Reveals Cell-Specific Gene Expression Changes Associated with Pulmonary Hypertension
2025, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.70322/jrbtm.2025.10004
PMID:40502298
|
研究论文 | 开发了一种使用10X Genomics Xenium平台对小鼠肺组织进行高分辨率空间转录组学分析的优化方法 | 比较了固定冷冻和新鲜冷冻两种组织处理方法，开发了室温下使用自由漂浮技术将薄肺切片安装到Xenium载玻片上的方法，保留了组织完整性并最大化成像区域 | 仅使用了预设计的379个小鼠基因面板，可能未覆盖所有相关基因表达变化 | 建立优化的空间转录组学方法以研究肺动脉高压中的细胞特异性基因表达变化 | 小鼠肺组织，特别是肺动脉高压模型中的各种肺细胞类型 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 多重荧光原位杂交(FISH)，高通量成像，差异基因表达分析 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium | Xenium载玻片，预设计379基因小鼠面板 |
| 1237 | 2025-10-06 |
Survey of transcriptome analyses of hippocampal neurogenesis with focus on adult dentate gyrus stem cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1605116
PMID:40519263
|
综述 | 本文综述了海马体神经发生的转录组分析研究，重点关注成年齿状回干细胞的特性和发育轨迹 | 整合单细胞RNA测序和克隆研究证据，揭示了成年齿状回中存在异质性神经干细胞群体，包括长寿命和快速耗竭两种类型 | 主要基于小鼠模型研究，人类神经发生的证据有限且存在物种差异 | 探讨海马体神经发生的分子机制和神经干细胞特性 | 成年哺乳动物海马体齿状回神经干细胞及其发育过程 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，克隆分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1238 | 2025-10-06 |
Adult-onset hypothyroidism induces granulosa cell apoptosis and affects ovarian follicle development in rats
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1610694
PMID:40519262
|
研究论文 | 本研究通过建立成年发病甲状腺功能减退大鼠模型，探讨其对卵巢发育和生殖细胞基因表达的影响 | 首次在成年发病甲状腺功能减退模型中结合单细胞RNA测序技术分析颗粒细胞和卵母细胞的基因表达特征，发现线粒体ROS的异质性变化 | 研究仅使用大鼠模型，未涉及人类样本验证 | 研究成年发病甲状腺功能减退对卵巢发育和生殖功能的影响机制 | 成年雌性大鼠的卵巢组织、颗粒细胞和卵母细胞 | 生殖内分泌学 | 甲状腺功能减退 | 单细胞RNA测序，激素水平检测，组织学分析 | NA | 基因表达数据，激素水平数据，组织形态学数据 | 甲状腺功能减退大鼠模型组和对照组 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1239 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of TMED2: unraveling potential immune characteristics and prognostic value in cancer therapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1578627
PMID:40519935
|
研究论文 | 通过多数据库综合分析TMED2在泛癌中的表达特征、预后价值及免疫调控机制 | 首次系统揭示TMED2在泛癌中的免疫特征和预后价值，发现其与免疫浸润、免疫检查点和关键信号通路的关联 | 主要基于公共数据库分析，实验验证相对有限 | 探索TMED2在泛癌中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型（包括CESC、MESO、LGG、UVM等）的肿瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞测序，基因富集分析，PPI网络分析，细胞功能实验 | 生物信息学分析模型 | 基因组数据，转录组数据，单细胞测序数据 | 多个公共数据库的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1240 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome profiling reveals dynamic cell populations and immune infiltration in cerebral cavernous malformation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592343
PMID:40519934
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示脑海绵状血管畸形病变组织中的细胞亚群动态变化和免疫细胞浸润情况 | 首次对散发性脑海绵状血管畸形病变组织进行单细胞转录组测序，系统描绘了细胞亚群组成和信号通路改变 | 样本量相对有限，未涉及不同疾病阶段的动态变化分析 | 深入理解脑海绵状血管畸形的发病机制 | 脑海绵状血管畸形患者的病变脑血管组织和正常对照脑血管组织 | 单细胞组学 | 脑海绵状血管畸形 | 单细胞RNA测序，多重荧光免疫组化 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组化图像数据 | CCM患者病变组织和正常对照脑血管组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |